3R2YA

Mk2 kinase bound to compound 1
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
300
structure length
259
Chain Sequence
FHVKSGLQIKKNAIIDDYKVTSQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRASQCPHIVRIVDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDTEREASEIMKSIGEAIQYLHSINIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTDKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYMKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKMLIRNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure-based lead identification of ATP-competitive MK2 inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MAP kinase-activated protein kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 259
sequence length 300
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-03-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3r2yA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3r2yA01
2HWPA 3GT8A 5BUJA 4QYFA 5FG8A 3OWJA 2YAKA 2ZAZA 2GTNA 2GHGA 2QOOA 2ITWA 2WMUA 3PRIA 3I79A 4G3GA 4I6FA 4NW6A 4ANNA 4BRXA 4CKJA 4FZAB 2WHBA 3SRVA 4L42A 4TZRA 3VAPA 4EH9A 5JFXA 1B38A 2WMSA 2UW9A 4E1ZA 4YC6A 5K4IA 4DTKA 3OBGA 4R78A 4BR3A 4AUAA 1ERKA 2B53A 2YJSA 3U87A 4EORA 2GNJA 2YISA 3EL8A 2UZVA 5KHXA 2VO6A 5BQ0A 1VZOA 4YZMA 3CQEA 3ZZWA 4GEOA 3W2PA 1MRVA 4DH1A 4YC8A 2YIRA 2WD1A 4EK3A 2PMLX 1H07A 5I9VA 4FTTA 4K9YA 2G15A 1JAMA 3R02A 4H1MA 5DG5A 5AR2A 4QYGA 4F6WA 1H28A 3NRMA 3HV3A 3PE2A 2B9IA 2C0TA 2XZSA 2OJGA 3V5PA 4M67A 3DLSA 4RZVA 4O0RA 4CCUA 4M13A 3CY3A 4C0TA 5FQDC 5H2UA 5BYLA 1S9IA 3UYTA 1Z57A 2J0LA 2F2CB 2EU9A 2BUJA 2C1AA 2BDFA 4G3EA 4NTSA 2JKMA 3QHRA 3G5DA 4F7JA 3QFVA 4KWPA 2I0EA 5IA0A 3QXOA 5CAQA 2PULA 5HOAA 3ATSA 4BHZA 2VGOA 5AP0A 3RCJA 1ZYSA 3DU8A 3KY2A 2XKEA 4YJOA 2P0CA 2F49A 3LLTA 3UOHA 3D9VA 3ZBXA 1S9JA 3OWLA 4RBLA 4ACGA 3POOA 2ZV8A 3R7IA 5ANJA 3B8RA 2HK5A 4MF0A 5JZJA 3U4WA 2XKDA 3FQEA 3UO4A 4CZUA 2XIXA 3DNEA 3QZIA 3RVGA 2Y7JA 4EQMA 5L3AA 5JMSA 3R9RA 3KF7A 2WGJA 4KBAA 5CTPA 2P2HA 4OR5A 3UE4A 5BVDA 4ZLYA 5L6PA 2WTJA 3ATTA 4C57A 3NVKI 1OKYA 1REKA 3Q5ZA 1W84A 3OCBA 2VTQA 5AUZA 4F99A 1ND4A 4D2PA 2OZAA 3KCKA 1Q8UA 3GFEA 5DEYA 4FICA 4M69B 2FVDA 4FBXA 4RFMA 4JT3A 1KOBA 4IDVA 5DNRA 2HENA 3V04A 5JFVA 3PRFA 4LFIA 2ITXA 4ITHA 3R2BA 4USDA 3PVBA 4LUDA 4NK9A 5JK3A 4V0GB 2CCHA 3LFQA 2P33A 2X7OA 3BLHA 4M66A 3I7CA 3LJ1A 1J3HA 2JLDA 4IZ5A 3BPRA 4L3LA 4PDPA 4CRLA 1V0BA 4FEWA 2ZM3A 1VEBA 3QYWA 4X3FC 2ZM4A 3LFAA 4WHZA 3VNTA 3G51A 4IEBA 5HHWA 4C4FA 2UW0A 2XK8A 4MX9A 3QRKA 4USEA 2NO3A 5BX0A 5CSVA 3M11A 4YHFA 1ZOGA 5EYMA 4S2ZA 2VX1A 4I23A 5EYDA 3CPBA 4XBRA 5D11A 4E5WA 2B4SB 3NNXA 4K8AA 3FDNA 1OVEA 1JQHA 3KMMA 4KA3A 4X6RA 4XG9A 5CT0A 4EH8A 2UV2A 3LFNA 2XEZA 3PZHA 2JBOA 3DQWA 3HA8A 3R04A 2GMXA 5J5TA 4XCUA 2Z02A 3GGFA 4LOOA 3TUDA 4GL9A 5CF8A 2ZYBA 3AT3A 3OWKA 4CYIA 3L1SA 4BCHA 2HY0A 3DB8A 3PA4A 5BVWA 5EH0A 2W4OA 2X7FA 4KKHA 1JKTA 3QTSA 4U44A 1W83A 4ZY5A 2XNPA 2F4JA 4V0GA 5HE1A 5FM2A 1XHAA 1YWVA 5KMOA 4ZOGA 4BZDA 3JY0A 5CNNA 1PXPA 3ZUUA 2BRBA 2PVJA 2R3MA 4KIKB 2CN5A 2PVYA 3WF9A 3R0TA 2VUWA 5HTBA 3COIA 5HVKA 4DH5A 4FI1A 3JPVA 5LARA 4YZ9A 3ZRKA 3QTXA 1YVJA 4YZNA 2PVFA 2Q0BA 4NCTC 3UNJA 4JG6A 1R1WA 4HVHA 4KS7A 4N57A 3KEXA 4FSUA 2YAAA 3PJ3A 2XYNA 3SV0A 3HAVA 4D2SA 2WMRA 3OY3A 4FSQA 2UZEA 4HYIA 4IHPA 1T46A 1FVVA 3DS6A 3WIGA 3PPKA 3PXYA 2CKEA 4K18A 2GFCA 2LGCA 3Q04A 4NFNA 3QC9A 3DK7A 3Q4TA 4LGDA 3DAJA 4JRNA 4I6QA 4FTIA 2VTTA 4IWPA 4Q5HA 5HNBA 3FYKX 1H25A 3TV6A 5AUVA 3V8TA 4GU6A 3LCOA 5HICA 3VBQA 3VBWA 5A4QA 5FEQA 3DAEA 1UWHA 4W4WA 3OTVA 4ZEGA 3FI2A 4KIKA 3T9TA 4RQKA 3R8ZA 2C3IB 3PVUA 4UWCA 4GVJA 4DT9A 1DI8A 2QONA 2HYYA 1WBVA 4FKOA 3KCFA 1H08A 3MH3A 4PMSA 4XP2A 2QLUA 3EYGA 4JBPA 4KS8A 5DT4A 4ID7A 3LMGA 2RFDA 2YWPA 3FC1X 3P4KA 5AP2A 2IW9A 3PY3A 2CPKE 3DDQA 3ZO4A 2B9FA 2OJ9A 3KA0A 4ZS0A 2YIQA 4JJRA 4JBQA 3VWAA 2XNMA 2FSOX 3RAHA 4F70A 4ANSA 5DPVA 1OPKA 4M12A 3AT2A 2XK7A 4MXXA 4FTNA 1U54A 4ZTLA 2YM4A 4ZTQA 3O2MA 3GXLA 1H1WA 2UVZA 4XOZA 3IECA 1SYKA 1H0WA 3RBWA 3RP9A 2PWLA 3GVUA 3AGMA 3LM0A 3GP0A 4RWLA 2IW8A 5HG7A 2CHLA 2BIKB 2R9SA 4BDCA 2P3GX 4FV8A 1ZYLA 4OT6A 1RE8A 3F69A 3BKBA 5FLFA 3FPQA 2PMIA 4I5MA 4BTFA 4PNKA 4GJ3A 3BCEA 3GC7A 3WZUA 3KULB 3IW5A 1ZY5A 3AXWA 3OCTA 3KQ7A 3E8DA 4FIHA 4MD7E 5IUIA 4OTRA 1XBBA 1KV2A 2JKOA 4G9RA 3JVRA 4XBUA 3UQCA 3BELA 5TF9A 2ESMA 2WQBA 4PPBA 4FEXA 3MA6A 2IZTA 3DKFA 3UG2A 4JQEA 4CLJA 2WAJA 2R3RA 4ZJVA 4PMTA 2QO2A 4UV0A 2UUEA 3QYZA 3UO6A 4ZTMA 4QP1A 5HU3A 4CKRA 2GNHA 3LQ8A 3FAAA 3CJGA 3ORTA 3HNGA 4YLLA 4QQ5A 5LVMA 4AW0A 2GPHA 3CEKA 3O8UA 2UW8A 4DEGA 2OF4A 3IGGA 3QRJA 1F0QA 3EZVA 2CLXA 2VU3A 3EFWA 1YWNA 3LXLA 3C50A 3QCSA 4FIEA 5JSMA 3CIKA 5CQUA 5CEKA 5I4NA 5LMKC 4IWQA 4O7LA 4C4HA 3FY2A 2OBJA 2PZPA 3E3BX 4RLKA 3DKGA 2OFVA 3NVMB 3GQIA 4AT3A 5E91A 4CFNA 3F3ZA 4FTJA 3QD4A 2QR8A 2VWVA 3W1FA 4P7EA 5L8LA 3O51A 5AUTA 2BROA 3HZTA 4XG3A 3LPBA 4ZLOA 4ANOA 4EOIA 5HBEA 1UKIA 2GHMA 3LFCA 2VWYA 4HCVA 4Z55A 4X3FA 2Z7LA 3BBWA 4B8LA 4UY9A 4Z7HA 2BKKA 1YOMA 4BY9E 4F7LA 4C3PA 3QALE 3AQVA 4JI9A 4V05A 1PXKA 2C3JA 3Q2JA 2IZUA 5AEPA 1JVPP 3NNVA 5H8EA 4E20A 3SW7A 2JKKA 4D1SA 4NIFB 3RCDA 2F57A 3ZLSA 2ITNA 4ENXA 2J0JA 4NM3A 4FC0A 3TNIA 5CI6A 3ZFYA 4EK4A 4XMOA 4FTOA 1WAKA 3VC4A 2BZKB 3FZTA 3HMNA 4GV1A 4E5AX 1TQIA 4LL0A 3F5UA 4KABA 4ZZMA 3WF5A 1OZ1A 3TNWA 4X3JA 3K3IA 1KE8A 1CTPE 1PMUA 3NX8A 4KIOA 3QLGA 3DZOA 1BL7A 2Z7QA 5B2LA 5ETIA 3TDVA 5BVKA 3D83A 1YDTE 5IISA 3RK9A 3VBXA 4R7HA 2J0KA 4LRJA 4G31A 2CGXA 3HUBA 4G3FA 5CF4A 4YC3A 1H8FA 3E63A 1FPUA 3HDNA 2OH4A 2W1GA 2R0IA 4O7RA 1OKVA 3N4UA 4ASEA 3QD3A 3CTJA 4XLIA 4RX9A 1FMKA 1KE5A 2PE0A 4J99A 2QNJA 2GDOA 2HWOA 1PXIA 4NT4A 5HESA 3FXZA 5LWNA 4ALWA 1KE9A 1OIUA 3A62A 2FB8A 3DK6A 3KXHA 2WMQA 4NCTA 4YJPA 2OZOA 3PSCA 1UU3A 4HNIA 3UP7A 4USFA 4O7WA 1WBWA 3OCSA 4RC3A 5CLPA 4XS2A 5CVFA 5EW9A 4C58A 3FLQA 3MV5A 2XK4A 3ANQA 4RJ3A 4XLVA 3TN8A 3R83A 4FVQA 1IAJA 5J1WA 1EH4A 4TPTA 3O7LB 4XV9A 4IJ9A 2X0GA 5EFQA 1XH4A 4M15A 3BV3A 2GCDA 4CV9A 3PUPA 2HY81 2WELA 3OG7A 2VWXA 3DTCA 3JUHA 2YLEA 4GVAA 5E92A 2QODA 4Y5HA 3UC4A 4L43A 4QTCA 3OFMA 3VIDA 4Q9ZA 3QRIA 3OHTA 3QF9A 3EN4A 3VF9A 3F66A 3OW3A 2WQNA 3VO3A 3MFSA 5K5XA 1CDKA 5LVLA 1IEPA 4WBOA 4FKIA 1RDQE 5DRDA 4R3CA 2JITA 3QTZA 2J4ZA 4ERKA 1OKZA 2WQMA 4I94A 2W4KA 4PP9A 5FXRA 3IW8A 4FTMA 4L6QA 3LFFA 3NR9A 4RVTA 5A4LA 5LWMA 3HRFA 2Y8OA 2XEYA 3QC4A 3E92A 3C5IA 4QPSA 4CT1A 4J96A 5IA1A 3LAUA 4GUEA 4F7NA 2B1PA 2X8IA 2PYWA 2QHNA 4O6EA 4NL0A 2EXEA 1Q62A 4EH5A 2IVVA 1XWSA 2VX3A 2O5KA 4FG9A 3A99A 4C62A 4EL9A 1SM2A 1H27A 3BYOA 1YOJA 3IQ7A 2ZDUA 3KMUA 4L44A 4UMPA 5C8MA 5IPJA 3UP2A 3KVXA 4IAKA 4X2NA 4ZJJA 5HCZA 3BWJA 4Y95A 2BRNA 2P2IA 4WRGA 4BGGA 2PVLA 4J95A 3KXMA 4P5ZA 2WTKC 5BVOA 5ITAA 4EOSA 3LKMA 4AFEA 3OY1A 3E5AA 3QCQA 4QMWA 1J1CA 5JEBA 5CS6A 4YJRA 2JD5A 4GKIA 5M09A 4JG7A 5AP3A 4ZY4A 3REPA 4M84A 5BMSA 4BBMA 1JSVA 2A1AB 5HD4A 2BPMA 3LMHA 3RM7A 3AGLA 4RC4A 4IAYA 2XJ0A 4TWNA 4MWIA 5JRSA 3CD8A 4Z3VA 1O9UA 4EH7A 2VV9A 1H1QA 5IU2A 5KO1A 5J9LA 2A0CX 5IH4A 2O0UA 3PVGA 5JZNA 3DT1A 5TE0A 5FUTA 3OW4A 4FIJA 4NEUA 4H58A 1JPAA 3Q6UA 1IR3A 5AR4A 3LQ5A 4HJOA 3DBQA 4IX6A 3P23A 4YBKA 1GZ8A 4YHTA 5LMKA 4CMOA 5E8WA 3R00A 4IXPA 3EN6A 3DBEA 2CJMA 3ENMA 1OUKA 2C4GA 5F20A 3ZO1A 5HBHA 4CFUA 4AE9A 4DINA 3COMA 3ZSHA 3QQHA 4EHEA 3TEIA 5E1EA 4EZ7A 2R64A 3CQWA 3F2AA 3P0MA 4F9CA 4R7BA 4RT7A 4FT9A 1M52A 1UNLA 3ZYAA 4D4YA 2CKQA 3EOCA 2UZUE 3R71A 4C02A 3IW7A 2OXDA 3FI3A 3ULZA 3G6GA 2CGWA 3A4OX 3D2IA 4QP8A 3PTGA 3HVCA 3F61A 3R2YA 2W7XA 2GNGA 1QL6A 3DBCA 2C6LA 2XP2A 3E7VA 4RFYA 2C1BA 4RLLA 4X2JA 3FZPA 5EI6A 1ZMWA 5FXSA 4XJ0A 3I60A 4BN1A 2J6MA 1YXXA 2BAJA 3G6HA 5AWMA 3PFQA 4DGGA 5HIBA 4GYIA 4TWPA 1CMKE 4Y8DA 4G6LA 5CU2A 4YJNA 5H9BA 4TYGA 3U55A 3QKMA 3QWKA 4ITIA 5AP5A 4ACMA 5IEYA 4MBJA 5BVNA 3FY0A 5ANGA 5HCYA 4D28A 4XP3A 1L8TA 2Y0AA 5C26A 5AMNA 5HNGA 4ZTSA 5BVFA 4F08A 1VR2A 3VUDA 1E1VA 2VNYA 4WNKA 5F4NA 4BDAA 5AV2A 5CSWA 5DMZA 2Z8CA 3D5XA 4HYSA 3BYVA 2PZIA 3Q9XA 3F7ZA 3TG1A 3AT4A 3RAIA 2P4IA 1U46A 4EJNA 2RL5A 4LM5A 2R5TA 4BICA 5CAUA 4R7IA 2YACA 4MNEA 3MDYA 4FKSA 2C0IA 4G2FA 3HV6A 4Y72A 3BU6A 4HYUA 1YDSE 4UMTA 5ETAA 5DGZA 1REJA 2O2UA 2X4ZA 3R8LA 1KOAA 3ORMA 4LQMA 2Y6OA 3AC8A 4PL5A 4TW9A 4Y73A 5G6VA 4AZTA 1ZOEA 1O6KA 2XYUA 3MI9A 3F3VA 2OICA 2YCQA 2BAKA 2GSFA 2I40A 4M7IA 4WD5A 5TT7A 5I9YA 1JNKA 3SDJA 4FKLA 1IRKA 4O38A 4CFXA 4ACHA 5IMXA 5J7BA 4AT5A 3O23A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2HWP A;  3GT8 A;  5BUJ A;  4QYF A;  5FG8 A;  3OWJ A;  2YAK A;  2ZAZ A;  2GTN A;  2GHG A;  2QOO A;  2ITW A;  2WMU A;  3PRI A;  3I79 A;  4G3G A;  4I6F A;  4NW6 A;  4ANN A;  4BRX A;  4CKJ A;  4FZA B;  2WHB A;  3SRV A;  4L42 A;  4TZR A;  3VAP A;  4EH9 A;  5JFX A;  1B38 A;  2WMS A;  2UW9 A;  4E1Z A;  4YC6 A;  5K4I A;  4DTK A;  3OBG A;  4R78 A;  4BR3 A;  4AUA A;  1ERK A;  2B53 A;  2YJS A;  3U87 A;  4EOR A;  2GNJ A;  2YIS A;  3EL8 A;  2UZV A;  5KHX A;  2VO6 A;  5BQ0 A;  1VZO A;  4YZM A;  3CQE A;  3ZZW A;  4GEO A;  3W2P A;  1MRV A;  4DH1 A;  4YC8 A;  2YIR A;  2WD1 A;  4EK3 A;  2PML X;  1H07 A;  5I9V A;  4FTT A;  4K9Y A;  2G15 A;  1JAM A;  3R02 A;  4H1M A;  5DG5 A;  5AR2 A;  4QYG A;  4F6W A;  1H28 A;  3NRM A;  3HV3 A;  3PE2 A;  2B9I A;  2C0T A;  2XZS A;  2OJG A;  3V5P A;  4M67 A;  3DLS A;  4RZV A;  4O0R A;  4CCU A;  4M13 A;  3CY3 A;  4C0T A;  5FQD C;  5H2U A;  5BYL A;  1S9I A;  3UYT A;  3VON A;  1Z57 A;  2J0L A;  2F2C B;  2EU9 A;  2BUJ A;  2C1A A;  2BDF A;  4G3E A;  4NTS A;  2JKM A;  3QHR A;  3G5D A; 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 3LJ1 A;  1J3H A;  2JLD A;  4IZ5 A;  3BPR A;  4L3L A;  4PDP A;  4CRL A;  1V0B A;  4FEW A;  2ZM3 A;  1VEB A;  3QYW A;  4X3F C;  2ZM4 A;  3LFA A;  4WHZ A;  3VNT A;  3G51 A;  4IEB A;  5HHW A;  4C4F A;  2UW0 A;  2XK8 A;  4MX9 A;  3QRK A;  4USE A;  2NO3 A;  2IF8 A;  5BX0 A;  5CSV A;  3M11 A;  4YHF A;  1ZOG A;  5EYM A;  4S2Z A;  2VX1 A;  4I23 A;  5EYD A;  3CPB A;  4XBR A;  5D11 A;  4E5W A;  2B4S B;  3NNX A;  4K8A A;  3FDN A;  1OVE A;  1JQH A;  3KMM A;  4KA3 A;  4X6R A;  4XG9 A;  5CT0 A;  4EH8 A;  2UV2 A;  3LFN A;  2XEZ A;  3PZH A;  2JBO A;  3DQW A;  3HA8 A;  3R04 A;  2GMX A;  5J5T A;  4XCU A;  2Z02 A;  3GGF A;  4LOO A;  3TUD A;  4GL9 A;  5CF8 A;  2ZYB A;  3AT3 A;  3OWK A;  4CYI A;  3L1S A;  4BCH A;  2HY0 A;  3DB8 A;  3PA4 A;  5BVW A;  5EH0 A;  2W4O A;  2X7F A;  4KKH A;  1JKT A;  3QTS A;  4U44 A;  1W83 A;  4ZY5 A;  2XNP A;  2F4J A;  4V0G A;  5HE1 A;  5FM2 A;  1XHA A;  1YWV A;  5KMO A;  4ZOG A;  4BZD A;  3JY0 A;  5CNN A;  1PXP A;  3ZUU A;  2BRB A;  2PVJ A;  2R3M A;  4KIK B;  2CN5 A;  2PVY A;  3WF9 A; 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