3RQTA

1.5 angstrom crystal structure of the complex of ligand binding component of abc-type import system from staphylococcus aureus with nickel and two histidines
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
465
structure length
465
Chain Sequence
GKDLNISLPLKTKSIAPYETDVPVKIGAAESLFKTNDQGKIEKALVKSYHQPNDTTLDIELKDNIKFQNGQKLTAEKVKSSLENSMKKSDLVKYSLPISSITAKGQKLTIKTNSAYPELVSELANPFMAIYDTDAKSDVNQTPVGTGPYQIKDYKQSRKISLSNFKDYWQGKPKLDHITVTYQEDGNNRVRNLESQKDDLITDVPVNKVQDIENNQNLKVSKESGFRTSLLMYNHTNKKMTKSVREALDHIIDRQGIADHIYQGYAKPATSPFNDKIPYIKEPKLTKQNIEQAKMLLAKDGYTKEHPLKIKLITYDGRPELSKIAQVLQSDAKKANIEIDIKSVDDIEGYLKDRSAWDATMYSFGTIPRGDTGYFFNQAYKKDGAINKGDYNNSNVDDLINQLNHTVDVKERHNISNDIIKLSSRDVPNSYIAYNDQIVAANSKVKNYKVTPEGIYLIDYRTTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title 1.5 Angstrom Crystal Structure of the Complex of Ligand Binding Component of ABC-type Import System from Staphylococcus aureus with Nickel and two Histidines.
rcsb
molecule tags Unknown function
source organism Staphylococcus aureus
molecule keywords Putative uncharacterized protein
total genus 166
structure length 465
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00496 SBP_bac_5 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 3rqtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rqtA01
1YTVA 1I6AA 1Y4TA 3PUVE 3RYAA 1URDA 3TTMA 4AQ4A 2ABHA 3QUFA 4PQJA 3PUZE 3MP8A 4GIZA 4NTLA 3S9NC 4U1OA 2WOPA 1PDAA 1US4A 2O68A 1S7YA 5AA2D 3T22A 1ZKBA 4JWOA 3UORA 4EF2A 3K00A 4KI0E 4QHQA 4LP2B 4PE5B 5JTYA 1ANFA 3A09A 2XXIA 3BFUA 1FTJA 1JW5A 4QF9A 2I48A 5I57B 5ICTA 1A99A 4Q0CA 2LAOA 3TFLA 3VV5A 1OQHA 1BLFA 3FGSA 1B3GA 1HSJA 1H43A 4Z0IA 5I57A 3IOVA 4F19A 5LOMA 4DDDA 5I59A 5ELVA 1JVYA 2D21A 1A55A 2XXVA 2QS3A 1UTBA 3MWBA 1FCKA 2Y7IA 5I2KA 2F35A 3ECRA 5CMKA 3FVGA 3LSWA 2HEUA 4QFLA 1QULA 5TU0A 4F18A 3E9XA 2ZYMA 3OOAA 4M4GA 1XVXA 1DPEA 2AL5A 3B6QA 3KOTA 1PC3A 4NWCA 2B3BA 3T9HB 5ITOA 3OO9A 3H4ZA 1LBBA 3V83A 4I9DA 3BKIB 3IAZA 5B7DA 3TUSA 2XX8A 2G29A 2AL4A 1NL5A 3Q26A 2PX1A 1D3KA 4XKNA 3VFJA 4F3PA 4OMBA 1O63A 3OENA 4NMYA 1B1HA 2H5YA 4U2RA 4DXCA 3DRHA 2PBWA 1JW1A 4ZDMA 3IOTA 2XXPA 3FJMA 4KQPA 2A5TA 3FV1A 1JNFA 2HAUA 4H0WA 4C1TA 3UK4A 3RY3A 4KYSA 1ZJLA 1HSLA 4DZ1A 4UA8A 4MH5A 5CI5A 1BKAA 3CSBA 5KDTB 4EQ7A 4XKPA 3U92A 1LB8A 1MM7A 4P0GA 3HV1A 3IR1A 3QUJA 1ATGA 5F7VA 4PFWA 2Y7RA 5DYHA 4E0XA 3MVXA 3C31A 5JK4A 4NF6A 4BDMA 1DTZA 3M3FA 3PPRA 1DTGA 4IB2A 1I6QA 1FTKA 2F7AA 1II5A 4R9GA 5M2VA 4R75A 3TMGA 3KN7A 2F36A 3TQLA 3U8QA 5H8QB 1FTMA 5I58B 1H45A 4H8JA 4F39A 1M5BA 3QAXA 3B7DA 4ESXA 1WVJA 4ZEDA 3IJOB 3LSXA 4EUOA 2R9JA 5I58A 2B3FA 3T93B 3RQTA 1MH4A 4EDPA 4EF1A 1AH5A 4OERA 4G8MA 2I0BA 2X26A 4YICA 1RYOA 2Z8EA 4LA9A 1R9LA 4LZ7A 5ICQA 4U4XA 1USYH 1P1UA 1URGA 2GHAA 3JYRA 1N7XA 3KG2A 1BTJA 1IXCA 1FQAA 1P99A 2ZNTA 2PVUA 4FATA 1B05A 1LAXA 4MLQA 1B7UA 2Z8DA 4BLAA 3OEMA 4RPOA 4GD5A 3N94A 1PB7A 4X9TA 3UN6A 3TQWA 1AMFA 2ESNA 1IUDA 5L9OA 1POY1 1B5IA 5J1DA 4R9FA 4POXA 4RK2A 3EN3A 1MM6A 2D5WA 4GFRA 3BFTA 4RNSA 1GV8A 1N0TA 4IY5A 4RA1A 4LQ5A 4F3SA 3C9HA 2REGA 1IXHA 3LSLA 1LAGE 2XXYA 4C0RA 3TCGA 5FHMA 2RCBA 1M5FA 3RN8A 4U21A 4YU0A 2ANJA 1VSOA 4ELQA 1R9QA 1SW4A 4Q5TA 3EPEA 1NKXA 5I2NB 3DP8A 5ITPA 3B6TA 4GWOA 2O51A 3H03A 1MY1A 1SDXA 4H8IA 4XIGQ 4WKMA 3CSGA 5BWJA 3TTNA 4IGRA 3TKDA 2ALUA 4JB7A 3TYHA 1LSTA 4IO6A 1D9VA 3B6WA 5L9SA 1XT8A 4JSOA 1FTLA 5H8NB 1YPNA 4POWA 3G3KA 1GTKA 4DXUA 3OO8A 2H98A 2I49A 2QS1A 1SI0A 1SYIA 4RYAA 5H8NA 3P7IA 4OYVA 4N07A 3DRJA 2O6AA 1QJMA 3E4RA 4YKJA 3SEXA 1TFAA 1B51A 4ECFA 3GZGA 2QMXA 3ONMA 3SEWA 3JV9A 5CRYA 2DE4A 3R7XA 1B5HA 1B3LA 3RPWA 3THIA 5CC2A 4EXKA 3UGWA 4RXLA 4FJPA 2QSXA 2UXAA 4BDOA 1MY0A 3EF7A 2B4MA 4F2QA 3H6VA 1DSNA 3QSLA 3CHGA 3G7WA 4G68C 2Z8FA 3MQ9A 1MY3A 2F5XA 4THIA 1H44A 5TPAB 4HCYA 1QKBA 4JXIA 4QFPA 3L6GA 1SD3A 1I69A 1IXGA 2Y7PA 3IB1A 1OQGA 4H67A 4DIGA 4YAHX 1XS5A 1NNPA 1J1NA 2QRYA 2GRVA 3JZJA 1S50A 3DP6A 4ZS9A 4NF5B 4R2FA 5K2XA 4ZEBA 3W9WA 2UVHA 4O3CA 2OWTA 3A3UA 4XKQA 3K6VA 2RINA 1BIYA 1SW5A 4NF5A 3KN8A 4R72A 4OFJA 2XXUA 1QVSA 5JTYB 1XC1A 2GHBA 3FVNA 3OMBA 4HS7A 4YMBA 4OVJA 2UYEA 2DS9A 1NH7A 1O7TA 3HPIA 5FHNA 3PPQA 1SW1A 1R1NA 4ND9A 3FASA 1Z7NE 3SERA 4DCXA 2O84X 3D4CA 3O97A 4KYEA 3Q29A 3PPNA 3K1MA 1NMUA 3U1OA 5I59B 2I58A 1QUIA 2Q89A 2NOOA 3S9EA 2D3IA 5H8HB 1UTBB 3MC2A 4XKRA 1SYHA 4FEBA 1UTHA 3MP1A 3MJNA 2UVIA 1MQDA 5I2KB 2ONKE 3IO4A 3G3HA 1MG1A 3PAMA 1SW2A 2DWHA 2P0SA 5H8HA 2Y7WA 2NXOA 4X1BA 3IK6B 3G3GA 3PMWA 4P11A 1LCTA 5KCJA 2V3TA 4IO7A 1D9YA 1Z7ME 1B3FA 1N3WA 2GH9A 4FEDA 3KGCA 4OEVA 1LCFA 3SEVA 3KSXA 3PD9A 3PPPA 3E13X 4NF8B 2HCAA 2DE2A 3EHTA 3PMVA 3K6UA 3OEKA 2RC9A 2A5TB 1B32A 2QS4A 3C32A 1S9TA 1ZU0A 3H7MA 2OWSA 2Q9TA 3KBRA 4NF8A 3FV2A 4R6YA 2F7CA 3N5LA 2HAVA 1LFGA 3K6XA 4IY6A 2BJJX 3WAFA 4F2OA 4U23A 4HTGA 3PGFA 1OVTA 1GGGA 1VR5A 4ZZAA 4N13A 4RY1A 4PETA 2B4LA 3CIJA 1I6BA 3OELA 4F3GA 2RKMA 4BDLA 5AA1A 4H65A 1MRPA 1MY4A 3O6IA 2ZYOA 1Y1MA 3IX1A 3V8XB 2DOJA 1B1XA 2V93A 4Q30B 4FIMA 4NF6B 5FTIA 1EZPA 2QMWA 2YJPA 3PUXE 1NNTA 1EZOA 3T96B 3G3IA 3O2AA 4ELRA 3CG1A 2OCUA 3S2VA 1B2HA 4OHNA 1JETA 2VD3A 4I1DA 1A8EA 4WXJA 3VVEA 1LB9A 3RTFB 3M8UA 2Z23A 3T9XB 3PD8A 4DLDA 3MVZA 3IORA 1CB6A 1DMBA 1BP5A 4H5FA 3IOWA 3C35A 4IO3A 3FTOA 1JVXA 4I62A 5A5XA 4ISUA 4G2ZA 1PB8A 1H3DA 4GXAA 5AA3A 5CBSA 4PFUA 3USDA 3S9LC 2RF1A 3N26A 1O64A 5K2YA 3TPAA 3O29A 3ILUB 1N04A 3EHSA 3U94A 3RNNA 3ZSFA 4LQ2A 3LSFB 2G93A 1MXVA 2Q88A 4YB7A 2O1LA 1MQGA 4P0IA 4KFQA 3ZKLA 3S4UA 1Y3PA 3OSRA 1MPBA 3VLUA 3IJXB 3FJ7A 4RK9A 1B46A 4WEDA 1MQIA 3C36A 1N84A 2Y84A 3N6TA 3TTKA 3ZKKA 1EU8A 2VHAA 2VOZA 1R6ZA 2HZLA 3Q28A 1NFTA 1MPDA 2ONSA 1FQDA 2PT2A 1OIBA 3UA8A 2O69A 4OWDA 2OLBA 4H1XA 1TT1A 2QS2A 3T66A 5IAIA 1MXZA 3TAJA 1QKAA 3H6WA 1B52A 2WOKA 3LVUA 4KCCA 3KOSA 3HO7A 3K0VA 3T9VA 2REJA 1A54A 1H76A 4QFOA 2AYSA 3TODA 3SDFA 5IKBA 1AL3A 4UACA 1IIWA 1MDQA 3F11A 2ZYKA 1POTA 1Y3NA 3C4MA 3KJTA 1EH3A 1WDNA 2DQVA 3SESA 3VVFA 1FQBA 2XX9A 4LONB 3M3LA 4YMAA 3DRGA 2I3VA 3M3KA 2ZYNA 3HCQA 3DM0A 3PV0E 4IO2A 4QSDA 3FVKA 3TELA 4JSDA 1JW4A 1N3XA 5DT6A 1RKMA 3MVWA 3FXUA 4H6DA 5AE4A 2F78A 3CRBA 4LZ5A 2PMSA 3RYBA 1SVXB 1XHYA 2VP1A 2XD3A 4G68B 1NNFA 4GL0A 3QYTA 5HPQA 3DLNA 4GLIA 2ZXTA 4GVOA 1Y9UA 2O1MA 3PPOA 4FORA 4G68A 5FHOA 2R6GE 3CFXA 4GF8A 2YLNA 1HSEA 2Q2CA 1US5A 2RC7A 3ILTB 1JEUA 2IEEA 4E0WA 2DVZA 3DRKA 1USYE 1N7WA 1MXWA 1YCJA 5H8FB 3CR9A 4R6KA 1N76A 1T0KA 3MPLA 3TTLA 1LLSA 1B0HA 1P1WA 5EHSA 4GXSB 1Q35A 2F34A 1ZLQA 3R6UA 2UVGA 2H9BA 5H8FA 5L9MA 3O66A 3W9VA 5JEIA 3VXBA 2PT1A 3VE1B 1PB9A 2V25A 3FVOA 4HCWA 5HBCA 1QUJA 2DWJA 4DXBA 1QW0A 4ESWA 2H25A 2P1SA 1GR2A 1FTOA 5DVJA 5FTHA 3CG3A 2F6PA 3K1PA 1SQYA 4ZE9A 4QFNA 1B0LA 3KFMA 2O7UA 4TOZA 3KN3A 1SI1A 3IL1B 1NNKA 3R26A 1FQCA 4GL8A 4ELPA 3TDJA 3OXNA 2B65A 1MQJA 2DWAA 2NWJA 4FAJA 2M8CA 2FYIA 2UYFA 2XXTA 2DWIA 1FW0A 3ZS6A 5AA4B 4KYDA 1B6HA 1UQWA 2PYYA 3KJ7A 4HW8A 2I4CA 3UIFA 3A3CA 2THIA 5AA2B 5AA4A 3C34A 1UTHB 4QSCA 1B9JA 3H06B 5I56B 2GFEA 1CE2A 4PP0A 3MP6A 1A7LA 2Q8JA 5AA2A 4K3FA 1LBCA 3VLWA 3TCFA 1ZIUA 5I56A 3IO6A 2V3QA 3IOUA 5KCJB 2H4IA 4U22A 4YKIA 2XD2A 1B58A 3G3JA 4N6PA 4QFKA 3PUYE 5KZTA 2CZLA 2F97A 2F6GA 4G8HA 4G8NA 2OK2A 1MXXA 1Q1KA 4KHZE 4WEPA 3I5OA 3O6GA 2XXRA 3O9PA 2H99A 4NE4A 3G3FA 3TTRA 4BDRA 1B4HA 4ZEKA 1YAEA 4KCDA 1A8FA 1P1NA 3FUZA 1MY2A 1B5JA 4ZECA 4GOTA 3MUQA 1QUKA 3AXFA 4YB5A 2XXXA 3C33A 3D4GA 4ZEFA 4LZ8A 1M5EA 1OLAA 4PFYA 1VFDA 4OETA 1B4ZA 2DXRA 4JBZA 1AIVA 2RC8A 3OSQA 2RCAA 5EHMA 1LGBC 1D4NA 3I6VA 2XXQA 5L8DA 1MXUA 2VGQA 4GRKA 3FXRA 1Y4CA 4OESA 3OD7A 3LC8A 4U4SA 2Q2AA 3S9MC 4O3BA 3V5AA 3O28A 3SEUA 2E0SA 4TQUQ 1DOTA 1Y20A 3V89B 3VDFA 2CMOA 4MF3A 2FNCA 4MBPA 1B7HA 5CMBA 1B40A 4QRZA 4Z7EA 3HN0A 3IB2A 3H6UA 4R6HA 4MFIA 5DTBA 3T9UA 2NUVA 3TEPA 4ZEIA 3K2DA 1TWYA 3U93A 3TCHA 2ZNSA 4OZ9A 5KDTA 5A5XB 3SEYA 3GXAA 2F8DA 3HHGA 4X48A 2DVCA 2HFBA 5H8SA 4BDNA 4EQ9A 4LVQA 2Y7KA 4OFLA 3LBSA 3IB0A 2O7IA 3MZBA 3N6UA 2I6EA 3FIRA 3SETA 2OBGA 2R71A 4TLLB 4LATA 3QXMA 3PU5A 4NF4B 3FATA 3KZGA 4F1UA 3CFLA 2VD2A 2I0CA 1B7ZA 4RJZA 1SBPA 1M5DA 3I3VA 5H8QA 4NF4A 5EYFA 3QIMA 4KPTA 3RLFE 3MVYA 4F1VA 4M1VA 3RUMA 2XX7A 4R74A 4JWXA 3H6TA 4DCYA 4MLVA 4Q8RA 1EZ9A 1VFEA 4OTEA 3ODBA 1OVBA 3CVGA 4H5GA 3UP9A 3HHFA 1WODA 2DSFA 3GBAA 1LAFE 1TFDA 1F9BA 1KWHA 2X7PA 2QPQA 3RT8A 4OFOA 1TXFA 4XTCQ 1MH3A 3FJGA 2F7BA 3LR1A 2I4BA 2QJEA 5HM4B 2E1SA 4C1UA 1AOVA 1FQFA 2Z22A 2W7YA 5I84A 3VXCA 1PBQA 3EHUA 3CI8A 1LFHA 3O6HA 1JQFA 4FE8A 2UVJA 4F3BA 1B3HA 4NWDA 3BBRA 5F1QA 2KLFA 4QSEA 1NH8A 2HZKA 3SKPA 3DRFA 5ISUA 1RYXA 3FD3A 5DVIA 3RTWB 2I3WA 4GQOA 3VVDA 2HXWA 1OLCA 2OJTA 4EQBA 1ZTYA 4O3AA 2ONRA 4LUBA 4F22A 3LUYA 3EQ1A 1Y1ZA 4G77A 3VLVA 2X7QA 1MDP1 3MZ1A 3TZAA 1MXYA 3OO7A 3K02A 4YB6A 4IO5A 2XHDA 5TP9B 4AB5A 1PEBA 2QL3A 4ONYA 4FECA 4R2BA 1LFIA 1JEVA 4F29A 2XXHA 2FA7A 4YKKA 4ZE8A 4YZZA 5TP9A 4OXVA 5DEXB 1LAHE 3L6HA 2P2AA 2ZNUA 1DPPA 1VE4A 2OZZA 1UIUA 4OEUA 1MS7A 5I2NA 4IO4A 3KEIA 3K6WA 1FQEA 4BDQA 1XOCA 1UIVA 1Y3QA 5DEXA 4F1YA 3GLBA 1MQHA 4KD5A 2XXWA 1PBPA 4ELOA 4XXUA 1GVCA 3OO6A 3Q25A 3DP4A 3RT6B 4OQOA 3PUWE 4RPNA 3MAMA 4PFTA 4U1ZA 2DE3A 1XVYA 2HQ0A 4F31B 1P1OA 3U72A 3DRIA 1ZBMA 1URSA 4R73A 3HSTA 3RGYA 4IGTA 1MPCA 1IITA 4OENA 1IZ1A 2NVUB 4L17A 2V84A 4TLMB 2AIXA 3W15C 3K01A 3O6PA 3CFZA 5CM6A 1ELJA 4JDFA 2WKYA 1M5CA 3K1NA 1P1QA 5CBRA 2DP8A 4YKPA 2YPNA 3E3KA 4DE8A 1B3EA 2ZMBA 1OMPA 2IA4A 4EXLA 3MBPA 3WAEA 3MPKA 3H3GA 4G4PA 5B70A 3K4UA 3DELB 1IXIA 1ZMGA 3FZVA 2DYXA 4X1DA 2WOLA 5CMCA 3Q27A 5DVFA 1L5TA 4KR5A 5BUUA 4AB6A 3MZ9A 3QK6A 4I8CA 3PMXA 2A5SA 5TPAA 1IEJA 3GBBA 4NEDA 4JWYA 3KSJA 2V3UA 1IQ7A 3FXQA 1A40A 5CMMA 2DXYA 3MW0A 4ZZEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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