3R8EA

Crystal structure of a putative sugar kinase (chu_1875) from cytophaga hutchinsonii atcc 33406 at 1.65 a resolution
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
b'GMILGIDVGGTSVKFGLVTPEGEIQNATRFMTADWVNGIGFVESMKLEIGNFLKQYPIVKGVGIGWPGLVSLDRTKVILLPNIPSVVNVPIVEILRSEFPHIHFKIENDAKCAALGEYYFGENKRMQTFILLALGTGVGSGVMMNGKLFIGGRGNGTEVGHMLTTRGKSLENQVGINHLIAYTHEQLALDVAKKSSLHTIAELSPKVIADHAAQGDALALAVWADIGTIIGESLVNIVRVMDLNNILLGGGISGAFDYFVPNLKKAMLEHLPTYYTDDMYIGKATLENDAGLLGAAGLIME'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a Hypothetical sugar kinase (CHU_1875) from CYTOPHAGA HUTCHINSONII ATCC 33406 at 1.65 A resolution
rcsb
molecule keywords Hypothetical sugar kinase
source organism Cytophaga hutchinsonii
molecule tags Transferase
total genus 91
structure length 301
sequence length 301
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3r8eA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3r8eA01
3JXUA 3VEOA 5BN9A 2GELA 2Q2RA 2ZWHA 3QMLA 3WQTA 1KAXA 1R59O 3VOVA 4JN4A 1OKJA 3VPZA 2DPNA 3ENOA 3HM8A 2QWRA 4C23A 4BR7A 3GOIA 2F9WA 1TYQA 4M7YA 4JHDA 3BF1A 2YJEA 4BRPA 4H5TA 3H3NO 4AM6A 4BGAA 3TU5A 3EN9A 4ISFA 4EFHA 4H0PA 4B1VA 4FWSA 5LY3A 1JCGA 1SZ2A 1KAZA 3H6EA 4RTFD 3A5NC 3GBTA 5AQHA 4BQZA 3WEEA 4K25A 3CQYA 3VGLA 3CJ9A 2D0OA 5AQKA 3FZFA 3EKUA 2A42A 5AQUA 3VERA 4O8KA 5ADXA 3FZLA 4HTLA 3O1BA 4BC2A 1KXPA 1HKGA 4DHYA 4CZHA 2PBDA 3MN5A 2Q36A 3VGMA 1MWMA 3FE1A 4JD2A 4CZMA 4BRMA 1NGCA 3QFPA 5B8HA 3I8BA 3A0IX 3SLCA 3RSEB 2BTFA 2YCHA 3O1WA 4FO0A 1BWFO 3CQXA 2P9SA 2V52B 3D2EA 5AZJA 5BREA 1NWKA 1J6ZA 2E8AA 4B1WB 4BRQA 1NBWA 2QW9A 1Z05A 2PAVA 3ENHA 3LDLA 5EX5A 2Q0UA 2QXLA 4QS8A 3GDQA 3GL1A 4CD3A 1K8KA 4BRGA 4HWIA 2YHWA 3QBWA 1D4XA 4BROA 4WYBA 2FSKA 3KHYA 3D2FB 4BG9A 1NGHA 3A5LC 4BRDA 4FWMA 5AQGA 3SJHA 5AQRA 1RDWX 5AQMA 3IDHA 3FR0A 4FWRA 3VF4A 3DXKB 3VEXA 3ZX3A 3O08A 1IJJA 1NGEA 3D7EO 2GUPA 1QZ6A 4WQ4A 3ZETA 2P9NB 2Q31A 4H5RA 2W40A 2BUPA 4GY2B 3EL2A 5KQDA 2Q1NA 3CJBA 1V4TA 1MDUB 5JICA 3U9DA 2FF6A 2QWPA 2YHXA 3MN7A 2J4RA 4H0TB 5ELZA 1JCEA 4MLEA 2IVOA 2QWQA 4CBWA 5AQQA 3FLCO 1NGJA 2NZTA 1XQSC 4J8FA 2CGLA 1Y64A 4QS7A 2I7NA 2AP1A 3CHWA 2P9KB 3F9MA 1TUYA 1HJOA 2V7YA 4ISEA 1HUXA 3LDNA 3H46O 1QQOA 4LC9B 1HX1A 1C0GA 2ASMA 4XEIA 5AQOA 1HKBA 3HTVA 3CI5A 4MLHA 3A5OC 4FWPA 2CH6A 4M7XA 3LM9A 4BC4A 5AQSA 1S3XA 5AQTA 4BRFA 4FOIA 3AAQA 3O8MA 1DKGD 4WQ4C 5BR9A 4K42A 3MMVA 2WUSA 5E84A 3FZMA 1U6ZA 4Y0WA 1G99A 5EOYA 5FPDA 3LDOA 5AQZA 2ITMA 2E20A 5FPNA 2ZGYA 3HSCA 3VESA 3UKUA 1BA1A 1NGDA 2FSJA 3DJCA 3M6GA 4M63C 5AQVA 1HLUA 3C7NB 3VEZA 3WQUA 3IFRA 4IZ9A 2D4WA 3OHRA 4L3QA 4BR9A 3LM2A 1ZBSA 1V4SA 1E4FT 1NM1A 3QBXA 4H5NA 3GG4A 5LJWA 4FPAA 2P9PA 4BC5A 2FLOA 3KVGA 4NB4A 4B1XB 2P9LB 4BRLA 2E2NA 5I9EB 3MN9A 2NRHA 3CJCA 3R9PA 3H3OB 2GWJA 1LOTB 5EVZA 4BREA 4BC3A 3LDQA 5KPTA 5JMVA 1CZAN 4IWVA 2I7PA 1GLAG 4CZKA 4BRHA 3H45C 1QQNA 4K43A 2A5XA 4DCHA 2H3GX 4H0OA 4KBOA 5AZJB 1NGIA 3U4LA 3CJ7A 5AQXA 3CETA 4IO8A 3C0BA 3KZBA 3VETA 1T6CA 2E2OA 4DQ8A 3VEVA 1X3NA 2A40A 4BRCA 1YAGA 1YXQA 5BPMA 4IJAA 2E88A 4BVOA 1BG3A 5AFUH 1GLCG 4B1UB 1GLBG 2FSNA 5E26A 3ULEB 2YJFA 3VF2A 4FWKA 3MN6A 5AQNA 4I6MB 2ASOA 3O6WA 2QM1A 1S22A 4CZJA 2VYPA 4H5VA 3QDKA 3A8YA 4EHUA 1QQMA 3RSEA 5KPRA 1YUWA 4H0VB 2FF3B 1XUPO 1E4GT 3GE1A 4B1ZA 2E2QA 2ASPA 2P9IB 3DAWA 4RCHA 4WQ5A 5AQJA 3G25A 3L0QA 5AZIB 2FXUA 5AQPA 3FZKA 4EHTA 1U2VB 3EZWA 3JS6A 4CD1A 3AY9A 4BQLA 3ATVA 3LL3A 3O4WA 4IJNA 1NGGA 3D2FA 4BRIA 5KPZA 1WUAA 1NLVA 3BF3A 4B1YB 5F0XA 4XH1A 4EAHD 1MWKA 3CIPA 1BOTO 2YHYA 3M1FA 3SMPA 4CZEA 4PKIA 5AFUA 5BRHA 1HKCA 3DXKA 4RWTA 3VGKA 3CERA 4CBUA 2P9NA 5CE3A 3ZEUB 2VWBA 2D1KA 3UKRB 4EIAA 4XH4A 1NGBA 3I33A 3QFUA 5BN8A 1NGFA 1ATNA 3BEXA 4PL8A 2QWMA 4BR4A 3QB0A 2ZF5O 2CGJA 1ZC6A 3IMXA 4FOEA 3DXMB 2P9UB 4BRKA 1BUPA 4IXCA 4WQ5C 3ATUA 1TUUA 3VEYA 3H1VX 2P9KA 2CH5A 4MO5A 4FL9A 4E1JA 1C0FA 4FWOA 1TYQB 4JHDB 3WXLA 2HF3A 2E1ZA 1GLLO 4MO4A 2IVPA 3MCPA 2W41A 1T44A 4CZFA 4BR5A 4A2BA 3BUZB 2HOEA 5FPEA 4BGBA 2QWLA 4H0YB 2HMPA 3WXIA 3IUCA 4BR2A 3B8AX 3CJ1A 4FPBA 3WEEB 2IVNA 4JNEA 3EO3A 3U9ZA 4DB3A 1RGIA 5AR0A 1Q18A 4QS9A 1ZXOA 5AQWA 2NLXA 2V7ZA 1DGKN 5JLHA 3R6MA 1GLJO 2ZGZA 5EY4A 5FPMA 2QWOA 4H0XB 3P4IA 1SAZA 3O80A 4JD2B 3H1QA 1GLDG 3M3ZA 4YDUA 5AQIA 5F2RA 3UE5A 1BO5O 3C7NA 1ESVA 4FWLA 4NO7A 3WXKA 3QICA 2P9SB 3D2EB 3LDPA 3ZX2A 4Z94A 4A61A 2P9LA 4FSVA 1JCFA 4CZLA 1GLFO 1NGAA 3EKSA 2V51B 1H1VA 1K8KB 3AAPA 2GEMA 3HBTA 4FWNA 4ISGA 1SQKA 3ID8A 4BRAA 3CJAA 4BRNA 3VF6A 3UB5A 2Q0RA 4CZGA 3U8XA 3R8EA 3BP8A 3WT0A 1YVNA 1XC3A 3WUHA 1QZ5A 3DWLA 3ZETB 4CJ7A 4K41A 2A3ZA 2E1YA 2KHOA 1IG8A 1LCUA 4O5FA 1KAYA 4AM7A 5BRDA 3TPQA 5LJVA 4YDUC 3ULEA 3A5MC 4BG8A 1X3MA 2HF4A 4XH5A 4I6MA 1ATSA 5EXWA 3HI0A 2A41A 3W3DA 3FFKB 1BDGA 3W0LA 3J8AA 1X9JA 5AQLA 1T6DA 1MA9B 4GNIA 3MK6A 3L6QA 2P9IA 3SMSA 3S41A 5AZIA 1WOQA 5BPLA 3VEWA 3FZHA 1U2VA 5BPNA 2YI1A 3O5BA 5AQFA 5BRFA 3AARA 3L4IA 1P8ZA 4BR0A 5KQ8A 3FGUA 2Q97A 5JLFA 4B9QA 2GWKA 4A2AA 4BVPA 1EQYA 4F9OA 1BU6O 1QHAA 2IIRA 4H03B 3SK3A 2CGKA 1Z6RA 5AQYA 4PL7A 2VCPA 3ZX0A 5TKYA 3UKUB 4CBXA 5F1XA 2E2PA 4PKHA 3ZEUA 1RFQA 3UKRA 4JAXA 1ATRA 2A6AA 2D0PA 2QWNA 2OANA 2F9TA 3WXJA 2UYTA 4FWQA 4CI6A 4CZIA 1NMDA 3HZ6A 3MDQA 5ADXH 1DEJA 1BA0A 2GTDA 4A62A 1GLEG 2EWSA 3VENA 2P9PB 4PKGA 1HPMA 4H5WA 3DXMA 2P9UA 2AA4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ELUA 3CC7N 4JI8K 1KSPA 3OYBA 3WQTA 2HHXA 1KAXA 3DLKA 3VPZA 3SV3A 2DPNA 4C8MA 3ENOA 3O3GA 3CCQN 2XRIA 4CF8A 1TYQA 4M7YA 3KK3A 5FRNA 3H3NO 3ZSQA 3NBPA 4JI4K 4CEDA 4CJ3A 3HL8A 2GV9A 5LY3A 1QQCA 1KAZA 4LFAK 2KZMA 2X78A 4H4MA 3FFIA 4K25A 2NNWA 3VA3A 3CCVN 3K9KA 2BANA 4O8KA 3KWGA 5ADXA 1VSMA 3FZLA 3O1BA 3SPYA 2UXCK 1SV5A 4JKGB 4CZHA 3MN5A 4LF9K 4LD0A 3KLHA 1JLFA 1NGCA 4Y1DA 3I8BA 3HYFA 3SLCA 2VG6A 3O1WA 1S6PA 4HTUA 2P9SA 3D2EA 1YJWN 2LSNA 5BREA 2KTQA 1WSEA 1NWKA 4DSKA 1J6ZA 2QW9A 4FJ8A 3ENHA 4KFBA 4OO1J 2Q0UA 3HP6A 2D0BA 1W7AA 4QS8A 1D8YA 1K8KA 4BRGA 3D6RA 3KK7A 3PX0A 1D4XA 3ITHA 4WYBA 3KHYA 3D2FB 3RMBA 2Z1HA 3DLRA 3TAQA 1NGHA 1HQUA 4FLXA 4M3UA 1T05A 1RDWX 4IEIA 5AQMA 2YNHA 4FM0A 1IJJA 3NH2A 3HVTA 2GUPA 4WQ4A 3ZETA 3QEWA 3MEGA 4X66K 3OYNA 3B6OA 1C0MA 1U49A 3OYLA 5KQDA 4AF1A 2GBZA 3PX4A 4DLGA 2O8FA 2J4RA 4MLEA 1Z25A 2ITGA 1NGJA 5K14A 5M1KA 1KVAA 4PUOA 1NJYA 2AP1A 4FJ9A 1YTAA 2P9KB 4ZHRA 1IKXA 1TUYA 1HJOA 4KTZA 4LC9B 4CFAA 1UAXA 4B8AB 2ASMA 5LL6Z 4O4GA 1YJNN 1VSDA 4HUGA 3CI5A 4MLHA 3SQ4A 3AVGA 3MECA 1RDBA 2PY5A 5M1PA 1VQLN 4BRFA 1VQ7N 4QCLA 4FOIA 3AAQA 4Z4IA 3O8MA 2NRVA 3EZ5A 4K42A 3CCRN 1U6ZA 4C8NA 4ELTA 2ZGYA 4JK8A 4CECA 2XY6A 4GV9A 1WSJA 3VEZA 3WQUA 4IZ9A 2D4WA 4L3QA 3ULDA 1NM1A 5D3GA 4DTPA 1N36K 1Q8IA 3GG4A 5LJWA 4G9ZA 5GAGP 1GOAA 3J81O 4NB4A 2P9LB 3TSQA 3SJJA 1RDAA 3RRGA 4FW1A 4K8XA 5EVZA 4BC3A 5KPTA 5HROA 3L2UA 3LWLA 3SBTA 4CZKA 1QQNA 1J54A 3MAQA 1YT3A 1C1AA 4DCHA 4JKDA 4CEQA 5IT9O 1RBTA 3U4LA 1UA1A 4IO8A 3C0BA 1N33K 4M3TA 3VEVA 1QHTA 4IJAA 3DI6A 5AFUH 4JI1K 3N4PA 2UUAK 5E26A 3ULEB 3L2RA 4FW2A 3VF2A 1XC9A 4M3ZA 4FWKA 1FW6A 2F96A 3MN6A 3CCEN 4BDYA 2ASOA 2G8UA 1RTHA 1ZYQA 3KKSA 5C42A 3SQ1A 1VAZA 3A8YA 3ASMA 1QQMA 5GAHP 4H0VB 1XUPO 1E4GT 1S1WA 3AVAA 2E2QA 2ASPA 5AQJA 4WQ5A 3NMUA 3L0QA 2O4GA 5AZIB 4FK4A 4GVEA 3WNEA 2RE2A 3O4NA 1TL3A 1U2VB 1SKSA 3LL3A 4IJNA 2OTLN 1GOBA 1NGGA 4M42A 4BRIA 5KPZA 3CCMN 4B1YB 2OYQA 1MWKA 1QE1A 1BOTO 3M1FA 3J80O 4PKIA 3VQBA 1W97L 4ICLA 1HKCA 3DXKA 3OJUA 4RWTA 3TAEA 4CBUA 4ELVA 2P9NA 2VWBA 3HRGA 2HHTA 4BE1A 1T3VA 3QFUA 3I33A 5CYQA 3OYIA 3CCLN 3TAMA 3CCUN 2QI2A 3ENBA 4PL8A 1C1CA 4CK1A 2QWMA 2G8HA 3SQ2A 3LANA 4GV3A 1KTQA 1ZC6A 3ZSVA 1BUPA 4IXCA 1TGOA 3VEYA 1JLCA 1RT4A 3H1VX 4LSNA 3OA9A 5KI6A 4MO5A 4LFCK 1C0FA 3CFOA 3TANA 3U6FA 1LAWA 2HF3A 2WTUA 2IVPA 3MCPA 2W41A 1ASVA 4YOTA 4DR4K 3CM5A 5FPEA 3V9WA 4O0IA 2QWLA 3TTDA 2HMPA 3LP0A 3B8AX 3MEEA 4MFBA 2YNGA 5AJ3K 3IS9A 1REVA 1RGIA 4DB3A 3HM9A 3KTQA 4QS9A 3LZJA 4FZXC 3CYMA 1ZXOA 5AQWA 1WSGA 5KGXA 5JLHA 3RTVA 5KGWA 3ZLJA 4F8RA 3P4IA 4DV4K 1I3AA 3O80A 3WNHA 4B9SA 1YJ9N 1YITN 4CIFA 3WXKA 4LF6K 4DFPA 1CZBA 2NRRA 3AVJA 3TABA 4A61A 4E1NA 4ID1A 1RTDA 5E41A 2O8CA 2YHBA 4ISGA 1HNVA 2D0CA 3ID8A 3CJAA 3NDKA 1JL1A 1VK0A 3THXA 4DTSA 1X9SA 3KIOA 1YVUA 4CJ7A 1JXEA 2O8EB 5C24A 2KHOA 2RPIA 4J2DA 1LCUA 2OCEA 4JKBA 1CXQA 5LJVA 4DUYK 3SUPA 2QKBA 3HO1A 4YDUC 3LDSA 5MLCQ 1BQMA 3VQPA 4N47A 2XY5A 1UA0A 5HP1A 3SNNA 3HI0A 3I0RA 3W3DA 1HMVA 3FFKB 4DWIA 4QAGA 1U04A 3W0LA 4R79A 5J2QA 5KRSA 3V6DA 5AQLA 1VQ5N 4KAZA 2OZMA 5C0YA 2HB5A 3L6QA 3MK6A 1Q86O 1RNHA 1WOQA 4CFBA 4CJTA 4FVUA 3NHGA 4OX9K 4BE0A 3O5BA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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