3QZSA

Crystal structure of bptf bromo in complex with histone h4k16ac - form i
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
111
structure length
111
Chain Sequence
SVLTPLTEKDYEGLKRVLRSLQAHKMAWPFLEPVDPNDAPDYYGVIKEPMDLATMEERVQRRYYEKLTEFVADMTAIFDNCRYYNPSDSPFYQCAEVLESFFVQKLKGFKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Recognition of a Mononucleosomal Histone Modification Pattern by BPTF via Multivalent Interactions.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF
molecule tags Transcription/nuclear protein
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 111
sequence length 111
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-03-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3qzsA00
5DY7A 3U5KA 3LXJA 3O35A 5FE3A 4C66A 5D7XA 4YBSA 2KTBB 4YYHA 4UIVA 2YEKA 3MB4A 1WUGA 2DVRA 5CU8A 4HXLA 2I8NA 5A83A 4CFKA 3Q2EA 4NR7A 5FE2A 4UIWA 5F2PA 5FG4A 4TTEA 5A81A 4IR4A 5E9KA 3Q2FA 5J0DA 5ENIA 3UVWA 3UVXA 3I3JA 4QR3A 5I40A 4XUAA 4PY6A 4IORA 2R0SA 5KO4A 3O34A 4XY8A 4X2IA 2N9GA 2NXBA 5CQ7A 4A9OA 5DW1A 5DYUA 5ENBA 4UITA 5IGNA 4YADA 3MQMA 4YYIA 3P1DA 4CUUA 3U5JA 3S92A 5EWHA 3G0JA 4YC9A 5DBMA 4WHUA 4QUUA 5FE7A 4HXSA 4O72A 4AKNA 2R0VA 4UYDA 5CUCA 4O76A 2R10A 4MR3A 4NYXA 4RVRA 4YBTA 4A9JA 5EWVA 2RFJA 4MEPA 2WP1A 2H60A 2G4AA 2WP2A 5F36A 5E3GA 5DFBA 4LZRA 4LYIA 4NR4A 2DWWA 2YELA 4YYJA 4QC1A 5L96A 4QNSA 4F3IA 5FG6A 4UIUA 3SVGA 4NR8A 4HBYA 5ACYA 4N4GA 3MB3A 5BT3A 5FFVA 5D3HA 4O78A 3LQJA 4HXMA 5F61A 4BW4A 4QR4A 4UIXA 3D7CA 5A5RA 2DVSA 4N4FA 5E74A 4E96A 5FBXA 2F6NA 4NUDA 3SVHA 4QSVA 5L8UA 5A5PA 4J3IA 5IGMA 4NUEA 5TB6A 5I83A 5ENGA 4Z1SA 4NXJA 3QZSA 4NR5A 4NRBA 5DLZA 5D3NA 4TZ2A 5FE6A 3GG3A 5AMFA 4TU6A 5KTWA 5CTLA 1ZS5A 4Z93A 3O33A 2L85A 2YYNA 5EA1A 5HLSA 2RNXA 4QSRA 4TT2A 5FH7A 3P5OA 4UYFA 5EICA 4IR5A 5I7YA 4A9HA 3SVFA 4YATA 5II2A 4A9FA 5EQ1A 4LC2A 5EPRA 3MULA 5E7DA 4MR6A 5HFQA 4LRGA 4WHWA 5D3JA 4GPJA 5I7XA 5IIDA 5FE1A 5CQ5A 2RNWA 5KTUA 3ONIA 4O75A 5A5OA 4OUFA 4WIVA 4KV4A 5CQ6A 4LZ2A 4UYHA 4OGJA 4NYWA 4KV1A 4YAXA 5HJCA 4YBMA 5FE9A 5HEMA 5CS8A 4O7AA 5EWDA 4TT4A 4NR9A 4TYLA 5F25A 4Z6HA 4YY6A 4MENA 5E3DA 4Q0NA 4HXKA 4XYAA 4QB3A 5CUBA 5H85A 5CP5A 3RCWA 5HQ6A 4IOQA 5IGLA 4O70A 5C8GA 5CPEA 5LKZA 4N3WA 4QEVA 3MXFA 5DYAA 5F63A 5FFWA 2YW5A 4HXNA 2DATA 1JSPB 3LJWA 5DX4A 5EM3A 5LJ1A 2OO1A 5EWCA 4PCEA 5DLXA 4NR6A 5CQ4A 5DFCA 5D0CA 4QZSA 5D3TA 2D9EA 4QC3A 5HCLA 5DKCA 5H1VA 4YK0A 5EP7A 5E9YA 4ALHA 5HM0A 5FG5A 3HMHA 4QYDA 5K29A 5I1QA 4QYLA 4J0SA 5CQ8A 4ALGA 5I80A 5ENEA 4NQNA 5CUGA 3HMEA 3UV5A 5E9MA 2D82A 4CUTA 3JVJA 4Z1QA 4LR6A 4MR4A 4TS8A 4QBMA 4A9EA 2E3KA 4YY4A 4CURA 5LJ2A 4LYSA 4YYMA 5FE0A 4HXOA 4QR5A 4IOOA 4CFLA 4XY9A 5CQAA 3HMFA 2RI7A 2F6JA 5CZGA 5D3PA 5L97A 4HBWA 3TLPA 5CGPA 5FFYA 5LJ0A 5F60A 4BW1A 5L98A 4UYFB 5COIA 2RS9B 3U5OA 4QSXA 5LVQA 2E7OA 4N4IA 4Y03A 4TT6A 5ETDA 5F5ZA 1X0JA 5DYCA 3P1CA 2LSPB 5F1LA 3U5MA 3UV2A 5CRMA 4YH3A 4CLBA 4PKLA 5C87A 4O74A 4HXRA 5D3RA 4UYGA 5D24A 5ENHA 4DONA 5E73A 3QZVA 4TZ8A 4OGIA 5CQ3A 4O7EA 5C4QA 3QZTA 2YQDA 5AD3A 3O36A 5IG6A 2R0YA 5HRVA 5AD2A 4O7BA 5LKUA 2E7NA 4UIYA 2L84A 5EPBA 5F1HA 4TQNA 3MUKA 4YYGA 4MEOA 4BW2A 4O77A 4QSSA 4A9IA 3ZYUA 4QSTA 5A7CA 3DAIA 3IU6A 4XUBA 4CUSA 3LQHA 4IR6A 4QSUA 3U5NA 5FE4A 4PTBA 5E0RA 5ENJA 2OUOA 3UVYA 5G4RA 4A9LA 5I88A 4UYEA 4MEQA 5KTXA 5CFWA 4LYWA 4YYKA 3FKMX 5D3LA 5D26A 4NS5A 3JVKA 5BT5A 4PCIA 3LQIA 4HBVA 4O71A 5FDZA 4NRCA 4QUTA 5A82A 4BW3A 4HXPA 4QSWA 4ZW1A 5FB0A 4N4HA 5D25A 5LKTA 4TU4A 5IGKA 5HQ7A 3U5PA 1JM4B 3AADA 5CUEA 5DFDA 4MR5A 2DKWA 5EI4A 5I29A 5CRZA 5A5NA 4BHWA 5H1TA 3P1FA 4ZC9A 1E6IA 4O7CA 4QEUA 4NUCA 5E9LA 5KU3A 5LUUA 5CQTA 4LZSA 4NRAA 2I7KA 5HFRA 5BT4A 3P1EA 5E9VA 5DW2A 5EPSA 3AQAA 4YYDA 4HBXA 5DKHA 5EK9A 5EGUA 2YEMA 4J0RA 5EU1A 5ENCA 2MJVB 4A9KA 5D3SA 2RNYA 5EV9A 4FLPA 5C7NA 5JWMA 5FE5A 3JVLA 4LDFA 5L8TA 3UVDA 2RO1A 5HENA 2DVQA 4C67A 2YDWA 5ENFA 4NQMA 5EWWA 1F68A 5EVAA 4ZQLA 5DKDA 5H1UA 4UIZA 5FB1A 3U5LA 5HELA 5IBNA 3JVMA 5EISA 5HRXA 3IU5A 4PS5A 4QSPA 5C89A 5A5QA 5LVRA 3UW9A 4O7FA 5DYXA 5CUDA 1WUMA 5ETBA 2DVVA 5E9IA 4YH4A 2FSAA 4BJXA 5LKXA 5CY9A 4A9MA 1N72A 5FH8A 4KCXA 4QSQA 2L5EA 4CUPA 5F3AA 4CUQA 3DWYA 5A85A 5CUAA 1EQFA 5KHMA 5G4SA 4IR3A 4QY4A 5FH6A 5C85A 5FE8A 4YYNA 4QEWA 3O37A 5A5SA 2OSSA 5II1A 4A9NA 5HRWA 4J1PA 5F62A 3S91A 3K2JA 5TCMA 3UV4A 3NXBA 4Q0OA 4Z6IA 5HQ5A 5JI8A 4NYVA 5AMEA 2GRCA 5I89A 5L99A 4YABA 4CL9A 3G0LA 5I86A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DY7A 3U5KA 3LXJA 3O35A 5FE3A 4C66A 5D7XA 4YBSA 2KTBB 4YYHA 4UIVA 2YEKA 3MB4A 1WUGA 2DVRA 5CU8A 4HXLA 2I8NA 5A83A 4CFKA 3Q2EA 4NR7A 5FE2A 4UIWA 5F2PA 5FG4A 4TTEA 5A81A 4IR4A 5E9KA 3Q2FA 3ERRA 5J0DA 5ENIA 3UVWA 3UVXA 3I3JA 4QR3A 5I40A 4XUAA 4PY6A 4IORA 2R0SA 5KO4A 3O34A 4XY8A 4X2IA 2N9GA 2NXBA 5CQ7A 4A9OA 5DW1A 5DYUA 5ENBA 4UITA 5IGNA 4YADA 3MQMA 4YYIA 3P1DA 4CUUA 3U5JA 2EJNA 3S92A 5EWHA 3G0JA 4YC9A 5DBMA 4WHUA 4QUUA 5FE7A 4HXSA 4O72A 4AKNA 2R0VA 4UYDA 5CUCA 4O76A 2R10A 4MR3A 4NYXA 4RVRA 4YBTA 4A9JA 3D1DA 5EWVA 2RFJA 4MEPA 2WP1A 2H60A 2G4AA 2WP2A 5F36A 5E3GA 5DFBA 4LZRA 4LYIA 4NR4A 2DWWA 2YELA 4YYJA 4QC1A 5L96A 4QNSA 4F3IA 5FG6A 4UIUA 3SVGA 4NR8A 4HBYA 5ACYA 4N4GA 3MB3A 5BT3A 5FFVA 5D3HA 4O78A 3LQJA 4HXMA 5F61A 4BW4A 4QR4A 4UIXA 3D7CA 5A5RA 2DVSA 4N4FA 4AI6A 5E74A 4E96A 5FBXA 2F6NA 4NUDA 3SVHA 4QSVA 5L8UA 5A5PA 4J3IA 5IGMA 4NUEA 5TB6A 5I83A 4AKGA 5ENGA 4AKHA 4Z1SA 4NXJA 3QZSA 4NR5A 4NRBA 5DLZA 5D3NA 4TZ2A 5FE6A 3GG3A 5AMFA 4TU6A 5KTWA 3D1BA 5CTLA 1ZS5A 4Z93A 3O33A 2L85A 2YYNA 5EA1A 5HLSA 2RNXA 4QSRA 4TT2A 5FH7A 3P5OA 4UYFA 5EICA 4IR5A 5I7YA 4A9HA 3SVFA 4YATA 5II2A 4A9FA 5EQ1A 4LC2A 5EPRA 3MULA 5E7DA 4MR6A 5HFQA 4LRGA 4WHWA 5D3JA 4GPJA 5I7XA 5IIDA 5FE1A 5CQ5A 2RNWA 5KTUA 3ONIA 4O75A 5A5OA 4OUFA 4WIVA 4KV4A 5CQ6A 4LZ2A 4UYHA 4OGJA 4NYWA 4KV1A 4YAXA 5HJCA 4YBMA 5FE9A 5HEMA 5CS8A 4O7AA 5EWDA 4TT4A 4NR9A 4TYLA 5F25A 4Z6HA 4YY6A 4MENA 5E3DA 4Q0NA 4HXKA 4XYAA 4QB3A 5CUBA 5H85A 5CP5A 3RCWA 5HQ6A 4IOQA 5IGLA 4O70A 5C8GA 5CPEA 5LKZA 4N3WA 4QEVA 3MXFA 5DYAA 5F63A 5FFWA 2YW5A 4HXNA 2DATA 1JSPB 3LJWA 5DX4A 5EM3A 5LJ1A 2OO1A 5EWCA 4PCEA 5DLXA 4NR6A 5CQ4A 5DFCA 5D0CA 4QZSA 5D3TA 2D9EA 4QC3A 5HCLA 5DKCA 5H1VA 4YK0A 5EP7A 5E9YA 4ALHA 5HM0A 5FG5A 3HMHA 4QYDA 5K29A 5I1QA 4QYLA 4J0SA 5CQ8A 4ALGA 5I80A 5ENEA 4NQNA 5CUGA 3HMEA 3UV5A 5E9MA 2D82A 4CUTA 3JVJA 4Z1QA 4LR6A 4MR4A 4TS8A 4QBMA 4A9EA 2E3KA 4YY4A 4CURA 5LJ2A 4LYSA 4YYMA 5FE0A 4HXOA 4QR5A 4IOOA 4CFLA 4XY9A 5CQAA 3HMFA 2RI7A 2F6JA 5CZGA 5D3PA 5L97A 4HBWA 3TLPA 5CGPA 5FFYA 5LJ0A 5F60A 4BW1A 5L98A 4UYFB 5COIA 2RS9B 3U5OA 4QSXA 5LVQA 2E7OA 4N4IA 4Y03A 4TT6A 5ETDA 5F5ZA 1X0JA 5DYCA 3P1CA 2LSPB 5F1LA 3U5MA 3UV2A 5CRMA 4AKIA 4YH3A 4CLBA 4PKLA 5C87A 4O74A 4HXRA 5D3RA 4UYGA 5D24A 5ENHA 4DONA 5E73A 3QZVA 4TZ8A 4OGIA 5CQ3A 4O7EA 5C4QA 3QZTA 2YQDA 5AD3A 3O36A 5IG6A 2R0YA 5HRVA 1ZKRA 5AD2A 4O7BA 5LKUA 2E7NA 4UIYA 2L84A 5EPBA 5F1HA 4TQNA 3MUKA 4YYGA 4MEOA 4BW2A 4O77A 4QSSA 4A9IA 3ZYUA 4QSTA 5A7CA 3DAIA 3IU6A 4XUBA 4CUSA 3LQHA 4IR6A 4QSUA 3U5NA 5FE4A 4PTBA 5E0RA 5ENJA 2OUOA 3UVYA 5G4RA 4A9LA 5I88A 4UYEA 4MEQA 5KTXA 5CFWA 4LYWA 4YYKA 3FKMX 5D3LA 3VKHA 5D26A 4NS5A 3JVKA 5BT5A 4PCIA 3LQIA 4HBVA 4O71A 5FDZA 4NRCA 4QUTA 5A82A 4BW3A 4HXPA 4QSWA 4ZW1A 5FB0A 4N4HA 5D25A 5LKTA 4TU4A 5IGKA 5HQ7A 3U5PA 1JM4B 3AADA 5CUEA 5DFDA 4MR5A 2DKWA 5EI4A 5I29A 5CRZA 5A5NA 4BHWA 5H1TA 3P1FA 4ZC9A 1E6IA 4O7CA 4QEUA 3VKGA 4NUCA 5E9LA 5KU3A 5LUUA 5CQTA 4LZSA 4NRAA 2I7KA 5HFRA 5BT4A 3P1EA 5E9VA 5DW2A 5EPSA 3AQAA 4YYDA 4HBXA 5DKHA 5EK9A 5EGUA 2YEMA 4J0RA 5EU1A 5ENCA 2MJVB 4A9KA 5D3SA 2RNYA 5EV9A 4FLPA 5C7NA 5JWMA 5FE5A 3JVLA 4LDFA 5L8TA 3UVDA 1PUOA 2RO1A 5HENA 2DVQA 4C67A 2YDWA 5ENFA 4NQMA 5EWWA 1F68A 5EVAA 4ZQLA 5DKDA 5H1UA 4UIZA 5FB1A 3U5LA 5HELA 5IBNA 3JVMA 5EISA 5HRXA 3IU5A 4PS5A 4QSPA 5C89A 5A5QA 5LVRA 3UW9A 4O7FA 5DYXA 5CUDA 1WUMA 5ETBA 2DVVA 5E9IA 4YH4A 2FSAA 4BJXA 5LKXA 5CY9A 4A9MA 1N72A 5FH8A 4KCXA 4QSQA 2L5EA 4CUPA 5F3AA 4CUQA 3DWYA 5A85A 5CUAA 1EQFA 5KHMA 5G4SA 4IR3A 4QY4A 5FH6A 5C85A 5FE8A 4YYNA 4QEWA 3O37A 5A5SA 2OSSA 5II1A 4A9NA 5HRWA 4J1PA 5F62A 3S91A 3K2JA 5TCMA 3UV4A 3NXBA 4Q0OA 4Z6IA 5HQ5A 5JI8A 4NYVA 5AMEA 2GRCA 5I89A 5L99A 4YABA 4CL9A 3G0LA 5I86A
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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