3RG4A

Crystal structure of the w5f mutant of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HFGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Structure and catalysis by carbonic anhydrase II: role of active-site tryptophan 5.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 68
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3rg4A00
1CAKA 4GL1X 3M2NA 4Q8YA 1HEBA 2NN1A 1CAJA 3M5TA 5FL4A 3TVNX 2HOCA 1BNTA 1CAZA 1G1DA 3NJ9A 4QJXA 4JSSA 1G52A 4QK3A 2X7UA 3N4BA 3MNKA 4ZAOA 4WL4A 4BCWA 4E49A 4E3HA 3M5SA 3RZ7A 2HNCA 4KNJA 4RIVA 1CANA 1CA3A 1CAHA 1CRMA 5HPJA 3HKUA 3M2ZA 5CJFA 4E3GA 4CQ0A 1CAYA 4JSWA 1CVBA 1FR7A 2HKKA 5SZ5A 3V3IB 1CVAA 4BF6A 4R5AA 4HT2A 1DCBA 3T84A 1IF8A 1IF9A 4K0ZA 4E4AA 4WUQA 1UGAA 4BF1A 2OSFA 3P55A 4FIKA 4Q9YA 2VVAX 5AMLA 5JEGB 3S74B 2CBBA 3RYJB 4Z1NA 2ZNCA 5FL6A 4DZ9A 4MDLA 1TH9A 4QJOA 4MTYA 5JGSB 1ZGEA 5E5RA 5BRVA 4XE1A 6CA2A 1ZFKA 4KNMA 2FOVA 1G46A 1UGFA 5CA2A 2NNSA 3M67A 4LHIA 1G0EA 1CILA 5FLOA 1FQRA 1BNQA 3HKNA 4JSAA 1CINA 1UGEA 1CCTA 3P5LA 1OQ5A 3CAJA 3CZVA 3OY0A 1IF6A 2Q1BA 4ITPA 3DC3A 5EKMA 4Q7SA 3OIKA 3RYVB 1ZFQA 2EZ7A 3MNAA 1JCZA 2NXRA 1DMXA 4CNVA 4M2UA 1CCSA 1BICA 3MMFA 1KEQA 4HU1A 1CRAA 2FMGA 4Q6DA 3GZ0A 1Z93A 1TG9A 12CAA 4PXXA 5SZ6A 2HFWA 5JEHB 5CACA 3DCWA 3IBUA 3U7CA 5DOGA 3S97A 1IF5A 1CVCA 2VVBX 3NB5A 3D92A 4DZ7A 1FQMA 3FW3A 3OILA 5EHVA 2CBEA 3OYSA 4YXIA 1G0FA 2FOYA 3DVCA 2CBCA 5DSOA 2ILIA 1KOQA 5FNHA 5JESB 1RJ6A 1CVEA 3W6IA 1BNUA 5SZ1A 1G3ZA 3P3JA 2Q38A 3Q31A 3N3JA 5G0CA 4R59A 5EIJA 3RLDA 3V7XA 3EFTA 3DCSA 4Q07A 4UOVA 4RIUA 5E2KA 1G54A 1G4JA 4Y0JA 5SZ0A 1CAMA 1RZEA 2WEHA 3U47A 1DCAA 1YDDA 1RZAA 1RZBA 5FDCA 3RYXB 4RH2A 2FOUA 4RFDA 1UGDA 1ZH9A 1MUAA 4QIZA 4RUYA 5L3OA 5CLUA 3KS3A 1FSNA 3N2PA 1BV3A 3P58A 4MDMA 3MNHA 4M2RA 4Q0LA 5EZTX 1CIMA 5FLQA 4ZWYA 1YDCA 1UGCA 4KNIA 5JQTA 3M1WA 2H15A 3S78B 1URTA 1I9NA 5DSKA 3S72B 1TEUX 2NNGA 1JD0A 1FSQA 1XQ0A 1UGGA 4YXOA 1XPZA 4ZX1A 3DA2A 3JXFA 4PYXA 2QOAA 4QIYA 4QJPA 1IF7A 1CZMA 3MHLA 3ML5A 3MYQA 1CVFA 3C7PA 7CA2A 3DVBA 4RFCA 3R17B 1A42A 3D93A 1ZGFA 1I8ZA 3MHMA 5BYIA 3IBNA 1XEGA 4Q90A 4YHAA 4CNXA 1Z9YA 3DVDA 5EOIA 4M2WA 3MNJA 2NXTA 4Q8ZA 2O4ZA 4YGKA 4N0XB 1OKNA 3P3HA 4XFWA 5FNIA 1G45A 3FE4A 3RZ0B 4K13A 4C3TA 5DSMA 2NWPA 4WUPA 4KV0A 1KWRA 5G0BA 3KWAA 4YGFA 1TTMA 3OYQA 4Z1KA 5JQ0A 5DVXA 2FOQA 2X7SA 4L5VA 5E2SA 4YGNA 3DCCA 1ZNCA 1BN3A 2CABA 3F7UA 4M2VA 1H9NA 5JEPB 5BRUA 3HLJA 3RYYA 3M2YA 4MLTA 2HD6A 5FNJA 4G0CA 4MLXA 3DD0A 1YO2A 3U3AX 3P5AA 5EKJA 5FLRA 3RZ5A 3HKQA 5SZ2A 3IBIA 4RUZA 1OKMA 4ZWZA 5E5UA 3UYNA 4E3DA 4Q99A 3OKUA 2FNKA 2NNOA 2CBAA 1BNVA 4CA2A 3P4VA 3DBUA 4HEZA 3KLDB 3VBDA 3ZP9A 4Q6EA 3T83A 2FNNA 3PYKA 5DSRA 1HEAA 3TVOX 3RG3A 4QSBA 5E2RA 4KUVA 5L6KA 3BL0A 3EFIA 8CA2A 1CAIA 2WD2A 3LXEA 4HBAA 3S71B 1CNCA 4YYTA 2H4NA 1LG6A 3KNEA 5AMGA 3UYQA 3JXGA 4E5QA 3T5ZA 1LGDA 4N16A 3HKTA 5IPZA 1AM6A 2FOSA 3M5EA 1DMYA 1I9LA 3M40A 4JSZA 3T85A 3M96A 3IBLA 1RAYA 3V3JA 1LUGA 1HVAA 3K34A 3M1KA 1JV0A 5FNLA 4XIWA 3V3GB 5SZ3A 3CYUA 1THKA 5EH7A 2QP6A 5EKHA 4Z0QA 4ZX0A 4YWPA 4FVNA 2NNVA 4K1QA 5EHEA 2F14A 4KP5A 2EU3A 3MDZA 4Q06A 4ZWXA 1RAZA 2CA2A 3V2JA 2POVA 1FLJA 5DSNA 2POUA 1BNWA 3RZ8A 5FLSA 1CNIA 1I9PA 3S9TA 4R5BA 4ZWIA 4WR7A 4QJWA 4COQA 1CNYA 1G48A 3M2XA 3M1JA 4YGJA 3MWOA 1J9WA 1YDBA 3S73B 4Q09A 3D9ZA 4ITOA 3RYZA 2W2JA 3L14A 1CNKA 1RZCA 3RGEA 3HFPA 1ZSBA 1KWQA 4Q49A 4FPTA 4YXUA 2GEHA 4QEFA 1FQNA 1I90A 3MNUA 5LMDA 1RJ5A 5JG3B 4XIXA 4HEYA 3MHCA 1T9NA 5DSPA 1HCBA 3KIGA 4FRCA 4Z1JA 4WW8A 1YDAA 1HECA 1Z97A 4Q78A 4QY3A 4WW6A 2AX2A 1ZSCA 2QO8A 4CNRA 3RJ7A 5DSQA 3N0NA 3MHIA 5E28A 5FNKA 5DSJA 3S75B 5BRWA 4TWLA 3M14A 5JG5B 5E2MA 3KONA 4K0SA 4XZ5A 3T82A 1G6VA 1FSRA 1ZSAA 3ML2A 1MOOA 4HT0A 5SZ7A 3B1BA 3MNIA 4JS6A 4HF3A 1UGBA 4QSIA 1OKLA 1TE3X 4KP8A 3BL1A 1BCDA 3DAZA 2WD3A 3TMJA 4KUWA 4PZHA 3CA2A 3DD8A 3SBHA 2X7TA 3OKVA 2GD8A 4RN4A 1V9IC 4QJMA 2HL4A 2FMZA 4FU5A 5DRSA 2POWA 2WEOA 3SAPA 3IEOA 5JGTB 1ZE8A 3DC9A 3PO6A 1BN1A 2WEJA 3KOKA 3S76A 4QTLA 1CAOA 4QSJA 1CALA 1CNJA 3M3XA 4FL7A 4KNNA 1I9OA 3B4FA 4PQ7A 4Q7WA 5A25A 1HCAA 5FDIA 1I9QA 4Q7VA 3F8EA 4Q08A 1H4NA 1AZMA 1BZMA 5C8IA 1Y7WA 5J8ZA 2NWYA 1TEQX 1CNHA 4ILXA 1HUHA 1H9QA 5FNGA 4Q83A 1RZDA 1XEVA 5SZ4A 1FR4A 2NWOA 4MO8A 5DOHA 3JXHC 4X5SA 5EHWA 4KUYA 4Q81A 3D0NA 5FLPA 3MZCA 2EU2A 4HEWA 3V2MA 4YVYA 4L5UA 1YO0A 3M04A 4IWZA 3SAXA 1TB0X 3HS4A 3FFPX 2OSMA 4PYYA 3OIMA 5FNMA 1LZVA 4LP6A 3P44A 5DSLA 1G53A 2ABEA 4L5WA 1LG5A 3M98A 3S77B 5G03A 4Q87A 3D8WA 4CNWA 2NWZA 5A6HA 3RG4A 5AMDA 5EH8A 1CA2A 4Q8XA 1HUGA 3KOIA 1G4OA 2CBDA 3F4XA 1YO1A 4K0TA 9CA2A 1BN4A 3V3FA 3T5UA 4YX4A 1CNGA 2AW1A 1I91A 1CNXA 1CVHA 2FNMA 5DSIA 5EH5A 3M1QA 3ZNCA 1TG3A 4KAPA 1I9MA 4CACA 1EOUA 1IF4A 3QYKA 4Q7PA 3W6HA 2FW4A 4G7AA 3V3HB 3IAIA 1CCUA 1TBTX 2WEGA 3F7BA 3IGPA 3R16A 3V5GA 4QK1A 1F2WA 4ETQC 1KOPA 4TWMA 4E9OX 1CVDA 2Q1QA 2NN7A 4E3FA 3KKXA 3U45X 4IDRX 4FVOA 4LU3A 3RZ1B 3K2FA 3SBIA 2NXSA 4MDGA 3NI5A 5JDVB 5BNLA 1V9EA 3PJJA 3DV7A 5E2NA 4Z1EA 1AVNA 1FQLA 1HEDA 2IT4A 1BNMA 3MHOA 1BNNA 4QSAA 3K7KA 5FLTA 4YGLA 3S8XA 4QK2A 5FL5A 4QJ0A 5G01A 2NMXA 1CNWA 4RUXA 1CNBA 3BETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CAK A;  4GL1 X;  3M2N A;  4Q8Y A;  1HEB A;  2NN1 A;  1CAJ A;  3M5T A;  5FL4 A;  3TVN X;  2HOC A;  1BNT A;  1CAZ A;  1G1D A;  3NJ9 A;  4QJX A;  4JSS A;  1G52 A;  4QK3 A;  2X7U A;  3N4B A;  3MNK A;  4ZAO A;  4WL4 A;  4BCW A;  4E49 A;  4E3H A;  3M5S A;  3RZ7 A;  2HNC A;  4KNJ A;  4RIV A;  1CAN A;  1CA3 A;  1CAH A;  1CRM A;  5HPJ A;  3HKU A;  3M2Z A;  5CJF A;  4E3G A;  4CQ0 A;  1CAY A;  4JSW A;  1CVB A;  1FR7 A;  2HKK A;  5SZ5 A;  3V3I B;  1CVA A;  4BF6 A;  4R5A A;  4HT2 A;  1DCB A;  3T84 A;  1IF8 A;  1IF9 A;  4K0Z A;  4E4A A;  4WUQ A;  1UGA A;  4BF1 A;  2OSF A;  3P55 A;  4FIK A;  4Q9Y A;  2VVA X;  5AML A;  5JEG B;  3S74 B;  2CBB A;  3RYJ B;  4Z1N A;  2ZNC A;  5FL6 A;  4DZ9 A;  4MDL A;  1TH9 A;  4QJO A;  4MTY A;  5JGS B;  1ZGE A;  5E5R A;  5BRV A;  4XE1 A;  6CA2 A;  1ZFK A;  4KNM A;  2FOV A;  1G46 A;  1UGF A;  5CA2 A;  2NNS A;  3M67 A;  4LHI A;  1G0E A;  1CIL A;  5FLO A;  1FQR A;  1BNQ A;  3HKN A;  4JSA A;  1CIN A;  1UGE A;  1CCT A;  3P5L A;  1OQ5 A;  3CAJ A;  3CZV A;  3OY0 A;  1IF6 A;  2Q1B A; 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