3RPPA

Crystal structure of human kappa class glutathione transferase in apo form
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
220
structure length
216
Chain Sequence
GPLPRTVELFYDVLSPYSWLGFEILCRYQNIWNINLQLRPSLITGIMKKPPGLLPRKGLYMANDLKLLRHHLQIPIHFPKDFLSVMLEKGSLSAMRFLTAVNLEHPEMLEKASRELWMRVWSRNEDITEPQSILAAAEKAGMSAEQAQGLLEKIATPKVKNQLKETTEAACRYGAFGLPITVAHVDGQTHMLFGSDRMELLAHLLGEKWMGPIPPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures and kinetic studies of human Kappa class glutathione transferase provide insights into the catalytic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase kappa 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 69
structure length 216
sequence length 220
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2011-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3rppA01
4NXIA 2DSAA 2H75A 1O7UA 3VK9A 4X0XA 5IMDA 1XWGA 3E3EA 3A5WA 4ZB8A 3M1GA 1M7TA 2GQKA 3DIEA 1XOBA 1W4VA 5D9XA 3D21A 4IELA 3LXZA 2FGXA 5INYA 2GGTA 1GNEA 4V2MA 1EP8A 3H93A 5FT3A 1YY7A 2LRTA 1RW1A 2CVBA 4BL7A 1AIUA 5LCZA 1PA3A 4BVYA 1JZOA 4IHUA 5G31A 1TK0B 4IQAA 2ZNMA 1N8JA 4G19A 5IOWA 11GSA 1W89A 4HQSA 3FEUA 2B1KA 5DJMA 4BA7A 3APSA 1V57A 3HKRA 1WPIA 4EC0A 4TN8A 5IO0A 4IJ3A 2JACA 5B8BA 2PVQA 2H0IA 4NPBA 3UARA 2CZ2A 3IV4A 3A2VA 5ECNB 1F37A 1PX7A 4KGIA 3SWLA 2NTOA 4WF4A 5IIZA 4QQ7A 1SKRB 2F8AA 1HNAA 2NVLA 1M2BA 1NW2A 3G7YA 4GQCA 3TCOA 2R5GA 3NOFA 1G6WA 5DCGA 4IQ1A 5JCWA 3HYPA 4F82A 1WRYA 2RLIA 2OA7A 2YZUA 1M9BA 1V40A 1SYRA 2F3MA 2JZRA 5G1LA 3IK9A 1M0UA 3NZNA 2HXKA 4JRRA 2LRNA 3C1RA 3HXSA 4P3YB 3FHKA 3FZAA 4QL7A 4J57E 4MF7A 4ZB6A 3TKSA 1QGVA 3QOUA 1TTZA 22GSA 2PVOC 1UA5A 2O87A 2VL3A 4FO5A 4TXVA 3FZ9A 2J23A 4MPFA 3GX8A 3DVXA 4N0ZA 5ELAA 4IBPA 3QFBC 4K8MA 5G2ZA 5KN2A 4PUAA 3KIJA 3PINA 1TW9A 2P5QA 4L0UA 4KSMA 2P5RA 5E4WA 5G5EA 3C73A 4PNGA 1O73A 1OAZA 3O6TA 2IJYA 3GSSA 3HHVA 19GSA 3GSTA 2DJ1A 1VF3A 4BWSA 3G9BA 1SJ6A 1Z3EA 1U87A 1OC9B 5G30A 2CX4A 2WZ9A 5ABRA 1K0BA 1THXA 5HR0A 5KEJA 1M9AA 16GSA 1UVZA 2H74A 4JR4A 1NSWA 4IN0A 5DBQA 1JLWA 2JZSA 2L4CA 1GULA 3KMNA 2R2JA 3D0ZA 3QD9A 1YEXA 1K3YA 3IC4A 3PR8A 2P31A 1K0DA 3APQA 1TP9A 1G7OA 2H0GA 1A0FA 2B3SA 3DEXA 3KTBA 1Z7RA 3W8SA 5ECPB 3D6IA 1AC1A 3ZFLA 2N5FA 1TKDB 2GSTA 3GHAA 2GT6A 2GDRA 1QQ2A 17GSA 1PKZA 2DJ3A 2WCIA 2WGRA 4MP4A 2VLTA 5DAKB 1GSYA 3ZVJD 4WKWA 3RPNA 5CYYA 13GSA 3CMIA 4TR1B 3LFLA 5A4UA 3UVTA 2OJLA 2V41A 4K7NA 2FD3A 5GSTA 9GSSA 1KNGA 5DALA 1PL2A 3D4MA 1SU9A 2LRCA 1EV9A 3HZ4A 5AISA 1KBNA 3HVXA 1EOGA 1ZOFA 4X43A 3CRUA 4KSOA 3KCMA 2VCTA 4CW9A 2DIYA 3EINA 1PL1A 3UJ1A 1AQVA 4N30A 4PURA 4PXOA 1HYUA 4KAEA 4OO5A 5B8AA 3ZMKA 2KOKA 4CHSA 2YOIA 1A2JA 3EU3A 4MZWA 1K0MA 1K3OA 3HVSA 3FR9A 3C7MA 2QSIA 1G7EA 4NWYA 2O89A 2DJJA 3KD0A 2HZEB 1DUGA 4XS4A 2HE3A 3LYKA 3WD6A 2GZYA 3EMPA 1UC7A 1ZYQB 3VI5A 4IP6A 3DRNA 4DSQA 2CQ9A 4PGTA 1XFLA 5H5QA 4XRDA 2WB9A 1EGOA 3AY8A 4GRFA 2GQMA 5IPGA 2X8GA 1M2DA 5C00A 2HZFA 4PQ1A 2H70A 4MH2A 4MJEA 1QK8A 2YNXA 4TRXA 1TXXA 2PBJA 4MJCA 18GSA 1HNBA 4HJ2A 4HUAA 1DE1A 4NHZA 5FWGA 3UBLA 6GSUA 4MJBA 2YWNA 2LJAA 4J2FA 1Y6EA 4YH2A 5EVOA 4ML6A 4KH7A 2IFQB 1EOHA 2B5XA 4HZ4A 1ST9A 4OCFA 2BJXA 1TI3A 3HVVA 3EYTA 1XVWA 4KE3A 4G9HA 4XIHA 1WE0A 4XHMA 1EWXA 5B6NA 1EP7A 4LLRA 2F51A 4K2DA 1MD3A 2CV4A 4IGJA 3FR6A 2XPDA 2YN1A 2MBTA 4KA0A 2MMZA 2VM1A 3SBCA 4OFMA 1SL0B 4YQMA 3H79A 4O92A 4PQHA 3RHBA 3TJBA 4EDZA 1ZYEA 1CQHA 1TU8A 1BJXA 3FYGA 2H0HA 3DVWA 3TRXA 2FWEA 1FOVA 3M3MA 1NM3A 4K0NA 3GFKA 4WR5A 3BJ5A 1HD2A 3I9V2 1RK4A 4V1Ap 5D96A 1MDKA 3HCZA 1S3CA 2VAFA 5CRGA 2L5OA 1YKAA 2FLSA 4N11A 4AGSA 4K7IA 3VWUA 1BQ7A 3IAM2 2H66A 6GSTA 1MDIA 3L0HA 4TOPA 1GSQA 2MZCA 1GSFA 3EVIA 3L9SA 2FA4A 3F3QA 1A8YA 1ILOA 2O85A 2CA8A 2O8VB 3GKKA 5LNKe 4OMVA 3KH7A 2JL4A 2A2RA 3FR3A 5COHA 4WBRD 3M9JA 1JLVA 3IA1A 1B8XA 4CDOA 1NHOA 3D4TA 3LQ7A 3EU4A 5A4WA 2C80A 3A2WA 5CRHA 4EUYA 1X9WB 5J9CA 3ZIJA 3F3RA 4MPGA 4N0VA 1WP0A 5EL8A 2N5BA 4IVFA 2CAIA 4V2NA 2LQOA 1Q98A 1R7HA 3W6GA 4L8EA 1ZL9A 1QFNA 3KM6A 3GKMA 1V98A 3KMOA 3PH9A 4TKYA 1XOAA 1EEMA 3C71A 4HU9A 4PUFC 2VLUA 3A2XA 1DBYA 3GUSA 2J9HA 4TW5A 2R3XA 5AIXA 1BAYA 3KZQA 1TK8B 2YWIA 2L5LA 2GZZA 5ECIB 1JHBA 4ZL7A 4WR4A 5D9TA 3GURA 1O85A 1F3AA 2WULA 1XWKA 1IYHA 4DSSB 5J9BA 2C4JA 3CYNA 4EKZA 5HQPA 4LA1A 5ECRB 3CSHA 2VD0A 2C8UA 1SKSB 2K18A 5ELGA 3GL3A 2LQQA 1PD21 2GSQA 4ZL8A 2IPAA 1FHEA 4XRAA 1XZOA 3TOTA 2A4VA 4AJ8A 20GSA 3S9FA 3K8NA 5F05A 4F0BA 1K0AA 3QAWA 4RQRA 4RQXA 4GQFA 2YJHA 4KNDA 1Z6NA 3VWVA 4JZQA 2CX3A 4GLTA 4K7OA 3I69A 3H1NA 4K9ZA 5ECKB 3ZMLA 3CRTA 1TU7A 4FIWA 5ECHB 5HFIA 3ZVJA 2KLXA 5AGYA 1XCCA 10GSA 4G2EA 2KUCA 1F9MA 2HT9A 3TJJA 1XWCA 4RI6A 4GWRA 2H71A 2IMEA 4I2TA 4XCSA 4IS0A 1H75A 1GTAA 1X9SB 2H19A 1ERWA 1T3BA 3C1SA 1J0FA 4ILFA 2IN3A 2IWTA 4KW6A 1ERUA 3E0UA 3F0IA 2TIRA 1AQWA 3FW2A 3QCPA 4HQZA 4TR0A 1N2AA 3KTLA 3DXBA 1TDIA 2H8LA 2LNSA 4MCUA 5ECMB 1T00A 1A0RP 3TRPA 5ECSA 3MSZA 2RUEA 3F63A 2JU5A 2FWHA 3TDGA 4ECBA 2XBQA 4ECCA 2H01A 1FVJA 2HSHA 2LEGA 4KX4A 1DE2A 2BTOT 2HLSA 2AUVA 2H6ZA 3EURA 4ZXGA 2H72A 5EPFA 1Z5YE 4MZCA 5GSSA 1XXUA 4G10A 4GTUA 3TJFA 3ERWA 3LEFA 2OKAA 1K0NA 1OYJA 2OE0A 3LORA 3VURA 3WGXA 2XHFA 2M72A 4YQUA 2YJ7A 3HJPA 4MMMA 3KJYA 2GS3A 2DBCA 4I8BA 4V2LA 3DWVA 3F8UA 4D73A 4LMVA 1PMTA 3ZL5A 3QDNA 3GH9A 3PGTA 1GUHA 4TXOB 3GTUB 1BX9A 3G7JA 1GSUA 2AHEA 1X5EA 2K9FA 2M46A 2FUG2 3UOMA 4ZBBA 2DMMA 2IMKA 4F03A 2P0GA 5LD0A 2R6KA 1BYEA 2YWOA 2LV3A 1GUKA 4OWYA 5HR2A 4POKA 3UEMA 5J3RA 1A2LA 3ZYWA 4I2UA 6GSSA 2PPTA 5KN3A 3APOA 4PNFA 4TR4A 3WT1A 2C3NA 4MA9A 2PN8A 1SYXA 1M99A 3IBHA 1YZXA 1XWAA 3KGKA 5DJLA 2WRTA 2H1AA 3GRXA 1TRSA 2H6XA 1AAZA 3N9JA 2ZCTA 5IMVA 1T8EB 2GVPA 2OE3A 4PQIA 1J9BA 5JWQB 3H4KA 3CBUA 3CTFA 5IM9A 4EDYA 2HYXA 2TRXA 2V1MA 3ME8A 2DJ2A 2H1DA 3GN3A 3QAGA 2Z9SA 1Y25A 1ZMAA 1SJIA 2I1UA 1SL2B 4I97A 5H5SA 3FK8A 3LWAA 5ID2B 3W8JA 3EWLA 1I5GA 2H1GA 1LU4A 1ON4A 3Q19A 1Z6MA 1JZWA 3LGCA 2I81A 3EC3A 3P7XA 6GSWA 1O8WA 3BD2A 3ZTLA 4ID0A 2WS2A 1GTIA 3VFIA 2PGTA 3GL5A 4FH8A 5C04A 2HSYA 4ISDA 2E7PA 1TI1A 1KEBA 5JCUA 4KCAA 2B5YA 2EIOA 5D73A 3WGEA 4GSSA 2R4VA 3EMXA 4EXJA 3HZ8A 3VPQA 1TRVA 2V32A 2CVKA 3FKFA 1OE7A 5IQYA 1QMVA 8GSSA 2VCZA 4ZBAA 3TGZA 1GRXA 1USBA 2H76A 3IRAA 4MJAA 4I5QA 2G0FA 3IDVA 2OBKA 1VGLA 2K8SA 1M2AA 1XBSA 2AV4A 1B9XC 3F4RA 2XBIA 3KH9A 3IE3A 5ECQB 2E0QA 1X5DA 1OC9A 3TJGA 3TUEA 2VD1A 1X9MB 1KTEA 2L59A 3R2QA 2HFDA 4WEYA 3ZRDA 5KN0A 1EGRA 1ACVA 3M0FA 4KB3A 3TKRA 2ON7A 4MF6A 3VWXA 3DGQA 2DMLA 4ECIA 2RIIA 3WYWA 4MLYA 1JFUA 4IKHA 5L71A 3IK7A 4ULXA 3H8QA 4DSRA 1ERVA 3CSIA 5IMZA 3TJKA 3TOUA 2ES7A 1O8XA 3ED3A 3CXGA 4I6XA 3OR5A 1GL8A 1SD9A 4ZIJA 2XPEA 3GMFA 1GLQA 1MTCA 3KXOA 4O7HA 2KP2A 4GSNA 2C3QA 1ERTA 5DAKA 2V6KA 4MF5A 4DEJA 4GSTA 2YP6A 3L78A 3GYKA 2EC4A 2D2ZA 3MWHA 2LS5A 4FYCA 2VIMA 4BPYA 2GTUA 2QGVA 4POBA 5D9VA 1S3AA 3HJMA 5DVBA 4Q5RA 1GLPA 1ABAA 2H30A 2B5EA 2NPBA 4LL4B 1GSDA 4ZBDA 4WXTA 2C0FA 1JZRA 1YDKA 2MMOA 1QUWA 2K8VA 2LUSA 2E2MA 3BCIA 1Z7PA 2VCXA 3U5RE 1U3AA 1JZDA 4O32A 2LKUA 1X0RA 4K1FA 3FRCA 4ZILA 4JE1A 1SD8A 1X5CA 3F6FA 4JEDA 5B7CA 1T4YA 4MABA 4L5LA 4N10A 4IW9A 1SK2A 2X8HA 3E9JB 3TB2A 2HZEA 2JADA 1XW6A 1ZGNA 2MBSA 1G6YA 3GIXA 5A4VA 3ISOA 3CTGA 2VL2C 5JCGA 1E6BA 2WJUA 2YPMA 2B7JA 1OVNA 3I43A 1GWCA 1YKCA 1BG5A 4RI7A 1R4WA 4FYBA 2DJKA 5CO3A 3GA4A 1F3BA 1FVKA 1XW9A 3ERFA 2GQLA 3QR6A 1TRWA 3GNJA 1QXHA 3RAZA 1H4OA 3WT2A 3WGDA 2VCQA 4OO4A 3GKXA 3N5OA 2IFQA 2YV7A 1HNCA 4EO3A 3D5JA 3IHQA 1VF2A 2H1BA 3NIVA 3KP8A 1F6MC 1FB6A 3Q74A 4NAXA 1EZKA 2IIYA 3IPZA 3O76A 2FNOA 1PN9A 2YZHA 2JSYA 2JZTA 3DYRA 2VL2A 3P2AA 3RDWA 5DQSA 2GLRA 4Q5NA 4IJIA 4JU5A 5HR3A 4EF0A 3G7IA 2C0EA 3IXRA 2H6YA 4KDYA 3GX0A 1C72A 2HRFA 3HD5A 5H5RA 3HY2A 3TKSC 2DJ0A 4RUVA 2ON5A 1LBKA 1GTUA 5JWRB 2CAQA 4TR3A 4O5RA 2O7KA 3F6DA 2LJRA 2RM6A 5A5KA 3TKPA 2IMDA 1OC3A 2OADA 3IAS2 3RPPA 5F8BA 3TKSE 2AAWA 5D93A 3ZREA 6GSYA 3MAKA 1EEJA 4POMA 5DALB 1SK1A 4MH3A 2C3TA 5B6MA 1FAAA 1SK0A 2B7KA 2GT5A 2I4AA 2BMXA 4ECJA 4JBBA 4E8HA 2FWGA 1EV4A 2NDOA 1GTBA 1F2EA 4HDEA 4ZB9A 5F06A 1VRSD 2C1YA 4GCIA 2L6CA 3QMXA 5G1KA 1GUMA 3O3TA 5ENUA 1DSBA 1V9WA 6GSVA 1XIYA 4GXZA 2CZ3A 2KHPA 4FYUA 1B4QA 1VF1A 3BOAA 2IL3A 2CVDA 2QKEA 1SJZA 5HR1A 4EE0A 4WBJA 2MYGA 2PUKC 1A24A 4K6XA 2ALBA 2L57A 4HOJA 4HJMA 2YV9A 2FY6A 1K3LA 1MDJA 3UVHA 4XS4B 4EVMA 1B9YC 1Q4JA 5J4UA 4H86A 3LXTA 2REMA 3VI7A 2PWJA 1S3DA 2LJKA 1E2YA 2YANA 3UAPA 2HRNA 4F9ZA 4XTSA 2RUFA 1PSQA 4YQVA 4LMWA 2GSSA 2HNLA 5J41A 1A8LA 3ZFBA 3JCML 2JSZA 12GSA 4YAVA 3P90A 1XPVA 2VOCA 3A3TA 3DKSA 2TRCP 2KP1A 1OKDA 2C0GA 5DDLA 2PU9C 3L4NA 1T4ZA 4HS1A 4XS1A 1XWBA 4AJ6A 3FZ5A 3V1WA 1R5AA 5F07A 1R26A 1XW5A 3ZZXA 2EIRA 2FHEA 4AJ7A 2X8CA 4DSSA 1A2MA 1BEDA 5AN1A 5DCHA 3HJOA 4PX1A 4NMUA 4BVXA 1AQXA 3Q18A 1O6JA 4OCEA 1T1VA 3QAVA 1B48A 4NHWA 3DD3A 1YF1A 2OE1A 1YEPA 2FCHA 5DQYA 2DLXA 4NV5A 3M8NA 1O81A 3KEBA 3FZ4A 1SKWB 4LL1B 2YWMA 3BCKA 4ZL9A 4JR6A 4WETA 1OKTA 3F4SA 1UN2A 3ME7A 2V6OA 5CRWA 2F9SA 1PX6A 5CNWA 2DIZA 4HU7A 3L9VA 4F2IA 2VLVA 2B6MA 1PRXA 5FHIA 5CRDA 2AB6A 3M9KA 3MDKA 1THOA 5D9WA 2GSRA 2X99A 3J7Yb 3UIWA 2MMNA 4MK3A 1XVQA 2DC5A 2AYTA 3HDCA 1AXDA 4Z7XA 2M80A 2EIQA 2AJQB 4KCEA 3F9UA 1SL1B 1ZCPA 3RHCA 2X64A 2WDUA 4AF2A 1PGTA 1PQNA 1WJKA 5IMCA 1FG4A 3GKNA 3UBKA 2V2GA 2OACA 1VF4A 4E8EA 1RQMA 1R5PA 4ML1A 3F4TA 3VLNA 7GSSA 4OD7A 4OFNA 3C8EA 1PKWA 3FY7A 2QC7A 3P8WA 4J56E 1A23A 3VWWA 4Q5FA 1GSSA 4HI7A 2K6VA 3MNGA 1OE8A 1U3IA 5CP1A 2WFCA 3I6AA 4MZBA 4TXOA 3GTUA 4YAPA 4KUNA 5CAXA 3IOSA 3ZITA 4IP1A 5CREA 3QPMA 4TVEA 1T7PB 1IYIA 1WMJA 2C0DA 3LSZA 1YF0A 2LTKA 3IR4A 6GSXA 2IMIA 2VCWA 4F0CA 4POLA 2G2QA 3VPTA 2L6DA 5E59A 1K0CA 4EL1A 2E2GA 3D22A 5IMFA 3HA9A 2HI7A 3Q6OA 2OBIA 2GZPA 2I9HA 2VCVA 2PMTA 2IMFA 2PERA 1I9DA 3LJRA 1TK5B 5IO2A 4DVCA 2VL9A 1TRUA 5IPHA 3J7Yk 5J5NA 4Q5QA 4TR1A 3L9UA 2YCDA 3LYPA 4QL9A 3GH6A 3GV1A 1U88A 3EE2A 3KP9A 5ECOB 3TRQA 1U6TA 2VUPA 5G5FA 3RBTA 2I3YA 5JWOB 4X1UA 3QFAC 4MDCA 3CSJA 1HQOA 1GNWA 2B1LA 5ID2A 4K0GA 1YJ6A 2R37A 3BBYA 2A2SA 1TOFA 4WF5A 4GF0A 1NHYA 1URMA 2CT6A 3DMLA 1WIKA 1OC8A 2LSTA 2MMAA 1SENA 1V58A 1GSEA 5EY6A 1YQ1A 1Z9HA 4OFTA 1LJRA 1ML6A 2L4QA 2N5AA 5IOXA 5HFKA 3US3A 1CQGA 2RM5A 1MD4A 5GAND 3U6VA 5ECLB 5GZZB 2NBSA 1WWJA 3UL3A 1MEKA 2XC2A 4L5OA 1J08A 2LNTA 1TJDA 5F0GA 4ACSA 5D8IA 1G0TA 2ZUPA 2FWFA 1V2AA 5HFGA 1FO5A 3ERGA 5GAPD 1B4PA 4HEA2 3ZIVA 1WOUA 1ZZYA 3LG6A 1K0OA 3TKQA 4NV2A 4V1Ag 2VM2A 5KN1A 4KDUA 4HZ2A 1AUCA 3ZLPA 4BWQA 4XS6A 1FW1A 3UMAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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