3QXMA

Crystal structure of human gluk2 ligand-binding core in complex with novel marine-derived toxins, neodysiherbaine a
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
RSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDANGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 2
total genus 82
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-03-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qxmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qxmA02
4RPNA 2DVZA 3PD8A 3IOVA 4YKKA 4R6HA 4OZ9A 2HAUA 1MG1A 3KOSA 3HV1A 3LSWA 3CSGA 3SETA 1MH4A 4WKMA 3I6VA 1B05A 2O1MA 4IO2A 1UTHB 3VDFA 4YB7A 1Q35A 2XXIA 2XXQA 3OELA 3IO6A 1JW1A 1JETA 3H6UA 3MQ9A 4X48A 4BDRA 3U72A 3THIA 3WAFA 4GFRA 4RPOA 1EZOA 3FUZA 4O3BA 1AH5A 2Z23A 3QYTA 2NXOA 4LUBA 2F34A 3USDA 5L8DA 2F35A 4LONB 1VFDA 1B6HA 4PETA 1UTBB 4N07A 1LFIA 1MXXA 4EQ9A 4X9TA 3VFJA 2HQ0A 3PPPA 3T96B 1H44A 5JTYB 3B7DA 2M8CA 1MM7A 5I2KA 3T93B 2AYSA 5AA4A 4F1VA 3Q28A 1B3HA 4YZZA 2F6PA 3ZS6A 1LFHA 3TTLA 3O97A 3E13X 4KR5A 3JZJA 3RT8A 2Q9TA 3TTMA 5TPAB 5JK4A 1XVYA 1NL5A 1TWYA 4R6KA 5HBCA 4WXJA 4NMYA 4NF4B 1MQGA 2HXWA 4F22A 2F78A 1OVBA 3MUQA 1L5TA 4IGTA 3TYHA 5AA2B 3K6WA 3PPRA 2XXVA 1JQFA 4OTEA 4R73A 4IY5A 4FJPA 3OO8A 1FW0A 1ZJLA 1SVXB 1LB9A 3TCGA 1FQAA 1AL3A 2Z22A 2DWJA 4F29A 3TTKA 2D5WA 4PFTA 1VSOA 2ONKE 4RYAA 2DYXA 2Y84A 4G4PA 2PYYA 3IOTA 2PBWA 2UXAA 4XXUA 4YB6A 4P0IA 2RKMA 1LAHE 1N3WA 3KJ7A 3TQWA 1TFDA 2X7QA 1MRPA 2O7IA 3O2AA 5AE4A 4UACA 4QRZA 4ZS9A 1MDQA 4MBPA 2I0BA 1WODA 2Z8FA 3MZ1A 2R6GE 4GQOA 4NEDA 1UQWA 4EXLA 3TDJA 1BTJA 3VVFA 2H99A 3DP4A 4OXVA 2Z8DA 4YICA 4F3PA 4U4SA 2RC8A 2GFEA 2OJTA 4G68A 1SI1A 1KWHA 3EHTA 1O7TA 4GOTA 3RGYA 4OFLA 1J1NA 5I56B 1HSJA 3MP6A 1P1QA 4O3CA 4RNSA 4KD5A 1MY4A 1N04A 3OOAA 1MY1A 4IGRA 1A8FA 1OMPA 3VXCA 4JB7A 5ITPA 3OO9A 2P1SA 3L6GA 4JWXA 3IB2A 1EU8A 5FHMA 2DWAA 3FATA 4WEPA 1Y1ZA 4DXUA 1S50A 1B7ZA 3Q27A 3G3KA 3ZKKA 3PU5A 2VD2A 3MAMA 4LZ5A 4ZEKA 3HSTA 1FQEA 4R9GA 3C35A 1PC3A 3TTRA 1B5JA 2FYIA 3SEWA 3G3FA 4LP2B 4PQJA 2ZNSA 3UP9A 3OEKA 3PPQA 3DELB 4HS7A 4OERA 4H5GA 1OQHA 1D9YA 2F97A 2DWIA 5KDTA 3OXNA 2E0SA 1ZMGA 2H25A 2QRYA 5H8SA 3SEXA 3O28A 4DLDA 4H65A 2XXUA 5CBSA 2NWJA 4HCYA 3C32A 1TFAA 3P7IA 1HSLA 3LR1A 3PV0E 3CRBA 1JEUA 5JTYA 5CC2A 5I2KB 3TKDA 4QHQA 1NFTA 3F11A 5AA4B 1SYHA 4U1ZA 1US5A 3SDFA 1B4HA 4ZEIA 4R74A 3H6TA 1OLAA 2GH9A 2V25A 1WVJA 1NNKA 4R2FA 2RINA 4F2QA 2F7CA 1LSTA 3O66A 1QUIA 4G8HA 3MPKA 4QSDA 5FHOA 4YKJA 3V83A 1B58A 1OQGA 2H9BA 4F19A 2ALUA 2I4CA 1VR5A 4IY6A 1M5DA 4LA9A 4QSEA 4TLLB 5CMMA 3CFZA 3CIJA 3VLWA 1QUJA 2H98A 3MZ9A 3C36A 4IO3A 4MLQA 3IB0A 1IXGA 3C33A 3TTNA 3GXAA 1EZ9A 1SW5A 2GRVA 3TELA 3IOWA 1A54A 2XXRA 4ZDMA 2F7BA 4JWYA 1FQCA 4OEVA 3ILTB 4JWOA 3PPOA 1IUDA 2NUVA 2F36A 3K00A 4MLVA 2ZMBA 2F8DA 1LB8A 2XHDA 4DCYA 1XVXA 4RXLA 1SDXA 4LATA 4O3AA 3GBBA 5I59A 1PEBA 1WDNA 2OZZA 4BDMA 1P1NA 3CG3A 4L17A 5CI5A 4N6PA 5IKBA 1NNTA 2QS3A 3S4UA 3MVZA 3FVKA 3K1NA 3U94A 3T9HB 4BDQA 4C0RA 4M1VA 4U23A 3TAJA 3VV5A 3A3UA 1SYIA 4R2BA 1SW1A 2DXYA 2DVCA 2Q2AA 4JSOA 1F9BA 2V93A 3MZBA 3HPIA 2OK2A 4G68B 3T9XB 2DP8A 1NMUA 3H7MA 1B7HA 3IL1B 2I3VA 3CFXA 4EQBA 2QL3A 3T22A 1POTA 3M3LA 1SW4A 1FTKA 1NNFA 3VE1B 5A5XA 3K6VA 1H45A 4AQ4A 4ELOA 5K2YA 1AMFA 1R1NA 3DM0A 3EQ1A 3KN7A 1JNFA 2I58A 3H3GA 4JSDA 3PUVE 4RK2A 1EZPA 4HCWA 1B46A 1GVCA 1JW5A 4BDLA 3EPEA 4EF1A 4YMBA 3SEYA 5FTIA 5LOMA 3FJGA 3K02A 3PUWE 2OBGA 3UN6A 2FA7A 1DPPA 4Q5TA 4F1UA 4ECFA 1S7YA 2I49A 4H0WA 1FCKA 3QUJA 3IB1A 3CR9A 1B3LA 5KDTB 2FNCA 1T0KA 2I4BA 3W15C 4ZZAA 3RNNA 2DSFA 1B40A 1FQBA 4H1XA 3AXFA 4ZECA 1QJMA 3MP8A 3EF7A 3CI8A 5L9MA 2XXPA 1H76A 4HW8A 2OCUA 1FTOA 4BLAA 3PUZE 2Z8EA 3V5AA 2QS4A 3O9PA 4NWCA 3PMWA 4XIGQ 1QULA 1Y20A 1PB7A 2G93A 3ZKLA 4YMAA 1I69A 5TP9A 1O63A 4M4GA 4OVJA 2G29A 1LAFE 2GHAA 3PMVA 5EHMA 2XXXA 1POY1 3OEMA 3GZGA 1MPCA 2VGQA 3PUYE 1B4ZA 5M2VA 1P1UA 4OMBA 2KLFA 3QAXA 4OESA 4KHZE 2Y7IA 4F3BA 5TU0A 2XXWA 2V84A 2D21A 1FTMA 4OYVA 2OLBA 1ZLQA 1IXIA 2O68A 4F39A 4MFIA 2O51A 2PT1A 3HN0A 2Q88A 3K0VA 4NF6B 3QXMA 4BDOA 3OO7A 4RJZA 3KJTA 4F18A 4FATA 1P1OA 1XS5A 2Y7KA 1N84A 4EQ7A 4HTGA 4F3GA 3HHFA 4U2RA 2HFBA 5B7DA 5I59B 3Q25A 1DSNA 1D3KA 2QJEA 1UIVA 2ANJA 4G77A 5K2XA 1GGGA 1VE4A 4IB2A 4K3FA 3U92A 3ECRA 2PT2A 1SQYA 2YLNA 1SBPA 4I62A 4ZEBA 1LAGE 1YTVA 3H6VA 5J1DA 3C34A 4FECA 1B3GA 2HZKA 2DOJA 3G3IA 3FVGA 2QMWA 3VVEA 1LGBC 2Q2CA 1B0LA 2ZNUA 4Q8RA 3UORA 3G3GA 2W7YA 3WAEA 1R6ZA 2O1LA 4QFLA 1JVYA 3UIFA 4NF5A 4OHNA 4RY1A 2ZXTA 1IIWA 3OD7A 4DDDA 4P11A 1USYH 3IX1A 4QFNA 3V89B 2QS1A 3BFUA 5A5XB 1URGA 1S9TA 2QPQA 5L9SA 2XD2A 4KYEA 3IR1A 4FIMA 1GV8A 2E1SA 3EHSA 3OMBA 1A99A 3LSXA 4H67A 4XKQA 1XHYA 2QS2A 2PMSA 2B3FA 4FE8A 1RKMA 4NF8A 2DE2A 3FGSA 4DXBA 4EXKA 2ONRA 1ZIUA 4RK9A 2YJPA 3TMGA 1D4NA 2A5TB 1MQIA 1LCTA 2Q8JA 3IORA 4GL0A 4ELRA 1H3DA 5HPQA 2I6EA 3SKPA 1MPBA 4DXCA 3C4MA 2IA4A 3H03A 1Q1KA 3O6GA 2DXRA 1NNPA 5EYFA 3K1PA 3KN8A 4H8JA 4IO7A 2O69A 1B0HA 1IZ1A 2DQVA 4ZE8A 1R9LA 1IEJA 2ZYMA 4PFUA 4Z0IA 4KYDA 3K2DA 4TOZA 4C1TA 4H8IA 2CMOA 4KFQA 1URSA 1QKBA 5DYHA 2RCBA 3FASA 5ELVA 2ZNTA 4KCCA 1JW4A 5TP9B 3UGWA 2RF1A 3JV9A 4ZEFA 1RYXA 4MH5A 3W9VA 5CRYA 3D4CA 3Q29A 4U4XA 3G3HA 3PMXA 3VLUA 4C1UA 1M5FA 1ZU0A 1YAEA 3T66A 3EHUA 3N5LA 2UVGA 4LVQA 3RTFB 1BP5A 1P1WA 3H6WA 1EH3A 4MF3A 2VD3A 5H8HB 1A40A 1N7WA 3S9EA 1TT1A 4LZ8A 1ZBMA 1PBPA 3IO4A 3S9LC 4NF6A 2QMXA 2R71A 1QKAA 1A7LA 3B6QA 1B51A 1LBBA 5JEIA 1SD3A 4H5FA 5BWJA 1OVTA 2Q89A 3IJOB 1MXYA 1PDAA 2UVJA 1MPDA 2P2AA 2UVIA 3GBAA 1ZKBA 4X1BA 5HM4B 1LFGA 3CVGA 1OIBA 5H8QA 1N7XA 1ZTYA 3PUXE 2PX1A 3K4UA 1IQ7A 5KCJA 3TEPA 3C9HA 4Q30B 4R75A 3DP8A 4U21A 1MQHA 1NH8A 2NVUB 3RPWA 1B2HA 1H43A 4DZ1A 4NF5B 4U22A 1M5CA 3I5OA 3Q26A 2I0CA 1US4A 3B6TA 1Y4CA 3C31A 1B9JA 2XD3A 4ND9A 2H4IA 1DTZA 4NTLA 5KZTA 3HHGA 2VOZA 3EN3A 4JDFA 4OWDA 3U93A 5DEXA 1VFEA 2X26A 3R7XA 4XKPA 3H06B 3TCFA 3MP1A 1DOTA 3K6XA 5I2NA 2V3QA 1Y1MA 1N76A 2H5YA 4NF8B 5DTBA 1OLCA 4KYSA 3MVWA 4GVOA 1PBQA 4I1DA 2RC9A 2R9JA 2XX7A 4YKIA 3N94A 4WEDA 1JVXA 2A5TA 3LSLA 4N13A 3A3CA 3S9NC 3TUSA 5H8FA 2HEUA 3TPAA 4QFKA 4GD5A 2V3TA 1DMBA 4XKNA 4U1OA 5CMBA 3E9XA 1HSEA 4NE4A 4E0XA 3M8UA 2VP1A 3E3KA 1Y3PA 1TXFA 1M5EA 3GLBA 4XTCQ 3K6UA 4EDPA 1A55A 1BKAA 2THIA 4POXA 2HAVA 1FTLA 1NH7A 5L9OA 5I84A 1FQFA 4YAHX 3QIMA 4AB5A 2DE3A 4XKRA 4IO5A 3W9WA 4ESWA 5I58B 2O7UA 3H4ZA 4RA1A 3UA8A 3M3KA 1GR2A 3V8XB 1Z7NE 1B5IA 1PB9A 2RCAA 1MM6A 3G3JA 4FORA 4F1YA 4ISUA 1M5BA 4H6DA 1ANFA 3MC2A 1MY0A 2A5SA 4EF2A 3S2VA 3CFLA 2VHAA 2B3BA 3A09A 5DVIA 3MJNA 4JBZA 1B1XA 3LC8A 2LAOA 5AA2D 2ESNA 3TZAA 5H8HA 4OEUA 1B32A 2DS9A 5AA3A 1DTGA 4E0WA 3TODA 3MVYA 2Y7PA 1XT8A 4TQUQ 4I9DA 2RC7A 1D9VA 1RYOA 1B5HA 4NWDA 1MXWA 4P0GA 3DP6A 2AL4A 3RLFE 3VXBA 2F7AA 3SESA 3FVOA 3RQTA 5ITOA 5H8QB 1ELJA 3FXRA 2B65A 4FAJA 3VLVA 4YKPA 4QSCA 4ELPA 1N0TA 4OENA 5KCJB 5IAIA 2UYEA 2ONSA 5DVJA 3MVXA 5DT6A 2V3UA 4KI0E 3RUMA 1UIUA 2QSXA 2F6GA 4KCDA 3KN3A 3S9MC 3IJXB 1Y3NA 4OETA 5F1QA 2XXYA 1QVSA 3IK6B 3TQLA 1I6BA 4THIA 2ZYOA 2I48A 3D4GA 1MXVA 4ESXA 3FJMA 1Y4TA 4ELQA 2XXTA 3ODBA 2HZLA 5ICTA 2ZYKA 3DLNA 4TLMB 5DEXB 4QF9A 3TCHA 1URDA 3MBPA 1LCFA 5I57A 1B1HA 3FV2A 4FEDA 5I2NB 1CB6A 4DE8A 3N6TA 4PFYA 5ISUA 5BUUA 4GL8A 3ZSFA 3FD3A 2Y7WA 5H8NA 3U8QA 3KSXA 1B3EA 1MQJA 3ONMA 5CM6A 3G7WA 1AIVA 1B52A 3SEVA 2PVUA 4PP0A 4POWA 3IAZA 3UK4A 4GXSB 1I6QA 3KFMA 3KZGA 4PE5B 3RY3A 2AL5A 2REJA 1SW2A 4IO4A 4OFJA 1UTHA 1ATGA 1MXUA 5H8FB 4ZEDA 3PGFA 3IOUA 3QSLA 4KPTA 5AA1A 3QUFA 3KSJA 4R72A 4Z7EA 4DIGA 4G2ZA 3HO7A 4ONYA 2WKYA 4OFOA 1IXHA 2AIXA 3T9VA 2Y7RA 1LLSA 3FXUA 1IXCA 3HCQA 4X1DA 3FIRA 4GLIA 1AOVA 5FHNA 4G68C 1UTBA 2DE4A 4EUOA 5F7VA 1MDP1 2REGA 1JEVA 4GRKA 3RT6B 3CG1A 1DPEA 4ZE9A 2XX8A 1MY3A 3FXQA 4AB6A 3O6HA 4QFOA 5I58A 1P99A 3OSQA 5CMKA 1O64A 3BKIB 1LAXA 1QW0A 3R26A 2NOOA 2IEEA 1FTJA 1GTKA 3R6UA 1FQDA 2OWTA 1B7UA 1B3FA 1IITA 3O6IA 3KEIA 2HCAA 1NKXA 4PFWA 4DCXA 5TPAA 4LQ2A 3KG2A 1SI0A 2O84X 3PD9A 1MY2A 4FEBA 2I3WA 3N6UA 3LUYA 1LBCA 1Z7ME 3CSBA 3OO6A 1PB8A 1MS7A 3MW0A 4NF4A 3RN8A 3SERA 5CMCA 1R9QA 4G8NA 4R9FA 1MH3A 4F31B 1I6AA 5AA2A 5CBRA 1XOCA 3L6HA 4I8CA 3PPNA 2O6AA 3B6WA 4BDNA 3FVNA 3KOTA 1A8EA 4OQOA 2UYFA 3VVDA 5EHSA 1YCJA 4GIZA 1MQDA 4ZZEA 3U1OA 1Y3QA 2F5XA 2YPNA 3N26A 1CE2A 3BBRA 2D3IA 3FJ7A 4UA8A 3TFLA 5DVFA 3ILUB 2DWHA 4GF8A 4GXAA 3MPLA 3JYRA 3T9UA 4KQPA 2CZLA 4LQ5A 4GWOA 2BJJX 3LSFB 5ICQA 3KGCA 4LZ7A 3OENA 4YB5A 4F2OA 4JXIA 2XXHA 2GHBA 4F3SA 1BLFA 2P0SA 3BFTA 1Y9UA 2UVHA 5FTHA 1QUKA 4IO6A 2X7PA 3FV1A 3QK6A 1BIYA 2ABHA 3K1MA 2ZYNA 1XC1A 3LBSA 3RTWB 5B70A 4G8MA 1II5A 5I57B 4YU0A 2OWSA 3E4RA 3OSRA 3SEUA 1N3XA 5I56A 3KBRA 1MXZA 3I3VA 3MWBA 1YPNA 1USYE 3K01A 2XX9A 4QFPA 4Q0CA 5H8NB 3FZVA 3O29A 4R6YA 3M3FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RPNA 2DVZA 3PD8A 3IOVA 4YKKA 4R6HA 2XWIA 4OZ9A 2HAUA 1AWBA 1MG1A 3KOSA 3HV1A 3LSWA 3CSGA 3SETA 1MH4A 4WKMA 3I6VA 1B05A 2O1MA 4IO2A 1UTHB 3VDFA 4YB7A 1Q35A 2XXIA 2XXQA 3OELA 4X8RA 3IO6A 1JW1A 4GWYA 2MKZA 1JETA 3H6UA 3MQ9A 4X48A 4BDRA 3U72A 3THIA 3WAFA 4GFRA 4RPOA 5EQAA 1EZOA 2BJIA 3FUZA 4PAFA 4O3BA 1AH5A 2Z23A 4N17A 2PCRA 3QYTA 2NXOA 4LUBA 2F34A 3USDA 5L8DA 2F35A 4LONB 1VFDA 1B6HA 4PETA 1UTBB 4N07A 1LFIA 1MXXA 5EQ8A 4EQ9A 4X9TA 3VFJA 2HQ0A 3PPPA 1JP4A 3T96B 4NG7A 1H44A 5JTYB 3B7DA 1CNQA 2M8CA 1MM7A 5I2KA 3T93B 1EYIA 2AYSA 5AA4A 2Y5KA 4F1VA 3Q28A 1YYZA 1B3HA 1BK4A 2WBDA 1FPKA 4YZZA 4JVDA 2F6PA 3ZS6A 2P3NA 1LFHA 3TTLA 3O97A 4OVRA 4PDHA 3E13X 4KR5A 3JZJA 3RT8A 2Q9TA 3TTMA 5TPAB 4MIJA 5JK4A 1XVYA 4GWXA 1NL5A 1TWYA 4MNIA 4I3YA 4R6KA 2VPOA 5HBCA 4WXJA 3RPLA 4NMYA 4NF4B 1MQGA 2HXWA 4F22A 2F78A 1OVBA 3MUQA 1L5TA 4IGTA 3TYHA 5AA2B 3K6WA 3PPRA 2XXVA 1JQFA 4OTEA 4R73A 4IY5A 4FJPA 3OO8A 1FW0A 1ZJLA 1SVXB 1LB9A 3TCGA 1FQAA 1AL3A 2Z22A 2DWJA 4F29A 3TTKA 2D5WA 4PFTA 5FBPA 5DW8A 4HE2A 1VSOA 2FVZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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