3RNNA

Crystal structure of iglur2 ligand binding domain with symmetric sulfonamide containing potentiator
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural and functional analysis of two new positive allosteric modulators of GluA2 desensitization and deactivation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rnnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rnnA02
5BUUA 4KR5A 1B5JA 4FEBA 1GR2A 1B0LA 3W15C 4FEDA 3UA8A 1QUKA 2PT1A 4I1DA 3VXBA 4G8HA 1ELJA 5KDTA 2YLNA 4POXA 1QULA 3EQ1A 4NF4A 3FATA 2V84A 3RT6B 3PPOA 1B0HA 4ELRA 2UVHA 1XC1A 1Y20A 2Y7KA 1JVXA 3G3FA 4ND9A 2G93A 3BKIB 3V89B 5I84A 1NFTA 5K2XA 5I59A 4NWCA 3PPPA 1R9QA 4H8JA 4ZS9A 3LSWA 3FJMA 4MF3A 1Z7NE 4FATA 2I3WA 2QPQA 4Q0CA 5H8FA 3ECRA 1PC3A 3I6VA 4KFQA 4IGRA 4LZ5A 1YAEA 4EQ7A 1I69A 3CRBA 3FXQA 3G3KA 3PPRA 4ZE9A 2D5WA 5CMBA 3LBSA 4MLQA 2PX1A 1MG1A 1Y1MA 1IZ1A 2D21A 3L6GA 3VDFA 2R71A 4LZ8A 2ESNA 3FIRA 1PEBA 4LQ2A 1VSOA 5FTIA 2V3TA 3E4RA 1MPDA 4Z7EA 3HHGA 4R75A 2ABHA 3MVYA 3KBRA 4QHQA 4OEVA 4NWDA 4JWOA 2OZZA 3OMBA 3MP8A 4R2FA 4RY1A 3BFUA 3RT8A 1IEJA 1SQYA 4GLIA 4QFKA 4GL8A 4LP2B 3UP9A 5HBCA 2ZYKA 4Q8RA 1R1NA 3EF7A 1RKMA 4O3BA 5F1QA 1OMPA 2ZYMA 1US5A 4ZZAA 1DTZA 2E1SA 4WEPA 4LA9A 1MDQA 1FQFA 1O7TA 5JEIA 1UTHB 5L9MA 2YPNA 2F97A 3B7DA 3MQ9A 5B70A 3RNNA 1D9VA 4OEUA 3S9EA 2VOZA 1RYXA 2UVIA 4HS7A 1LGBC 2D3IA 2DP8A 3O97A 3S2VA 2RCBA 3ODBA 3VVDA 2RCAA 2XXQA 2RF1A 1B40A 4G8NA 4U4XA 3D4CA 1GGGA 4U1ZA 1YPNA 4NE4A 4YAHX 2HQ0A 3V83A 3TEPA 2DS9A 2DOJA 4TQUQ 4ZEKA 3G7WA 1WODA 4N6PA 3MBPA 2DWAA 3PGFA 4OWDA 5JK4A 3KN3A 1KWHA 4Q30B 4FIMA 5KZTA 2XXWA 1D3KA 1OLCA 4GXAA 5DVFA 4I8CA 3VXCA 1N7WA 2W7YA 1A55A 4U22A 3EHTA 3TAJA 4N13A 3KSJA 5L9SA 3IJOB 3H6WA 4O3CA 4P0IA 4DCXA 3MJNA 4F18A 2QL3A 4R9GA 5I58B 5AA4B 3H6UA 4PFUA 4NF6A 3N94A 3VLUA 1P1UA 1H3DA 3WAFA 2OK2A 3SERA 3FV1A 3MVZA 1ZLQA 1Q1KA 1SW2A 4U21A 1B3FA 3FVNA 2QS2A 4LATA 1P1QA 1BKAA 2H99A 3IB0A 2F5XA 1EZOA 4GVOA 3O6IA 2I49A 3IJXB 4YICA 2DE2A 1IITA 2O7IA 4AQ4A 4M4GA 4ZEDA 3G3GA 5AA2D 5TPAB 1XHYA 1H43A 1MY1A 1N04A 1J1NA 2LAOA 1OVBA 4I9DA 3T9HB 2I0CA 2IEEA 3LC8A 2XXHA 4KYEA 4I62A 2ZNSA 2VD2A 4X1BA 2Z22A 2QS3A 3TQWA 4ESXA 4EDPA 2XXRA 1Y4TA 5KCJB 3VVFA 1LAGE 1FTOA 2PT2A 5CM6A 4KPTA 2P2AA 5EYFA 1MDP1 3VE1B 4OXVA 1S7YA 2I4CA 1LFIA 3QUJA 2HCAA 1DSNA 3CSBA 3GLBA 4THIA 2I3VA 4TLMB 4XXUA 2G29A 5HM4B 4U4SA 3TTRA 3QSLA 2R6GE 4JB7A 1A40A 5ICTA 2P1SA 2AL5A 4C1UA 3BFTA 3TTLA 1AH5A 4ZEBA 3MZBA 2OCUA 4F22A 3QXMA 4F3SA 5I59B 3HPIA 4DZ1A 2KLFA 3I3VA 2O1LA 4K3FA 1JEUA 1ZU0A 4R6HA 5DEXB 1NH7A 2UYEA 3O6HA 2H4IA 4YU0A 3IB1A 4GQOA 4IO4A 4M1VA 3W9VA 3M3KA 5H8HB 4F3PA 2X7PA 1B1XA 1USYH 2AIXA 2V93A 2Q2CA 3C33A 2O68A 5CMKA 3H06B 2NXOA 4OFOA 3Q28A 1B4ZA 5AA4A 2WKYA 2DQVA 4IB2A 1L5TA 3TZAA 1WDNA 3GBAA 1B2HA 3KSXA 3FVKA 3CFXA 4QSDA 1HSEA 3G3IA 1MS7A 2XXUA 4FECA 3RTFB 3EPEA 5FHMA 1LB9A 3UIFA 1LAXA 3CI8A 2DWIA 4ZEFA 4EXKA 2P0SA 4ONYA 3MW0A 1XVXA 3RGYA 3TKDA 1MQDA 4PFWA 5J1DA 3A3UA 3TTKA 1NL5A 3A09A 3K2DA 2V3QA 3LR1A 4GF8A 2F7AA 4XKRA 3U94A 4JXIA 3PMWA 2AYSA 2FNCA 3OO8A 1DPEA 4YB6A 5I2NB 4GL0A 3Q27A 2QJEA 3Q26A 2RINA 1B5HA 4HTGA 1YTVA 1NNTA 3MZ9A 4BDQA 1DPPA 4OVJA 3KJ7A 3CVGA 1N84A 1ANFA 5KCJA 3T9VA 2I4BA 2Y7PA 4YMAA 3RPWA 3TELA 1B05A 4KCDA 3H4ZA 5CI5A 1LLSA 4G68C 4DLDA 1B3GA 1IXIA 4TOZA 4ZE8A 3OEMA 1XS5A 1Y9UA 3FASA 1Z7ME 2F36A 2XXXA 1RYOA 1H44A 3OXNA 1MXUA 3MP6A 4EF2A 3M3FA 5CMMA 3HV1A 4GOTA 1B7UA 4H0WA 2THIA 3JZJA 1Y1ZA 3OOAA 2F7BA 1PBQA 4YKIA 1Y3QA 4OMBA 2ONKE 4QSEA 3KEIA 1ZBMA 5DEXA 2IA4A 2QMWA 3C32A 3IB2A 2H98A 4C1TA 3PPNA 5H8HA 2RC8A 5L9OA 4NEDA 4BDNA 3TCHA 3HN0A 1EH3A 2V3UA 3TPAA 3C31A 4C0RA 1EU8A 2XD3A 1QUIA 3WAEA 4H6DA 2REJA 3K4UA 3B6TA 4JDFA 4BDMA 2I48A 3KOSA 1QW0A 3LSXA 3IR1A 4DXUA 1OLAA 3T22A 3PD9A 3THIA 3CIJA 4NF6B 1HSJA 3HCQA 3SESA 3K02A 3E13X 4QFLA 4KCCA 1P99A 4LQ5A 1Y3PA 2UXAA 5TP9B 4H67A 3PUZE 4JWYA 5FTHA 1VE4A 1M5CA 1URGA 1SYIA 3ZKKA 5I57A 2F35A 3QK6A 1CE2A 3PUYE 1URDA 3MP1A 5I2NA 4G2ZA 4OQOA 4DXBA 1B9JA 1MY4A 1TT1A 4RYAA 4F1VA 1SW1A 4WEDA 2OLBA 1SD3A 1OQGA 4F3BA 1FTMA 5AA3A 1BP5A 2Z8DA 2XHDA 3FVOA 4EQBA 3R6UA 4YKPA 4DDDA 1FTLA 1TFAA 3O29A 4PFYA 3SDFA 2XX9A 4R73A 4OTEA 4POWA 3S9LC 1CB6A 2Q89A 2H5YA 3TCGA 3RY3A 1LCFA 1I6BA 1POTA 2CMOA 2Y7IA 4QRZA 1IXHA 4F29A 3OO9A 2VGQA 1B52A 3DP6A 4ESWA 3VFJA 3TTMA 2RC9A 3SETA 2NUVA 3FJ7A 3ZS6A 2XX7A 3TODA 4F31B 3IO6A 4PQJA 3N26A 3H6TA 1UIVA 1A8EA 2ANJA 4BDLA 3RUMA 3B6WA 4KI0E 3V5AA 3JV9A 4RPOA 1IIWA 3T9UA 1LBBA 4R74A 4JWXA 2AL4A 1PB8A 3EN3A 2Y7WA 4O3AA 4IY6A 4PFTA 3HHFA 3TCFA 5ITOA 4U23A 3BBRA 4UACA 3F11A 1NH8A 3O66A 4JSDA 4DCYA 4AB5A 2OWTA 4NTLA 3PUWE 5BWJA 1JVYA 2O51A 2A5TB 4KYSA 4LUBA 2QSXA 3VV5A 3MUQA 3IORA 3QUFA 4KHZE 3TQLA 1MH4A 3R26A 3G3JA 1NMUA 5TP9A 4X1DA 3TFLA 4OFJA 1VFDA 3HO7A 3MWBA 2HZKA 1IUDA 3IOWA 1Q35A 4YKJA 5AA1A 1O63A 2HFBA 2REGA 1ZMGA 3IK6B 3D4GA 1M5DA 4WKMA 5TU0A 3M3LA 5B7DA 4ELQA 4ECFA 3Q25A 1ZKBA 1TWYA 5DTBA 3RLFE 4XKQA 1MQIA 2Q8JA 2FA7A 1JW5A 4FE8A 3C35A 4GRKA 1MM6A 4IO2A 4FJPA 1XOCA 2Q88A 3K0VA 4DIGA 3CFLA 4XKNA 3HSTA 5I56B 2ONRA 2HAVA 3CR9A 2H9BA 2VD3A 5DT6A 3CG1A 1ZJLA 1MPCA 1NNPA 2PYYA 1FTKA 4NF8B 1VFEA 2I6EA 5LOMA 3A3CA 2Z8EA 3OO7A 5HPQA 2CZLA 1YCJA 3ILTB 4LVQA 3H3GA 3PD8A 1LSTA 2F8DA 4BLAA 2F6GA 3C9HA 2UYFA 3KGCA 4X9TA 1ZIUA 1QKAA 4ELPA 5DVJA 2A5SA 5FHOA 4OFLA 1MY0A 2PVUA 4G77A 1B5IA 3N5LA 3EHSA 1R9LA 2HEUA 4KQPA 1QUJA 5CMCA 3ZSFA 1AMFA 3T96B 2XXTA 3GXAA 3MVXA 5ELVA 3H7MA 2QS4A 3ONMA 5AA2A 1OIBA 1BTJA 5H8NB 3SEWA 1LAHE 3K00A 2GH9A 1SI0A 1TFDA 1SW4A 4U1OA 1B58A 2A5TA 2BJJX 3MC2A 2I58A 1UQWA 4F2QA 1S50A 1N3XA 3I5OA 4JSOA 5CC2A 1PDAA 3E9XA 1QVSA 2B65A 3KG2A 4NF5B 4YZZA 1DMBA 3KZGA 3QAXA 1N7XA 5M2VA 3OO6A 4QFOA 2O6AA 3VLWA 2F34A 2Q2AA 4DE8A 5I57B 4N07A 3GZGA 3IL1B 4XIGQ 4OESA 3DP4A 4X48A 5JTYA 4DXCA 3QYTA 1IXGA 2DXYA 3M8UA 4OZ9A 4GFRA 3K01A 5I2KB 3R7XA 3U8QA 2X7QA 4QFNA 1B7ZA 4G4PA 4WXJA 3W9WA 3RQTA 3S9MC 4RJZA 1P1WA 5FHNA 1Y4CA 1MM7A 1D4NA 1R6ZA 5AE4A 1M5BA 3S9NC 3FUZA 1WVJA 3UGWA 2DE4A 5K2YA 3OD7A 4G68A 5I56A 3S4UA 4QFPA 4KYDA 2ALUA 4F1YA 3UK4A 3SEYA 2OBGA 3CG3A 4GWOA 4NF8A 2QMXA 1FQBA 4OHNA 4YMBA 2F7CA 3C4MA 3KOTA 4GIZA 1OVTA 4EF1A 1UIUA 1XVYA 1MPBA 4ZDMA 5H8SA 4F19A 2UVGA 1BLFA 4MLVA 2PMSA 3PV0E 2ZMBA 2RKMA 4R2BA 4XKPA 4EXLA 2DYXA 3PUVE 1A99A 4E0XA 1MXWA 1FQAA 4ZZEA 2B3BA 5ICQA 1PB9A 2GFEA 4QF9A 4FORA 4PP0A 3LUYA 3O28A 1JNFA 3N6UA 5EHMA 5H8NA 1ATGA 2XXPA 2DXRA 2XX8A 3USDA 4ZEIA 4IO6A 1UTBA 4QSCA 2H25A 5L8DA 5H8QA 4YB7A 1NNKA 4JBZA 2ZYNA 1PB7A 1NKXA 4ELOA 1MXZA 3PPQA 4LONB 3V8XB 3E3KA 2Z8FA 4FAJA 4P11A 2I0BA 1GTKA 3C36A 4F1UA 4BDRA 3KN8A 3O6GA 1OQHA 4NF5A 1AL3A 2XXYA 2E0SA 3K1NA 4R6YA 1FCKA 4PETA 4YB5A 1LBCA 1A54A 3FXUA 2VP1A 1ZTYA 1MXVA 4R6KA 2F6PA 3FZVA 2HAUA 3U93A 4EQ9A 3T66A 3H03A 5EHSA 1SDXA 4G8MA 5A5XB 3UORA 1FQDA 1GVCA 5ISUA 1B3HA 5I2KA 1I6AA 2ZYOA 1FQEA 3OEKA 1IQ7A 2DSFA 4YKKA 1MRPA 3MPLA 4MBPA 4TLLB 4Q5TA 3RN8A 3SKPA 1B3LA 5CBSA 4RNSA 1USYE 1MQGA 4RPNA 3PMXA 2VHAA 3FXRA 3L6HA 1B4HA 4RXLA 1JETA 3H6VA 4OERA 1SW5A 4RA1A 1Y3NA 3DLNA 4H5FA 1XT8A 1URSA 2OWSA 1A7LA 3K1MA 2QS1A 1T0KA 1N0TA 2M8CA 1TXFA 4HCYA 2O84X 3DM0A 5F7VA 1VR5A 1SVXB 1AOVA 1MY3A 2ZNTA 1NNFA 2PBWA 2R9JA 5DYHA 3QIMA 3K1PA 4IGTA 1AIVA 3FD3A 4GXSB 4XTCQ 5AA2B 1EZPA 3DP8A 1B46A 4OENA 1LB8A 2O1MA 3MZ1A 1B6HA 4BDOA 1N76A 1QKBA 4LZ7A 2Q9TA 3MPKA 2NOOA 1DOTA 2OJTA 3SEXA 2F78A 2X26A 4IO7A 4RK2A 3O9PA 3GBBA 3MVWA 2XXVA 1F9BA 1MH3A 3U92A 5CBRA 2O69A 2QRYA 2ZNUA 1GV8A 2UVJA 3OENA 2DVZA 3T9XB 2NWJA 1LFGA 3ZKLA 3IOTA 4IO3A 5JTYB 5A5XA 1MQJA 2ONSA 5DVIA 3KFMA 1LCTA 4HCWA 2XD2A 2DWHA 3TUSA 2XXIA 4NMYA 2Z23A 1MQHA 4R72A 2HZLA 2GHAA 1JW1A 1US4A 3KN7A 4PE5B 1SI1A 3N6TA 3K6UA 4HW8A 3PMVA 1N3WA 1MXXA 1UTHA 2RC7A 3U72A 2V25A 3FGSA 1B7HA 5IAIA 1B32A 3PU5A 2NVUB 3LSLA 4G68B 1FW0A 1DTGA 4MH5A 5KDTB 1M5EA 1JEVA 4U2RA 3TMGA 4NF4B 2YJPA 4H8IA 4IY5A 1I6QA 3UN6A 1SYHA 3IOVA 1SBPA 3PUXE 1MXYA 2DVCA 3IAZA 4R9FA 1BIYA 3U1OA 4L17A 1JW4A 4E0WA 2HXWA 3Q29A 3MAMA 1FQCA 1H76A 3SEVA 3TDJA 1B51A 1FTJA 4KD5A 4UA8A 2B3FA 3TTNA 3ILUB 3K6VA 3OELA 2Y84A 3C34A 1D9YA 3IX1A 4OYVA 3IO4A 5H8FB 3B6QA 3VLVA 1P1NA 3KJTA 5IKBA 1UTBB 3G3HA 4F2OA 1B1HA 4OETA 1II5A 1P1OA 5H8QB 1IXCA 1H45A 2DWJA 3EHUA 1M5FA 1LAFE 2DE3A 5I58A 4H65A 2FYIA 3DELB 4RK9A 4AB6A 3LSFB 3AXFA 5ITPA 3TYHA 4H1XA 4F39A 3K6WA 3T93B 3VVEA 1A8FA 2GHBA 4H5GA 3SEUA 3OSQA 4IO5A 3FVGA 1QJMA 1O64A 1LFHA 1JQFA 3O2AA 1HSLA 3CFZA 3CSGA 3IOUA 2Y7RA 1PBPA 2GRVA 2ZXTA 4GD5A 4ZECA 3K6XA 3JYRA 2O7UA 4Z0IA 1POY1 1B3EA 5TPAA 4EUOA 4ISUA 3FJGA 1EZ9A 3FV2A 3P7IA 3RTWB 5CRYA 3OSRA 1MY2A 4F3GA 4MFIA 4P0GA 1S9TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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