3RT8A

Chlorowillardiine bound to the ligand binding domain of glua3
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanisms of Modal Activation of GluA3 Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 3
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rt8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rt8A02
2R71A 3O6HA 1MPDA 3MBPA 3UN6A 2NXOA 3C31A 3GLBA 1R6ZA 4EF2A 1H76A 3PV0E 4LUBA 2I3VA 4EQBA 3SDFA 3UIFA 1B1HA 3K6XA 3FVKA 5FTIA 4N13A 1MH3A 2QL3A 4X1BA 1MPCA 1LAHE 3DLNA 3PUVE 3V5AA 4R74A 3TYHA 1OMPA 4GLIA 2F7CA 1GVCA 4LONB 2ZNUA 2RC9A 1QULA 2HZKA 2B3BA 3VXBA 4OWDA 1PEBA 3OO6A 1YAEA 1MQGA 3RUMA 2Q8JA 3KJ7A 3KSJA 2OWSA 1TFDA 1LCTA 1A40A 2Y84A 1O64A 1R9LA 3IB1A 3H6UA 5AA4A 3U1OA 4QFPA 3W15C 1BTJA 3T22A 1S7YA 4DLDA 3HHGA 4OXVA 2DWJA 1YTVA 4PP0A 1SQYA 4N07A 4LP2B 2P0SA 3Q28A 2REGA 4UACA 2ZNSA 1N7WA 1FQCA 4QRZA 1FTJA 3PD9A 4KHZE 3E9XA 1SBPA 3Q27A 2O68A 4ELQA 2W7YA 2GHAA 3EHTA 4FAJA 1QUIA 5AA2B 4MF3A 1OLAA 3O9PA 5L9OA 2I4BA 4DXUA 1AIVA 4GQOA 4O3BA 2AIXA 4PFWA 4NEDA 1B32A 4GXSB 1B40A 3FZVA 4PE5B 4RA1A 5IKBA 2DYXA 3ILTB 1ZBMA 1FW0A 4YMBA 5EYFA 1TFAA 4F1VA 3TODA 4KYDA 4OVJA 1SYHA 1B0HA 4TLLB 5CC2A 2HCAA 4BLAA 3Q26A 4GL8A 1M5EA 1JEUA 2XXRA 4RNSA 4ONYA 2F97A 4H1XA 5CBRA 2Z22A 1D9YA 1MY3A 1JW5A 3KN7A 4IO3A 1MY0A 3N26A 1FTOA 3EF7A 1Q35A 1Y4CA 1LFHA 2M8CA 3MVXA 3R7XA 2DQVA 2E0SA 2HXWA 4RPNA 4OEUA 1JNFA 4IGRA 3SEXA 2XX9A 1A54A 3SEUA 1PBQA 1WODA 4HTGA 1SD3A 3DM0A 5I84A 1EZPA 4YKKA 2F7BA 3FJGA 4ND9A 3KZGA 1UTBA 3FV2A 1DMBA 1FTLA 3MAMA 4DCYA 2LAOA 1R1NA 3O66A 5AA2D 3M3LA 1JW4A 2G93A 3I3VA 4FATA 2H5YA 2A5TA 4IB2A 3O2AA 5I59B 1BKAA 2R6GE 1BLFA 4EXKA 1ZIUA 4ZEDA 3IJXB 2XXTA 1A8FA 4IY6A 3TQWA 1MRPA 4GVOA 4NF8A 3CG1A 4GXAA 1I69A 5DEXB 4HCWA 1B3FA 1H45A 4G4PA 4IO6A 3TTNA 3PPPA 4U22A 4YB6A 1ELJA 3FV1A 1MM6A 3SESA 2I6EA 3U8QA 4HCYA 2V84A 4JB7A 5ITPA 3QYTA 4OENA 3MZBA 2Q89A 3C35A 5B7DA 3PMVA 1QVSA 4IY5A 1BP5A 3T96B 4L17A 1EU8A 2QSXA 3PGFA 2CMOA 3LSXA 4C1TA 4U1OA 2ONSA 2DE4A 2KLFA 4EXLA 5H8NB 1USYH 3PPRA 5ITOA 4O3AA 4GD5A 4JXIA 4LZ5A 5DVJA 1Y3QA 3EHUA 3N6TA 3S9EA 2QPQA 3SEYA 3HN0A 4NWDA 5I58A 4G8HA 4DZ1A 2XXXA 3UP9A 1BIYA 3JV9A 1IITA 1B51A 4I62A 4TLMB 4I9DA 4HS7A 3C32A 2F5XA 2RC8A 3GBAA 3ODBA 2OWTA 3BBRA 3RY3A 3I6VA 4JWYA 1IUDA 5DTBA 1SI1A 4IO7A 1S9TA 5CMCA 4U2RA 4RYAA 4WKMA 1MY2A 5AA1A 2V93A 4FJPA 3PD8A 2XXHA 3IORA 1LSTA 4Q8RA 2XXPA 2X7PA 2THIA 3FIRA 2HZLA 4YKIA 5ICTA 1NFTA 2RF1A 3IO4A 3JZJA 2DXRA 3K6UA 1IXHA 1A7LA 4R72A 1AOVA 2ESNA 1HSLA 1WDNA 3IAZA 3KGCA 4F18A 3VLWA 4PFYA 4JWXA 4ZEIA 3S9NC 2UVGA 5FHOA 4C1UA 1UQWA 3USDA 4EF1A 4PQJA 4F19A 4XKNA 1SW5A 3U92A 3FVGA 2VP1A 3VVDA 5F1QA 1NNFA 1US4A 2NOOA 1JETA 2XXYA 5I57B 4XIGQ 1D4NA 4QFOA 4AB5A 4LATA 3QUFA 5KCJB 3SEVA 3GXAA 5I2KB 1M5BA 3ECRA 4RJZA 3LSFB 4G68B 1LCFA 2F6PA 1UIVA 3G3GA 5I2NB 3A3UA 3OO9A 1PBPA 3VVFA 4OTEA 3KG2A 1LFIA 1VFEA 3PMXA 1M5DA 1ANFA 4ESWA 1MDP1 3OXNA 3DP8A 3TAJA 1EZOA 3RNNA 1MM7A 4LQ5A 4F31B 3LUYA 1T0KA 4I1DA 3HSTA 4ZZEA 4NF4A 1LAXA 4TQUQ 2V3TA 2I48A 5TP9B 1VFDA 2ZYNA 2DVCA 3FUZA 3TZAA 4KR5A 4QSDA 2I0BA 3V83A 1D3KA 3LBSA 3U72A 2R9JA 1FTKA 1NL5A 3KEIA 4F1YA 1MXUA 3K4UA 4JSDA 1JQFA 5ISUA 4F2QA 4THIA 4QF9A 1US5A 2PYYA 2F35A 3TFLA 3FJMA 1UTHA 3T93B 1I6BA 4DDDA 3O29A 1H3DA 3VXCA 3TTRA 4Z7EA 4GWOA 2OZZA 3DP4A 4NF5A 5ICQA 4ESXA 4BDQA 2Z23A 3OELA 1FQEA 5JTYB 3TMGA 4GF8A 4BDRA 4XKPA 1QKAA 1Y3PA 4RK9A 4PETA 1NNKA 1A8EA 3UGWA 4BDOA 4H65A 3DP6A 1LGBC 4X1DA 5I59A 3B6QA 1XOCA 2O69A 2F78A 1IQ7A 1MY4A 3O6IA 3FXUA 2D5WA 2HFBA 4F29A 1LB8A 3RTWB 5FHNA 2A5SA 3H03A 4JDFA 1Y9UA 4ELRA 2UYFA 3W9WA 1Q1KA 1LAFE 1ZU0A 3IX1A 2ALUA 3ILUB 4F3BA 1XVXA 3LSWA 2FYIA 5HPQA 4OETA 1MXZA 2HAVA 2IEEA 2PBWA 3SKPA 5L9MA 1FQDA 3MW0A 4QFLA 2RCAA 3FD3A 3G3FA 5L9SA 1N7XA 3N5LA 1B4HA 2XXVA 2AYSA 4Q0CA 2H4IA 1SVXB 4POXA 1EZ9A 4KYEA 1NH7A 3QSLA 1B3GA 5I56A 4LZ8A 3MPKA 3U93A 5AE4A 3G3HA 2F34A 4EQ9A 1LBCA 2DE3A 5L8DA 3HO7A 2ANJA 3C33A 2ZYKA 4LVQA 4DIGA 5A5XB 2XXUA 5AA4B 4P0GA 1N3WA 2XXWA 3B6WA 3LR1A 3E13X 1CB6A 4MLQA 3S9LC 4P11A 1SW1A 1B7HA 4DE8A 1OVBA 3CSBA 3K00A 5EHSA 1B0LA 1B05A 4NF6A 3OO7A 3TCGA 2ZYMA 4EDPA 1MG1A 1MS7A 4MFIA 4H8JA 1OQHA 1GTKA 2Q2AA 4F1UA 4EUOA 3L6HA 4OFOA 4U4XA 4C0RA 3HV1A 2G29A 1MQJA 3ZKLA 4G2ZA 4OFJA 3SERA 1VR5A 3K6VA 4M1VA 2OBGA 1Y4TA 3E3KA 2I49A 1LAGE 1IXIA 3N6UA 5H8QA 3FATA 4QFKA 5KDTA 3RT6B 2XXQA 3K02A 4EQ7A 3I5OA 3PU5A 2Q9TA 5H8FA 2REJA 5CM6A 4R9FA 1P99A 3QUJA 1OIBA 3HCQA 4JWOA 4R9GA 2DWIA 3BFTA 3HPIA 3MZ1A 1URGA 1S50A 4DXCA 1ZTYA 3KFMA 5LOMA 2ZNTA 5K2XA 5I57A 5TPAB 2V3UA 3D4GA 2DE2A 3KJTA 3FVNA 1O63A 2F36A 3MZ9A 5ELVA 5KCJA 1RKMA 5I2KA 1MY1A 2QS2A 4G68C 1POTA 1XHYA 5IAIA 1MXWA 1ZMGA 2I58A 1UTBB 1GGGA 4ZEFA 3T9VA 1AMFA 4LZ7A 1GR2A 3EQ1A 1CE2A 2A5TB 5H8HA 3S9MC 2UVIA 4F2OA 3C34A 4FECA 3H3GA 3GBBA 1N04A 3VDFA 2DWHA 1B58A 2VGQA 3VV5A 4HW8A 3EN3A 4BDMA 3ZS6A 2DXYA 2ZYOA 2B65A 2UVJA 3PPNA 4R75A 3O6GA 3PUYE 2DWAA 4BDNA 4NF8B 3VLVA 3RN8A 4H8IA 1MPBA 4ZS9A 3T9XB 5F7VA 1URDA 4KI0E 5TP9A 4DXBA 1A99A 4X48A 4P0IA 2X26A 1A55A 2HAUA 3OO8A 3CI8A 1OQGA 3K0VA 2QJEA 3K1NA 2O84X 1NKXA 4KQPA 4E0XA 3G3IA 1JVYA 4Q30B 2F6GA 4IO5A 3IB0A 4WEPA 1TWYA 3R26A 2O6AA 1AH5A 1ZJLA 2PT2A 4Z0IA 3CR9A 3MP1A 1B3LA 3QAXA 3IJOB 4H5GA 1SW2A 3MVYA 3C9HA 2PVUA 3O97A 3MQ9A 1IIWA 3OENA 4ZEBA 1WVJA 3G7WA 2Y7PA 5HBCA 3PUWE 4YU0A 1MQIA 4FEDA 4F3GA 3CSGA 4M4GA 4PFUA 2NWJA 4F3SA 1R9QA 4FEBA 3PPOA 1JW1A 1B7UA 3C36A 1NNPA 3TQLA 3V8XB 4BDLA 5CBSA 3WAFA 1NNTA 5I58B 5K2YA 1ATGA 3CFXA 5AA2A 1PDAA 3CRBA 2ZMBA 2OJTA 4FE8A 1DPPA 1OLCA 1QJMA 3M3FA 3MUQA 2PT1A 1SYIA 4LA9A 2PX1A 4X9TA 3TTLA 1B5HA 4OQOA 1SW4A 3JYRA 3F11A 2F7AA 3CIJA 4XXUA 1QUJA 5AA3A 4YZZA 4QHQA 4OESA 2YJPA 2Z8DA 3MC2A 3U94A 4MBPA 3S2VA 4YB7A 3FVOA 4U1ZA 4R6YA 5DYHA 4ZDMA 3OSRA 4MLVA 2Z8EA 4R2BA 1XT8A 3QXMA 2DVZA 4YKPA 2Q2CA 2O51A 3FASA 3EHSA 1NMUA 3DELB 3SEWA 3THIA 3PUZE 2QMXA 4F39A 3OD7A 2NUVA 2YPNA 1DTZA 2Z8FA 4U23A 4NTLA 3WAEA 1PB8A 3R6UA 1MDQA 1PB7A 3ZSFA 1POY1 1B4ZA 5H8SA 4E0WA 1IXGA 4Q5TA 2OCUA 5KZTA 2VOZA 2X7QA 2H9BA 5A5XA 3T66A 3H6TA 2ONRA 4I8CA 5CI5A 2O1LA 1Y1ZA 2Q88A 4OZ9A 1H44A 1IEJA 4U4SA 4XKQA 1N0TA 2IA4A 1N3XA 4R73A 3QIMA 1FCKA 2VHAA 1PC3A 1D9VA 2RC7A 1B46A 1B3HA 4ZE8A 4IO4A 3ONMA 1DPEA 3B6TA 3HHFA 2D3IA 3SETA 3MP8A 3Q25A 5DEXA 1JEVA 4TOZA 4ECFA 3G3KA 4KCDA 4YAHX 1DTGA 4POWA 3M3KA 2YLNA 4NF4B 1P1QA 1YCJA 5B70A 3P7IA 2Y7IA 2XX8A 5DT6A 2I3WA 2P2AA 3MP6A 3FGSA 2H25A 1FQAA 5CMKA 3CVGA 2XXIA 1B5IA 3CFZA 3RGYA 3Q29A 1M5FA 1DOTA 3O28A 3W9VA 3MWBA 4WEDA 3VVEA 1USYE 2I0CA 2XX7A 3MPLA 3A3CA 2HQ0A 4YB5A 2ONKE 2O7UA 2UYEA 2ABHA 1FTMA 5H8NA 3RPWA 3TELA 4GOTA 4RK2A 1MXYA 3MJNA 3V89B 3TUSA 1TT1A 4F3PA 1XS5A 1HSEA 5TPAA 3TCHA 4R6HA 4UA8A 1UTHB 5JK4A 2OK2A 1B7ZA 1ZLQA 1B5JA 2RCBA 1MQDA 2UXAA 1LB9A 1AL3A 1II5A 5JEIA 1IXCA 4RPOA 1FQFA 4NF5B 3TDJA 2FA7A 1B3EA 3KN8A 4ZE9A 3M8UA 4F22A 4R2FA 1XC1A 3C4MA 3K6WA 3A09A 5BUUA 2AL5A 1B2HA 1M5CA 3OMBA 4GFRA 1HSJA 4K3FA 2QS1A 2QS4A 3FJ7A 4N6PA 1Y20A 3FXRA 4ELPA 1N76A 3T9HB 3KSXA 1EH3A 3H7MA 3UORA 5CMBA 3RQTA 1MXVA 3K1MA 3BKIB 5DVFA 3B7DA 1B1XA 3IOVA 4ELOA 2DSFA 4RY1A 3UK4A 3OOAA 3RT8A 1KWHA 5CMMA 4OYVA 3KOTA 4O3CA 2OLBA 4JBZA 4MH5A 1XVYA 2H98A 4G8NA 4IGTA 5FTHA 3PMWA 1P1WA 2DS9A 3VLUA 4H6DA 2ZXTA 3KN3A 5EHMA 3D4CA 4PFTA 4XTCQ 1UIUA 2NVUB 4AB6A 4GRKA 2V25A 1I6AA 4GIZA 3H4ZA 1LLSA 4AQ4A 4RXLA 4OMBA 3T9UA 4QFNA 4DCXA 3PUXE 3RLFE 3TTMA 2E1SA 3TTKA 1F9BA 3IK6B 2F8DA 2GH9A 4H0WA 1VE4A 4ZZAA 5I56B 2DOJA 1MH4A 3CFLA 2V3QA 2QS3A 4ZECA 1Y1MA 4FORA 3GZGA 1QKBA 4JSOA 1MXXA 1ZKBA 4QSEA 3IB2A 1I6QA 4KFQA 1FQBA 3KBRA 3LSLA 2Y7KA 2XD2A 1H43A 4G68A 4OFLA 3TKDA 4KCCA 1OVTA 1J1NA 3G3JA 4LQ2A 5I2NA 4G8MA 1IZ1A 1N84A 3KOSA 3IR1A 2P1SA 4G77A 4U21A 2VD3A 1DSNA 4NWCA 1LBBA 3ZKKA 4KPTA 2D21A 3VE1B 3H6WA 1JVXA 4NF6B 3K1PA 4NE4A 2HEUA 3OSQA 4YMAA 3K01A 2Y7RA 1Z7NE 1P1UA 3FXQA 2FNCA 1B6HA 5FHMA 2WKYA 4H67A 3RTFB 2CZLA 3TEPA 2O7IA 1TXFA 3EPEA 4OEVA 3H6VA 3AXFA 1Y3NA 3L6GA 1LFGA 4QSCA 5TU0A 4YICA 1B9JA 3OEKA 3IOTA 2VD2A 2QRYA 1SDXA 4IO2A 3MVWA 3OEMA 5H8QB 4GL0A 2B3FA 5KDTB 4FIMA 4OERA 1QUKA 1SI0A 2GHBA 5H8FB 1O7TA 4OHNA 3TPAA 3MVZA 2PMSA 4ZEKA 3K2DA 2GFEA 4H5FA 2H99A 3LC8A 1B52A 3UA8A 1URSA 4XKRA 4WXJA 2GRVA 2O1MA 3QK6A 1MQHA 2AL4A 1VSOA 3E4RA 1GV8A 5JTYA 2I4CA 2XHDA 5J1DA 4ISUA 4NMYA 5HM4B 2UVHA 1QW0A 5M2VA 3VFJA 1RYOA 2RKMA 3N94A 2DP8A 1NH8A 3IOWA 1P1NA 3CG3A 4KYSA 4YKJA 1PB9A 3S4UA 1Z7ME 4KD5A 1L5TA 5CRYA 1RYXA 1YPNA 2Y7WA 4R6KA 5DVIA 2BJJX 2QMWA 2XD3A 1P1OA 5H8HB 3IL1B 3IO6A 3BFUA 2RINA 3IOUA 5BWJA 3H06B 3PPQA 3TCFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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