The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
35
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sequence length |
94
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structure length |
94
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Chain Sequence |
QIEVGPGATNATINFEAGILECYERFSWQRALDYPGQDRLHRLKRKLESRIKTHNKSEPENKRMSLEERKAIGVKMMKVLLFMDPSAGIEGFEP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of human ISG15 in complex with influenza B virus NS1B
rcsb |
| molecule keywords |
Ubiquitin-like protein ISG15
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Antiviral protein/viral protein
|
| total genus |
35
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| structure length |
94
|
| sequence length |
94
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-05-03 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | S15/NS1, RNA-binding |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HR0 O; 4DUY O; 1N32 O; 2UUC O; 5IWA O; 4B3R O; 3F5T A; 5IT9 N; 5A2Q N; 2AGA A; 3JAM N; 1XEQ A; 1YZB A; 5BY1 A; 4DR2 O; 4DV4 O; 4DR4 O; 5FLX N; 2F4V O; 2LW7 A; 4YHH O; 4DV3 O; 1XNQ O; 2JRI A; 1IBM O; 1AIL A; 4AQY O; 4B3M O; 1D2D A; 4JI4 O; 4LFC O; 2UXC O; 1R1B A; 4DR6 O; 2UXB O; 1HNW O; 1X59 A; 1F7Y A; 4X66 O; 3T1Y O; 4LF4 O; 1A32 A; 5BXZ A; 4DV7 O; 1HNX O; 1FYJ A; 2ZM6 O; 4GKJ O; 1AB3 A; 1J5E O; 3SDL A; 3J80 N; 4LF5 O; 4NXM O; 2UU9 O; 3T1H O; 1KUQ A; 4JI6 O; 1N33 O; 1IBL O; 3J81 N; 4DV0 O; 4DV2 O; 4JV5 O; 5LL6 Y; 2DJV A; 3RT3 C; 4DV1 O; 4YY3 O; 1N36 O; 4K0K O; 4JI5 O; 2N74 A; 2VQF O; 4LF8 O; 4JI8 O; 5H5N A; 2DOS A; 3J7A U; 3OTO O; 3R66 A; 4JI3 O; 4LFA O; 1HNZ O; 4B3T O; 4JI7 O; 4X64 O; 2FKX A; 1DK1 A; 4DR5 O; 1NS1 A; 5BR8 O; 5LMU O; 4JI2 O; 4LF7 O; 2UXD O; 4OPA A; 1XMO O; 4DR3 O; 1I94 O; 2ZKO A; 4DV6 O; 2E5L O; 3M8A A; 4GKK O; 4OPH A; 4NXN O; 2Z0A A; 4A5U B; 1IBK O; 4JI0 O; 4DUZ O; 4B3S O; 1FKA O; 4JI1 O; 4OX9 O; 4DR7 O; 4X65 O; 4LF6 O; 2UUB O; 1XNR O; 1R6T A; 2VQE O; 2HHH O; 3O65 A; 2UUA O; 1XMQ O; 1FJG O; 1N34 O; 1G1X B; 4DR1 O; 4DV5 O; 4X62 O; 4LFB O; 4LF9 O; 4JYA O; 4KHP O; 5LMN O; #chains in the Genus database with same CATH topology 5BR8 B; 3LDC A; 4E4E A; 2R9R B; 2Y69 C; 1WLE A; 1JVM A; 5IYZ A; 1I94 B; 5IT9 N; 3OMN B; 3TXS A; 4DUY B; 3BRC A; 1QLE C; 4DR4 O; 5FLX N; 4GZR B; 1WP7 A; 4FPP A; 1GMG A; 1AIL A; 3SPJ A; 1UJW B; 4DR2 B; 2PUS A; 1R1B A; 3VQX A; 4KL1 A; 1HNW O; 2IU3 A; 1XL4 A; 1PNL A; 1FFX B; 1V55 B; 4AIL C; 3VQY A; 2WLL A; 5J2U B; 5CA1 B; 1HR0 B; 1TA8 A; 3CXH F; 2XHB A; 3RFR A; 4W4L A; 5JJN B; 1VAR A; 1JFF A; 4F6E A; 1VQL V; 2WAM A; 1BT8 A; 2DJV A; 5IY5 B; 2WA4 A; 1FS0 G; 1ZAU A; 4LNU A; 3QF7 A; 3H9V A; 4IIJ B; 4JI8 O; 2JGU A; 1F4M A; 2PZS A; 1P7G A; 5H9C A; 1YTF D; 3OMA B; 1VQ9 V; 5BR8 O; 4O2B A; 1XL6 A; 3HR0 A; 4LF5 B; 1I94 O; 3ASO C; 4OXS A; 4DYL A; 5EYP B; 1IBL B; 1Q6U A; 3ZHV A; 4JV5 B; 2P4V A; 3OTF A; 5EBW C; 2KKW A; 4C7U A; 5JCO C; 5LOV A; 1WA8 B; 1K7D A; 1R73 A; 3O65 A; 5EZY B; 1NVP B; 1Z5W A; 1LUW A; 4CS4 A; 2Z3Y A; 3CRC A; 2HJF C; 4FM2 A; 2ZE5 A; 3AG2 B; 4U3F H; 1FJG B; 2DWE C; 1HR0 O; 4E2L A; 1QVG U; 4DRX B; 1K9M W; 1YIJ V; 2ZD9 A; 5LHH A; 5EC1 C; 4X1Y B; 4JTC B; 3ETG A; 4JI0 B; 4PEL A; 2UUB B; 2CTW A; 2IW5 A; 1HP8 A; 3ABL B; 3D8C A; 1S0V A; 1D2D A; 3H1K H; 1ARO P; 2HHH B; 3KZI Z; 4O4H B; 4MVO A; 5IYD O; 3ZN0 A; 1BHA A; 1ZLZ A; 4YIP A; 2HEP A; 4K35 A; 1VF6 C; 4LF5 O; 1VP7 A; 3K9A A; 1WN7 A; 4I55 B; 1XHZ A; 4GCZ A; 1M1K W; 1IBL O; 4JV5 O; 2LFR A; 1IVS A; 3FB7 C; 4FM0 A; 1Y67 A; 4X1I B; 4DV1 O; 4LR3 A; 3CJH A; 3HKC B; 4HNA B; 1NI8 A; 1XI1 A; 4ZOL B; 5A9G A; 2XUM A; 4RUF A; 1Y74 A; 5ITZ A; 3CME V; 1NTM H; 3R66 A; 4J41 A; 4IHJ B; 2Q5Z A; 3ZRX A; 1QR9 A; 4ZHQ B; 1HNX B; 4K8Z A; 1W0J G; 2OIG A; 4XDK A; 5LP6 B; 1RP3 B; 2BTQ A; 3RYH A; 2QWN B; 4MTO A; 5KAI Z; 4FLV A; 4CC6 A; 2KG7 B; 3M8A A; 2QSA A; 4JZ2 A; 1N33 B; 4Q20 A; 4JI0 O; 1J95 A; 2UUB O; 3EFF K; 4PA4 A; 3L74 H; 4X89 A; 2HHH O; 3JD3 A; 4QPK A; 3UT5 B; 1G1X B; 3WG7 B; 3TXQ A; 1LNQ A; 3DTU B; 2Y69 B; 2ZIN A; 3CP1 A; 1K5Q A; 1MOF A; 4CBC A; 3P32 A; 4MT8 A; 2E76 B; 2V7Q G; 3ZHT A; 1ZL8 B; 4J80 A; 2X6A A; 5CBF A; 3RWR D; 4U7O A; 1XMO B; 1QLE B; 4NR1 A; 1PPJ H; 5B1O A; 3AEI A; 3JCU Z; 2FL4 A; 2X0L A; 1W59 A; 1NH2 B; 4RWU A; 1FPO A; 1CP9 A; 1SQQ H; 3CCJ V; 1AVM A; 1FXK A; 2WLM A; 4JZG A; 1Z2G A; 2AHY A; 4O4L B; 1X59 A; 5L3D A; 1XMQ B; 3JAS B; 3B09 A; 4PV1 B; 1V9P A; 1A32 A; 3L75 H; 4HZ3 A; 1HNX O; 3L9D A; 4XBF A; 2V1D A; 1YVW A; 5LGU A; 4GLX A; 2CK3 G; 2DMX A; 5D5P A; 5BMV B; 1N33 O; 3RYF B; 4O2A A; 5H6Q A; 1S5L Z; 5J2T A; 3SPG A; 4WFH A; 3D3I A; 3HKE A; 2YIB A; 1P84 F; 3CPW U; 3E89 A; 4FFB B; 4OGQ B; 2N74 A; 1OCO C; 5H5N A; 2DOS A; 2EUL A; 4TV9 B; 1ZSP A; 1S77 D; 3D36 C; 3T4Z A; 2RNB A; 1DK1 A; 3ASO B; 3G80 A; 1N8R W; 3K79 A; 1XMO O; 1XOU A; 3H1J H; 4FFK A; 3FB8 C; 5DEC A; 1P7B A; 1I7F A; 4DV2 B; 2ZE7 A; 1NTK H; 5C93 A; 3IC9 A; 3HPL C; 3IC7 A; 4FZ0 A; 3SPI A; 1EN5 A; 1XMQ O; 1JA8 A; 2IJI A; 1G4Y B; 1HWY A; 2OCC C; 3H1L H; 4QIW F; 1OCR C; 5L3G A; 1XHX A; 2Q6A A; 4Z1M G; 5EIB D; 1MZE A; 1THZ A; 1QQC A; 5DM6 V; 2AGA A; 1Y66 A; 2YUA A; 3ASN B; 2HVK C; 2ZXW B; 4XDJ A; 4ZI7 B; 1FFX A; 1VF7 A; 5KX5 A; 5FPO A; 2F66 C; 2ZCE A; 3WB1 A; 2CUG A; 4DR1 B; 3FD9 A; 5J2U A; 4LF9 B; 3AG3 C; 2Q8V A; 5JH7 B; 4LH7 A; 5CBH A; 2D2C B; 3P3P A; 4D7S A; 1IDS A; 4JYC A; 3U11 A; 3VBB A; 5B66 Z; 4JTA B; 3SJA C; 4BR6 A; 5LXT B; 1XDC A; 3H1H H; 1R3I C; 1KYO F; 2QA4 V; 2Y4U A; 4DV2 O; 3RT3 C; 2ZDI A; 1IUR A; 3B8M A; 2EZP A; 2R9I A; 2B5U A; 4LFC B; 1BZK A; 1UPG A; 4HAM A; 4DR6 B; 2UXB B; 4R50 A; 2N05 A; 5JWP A; 4UCU A; 1AI5 A; 3E22 B; 4I0X B; 1QU7 A; 2QE7 G; 2QGN A; 2E74 B; 2CTR A; 3Q4H A; 4MTG A; 2AZ2 A; 4NKG B; 5GW7 A; 3SJC C; 1I5Y A; 1KP2 A; 1S3J A; 4OPA A; 2ITC C; 4NXM B; 2RMK B; 4Q6G A; 3K59 A; 3G67 A; 1WB7 A; 3E8F A; 1K4D C; 1VQP V; 2EIL B; 1HDJ A; 3AG1 C; 2DYS C; 1V54 C; 1YSC A; 1N4C A; 2A7W A; 1AP6 A; 2ZR3 A; 3E8B A; 1N36 B; 1WA8 A; 4K0K B; 5EZY A; 5L3C A; 3CRA A; 1K34 A; 5KAF Z; 4PD4 F; 1ZUQ A; 1H8H G; 1RM1 C; 4DR1 O; 2RDC A; 1OCZ C; 4B3T B; 4LF9 O; 4CC5 A; 1M56 C; 4NTY A; 5EBM C; 4K8X A; 1PL4 A; 1COW G; 4DRX A; 1WB8 A; 3X2Q C; 2QKC A; 4PI0 A; 4DV6 B; 2EJ7 A; 2QR4 A; 2Q0O C; 2DN9 A; 1Q43 A; 4X1Y A; 5B5E Z; 4X1K B; 5KUM A; 2QM7 A; 5IWA B; 4TWK A; 4IT5 A; 3KCY A; 5H6R A; 4JI1 B; 3W7T A; 1VQ5 V; 4OX9 B; 5JJJ B; 4JAS A; 1XNR B; 4O4H A; 4LFC O; 3VOU A; 2P4K A; 1I5X A; 4DR6 O; 2UXB O; 2UUA B; 3B4S A; 4PA3 A; 5BXZ A; 1AB3 A; 3BEH A; 1NTZ H; 5LMN B; 3SDL A; 3ABT A; 3KG2 A; 1PNM A; 4B3R B; 4YXW G; 4NXM O; 4FLX A; 1SKV A; 3VQW A; 3ABK B; 4X1I A; 3K04 A; 3CWB H; 3APO A; 1N36 O; 4K0K O; 4PA9 A; 4LWS A; 3HKC A; 4HNA A; 2YIB D; 2Q7H A; 4ZOL A; 5EBL C; 1NZ6 A; 1B3Q A; 1Q6H A; 2AXT Z; 3THO A; 5LYJ B; 4IHJ A; 3BA9 A; 3UM7 A; 3JD2 A; 1AP5 A; 5B1A C; 5FNV B; 4B3T O; 4EEQ A; 2L35 A; 2YXL A; 4GX0 A; 5LP6 A; 1J5E B; 3C3S A; 1VQM V; 1WPB A; 4IYH A; 4QE9 A; 4DV6 O; 3IGA C; 2KG7 A; 5JQG B; 5KMG B; 2EBO A; 3K06 A; 2H94 A; 4JI1 O; 5IYC O; 4OX9 O; 2A3Q A; 3I56 V; 1XNR O; 2UXX A; 4JI5 B; 1M4U A; 4RUE A; 3F5W C; 4O4I B; 2UUA O; 1OCR B; 1K8A W; 4I50 B; 4WFB V; 2FB5 A; 4X64 B; 5LMN O; 4PJ0 Z; 4LBE C; 5KHI A; 2EZO A; 4TQF A; 4B3R O; 3F5T A; 2B1I A; 5B3S C; 1XEQ A; 2AW9 A; 3CYO A; 1YZB A; 3DXR B; 4TUY A; 1G8M A; 1YXB A; 2VS0 A; 1SQP H; 4O4L A; 5LA6 B; 3CCQ V; 1F7Y A; 3K5N A; 4GT1 A; 4MVS A; 4UV8 A; 4I7Z B; 1VMG A; 2B1G A; 4MVQ A; 4JYA B; 1J5E O; 2ILM A; 2JJ1 G; 5GON B; 4BAY A; 3UO3 A; 2LQT A; 4UB6 Z; 3CCM V; 4BW9 A; 1BQ0 A; 1EBO A; 4P2Z A; 4ZKI A; 3LSS A; 3RYF A; 3D3Q A; 3ZJZ A; 1GM9 A; 5LL6 Y; 1S5H C; 2D3O W; 4KUM A; 2BE3 A; 2JJ2 G; 3JCZ A; 2GUZ B; 4FFB A; 4JI5 O; 1O9G A; 2JDI G; 3ABM C; 1H38 A; 2CDY A; 4PDM A; 1X4T A; 4TV9 A; 4RQF A; 4X64 O; 1GAX A; 4BW5 A; 2NLJ C; 5CA0 B; 1M90 W; 1EN4 A; 1EZV H; 2W6I G; 1JMK C; 1H2S B; 1Q82 W; 4GX1 A; 5AG2 A; 4HYO A; 3QVN A; 4GX2 A; 5JVD B; 3U10 A; 3JD4 A; 4FJC C; 5B1B C; 4JYB A; 4DV0 B; 2ITD C; 4JAU A; 1XBL A; 3UO2 A; 1VEW A; 2Q7G A; 3LNN A; 2BOC C; 1VQ4 V; 2EIM C; 3B40 A; 5KUK A; 4UVC A; 2WWW A; 3ML0 A; 2ATK C; 2V4D A; 3X2Q B; 2VWJ A; 1SES A; 4JYA O; 2BSK B; 4DR5 B; 3OE7 G; 2Y0P A; 4DUY O; 4I9Q A; 3LUT B; 4MVU A; 1SF9 A; 2QJ1 A; 4N21 A; 2H3O A; 2YSU B; 2IJH A; 4DR3 B; 3TK1 A; 4L87 A; 2EIN B; 4DR2 O; 3CCS V; 4NXN B; 2YDE A; 1JCH A; 1IBK B; 1Y76 B; 2IH1 C; 4DUZ B; 4B3S B; 5JJE B; 1AR5 A; 1VQ7 V; 1H2G A; 3OUF A; 4X20 B; 1Q90 D; 3C90 A; 2LO1 A; 4R8C A; 3FX7 A; 3TJT A; 1SQG A; 4ZIB A; 5JH7 A; 1DGS A; 4B3M B; 3ZRS A; 1YJW V; 4DXW A; 1YTF B; 1NJI W; 2W0X A; 2EIK B; 1Y6X A; 4RAI A; 1PL0 A; 4DV0 O; 2Q67 A; 1E1Q G; 5IJ0 B; 4MTX A; 3G71 V; 4UVA A; 4DV4 B; 2F4V B; 4YHH B; 4J11 A; 3A8T A; 3I55 V; 2KB1 A; 4JI4 B; 3HKB B; 2LGW A; 3DC6 A; 1SA0 B; 1ENV A; 4FM1 A; 1BSM A; 3JAW A; 1WP8 A; 4L8J A; 2CAZ C; 1L0N H; 4F4L A; 2DYR B; 4AI8 A; 1Q7Y W; 2H8P C; 1RFY A; 3JAK B; 1E1R G; 3E86 A; 1MNG A; 1S5J A; 4DR5 O; 2EIJ C; 3N2K A; 5L3B A; 4N23 A; 4WBN B; 2CH7 B; 3SYP A; 4I5S A; 4DR3 O; 2KQX A; 5IJ9 B; 2IU0 A; 4UXN A; 4NXN O; 1BCC H; 3AG4 C; 2PI4 A; 2Q9L A; 1IBK O; 4DUZ O; 4B3S O; 2WLI A; 3BCC H; 5E79 Z; 5EIB C; 1Y4M A; 4J7K A; 4MSW C; 1FFT B; 1FJG O; 3FYE B; 1XQ8 A; 4J7J A; 1JPX A; 4JI7 B; 3M7M X; 1TVK B; 4TV8 B; 4B3M O; 2Q69 A; 1AR1 B; 1RSO B; 4LF7 B; 2P06 A; 1NH2 D; 2XAJ A; 3STZ C; 4DV4 O; 2F4V O; 5FL7 G; 4YHH O; 2QTS A; 4DR7 B; 4X65 B; 2IJJ A; 1K97 A; 1TUE B; 4X8A A; 1Q3E A; 2VQE B; 4JI4 O; 1B04 A; 3OAA G; 3K5M A; 1YF2 A; 3E83 A; 1K3E A; 2AZ0 A; 4P9P A; 2PTM A; 3G6B A; 2ZT9 B; 3DSQ A; 3A0R A; 3CSX A; 3O9O A; 3K0D A; 3JAR B; 2Q73 A; 1F51 A; 3SPC A; 3OR7 C; 3EHB B; 2JEU A; 3JAL B; 2UUC B; 2CTP A; 2GBO A; 3JAT B; 2ZNI A; 1QVF U; 1ZWI C; 4CH3 A; 4H37 A; 1GN6 A; 2XAH A; 1KQS U; 1XRE A; 2UXC B; 1FD9 A; 5LYJ A; 4EFE A; 3J7A U; 3E8H A; 2Q7E A; 4DV7 B; 4MW3 A; 3B77 A; 1SQF A; 4JI7 O; 4YJ2 B; 2XTA A; 4PI2 A; 2GSM B; 2JGD A; 4RQE A; 3STL C; 4LF7 O; 5B1B B; 4J9Y B; 2YEV B; 1SRY A; 5HFM A; 2L6L A; 1N0N A; 2QWO B; 5JQG A; 3I5D A; 1VQN V; 1N0J A; 5KMG A; 2EIM B; 3JSN A; 1FKA O; 1OCC C; 4I9W A; 4DR7 O; 4X65 O; 3K5O A; 1R6T A; 2QTO A; 2VQE O; 4FIP C; 4O4I A; 4B7E A; 2Y48 A; 3ZMU A; 1BHB A; 3ZED A; 1EZJ A; 5CB4 A; 1XIL A; 3W7U A; 2K9P A; 4B08 A; 1VF5 B; 3ZX6 A; 3UQ8 A; 1SC5 B; 1FXK C; 2PYL A; 2UUC O; 4JI2 B; 4X88 A; 1KKC A; 1JQ0 A; 2WLL B; 3ZHQ A; 1G6U A; 1WAZ A; 2P7T C; 4UCT A; 3DXR A; 2LJ2 A; 3HKD B; 4IL6 Z; 3WU2 Z; 3ICX A; 3SYQ A; 4CH6 A; 2E75 B; 2UXC O; 5LA6 A; 1R6N A; 3CCL V; 4H44 B; 4DV7 O; 1W2B U; 4UCV A; 5GON A; 1GO3 F; 1PD3 A; 2M6Y A; 4IYI A; 1URF A; 4ICG A; 2YIC A; 4YJ3 B; 1Q86 W; 1D5N A; 4B7K A; 3SPH A; 1JJ2 U; 3K9S A; 4WFG A; 2XND G; 3ETQ A; 3EXA A; 2GUZ A; 3ZRW B; 5LGT A; 1BMF G; 1K4C C; 3K0G A; 3CXC U; 3T2M A; 3GB7 C; 4G28 B; 2CE4 A; 5CA1 A; 1MZF A; 4X66 B; 4PA7 A; 4GYC B; 3ZHS A; 3CCE V; 3FKS G; 5LOV B; 2MK3 A; 2F1M A; 5B1N A; 4LP8 A; 1IXM A; 3AK3 A; 5CA0 A; 2Y0I A; 3AK1 A; 3L72 H; 3LDE A; 4JI2 O; 1L0L H; 1S76 D; 3S3X A; 5JVD A; 1GM8 A; 3QG5 A; 3ZMS A; 1MA1 A; 4JI6 B; 4OPH A; 5GTH Z; 1PV0 A; 2YXY A; 4UCS A; 1OJH A; 1DF4 A; 4IIJ A; 2JIZ G; 3N2G B; 3RYC B; 3EVK A; 1PKX A; 3E2E A; 1VIB A; 2ZNJ A; 3P30 A; 1AJQ A; 3HB3 B; 2BSK A; 4PHZ A; 1R3K C; 4DO2 A; 1BS3 A; 4Z2W A; 5EYP A; 1PNK A; 1FXH A; 2HP8 A; 3OEE G; 3LSQ A; 1V55 C; 1SZX A; 2A0L A; 3FAV B; 1MSD A; 5BY1 A; 1VQK V; 2LW7 A; 4U3J B; 2IM9 A; 1GK9 A; 2Q68 A; 1D5A A; 3R65 A; 1KU9 A; 4X66 O; 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