3RSJA

Structure of hcrf in complex with ganglioside gd1a
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
413
structure length
406
Chain Sequence
IKDNSILDMRYENNKFIDISGYGSNISINGDVYIYSTNRNQFGIYSSKPSEVNIAQNNDIIYNGRYQNFSISFWVRIPKYFNKVNLNNEYTIIDCIRNNNSGWKISLNYNKIIWTLQDTAGNNQKLVFNYTQMISISDYINKWIFVTITNNRLGNSRIYINGNLIDEKSISNLGDIHVSDNILFKIVGCNDTRYVGIRYFKVFDTELGKTEIETLYSDEPDPSILKDFWGNYLLYNKRYYLLNLLRTDKSITQNSNFLNINQQRGVYQKPNIFSNTRLYTGVEVIIRKNGNTDNFVRKNDLAYINVVDRDVEYRLYADISIAKPEKIIKLIRTSNNSLGQIIVMDSIGNNCTMNFQNNNGGNIGLLGFHSNNLVASSWYYNNIRKNTSSNGCFWSFISKEHGWQEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin
molecule keywords BoNT/F
publication title Unique ganglioside recognition strategies for clostridial neurotoxins.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 105
structure length 406
sequence length 413
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3rsjA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3rsjA02
1GBGA 1LCLA 2R0FA 4DS0A 1W6PA 2ZMLA 4YG3A 4YZ2A 4GAIA 3BAHA 5CAZA 4I4XA 4YW2A 5JOYA 1ULDA 1IOBA 3AH1A 2HZ9A 1BKZA 1SLIA 1JN2P 2E7QA 3BRDA 4CRQA 1AXYA 1SLTA 3R05A 1NLSA 3INAA 2AGSA 5DUUA 1G9CA 1JYIA 4ZFUB 4Y1XA 1ISXA 4P6AA 3ILFA 3WDXA 2JECA 3VSFA 4G6JA 41BIA 1FV2A 3U4XA 1YTOA 2DU1A 3NJ5A 3ZXJA 1JT5A 1LOCA 4LO2C 3WVJA 2AUYA 3ZC9A 3W59A 3H6SE 1BZWA 1A78A 4G1RA 3WLUA 3AXEA 3SNVA 3OJBA 4QKSA 2HWAA 3VT1A 2BQPA 4XFUA 3WOGA 4A7YA 4JAWA 1ONKB 2PHTA 1R1ZA 2DTYA 3RTJB 1Q8OA 1FN0A 2XG3A 2Y9FA 5BYNA 3LSDA 3RG0A 4PF5A 5DG1A 1PZ7A 1Z4SA 1G9BA 4M3CE 2XOAA 4LO0A 1WCSA 5JOXA 4JCKA 3ZYPA 2R1BA 3OYWA 2ZGOA 2GZBA 1W6MB 3UD8A 4IQPA 1WLCA 4DRVA 4GP0A 2JD4A 4ENDA 3BA4A 3KM5A 1SBDA 5F9TA 1DZDA 2FGFA 4Y26A 4I6IA 2YROA 3LLPA 1MC9A 4HL0A 2DTWA 3VKOA 2WRYA 3MALA 1K5UA 2P3KA 1G9AA 1Q8SA 1AVWB 4I4RA 1QOTA 1HQWA 3CNAA 4LO1A 2CTVA 2R16A 4AYUA 1RINA 3Q7YA 4FP3A 1FGAA 3ASIA 1V6LA 5T5JA 1BFGA 1FMMS 3WA1A 1GKBA 3HSMA 2IHOA 1SLLA 4XTMA 1Q8QA 3BRFA 2D6MA 2W39A 3ILNA 5F90A 3H6QA 1CQ9A 3Q9OA 2MC2A 5GLVA 4LBJA 3QR5A 1TWMA 1BARA 5DZFA 4J2SA 5JLVA 3AP5A 3M3OA 4FOVA 1WLDA 4XOGA 1JLYA 3AYEA 1RMLA 5DUWA 1W3GA 5HCBA 2DYCA 3AXDA 2P23A 1UX6A 1S0EA 1ITBA 4YW5A 2KI6B 2E53A 3FJKA 3FJ8A 4XTPA 3CRIA 3B69A 1HIBA 2HYKA 2X2SA 1V6OA 3AKIA 1ISVA 3ZSLA 1WW5A 4QALA 1MR5A 2D7IA 2GMPA 4Y1UA 1AZDA 3MPPG 3ZSMA 1W6QB 4AN7B 4AVVA 5T54A 2SLIA 5GLUA 4XJ9A 2NMOA 3AX4A 2EALA 3P6JA 5CA6A 2WKKA 1R8OA 4OWJA 2ZA9A 2NZ9A 2RHPA 3O4DA 3WCSA 1JBCA 2NYYA 3A21A 5BXRA 2NP0A 1BASA 3PHZA 2CY6A 4A7ZA 1J0SA 1BA7A 3BX1C 2A6WA 1DYKA 4ATFA 3OJVA 2GO2A 2NM1A 1KJLA 2ZAAA 1UN1A 2WLQA 3A0KA 3CAHA 3M1HA 3WO3A 3CA4A 4USPA 2RQ9A 3APBA 1IILA 4BM8A 2BFHA 4XJWA 2CWSA 3ATGA 1X50A 3FJEA 3BAVA 5FREA 4R9BA 2SBAA 3Q7WA 4I30A 2A6ZA 3VV1A 1S0FA 4LBQA 2D7RA 1L2HA 2YUGA 2E7TA 4RL7A 1MS9A 4DPNA 2VUAA 1G7YA 2UWAA 3FLRA 4YGEA 3UD7A 3UJ0A 4XHXA 5KXDA 1W6OB 2VH9A 1W6MA 4WVVA 4Q8KA 3O12A 4GKXA 3B3QE 3BIWE 1Q04A 1H9WA 3IKWA 3UL2A 1IHKA 1LOEA 4FPYA 5FZYA 4XE9A 3I4IA 2C9AA 2VW0A 4ZGRB 1CVSA 5BQUA 3OGFA 1DQ0A 2ZHMA 2ZZJA 2ZQOA 1D0HA 4U36A 3NV1A 2P39A 4ZBVB 1MS4A 4Q9GA 4Y1YA 1SR4A 1IT0A 2DURA 3BADA 1LECA 1N1VA 2W08A 3AJ6A 1KJRA 1HDKA 1QKQA 4GP3A 4YFZA 1APNA 3P6IA 1FNZA 3IIRA 2Q3NB 3F1RA 5KXEA 4JKXB 3B00A 1BLAA 2AAIB 3FJHA 4XJUA 4BMEA 1V6XA 2E4MA 4FOWA 1N1YA 4HJJA 1AX1A 1WBCA 1HWNB 4MYEA 2ET2A 1Q03A 2D3PA 1V6IA 1LGCA 3AZZA 2DUQA 5EC5A 3BAUA 4AVSA 2ZGMA 4R9AA 1J1TA 1GZ9A 3GNEA 1P63A 2FFVA 1RITA 2A6VA 1VALA 1RZOB 3BTAA 2LIQA 1IKQA 2ZGPA 4R6UB 1KNMA 2Y9GA 1LOFC 4XKIA 1AX0A 4C1XA 4EB2B 1BLDA 4YG0A 3WG3A 4JKQA 4YM3A 5KXBA 3FUQA 4GWNA 2GNTA 1S1AA 4GWMA 3VKNA 4Q8LA 3WNXA 5IUQA 1E0OA 2JJ6A 1C4RA 3FUOA 1NXD1 3BRGC 4AN6A 4LO2A 4M3CA 4YZ3A 3JRRA 1DZQA 1BJQA 1FQ9A 1PUUB 1Q8VA 3HALA 3AH4A 3RSJA 2GDFA 1BFCA 2M49A 3JUUA 2EAKA 4FPOB 2WT2A 3C9ZA 1SLBA 3IN9A 1QU0A 4XJ8A 3W58A 3D7WB 1YBIA 5F8SA 4YZ4A 4KEIA 3EF2A 1LJ7A 3SH5A 4GOVA 3N0KA 3WHTA 1FX5A 3N35A 4M01A 2W52A 3WO2A 1XZZA 4LBLA 4ASMB 2WSUA 1XHBA 1Q8PA 3N7LA 2NTDA 5JOZA 1DQ2A 1WUVA 1LHNA 1GICA 1DHKB 1BXHA 2PHWA 2W68A 1IRPA 1JQZA 2VXTI 1S0JA 5JMCA 4ATEA 1D2SA 5AVAA 5E24E 5DVHA 4Q91A 3ZSKA 4LO7B 4GAFA 2KI4A 3HN1A 3WG2A 1N47A 1W6OA 2DREA 4XXAA 4R9CA 1CPMA 1V6WA 1GNHA 1FMZA 2A71A 1W0PA 2WJSA 1LU1A 1AJOA 1YO8A 1QF3A 3VKMA 4XBLA 1QDOA 2ZHKA 3L2YA 4YOLA 1SLAA 2Z42A 1PUMB 5BP5C 1Q56A 1LGBA 1GV9A 1JOJA 3M3EA 3QYDA 4J2XA 4KC3A 3PVOA 1R8NA 4IHZA 1CVNA 5JOWA 1YI7A 2P3JA 4LO8B 2VSEA 3W9TA 2ARXA 4W65A 1LHWA 3I29B 1MZ6A 1G9DA 3N3HA 3LTQA 3KQRA 1T4QA 1IOAA 3CRHA 5GAQA 1OQLB 3FGMA 1HQLA 4YLZA 1G86A 4XXPA 4XYXA 4QC4A 2P37A 2NN8A 1LODA 4LBQB 1AVXB 1S0DA 2FHRA 1GZCA 1GSLA 2TEPA 4XMIA 4LO3C 3NBNA 2ZQNA 1SACA 4XFTA 4QD2C 2LTNA 2UUSA 4I4SA 4SLIA 4AVTA 3JU9A 4XJZA 1Y7BA 1K5VA 3CA3A 1VLNA 1WD4A 3RQ0A 1QOOA 3NBCA 2A6XA 2YMZA 4DEPA 1O4ZA 2AR6A 1TEIA 4NOTA 3FJFA 3D5OA 1HCDA 4ZOTA 3DUIA 1LGNA 1DQOA 1WLWA 3I8TA 5BVPI 2UURA 1FWVA 1GZWB 1ENRA 5JVVA 2D7FA 4FQZA 3O4AA 1F5FA 4I2SA 1JYCA 5BXSA 3JUTA 4Y20B 1GGPB 4I37A 5DXDA 1WW6A 2CYFA 1CPNA 4P9YA 2UWCA 3TC2A 3T8SA 4R9DA 3WINA 4YM1A 2K43A 4Z8SB 5DZEA 3OBTA 4FPJA 4WZFA 4G9MA 4OUJA 4D0TA 2UU8A 3WDVA 2ERFA 3V79C 5CB7A 5IK8A 2Z49A 3ZXGA 4XILA 3BA7A 3E8LC 1FATA 4PCRA 3MW3A 1KDKA 2EF6A 1DYPA 3WDUA 2ZMNA 1M16A 1IKPA 5T5LA 4AGRA 1JHNA 3BODA 3V0AB 4FOYA 2DUOA 5F8WA 3O4OA 3WUCA 1ISZA 4OWLA 2P34A 3S8KA 5D61A 3P53A 5D63A 1PC8B 2ZR1B 5JDBA 4QBVA 2D22A 3AZWA 3RMYA 3OGGA 2VLCA 8I1BA 2Q9XA 3AKHA 3SISA 2GALA 1SFYA 4P14A 2K8RA 1V6NA 1TOOA 4X39A 3BAGA 2GMEA 3ZXFA 4LBOA 4LO0C 2ZGRA 2F8XC 5DZGA 2FMDA 3WMVA 1LHOA 3NBDA 3ENRA 5EYXA 5FZUA 5IK4A 3RTIB 1BFBA 2YY1A 1JY0A 5T50A 1QQKA 3I2XA 4M3CB 4Q1PA 1V6VA 1MVEA 1FWUA 4M00A 4WVWA 3LCPA 4YW3A 3BA5A 5EG6C 1MD6A 5T52A 3ILAA 4FPHA 3CA0A 4FPCA 3AKGA 4Q27A 3O49A 5F5QA 1LENA 2YXSA 1QNYA 4IONA 1MS1A 2D24A 1N3QA 1CE7B 1BFFA 4YW4A 1VIWB 3N7KA 4I4QA 1MZ5A 2YZ4A 1AXKA 2PHXA 5CBLA 3IAGC 1WW4A 2A3YA 2AREA 3H6RB 1M2TB 2C5DA 4P0LA 1V6MA 4FQ4A 4FP2A 4I1BA 3O3QA 1DQ1A 4C1WA 2OUHA 1AXMA 3T2TA 4JC1A 1C57A 4UW4A 3CQAA 4Y22A 1LOFA 3UJQA 4QKRA 1AJKA 4I4UA 3R4UA 4I1EA 2OUJA 3D6EA 1CJPA 1EPWA 1ULEA 4OW4A 1Z2VA 4IY9A 4KBBA 1LULA 1UL9A 4FOQA 2OW4A 1UAIA 4Y1VA 4XIKA 2PHFA 1H9PA 3UJOA 4USOA 2ENRA 1BYHA 5FNWA 3AZXA 1JT7A 4CTEA 4WBCA 4XHBA 1PZ9A 1ENSA 3K1XA 2AQZA 2D23A 4ZFWB 3VWCA 1HLCA 3VT2A 7I1BA 2E51A 1EYLA 1DQ6A 4IY8A 1FYUA 1GZWA 3WCRA 2ZGKA 1VAVA 3T1LA 3IMNA 2AXMA 2AENA 4L4HA 3ILRA 2CNAA 1ULCA 3TAYA 5GZFA 2A3WA 1YIFA 4Y20A 4I0YA 2BEAA 1AX2A 4YFWA 4RA0A 4YM2A 4PC4A 5DG2A 5GZDA 4D0ZA 2DVFA 5BXPA 2CWMA 3FLPA 1N1TA 5GJ6A 2ZGLA 4Q26A 1TWEA 1B09A 1G82A 1WBFA 2D6OX 2ERMA 1ULGA 1YF8B 4OZXA 4YZ5A 3LSEA 4ZKTB 2FDBM 1QGLA 1LHVA 3V65A 4AWDA 5DSSB 3V0AA 4BMBA 2VSAA 3ZC8A 2ESUA 3CA5A 4PQ9A 4XMAA 2KH2A 4L4IA 4EFRA 4L8QA 1W3FA 2D6PA 4GALA 6I1BA 2F2FC 1EV2A 1C1LA 1F9KA 2GMMA 3VKLA 2WBCA 3D4KA 2Y9WC 2EXIA 3B9UA 1UZYA 4K21A 2UWBA 4FGFA 4X3AA 3MEPA 5T5OA 3AZVA 5BP5A 3WG4A 4JPZA 5H9SA 4BLIA 2PHUA 3USUB 1QMJA 5F8YA 1WD3A 4K1ZA 3VEQA 3AP9A 3AJZA 2L5XA 4AGGA 3AP4A 3FJAA 3O4CA 3RS6A 1I1BA 4I4PA 3UJ4A 1UZZA 1MS8A 1DFCA 4M3CF 1QXMA 3TB0A 2ZACA 4J2KA 2JDZA 3ZXEA 4XZPA 4H9WA 1LOAA 2R9KB 1VCLA 3BOPA 5E8AA 2RSTA 4J23B 2R0HA 2A6YA 3AFKA 4LO3A 2EXJA 5GLZA 1IS4A 4FPFA 3FJCA 3H6RA 1GNZA 3IM0A 1DZCA 5FRAA 4K1YA 3PVEA 1A3KA 1DIWA 3WV6A 1ILR1 3UD9A 3RMXA 2E4MC 2EXKA 2GNMA 5HPZA 1AVUA 3OJMA 1CIWA 5LK5A 5SV8A 3NV2A 3WHUA 5BOWA 4XJAA 5GZCA 4AGVA 1DQ5A 1JT4A 4G6MA 3PJQA 2FFUA 2DVBA 1YRZA 5L73A 1WW7A 5GZGA 4OWKA 2B7YA 2XB6C 4F83A 4YZ1A 4TLPA 3WZ1A 3SLIA 2KKIA 1KDMA 2D6NA 3AYAA 4I4YA 3A23A 1MACA 1SCSA 3IM7A 1DBNA 4OEEA 2ZGUA 1NUNA 3PG0A 4TYSA 1XG6A 1FAYA 3AZYA 5EHAA 1SZ6B 1CONA 2DS0A 1F31A 5DUVA 4ISRA 1IJTA 3UK9A 3WDTA 5DZUA 1YYNA 1JT3A 3QLQA 4YGBA 2PELA 2NMNA 1N4KA 2QYIB 2E6VA 4KEKA 5FNXA 1U0AA 3AYDA 4YM0A 1T9FA 4CZSA 1JUIA 1FV3A 1LU2A 1SCRA 3SITA 4LBMA 2ZABA 2DUPA 4YG6A 1BQPA 3CA1A 3QCWA 3A4UA 3ZVXA 3A07A 2ZKNA 1WBAA 3VUOA 5GZEA 4ZXKA 2V5YA 1PWAA 2D6LX 3T1MA 3I2AA 2D6KA 2LALA 4Z9WB 4GA9A 3NBEA 1LESA 5IT6A 4HA2A 1OQ1A 1UPSA 4GXLA 2KLLA 1ONAA 1AFCA 1AVBA 5E89A 1C1FA 1I3HA 1N3PA 2A70A 3A22A 1HWOB 1GANA 3WUDA 4A7KA 4YW1A 4Y22B 9ILBA 21BIA 2GNBA 1ULFA 4X38A 3ZXDA 2ZHNA 3B9CA 5GLTA 3AYCA 1QNWA 5FZZA 1SBEA 1G9FA 2QN4A 2WT1A 1ABRB 2KM2A 2ZMKA 4GKYA 3UDAA 2D43A 2H0BA 3POYA 3VT0A 4I96A 5E88A 3B01A 4NO4A 4OEGA 4EFPA 1VAMA 3IM6A 2X2TA 1S0LA 1MS3A 3MW2A 2LIEA 3AP7A 1HWMB 5IK7A 2ES3A 1PZ8A 1W0OA 3IPVB 3POSA 2R49A 3C2UA 3USUA 2ZGSA 3NWKA 1V6KA 3V0BB 3GALA 3BB2A 1UMZA 3M3CA 1TIEA 1LOBA 4HANA 2D1ZA 4IZXA 3WMUA 2A75A 2GNDA 1ENQA 4OEFA 1DLLA 4J2YA 3O0WA 5GLWA 3S8JA 1GLHA 3V64A 1UKGA 1ZM1A 4P0KA 5DUXA 4II0A 1ZA4A 1H30A 4FPEA 3FJ9A 5I1BA 1G8WA 3PMEA 1RIRA 1FNYA 5G00A 1CN1A 2GN7A 1LEDA 4XIOA 1HCEA 2BEBA 1S0IA 4IZEA 1JW6A 3O44A 1KQRA 3DGTA 3OJ2A 4UW3A 4DCKC 1CESA 4DRRA 1AVAC 1IS3A 2WSVA 1V00A 2DRZA 2I2SA 3ZSJA 3ZXKA 4D69A 1LHUA 1KRIA 3FJJA 1WBLA 1ISWA 3CRGA 4I8MA 4JQ0A 2R1DA 1W6NA 3FFZA 2ZBJA 5T5PA 4Q1RA 2DV9A 4P9WA 2AYHA 1O4YA 5H9QA 3SH4A 4Q9PA 3CA6A 4FPLA 2EXHA 4LBNA 3FBYA 3FJIA 4YGCA 2FO1A 2D3RA 2Y9XE 4BQ1A 1LOGA 3NV3A 3OY8B 1Q1UA 2Z48A 2DVDA 1S0CA 4H55A 5EXOA 2A3XA 3O0VA 1Z78A 2CL2A 3N7MA 1CR7A 2VW1A 3CU1B 2RG9B 4I4VA 3HMYA 3MW4A 2ZGNA 2NVHA 4FPKA 4P0JA 3PUBA 3M2MA 3ZPYA 4LO1C 4DENA 4D8HA 3H0OA 4DQAA 1JTCA 5BXTA 3O0XA 4EKXB 2J3PA 5EWSA 4QD2B 1JXNA 3VKFC 1S0BA 2DVAA 3WINC 3HOMA 3FJBA 4XBQA 4JRAA 2GN3A 4G9NA 2IWTB 3AH2A 1QDCA 2JE9A 1HKNA 5IK5A 4Q2FA 1A8DA 1KITA 2WQZC 4I7IA 3ZXLA 1II4A 2F2FA 3NV4A 3O4BA 4ZFYB 2P2KA 2DU0A 1IS5A 3OPZA 4BPZA 3A0NA 2ZHLA 1W6PB 2VU9A 4WV8A 3WDYA 1AXZA 1OKQA 3HR9A 2AH2A 2WNEA 4UW6A 4ITCA 1Z0HA 1S0GA 3WG1A 1DFQA 3OBRA 4LBQD 4XBNA 1IS6A 1HKDA 2ZGTA 4LO7C 1MS0A 1QOSA 5H9PA 3IPVA 1SBFA 4QO3A 2PHRA 1LTEA 2DWRA 2Q5TA 2HWMA 5KXCA 2K4AB 4XFSA 2G4IA 3V0BA 4YGDA 1RY7A 5DUYA 3POWA 1GYKA 1JLXA 1DGLA 2WT0A 3WO4A 4ZLBB 5EYYA 3VSZA 4Z8BA 1MS5A 1URXA 1ISYA 2HW9A 4ISQA 4K20A 1SLCA 3FLTA 5B2HA 1V6JA 4PBOA 1HWPB 1N1SA 31BIA 3BAOA 3POKA 4ZA3B 3AP6A 3SH3A 4EEEB 3IM5A 2JKBA 4JP0A 4Y24A 3F62B 4BLJA 3WDWA 2YV8A 3O5WB 2JE7A 3AK0A 4TZDA 3PVNA 3R4SA 2VW2A 3OYWB 1QQLA 1XQNA 4LBKA 1V6UA 2ZGQA 5H9RA 1DQ4A 1PZZA 1AF9A 2P3IA 4DFSA 3M3QA 3N36A 1LEMA 2OVUA 5GM0A 3O5SA 1EVTA 4FVVA 2MLLB 2VY0A 1W6QA 3AJYA 1RG8A 2V73A 3KMVA 4KEJA 1N3OA 4FPGA 3ZX7A 4I4OA 3OY8A 3AJ5A 4QBCA 5HCAA 3N7JA 4PBPA 5D62A 3HBWA 2A5ZA 2A7AA 2ARBA 2MIBA 2AFGA 5CNAA 5BQUC 4UW5A 5T55A 1DQGA 3ZYRA 2DVGA 5HCFA 4P9XA 1SR4C 4H04A 1DJSB 1NZKA 2D44A 4IYBA 1TFMB 3BAQA 3FJDA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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