3RNNA

Crystal structure of iglur2 ligand binding domain with symmetric sulfonamide containing potentiator
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structural and functional analysis of two new positive allosteric modulators of GluA2 desensitization and deactivation.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 87
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rnnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rnnA02
3G3KA 3KOTA 3IL1B 4N07A 5H8FB 3USDA 2V93A 1H43A 3FVGA 2FA7A 4ISUA 3MPLA 3H6TA 4H5GA 2UVGA 2DWIA 1SYIA 4R75A 4OESA 1ZLQA 4ZZAA 1H3DA 1BIYA 3KFMA 3O97A 4JBZA 1IIWA 3FD3A 5JEIA 1MDP1 1FQEA 2DXYA 5AE4A 4IY6A 1MQDA 4NF8A 4G8NA 4NF4A 1HSEA 4KYEA 1XHYA 2THIA 1MM7A 4YICA 4TLMB 4RYAA 4EQ7A 4Z7EA 4ZEDA 5AA2D 2XXPA 4G68C 4YB5A 3U93A 1SBPA 3Q27A 1DSNA 4IGRA 1SDXA 4Q0CA 4QSEA 3FIRA 3LUYA 4KYDA 5IKBA 3DP4A 5ICTA 2F35A 3K6XA 2OZZA 3EHTA 5I59B 4G68A 4GIZA 2D21A 1LFGA 3DLNA 3PUWE 2REGA 5J1DA 3CFLA 3EQ1A 4MH5A 5CBRA 4JXIA 1Z7ME 2ESNA 3IO4A 3PMXA 1ANFA 5FHMA 4HCYA 4Q5TA 4YMAA 3BBRA 3OO8A 1QULA 1JNFA 1F9BA 5HM4B 1OQGA 4BDLA 4F22A 3K02A 3ONMA 1B32A 4OERA 3KOSA 3LSWA 1RYOA 4ELQA 2Q8JA 2H99A 3I5OA 4THIA 1FTJA 2RC9A 2XX8A 1JVYA 3B6QA 2KLFA 3OXNA 3OOAA 2UYEA 1PB9A 4K3FA 1M5BA 2H5YA 5ICQA 5JTYA 3IJOB 4BDNA 3VFJA 1FQAA 2ZYOA 4GRKA 3C9HA 3SDFA 2I3WA 1IXIA 2XXTA 3M3KA 2V84A 1AH5A 3Q29A 3TTKA 4ZS9A 1PB8A 3MC2A 3PPNA 3IR1A 1N84A 1ZTYA 1LAFE 4PE5B 3B6TA 1CE2A 4XXUA 1N3WA 2ZNSA 5I58A 4X9TA 1OIBA 3JYRA 4DCYA 2PT2A 1XVYA 2FNCA 2F36A 4NF5B 1RYXA 2Z8EA 4YKIA 5LOMA 1US4A 4ND9A 4PQJA 4PFUA 5B7DA 4I8CA 4DZ1A 3GBBA 4F3GA 1EZPA 3H6WA 3FXUA 3PV0E 3ZKKA 4JSOA 3DELB 1P1WA 1SI0A 2XXIA 2NUVA 3T9VA 2Z8DA 2OWSA 5CMMA 3S4UA 1XS5A 4O3AA 1FTMA 2DOJA 2XXUA 3FV2A 1MDQA 3QYTA 2I58A 3O29A 1Y3NA 3R6UA 5DT6A 3L6GA 3C4MA 2I3VA 2ZMBA 1MXXA 4G8HA 1OVBA 1MXZA 4U2RA 4E0WA 2REJA 3ILTB 1AIVA 2X26A 4OTEA 3G3FA 2RC7A 5HBCA 3CFXA 1N04A 3EHUA 2OWTA 2Q88A 3TTLA 5L9SA 2UVIA 3CRBA 3BKIB 3MJNA 4OEVA 1JQFA 4R72A 2RF1A 1MQJA 4KYSA 1SW4A 3QAXA 3TQLA 5I2KA 2Q2AA 5L9MA 3RLFE 1AMFA 1H76A 3MW0A 4TOZA 1OLCA 1P1NA 3TTRA 1A55A 3PUXE 5H8NA 4I1DA 3S2VA 1XOCA 3W9WA 3RT6B 3A3CA 4QSCA 3N26A 3EN3A 2XX7A 3VLVA 5I56A 1QW0A 4H67A 1B7UA 4HW8A 2XXVA 2PVUA 4NF8B 4DXUA 5KZTA 4DE8A 4N6PA 3C36A 3T9XB 1IXHA 1EH3A 2VD3A 4M1VA 4MLVA 3W9VA 1Z7NE 2B65A 1ATGA 1USYH 3TPAA 2O69A 4IO4A 1ZU0A 1ZBMA 4KR5A 3KSXA 1A8FA 4KHZE 3IB2A 1DPEA 3IOWA 1MQIA 1HSJA 1FQCA 4G68B 1ELJA 2ZNUA 1N3XA 5TU0A 3MVYA 3GXAA 3UA8A 1SD3A 2B3BA 4RK2A 4EF1A 2ZYNA 4BDRA 1D4NA 4X1DA 3VXCA 4GOTA 1T0KA 4JB7A 2WKYA 5CC2A 2V3UA 1UTBB 2W7YA 1QKBA 1S50A 1N0TA 2H4IA 5K2YA 1B0LA 3MAMA 3UN6A 1D9YA 3MVZA 4FJPA 3H4ZA 5DEXA 4ZEFA 2NVUB 2HEUA 4OHNA 1D3KA 5I2NB 3BFTA 3G3GA 1A40A 3KN8A 2QRYA 3H3GA 1POTA 3K1NA 4JWXA 4QFPA 4IO5A 1JW4A 1MXVA 1MY2A 3RPWA 2NOOA 3B6WA 3WAEA 4G8MA 1P99A 2OK2A 1MG1A 4PP0A 3E4RA 3TQWA 2Y7RA 3FASA 2A5TA 3FZVA 3PD9A 4X1BA 3TELA 3ZS6A 1EU8A 4LVQA 3DP8A 3THIA 2X7PA 1R1NA 2I49A 5FHOA 3O28A 2ANJA 1LAXA 3I3VA 4RJZA 4OFLA 2RC8A 4LZ8A 4ZEBA 3IJXB 4QFOA 3C31A 5K2XA 1QJMA 3K6UA 2GH9A 5H8HB 2G93A 4NEDA 4F18A 4ZDMA 1GGGA 4O3BA 4QFKA 2PX1A 2RCBA 5A5XB 1YPNA 4OENA 3IB1A 4AB6A 4I62A 4R9FA 3HV1A 3D4CA 3CG1A 4H0WA 5AA4A 4ONYA 5AA1A 3VE1B 2QSXA 2Q2CA 2VP1A 1DOTA 1NH8A 1IZ1A 1SW2A 3QXMA 2V25A 1R9LA 1MPDA 3MZBA 3TCFA 4C1UA 1M5DA 2CZLA 3HHFA 3KGCA 4FEDA 4FORA 1EZ9A 1LCTA 4GXSB 4FE8A 3U92A 3C32A 3T93B 2PBWA 2BJJX 4F2QA 1A99A 4ZEIA 1SW1A 1BLFA 4JDFA 3V89B 3TMGA 3V83A 2F78A 5CMKA 3LSXA 4G4PA 1Y4TA 3A09A 5M2VA 2FYIA 1MY0A 1Q1KA 4GL0A 3TAJA 2XD3A 3VVEA 3Q28A 3VVDA 3FVKA 4U4SA 4LUBA 1YAEA 5L9OA 5CM6A 4R6HA 3OELA 3RY3A 2F6GA 5AA3A 4R74A 3FVNA 3PUVE 4IO6A 4RNSA 1FTKA 4F1VA 3EF7A 4JWYA 4FAJA 3T9HB 3CSGA 3SERA 3C34A 5KCJB 3MQ9A 2E1SA 2R71A 2Z23A 4LP2B 1NH7A 1B3HA 1B58A 3OSQA 2RKMA 4YKJA 4ELOA 1MXWA 2Q89A 4PFWA 1MH4A 1M5CA 3RTFB 1H44A 1NNKA 5AA2B 3OO6A 1II5A 2DVCA 4LONB 4YMBA 2O6AA 2ZXTA 3ZSFA 2ABHA 1NL5A 3OO9A 4LQ2A 4KPTA 2E0SA 3K2DA 3U8QA 3IX1A 3KEIA 3E13X 4DIGA 5EHSA 5H8QB 4KD5A 5HPQA 1QVSA 1OLAA 2UXAA 3S9LC 3VVFA 2V3TA 3K00A 1SI1A 3LSFB 2G29A 1Y1MA 4EQ9A 5DVJA 1MXYA 4P0IA 5H8FA 3RGYA 3HCQA 1MY1A 3H6UA 5KDTB 1N7XA 2Y7KA 3U94A 1MPBA 1URSA 1B5JA 1WODA 4RXLA 4G77A 4NF6B 1FQBA 2DP8A 2ZYMA 2O7IA 3RQTA 2IA4A 3V5AA 5TP9B 2UVHA 3CIJA 1L5TA 3MPKA 3TEPA 4OEUA 1Y9UA 1BTJA 5BWJA 4ELPA 1BKAA 4RA1A 1B3FA 4OXVA 1B0HA 1JW5A 5DEXB 1B7HA 2XXYA 2Q9TA 2ZNTA 3PD8A 3QK6A 4Q30B 3T66A 3KG2A 1R9QA 2DSFA 1UIUA 4F39A 4YKKA 4MLQA 1XC1A 4RPOA 2O1LA 3PUYE 3RNNA 3G3JA 1LB9A 1FW0A 2F97A 1KWHA 3VLWA 4RPNA 4OETA 3SETA 4M4GA 3PGFA 1O63A 3LR1A 2P1SA 3CSBA 1URGA 2XXHA 2AYSA 3C35A 2A5TB 3FJMA 5I59A 3OSRA 4LATA 1PC3A 2I4BA 3L6HA 2XX9A 3ZKLA 1Q35A 2VD2A 2Z22A 4QFLA 3FUZA 1FQFA 2GFEA 2OJTA 5I57A 4X48A 2GHBA 2H98A 5CMBA 1B51A 3GLBA 1OVTA 1NFTA 1SYHA 3TTNA 1GTKA 2I6EA 5DYHA 2I0CA 3T96B 3OEKA 2R6GE 3KJTA 4F29A 1B4HA 3U1OA 1PDAA 4U21A 3CFZA 3T22A 4GF8A 4F1UA 4NF4B 1B40A 5ITOA 3LBSA 1DTZA 3LSLA 4XKPA 4TQUQ 2QS3A 3C33A 1Y3PA 4IO7A 2ONSA 1ZIUA 4ZECA 2XD2A 4F3PA 1MY4A 5DTBA 4NTLA 1CB6A 2VHAA 3O6IA 4NWDA 3BFUA 4BLAA 3GBAA 1MY3A 2UVJA 2PMSA 1ZMGA 3O6HA 4QFNA 4F3BA 5FTIA 4FATA 2HCAA 1WVJA 3OEMA 4KCDA 1N7WA 2CMOA 2HQ0A 4NF5A 1B46A 4I9DA 4GWOA 1FQDA 4NMYA 1LSTA 3Q26A 4GVOA 4H5FA 2DQVA 2F7AA 1SVXB 2HZKA 4OMBA 2QMWA 4R2FA 3TZAA 4NE4A 3TCGA 1US5A 2M8CA 3K01A 1M5EA 4HS7A 1TFDA 1MPCA 1HSLA 4XIGQ 3HPIA 3VDFA 4ZE9A 4AQ4A 3QUFA 4ZZEA 3PPRA 1TWYA 2R9JA 2XXRA 4KI0E 2DE4A 3QUJA 3TUSA 3SEYA 5JTYB 3MP8A 3JV9A 1VE4A 3S9EA 1VSOA 3TFLA 3MUQA 2DE2A 1B3LA 4XKNA 1B3EA 5EYFA 1A8EA 4IO3A 2OCUA 4R2BA 3K6VA 4WEPA 1USYE 1B9JA 4R6KA 1J1NA 2QPQA 2F6PA 4KFQA 4KQPA 2ALUA 1TT1A 3CI8A 2O51A 5ELVA 4ESXA 2F7CA 5I58B 4QHQA 1NKXA 4POWA 1O7TA 3VLUA 1S7YA 3TKDA 4RK9A 4QRZA 4F31B 3IAZA 4F3SA 3QIMA 4U1OA 2GRVA 4BDOA 1B7ZA 3IO6A 3RUMA 3G3IA 2F34A 4JSDA 4F2OA 1IXCA 3FVOA 4HTGA 3B7DA 3SEWA 3S9MC 1DPPA 3KZGA 3VXBA 2DVZA 3UIFA 3PPPA 2XHDA 2O1MA 2ONKE 5IAIA 1JW1A 2QS1A 4MFIA 4EDPA 1JVXA 2GHAA 1B2HA 1LCFA 3MP6A 1DTGA 4P0GA 4WKMA 1Y1ZA 4Z0IA 4GXAA 3TTMA 1YTVA 4DCXA 4R6YA 4QSDA 3M3FA 3KBRA 1UTHA 2AL5A 3E9XA 1LBCA 1B5IA 4JWOA 3TCHA 3N94A 3H7MA 3DM0A 1Y20A 2Y7IA 1MQGA 1MS7A 5FHNA 1LB8A 3F11A 3VV5A 3OO7A 4OZ9A 3M3LA 1MH3A 3MBPA 2Y7WA 2AIXA 2DS9A 1NMUA 1UIVA 3FJGA 3H03A 5I2KB 2B3FA 2OLBA 3K4UA 2DWHA 5EHMA 4MF3A 1UTBA 5I57B 1N76A 5CBSA 4DLDA 1P1OA 4WEDA 5CMCA 5H8NB 1PEBA 2HZLA 3SKPA 3SEUA 4ZEKA 5B70A 3GZGA 4Q8RA 4POXA 1LAHE 3IORA 5I56B 2F5XA 3CR9A 2PT1A 4O3CA 3E3KA 2Y7PA 2UYFA 4IGTA 5I2NA 2IEEA 1B1HA 2AL4A 4RY1A 4ESWA 5TPAA 2VOZA 3ILUB 1DMBA 4NWCA 1FTLA 2XXQA 3TDJA 5ISUA 3MZ9A 1MXUA 3I6VA 3T9UA 4EXLA 3K0VA 4H8JA 1LAGE 3A3UA 3H06B 4QF9A 4IY5A 4YU0A 3EHSA 4GD5A 1Y4CA 3FJ7A 4YZZA 2P2AA 4ELRA 4P11A 3ECRA 3SESA 1B05A 1ZKBA 4EF2A 4YAHX 1R6ZA 3O66A 4OVJA 1OMPA 1POY1 2DYXA 2P0SA 4U22A 3SEXA 3UGWA 3IOTA 2O84X 4U1ZA 3HSTA 4H65A 3G3HA 4UACA 2XXXA 4LQ5A 4ZE8A 4IB2A 2Y84A 1LFHA 1EZOA 4OFJA 1LFIA 4BDQA 1O64A 1UQWA 1AL3A 2F7BA 2I48A 4PETA 1IITA 2HAVA 5DVFA 3FXRA 3HN0A 5H8HA 2O68A 4F19A 3Q25A 3S9NC 5A5XA 1S9TA 3PPQA 5JK4A 3KJ7A 3KN3A 4U4XA 3EPEA 1FTOA 1I69A 2DWJA 3PMVA 1AOVA 1IXGA 4IO2A 3D4GA 2H9BA 3KN7A 4AB5A 1B6HA 4OYVA 3N5LA 3FV1A 2I4CA 2ONRA 5H8SA 3PPOA 1B5HA 1RKMA 5CI5A 3FATA 4C0RA 3R7XA 3OMBA 3UORA 5FTHA 4DXCA 1MQHA 3O2AA 5BUUA 1XVXA 3MVWA 3V8XB 3OD7A 1Y3QA 3G7WA 1GVCA 2PYYA 2DXRA 1OQHA 3MP1A 3MZ1A 4OWDA 2RINA 4FIMA 4FECA 3M8UA 4OQOA 3HHGA 3O9PA 2HAUA 4N13A 3PU5A 3N6TA 2A5SA 3DP6A 4ECFA 3PMWA 1PBQA 1MRPA 2YLNA 2NWJA 1GV8A 4LZ7A 4G2ZA 3IOUA 1I6BA 4GQOA 3CVGA 3LC8A 1B3GA 1IEJA 4WXJA 3IB0A 1GR2A 3K1PA 3P7IA 1ZJLA 5KCJA 1A54A 5CRYA 3PUZE 5AA4B 4YKPA 1VR5A 2XXWA 4EXKA 1QUIA 4EQBA 4LA9A 2QJEA 3OENA 2NXOA 2QL3A 3RTWB 3CG3A 4R73A 2H25A 4LZ5A 3H6VA 3W15C 1NNTA 2X7QA 1BP5A 1LGBC 3IOVA 3SEVA 2V3QA 3FXQA 4E0XA 1P1QA 2O7UA 5AA2A 1TXFA 4XKRA 1LLSA 4XKQA 2D5WA 2YPNA 3AXFA 3TODA 1FCKA 1NNPA 5H8QA 3MWBA 1QKAA 4EUOA 1UTHB 3N6UA 2VGQA 1URDA 2HXWA 1B52A 1PB7A 2ZYKA 1YCJA 4BDMA 5ITPA 1LBBA 5F7VA 4H1XA 4C1TA 2F8DA 2I0BA 3QSLA 1I6AA 3KSJA 4DDDA 1IUDA 3UP9A 4KCCA 3ODBA 3FGSA 1NNFA 4L17A 5KDTA 3R26A 2QMXA 4YB7A 1WDNA 1XT8A 3UK4A 3MVXA 4NF6A 2DE3A 5I84A 1I6QA 2D3IA 1MM6A 5L8DA 3U72A 1PBPA 1B4ZA 1B1XA 3JZJA 3WAFA 3HO7A 1H45A 5TP9A 4GL8A 4H8IA 4MBPA 1VFDA 5DVIA 1P1UA 4OFOA 4HCWA 4PFTA 4YB6A 4PFYA 4XTCQ 4F1YA 2RCAA 1IQ7A 1TFAA 1VFEA 2HFBA 3RT8A 5F1QA 1A7LA 4GLIA 1M5FA 2Z8FA 2QS2A 5TPAB 1SW5A 1JETA 1SQYA 3IK6B 4R9GA 2LAOA 3RN8A 1D9VA 4GFRA 2QS4A 4UA8A 2OBGA 1JEVA 3O6GA 1JEUA 4TLLB 3TYHA 4U23A 1QUJA 1QUKA 3K6WA 4FEBA 3K1MA 2DWAA 2YJPA 4H6DA 4DXBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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