3RQTA

1.5 angstrom crystal structure of the complex of ligand binding component of abc-type import system from staphylococcus aureus with nickel and two histidines
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
465
structure length
465
Chain Sequence
GKDLNISLPLKTKSIAPYETDVPVKIGAAESLFKTNDQGKIEKALVKSYHQPNDTTLDIELKDNIKFQNGQKLTAEKVKSSLENSMKKSDLVKYSLPISSITAKGQKLTIKTNSAYPELVSELANPFMAIYDTDAKSDVNQTPVGTGPYQIKDYKQSRKISLSNFKDYWQGKPKLDHITVTYQEDGNNRVRNLESQKDDLITDVPVNKVQDIENNQNLKVSKESGFRTSLLMYNHTNKKMTKSVREALDHIIDRQGIADHIYQGYAKPATSPFNDKIPYIKEPKLTKQNIEQAKMLLAKDGYTKEHPLKIKLITYDGRPELSKIAQVLQSDAKKANIEIDIKSVDDIEGYLKDRSAWDATMYSFGTIPRGDTGYFFNQAYKKDGAINKGDYNNSNVDDLINQLNHTVDVKERHNISNDIIKLSSRDVPNSYIAYNDQIVAANSKVKNYKVTPEGIYLIDYRTTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title 1.5 Angstrom Crystal Structure of the Complex of Ligand Binding Component of ABC-type Import System from Staphylococcus aureus with Nickel and two Histidines.
rcsb
molecule keywords Putative uncharacterized protein
molecule tags Unknown function
source organism Staphylococcus aureus
total genus 166
structure length 465
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00496 SBP_bac_5 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 3rqtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rqtA01
3K4UA 1ZBMA 1MRPA 4ELOA 3T9VA 2D5WA 3CR9A 4BDQA 3LSLA 3B6QA 4L17A 1A8EA 3DRGA 3ZS6A 1TFAA 2FNCA 4PE5B 5TPAB 4POWA 1P99A 4MLVA 3PU5A 5DVJA 4GQOA 5CMMA 1R9LA 1MY0A 3FVKA 4U2RA 1PB7A 4ZEIA 1B7ZA 2DWAA 3C9HA 1IUDA 4I9DA 3FJGA 2PT1A 2H4IA 1FCKA 3H3GA 5L8DA 3KZGA 5I59A 3C34A 2I0CA 1XC1A 4OEUA 3IOTA 4IO4A 3TEPA 1XVXA 1A7LA 4X9TA 3IOWA 3WAFA 1B40A 4NF6B 3I3VA 2PX1A 4R2BA 1ATGA 4R6YA 2PT2A 3N5LA 3HCQA 3OELA 1XS5A 5F7VA 4AB5A 4F31B 1B58A 2DSFA 3K6XA 3Q29A 4ELPA 4H1XA 4LP2B 5CBSA 4PFTA 2YLNA 1B0LA 1LFGA 3PPNA 1M5DA 1FTLA 5H8FA 1QUKA 2B3FA 1IXIA 4X1DA 2HXWA 3U72A 1URDA 1POY1 1O64A 4OFLA 4OZ9A 4QRZA 2V84A 2V3QA 1ZLQA 4OTEA 4C1TA 1NMUA 3H4ZA 3UA8A 5KDTB 4NEDA 5FTIA 2VD2A 1IXHA 2ZYNA 2ANJA 4NF5A 3RQTA 1M5FA 3EN3A 2RINA 2GFEA 2XXWA 4XKPA 4KHZE 2OWTA 1R6ZA 1RYOA 3FD3A 2Q89A 1MXYA 3ECRA 3O29A 3JZJA 2OJTA 4OYVA 4F1VA 3KEIA 1DTGA 3H06B 3ONMA 3ZSFA 5IKBA 1NNPA 2G29A 1SYIA 4R9GA 5TP9B 4YZZA 1MXWA 4IGTA 2R71A 4U21A 4Q8RA 2GHAA 1LFIA 4G68C 4P0GA 3K6WA 3IO4A 1FQDA 3V8XB 1CB6A 2P0SA 4QSEA 3LSWA 1PEBA 2HFBA 4TQUQ 5LOMA 4TLMB 3RTWB 1EU8A 3TDJA 3FVGA 2XXVA 2HZKA 3C32A 4PP0A 2O84X 3KOTA 3V89B 3OO9A 2ZNTA 3BFUA 4RK9A 3RPWA 4F1UA 1LGBC 3PD8A 3RLFE 3TQWA 3W9VA 1JETA 1HSEA 4ELQA 2VGQA 4FECA 2QMWA 2AL4A 4F3GA 1GGGA 4OWDA 4R73A 1ELJA 4JBZA 5EHSA 3RT6B 1OQHA 3VXBA 1MQHA 2V93A 1O7TA 4GXAA 4GL8A 5TU0A 1UIVA 1I6BA 3LVUA 1LB8A 3OEMA 3K01A 3S9LC 2B65A 4KYDA 2ABHA 3N6UA 1NNKA 2XXUA 3K02A 5H8NB 5DEXA 3DRJA 4RA1A 1MY4A 3FXQA 2H5YA 3SEUA 5I2KA 5L9SA 2F8DA 2F5XA 1DPEA 5ITOA 3OSQA 4AQ4A 1B7UA 4ZECA 1MXZA 1Y4CA 3O2AA 3BKIB 5CMCA 1MY2A 1P1OA 3PUYE 1IEJA 3KN8A 4IO5A 3MP1A 3K6UA 3TPAA 1QUIA 3T66A 3IOUA 2O51A 1MDP1 3TQLA 4OFJA 4LONB 3TMGA 3EHUA 4KI0E 3T96B 1Y3NA 3GZGA 1FTOA 2E0SA 2FYIA 1M5CA 4EUOA 3SEWA 3PUWE 3CFXA 3PPQA 2Z8FA 3RGYA 3PUVE 2Y7PA 4GRKA 1MY3A 1EZOA 5I58B 1I6QA 2DWIA 3HHGA 1LAHE 2REGA 5FHMA 3C35A 5BWJA 2DYXA 3PPPA 4GL0A 3GXAA 1NNTA 5EHMA 3FIRA 4QFKA 4DE8A 1SDXA 4OFOA 4EDPA 3O6GA 4C0RA 2RCBA 3G3KA 5FHNA 2HCAA 4F22A 1GV8A 4BDRA 4ESWA 1A54A 4RPOA 1S9TA 1MQJA 4QFLA 2O68A 4FEDA 2CZLA 3THIA 1H44A 4ONYA 5I56A 1UIUA 3MZBA 3R7XA 5JEIA 2XD2A 3MVYA 2XXHA 1LFHA 4F3PA 2F6PA 3W15C 3PV0E 2QS1A 3MZ1A 1P1UA 3G7WA 1ZTYA 3KN3A 2UVHA 3O97A 3TTRA 3SETA 1NH8A 1DOTA 1BP5A 4DCXA 5HPQA 4ISUA 1B32A 1OQGA 3K00A 4IO7A 3RTFB 4LZ5A 4THIA 3BBRA 3K6VA 4ZDMA 5KZTA 5I57B 3DELB 2A5TB 1FTJA 5EYFA 1JVXA 2QMXA 4R72A 2ZMBA 4KR5A 1UTBB 1MQDA 4MH5A 4JSOA 2DS9A 3SESA 4QSCA 3VV5A 3IB0A 3VE1B 3MZ9A 4PFYA 1POTA 1LLSA 2GH9A 1PBPA 5DT6A 1UTHA 4HS7A 3RT8A 4JWOA 1Y20A 3U94A 4ND9A 2Z22A 3IX1A 1Q35A 3TTNA 1USYH 1HSLA 2YJPA 1Y3PA 4XIGQ 4EQBA 2Q2CA 2UVGA 3B6TA 2THIA 1WDNA 3FVOA 1YCJA 4M1VA 3ILUB 3FZVA 3MUQA 4ZEFA 1MPDA 3TCFA 1LSTA 4P0IA 4RY1A 5KCJB 1N7XA 2OLBA 1MPCA 5I2NB 2DP8A 4WEDA 4QF9A 3QUJA 3PUXE 3PPOA 1S50A 4YMBA 4DXBA 1BTJA 4E0WA 1FQAA 1NFTA 3FXRA 3UK4A 4GF8A 2VP1A 4U4XA 3A3CA 2QS4A 3DRHA 4NF8B 4EXKA 1EZ9A 4FEBA 4ZEDA 3CI8A 5AA4A 2ZNUA 4R74A 3CHGA 3Q28A 4KFQA 4I1DA 3G3IA 2LAOA 2Z23A 2IA4A 1XT8A 5HBCA 5H8QA 1NH7A 4NF4A 1MY1A 1P1WA 2RKMA 1II5A 4F1YA 2QJEA 3G3HA 3RYBA 3KSJA 4OENA 1AH5A 2NVUB 4PETA 1RKMA 3FTOA 1JEUA 5AA2B 1H3DA 1MG1A 2UVIA 1DMBA 4FE8A 3S4UA 3KG2A 4DIGA 4JDFA 2B4MA 1RYXA 1VR5A 4NMYA 2Q2AA 3C4MA 2RC9A 3F11A 2O7IA 4XKNA 4GIZA 3TELA 4U1ZA 3P7IA 3QIMA 5CMKA 5ISUA 2V3TA 4H8JA 2KLFA 4G68A 1SW2A 1LAFE 4YKPA 1JEVA 1PBQA 4K3FA 3IAZA 3PD9A 2E1SA 1SI0A 1B5IA 1FW0A 2H9BA 2HAVA 1N84A 2X7QA 3D4CA 4OVJA 2XXTA 1ZU0A 2RC7A 3OO8A 1NNFA 2O7UA 4R2FA 2DE3A 1D3KA 3VVFA 4DXUA 1SYHA 3IB1A 4QSDA 5AE4A 1S7YA 4MLQA 3DRKA 1H43A 3GBBA 4G8HA 2F35A 2ZNSA 1SQYA 1B9JA 4OERA 4RXLA 3E13X 4RYAA 5JTYB 2X7PA 4KPTA 2WOKA 3K1NA 1O63A 3TTKA 3E3KA 2IEEA 1URSA 4BDMA 1OLCA 3UIFA 5TPAA 2O69A 4IGRA 4POXA 1USYE 3OEKA 1MS7A 3T22A 2DE2A 2D21A 5L9MA 3VDFA 3U1OA 4YMAA 3QUFA 4X48A 1MQGA 3TCHA 4M4GA 4F19A 1US4A 2F97A 1SVXB 3IB2A 4ZS9A 4WEPA 1IITA 3VLUA 3UP9A 3ZKKA 4Q0CA 3M3KA 3MPKA 3PGFA 3OENA 3OOAA 1BIYA 1JW4A 4FATA 4MF3A 3IOVA 1FQCA 2Y7IA 1IQ7A 5H8HB 4NF6A 2DXYA 5B70A 3A09A 4HCYA 2NOOA 3S9EA 2DXRA 3PAMA 3V5AA 4GWOA 1FTKA 4N07A 2M8CA 4GOTA 3HN0A 3ILTB 1A40A 1A99A 3OD7A 5CMBA 3T9UA 3HPIA 4LZ8A 3QXMA 4JWYA 4ZZEA 5DTBA 3JV9A 1N3XA 2REJA 1SW5A 3VXCA 1MM7A 2Q9TA 3HHFA 1ZMGA 2WKYA 5AA3A 3MVZA 2ZYKA 2QS3A 3SERA 3T93B 1T0KA 2F34A 2F78A 2XXQA 3HV1A 5KDTA 2H25A 1AL3A 5CI5A 5HM4B 1QULA 3KJ7A 5ELVA 3DRFA 2D3IA 4N13A 3KGCA 3U93A 1EH3A 3IR1A 2OBGA 4H6DA 4DDDA 1R9QA 4H8IA 1UQWA 4F3BA 1MPBA 3RYAA 1B51A 2OZZA 3BFTA 1JVYA 1MH3A 1AIVA 2HAUA 3FXUA 2CMOA 5TP9A 4YICA 1N76A 3O66A 4OEVA 4PQJA 4MBPA 2O1LA 2H98A 1AOVA 2RCAA 1OVTA 4YB6A 3G3GA 1B4HA 1A55A 2PBWA 3GBAA 4IO6A 4NTLA 3TFLA 4F2OA 1YTVA 2XX9A 4ESXA 2WOLA 4BDLA 2XHDA 1PDAA 1B3HA 3GLBA 3CVGA 3DP6A 3KJTA 1D9YA 1FQBA 3O28A 1IIWA 4OQOA 5H8SA 2AL5A 1DPPA 3M3FA 4XXUA 3MAMA 1N0TA 1PB8A 1FQEA 2XX8A 5FTHA 4IY6A 3QSLA 3MWBA 2OK2A 2HQ0A 1D9VA 4BDNA 4DLDA 3UGWA 3R26A 1B0HA 4ZZAA 3MP8A 4KCCA 1OMPA 1FTMA 3A3UA 3LR1A 4Q30B 3IL1B 3QAXA 3Q27A 1VFDA 1B46A 1Q1KA 3H6TA 4BLAA 3SEYA 2A5SA 3N26A 3IO6A 5H8NA 2V25A 1B4ZA 4IB2A 2HZLA 1P1NA 3Q25A 3R6UA 2Y7WA 2HEUA 3FVNA 2RF1A 3CSBA 1J1NA 2DE4A 2QRYA 1KWHA 3QYTA 3EHSA 4UACA 5ICQA 2OWSA 3OMBA 4F29A 2I0BA 3CFLA 4KCDA 1JNFA 1JW1A 3DM0A 5B7DA 2YPNA 4YB7A 2I3WA 4F39A 4ZE8A 4OXVA 3QK6A 3VLVA 3G3FA 1OVBA 2NWJA 1HSJA 5I59B 4RK2A 1JW5A 4G77A 3TKDA 3OSRA 3FJ7A 3MP6A 3FGSA 4U22A 1B7HA 3C33A 4XTCQ 4GXSB 4Q5TA 2ALUA 3OO7A 1LBCA 1B5JA 4RJZA 1AMFA 4GFRA 5I58A 5FHOA 1Y4TA 2QS2A 1D4NA 4GLIA 1VE4A 4QFOA 4H5GA 2DWJA 5H8FB 3ODBA 5IAIA 3C31A 2P2AA 3MBPA 1LCFA 2F7AA 3PMWA 4FAJA 1SD3A 3EPEA 5J1DA 2AYSA 3IORA 3V83A 2I6EA 1FQFA 2XXPA 3USDA 1XVYA 1TFDA 3N6TA 4YKJA 4NF5B 4U4SA 3MVWA 1WVJA 2NUVA 4F18A 5DVFA 2F6GA 4LQ2A 2DVCA 3L6HA 1JQFA 1Z7NE 1B3GA 2A5TA 5I57A 5AA2D 4H0WA 1IZ1A 4JSDA 1QKAA 4G2ZA 3H7MA 3CSGA 4LUBA 2Z8DA 2UYEA 1MH4A 1UTBA 4F2QA 1PC3A 3T9XB 1B3FA 1SW1A 1LAXA 5A5XB 3W9WA 1VFEA 1LBBA 3FATA 2H99A 2I58A 3IJOB 1QKBA 3TUSA 5JK4A 1L5TA 3H6UA 1Y3QA 3FJMA 5F1QA 4I62A 5ICTA 2GHBA 4EXLA 2F36A 4AB6A 2XXRA 4TLLB 3DRIA 4Z0IA 5KCJA 1CE2A 5I2NA 1TXFA 3RUMA 5CC2A 3H6WA 3O6HA 4G8NA 3VLWA 4QFNA 3U8QA 1P1QA 4BDOA 1TWYA 2VOZA 3VVEA 4NF8A 3FV2A 3CG3A 1Y1ZA 2DOJA 1MDQA 1ZIUA 3LSXA 3JYRA 3FUZA 1GVCA 1US5A 2B4LA 1LCTA 3UORA 4H65A 3HO7A 3Q26A 4PFWA 1IXCA 4LZ7A 4WKMA 3LBSA 4KYSA 3KN7A 4EQ9A 3SEVA 5DEXB 1ZKBA 1IXGA 1DTZA 1B6HA 4TOZA 2DWHA 3N94A 2I4BA 1SBPA 5CRYA 2I3VA 5I2KB 1B1HA 4YB5A 3OXNA 3TODA 5AA2A 2NXOA 1QW0A 2G93A 4GD5A 3SDFA 4EF2A 3I6VA 1N7WA 2PMSA 3SEXA 5DVIA 1QVSA 2OCUA 3DLNA 3I5OA 1SW4A 1OLAA 3PMVA 5A5XA 3CRBA 3MVXA 4ECFA 2Y7RA 4JWXA 4FORA 3UN6A 4R6KA 2AIXA 5K2YA 4IY5A 2ONSA 4JB7A 3MQ9A 4R75A 4QFPA 2XX7A 1B5HA 4F3SA 3OO6A 4NE4A 3TYHA 4ZE9A 1BKAA 2F7CA 4O3AA 2V3UA 2Z8EA 3VFJA 4U23A 1I69A 3S9MC 3D4GA 2DVZA 2BJJX 3EF7A 3E9XA 4C1UA 5BUUA 3KFMA 2Y7KA 3VVDA 3M3LA 1XOCA 4LQ5A 4NWCA 4X1BA 4R6HA 3RY3A 4PFUA 5I84A 4JXIA 1I6AA 3DP8A 3S2VA 2Q88A 2VD3A 1NKXA 5ITPA 5JTYA 4YU0A 1Y9UA 2Q8JA 4U1OA 4I8CA 5CM6A 5I56B 1VSOA 1OIBA 2GRVA 1DSNA 3H6VA 3E4RA 2XXIA 4OESA 3LSFB 1H45A 2FA7A 3B7DA 4QHQA 3MC2A 3O6PA 5CBRA 3TZAA 1ZJLA 3U92A 2QPQA 3RN8A 3L6GA 1N04A 2ZXTA 4P11A 3IJXB 2WOPA 4O3BA 3EQ1A 3HSTA 1LAGE 1Y1MA 4YKIA 2XD3A 1N3WA 3FV1A 4XKRA 3DP4A 2O1MA 1NL5A 4RNSA 2X26A 1MQIA 2ZYMA 1UTHB 2QL3A 2P1SA 3SKPA 1MXXA 2PVUA 4IO3A 3ZKLA 1URGA 4UA8A 4OETA 4NWDA 1M5BA 1YPNA 5H8HA 2ESNA 1B1XA 4E0XA 1H76A 4MFIA 4KD5A 4FJPA 1GR2A 4KYEA 3K1PA 1MXUA 3AXFA 4Z7EA 1GTKA 4OHNA 2ONKE 4HW8A 4YKKA 4G4PA 1QUJA 3EHTA 4H67A 4HTGA 4LA9A 2O6AA 3H03A 4ZEKA 3K0VA 3K2DA 3O9PA 1BLFA 2F7BA 4DCYA 2ZYOA 2UVJA 4HCWA 2UXAA 1B52A 1B3EA 4G8MA 5AA4B 3KOSA 1F9BA 3O6IA 2XXXA 1MM6A 3CG1A 5L9OA 1B05A 5DYHA 1QJMA 5H8QB 1B2HA 4NF4B 2B3BA 3CIJA 1MXVA 2R9JA 3RNNA 3KBRA 1R1NA 4LATA 4KQPA 4IO2A 2I49A 1TT1A 4GVOA 3MJNA 3TAJA 4DZ1A 3M8UA 3PPRA 3PUZE 3FASA 1PB9A 1XHYA 1EZPA 2W7YA 4OMBA 3PMXA 5M2VA 4O3CA 4FIMA 4N6PA 1LB9A 4H5FA 2I48A 3MW0A 4LVQA 4R9FA 3KSXA 4EF1A 3TTLA 3MPLA 2DQVA 4RPNA 1SI1A 4ZEBA 3T9HB 2RC8A 3K1MA 3IK6B 2R6GE 2PYYA 3LC8A 4G68B 3C36A 1B3LA 4ELRA 1ANFA 3CFZA 3TCGA 2ONRA 3WAEA 3B6WA 4DXCA 4WXJA 2XXYA 2QSXA 4YAHX 1Z7ME 2I4CA 2VHAA 1A8FA 5K2XA 4XKQA 1WODA 2UYFA 3S9NC 2Y84A 3TTMA 1M5EA 1YAEA 4EQ7A 3LUYA 3G3JA 5AA1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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