3RPNA

Crystal structure of human kappa class glutathione transferase in complex with s-hexylglutathione
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
220
structure length
220
Chain Sequence
GPLPRTVELFYDVLSPYSWLGFEILCRYQNIWNINLQLRPSLITGIMKDSGNKPPGLLPRKGLYMANDLKLLRHHLQIPIHFPKDFLSVMLEKGSLSAMRFLTAVNLEHPEMLEKASRELWMRVWSRNEDITEPQSILAAAEKAGMSAEQAQGLLEKIATPKVKNQLKETTEAACRYGAFGLPITVAHVDGQTHMLFGSDRMELLAHLLGEKWMGPIPPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures and kinetic studies of human Kappa class glutathione transferase provide insights into the catalytic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutathione S-transferase kappa 1
total genus 73
structure length 220
sequence length 220
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2011-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3rpnA01
1GL8A 4MF5A 2VD0A 1A0FA 3ZL5A 1A0RP 3BCKA 4ECJA 4QL7A 3CRTA 4WF5A 4FYBA 2G2QA 3VPQA 3PH9A 2R37A 4ZB9A 2V41A 4IBPA 1GSDA 2R4VA 2VL3A 5HFIA 2YV9A 5CNWA 1FVJA 20GSA 2GGTA 4IKHA 1NSWA 2IN3A 3GKXA 1SJIA 2L59A 5ECQB 2IIYA 5G1KA 5G1LA 4TXOB 4TRXA 3A2VA 1ZCPA 19GSA 3TJGA 1GNEA 13GSA 3CBUA 2LQQA 2PPTA 2VCWA 1TI3A 5J3RA 3J7Yb 2MMNA 4Q5FA 5LD0A 1THXA 1TRWA 1XW6A 1VF4A 4X43A 2GSTA 1SKSB 1FVKA 1XWAA 3GRXA 4RQXA 4DEJA 5DAKB 3CSIA 2DJ1A 3GX0A 3I9V2 3C1RA 1EGOA 1SENA 2VL2C 1U87A 1K0OA 3HZ4A 4WEYA 3UJ1A 5CYYA 4D73B 5HR0A 2FNOA 3RAZA 3LFLA 2P5RA 3H93A 2CX3A 2GQMA 3KGKA 4I97A 1XCCA 3VWWA 1Z5YE 5IMVA 1ERVA 3DWVA 3UARA 2R2JA 2O87A 4I2TA 5ID2A 2CZ3A 2DMLA 4TW5A 2H1GA 2LJRA 4EDZA 1K0DA 2G0FA 2PVOC 4FIWA 5ELAA 1TK0B 4RQRA 5IPGA 3HVSA 3D22A 2V2GA 4V2NA 1PGTA 2H0GA 5DCGA 3RHCA 2IL3A 3VK9A 3IRAA 4OFNA 5B8BA 2K18A 3NZNA 2MYGA 2H76A 1QXHA 4ZL7A 2D2ZA 1PL2A 3EYTA 2J9HA 2CA8A 3D5JA 2LKUA 2MZCA 3BOAA 4MPGA 1AW9A 1BG5A 1XW5A 3BBYA 4L0WA 1BX9A 3G7IA 5KN2A 3KTLA 5ABRA 1SD8A 4LMVA 2LRTA 1MTCA 1MDIA 4GSSA 1E6BA 3D4MA 2IMKA 2AUVA 3HY2A 4JR6A 4MK3A 2LV3A 2YJHA 1V57A 3EU3A 4KCEA 5G30A 1EV4A 4LL4B 2QGVA 3HJMA 1EOHA 5DQSA 1B9YC 5C00A 2H8LA 1G6YA 5FHIA 4FYUA 5KEJA 3DKSA 3A2XA 1R5PA 4MJEA 3D0ZA 3K8NA 2P0GA 3GL5A 3D6IA 4QL9A 3M8NA 5D96A 1F3BA 2YWNA 2FWFA 1KEBA 1U88A 5EL8A 4BVXA 4ZBBA 5HQPA 1PX6A 1XWCA 3BD2A 3D21A 1OVNA 2CZ2A 4HU9A 2X8HA 2C3TA 10GSA 3LQ7A 3MAKA 1VRSD 2X64A 3R2QA 1UA5A 1R26A 1SYRA 4MMMA 2NDOA 3P90A 4AJ7A 2E2MA 5D73A 1G7EA 2QSIA 1JLVA 5F06A 3G9BA 4KH7A 1O6JA 1TDIA 4AGSA 4OO5A 2MMOA 3TUEA 2OACA 3LG6A 2E7PA 4TR1A 3W8SA 2IMIA 4PUFC 3TJFA 3MNGA 2NTOA 3J7Yk 1YF1A 2DC5A 1UN2A 3KP8A 3TCOA 2AYTA 1A2JA 4MF7A 5AN1A 1GSFA 2ZUPA 4Q5QA 2VM1A 4HZ4A 2JZSA 2GSQA 2EIOA 4XS4A 1XOAA 5B7CA 3VLNA 2GZPA 2GSRA 1ZZYA 2AB6A 4Z7XA 4FO5A 3GTUA 4BVYA 3G7JA 3VI7A 1XVQA 1BEDA 1M2BA 1ZOFA 3KXOA 1A8LA 4LA1A 5EVOA 5H5SA 14GSA 4XRAA 5CRDA 2CAIA 5G31A 2X99A 1WRYA 4E8HA 4CW9A 1XWGA 1OAZA 2WJUA 2DJJA 2GTUA 5G2ZA 2Z9SA 1HYUA 3IHQA 4EVMA 3H4KA 2DJ2A 6GSUA 2AJQB 1LJRA 1Q98A 3HVXA 1KBNA 3FR6A 1T3BA 5A4UA 2N5FA 4IN0A 1J0FA 2GZYA 5HR2A 18GSA 2RIIA 2VOCA 1AXDA 4N0VA 1SL1B 3TGZA 1BYEA 1F37A 4HQZA 2XPDA 1EP8A 3EMPA 4JZQA 3LXZA 1TU7A 4N10A 3ZITA 8GSSA 2F3MA 2C0GA 1O73A 4RUVA 1EV9A 3TKSA 2AV4A 1TW9A 1O7UA 3CXGA 2JZRA 4IW9A 5IOXA 2GQKA 3APSA 3F3RA 3WGEA 4L5OA 4G2EA 1ILOA 4K7NA 1OC8A 3E3EA 3RPNA 3KIJA 1GUKA 3ZYWA 4DSSA 1GTBA 3UVHA 4BL7A 2F9SA 3DRNA 4O7HA 3ERWA 2KHPA 1JHBA 2E2GA 5B6MA 3QDNA 2H0HA 9GSSA 1SL2B 1O8WA 4PUAA 3L9SA 1FHEA 4KAEA 2KUCA 4DSRA 4V1Ap 1OC3A 4TR1B 2YOIA 3ZTLA 1EEMA 2I1UA 1PL1A 4MH3A 1GSUA 1YJ6A 3IDVA 2REMA 2H75A 2B5YA 4O5RA 4GSTA 4G9HA 3O6TA 1ACVA 1ABAA 5G5FA 3Q74A 4XS4B 4K0GA 5JWQB 2XC2A 4GRFA 1QUWA 1XWBA 1T1VA 2WDUA 1S3DA 1EWXA 4EO3A 3ZMLA 2LEGA 2DLXA 4EXJA 5GSTA 3TRPA 2C3NA 2HE3A 1O85A 3GTUB 4O92A 3FK8A 2LRNA 2OE3A 1R5AA 3IXRA 2FD3A 2IJYA 4F82A 2YN1A 4L8EA 2ON5A 5F07A 2KP2A 5IIZA 1B4PA 4LL1B 2HYXA 3IBHA 2A2SA 2P5QA 3VWVA 5ECIB 5HR1A 1FB6A 4LMWA 1SYXA 1RQMA 1EGRA 3V1WA 1Z7RA 2YWOA 4F2IA 3DIEA 1TI1A 2CV4A 4OFMA 1GTAA 1OE8A 2TRCP 2B5EA 2LRCA 4G19A 3C73A 2CT6A 1XIYA 3M1GA 1Q4JA 1A2MA 4IELA 2FWHA 4K9ZA 2PGTA 2R3XA 1YEXA 3UEMA 1IYIA 2YNXA 4JU5A 1NW2A 2B5XA 2JACA 1EEJA 3GX8A 3F9UA 3KEBA 1U3AA 2N5AA 1TRVA 4NAXA 4GXZA 4WF4A 1A2LA 4KSMA 4G10A 4DSSB 3F3QA 4KGIA 1XZOA 2M46A 1WPIA 5E59A 3QFBC 3NOFA 2CAQA 4Q5RA 2IFQA 4HI7A 2JL4A 2LSTA 2GQLA 2WFCA 1HQOA 2FA8A 4RI7A 3ZFBA 2DJ0A 2L57A 2FY6A 1YEPA 6GSWA 3LORA 1ERUA 3QMXA 2ZNMA 4XS6A 4P3YB 4GWRA 1GSSA 4AJ6A 2IMDA 4I6XA 1SL0B 2OKAA 1PA3A 3H79A 3FW2A 1RK4A 1SKRB 1F2EA 5A5KA 3RDWA 1PKWA 1XBSA 3FRCA 2RM6A 2JSYA 2O89A 4MJAA 4JR4A 11GSA 3IK7A 4POKA 2YZUA 4MLYA 4F9ZA 2VUPA 3WT2A 1JZOA 4IJ3A 4EKZA 3TJJA 2VLUA 3W6GA 1CQGA 2F8FA 2N5BA 3KD0A 3H1NA 4JE1A 3GV1A 2PERA 2JZTA 2O85A 2VD1A 2A4VA 3ZLPA 1K0AA 3GNJA 4BPYA 2EIRA 4H86A 1TRUA 3HA9A 4OCEA 4J57E 1T4YA 2H66A 5FT3A 3FZAA 2F8AA 1Z6MA 4ID0A 5IMDA 3UBLA 2OA7A 1AQWA 4WR5A 1VGLA 4KCAA 2MMAA 2H6XA 5ECRB 4WETA 5CRGA 1B4QA 1NHOA 2FLSA 3ERGA 3F4RA 5IM9A 4TN8A 4MZBA 2B3SA 2IPAA 4PURA 2J23A 2WGRA 3PGTA 3ZMKA 2HT9A 1TOFA 1TK8B 3GIXA 4NMUA 4KDYA 4V2LA 6GSXA 3VI5A 1TK5B 5E4WA 1AAZA 1K0NA 2WZ9A 3A3TA 3DEXA 4POMA 2AAWA 3GHAA 4AF2A 4QQ7A 2GSSA 3L0HA 2IFQB 3NIVA 1G0TA 3IAM2 2OADA 5IMZA 2OE1A 4I5QA 2YV7A 2B6MA 4YAPA 1ZYEA 2I4AA 5DALA 2FWGA 1C72A 2DIZA 4OD7A 1SKWB 3QOUA 3IA1A 6GSYA 3QAWA 1GLPA 3VWUA 3FEUA 3TKSE 4NXIA 2P31A 1PSQA 2WULA 2XBIA 5A4WA 3DD3A 2CVKA 4TKYA 4ZXGA 4BWQA 1K0BA 1MEKA 3Q6OA 2BJXA 5IQYA 4MDCA 2DJ3A 4TXVA 1QQ2A 3EMXA 3WGDA 4MH2A 1QGVA 4KB3A 3MWHA 4ZIJA 1Y6EA 3N5OA 4YAVA 2I3YA 4KA0A 4IQ1A 3TKSC 4EE0A 2AHEA 4MZCA 5COHA 2K8VA 4YQUA 1SJ6A 1U6TA 2KLXA 3TKPA 5LNKe 5ECPB 2PN8A 4K6XA 2VAFA 2XBQA 4OO4A 1EP7A 1DUGA 4K7IA 3LWAA 2LJAA 2FWEA 2YP6A 3IOSA 4CHSA 1ZYQB 2HSYA 5D9WA 1V98A 5ID2B 2L4CA 2ZCTA 2HI7A 1ST9A 5ECNB 1E2YA 5GZZB 4AJ8A 1AC1A 1DSBA 2FUG2 3VURA 3HYPA 1M9AA 5B8AA 4PGTA 3I69A 2RLIA 1GP1A 1XVWA 1ZL9A 4JRRA 2VL9A 4ILFA 5IOWA 1GSEA 1GLQA 5B6NA 3EWLA 5JWRB 5J41A 3KH7A 4GCIA 2BTOT 1I9DA 1THOA 3EURA 2LTKA 1S3CA 3FY7A 2IWTA 3SWLA 5D93A 2R6KA 1T4ZA 2KOKA 3DVWA 2GZZA 5EPFA 1I5GA 3O3TA 3DVXA 3ZVJA 4WBJA 1TRSA 4IGJA 5DALB 1XXUA 3LYKA 3LSZA 4MF6A 3GFKA 5ECSA 3IR4A 5DBQA 4HS1A 4PQ1A 1O81A 1USBA 4PQHA 4IS0A 5KN3A 3TDGA 5J5NA 5F8BA 2X8CA 3M9KA 2HSHA 2I9HA 2NBSA 3ERFA 1J9BA 2QC7A 4ULXA 2H1BA 5ECMB 4I2UA 3ME7A 3HZ8A 4V1Ag 3RBTA 4HU7A 3ZZXA 4N30A 5KN0A 3P8WA 2DBCA 2E0QA 4NPBA 5IMFA 2NPBA 1TXXA 5ECKB 5L71A 1EOGA 4NHWA 3QPMA 3MSZA 3HXSA 2H70A 1YKAA 5J4UA 1Z7PA 4OFTA 4ZL8A 2LS5A 4MJBA 1FW1A 4XHMA 1UVZA 1KTEA 2FA4A 5CREA 3WYWA 1YZXA 2K8SA 3M3MA 3GH6A 1K3YA 2H0IA 2MBSA 2YANA 5GAPD 3CYNA 2M72A 2H1DA 2WRTA 1TTZA 2CX4A 4KX4A 1YDKA 3A2WA 2M80A 2O8VB 1MDKA 4MCUA 3ED3A 1YKCA 2LNSA 1XFLA 3WT1A 3HVVA 1OYJA 5AIVA 2FCHA 2H71A 3FZ4A 4O32A 2RUEA 5J9BA 1X5EA 4GQFA 4LLRA 4OWYA 4WBRD 2HNLA 5ELGA 1OC9A 4GSNA 2H73A 3MDKA 4NWYA 3EU4A 1YF0A 4IJIA 3H8QA 5HFKA 2X8GA 3GL3A 3APOA 1ZMAA 4PNGA 1BAYA 2NVLA 3KCMA 4JEDA 3JCML 2ALBA 4EL1A 1Z6NA 2IMEA 3PR8A 1K0MA 1SK1A 3CSHA 1J08A 3D4TA 2YJ7A 3F6FA 2DSAA 1T7PB 5DJLA 2H74A 2CVDA 2YZHA 1VF2A 3UOMA 4KNDA 2H30A 4GTUA 4ECCA 4TVEA 5IMCA 4PXOA 3C71A 1WWJA 1PMTA 5GSSA 2VCTA 2WS2A 4D73A 3TB2A 1ON4A 3KJYA 4IP6A 1GTUA 1GSYA 1X0RA 4KW6A 1U3IA 2TRXA 3CTGA 2YPMA 5G5EA 4EC0A 3I43A 3UL3A 4WR4A 4K1FA 3IAS2 2VO4A 3WGXA 4JBBA 3HDCA 3KZQA 2PU9C 3HD5A 1N2AA 4IP1A 2MMZA 5FWGA 3IE3A 3VFIA 3E0UA 2LNTA 4EF0A 3VWXA 2XHFA 1FO5A 3DGQA 1A8YA 1B9XC 3L9UA 3QR6A 4POBA 5A4VA 5DJMA 4ZBAA 3TOTA 1FOVA 2FHEA 4GF0A 1SK2A 5C04A 1HNBA 1Z9HA 3FZ5A 2VCVA 1GUMA 3N9JA 3GMFA 3GKNA 1V2AA 3UBKA 3SBCA 1OC9B 5JCWA 1OKTA 2OE0A 1T8EB 2V6KA 3L4NA 3OR5A 3GSSA 2K6VA 1HNAA 1X9MB 1XPVA 4ECIA 4WKWA 1W4VA 4GQCA 5D9XA 4J2FA 1GUHA 3CSJA 2VCXA 1URMA 3KTBA 2F51A 1HD2A 5ENUA 4YQVA 7GSSA 2VCZA 1JZWA 3GH9A 2OJLA 4NV5A 3HHVA 3UVTA 3DMLA 2H6ZA 4NV2A 2B1KA 4POLA 1TKDB 1WOUA 1TP9A 1YQ1A 3ZVJD 2WB9A 4PNFA 2PMTA 2VIMA 4IVFA 1TU8A 4ISDA 4OCFA 2PVQA 4E8EA 5KN1A 2GVPA 1FG4A 3DYRA 2L6DA 1B48A 3ISOA 1H75A 2C8UA 2B7KA 3TJBA 3FYGA 4HJMA 3E9JB 4ZILA 3GN3A 4CDOA 1PRXA 2DMMA 1LU4A 3KMNA 1S3AA 1UC7A 1V40A 3ZIVA 1AUCA 3FHKA 3RHBA 3GUSA 4HUAA 4MJCA 5ECHB 1X9SB 4ZBDA 5H5RA 1KNGA 1N8JA 3W8JA 2B1LA 3EVIA 3GURA 3QD9A 3L78A 3BJ5A 3GKKA 3IK9A 2C0FA 3AY8A 6GSTA 1F3AA 4ZB6A 4TR3A 1R7HA 1SD9A 4L0UA 4BA7A 3O76A 2C3QA 3QAGA 2GT6A 5GAND 1X9WB 3HKRA 3TOUA 1WP0A 4TR0A 1R4WA 3ME8A 5ECLB 1EZKA 1AIUA 3WD6A 3Q18A 4PX1A 2LUSA 1ML6A 2C4JA 4KUNA 3RPPA 1HNCA 4YQMA 3VPTA 1VF1A 2IMFA 2OBKA 2HFDA 1WMJA 2O7KA 1GSQA 5DVBA 2PWJA 1GTIA 5JWOB 2GDRA 1GNWA 2DIYA 1TJDA 4N0ZA 4I8BA 1A24A 3EINA 4WXTA 2XPEA 2GS3A 3ZFLA 4TOPA 2L5OA 5INYA 3GKMA 5AIXA 4FYCA 3FZ9A 5EY6A 1XOBA 3C7MA 3EE2A 1W89A 5CP1A 2TIRA 2L5LA 2YCDA 5F0GA 1GWCA 5D9TA 3QAVA 2EIQA 1JLWA 2RUFA 1JFUA 4KDUA 2V6OA 2VL2A 3S9FA 2VCQA 4HJ2A 3QFAC 5JCGA 3CTFA 4F0BA 4PQIA 3TKQA 1ERWA 2A2RA 3UAPA 4NHZA 4KDXA 3C8EA 4V2MA 3LYPA 4ML6A 3LGCA 5IO0A 1MDJA 4FH8A 1WIKA 2WCIA 4ZB8A 4HDEA 1M99A 5J9CA 3APQA 1QMVA 2ES7A 1PKZA 5DDLA 4MP4A 1GULA 5LCZA 1A23A 3FR9A 6GSSA 1AQVA 1XWKA 4K8MA 3P7XA 6GSVA 3EC3A 3M9JA 4HZ2A 1YY7A 1AQXA 4K0NA 2LQOA 22GSA 1Y25A 2R5GA 2HZEA 5JCUA 1X5CA 2B7JA 4J56E 3M0FA 2GT5A 2C1YA 1IYHA 3KMOA 4MZWA 1V9WA 2H19A 1JZRA 3UMAA 2ON7A 2DJKA 1M0UA 2H72A 2HLSA 4X0XA 5AGYA 1PX7A 4XS1A 4F03A 4ACSA 3L9VA 2H1AA 2CQ9A 3TJKA 1NM3A 1QFNA 4OMVA 2JU5A 1F6MC 1PQNA 2C80A 4EDYA 1VF3A 1SK0A 5DCHA 2HXKA 3C1SA 3TRQA 1SJZA 1M2DA 12GSA 16GSA 4MPFA 2C0EA 1FB0A 3F4TA 1MD4A 1WJKA 4X1UA 2I81A 3KM6A 1SU9A 2JADA 1GRXA 2LJKA 3TKRA 1M7TA 1PN9A 3BCIA 1V58A 1CQHA 1WE0A 2C0DA 2QKEA 2L6CA 2GLRA 1G6WA 3LJRA 4K2DA 2VM2A 2CVBA 2PBJA 3ZIJA 4ZL9A 4F0CA 3GYKA 1OKDA 1RW1A 4IQAA 5IPHA 3QCPA 1DBYA 3ZRDA 5AISA 3I6AA 1DE1A 5DQYA 1X5DA 1DE2A 3Q19A 3U6VA 5D9VA 3HJPA 3U5RE 4KSOA 4HOJA 1LBKA 4IHUA 4K7OA 3F63A 5CO3A 3IV4A 5HR3A 1H4OA 5IMAA 2HRNA 3HCZA 2RM5A 3US3A 2VLVA 3P2AA 4ML1A 17GSA 1K0CA 4TXOA 3DXBA 2HZFA 3IC4A 2MBTA 1ERTA 3TRXA 4TR4A 4GLTA 1M9BA 4MABA 2HZEB 3LXTA 4HEA2 1FAAA 3KP9A 1XW9A 1JZDA 4BWSA 2EC4A 4HQSA 1BJXA 4N11A 1G7OA 2FGXA 2BMXA 5H5QA 3A5WA 3CMIA 2HRFA 3F0IA 3F6DA 3G7YA 2H6YA 1O8XA 5ECOB 1NHYA 3IPZA 5DAKA 1B8XA 3PINA 3F4SA 4YH2A 3FKFA 3KH9A 1Z3EA 5CRHA 2YWMA 3LEFA 1OE7A 2H01A 5IO2A 4Q5NA 4XTSA 1PD21 4XRDA 3GA4A 4MA9A 4L5LA 2JSZA 2V32A 1BQ7A 5CAXA 4ECBA 5HFGA 3GSTA 3F8UA 4XIHA 1F9MA 2K9FA 4KE3A 1MD3A 3ZREA 2OBIA 2V1MA 2YWIA 1QK8A 3HJOA 1K3OA 3CRUA 1GH2A 4RI6A 4DVCA 2KP1A 2VLTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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