3RBWA

Crystal structure of spire kind domain
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
195
structure length
154
Chain Sequence
DALSLEEILRLYNQPINEEQAWAVCYQCCGSLRAAARRRQPRHRVRSAAQIRVWRDGAVTLAPAADQCMETEVIESLGIIIYKALDYGLKENEERELSPPLEQLIDHMANTVEAIRSYRDVMKLCAAHLPTESDAPNHYQAVCRALFAETMELH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Protein binding
source organism Homo sapiens
publication title Structure of the Spire KIND domain and insights into its interaction with Fmn-family formins
rcsb
molecule keywords Protein spire homolog 1
total genus 49
structure length 154
sequence length 195
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF16474 KIND Kinase non-catalytic C-lobe domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3rbwA00
5ANEA 3V6RA 1MRUA 4GIHA 4HW7A 5AUYA 3LM5A 3FLYA 4I6FA 4PX6A 5DPVA 3VWAA 2B9IA 5LVLA 4B8MA 3TUBA 2Y4PA 5CVFA 3HV5A 3MJ2A 3UQGA 4TYIA 5D41A 3GQIA 1UKIA 3GFEA 4ZTRA 4ZOGA 2FA2A 3NIZA 3ZOSA 1NVSA 3KRXA 5AM6A 5LXMA 2RF9A 5AM7A 3PZEA 2X7GA 4FT7A 5JQ5A 2V0DA 5HO6A 1M52A 3LJ2A 1SM2A 2BTSA 3IG7A 2IZTA 2YEXA 2QKWB 2GNHA 4FTRA 4PDPA 3UOKA 4ACGA 4HVGA 4E6CA 2QONA 4YSJA 3VQUA 3SXRA 2WTJA 4YC3A 3O23A 5AAEA 1ZYLA 2OI4X 3FKNA 5FBOA 4FKWA 4CFUA 4ID7A 2J0KA 3VIDA 4ENYA 3FQEA 1H1RA 2R3OA 3KXXA 3ZO1A 3PPKA 3EQIA 1OL6A 5EG3A 2C3LA 2PSQA 5CQUA 2E9PA 3R2BA 5K4IA 3QQJA 3QWJA 4ZY6A 2I0VA 2G2HA 3MPTA 4R1YA 5DA3A 3AGLA 4BI1A 4F99A 2O63A 3O0GA 5D11A 1FPUA 5EOBA 4NM0A 2VV9A 1XH5A 2AC3A 3DOGA 4CLJA 1J3HA 3SVVA 4DITA 2WMSA 5H2UA 4QMOA 3QA0A 3QTSA 4DYMA 2F2CB 4MWHA 3A4OX 5J9ZA 3FLNC 5IEXA 3QYZA 5HVYA 3EN6A 4IVAA 3ZSGA 3R8LA 3I0OA 3EQDA 4OW8A 5I9VA 3FC1X 4IE9A 4P2KA 4AT5A 5HQ0A 3G51A 3NUXA 4FIGA 3NWWA 4FT5A 2JKOA 3JYAA 3FMEA 2FVDA 4FV3A 4D28A 1IASA 2JKKA 2QCSA 2JAVA 2QKRA 4AG8A 3PVUA 2VTQA 2YERA 3PLSA 3QXPA 4XG8A 3V5TA 4IANA 4RVLA 4GEOA 2X4ZA 3RAIA 4WUAA 5CF8A 5HX6A 1R0EA 3BU3A 3PJ1A 5T68A 3ELJA 4RMZA 3CEKA 4JBOA 3ZZWA 2G9XA 2W4JA 2VWYA 4JBPA 3VJNA 2YLEA 4EC8A 4XV9A 3I4BA 3GCVA 2CCIA 3OWJA 2AYPA 3IQ7A 3PSBA 3R9OA 3IDPA 4EUUA 5CU0A 3TCPA 2OU7A 3UIMA 4E73A 3EJ1A 2GHMA 3KVWA 4FEQA 4YTIA 3NNXA 4XMOA 3SHEA 3MY0A 3VO3A 2Y6MA 2YJSA 3GENA 3AC3A 3EHAA 3QFVA 4ZJJA 2E9OA 3A62A 4PWNA 3MDYA 3QQUA 5EW8A 3MH3A 4TWPA 3ZONA 2ZB0A 4QP4A 4O1PA 1H01A 1KE8A 2A19B 3QX4A 1B39A 4IM3A 1WBVA 5HORA 4NSTA 4FSWA 1OKVA 5AUVA 4KBCA 4DINA 4MCVA 3LFDA 4EYMA 4ENXA 4HVSA 3UMWA 4ZZNA 1OM1A 2BVAA 3JVSA 2VTJA 3HZTA 4K2RA 3ENMA 4O0WA 3C13A 4IDTA 3WZDA 3ACJA 4RWJA 5M4UA 3ZO3A 5TOZA 3G0EA 2ITVA 3UIBA 1FMKA 3B2TA 3SW7A 4WO5A 3L8SA 4XP0A 1BL6A 3BLQA 3GCPA 4J98A 3S2PA 3W8QA 4DG3E 2OIDA 1JSUA 2ZMCA 4KS8A 3E8NA 4GT4A 1WBWA 4AZTA 1FVRA 5E1EA 2RFDA 2H34A 3MIYA 1WVXA 3ZRLA 3UZTA 2QVSE 4LRKA 5T6KA 1Q3WA 1FQ1B 4J52A 4X3FC 4D0WA 2IJMA 4X3FA 3AT4A 4U80A 3G9NA 3MJ1A 3CQUA 3NUPA 5DRBA 1HOWA 3HEGA 4I22A 3BU5A 2VTAA 2X8EA 3GGFA 5BUEA 4CLIA 3S00A 4G6NA 2QHMA 1PXKA 4J97A 3ZU7A 4BDIA 3IW5A 2XF0A 3KCKA 4XV1A 3UVRA 4IC8A 3UMXA 4FK6A 1H0VA 5AEPA 2H96A 3ROYA 3FSFA 3MI9A 2PE1A 2X7OA 3GQLA 2PUUA 5HGIA 4U41A 1OITA 3R28A 4Y73A 1V0BA 2PMIA 3W2QA 3VNTA 1YHVA 3DLSA 4GFGA 5L2TA 3GC9A 2HW7A 5FBNC 1R0PA 3EZRA 3GXLA 1A06A 3F5UA 4ZZMA 3LXNA 5E8TA 5LMBA 5EDRA 4BHZA 2W4KA 3MH1A 4X6QC 3VUDA 4ASDA 4F4PA 5TO8A 4IX5A 5I9UA 4C02A 3HDNA 1WFCA 1FVVA 4ZJIA 1YOJA 3A7IA 1H26A 2WMQA 4WNOA 2VNWA 5I5ZA 5DBXA 4KIQA 4WD5A 3EL7A 4YZ9A 3OD6X 3V8SA 4XG9A 1TQMA 5AP0A 4BTMA 2GS2A 4JDIA 2F7XE 3E93A 1TVOA 3SDJA 3POZA 4DAWA 4KSQA 2J51A 2YM7A 4C34A 3W2RA 1Y8GA 4M68A 4YZDA 3OFMA 1U59A 2OIBA 4OTHA 2J50A 3QCXA 4I92A 4RIWA 4QMTA 5LVNA 2IVSA 2YM3A 3SOAA 4V05A 4FV5A 4YJQA 3I6UA 3P9JA 4BGHA 3QQKA 2B52A 3DLZA 5ANKA 3U4WA 3HGKA 2OXXA 4LI5A 5AUXA 2QLQA 5EI2A 3ZO4A 3EQRA 3KB7A 4FICA 4C3RA 2X6EA 5HBHA 5AV0A 4WBOA 4QRCA 3LFEA 2W7XA 3FLQA 3Q96A 4C4JA 1ZMUA 4M69B 4UZDA 5J1VA 2KULA 3MYGA 2ESMA 5M4IA 3S3IA 4C61A 5C03A 5L2WA 4NUSA 1ERKA 3LCKA 2YCRA 4EOKA 2FGIA 4PMSA 2JAMA 5HCYA 4ZK5A 4ZTNA 5AR4A 3AC1A 2YACA 5AR8A 2Z8CA 4XP3A 4D55A 4F1OA 1M7QA 5IF1A 3DB8A 1ZYDA 3QRJA 2XK6A 3VBVA 3ZXTA 2C5VA 2P0CA 4TWCA 3Q53A 4UXLA 4JNWA 1QL6A 2X6DA 4A07A 4USDA 4HPTE 4BF2A 4IWDA 5I9YA 2UZUE 4AAAA 2ETRA 3Q52A 2Y8OA 3C9WA 2VWZA 5LCJA 3PJCA 5IA4A 4CEGA 2C6LA 3VS7A 2JC6A 5J9LA 1UU7A 3R22A 3EH9A 3R73A 4IACA 2OSCA 2C6IA 5KMNA 5CXHA 3UGCA 4M13A 4MF1A 2IW8A 5JMSA 2E9VA 4Y46A 1S9JA 3R7YA 2ZOQA 3L8XA 4UEUA 4C2VA 2A27A 5HHWA 1OUKA 3PXZA 2BILB 5AV2A 2F9GA 4RFZA 5BYZA 3C0IA 4GJ2A 1ZOGA 4LMNA 3VUIA 3IKAA 3Q9WA 4C58A 3CLYA 2PTKA 3I7CA 4FC0A 3GC8A 4FNXA 5JFVA 4U42A 3AC2A 3O8TA 4WKQA 3C4FA 4BBEA 4L52A 3CJFA 2Z60A 2O64A 1UU8A 3DK6A 5LVPA 4DFYA 1Q61A 3L1SA 1GAGA 3FMJA 3MFTA 1KE7A 4F70A 5IPJA 4TWNA 4NH1A 2V5QA 2BAJA 5EM5A 3FY0A 3QGWA 4IDVA 4W4XA 3BCEA 3U6IA 1GY3A 4F09A 3QD2B 4KABA 5KHXA 5I3RA 3KKVA 4FG9A 5J87A 5HBJA 4O91A 4KIKA 4ZTLA 2OICA 3FZSA 4I93A 2GQGA 2C1BA 3T8OA 2WTIA 3LJ1A 1XR1A 1ZOEA 3NRMA 1SVGA 3MH2A 3NAYA 2UZEA 3BRBA 4I41A 2YZAA 2C6EA 5IH5A 3FL4A 3NS9A 3TNHA 3E64A 4D2RA 5GHVA 1R39A 3BYSA 3C51A 1YDTE 3M1SA 2UZVA 2BALA 3BHTA 3BYMA 3Q9XA 2G15A 4PL3A 2JD5A 4RWKA 4LOPA 3V5LA 3CGFA 3E7OA 3BU6A 5GJDA 2QOBA 2YDJA 4IX4A 4EHGA 4FSRA 4AW0A 2UW3A 4MD9E 4I21A 2VZ6A 3AD6A 2PVJA 3QC4A 2RSVA 4WRSA 1O9UA 2YIQA 3MFSA 3RMFA 3ZC6A 1UWHA 4FG8A 4CQEA 5BVNA 4OGRA 3Q32A 1V0OA 2FSLX 4RIYB 4JVGA 2YM5A 2R64A 4YZMA 4G3DA 4C7TA 4HCTA 3AC5A 4G1WA 1JAMA 2P2HA 1I09A 3RPRA 1PF8A 4LOOA 1Q99A 4IWPA 3DBFA 2PZPA 4NEUA 4ZTSA 4B9DA 3QQLA 2H8HA 5CF5A 4PUZA 4ZTHA 5EHYA 5HE0A 4BBFA 3OWKA 5DHJA 3QU0A 2WQEA 2J2IB 3ZDIA 3EFJA 2W1CA 5KKRB 2UW0A 5HCZA 5A3XA 3TKUA 4M3QA 5DRDA 4QP1A 2QC6A 2WEIA 3FUPA 3QD4A 3EQHA 4LRMA 3TNWA 3BQRA 5CEPA 5KHWA 2WU6A 3KY2A 5HIEA 3NW7A 4OTDA 3UNZA 4BBMA 4ACMA 5ANIA 1G3NA 4R1VA 5AWMA 1XWSA 3CE3A 2DWBA 4M12A 3NW6A 3P7BA 4IJPA 4L7SA 4OTQA 2W05A 4XNEA 4FSQA 1OPJA 2WMVA 3PXRA 4ANOA 5HU3A 2R7BA 2WTKC 1QCFA 2ZVAA 4BZOA 5HTCA 3OUKA 3PXKA 4A9TA 4YBKA 4MXYA 4YJNA 5JEBA 4L46A 1XH8A 5HEZA 1LUFA 3ZUTA 2XNOA 2R9SA 2X2KA 4QMZA 2Y0AA 4WNKA 3H0ZA 2RIOA 1GIJA 2UZLA 4U40A 4BI2A 1URWA 3ORZA 4ZY5A 5IDNA 1OECA 3PP0A 2QD9A 2BKZA 2JLDA 3Q4TA 3OTVA 4ZSEA 3ODZX 4AGDA 2W1EA 3EWHA 4W8EA 2W1ZA 5GZAA 3PE1A 4FKJA 3OS3A 5AV3A 5FXSA 1OIRA 1YXXA 3CCNA 1H1QA 4PMMA 1ZWSA 5I4NA 3VC4A 4FL2A 3D7ZA 2XK8A 3A61A 5B2KA 4F1TA 2YCSA 3Q2MA 3GT8A 5FD2A 3EB0A 3ZFXA 4C3FA 5BUIA 4O0TA 5IZFA 5HOAA 1H1WA 4FKTA 4YLJA 1ZAOA 3AC8A 2BDFA 3F69A 3E8CA 4QO9A 4RVTA 4U45A 4UXQA 3DFCB 4BB4A 3PG3A 4E4LA 2EWAA 3KRRA 4U44A 2C0TA 4RC2A 4YJVA 3OT8A 4CFMA 1VR2A 2OF4A 5IG1A 4YJPA 4IAIA 4D0XA 4O2PA 2ZV8A 3KMUA 3FC2A 1Q8UA 5A4TA 5EI8A 5JFSA 5GNKA 4J99A 3MVJA 1W98A 2WD1A 4DEGA 3A7HA 4PNKA 4JX3A 5FM2A 2GFCA 3ALOA 4OR5A 5CSPA 5L3AA 3OXTA 5D10A 5EFQA 2XNBA 4F0FA 2ZV9A 2QG5A 5J1WA 3ORNA 4JDKA 2ZYBA 4FVRA 4E5BA 1M14A 3D5VA 3LFNA 2X8DA 2B4SB 4HGSA 2A0CX 2ITYA 4I5HA 4AN2A 4BCIA 5HKMA 1H28A 1T45A 4FIEA 5J95A 4ZXTA 4DFLA 5AR2A 2ITPA 4GT3A 3ZRKA 4EOOA 5G6VA 4CV8A 4JT3A 2Y9QA 2CGUA 4JXFA 4G3GA 2XUUA 4V01A 5CAUA 4D2SA 2PWLA 4HOKA 4ZZOA 3I79A 2ZM1A 4MH7A 3A8XA 3ZXZA 4CTCA 3KXGA 1YKRA 1CDKA 3W2PA 1J1CA 4E4XA 5BMSA 3DQXA 3R7VA 5ACKA 4DGOA 3I5ZA 4NIFB 1YI6A 3CJGA 4XEYA 4TL0A 5J79A 2XNGA 4FBXA 4GFMA 2OO8X 3PY3A 4FTMA 4NKSA 1KOAA 5CS6A 2WOUA 5DE2A 3FBVA 4RA5A 4E4MA 3SRVA 4FL1A 3ZLYA 3NW5A 4GIIA 3DK3A 3VW6A 3Q04A 4F6SA 4FKIA 3DKOA 2OXYA 4MNEA 5E8UA 3R9HA 1ZYSA 4HZRA 3LFQA 5CAPA 1K2PA 5LOHA 5EYMA 2HELA 5F4NA 4M0ZA 4O6LA 4QTBA 1VJYA 3FL5A 5KBRA 4O2ZA 4BDAA 1H25A 4YBJA 2EB2A 3WE8A 3FLSA 4YPDA 1AQ1A 4IB3A 5A4QA 4MBIA 4K9YA 3P79A 4M84A 4W9XA 4ZJVA 4UMUA 2HZ0A 3EZVA 4D2PA 3IONA 1MRVA 3ZHPC 1RQQA 4APPA 5A4CA 2BZHB 2X2MA 3HYHA 4I24A 3IGOA 5ACBC 3NUUA 4PL5A 2WKMA 3QTQA 4BRXA 2NP8A 4BL1A 4G6OA 3RWPA 4QYHA 2GTMA 2CN8A 1OGUA 5FDXA 2XJ2A 3ZH8A 4YURA 2YN8A 3TV4A 4MX9A 2B54A 2O0UA 2XBAA 3NPCA 4MXCA 4HZSA 3HECA 1RDQE 1KOBA 2UW7A 5KMKA 4FVPA 2YHVA 2BRBA 2ZAZA 4AZFA 3VBXA 2X7FA 4OAVB 4KAOA 2XM9A 3ZLWA 2VX1A 3CD8A 4GFOA 4XG7A 3LE6A 4K11A 2X1NA 2JITA 5EW9A 5C8MA 3QTIA 3BV3A 2HW6A 4JOAA 4IJ9A 4MAOA 3TJDA 3L8VA 4W9WA 4H58A 3L9PA 1M17A 3MFUA 3GOKA 2OJIA 2XK7A 3TJCA 2I1MA 3D2KA 3L9LA 4FZFB 3SW4A 3TKIA 5KMOA 3ZM4A 3GC0A 3R7EA 1W84A 2BAKA 2QI8A 2XCKA 1XHAA 4XHKB 3ORMA 2BFXA 4GYIA 4C59A 3KCFA 4FOBA 3R7GA 4ZTQA 3G6GA 3C4ZA 4TYJA 1PXPA 4AZWA 4G6LA 4EBVA 4YJOA 4FTUA 3WOWA 3KGAA 5JN2A 2W1DA 4UB7A 4ZIMA 4G5JA 3H10A 5CTPA 5BX0A 5I9ZA 3R8MA 4V0GB 4XG4A 3TIYA 3KRJA 5FTOA 4OBQA 2CDZA 4RX5A 5JH6A 2WMRA 1YVJA 4BKYA 2C6TA 4EH9A 4G3FA 2WO6A 2R3IA 1NVQA 4RX8A 3CQWA 4ZY4A 2FO0A 2JKQA 1LPUA 3UZPA 3KEXA 2SRCA 3DPKA 3CTJA 4U5JA 3UQCA 3OEFX 4YLKA 2EB3A 4Y83A 3NIEA 3ET7A 4I6HA 5DEWA 3MTLA 4EK5A 4F9AA 3FV8A 2A4LA 3OC1A 1Q97A 4ANLA 4I0RA 4APCA 4Y72A 4XV2A 4EKKA 3DAJA 3D5XA 3LIJA 2YITA 2ZV2A 4IX3A 4BCOA 4YZCA 2J9MA 3CKWA 3LOKA 4CRLA 3RPYA 4EWHA 4ALUA 4RFMA 3BGPA 3AD5A 3BZ3A 3NYNA 4RWIA 1OPKA 4X6RA 2VO7A 4LUDA 2OFUA 3ANQA 4G5PA 5AP4A 2C68A 4R6VA 3P0MA 4N6ZA 3HVCA 5HD4A 2C5OA 2FSMX 4QYGA 5LJJA 4MXOA 5TT7A 2V55A 1XH6A 2CGWA 4R7HA 4YNOA 3Q4ZA 3LCSA 3FHRA 3TNIA 1OKZA 4FTIA 5EHLA 3TZ8A 4U9AA 5LCKA 3VBYA 4TYHB 2Z7RA 4CYIA 1PHKA 4XJ0A 4I5CA 4X7QA 4NM5A 5HICA 5AUZA 3U4UA 4BCQA 2R3GA 3F2NA 2HAKA 2IWIA 5JRQA 3S4QA 3FYJX 4XYFA 5AV4A 1IR3A 3QTRA 3UOLA 3NGAA 4CQGA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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