3RQTA

1.5 angstrom crystal structure of the complex of ligand binding component of abc-type import system from staphylococcus aureus with nickel and two histidines
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
465
structure length
465
Chain Sequence
GKDLNISLPLKTKSIAPYETDVPVKIGAAESLFKTNDQGKIEKALVKSYHQPNDTTLDIELKDNIKFQNGQKLTAEKVKSSLENSMKKSDLVKYSLPISSITAKGQKLTIKTNSAYPELVSELANPFMAIYDTDAKSDVNQTPVGTGPYQIKDYKQSRKISLSNFKDYWQGKPKLDHITVTYQEDGNNRVRNLESQKDDLITDVPVNKVQDIENNQNLKVSKESGFRTSLLMYNHTNKKMTKSVREALDHIIDRQGIADHIYQGYAKPATSPFNDKIPYIKEPKLTKQNIEQAKMLLAKDGYTKEHPLKIKLITYDGRPELSKIAQVLQSDAKKANIEIDIKSVDDIEGYLKDRSAWDATMYSFGTIPRGDTGYFFNQAYKKDGAINKGDYNNSNVDDLINQLNHTVDVKERHNISNDIIKLSSRDVPNSYIAYNDQIVAANSKVKNYKVTPEGIYLIDYRTTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Unknown function
molecule keywords Putative uncharacterized protein
publication title 1.5 Angstrom Crystal Structure of the Complex of Ligand Binding Component of ABC-type Import System from Staphylococcus aureus with Nickel and two Histidines.
rcsb
source organism Staphylococcus aureus
total genus 166
structure length 465
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00496 SBP_bac_5 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 3rqtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rqtA01
1TXFA 3E3KA 5H8FA 1FTOA 2I0CA 3IJXB 4MLQA 4EF1A 3S9NC 2REGA 4C1UA 2DWAA 3O2AA 4LZ7A 1JNFA 4GL8A 1N84A 1R1NA 2UYEA 3TYHA 1MH4A 2ONKE 2Z8DA 4YMBA 1ZKBA 2O51A 1XC1A 2ZNSA 3IB0A 1B3EA 3ECRA 1MDP1 1JW1A 2XXPA 3ODBA 4XXUA 1Y4TA 1FQBA 2V84A 2QRYA 2UVHA 3H03A 4PE5B 3W9VA 5L9SA 2Y7WA 3C34A 3H6TA 4YKJA 1WVJA 3UORA 2ONRA 4KYEA 3IB1A 3DRIA 3IOTA 2ABHA 4JSDA 2NXOA 4G68C 3DP6A 4O3CA 5I2NB 3LR1A 3B7DA 3D4GA 3UA8A 1LBCA 1QKBA 4XTCQ 2DWHA 2QL3A 1B05A 3LC8A 4G8MA 5CBRA 3C9HA 3SETA 4UACA 4X9TA 4ZEFA 3VDFA 3OD7A 3VVFA 3S9LC 2YJPA 1A54A 1IITA 1TFDA 4MLVA 3E4RA 4GFRA 2H4IA 2XXHA 2DE4A 1B1XA 3GXAA 1VR5A 4FEBA 3DP4A 4I8CA 3S4UA 3FASA 4RPNA 3TELA 2CZLA 1NL5A 1AOVA 2ANJA 3PMVA 4R9GA 4XIGQ 2VHAA 4PFUA 3UK4A 1FQDA 2PX1A 4ZE8A 2AIXA 4R73A 3A09A 2E1SA 2XXIA 3UGWA 3USDA 4U4SA 4EQBA 3ZSFA 5H8NA 4FJPA 4RA1A 5LOMA 2YLNA 2HAUA 3FVGA 1B7ZA 1B46A 3MP6A 3TTMA 5J1DA 4FIMA 4C0RA 3O6HA 4F1YA 3C32A 3T9XB 1VFDA 1KWHA 3VVEA 3JV9A 2ZNUA 4X48A 3IJOB 4R72A 3TPAA 2HZKA 5FHNA 2QS1A 4HTGA 1P1WA 1NMUA 4Q30B 3FV1A 5I59A 1QUKA 2G29A 1US4A 2R6GE 3HV1A 3M3KA 4IO3A 2H9BA 2R9JA 3IO6A 3KJ7A 5TU0A 5AE4A 5I56B 3MC2A 2HXWA 4RK2A 5DVIA 1Y20A 3CFXA 5DVJA 4IO2A 1XVXA 3MBPA 1I6QA 3KFMA 5I2KB 4GF8A 2V3TA 3QYTA 3SEVA 3L6GA 2Q2AA 3TTRA 4YICA 4IB2A 3RLFE 3PMXA 4R2FA 1UTHB 3BFTA 4NF6A 4IO4A 3L6HA 4MH5A 3OELA 3GZGA 1UTBA 3TTNA 2WKYA 1Q1KA 4F2OA 3DELB 3FXQA 2O6AA 2THIA 2ZNTA 3OENA 1SW4A 1Z7ME 1D3KA 1ZLQA 4IY6A 3R26A 3KN7A 2AL4A 2F7AA 5KCJA 2QS4A 2M8CA 1OQGA 4QRZA 3K1NA 2R71A 4ZEKA 5IKBA 2OJTA 5L9OA 1B0LA 2B4LA 1PEBA 1B4HA 1MQIA 2Y7IA 3ZKLA 3IR1A 2AYSA 3U1OA 3QIMA 3E9XA 1MXZA 1FCKA 1SI0A 2O1LA 4QSCA 1OLAA 3PMWA 3R7XA 1XVYA 2DWIA 1ZTYA 3EHSA 4KHZE 4KD5A 1MM6A 1QW0A 1XS5A 3OSQA 1ANFA 5AA2A 1DPEA 4QFPA 1P99A 4LQ5A 1QVSA 2DWJA 2UVJA 3N5LA 3ILTB 1CE2A 3FTOA 1IXCA 1P1QA 5ITPA 4F31B 4F1VA 3CG1A 4NWDA 1EZOA 4LATA 1IXHA 3IB2A 1MXWA 1LCTA 4IGTA 4EF2A 2H5YA 3TQLA 5DT6A 4Z7EA 5AA4B 4IY5A 4GL0A 2P0SA 2F6PA 3G3HA 3O9PA 1FTKA 4JWXA 4NF4B 5H8HB 1JVXA 2ZYKA 4ZEIA 3RQTA 4LP2B 3T9UA 4EQ7A 1NNTA 5CRYA 1FQFA 2VGQA 2ZXTA 1B58A 5H8SA 1IXGA 4YB5A 1IUDA 1EZ9A 2RCAA 3MVWA 1AL3A 2D5WA 4QFKA 3MVXA 5I58B 4F18A 5I2NA 2B4MA 2F36A 4M4GA 2VD2A 1A55A 1GV8A 1H3DA 1JW4A 2I48A 3RPWA 4N13A 1MXVA 3GLBA 3HHFA 3SDFA 2DYXA 2O1MA 2DSFA 1RYXA 3KG2A 2GHAA 5FHOA 1P1OA 3PU5A 3BBRA 2XX8A 2X7PA 4HCYA 2WOLA 2V3QA 1II5A 2DS9A 4I1DA 4I9DA 1N76A 2ALUA 1MQDA 3RYAA 1XT8A 3OEKA 1MY2A 1NH8A 3Q29A 2F8DA 2F97A 4R6KA 3RNNA 1Y1ZA 4POWA 4BLAA 3K1MA 4U1OA 1ZU0A 3TCHA 3SEWA 4ZEBA 4ZS9A 2A5TA 4R2BA 3T9VA 4BDOA 1SQYA 4BDQA 1LSTA 1L5TA 1TT1A 1Y3NA 3C35A 2RC8A 4RJZA 5DVFA 3SEXA 3MP1A 1WODA 1R9LA 1OLCA 1RKMA 4H67A 1B40A 3M8UA 4H5GA 3QAXA 4DE8A 1LCFA 3UP9A 3FIRA 1JEVA 3MWBA 3K6WA 3IOVA 4G8HA 1FW0A 3FD3A 1XOCA 4E0XA 3PPQA 1OMPA 3K2DA 2XXYA 3S9EA 1ELJA 1EZPA 3PAMA 4KCCA 5HBCA 4R9FA 4GLIA 1QUIA 4JBZA 4NTLA 2H25A 4R6YA 3K0VA 3VLWA 2O84X 3GBBA 3VVDA 4TQUQ 1URSA 2RF1A 2H99A 1YTVA 4GQOA 3DM0A 3FATA 4Q5TA 3ILUB 3VFJA 2UYFA 1FQAA 5I2KA 2QSXA 3LSXA 4NE4A 3G3KA 1Y3PA 2O7UA 2PVUA 1SW2A 3VLUA 3PD9A 1UIUA 4KYDA 4F3GA 1A40A 1UTHA 1P1UA 4OWDA 4ELRA 3E13X 4FECA 1Y4CA 3OEMA 5B70A 4LZ5A 1NNPA 4E0WA 4IO6A 2IA4A 1AH5A 1FTLA 1MS7A 3MP8A 4LUBA 1LAHE 3QUFA 4K3FA 1M5EA 1M5FA 5A5XB 4PP0A 1URDA 2HFBA 4OXVA 4ONYA 1PBPA 4G68A 5EHSA 4FAJA 1QJMA 3K1PA 4NMYA 3HN0A 4GOTA 1B5IA 1SW5A 4QFOA 3TODA 3T93B 1SI1A 4LZ8A 4N07A 2I3WA 2QJEA 2NVUB 3S2VA 1EU8A 3R6UA 1H76A 4IO5A 1VSOA 3H06B 1SYHA 3T66A 3UN6A 4ZECA 1GR2A 2OCUA 3PPNA 1BIYA 4JB7A 1MDQA 4ND9A 1MM7A 4P11A 1B5HA 2NUVA 4EQ9A 1O64A 3DP8A 1DSNA 3FVKA 3MPKA 4THIA 2W7YA 3FXRA 2V3UA 4WXJA 3KOSA 4U2RA 3MAMA 1SBPA 2RINA 3LVUA 2HEUA 1N7XA 3MQ9A 3S9MC 4DIGA 4YAHX 2HZLA 2V93A 2Q9TA 4H5FA 1D9YA 5AA4A 1B3GA 3TDJA 1JETA 3KJTA 4JWOA 3RT8A 4DXBA 2Y7PA 3SEYA 3PPOA 5H8FB 4DDDA 1NH7A 5H8HA 4ISUA 3EHUA 2DVZA 4GIZA 4NF5B 1MPBA 3MW0A 4DLDA 3DRFA 3SKPA 1MY0A 1SDXA 2I58A 4HW8A 2O69A 5FTHA 4QHQA 4NEDA 2REJA 4U4XA 3PPPA 2QS3A 1XHYA 3W9WA 1FQCA 5K2XA 5I58A 3O6IA 2HCAA 3G3FA 4C1TA 3JYRA 2PT2A 3G3IA 5CI5A 3VLVA 3FZVA 1PB8A 3TTLA 2OBGA 4F22A 1HSJA 2XXUA 5CMCA 3CIJA 4U23A 3C36A 3SEUA 1JW5A 3FV2A 5ITOA 3KBRA 3TCGA 4KPTA 4ZZEA 3RGYA 1I6BA 1GGGA 2ZYNA 3HSTA 4G77A 1M5BA 5F1QA 1DMBA 4YB6A 2D3IA 4LQ2A 1S9TA 1MXXA 3TKDA 1J1NA 4OVJA 3O6PA 3T96B 3QXMA 4O3BA 2ONSA 5JTYB 2E0SA 1JEUA 1MY1A 3VXCA 4BDMA 1PDAA 3Q25A 3I6VA 1BKAA 2XXWA 5F7VA 3IX1A 2AL5A 1JVYA 2VD3A 4O3AA 5KZTA 1HSEA 3Q28A 3CFLA 3K6XA 3K01A 3OO9A 4OTEA 2DE3A 1MQGA 4IGRA 1R6ZA 4KQPA 3C33A 2D21A 1LB9A 3SERA 4MF3A 1BP5A 3TQWA 3KZGA 1MY3A 3PPRA 1USYH 2UVGA 1B6HA 2X26A 1N0TA 3RTFB 5ELVA 3V89B 4IO7A 1S7YA 1B32A 1LGBC 1OVTA 3FJ7A 4YB7A 1VE4A 1B9JA 3KSXA 4QSEA 1GVCA 5KDTB 2Y7KA 3MZ9A 5CMMA 3V83A 4F1UA 4U22A 3CI8A 4H0WA 5BUUA 4H6DA 4YKKA 4RK9A 4XKPA 3D4CA 3N6UA 2F7BA 1YCJA 1N04A 1B5JA 1LAGE 4GWOA 2GRVA 1A8EA 1JQFA 5CBSA 3V5AA 3CR9A 1NNKA 1DOTA 4YKIA 1H43A 3LSLA 5CMBA 1O63A 3G7WA 5H8QB 4LONB 2Z23A 2DXYA 3U8QA 2DOJA 1SD3A 1US5A 1CB6A 3DLNA 1IXIA 3RN8A 5A5XA 2CMOA 2XHDA 2B65A 1B52A 1PBQA 5BWJA 4JSOA 3IL1B 3CFZA 2XD3A 2KLFA 1LB8A 1FQEA 2HAVA 5JEIA 3KGCA 1IZ1A 4H65A 4ESXA 4HCWA 1F9BA 2XX7A 3K6UA 1ZMGA 3U93A 3C4MA 3KN3A 2DQVA 3OOAA 1MPCA 3LBSA 2B3FA 5CC2A 3OO7A 1FTMA 4DXUA 5KCJB 1B4ZA 2RKMA 4QF9A 2Q8JA 4F2QA 4ELOA 1B7HA 4DXCA 3CG3A 4EXLA 4OEUA 3EQ1A 4ZE9A 5DEXB 4GD5A 2B3BA 1QUJA 1H44A 4OEVA 1A99A 2Y84A 4YZZA 2P2AA 4PFTA 3FGSA 2GH9A 1I6AA 4UA8A 4N6PA 3HCQA 2Z22A 4MBPA 1MPDA 1EH3A 3O28A 4JXIA 1Y1MA 5AA2B 3PV0E 5FHMA 5TP9B 2XXQA 3HHGA 3SESA 1YPNA 4OENA 2Q89A 3MUQA 2PT1A 2NWJA 3P7IA 1O7TA 3MZBA 4YU0A 3H3GA 1DTGA 5I57B 4R6HA 4NF5A 1NKXA 1SYIA 1NFTA 3VV5A 5I56A 1LFIA 4X1BA 4FE8A 4QFLA 1HSLA 4OHNA 2BJJX 4H1XA 3HPIA 3FJGA 4KFQA 2PBWA 4WEPA 4XKNA 2LAOA 2VOZA 4X1DA 1N3XA 2QS2A 4F29A 2O68A 3GBAA 1B3LA 5DTBA 3KOTA 1M5CA 3U72A 3FXUA 5IAIA 3OO8A 3DRHA 2XD2A 2FYIA 4OFOA 3H6VA 1RYOA 4G2ZA 5ISUA 3EN3A 3IOUA 4EUOA 4NF8B 3HO7A 3QUJA 2YPNA 2ZYMA 2F78A 3O97A 1I69A 4H8JA 1MQHA 4RY1A 2OWTA 4YMAA 4OESA 3KEIA 3MPLA 3QK6A 1NNFA 4Q0CA 5JTYA 3B6WA 1LAFE 3U94A 2QPQA 1ZJLA 3C31A 1POTA 1D9VA 3U92A 1PB7A 3K4UA 5HM4B 3Q27A 1OVBA 4FATA 4XKQA 2OWSA 2I3VA 4P0IA 4DCXA 3TEPA 2Q88A 1B0HA 4OMBA 1N3WA 3OO6A 5TPAB 1QKAA 2A5TB 2UXAA 2O7IA 3PUYE 4GXSB 4F39A 3THIA 1H45A 1LLSA 3AXFA 4KI0E 4WKMA 4QSDA 2DVCA 4GRKA 5JK4A 4G4PA 4OFJA 3MZ1A 4DCYA 4P0GA 4OERA 1N7WA 3MJNA 4QFNA 3K00A 1MRPA 2Y7RA 3IK6B 4AB6A 2FNCA 4AQ4A 3OXNA 4FEDA 1IEJA 5L8DA 4F19A 4PQJA 5EHMA 4NF4A 5DYHA 4RXLA 1YAEA 4DZ1A 3OMBA 5KDTA 5CM6A 4BDNA 2I4CA 1MH3A 1UQWA 3TAJA 2DP8A 3A3CA 3RYBA 2I4BA 3H6UA 3KN8A 4MFIA 2DE2A 2QMXA 1TWYA 5M2VA 2NOOA 4GVOA 2F35A 5B7DA 1B51A 1Q35A 3IORA 1GTKA 3LUYA 2RC9A 2XXTA 3O29A 5FTIA 1M5DA 4POXA 1D4NA 5HPQA 2OZZA 2HQ0A 1POY1 1LFGA 4ELQA 4EXKA 2WOPA 3I5OA 4TLMB 1A8FA 5I84A 3TFLA 5H8QA 5K2YA 1MQJA 3FJMA 1LFHA 3TTKA 4Z0IA 2RC7A 2V25A 2DXRA 4L17A 4FORA 1MXUA 3CSBA 3MVYA 2F6GA 1QULA 5AA1A 1AIVA 2ZYOA 3TMGA 4GXAA 2PYYA 4XKRA 2Z8EA 4OZ9A 4ELPA 1MG1A 3LSFB 4OYVA 4G68B 1AMFA 3CSGA 3PUZE 1Y9UA 1LBBA 1OIBA 4LVQA 2A5SA 5EYFA 3B6QA 1URGA 4KYSA 4PETA 1R9QA 3FVOA 5CMKA 5DEXA 1S50A 3PGFA 4H8IA 1SVXB 1B7UA 3DRJA 3O66A 3PD8A 3G3GA 3CRBA 3PUVE 3EF7A 1Y3QA 3IO4A 4BDRA 1USYE 1P1NA 1B2HA 4RNSA 2Z8FA 3V8XB 1FTJA 2RCBA 3RTWB 2IEEA 5H8NB 3H4ZA 1ZBMA 3RUMA 5TP9A 2I6EA 4R74A 5L9MA 3Q26A 2ESNA 3M3LA 5AA2D 3CHGA 2QMWA 3PUWE 5I57A 1DTZA 4YKPA 3W15C 3TUSA 1WDNA 1TFAA 4HS7A 3LSWA 4BDLA 2GFEA 3TZAA 3EHTA 3G3JA 4AB5A 4F3SA 3A3UA 5I59B 1PC3A 3N94A 3VE1B 3CVGA 3IOWA 1Z7NE 3BFUA 4JWYA 4U1ZA 1IIWA 3H7MA 4R75A 1MXYA 2G93A 3PUXE 4ZZAA 1MY4A 2F7CA 3KSJA 1A7LA 2XX9A 4NWCA 2GHBA 3DRGA 4U21A 1DPPA 2OLBA 2WOKA 3BKIB 3K6VA 4ZEDA 3B6TA 1ATGA 4JDFA 4ECFA 2PMSA 1IQ7A 4ZDMA 3EPEA 3WAFA 4KCDA 3M3FA 1BLFA 4TOZA 3T22A 3DRKA 1VFEA 1LAXA 3I3VA 2ZMBA 1B3HA 4NF6B 3H6WA 3O6GA 5ICTA 4ESWA 3F11A 4LA9A 4NF8A 1UTBB 1BTJA 3FUZA 1OQHA 3RT6B 5ICQA 3ONMA 2P1SA 3N6TA 2I49A 1SW1A 3OSRA 2F34A 4OFLA 3MVZA 3QSLA 3T9HB 3FVNA 4WEDA 5AA3A 3N26A 4KR5A 1UIVA 3VXBA 3WAEA 3TCFA 4M1VA 1ZIUA 2XXRA 4I62A 2Q2CA 3ZKKA 3K02A 2UVIA 4OETA 2XXVA 2X7QA 2OK2A 2VP1A 1B3FA 4Q8RA 5TPAA 4EDPA 4RYAA 3ZS6A 4OQOA 4F3PA 4G8NA 4PFWA 2FA7A 4F3BA 2I0BA 1PB9A 2F5XA 3UIFA 1T0KA 3JZJA 3RY3A 2XXXA 4PFYA 3IAZA 4TLLB 2H98A 4RPOA 1B1HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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