3RNNA

Crystal structure of iglur2 ligand binding domain with symmetric sulfonamide containing potentiator
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
b'NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural and functional analysis of two new positive allosteric modulators of GluA2 desensitization and deactivation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 87
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rnnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rnnA02
1AL3A 2REGA 4YZZA 3RT8A 4BDQA 3VXCA 2V84A 4I8CA 4NF5A 1EU8A 3GBBA 4I62A 2OWTA 2I3VA 3IO4A 5LOMA 2DXYA 3B6TA 1QUJA 4GOTA 3VXBA 3MUQA 4GWOA 3HO7A 4R74A 4NF6B 3K6VA 3AXFA 5I58B 3JZJA 4G8MA 3GZGA 4OMBA 1S7YA 1MY1A 3B6WA 4F1VA 2Q8JA 3UK4A 2F7AA 2XXPA 3O28A 3TCGA 4G68A 1USYH 4FIMA 1MPDA 3N94A 4THIA 1TWYA 1QUIA 3MWBA 4GRKA 3CRBA 3FGSA 3U92A 2AYSA 3EN3A 4FE8A 2I4BA 4TQUQ 1SDXA 1URSA 2F7CA 2NXOA 1IUDA 3IOVA 3UP9A 3SEUA 1UTHA 3C36A 3K01A 3OSRA 4R9GA 1HSJA 2F5XA 2HQ0A 2ZNUA 5J1DA 5F7VA 2CZLA 4EXLA 3PPRA 4LA9A 2RCAA 1JQFA 3KJ7A 1MXZA 1MRPA 4QFLA 4QSDA 3QAXA 3SEWA 4Z0IA 3TTMA 3FJGA 1QW0A 4FECA 3CR9A 5DYHA 2DP8A 4GVOA 1R9QA 4WEDA 3MVYA 3P7IA 1XVYA 2V3QA 4U1OA 1A8FA 1I6BA 4BDRA 4XTCQ 2ALUA 4ISUA 5ITPA 2IA4A 5DTBA 1MXYA 2QS1A 3BKIB 1N04A 3G3HA 3GXAA 4LZ5A 3M3KA 1B5JA 5EYFA 1ELJA 1TFAA 4POWA 1M5FA 3LR1A 1AH5A 4YB6A 3FXUA 3PU5A 4OEVA 5L9OA 1FQDA 3MVXA 4Z7EA 4ZZEA 1S50A 5CMBA 3BFUA 3Q27A 3O6GA 1YAEA 2RCBA 1Q1KA 2QMXA 3IJOB 4X1BA 3OO7A 4JWYA 4NF4B 1B7ZA 2XX8A 4QRZA 2I58A 1JNFA 1M5EA 2OCUA 1B7HA 3S9EA 3MBPA 3K1MA 2PT1A 4ESWA 4YAHX 4KYDA 1NNFA 1B58A 3I6VA 4G8NA 1M5CA 5TP9B 5I56B 2DWHA 1A8EA 1VE4A 3G3IA 1FQBA 2I3WA 4DXCA 3KEIA 3S4UA 2ZYMA 2PMSA 2OK2A 3FIRA 4U2RA 2REJA 1B46A 1LAGE 1Y4TA 3WAFA 3RNNA 3Q29A 3Q25A 3QXMA 3CI8A 3SESA 4N07A 4GL0A 1LB8A 4AB6A 5KDTA 1FTMA 3UORA 4EF2A 4WKMA 3RT6B 4YU0A 2XXYA 2Z8FA 2IEEA 1XC1A 4RPOA 1N3XA 5FHNA 4YMAA 2RC9A 1UTBB 4NF6A 1SYIA 4OFOA 5I58A 1XVXA 1VR5A 5KZTA 3MZBA 4KPTA 5ITOA 2VD2A 2ZMBA 2UVJA 4F31B 1MQJA 2ONKE 4R73A 5B70A 3MW0A 2Q9TA 4L17A 4ECFA 5AA2D 3EQ1A 3OO9A 4RPNA 4EQ7A 4OQOA 1BLFA 4LQ2A 3TCFA 1JETA 2F6PA 4NE4A 4DLDA 1FQEA 2HAVA 3SERA 1PB9A 1OLCA 1SW4A 5A5XB 3OENA 3HCQA 4EQBA 1B32A 1MY3A 4NWCA 4TOZA 2UVGA 1B3LA 1DTZA 4G77A 4F3SA 1A40A 5M2VA 2R9JA 3E13X 1BTJA 2DOJA 2ZNSA 4H8JA 1AOVA 3TTNA 1PBPA 1PC3A 3C33A 1LFHA 1ZTYA 4OWDA 3MZ1A 2OLBA 2R6GE 1LBCA 2QS2A 1MY2A 3ILTB 2NWJA 1Y4CA 3D4GA 4H8IA 2F97A 5ISUA 2W7YA 3CIJA 4PETA 1IQ7A 2UVIA 2GHBA 3E3KA 4GLIA 5TPAA 2HAUA 1MQIA 1A54A 2VHAA 5DEXA 1LB9A 3MPKA 3PPOA 3TUSA 1TT1A 2F78A 5IKBA 3K1PA 4YB7A 4KCDA 1MXWA 5ELVA 3CSBA 3IB2A 4M1VA 1FQCA 2XXQA 1FCKA 1H76A 3N5LA 2I0CA 1O64A 3UA8A 5KCJB 3MJNA 4ELPA 2OJTA 1IZ1A 4ZZAA 2AIXA 3PMVA 4JB7A 4KCCA 3RUMA 4R2FA 4F2QA 1B1HA 1S9TA 3IOTA 4MH5A 3B6QA 1ZU0A 3TEPA 1GGGA 4OENA 2DWJA 4K3FA 2XX9A 1SVXB 4H1XA 1QJMA 3TDJA 4KYSA 4DCYA 2WKYA 2O7UA 4NF4A 2VP1A 3O29A 4JXIA 4ZDMA 4ZECA 3D4CA 1OVBA 4PFUA 4BDNA 1PEBA 3HSTA 2Z22A 1VFEA 3H4ZA 4RJZA 1GTKA 1H3DA 1EZOA 4MFIA 2DE3A 1P1NA 5AA4B 2F36A 5I56A 3VFJA 3HHFA 4ONYA 4LP2B 2O68A 1N76A 1B5HA 3VVEA 1B7UA 1EZPA 4Q0CA 4QFNA 4EDPA 1MDQA 3KG2A 3T9VA 1Y9UA 5CM6A 1R1NA 4NTLA 1ZLQA 2XXTA 4QHQA 1UIVA 5B7DA 3CFZA 1PB7A 4DCXA 2Y7WA 4IO6A 4JDFA 3K1NA 1DMBA 3U8QA 3CSGA 2I48A 1O7TA 2BJJX 1WODA 2Z8DA 3LSLA 3QYTA 4OXVA 4OFLA 1FTOA 1UTBA 3DELB 2QPQA 3RQTA 4YB5A 3LUYA 3G7WA 2QRYA 1PBQA 2ZYOA 4F19A 2VOZA 1H45A 2X26A 3SETA 4QFKA 4KYEA 2DE4A 3C31A 1JEUA 1N84A 2UXAA 5H8QA 1SYHA 2XX7A 4EXKA 5DVIA 2M8CA 3KSXA 3UIFA 1XT8A 3UGWA 3V89B 1VSOA 3ONMA 3JYRA 1XOCA 1SD3A 1DTGA 2XXUA 2O6AA 4DXUA 2RINA 2HXWA 4OEUA 3H06B 5AE4A 3TTKA 5H8NB 1FTKA 1Z7NE 3QUFA 2XXXA 2O1MA 3FXQA 3N26A 2DYXA 1TXFA 1B1XA 2I6EA 4F3BA 2RF1A 2O69A 1POTA 4IY6A 2FA7A 3KOTA 4BDMA 2Y84A 2I4CA 2YLNA 3LBSA 3O6HA 5BWJA 5JK4A 1URDA 5I2KB 3OSQA 2P1SA 1CE2A 3BBRA 1M5BA 3TELA 3VE1B 3S9NC 1P1WA 3CG3A 3KN8A 4UACA 1Q35A 4G68C 1UIUA 1OQHA 4TLMB 2RC8A 3Q28A 4C1UA 4NF8B 1NFTA 3PUVE 5HBCA 3MVWA 4FEDA 4U4SA 4N6PA 4EF1A 3EHUA 2ZNTA 3PUYE 4AQ4A 5F1QA 4OVJA 1OMPA 1YCJA 4IGRA 4YKKA 1J1NA 3VVFA 4XKQA 2QMWA 4U22A 5KCJA 1WDNA 4R6KA 1RKMA 3ZS6A 3K6XA 2OBGA 4IB2A 3R26A 1R6ZA 4U23A 2B3BA 3DM0A 1LCTA 3PUWE 3QIMA 3FZVA 4PQJA 4MBPA 3Q26A 1NKXA 3FVKA 4G4PA 4IO7A 4TLLB 1Z7ME 1MXUA 2H25A 4FAJA 3ECRA 3MAMA 3T9UA 4NEDA 1VFDA 3PPNA 4OFJA 5CMMA 1ZJLA 3RY3A 3HPIA 2O51A 1D9YA 4X1DA 2Y7IA 3A09A 4KI0E 4MLQA 4ELRA 3EPEA 1B4HA 3FVGA 2I0BA 3PV0E 3O2AA 1Y3PA 5L9MA 5AA3A 2OWSA 4PFWA 1IEJA 2VD3A 5HPQA 1JW1A 3T9HB 5I59A 1XS5A 4ELQA 2GH9A 1IXCA 3T93B 2F35A 1B3HA 5K2XA 5DT6A 1N7XA 1EZ9A 5I2NB 3C35A 3GLBA 4PFTA 3KBRA 3TFLA 5JTYB 3ODBA 3MP1A 4MLVA 2PVUA 3CFLA 3QSLA 3KZGA 1OIBA 4G2ZA 3F11A 3OO8A 3U94A 4NMYA 2QSXA 4H65A 4HTGA 1II5A 3TCHA 1ZKBA 4ELOA 3OO6A 3TMGA 3VLUA 3H03A 2HZLA 1AIVA 3G3JA 1FQAA 2ZYKA 4U1ZA 4NWDA 1DPPA 1MXXA 3JV9A 1JW5A 2V93A 4P11A 3TTRA 1TFDA 2UYFA 4LATA 3IX1A 1FTJA 2DVCA 4AB5A 3TZAA 5H8NA 3VVDA 2G29A 4XXUA 3OELA 3K4UA 1LFGA 3T22A 1M5DA 3N6TA 2P0SA 3KN3A 2R71A 3FUZA 5FHOA 4FORA 2Q2AA 5I2KA 1LBBA 4JSOA 2E1SA 1IXGA 1SW1A 4IO5A 4FJPA 3C34A 3CVGA 3PGFA 1NNTA 2D5WA 4RK2A 3L6HA 4OERA 5DVJA 3IR1A 4LZ7A 4F1YA 2FYIA 3T9XB 3S9LC 4XKPA 4NF8A 4RNSA 2V25A 4LQ5A 4DZ1A 1N7WA 2XXRA 1B0LA 3FVOA 4I1DA 2HFBA 1NH8A 3H6UA 3DP6A 1LAHE 3MZ9A 1JVYA 4KQPA 1SI0A 1SW2A 1HSEA 4JWXA 4ZEFA 3TPAA 1NNPA 1MS7A 1QUKA 1T0KA 3SEXA 3KJTA 4GIZA 1MDP1 3ZKKA 3A3CA 2F7BA 1B52A 1ZBMA 1FTLA 3VDFA 3FD3A 3TTLA 3VLVA 2DE2A 2H4IA 3H7MA 4F39A 4F3PA 3R7XA 3USDA 2QS3A 4U21A 1L5TA 2V3TA 3PUZE 3V83A 4X9TA 4HS7A 3MPLA 4PP0A 2ONSA 5HM4B 4JWOA 1GV8A 2E0SA 3U1OA 2H9BA 2YJPA 1B3FA 3RGYA 4RA1A 4EUOA 5TP9A 1I6AA 4LZ8A 4DE8A 2Z23A 5AA2B 2QJEA 4KD5A 4FEBA 2UYEA 1Y1ZA 3IORA 4IO3A 1MM6A 1MPCA 3K6WA 2DS9A 3A3UA 4ZE8A 3IB1A 3TAJA 4YKJA 1D9VA 3OEKA 2PX1A 3T66A 4RY1A 3KGCA 5H8FB 4F29A 5I2NA 3LSXA 1NL5A 1RYXA 1UQWA 2G93A 5CBSA 2ZYNA 5JTYA 5L8DA 1HSLA 1POY1 1MXVA 4X48A 5IAIA 1MY4A 3IOUA 1DOTA 3OMBA 4QFPA 3V8XB 4IGTA 3T96B 4DXBA 1OQGA 4GF8A 4GXAA 1EH3A 1ANFA 2Y7PA 2AL4A 5CRYA 3W15C 1B05A 1PDAA 3IK6B 3EF7A 1A55A 4M4GA 1SBPA 3KN7A 3WAEA 2PBWA 1QKBA 4C0RA 1US4A 2Q88A 3TQWA 4XKRA 3FATA 3CFXA 3KFMA 3FV2A 3SEVA 3IB0A 4JBZA 3HV1A 3I3VA 3DP4A 2F34A 3B7DA 1MPBA 2Z8EA 3IAZA 3PPQA 1D4NA 1CB6A 4F3GA 1B2HA 2F8DA 3TQLA 1N0TA 3OD7A 3SKPA 3DLNA 4PE5B 3TYHA 4F2OA 4XIGQ 2Q2CA 3LSWA 3R6UA 1YPNA 4IY5A 4F1UA 2GRVA 4QSEA 1MM7A 1B51A 2V3UA 2NUVA 1RYOA 3FXRA 4BDLA 5A5XA 3PMWA 4LONB 2XXWA 4H67A 1BKAA 3SEYA 3L6GA 4HCYA 2ANJA 3H6VA 4Q30B 4BDOA 1R9LA 2PYYA 3EHTA 4YICA 3OOAA 4YKPA 2A5TB 2AL5A 2LAOA 2XHDA 3MP6A 1LSTA 2XD3A 1B3EA 3RTFB 1Y20A 1P1OA 2Y7KA 4KR5A 1LFIA 1BIYA 2NOOA 4ND9A 3C4MA 1F9BA 1ZMGA 3K0VA 4JSDA 5H8SA 3PD9A 3OXNA 2DXRA 5FTIA 2XD2A 3O66A 3MC2A 1GR2A 4R9FA 4ZE9A 5TPAB 1ZIUA 3C9HA 3TODA 3ZSFA 1YTVA 2DWAA 1P1QA 5DEXB 4POXA 4O3CA 5EHMA 2GHAA 1Y3NA 3LSFB 4OZ9A 1SW5A 4GL8A 2ZXTA 3K2DA 3PMXA 1B9JA 2RC7A 3M8UA 2THIA 1NH7A 1FW0A 4EQ9A 2A5SA 1US5A 4GD5A 3VLWA 3OEMA 1USYE 4XKNA 3M3LA 3UN6A 4F18A 2ONRA 4HW8A 1SQYA 3QK6A 5I57B 1JW4A 1LGBC 5TU0A 1JVXA 5JEIA 2Y7RA 1KWHA 2FNCA 1QVSA 3V5AA 4F22A 3K02A 5AA2A 3S9MC 5AA4A 1H44A 3H3GA 4RYAA 4E0XA 3EHSA 3G3FA 4ZEDA 1DPEA 1SI1A 1B5IA 2DWIA 2DQVA 1LLSA 2O84X 4IO4A 5H8FA 4G8HA 1IXHA 4IO2A 1I69A 4O3BA 4H0WA 2ESNA 3HHGA 4HCWA 1MY0A 3G3KA 4OETA 2QL3A 2XXVA 5H8HB 5BUUA 2RKMA 5I84A 4R6HA 4R72A 2I49A 3N6UA 3RPWA 3FJ7A 1JEVA 2YPNA 4NF5B 1ATGA 2H99A 4R75A 2O1LA 3K00A 3H6TA 3CG1A 1GVCA 4R2BA 4QF9A 2X7QA 5CC2A 2X7PA 2B65A 3O97A 2HZKA 3K6UA 1XHYA 1IXIA 3KSJA 1B40A 3RTWB 3O6IA 4OESA 4WXJA 1BP5A 2QS4A 1IIWA 1B3GA 3W9VA 5K2YA 4BLAA 3H6WA 4MF3A 3TKDA 2PT2A 3IL1B 4GFRA 4G68B 2DSFA 5H8QB 4O3AA 1MQDA 4RXLA 1IITA 3THIA 5ICTA 4DDDA 3SDFA 4ZEBA 3I5OA 2NVUB 2VGQA 4PFYA 3HN0A 1WVJA 5FHMA 4I9DA 5CMKA 4FATA 3LC8A 1UTHB 1N3WA 1DSNA 5CI5A 1QKAA 3BFTA 5ICQA 1URGA 1Y3QA 2HCAA 3G3GA 2DVZA 2D21A 4N13A 4OYVA 5DVFA 2A5TA 1H43A 2F6GA 3PUXE 1AMFA 5CBRA 2H5YA 3FVNA 3IOWA 3U93A 3FJMA 2H98A 2GFEA 1I6QA 1QULA 4H5FA 4GXSB 5L9SA 1B6HA 2ABHA 1LAFE 2B3FA 1OLAA 3U72A 3GBAA 4OHNA 2CMOA 4WEPA 3KOSA 3E4RA 2KLFA 3M3FA 4C1TA 1LCFA 3IO6A 3PPPA 5EHSA 4RK9A 1MQGA 3ILUB 1P1UA 2D3IA 2P2AA 3C32A 1A99A 1NNKA 1MH3A 1Y1MA 5AA1A 4QSCA 1MH4A 3ZKLA 4KHZE 1PB8A 5FTHA 4H5GA 3MQ9A 5CMCA 3RLFE 1P99A 4ZS9A 4LUBA 4OTEA 1O63A 5I57A 3RN8A 4H6DA 4QFOA 3S2VA 2XXIA 3QUJA 4Q8RA 4E0WA 3E9XA 3VV5A 4KFQA 2O7IA 3MP8A 4R6YA 3W9WA 3MVZA 1LAXA 3DP8A 4ZEIA 4ESXA 3FASA 2OZZA 3FV1A 1MQHA 4U4XA 1NMUA 4GQOA 4P0IA 4P0GA 4YMBA 1B0HA 1A7LA 3PD8A 4Q5TA 2UVHA 4DIGA 2Q89A 5I59B 3O9PA 4ZEKA 1B4ZA 1MG1A 2HEUA 5H8HA 1OVTA 1D3KA 4LVQA 4UA8A 3IJXB 5KDTB 1FQFA 2XXHA 4YKIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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