The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
|
sequence length |
67
|
structure length |
67
|
Chain Sequence |
GPLGSGRMRVKAIFSHAAGDNSTLLSFKEGDLITLLVPEARDGWHYGESEKTKMRGWFPFSYTRVLD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain from IRSp53 (BAIAP2)
rcsb |
| molecule keywords |
Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
15
|
| structure length |
67
|
| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-04-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HSQ A; 1NG2 A; 5IHI A; 2CUD A; 1H8K A; 4AG1 C; 3M0R A; 2JM8 A; 2YUN A; 3VS3 A; 1NLO C; 4OMM A; 1RI9 A; 2NWM A; 3UF4 A; 2QDL A; 1X6G A; 4LUE A; 3ZL7 C; 2C0I A; 3KFV A; 1B3Q A; 1PRL C; 2EYZ A; 4F14 A; 2VVK A; 3U23 A; 1UHC A; 1ZSG A; 3LH5 A; 3ULR B; 2AZV A; 2CDT A; 4J9H A; 2AKL A; 1ZUU A; 2LX7 A; 1J3T A; 2SEM A; 4RTT A; 2DL5 A; 3NHN A; 4ESR A; 4RTY A; 4FSS A; 4J9I A; 4K11 A; 1KIK A; 1PKT A; 1EFN A; 3EG1 A; 2DNU A; 1NM7 A; 2EYY A; 2ROL A; 3H0H A; 1BU1 A; 2W10 A; 1UJY A; 3H0F A; 2HSP A; 2MCN A; 2F2V A; 4Z88 A; 2DA9 A; 1X27 A; 2BZ8 A; 4Y92 A; 4AFQ C; 2EPD A; 1WXT A; 1KJW A; 1K9A A; 1WFW A; 2L3S A; 2ENM A; 1VYT A; 2FRY A; 1Y57 A; 1UE9 A; 2DIL A; 2RQU A; 2JXB A; 2H8H A; 2YDL A; 4R0K A; 1QCF A; 3M0P A; 3M0T A; 1OPL A; 1OV3 A; 1E6G A; 2CT4 A; 1YP5 A; 1UEC A; 3C0C A; 2JMC A; 2W0Z A; 3M0Q A; 2JS0 A; 1H3H A; 4D8D A; 2RNA A; 1K0X A; 2BTT A; 2DJQ A; 1WLP B; 2D8J A; 4IIM A; 2B86 A; 1AWW A; 2HEQ A; 2L3P A; 1LCK A; 1PWT A; 4JJC A; 1TG0 A; 2RMO A; 2FPE A; 1AWO A; 2O9V A; 4QT7 A; 1OOT A; 2KXD A; 2DL8 A; 2I0N A; 2CRE A; 2EW3 A; 5GJW B; 2CH4 W; 2D8H A; 2L3Q A; 1T0H A; 2FPF A; 3EG3 A; 3VS4 A; 4X1V A; 1CKB A; 2J6O A; 4JZ4 A; 1K0S A; 5GJV B; 2DL7 A; 2ABL A; 4RTX A; 3I5R A; 1YWP A; 2YSQ A; 1GCQ A; 3SEM A; 2L0A A; 4LN2 A; 1GBR A; 4JPB W; 4ZNX A; 2NUZ A; 1K76 A; 3H41 A; 1WA7 A; 3M0S A; 1KFZ A; 1ABO A; 2KRM A; 3VRZ A; 2J06 A; 5IXF A; 2AKK A; 1BBZ A; 1Z9Q A; 1OEB A; 2ED0 A; 4J9E A; 2RF0 A; 3VS5 A; 1ZUY A; 1AWJ A; 1W1F A; 3CQT A; 2OJ2 A; 3EHQ A; 2LMJ A; 2GQI A; 2IIM A; 2KRS A; 1VYU A; 1NYG A; 2KEA A; 2DYB A; 2KYB A; 4CC4 B; 1HD3 A; 1QKX A; 2KBT A; 4J9C A; 2A36 A; 5IXB A; 2LQN A; 2C0T A; 4HVW A; 2DVJ A; 1CKA A; 2K9G A; 2J05 A; 2M51 A; 5IH2 A; 2K79 A; 2D1X A; 2YUQ A; 1UDL A; 1X2Q A; 1WDX A; 1WI7 A; 3NGP A; 3QWY A; 2MOX A; 4IIO A; 2O31 A; 4JZ3 A; 5FW9 A; 1HJD A; 4OMQ A; 2JT4 A; 1SSH A; 1VA7 A; 2LJ3 A; 5FWB A; 3VS1 A; 4F16 A; 2YUO A; 1X69 A; 1T0J A; 2M0Y A; 1JQQ A; 1G83 A; 4AFU C; 2L2P A; 3EG2 A; 4CC7 A; 1GCQ C; 2P4R A; 1MUZ A; 2KGT A; 1KSW A; 1NYF A; 4GBQ A; 1WXU A; 2KT8 A; 4LE9 A; 1Y0M A; 2CT3 A; 1T3S A; 3RNJ A; 2EYX A; 1SHF A; 1UHF A; 3I9Q A; 1OPK A; 4HXJ A; 1AWX A; 2DF6 A; 1MV0 B; 2CH4 A; 4J9B A; 4KRT A; 1SEM A; 1RLQ C; 1FYN A; 2F2W A; 4RTW A; 3GBQ A; 5EC7 A; 1YCS B; 1SRM A; 3H0I A; 3VS7 A; 3JV3 A; 1ZBJ A; 1JEG A; 4GLM A; 1GCP A; 2DRK A; 2EQI A; 2LJ1 A; 3A98 A; 4DEX A; 2HCK A; 2RQW A; 1GFD A; 3TVT A; 2RPN A; 2EYW A; 2K3B A; 1XOV A; 4EIK A; 2LJ0 A; 1U06 A; 4RUG A; 4HVV A; 3NMZ C; 1X6B A; 2ED1 A; 2KRO A; 2EGA A; 1GL5 A; 3VS2 A; 1K4U S; 4OML A; 2OI3 A; 2PZ1 A; 1E6H A; 1ZX6 A; 1JO8 A; 1PRM C; 2EGC A; 2LNH B; 3PVQ A; 2K6D A; 2EVR A; 1AEY A; 5I11 A; 1YN8 A; 2GGR A; 1U3O A; 1VYV A; 2A08 A; 2OAW A; 3PVL A; 1QWE A; 2A37 A; 2O9S A; 1NEG A; 4J9F A; 1GBQ A; 1B07 A; 1NEB A; 1M30 A; 2ESW A; 2CUB A; 1UG1 A; 5FWC A; 2DL3 A; 4LNP A; 1U5S A; 2F2X A; 4HCK A; 5IHK A; 1YWO A; 1FMK A; 1IO6 A; 1WYX A; 1M3B A; 2CSI A; 2J6F A; 5I22 A; 4OMN A; 3UAT A; 1N5Z A; 2RQR A; 4Z89 A; 4CC2 A; 1RUW A; 1UTI A; 1UGV A; 2DM1 A; 2FPD A; 3EG0 A; 2EGE A; 4JJB A; 2KYM A; 3RBB B; 1UJ0 A; 4A63 B; 3VS0 A; 2EBP A; 4CC3 A; 3REA B; 4J9D A; 1SRL A; 3M0U A; 2C0O A; 1X43 A; 4JJD A; 1E7O A; 1CSK A; 1UFF A; 1X2K A; 4J9G A; 1S1N A; 3TSW A; 1AOJ A; 1TUC A; 3VS6 A; 1RLP C; 2JM9 A; 2KE9 A; 5IHN A; 5HCK A; 1YNZ A; 2DMO A; 1WXB A; 2LCS A; 2KRN A; 4OMP A; 1G2B A; 2KNB B; 1JXO A; 1PKS A; 1JXM A; 1ZLM A; 3I5S A; 1M3C A; 3TSZ A; 2FRW A; 2LZ6 B; 1PHT A; 3FJ5 A; 1H92 A; 2DX1 A; 2V1Q A; 4AG2 C; 2GNC A; 2LQW A; 3UA7 A; 1QLY A; 2DL4 A; 1AVZ C; 1W6X A; 2RQV A; 4ORZ A; 1Z9Z A; 1QKW A; 3IQL A; 4RTU A; 1AD5 A; 3O5Z A; 1I07 A; 2V1R A; 2GTO A; 2K7A A; 1AZE A; 1I0C A; 1M8M A; 2G6F X; 2KT1 A; 1A0N B; 2FG0 A; 1M3A A; 2KXC A; 2O88 A; 4M4Z A; 1ZUK A; 3EGU A; 2EKH A; 1BB9 A; 3R6N A; 2JS2 A; 1M27 C; 1NLP C; 2X3W D; 5ECA A; 2YT6 A; 2E5K A; 4WCI A; 4RTV A; 2VWF A; 2KR3 A; 2PTK A; 2SRC A; 2FO0 A; 1BK2 A; 2HBW A; 2YUP A; 3NPF A; 2K2M A; 4E6R A; 1AZG B; 1MV3 A; 3PE0 A; 2JMA A; 1V1C A; 1WIE A; 1JU5 C; 3VRY A; 1WX6 A; 1SHG A; 1GFC A; 2J6K A; 2HDA A; 2RQT A; 2GTJ A; 2CSQ A; 4AFZ C; 2JW4 A; 1QWF A; 2GBQ A; 2RN8 A; 1ABQ A; 2ECZ A; 2X3X D; 3REB B; 1TUD A; 3EHR A; 2DBK A; 2LP5 A; 1W70 A; 2XMF A; 4HVU A; 4RTZ A; 2PNI A; 1UUE A; 1K1Z A; 2A28 A; 1T3L A; 2MIO A; 2D0N A; 2VKN A; 4F17 A; 4D8K A; 2AZS A; 3I35 A; 3UA6 A; 4LUD A; 4DEY A; 2ROT A; 2FEI A; 2DRM A; 3THK A; 2J7I A; 1SPK A; 1GRI A; 2JTE A; 2O2O A; 2DLP A; 4OMO A; 4Z8A A; 1ARK A; 2DBM A; 3SHW A; 1PNJ A; 2DE0 X; 4AFS C; 5L23 A; 1I1J A; 2AK5 A; 2BZY A; 3QWX X; 2BZX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4F7U E; 1HSQ A; 3P8H A; 1IB8 A; 3LWI A; 2JM8 A; 3VS3 A; 1NLO C; 4OMM A; 2NWM A; 1AHJ B; 1BI2 A; 2HKN A; 3KFV A; 1B3Q A; 1PRL C; 3G7Z A; 1QVG S; 2JJ9 A; 1QCN A; 3LH5 A; 2QA4 T; 1NPR A; 3ZEH A; 1YHQ A; 3CCS T; 1M90 U; 4OF1 A; 4J9H A; 1WHL A; 3X28 B; 3S3M A; 1ZUU A; 5KCO A; 4N4G A; 5GAN d; 2SEM A; 3OBW A; 3C4S A; 5GAN j; 3NHN A; 4C8Q C; 3OQ5 A; 1PSE A; 3QKJ A; 4K11 A; 5D6X A; 1KIK A; 1PD1 A; 2AIR B; 4ZN1 A; 4E7H A; 2CP7 A; 2DNU A; 1V76 A; 2MAM A; 1PG5 B; 5L8R E; 1UJY A; 4PJL A; 3PT9 A; 2HSP A; 1SKU B; 5LJ3 h; 3M53 A; 3DB4 A; 2DA9 A; 1X27 A; 2GCX A; 1NBE B; 3CPW A; 1YIJ Q; 2MF2 A; 2PVD B; 1YIJ A; 5FRM A; 3G71 T; 1YJW T; 2X51 A; 8ATC B; 2VV5 A; 4RCB A; 1WFW A; 2RJD A; 1UE9 A; 4FCY A; 2RQU A; 1R77 A; 1XJW B; 2YDL A; 4R0K A; 4MDX A; 3M0P A; 4FIB A; 4CRI A; 3OYB A; 3QII A; 4ZTF A; 5GAM d; 1VQ5 T; 1YIT Q; 4LDX A; 3EGX A; 1UEC A; 2HQX A; 3M0Q A; 2QDY B; 1QMC A; 2DFU A; 1TTH B; 2DJQ A; 1OYX A; 2D8J A; 2DEQ A; 4B9W A; 2K3X A; 2M02 A; 1XQH A; 1TG0 A; 2RMO A; 4PJO A; 2LQK A; 1R8O B; 4M7A A; 3C12 A; 3QJY A; 4JRP A; 5GAN 8; 3HRT A; 1WZO A; 2I0N A; 3URG A; 5FRO A; 2KVQ G; 3RKW A; 4C8Q G; 2FPF A; 3EG3 A; 3VS4 A; 1O75 A; 5KCH A; 1CKB A; 5FU7 C; 2O01 E; 5GJV B; 2VGM A; 2ABL A; 2GF7 A; 2KI7 A; 3I5R A; 1U1S A; 1VUB A; 3BDL A; 5LJ5 e; 2YSQ A; 2R58 A; 4ME7 A; 1S72 T; 3SEM A; 2L0A A; 1M1K U; 4OP0 A; 3RR6 A; 1B34 A; 4JS4 A; 3M0S A; 1UGQ B; 5IXF A; 3OMC A; 2AKK A; 2RJC A; 4QVZ A; 4FW2 A; 4J8O A; 4E2F B; 3OBY A; 1NZ9 A; 2ZAE A; 1BCO A; 3MHX A; 2XD0 A; 1SG5 A; 2ED0 A; 1TS9 A; 1ZUY A; 4XU3 A; 5C0M A; 3MEA A; 3OYH A; 2E4H A; 2OJ2 A; 3V8L A; 3EGX B; 3OYF A; 3AHU A; 4V2S A; 3X25 B; 4CI0 C; 1Y96 A; 3UT1 A; 3CME T; 1NJI C; 2KEA A; 2HSE B; 3OYJ A; 2DYB A; 2JUF A; 1QKX A; 5J26 A; 4PJO B; 4M7A B; 2DVJ A; 1CKA A; 2K9G A; 4M75 C; 2DKG A; 2VUB A; 4KGZ B; 3VUZ A; 4O5V A; 1UDL A; 1X2Q A; 5KYX A; 3NGP A; 2HAX A; 3MPU B; 2X35 A; 3QYH B; 4IIO A; 5CKH A; 1VQ4 T; 4JZ3 A; 4RG8 A; 3VS1 A; 2YUO A; 1B34 B; 2M0Y A; 1KQ2 A; 3CBP A; 1JQQ A; 4AFU C; 2M1H A; 3EG2 A; 4CC7 A; 2E3I A; 2DD5 A; 1GCQ C; 2KGT A; 1NYF A; 4M7D G; 2KT8 A; 3KXT A; 2CT3 A; 5DM7 R; 2EYX A; 3CCU Q; 1Y96 B; 5CKF A; 2P0P A; 2CP5 A; 2GFU A; 3WVD B; 1M90 C; 1VQN T; 1TOV A; 2RI2 A; 4HXJ A; 3L2U A; 3MEW A; 4RTW A; 1Q82 R; 2JN0 A; 1VQL Q; 5GAN f; 1VQL A; 4PJO E; 2NYS A; 3JV3 A; 1ZBJ A; 3VJP A; 2HQE A; 4FYY B; 4ANJ A; 1GCP A; 4XU1 A; 1G8X A; 3BE3 A; 2K3Y A; 5KYX B; 2OTJ T; 3ME9 A; 4C5I A; 1W2B S; 1D1C A; 4DEX A; 4EMG A; 2ATC B; 1GFD A; 3TVT A; 2OTL T; 1IRE B; 4BE0 A; 2KK4 A; 4RUG A; 2X4X A; 4FSX A; 5CQX A; 2EGA A; 3VKI A; 1K4U S; 1X75 C; 2R57 A; 2CYZ B; 2PZ1 A; 4C92 E; 2KQW A; 4IUU A; 4HKE A; 4M78 D; 4ZGD B; 1VQ8 Q; 1D0Y A; 3PVQ A; 2WSF E; 1G3T A; 2QA4 Q; 2QA4 A; 2OAW A; 3PVL A; 3CCS A; 4J9F A; 3QPH A; 3CPF A; 2QAZ A; 2ESW A; 4J7F A; 2E3H A; 5GAM f; 3GNG A; 4HCK A; 1FMK A; 5LJ3 e; 2CSI A; 2D9T A; 5I22 A; 2YXY A; 1N5Z A; 3HKS A; 4Z89 A; 1KQS A; 1RUW A; 1UTI A; 3LX7 A; 4M77 A; 2E64 A; 3EG0 A; 3OSV A; 1PD0 A; 4J7I A; 1BYM A; 3CCM T; 1SRL A; 2XID A; 5I2M A; 1QVF S; 2XDP A; 4F7U F; 3OYA A; 3JCM h; 1M4Z A; 1W2B P; 1E7O A; 4PJM A; 3OYY A; 4A4K A; 3JB9 F; 1UFF A; 4J9G A; 1S1N A; 3G71 Q; 3G71 A; 1G3S A; 2COW A; 1YJW Q; 1YJW A; 1AOJ A; 3MCA B; 4L6V 5; 2KE9 A; 3MEV A; 3OYE A; 5GAN 2; 3ZFJ A; 2KNB B; 1PKS A; 1JXM A; 2HQH A; 2HL5 C; 4LD9 K; 5GAN 5; 2FRW A; 3JRZ A; 4OB1 B; 1N9R A; 3VUB A; 4KH1 B; 5CQY A; 1VQ5 Q; 1VQ5 A; 2XU8 A; 1QLY A; 1Q82 U; 2RO0 A; 1W6X A; 2RQV A; 1QKW A; 2E1H A; 3O5Z A; 1I07 A; 2DYI A; 2YWW A; 2MYS A; 2FL7 A; 2K7A A; 4EDU A; 4EMK C; 2CP6 A; 5A0G A; 5I2S A; 3L1A A; 2LDM A; 2FVU A; 3BW1 A; 3QDF A; 3OMG A; 1ZUK A; 3OYC A; 3EGU A; 3TQ7 P; 3R6N A; 1VQ9 Q; 1OX8 A; 4PFP A; 5ECA A; 4WCI A; 2VWF A; 3CXC A; 1QVF P; 4HT9 A; 2DAQ A; 1SSF A; 1MV3 A; 4C0D C; 1D09 B; 2QXF A; 4QVC A; 2JMA A; 1WIE A; 1WX6 A; 5D6W A; 5CKB A; 2RQT A; 4AFZ C; 2DVE A; 1S72 A; 1KD1 R; 2GBQ A; 3DLM A; 5EG2 A; 2RN8 A; 2ECZ A; 3LGL A; 1UGR B; 2X3X D; 3REB B; 3N5B B; 3EHR A; 2P0K A; 3OYM A; 2DBK A; 2LP5 A; 2JZ2 A; 1UUE A; 2A28 A; 5KYY A; 4M75 F; 1MGQ A; 3EH1 A; 2D0N A; 5J39 A; 4MML A; 3JCM b; 3DLL A; 3JCM P; 4LUD A; 4DEY A; 2FEI A; 3THK A; 2J7I A; 2L3R A; 5HKC A; 2V8I A; 1ARK A; 4FL6 A; 3SFM A; 4ZN3 A; 2AK5 A; 2BZX A; 5LJ5 f; 3I56 T; 2LTO A; 2CUD A; 3M0R A; 4F7U A; 2JNG A; 3KUF A; 1EZZ B; 2QQS A; 1BI1 A; 1X6G A; 5DLQ E; 3A8M B; 3H9N A; 3CCQ T; 2R5A A; 2EYZ A; 4JDS A; 4KUD K; 3U23 A; 4E7I A; 3CC4 Q; 1WJR A; 1UHC A; 1YI2 T; 1ZSG A; 2EJF A; 4JLG A; 4BB7 A; 3X20 B; 2LX7 A; 1J3T A; 3CBO A; 2RI5 A; 1MNE A; 4YTL A; 2DL5 A; 3OYD A; 1RAA B; 5KYY B; 2QGG A; 1QP2 A; 2EAY A; 3CCE Q; 2NUT A; 1NM7 A; 2DIG A; 1H3Z A; 3HSB A; 2M0O A; 2EJ9 A; 2ROL A; 3R6O A; 1BU1 A; 5GAN 7; 5KE3 A; 3CCJ Q; 2RHX A; 4L59 A; 3RDV A; 1VQN A; 4Z88 A; 3HRU A; 2EQJ A; 4X9D A; 4J5Y A; 4AFQ C; 1KD1 U; 2EPD A; 3OY9 A; 1K8A C; 4XTV A; 2NUP A; 1WXT A; 2BIV A; 3D7S B; 4HT8 A; 2KAF A; 3OSS C; 2PUO B; 4F7U B; 1TWB A; 2L3S A; 3TCJ A; 1Y57 A; 5I21 A; 2OTJ A; 2OTJ Q; 3FRN A; 4KGV B; 1TSF A; 2JXB A; 2H8H A; 4XTW A; 5DLO A; 3M56 A; 3H8Z A; 3EFR A; 2DJZ A; 4M7A D; 2OTL Q; 3DKM A; 2OTL A; 2CZ7 B; 1E6G A; 2CT4 A; 3QJ6 A; 4C8Q E; 3CD6 T; 3C0C A; 1U1T A; 2JMC A; 1KHC A; 5LJ3 g; 3CCL T; 4D8D A; 2RNA A; 4J6W A; 3UWN A; 4R55 A; 4M75 A; 2BTT A; 3KBG A; 4A4G A; 1WLP B; 1G3W A; 1W4S A; 2F5K A; 2B86 A; 1AWW A; 3V8K A; 4MZP A; 2NUT B; 1HYO A; 1UEB A; 4PFO A; 2CRE A; 1Q82 C; 4IKF A; 2DPP B; 5GMK j; 3QHS A; 2DO3 A; 1M2O A; 1WNL A; 2J6O A; 4JZ4 A; 4OVA A; 3H6Z A; 1LPL A; 4RTX A; 1YWP A; 1XNI A; 3JCM e; 2NUP B; 1GCQ A; 5J3B A; 2RHZ A; 1SF9 A; 3CCM Q; 4JPB W; 4ZNX A; 3CCM A; 4UC4 A; 1H64 1; 4A53 A; 1WA7 A; 1KFZ A; 2KRM A; 3HP9 A; 1ZA1 B; 1GXI E; 3A8H B; 2RD1 A; 4C92 F; 2RF0 A; 3VS5 A; 2ZPF B; 3WVE B; 2IIM A; 1VQO T; 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