3R8EA

Crystal structure of a putative sugar kinase (chu_1875) from cytophaga hutchinsonii atcc 33406 at 1.65 a resolution
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
GMILGIDVGGTSVKFGLVTPEGEIQNATRFMTADWVNGIGFVESMKLEIGNFLKQYPIVKGVGIGWPGLVSLDRTKVILLPNIPSVVNVPIVEILRSEFPHIHFKIENDAKCAALGEYYFGENKRMQTFILLALGTGVGSGVMMNGKLFIGGRGNGTEVGHMLTTRGKSLENQVGINHLIAYTHEQLALDVAKKSSLHTIAELSPKVIADHAAQGDALALAVWADIGTIIGESLVNIVRVMDLNNILLGGGISGAFDYFVPNLKKAMLEHLPTYYTDDMYIGKATLENDAGLLGAAGLIME
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Cytophaga hutchinsonii
publication title Crystal structure of a Hypothetical sugar kinase (CHU_1875) from CYTOPHAGA HUTCHINSONII ATCC 33406 at 1.65 A resolution
rcsb
molecule keywords Hypothetical sugar kinase
total genus 91
structure length 301
sequence length 301
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3r8eA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3r8eA01
1S3XA 4EAHD 3ATUA 3UKRB 3IUCA 3B8AX 5LJVA 4BC4A 3CQXA 3VEXA 2A42A 5BR9A 4BC2A 2IIRA 1C0FA 3ULEA 1MWKA 3FFKB 3CJAA 4BRIA 3CJ1A 2CGKA 2NLXA 2W41A 4BRCA 3M6GA 1QQNA 1H1VA 3FR0A 3LDOA 5AQRA 1TUYA 3D7EO 2E88A 2Q97A 2Q2RA 2FLOA 4BRKA 4BRFA 4RCHA 3A5NC 4AM6A 2FXUA 3A5OC 2P9NB 3R8EA 5EY4A 4FWQA 4DB3A 4EHTA 3DXKA 1IJJA 3F9MA 3H1QA 3QFUA 1HUXA 3AAPA 3G25A 4O8KA 3VGLA 1BDGA 3WEEB 1KAZA 4H5NA 3S41A 3FZKA 4QS9A 4B1XB 4FWSA 4IWVA 3FZHA 4QS7A 2ZWHA 3DXMB 5AQQA 4H0YB 3A0IX 4K41A 1WOQA 2E2QA 2P9LB 3WQUA 3VERA 1SZ2A 2J4RA 4I6MA 4H0VB 1HKGA 3JS6A 3CETA 2P9UB 1JCEA 3UKUB 2VCPA 3QDKA 1RDWX 4EHUA 4ISEA 2ZF5O 3UB5A 2ASOA 3FLCO 3CHWA 1S22A 3HM8A 1SQKA 5BPMA 3H6EA 3IDHA 3QMLA 2P9KB 2QM1A 3GOIA 3VGMA 2W40A 3VEWA 4PL7A 3VEOA 1D4XA 3H1VX 4M7XA 4BRNA 2BTFA 3VEZA 3I33A 4BRDA 3EKSA 1HKBA 3HI0A 3LDPA 4CI6A 2Q1NA 3O8MA 4CBUA 4IO8A 1DEJA 4FWPA 3O80A 5E26A 3A5LC 4A2BA 2QWOA 2ASMA 2BUPA 1TYQB 2E8AA 4NB4A 5AQIA 5EX5A 1ATNA 5AR0A 5AQWA 5AFUA 1SAZA 1WUAA 5AQSA 4A61A 4B1UB 2YJFA 3FZLA 4K25A 3L0QA 1T6DA 2UYTA 4BQLA 1T44A 2P9NA 4JD2B 3LL3A 3QBXA 4KBOA 4WYBA 4BVOA 5BRDA 2GELA 2EWSA 2F9WA 3VESA 2V7YA 1TUUA 2YI1A 4I6MB 3U9DA 1NMDA 2D0PA 3VENA 3TU5A 3ENHA 5KQ8A 3WXIA 1QHAA 4BRPA 4K42A 2YHWA 3MN6A 3U8XA 4BREA 3DXMA 2P9LA 4MLEA 3HZ6A 3QICA 3BUZB 3AARA 3H3NO 1E4GT 2P9IA 1KAXA 4FWNA 3UKUA 4YDUA 4K43A 4XH1A 1X3NA 4BG8A 4CZJA 3O6WA 4CZMA 3KHYA 2YHYA 3VF4A 2A5XA 3A5MC 3GL1A 4Z94A 4B1YB 3P4IA 2P9KA 1ESVA 3D2FB 1C0GA 2GTDA 4HTLA 4O5FA 4CZIA 1V4SA 2HF3A 4IJNA 1T6CA 1YVNA 1K8KA 2GEMA 4L3QA 4PKHA 3H45C 1GLDG 1OKJA 1X9JA 1P8ZA 4CD3A 3MK6A 4CD1A 3W0LA 1BOTO 2QWNA 2H3GX 5I9EB 1J6ZA 1MDUB 2GUPA 2KHOA 4H5RA 3VF6A 2DPNA 3AY9A 2E2OA 2VYPA 2A41A 1TYQA 3WXJA 3DJCA 1X3MA 1GLLO 2FSJA 3ENOA 5AQHA 5FPEA 4CBXA 3KZBA 4IXCA 2IVPA 3MN7A 4IJAA 5TKYA 4BRQA 3J8AA 4JD2A 4BQZA 4WQ4C 1CZAN 3C0BA 4FSVA 4ISFA 2AA4A 3EL2A 3BF3A 3KVGA 1JCGA 4PKGA 4BC3A 4BR2A 2ITMA 4A62A 2Q31A 4F9OA 3AAQA 3MN5A 2P9IB 4JHDB 1GLBG 1KAYA 2E1ZA 3BEXA 3ZX0A 3SJHA 1XQSC 4BRGA 4QS8A 3JXUA 5BN9A 5AQOA 3FZFA 5CE3A 3O4WA 4GNIA 3MMVA 1NGGA 4BVPA 3LDQA 2QW9A 3ZEUB 3ZX2A 3WXKA 2E2NA 5AQKA 4BR0A 1GLJO 5FPDA 2CGJA 1QQOA 3L4IA 3EO3A 4BG9A 1RGIA 3GDQA 3CJCA 2YHXA 4FPBA 3A8YA 3IFRA 4FWMA 5EOYA 4B1WB 2FF6A 5BN8A 1K8KB 1ATSA 2E2PA 4CZHA 2V7ZA 5BPLA 5KPZA 1MWMA 3ATVA 3D2FA 5AQTA 5AFUH 3RSEA 3ID8A 5KPTA 3BP8A 2PAVA 4BR4A 3WT0A 5ELZA 5AQPA 3CQYA 1HJOA 3D2EB 3DWLA 4C23A 5KQDA 5LY3A 4BGBA 3FZMA 4EIAA 4PKIA 3LDLA 2GWJA 1NGCA 1HX1A 3M1FA 2NZTA 3R9PA 1LOTB 3GE1A 3FGUA 4GY2B 1Z05A 3O1BA 5F2RA 4H03B 2ASPA 2IVOA 4FWKA 4PL8A 4DQ8A 3QFPA 1GLFO 1NGDA 5ADXH 3MN9A 2A3ZA 4FL9A 4FWLA 4B1VA 4BR9A 3VEVA 4RTFD 5JLFA 1Q18A 3CI5A 2P9PA 4WQ5A 2D1KA 2D0OA 1NGHA 4MO4A 3WUHA 3SMPA 4JHDA 2AP1A 1U2VB 3QBWA 5ADXA 3L6QA 4XEIA 5F1XA 5JMVA 1ATRA 3W3DA 3GG4A 2FSKA 1QZ5A 1V4TA 1BG3A 3BF1A 3VOVA 1YXQA 1QZ6A 4B9QA 3ZEUA 1BA1A 3UE5A 5LJWA 4CZKA 1G99A 1NBWA 5BREA 1IG8A 3RSEB 2Q0RA 3SK3A 3EZWA 2Q36A 2I7NA 5EVZA 3HTVA 4FOEA 5E84A 4H0PA 3DAWA 3CERA 5AZIA 2NRHA 4H0OA 3FE1A 3LM9A 4FPAA 5BPNA 2PBDA 1NGJA 5FPNA 3CJ9A 4CZFA 4FO0A 1DGKN 4JN4A 5AQFA 3I8BA 2ZGYA 1QQMA 2QWLA 4NO7A 3D2EA 1ZBSA 3MDQA 2YJEA 2QWMA 3EKUA 2P9SB 3CJBA 4A2AA 2E20A 1BA0A 4M63C 4DCHA 1EQYA 1LCUA 2ZGZA 5F0XA 3U4LA 2E1YA 1NLVA 3EN9A 1HPMA 4AM7A 5AZJA 1U6ZA 1NM1A 2P9PB 1NGEA 5JLHA 1NWKA 3VEYA 4FOIA 4LC9B 2Q0UA 4FWRA 4FWOA 5BRFA 4DHYA 3H3OB 2QWPA 1ZXOA 3WQTA 1ZC6A 3ZETA 2CH5A 5AQZA 4BRAA 3U9ZA 2CH6A 3O1WA 3QB0A 5FPMA 3IMXA 4EFHA 3LDNA 1E4FT 4Y0WA 4WQ4A 1U2VA 1KXPA 4JNEA 4BRHA 5AQVA 1MA9B 3O08A 1NGAA 4H0XB 1BUPA 3VETA 1BU6O 4CJ7A 5B8HA 2FSNA 3VPZA 4BR7A 1GLCG 3HSCA 4MLHA 5AQNA 5AZIB 4CBWA 3MCPA 3VF2A 1R59O 2OANA 2A6AA 3SLCA 2V51B 3VGKA 1NGFA 3M3ZA 4CZEA 5AQUA 2IVNA 3C7NA 3ULEB 1BO5O 5KPRA 2HMPA 1XC3A 3UKRA 1GLEG 2HF4A 4H5VA 1GLAG 3ZX3A 2YCHA 1NGBA 3TPQA 1BWFO 4M7YA 5AZJB 2WUSA 5EXWA 4HWIA 2A40A 2P9SA 3H46O 5JICA 4E1JA 2FF3B 1Z6RA 2V52B 2I7PA 4ISGA 1YAGA 1DKGD 2GWKA 5AQLA 4BC5A 3CJ7A 4BGAA 3HBTA 3OHRA 3SMSA 4BRMA 4XH5A 3DXKB 3GBTA 5AQYA 3ZETB 4WQ5C 4MO5A 5BRHA 4H5WA 3WXLA 2QXLA 2HOEA 4BRLA 2VWBA 4YDUC 1YUWA 4H0TB 2F9TA 4IZ9A 5AQMA 3WEEA 4J8FA 1HKCA 1JCFA 4RWTA 5AQXA 3R6MA 4CZLA 3O5BA 2D4WA 1NGIA 1RFQA 4BROA 2CGLA 3CIPA 4H5TA 5AQGA 4CZGA 4JAXA 2QWRA 4B1ZA 1Y64A 1XUPO 2P9UA 4XH4A 5AQJA 3LM2A 1HLUA 2QWQA 3C7NB 4BR5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FLXA 2IC3A 4FLUA 3WNHA 4ZHRA 3PY8A 4RW4A 1RT6A 5BR9A 2QKBA 1SV5A 5LL6Z 1C0FA 3FFKB 3CJAA 3OJUA 3S9HA 2W41A 3AVIA 3ZT0A 4BRCA 2YV0X 1QQNA 3MECA 5AQRA 1M1KO 4M41A 3CF5L 1W97L 2Q97A 3AA2A 1ZBUA 4Z4CA 1NK7A 2OA8A 4MFBA 2FXUA 4MQ3A 3IAYA 2P9NB 3PSIA 4KFBA 3O9RA 5EY4A 4DB3A 4EHTA 1X9MA 3MWPA 4DR7K 3ENBA 2O8FA 1HUXA 3AAPA 1FKPA 4O8KA 1KAZA 3DI6A 3VQ8A 4KB0A 1T3VA 4B9LA 1WOQA 3WQUA 4N47A 1TK5A 3U6FA 2ZJRL 3KD5E 2P9UB 1LWFA 2ATQA 3JSMA 3N4PA 2ZF5O 2ASOA 1RDAA 4KTWA 4CJ5A 2ITGA 3CHWA 1MU2A 3HM8A 3QESA 4CEAA 1HRHA 3H6EA 3IKMA 3IDHA 3I8DA 3NH2A 1CLQA 4UQGA 4M3UA 3LANA 1T8EA 1D4XA 2BTFA 3VEZA 3LP2A 4BRDA 4DF4A 2IAJA 4CJSA 3O8MA 2NNWA 4OPJA 4CBUA 1EO1A 1DEJA 4IEIA 3PO5A 2ASMA 2BUPA 1TYQB 1TKXA 3VTHA 4NB4A 4JRQA 4DSFA 3Q7BA 4V19S 3PX4A 5AQSA 3ZLJA 3FZLA 2XRIA 5HROA 1RT4A 4BQLA 2P9NA 3QBXA 4WYBA 4E3SA 3N4QA 3NCIA 2D5RA 4C8MA 3LZJA 2F9WA 3EE8A 4DSEA 1TUUA 3L2RA 3MXMA 1VSMA 4I6MB 3OY9A 1NMDA 4OO1J 2WC9A 4KI4A 4RW8A 3ENHA 4A57A 5KQ8A 4K42A 1KLMA 2YHWA 1YJNN 4BREA 2NRZA 1U47A 3HYFA 3QICA 4FLZA 3H3NO 2P9IA 4CIGA 4FWNA 4JKAA 4DV1K 2QA4N 1RBTA 4FXDA 3VQQA 4CFBA 4BE2A 2HVHA 4XH1A 1XI1A 1XNRK 4E7KA 4CZMA 4KTQA 3SZ2A 5HRNA 3AO4A 3HOSA 3QEVA 4K8XA 4LY7A 4DG1A 3RMCA 1RNHA 1V4SA 1HQUA 4CZIA 4DMNA 4OLAA 3L2QA 4FVUA 4Y1CA 1K8KA 4PKHA 4AHRA 3NH0A 1GLDG 1X9JA 4CFCA 1P8ZA 1EP4A 5GIPA 4CD3A 4HVJA 4PY5A 5TKWA 4ID1A 2QWNA 4BACA 1MDUB 3OYNA 2DPNA 4U7BA 2A41A 1TYQA 3DJCA 1RBSA 1QTMA 3ZT2A 3HO1A 1XWLA 3KZBA 5HBMA 1TAUA 4FW1A 3OYLA 4CJFA 4IJAA 5C10A 2RE2A 4BQZA 4H4OA 4DU3A 3C0BA 4QAGA 4FSVA 2R7YA 2AA4A 3HK2A 5HRRA 4PKGA 4BR2A 1SKWA 3SUQA 2YNIA 3MX2A 3O9SA 4BRGA 4PA1A 4QS8A 5AQOA 2HB5A 4O44A 3V9SA 2UXDK 2OTJN 3DM2A 4CHQA 5CE3A 3V9UA 3B6PA 3CM5A 1S1WA 2NRWA 2QW9A 4MDAA 3ZX2A 1XMQK 4IOAL 1TL1A 4BWMA 1WNSA 4CJ4A 4DTRA 3THYB 1HNXK 3DLGA 4PWDA 1BL3A 4FWMA 4CJQA 4DSKA 2UU9K 4DFJA 5HP1A 1ATSA 2E2PA 3DOLA 3ATVA 5AQTA 4YOTA 3K2PA 3ID8A 2ZQBA 4BR4A 4CIEA 5ELZA 1D9FA 1HJOA 2DFEA 3KLHA 5LY3A 3LDLA 3MEEA 4JKCA 3OTOK 3DLHA 1X1PA 2O8EB 1QQCA 3K0SA 2FC0A 2WFBA 2WONA 3O1BA 5F2RA 4BE1A 4H03B 3AVCA 4DQIA 3OVNA 2XY6A 4DQ8A 3AO3A 3QFPA 1J9AA 3T1AA 5C15A 2QKKA 2GBZA 5SZTA 4CF8A 5ADXH 4KH4A 4B1VA 4BR9A 3MXIA 3CI5A 4LD0A 1VSEA 4WE1A 3P83D 1U2VB 3QBWA 2LSNA 1KFDA 3GG4A 4FM1A 2NRVA 5JVGL 1V4TA 1VQNN 3QETA 4PUOA 3VOVA 1YXQA 4B9QA 4CK3A 3UE5A 5LJWA 2BE2A 1NBWA 5BREA 3IG1A 2X78A 2Z1HA 2Q36A 4KHPK 1JL1A 3O9QA 1RTHA 5EVZA 5E84A 1YITN 4KREA 3CERA 4I9QA 2NRHA 2B4JA 2IGIA 1ASWA 1P90A 4CZFA 3I8BA 1W0HA 2QWLA 5CR4A 3ZT1A 4AILC 2F8SA 1K6YA 1ZBSA 5A2QO 3T1HK 5J1EA 4FM0A 5J2MA 2W6KA 4ID5A 4IFEA 1D8YA 1EQYA 4LF8K 4JKGA 3U4LA 3EN9A 2DTUA 4GVEA 4E7IA 1X9SA 2VG5A 4A59A 1NGEA 3LAKA 1A5VA 1NWKA 3VEYA 4YORA 3NF9A 2DY4A 2Q0UA 2QWPA 4CVNE 1N36K 3ZETA 3HSTB 1BISA 2CH6A 5HRSA 2HBMA 4DKWA 2HW3A 1S1UA 1E4FT 4Y0WA 1U2VA 4HCCA 4BRHA 1N6QA 1VSDA 3O08A 4H0XB 1BUPA 5MLCQ 3D6RA 4CJ7A 5DK5A 2FSNA 3F73A 3VPZA 4BR7A 1UA1A 3CC4N 4F8RA 3OYHA 2A6AA 3VGKA 5HLFA 3AVJA 3O3GA 5DMRA 4Z4HA 1RTIA 3KD1E 4M3TA 1XC3A 3L3UA 3CFOA 4FLWA 1GLEG 2X6NA 2HF4A 3CC7N 3K58A 1GLAG 3DRSA 3QNOA 2XHBA 4OX9K 3CCVN 1NJXA 1HPZA 1KQSM 3TTDA 2UXBK 4LSLA 1Z26A 1Z6RA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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