3RNNA

Crystal structure of iglur2 ligand binding domain with symmetric sulfonamide containing potentiator
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Structural and functional analysis of two new positive allosteric modulators of GluA2 desensitization and deactivation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 87
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rnnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rnnA02
4DCXA 3M8UA 4NF6B 3N5LA 2V3TA 1UTHB 1MG1A 2QS3A 1LLSA 3Q25A 2V93A 2XXIA 3OSRA 5CRYA 4N07A 4H6DA 4IO4A 2REGA 3VLUA 4DLDA 4OEUA 1FTKA 1NFTA 3QSLA 4EDPA 3GZGA 2DYXA 1Y3PA 3A3CA 1RYXA 2G29A 3E13X 3EHTA 1SVXB 1UQWA 5DT6A 5TP9A 1M5DA 3ILUB 4EXKA 3T9HB 1F9BA 5H8NB 4DXBA 4BLAA 4AQ4A 3OEKA 2HZLA 2OLBA 1QVSA 1J1NA 4G68C 1MY2A 3N6TA 1LAXA 3IOWA 1US5A 3D4CA 1AIVA 1OQGA 3B6WA 1ZU0A 3JYRA 1MPCA 4FATA 2PYYA 2YPNA 3MZBA 2QS2A 5I59A 1N0TA 3PMWA 4KYDA 3LSFB 3MBPA 1IEJA 3EHSA 1A99A 2RKMA 3EQ1A 1MH4A 2DOJA 3OSQA 2HAVA 3MQ9A 2HXWA 4MBPA 1NNTA 1JVXA 5DVJA 1I6AA 4QFNA 1O63A 1CE2A 2CMOA 5KDTB 2R71A 3OELA 1PB9A 3PUWE 3ONMA 4R6KA 1Y4TA 4RPNA 4ZDMA 3MVXA 1SI1A 3VFJA 4WEPA 5DTBA 2QS4A 3U1OA 1B6HA 5AA4A 3IX1A 3HHFA 4XKRA 1GR2A 5H8QB 1MQHA 2ESNA 4M4GA 4I1DA 1D9VA 4NF8A 4XXUA 2F8DA 1P1OA 4LZ7A 3O28A 4YKIA 1XVXA 4QSDA 2F7CA 4F18A 5KCJA 4EF1A 3HN0A 4JBZA 3RNNA 3TELA 3M3LA 1MY4A 2OWSA 3IB2A 2O1MA 3UK4A 1DTGA 5B7DA 4EQ7A 4DXUA 3DELB 1B4ZA 4LP2B 2DSFA 4KCCA 4YMAA 1NNKA 1UIUA 4YB6A 1H76A 1TWYA 2I48A 4ELRA 2GH9A 5I58B 1BKAA 3P7IA 1IXHA 3SEVA 4H67A 4QFLA 4F2QA 4QSEA 3L6GA 3EPEA 4FIMA 5JTYA 5CI5A 4ELOA 3G3HA 2Q2AA 3Q29A 3MUQA 3HCQA 4Q30B 1OLAA 4FEDA 4I8CA 4Q5TA 3FVKA 3FVGA 4EF2A 1OQHA 1MPBA 1B1HA 1Z7ME 2PVUA 2E0SA 2O7IA 1PBQA 5A5XA 3U72A 1TFDA 2X7PA 1LCFA 2ONKE 2PX1A 4RK2A 4FORA 3HPIA 3G3KA 2VGQA 2VP1A 2QJEA 3OO8A 1ZJLA 4QHQA 4IO5A 4QFKA 2I49A 1NL5A 3W9VA 3O6IA 3O9PA 3FIRA 1LAGE 2XXWA 1CB6A 4E0WA 1XC1A 1SI0A 2F5XA 1P99A 1B51A 5CMMA 4LZ5A 2M8CA 2D5WA 4G77A 1A8EA 1HSEA 5M2VA 3T96B 3RUMA 3SEUA 4IGRA 3GXAA 5I2NA 2HAUA 1MQGA 1PB7A 1LFHA 2NWJA 5LOMA 4NF4B 3C33A 4IO6A 2ZYMA 3K2DA 1LSTA 1SQYA 1FQBA 5F7VA 2B3FA 5HM4B 2XXPA 1P1UA 5I57B 3IOUA 5F1QA 1O64A 3ZKKA 4ZEIA 2R6GE 3CR9A 4KPTA 4IO2A 1N3XA 3S9NC 4TQUQ 1B0HA 3UN6A 5B70A 1B2HA 1H45A 1S50A 4UACA 2DQVA 2ALUA 2O68A 4GRKA 3EHUA 3JV9A 3VLWA 2B65A 1DPPA 2UVGA 3N6UA 4PFWA 5EHSA 3MZ1A 3V89B 2O51A 3JZJA 3IORA 3OO6A 1XHYA 2H25A 4G8HA 3TCHA 2OCUA 4H65A 3FUZA 1SDXA 1H44A 4E0XA 4BDOA 1AH5A 4OERA 3V5AA 4EQBA 1YAEA 1B7ZA 3DLNA 4DXCA 2QRYA 2Z23A 3VVEA 2B3BA 2RCBA 2I0BA 4F22A 2Q2CA 1Y3NA 3K02A 4O3BA 4OENA 1SW5A 3PMXA 4F3GA 1OIBA 2I4BA 4BDRA 2H98A 4ISUA 5CBRA 3O2AA 2OZZA 4R74A 5K2YA 1JEVA 1QUIA 3U8QA 1JETA 1DPEA 1ZLQA 2Q9TA 1IUDA 2D3IA 5H8SA 2XD2A 3H6UA 3VLVA 3HSTA 4BDNA 5H8NA 2ONSA 3FVOA 3CFLA 1A8FA 3FD3A 3TODA 3OO9A 4F1YA 3KZGA 4C0RA 5EYFA 5HPQA 3VXBA 3RTFB 1GGGA 5FTHA 3C32A 2D21A 5L9SA 4G4PA 4RXLA 1IITA 1FTLA 2G93A 4G68B 3BKIB 1M5BA 2OK2A 3K6VA 5CBSA 2NVUB 4ONYA 1URGA 3MVZA 2PMSA 4ZZAA 4R9GA 4ZEFA 3FXQA 4M1VA 4OWDA 1FTMA 4KYEA 4PETA 3IR1A 3TDJA 2Z8FA 2P0SA 4KD5A 4R75A 4AB6A 5TPAB 2DWHA 2AL4A 4IO7A 4JSOA 2PBWA 3KN3A 1B5JA 4ECFA 2Y7WA 4WKMA 3CRBA 3QUFA 1IQ7A 2UVJA 2XXYA 4NE4A 3S9LC 1B7HA 2ANJA 1DTZA 2HZKA 1Y9UA 1JQFA 2A5TA 1OLCA 4QSCA 1EZPA 3U93A 1MY0A 1A54A 4PP0A 4H5GA 5DEXB 4YB7A 4R2BA 4F29A 2CZLA 3T9VA 5ICTA 4BDLA 4YKJA 2H9BA 3H6WA 3ZS6A 4YU0A 2XXXA 4GL0A 4H8IA 3IK6B 2O6AA 2F97A 3TFLA 1MRPA 3O97A 2ZNUA 1IXIA 3D4GA 2Q89A 4LUBA 2H5YA 4NMYA 2XXTA 3MZ9A 4OETA 3V83A 1QW0A 2XHDA 5H8FB 4MH5A 5I58A 3OEMA 3RLFE 2H99A 1FTJA 1JVYA 1MPDA 4IY5A 5I84A 3H03A 4U2RA 3LBSA 3I3VA 4NWDA 3WAEA 4GVOA 2XXRA 2XX9A 3MJNA 2F34A 2UXAA 3PD9A 3PGFA 1DMBA 2F78A 1XS5A 2YLNA 4N6PA 3QXMA 2AYSA 3G3JA 3MP8A 3IO4A 3Q26A 5CM6A 4LQ5A 4GL8A 1R1NA 3DM0A 1USYE 2RINA 1YTVA 1QUKA 3TKDA 4YKKA 3O6GA 3QYTA 1OVTA 3VDFA 2V3UA 3VV5A 2R9JA 1LBCA 2E1SA 2F6PA 2FNCA 4R73A 1B05A 2OBGA 4U4SA 4HW8A 1HSJA 4KQPA 1SW1A 4ZE9A 1B46A 2Y7PA 4OFLA 1FQDA 3H4ZA 2ZYNA 4NEDA 3QUJA 4RA1A 4ZE8A 3V8XB 3FJGA 3M3FA 1B4HA 3IJXB 3TQWA 5TP9B 1OMPA 2I4CA 1M5EA 3HHGA 4NF4A 4P0IA 3TTMA 2UVHA 2RCAA 4FJPA 1IIWA 1HSLA 5AA3A 3VE1B 4OVJA 4P11A 1FQCA 5AE4A 5IAIA 1MXXA 2DXRA 4NF5A 5I57A 4GLIA 5DVIA 1UTBA 1SYHA 3PUXE 3SESA 4OXVA 4N13A 1US4A 4OMBA 1II5A 3CFZA 4AB5A 3M3KA 1T0KA 1ELJA 4G2ZA 4PFYA 3RY3A 5KZTA 1MXYA 1URDA 1A55A 3TZAA 3DP6A 4R72A 3G3GA 3R7XA 5DYHA 2F6GA 3LSLA 1MY1A 4XKQA 3H3GA 4ZZEA 3G3IA 4ZEDA 3TCGA 1S7YA 3E4RA 2GFEA 3FVNA 2UYEA 4POXA 1D3KA 5H8HA 1MDQA 2Q8JA 5AA4B 2DE4A 2WKYA 4PE5B 4Q8RA 1FCKA 3IB1A 3QK6A 1P1NA 5BWJA 3O66A 4WXJA 1DSNA 5CC2A 4HCWA 1ZBMA 4NF8B 1MXWA 2GHBA 2OJTA 4ND9A 4GIZA 5ELVA 1I6BA 5KCJB 1PBPA 3DP4A 3W15C 4KR5A 3MP1A 2RF1A 5CMBA 3THIA 1B32A 2DVCA 3PPRA 4Q0CA 3E9XA 3SDFA 1MS7A 2GHAA 3IAZA 3ZSFA 1N7XA 1BP5A 4PQJA 1MQJA 3FXUA 4F3SA 4NWCA 1WDNA 1Y4CA 3TUSA 3CSGA 2V3QA 2FYIA 2ZNTA 2XXQA 2DE2A 4G8NA 3IO6A 1RKMA 1P1QA 3CFXA 4EUOA 3S4UA 2X26A 1MM7A 3FZVA 5I2KB 1FQAA 1L5TA 5FHNA 5JTYB 4YKPA 1LGBC 2XX8A 3CVGA 4GWOA 1H43A 3KJTA 2HEUA 1XT8A 3DP8A 3MW0A 3TCFA 1IZ1A 2QL3A 1WVJA 3EN3A 4U1ZA 3C35A 1MDP1 2OWTA 2QS1A 1D4NA 1SW2A 5I56B 5A5XB 3UA8A 4NF6A 1Y1MA 3KEIA 4O3CA 4EXLA 2UVIA 5HBCA 1UTHA 5FHOA 4OHNA 1ZMGA 4GF8A 4GXSB 4RNSA 3PV0E 3VXCA 4X1BA 3A09A 2BJJX 4PFTA 3B6QA 2V84A 3MPLA 4R6HA 4F2OA 1O7TA 3LR1A 3A3UA 4OEVA 1B3EA 2W7YA 3KN7A 1OVBA 1LBBA 3TPAA 3TYHA 2F35A 1MM6A 2HFBA 3HV1A 5DEXA 1UIVA 4MLVA 1TT1A 1FQFA 3K1MA 3K1PA 4OFOA 4G8MA 4IB2A 2Y7KA 4JWOA 1LFGA 1MH3A 4QFOA 4U23A 5I2NB 1YCJA 2VHAA 4H0WA 5FHMA 1B0LA 4RJZA 3TTKA 1N76A 4RY1A 1R9QA 1QKBA 4ESXA 3PMVA 3FATA 2VD2A 3Q28A 1RYOA 2RC7A 1B9JA 5AA2B 4I62A 3K6WA 2VD3A 4Z0IA 3ZKLA 2DVZA 1LFIA 1SD3A 2PT1A 4RK9A 3B7DA 4QF9A 3K01A 2Y7IA 1URSA 1FQEA 1EH3A 3O29A 2I3VA 4FECA 5L9OA 2DWIA 1PC3A 4THIA 4FE8A 1A40A 4XKNA 2P2AA 5ICQA 3FJMA 4FAJA 5K2XA 3T93B 3F11A 4JSDA 4ELPA 3OOAA 3I5OA 5KDTA 4R9FA 3SERA 4JWYA 3GBAA 3KG2A 4DIGA 2AIXA 4GQOA 3BFUA 4ESWA 2O84X 2ONRA 1MY3A 1SW4A 4YZZA 3KBRA 4XIGQ 1R6ZA 3FXRA 5TU0A 5AA1A 5EHMA 1QJMA 1JW4A 1MQIA 4KHZE 4WEDA 5H8QA 3PD8A 4C1UA 4X9TA 1NNFA 1N84A 3TQLA 3RGYA 2I0CA 2I3WA 1TXFA 4F19A 1Q1KA 2O69A 1POTA 5J1DA 4OESA 2X7QA 3IJOB 5ITPA 2QPQA 4BDQA 3WAFA 2I6EA 4TOZA 1N3WA 1P1WA 3BBRA 4F31B 1ZKBA 3IOVA 1FW0A 3RT6B 4F1VA 3N26A 5BUUA 1NKXA 2A5SA 4H8JA 5ISUA 1B7UA 1B5IA 4HS7A 3H7MA 4JDFA 3Q27A 2YJPA 2XXVA 1LAHE 3MWBA 3HO7A 4I9DA 4KFQA 3KOTA 1EZOA 1XOCA 3MVYA 3OENA 4HCYA 3KOSA 4IO3A 3GBBA 1I6QA 1KWHA 4U1OA 1AOVA 5CMKA 4R6YA 1JW1A 4LONB 3R6UA 2Y84A 2NOOA 3CG3A 2QMWA 3PUYE 4EQ9A 5JEIA 3TTRA 1PB8A 1SYIA 3PU5A 3S2VA 3S9MC 1WODA 1PEBA 1DOTA 1MQDA 1I69A 2HQ0A 1Z7NE 3IL1B 2P1SA 3I6VA 2V25A 4GD5A 1Q35A 2O7UA 2ZXTA 2ABHA 2DWAA 2QMXA 3H6TA 1B3LA 2DWJA 3FJ7A 3KFMA 1Y20A 3VVFA 1GV8A 2VOZA 4DZ1A 3KSJA 2Q88A 4JB7A 3QIMA 4U4XA 2A5TB 3CSBA 1MXUA 1N04A 3MPKA 3H06B 3CIJA 3G3FA 1B5HA 3PPQA 1Y3QA 2DE3A 4R2FA 3FGSA 3BFTA 4P0GA 3PPOA 3G7WA 1IXGA 4UA8A 5JK4A 5AA2D 3K0VA 2Z8EA 3UP9A 3MAMA 1NH7A 3SEXA 3GLBA 1BTJA 4L17A 1EU8A 2F36A 4KCDA 4X48A 3ILTB 1H3DA 3TAJA 3FV2A 4NTLA 3N94A 4H5FA 4F39A 1VSOA 1D9YA 3EF7A 5I2KA 4ZEBA 3TEPA 5I59B 3PUVE 3OXNA 1TFAA 3T9UA 2GRVA 3K6UA 1PDAA 3UGWA 4DE8A 3LC8A 4QFPA 1B58A 1GVCA 1USYH 4XKPA 1B40A 1A7LA 3RTWB 2DXYA 4IY6A 5I56A 1QULA 3SETA 3KSXA 1LB9A 3OD7A 3C34A 1LCTA 3KJ7A 4OTEA 3H6VA 4ZECA 4YMBA 2IEEA 3T22A 2KLFA 2Z8DA 2Z22A 3UORA 2IA4A 2NUVA 5CMCA 4IGTA 5DVFA 4DCYA 4XTCQ 2XXUA 5L8DA 1QUJA 3RPWA 3U92A 1JW5A 1B1XA 1QKAA 2REJA 2H4IA 4ZS9A 1BIYA 5FTIA 3QAXA 3B6TA 2HCAA 4O3AA 2F7AA 4JXIA 1EZ9A 3KN8A 2ZYKA 2ZMBA 2XXHA 4JWXA 3LSXA 3R26A 4YAHX 2LAOA 5IKBA 3C31A 3C9HA 4BDMA 3SEWA 4RPOA 4C1TA 4OZ9A 2I58A 1B3FA 3L6HA 4TLLB 3K4UA 5AA2A 1LB8A 3FV1A 4HTGA 4KI0E 3VVDA 4LA9A 4LQ2A 4POWA 4U21A 4G68A 4PFUA 1VR5A 3KGCA 1FTOA 4DDDA 4NF5B 3LUYA 4KYSA 1YPNA 1UTBB 1NNPA 4ZEKA 3PPPA 4U22A 3TTNA 3O6HA 1M5FA 3T9XB 3C36A 3OO7A 4H1XA 3UIFA 5L9MA 1B3HA 1N7WA 3AXFA 1JNFA 1LAFE 5TPAA 1M5CA 3PPNA 4MFIA 2DS9A 1R9LA 4GFRA 3E3KA 1MXZA 4LATA 4YB5A 3FASA 4OFJA 3U94A 4F3BA 3CI8A 3ECRA 3RN8A 5ITOA 1VFDA 2AL5A 4OQOA 1NMUA 5H8HB 2NXOA 2ZYOA 3USDA 3T66A 4YICA 3K1NA 1POY1 2THIA 4TLMB 4OYVA 3K6XA 4RYAA 4LZ8A 1Y1ZA 3RQTA 2O1LA 2FA7A 1ZIUA 1ATGA 4K3FA 4GXAA 3TMGA 1S9TA 2RC8A 4FEBA 2Y7RA 1ZTYA 2XX7A 3ODBA 1VFEA 4ELQA 1BLFA 1B3GA 1SBPA 4Z7EA 5H8FA 3OMBA 2PT2A 2ZNSA 1AMFA 2QSXA 4MLQA 1VE4A 3LSWA 3MC2A 3IOTA 3S9EA 3RT8A 2DP8A 1JEUA 2RC9A 3W9WA 2XD3A 4LVQA 3MP6A 3PUZE 4X1DA 1MXVA 3TTLA 3IB0A 2F7BA 4F1UA 1ANFA 1B52A 1NH8A 4F3PA 1XVYA 3K00A 4GOTA 4QRZA 3C4MA 3SEYA 3CG1A 1GTKA 2UYFA 1IXCA 3MVWA 4MF3A 1AL3A 3SKPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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