3R26A

Perrhenate binding to molybdate binding protein
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
GKITVFAAASLTNAMQDIATQFKKEKGVDVVSSFASSSTLARQIEAGAPADLFISADQKWMDYAVDKKAIDTATRQTLLGNSLVVVAPKASVQKDFTIDSKTNWTSLLNGGRLAVGDPEHVPAGIYAKEALQKLGAWDTLSPKLAPAEDVRGALALVERNEAPLGIVYGSDAVASKGVKVVATFPEDSHKKVEYPVAVVEGHNNATVKAFYDYLKGPQAAEIFKRYGFTIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Protein binding
source organism Escherichia coli
publication title Binding of ReO(4) (-) with an engineered MoO (4) (2-)-binding protein: towards a new approach in radiopharmaceutical applications.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Molybdate-binding periplasmic protein
total genus 76
structure length 231
sequence length 231
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3r26A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3r26A02
2ZXTA 3IJOB 1FTKA 1IITA 4R75A 1A7LA 1B0LA 5I58A 1Q1KA 2P2AA 1OLAA 4LVQA 1NMUA 4P0GA 1NNFA 4NF8B 1LBBA 1B7UA 4U4XA 1JNFA 3TTRA 2UVIA 3MZBA 3K6WA 1GGGA 5I57B 3VLWA 4XXUA 4H8JA 1MRPA 3FV2A 3RTFB 1D9YA 2HEUA 5CM6A 3IOVA 2O1LA 4TOZA 2UXAA 4H5GA 1O63A 3G3IA 3EN3A 4C0RA 1OQHA 3IK6B 3F11A 3GLBA 4KFQA 1MM6A 3B6QA 3MZ1A 1P1NA 1FTJA 2DS9A 1QUJA 3PUYE 2Y7PA 1FQEA 3HCQA 3H6UA 3ZKLA 3PPQA 4N6PA 2OWTA 5ISUA 1MY4A 2Z8DA 1IUDA 1CB6A 2PMSA 4G68C 3TTKA 1Q35A 3U72A 5ITOA 3OO7A 4BDQA 3D4CA 2R9JA 3UORA 4HTGA 3TYHA 3C33A 4JSDA 2NWJA 3ODBA 3G3KA 5JK4A 2FA7A 1BP5A 3MW0A 2DE3A 4JBZA 1MQJA 1N3XA 3Q28A 1I6QA 2Z8FA 3PPRA 2I4BA 5EHMA 1ATGA 3O9PA 2RKMA 3N6TA 5F1QA 2QJEA 3JV9A 3A3CA 3CR9A 1Z7NE 3TEPA 3MUQA 4BDOA 4G77A 3RGYA 1MXWA 1UTBA 2F5XA 2QMWA 5TU0A 4E0XA 1YPNA 2DE2A 4NEDA 3SEXA 5I58B 2HAVA 4FIMA 4YKKA 5B70A 3E3KA 3BBRA 4EDPA 3TCGA 3IOUA 3PUWE 1EZPA 2GH9A 3K6VA 4F1YA 1HSEA 3KN3A 2PX1A 1IXCA 2H5YA 3QIMA 3O6HA 1I6AA 1Z7ME 2HQ0A 4R74A 5H8FA 1B5IA 3LSLA 3HSTA 3T9VA 4F39A 2OJTA 3H4ZA 2O7UA 4IO4A 1N7XA 4BLAA 2F34A 4FECA 1MXVA 3CG1A 3PMVA 1R1NA 3EHTA 2QS2A 4YKIA 1MDP1 3KGCA 4HCWA 4ELPA 1SW2A 2ZYNA 3ECRA 1B6HA 4IY6A 3PPPA 2ZNTA 1B3HA 1QUKA 3C36A 1NNPA 3SERA 3RNNA 2A5TA 1FTLA 3PUVE 3RT8A 1ZBMA 3CFLA 5BWJA 2AL4A 1FQBA 1VFDA 1BKAA 4U4SA 2P1SA 3OD7A 4YU0A 5CMCA 2GRVA 3FUZA 4ZEKA 1NH8A 4Q5TA 4RXLA 3QK6A 2ZNSA 2PT1A 3M3LA 3EHSA 5CMKA 2HAUA 2OZZA 5I84A 3FVNA 5AA2A 4GD5A 2ALUA 1EU8A 4M4GA 3T9XB 4GQOA 4OVJA 4EF1A 4RK2A 3BFUA 4FEBA 1P1UA 4POWA 4NF4A 1O7TA 3SEUA 1DTGA 1B7HA 1QULA 2CZLA 4QFNA 4U1ZA 1UTBB 2ONRA 2IA4A 3I6VA 2OCUA 4PFYA 3LSFB 5DVIA 1B52A 3MBPA 3RTWB 3EPEA 2V25A 1AH5A 3MC2A 1IXHA 2XD3A 4QRZA 5I2NA 1UIUA 4X48A 3UGWA 2I58A 3C35A 1WVJA 5ICTA 1LAXA 3H3GA 2THIA 1YAEA 5TPAA 5H8FB 1Y1ZA 1P1QA 3D4GA 4Q30B 2F7AA 2OK2A 4G8NA 4ONYA 1JW5A 4HS7A 4MLQA 1SYHA 3V89B 3GXAA 4HCYA 2G93A 3KJTA 4MBPA 3I3VA 3BKIB 1FW0A 1KWHA 4TLLB 2A5TB 4YKJA 2RINA 3CSBA 2DXYA 1DMBA 3CFZA 1D4NA 1II5A 2F35A 1RKMA 2B3FA 1PB8A 4XKQA 2REGA 5DT6A 4F29A 1RYXA 1NH7A 1GTKA 3SKPA 4OERA 3KG2A 4NF6A 3IB2A 3CG3A 2RCBA 3LC8A 3VVFA 2VP1A 1LBCA 2H25A 5TP9A 5AA2B 4OQOA 4F19A 4FE8A 1MQHA 1N76A 3PUXE 4YICA 3IO6A 2Y7KA 4ESXA 4ZEBA 4NF4B 3E4RA 5CMMA 2I3WA 1D3KA 4KR5A 2Q2CA 4KCDA 4ISUA 4ZE8A 1URGA 4OEVA 3EHUA 4DXBA 2XXHA 3IAZA 3FVKA 5I2NB 2R71A 3PV0E 1XT8A 4ZDMA 1PB9A 3IORA 1HSJA 3A09A 4C1TA 3OELA 2FNCA 1MY3A 5HM4B 4KD5A 5L9MA 2PVUA 2RC8A 1Y1MA 3K01A 3KEIA 1QJMA 2UYFA 3KZGA 1NL5A 1MQDA 4R9GA 4R73A 4RA1A 1M5EA 4MFIA 1MY2A 4FAJA 2ZMBA 2O69A 3TUSA 1YCJA 3K0VA 1N7WA 2VOZA 4IO7A 1MG1A 3IX1A 4OMBA 4ZEIA 3MZ9A 2NOOA 5H8NA 2W7YA 4F3SA 5I59A 5CC2A 5ELVA 3G3GA 3KN7A 1N3WA 2E0SA 1A8EA 4NF6B 3SDFA 2XXWA 4R6HA 3FZVA 1QVSA 4GXSB 5TP9B 4NWDA 1TT1A 4OETA 5KDTA 1I69A 3L6HA 2UVGA 2M8CA 2X7PA 1URDA 2AYSA 1A99A 4Q8RA 1FQAA 5FHMA 2RC7A 3PPNA 4OWDA 2O68A 3PMWA 2WKYA 2O7IA 3N5LA 3PU5A 1A54A 1T0KA 1A8FA 4Z0IA 2PBWA 1B05A 1J1NA 2Q89A 3O6IA 1XOCA 1JW1A 3DLNA 3VXCA 1DTZA 4OTEA 4F2QA 2Q9TA 4XKRA 1A40A 3JYRA 1LFIA 3U1OA 5LOMA 1B3FA 1YTVA 4XKNA 4GOTA 3KJ7A 2ONSA 4DLDA 2XXXA 1B32A 1ZTYA 1B3EA 4DDDA 4NE4A 3HO7A 5AA4A 5FTHA 3K00A 1LAGE 4RYAA 3QXMA 1UTHA 1Y4TA 3ZKKA 5CRYA 4R6YA 1L5TA 4EUOA 1B9JA 2OBGA 4E0WA 5L9SA 1EZOA 4GVOA 1VSOA 2RF1A 2ZYOA 2RC9A 5H8NB 1BTJA 5I59B 1USYE 4HW8A 4RPOA 2AIXA 4DIGA 2HCAA 3H03A 3MWBA 4G2ZA 3H7MA 1B0HA 4ELQA 4EXLA 1NKXA 2FYIA 3RN8A 1TWYA 3S9EA 1O64A 3T96B 2XXRA 1MXZA 1AMFA 5KDTB 3C4MA 1ZLQA 1Y3PA 4KYEA 3TAJA 5L9OA 4R2BA 2XXTA 4OZ9A 4PFWA 2F97A 3EQ1A 4QFLA 3K1NA 4AB6A 4OEUA 2QL3A 3TZAA 4TLMB 3MVWA 3CFXA 4EQ7A 2I0BA 2Q2AA 3S2VA 5A5XA 3K1MA 3UA8A 3S9LC 1MPBA 3TPAA 3DP4A 1SQYA 4BDLA 3O2AA 3G3FA 4NMYA 4RPNA 1Y3QA 1B4ZA 1TXFA 3TTNA 4N07A 3DP6A 5CBSA 3RT6B 4POXA 1XC1A 1FQCA 4QSDA 2V3QA 2F6PA 4R6KA 1M5BA 3ONMA 1JETA 3FASA 4I8CA 1Y20A 4NTLA 3R26A 4F2OA 1BLFA 3CI8A 4FEDA 3SETA 2QPQA 3T22A 1N04A 4JWYA 3CSGA 5AA4B 2D3IA 2HZLA 3ILTB 2XD2A 1B40A 3N26A 4H67A 1UTHB 1GR2A 2OWSA 1VE4A 3IB0A 4YKPA 4WXJA 4YB5A 3U94A 1QW0A 3RY3A 4GF8A 4LZ7A 5DYHA 1H43A 3CRBA 3TMGA 1B1HA 4X1DA 1XHYA 3SEWA 4OFLA 1SW1A 5I2KA 1DOTA 1LAHE 4XIGQ 3RQTA 4LP2B 5JTYA 2F7BA 1PEBA 2H98A 3FVOA 3RUMA 3UP9A 3M3KA 2I0CA 3OO9A 5IAIA 3ILUB 2PT2A 4LZ5A 3TODA 3VVEA 3DP8A 1LCFA 2DP8A 1N84A 3MJNA 4XTCQ 3S4UA 3TCFA 1B5JA 1SI0A 2V3TA 1TFDA 1QUIA 2HFBA 4G4PA 2F6GA 5BUUA 1JVYA 4JSOA 5IKBA 3V5AA 1AL3A 4IO2A 3CVGA 2H9BA 2ZYKA 1MH4A 5A5XB 2AL5A 1MY1A 5CMBA 5EYFA 2D21A 4I1DA 1MQIA 2Q8JA 5K2YA 1IEJA 3M3FA 4OESA 4YB7A 1B5HA 3FIRA 4JDFA 4NF5A 2NXOA 4F1VA 3OO8A 3VLVA 1JEVA 3MVZA 3Q25A 2GFEA 3FV1A 4AB5A 2Z8EA 3H6VA 3O97A 3JZJA 4DE8A 3FD3A 3L6GA 3GBAA 3OSQA 4LQ5A 4QFKA 3E9XA 5FHOA 3FXUA 3IJXB 5EHSA 4XKPA 1H3DA 4F1UA 5FTIA 1QKBA 3OSRA 2H99A 1IXGA 5DVFA 5JTYB 3C34A 2NVUB 1IQ7A 4ZEFA 3LBSA 3PPOA 1OIBA 4KYDA 1OQGA 1FQDA 3FJGA 3OENA 5FHNA 5DEXA 2I6EA 3KN8A 2Y7IA 3U92A 2IEEA 1EH3A 4F31B 3OMBA 5H8SA 5M2VA 3GZGA 3SESA 1A55A 3TFLA 4ZECA 3K6XA 1GV8A 2YJPA 3EF7A 4YZZA 3VVDA 3OOAA 4YB6A 1EZ9A 1ZU0A 4G8MA 5TPAB 2DWIA 4H0WA 3AXFA 1NNKA 3LUYA 3KSJA 4ELRA 4O3CA 2PYYA 3SEYA 5AA2D 4OYVA 4OFOA 1PBPA 2QS1A 1LB8A 4H5FA 1I6BA 2XXPA 2DXRA 3RLFE 2ESNA 3MP6A 1SDXA 4NF5B 3RPWA 2ANJA 3LR1A 5L8DA 3THIA 1USYH 1DPPA 4P11A 4PE5B 4LQ2A 1SW5A 1N0TA 3G3JA 1B46A 1B58A 1JQFA 4ELOA 4R9FA 1ZKBA 4R72A 1F9BA 2DE4A 4MH5A 4TQUQ 4OENA 4M1VA 2DSFA 3WAFA 3TTLA 3DM0A 4IO5A 3FXQA 3B6TA 3QUFA 2VD3A 2Y7WA 1R9LA 3MPKA 1H45A 3KBRA 2VD2A 2REJA 4KI0E 2E1SA 3A3UA 4IB2A 5AA1A 3QAXA 1ZMGA 4IGRA 1H76A 2UVHA 4YMBA 5DEXB 3MAMA 3O28A 4ZS9A 5H8HA 2DWHA 5CBRA 4N13A 3LSXA 4ZZEA 1FTMA 1POTA 3C32A 3VLUA 2O84X 3ZS6A 1MPDA 2UVJA 4KHZE 1NNTA 1SBPA 2XXUA 2CMOA 4G68A 4G8HA 1VFEA 1RYOA 3CIJA 4DCYA 1JVXA 3PGFA 3QYTA 4F22A 3Q26A 2UYEA 2QS4A 3VXBA 1MY0A 1OVBA 3PMXA 3E13X 4QSCA 4R2FA 2B3BA 2NUVA 4H65A 1JW4A 4FJPA 1LCTA 1LFGA 2H4IA 3C31A 4U21A 5H8QA 3TTMA 1OLCA 1B1XA 3KOSA 3B6WA 4I62A 1B2HA 1DPEA 3T9UA 4F3PA 3FXRA 2Q88A 4O3BA 1SD3A 2Y7RA 1B7ZA 3UN6A 2V93A 4JWOA 4LONB 4QF9A 4U2RA 1PC3A 4MLVA 1MXXA 3VE1B 2V3UA 1JEUA 1PDAA 3HPIA 1B4HA 2A5SA 5ITPA 1GVCA 3KFMA 1US5A 5K2XA 2VGQA 1LSTA 2O51A 4ZEDA 1B3GA 5KZTA 4KCCA 4ECFA 2Z22A 3V83A 1POY1 1XVXA 3MP1A 1SVXB 2F78A 4ND9A 3PUZE 3T9HB 4ZZAA 3FATA 1ZIUA 4OHNA 2F36A 3FJ7A 3PD8A 4QHQA 1P1WA 4QSEA 3W9WA 2QMXA 3T93B 4KQPA 4THIA 2HZKA 4PP0A 1LFHA 4PQJA 4RK9A 5H8HB 2BJJX 4L17A 1IXIA 3PD9A 2RCAA 2R6GE 3K02A 2XXIA 3N94A 5KCJA 1MQGA 2QRYA 1MDQA 4WKMA 5DVJA 4OXVA 1AIVA 3DELB 4G68B 3GBBA 4BDRA 1ELJA 1DSNA 2I4CA 4JB7A 4IGTA 4NWCA 4FATA 3IR1A 1TFAA 3K6UA 1MXYA 4BDNA 4MF3A 3HHGA 2YPNA 1PB7A 1VR5A 3UIFA 3UK4A 4YAHX 4U23A 1D9VA 4H1XA 4EQBA 3P7IA 3IB1A 4F3BA 3W9VA 1UQWA 5H8QB 4KPTA 1Y9UA 3QUJA 4OFJA 2XXYA 1URSA 2ABHA 4DCXA 4GL0A 3MQ9A 3Q27A 4ZE9A 2Y84A 2O6AA 3S9MC 3R7XA 3TDJA 1SYIA 1HSLA 3H06B 4PFUA 4KYSA 2D5WA 3SEVA 1M5FA 4I9DA 3TQWA 4GL8A 2O1MA 3HN0A 2V84A 3FJMA 1FTOA 5CI5A 2X7QA 5J1DA 4LUBA 5HBCA 4QFOA 5AE4A 3TQLA 4O3AA 1MXUA 1XVYA 3T66A 4FORA 5I56A 2XX9A 3MP8A 2LAOA 1OVTA 3U93A 3WAEA 4U1OA 2X26A 1BIYA 5DTBA 2XXVA 2GHBA 3TELA 5ICQA 2XX8A 3ZSFA 4Z7EA 3OEMA 3H6WA 5KCJB 3K4UA 1MM7A 1AOVA 1LAFE 4H6DA 1S50A 4X9TA 3BFTA 3TKDA 4EQ9A 2XX7A 2ZYMA 2I49A 3C9HA 4IO3A 4LZ8A 1IIWA 3N6UA 2F8DA 3MVYA 4PFTA 3KSXA 1Y3NA 2DWJA 4PETA 3HV1A 5JEIA 1LB9A 3O66A 3LSWA 2ZNUA 3OXNA 2Z23A 4WEDA 4GLIA 1R6ZA 3K2DA 4UACA 1Y4CA 4H8IA 3USDA 4JXIA 4GXAA 1ZJLA 3O6GA 4RNSA 4C1UA 2I48A 2XXQA 4EF2A 2OLBA 4LATA 3VV5A 3V8XB 3MVXA 2QSXA 5I2KB 3G7WA 3Q29A 4UA8A 3IOTA 4JWXA 1QKAA 3U8QA 4X1BA 3OEKA 3VFJA 3R6UA 2HXWA 4QFPA 2DVCA 4NF8A 3KOTA 4DZ1A 3VDFA 3M8UA 1NFTA 4GFRA 3W15C 1FCKA 1PBQA 3FGSA 4IY5A 5F7VA 5I57A 2QS3A 1OMPA 1WODA 3HHFA 4AQ4A 1SW4A 4GWOA 4P0IA 2DWAA 5I56B 1M5DA 5AA3A 4YMAA 2P0SA 3O29A 3OO6A 1P99A 2ONKE 5B7DA 2XHDA 1CE2A 1LGBC 3IOWA 3G3HA 1B3LA 3FVGA 3B7DA 4RY1A 3K1PA 3S9NC 1FQFA 1M5CA 4IO6A 2VHAA 1US4A 4BDMA 4WEPA 1MPCA 2DOJA 1XS5A 1IZ1A 2GHAA 4F18A 2DYXA 4U22A 1B51A 1UIVA 4LA9A 2DVZA 5HPQA 4GRKA 1S7YA 1MH3A 4K3FA 1WDNA 2F7CA 2DQVA 1S9TA 3IL1B 1ANFA 2B65A 4ESWA 4DXCA 2KLFA 4GIZA 3TCHA 2I3VA 1LLSA 1SI1A 1MS7A 3IO4A 4F3GA 3H6TA 4EXKA 1P1OA 4RJZA 2G29A 2YLNA 1R9QA 4Q0CA 3I5OA 3MPLA 1H44A 4DXUA 3QSLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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