3RVCA

Effector domain of ns1 from influenza a/pr/8/34 containing a w187a mutation
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
118
structure length
118
Chain Sequence
ASRYLTDMTLEEMSRDWSMLIPKQKVAGPLCIRMDQAIMDKNIILKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSLPGHTAEDVKNAVGVLIGGLEANDNTVRVSETLQRFAW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Non-structural protein 1
publication title Conservation of a crystallographic interface suggests a role for beta-sheet augmentation in influenza virus NS1 multifunctionality.
pubmed doi rcsb
source organism Influenza a virus
molecule tags Protein binding
total genus 32
structure length 118
sequence length 118
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.330 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3rvcA00
4OPAA 3O9SA 2RHKA 3O9TA 3P39A 3P31A 4OPHA 3EE9A 3KWIA 3OA9A 3EE8A 3L4QA 3O9QA 3P38A 3F5TA 3O9UA 3D6RA 2KKZA 3O9RA 3M5RA 3KWGA 3RVCA 2GX9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2V51B 4BVOA 4DV2K 3K0SA 4O0JA 1N6QA 3ISNC 4H4OA 5AQLA 1XI1A 1YIJN 4FWQA 3QMLA 5JICA 1IG8A 3SQ0A 1XUPO 4ID5A 1YHQN 4RW8A 3C6HA 1RTHA 3TAEA 3VN5A 3D45A 2RE2A 4LF7K 1NK0A 5AZJA 3AO3A 4FJHA 3P5JA 4OVLA 4JHDA 2HBJA 2Q36A 2F4VK 4HWIA 4DV6K 5AFUH 4WFNL 4GY2B 3VQ7A 3C6UA 4FYDA 1C0TA 5CE3A 3LZIA 4LF5K 4BG8A 3M8RA 4B3OA 3D7EO 2UUBK 2W6KA 1D5AA 3PY8A 2UU9K 3MX2A 2A5XA 2FBTA 3ZSYA 3DOKA 1NJIO 1TK5A 5KPRA 3CERA 3MCPA 1VQ4N 3EYZA 4FK4A 2X74A 4OPJA 4FWRA 5AZIA 4CJPA 3IUCA 2D1KA 3EZWA 3R8EA 3OTOK 4JI5K 1YITN 3D2FB 3TU5A 1Q7YO 4HTUA 4CEFA 1HJOA 4HUGA 1SL1A 5BPNA 1MA9B 4FLWA 1XC3A 3VENA 1U48A 4OLBA 3KWGA 1GLCG 2FF3B 1EP4A 2O8BB 3SMSA 4OGCA 3VF4A 4DB3A 5KRTA 3J7YP 3HO1A 2O8CA 1IKVA 1DGKN 2YHXA 4ILGB 3LANA 3SV3A 2F7TA 4PKIA 3VQ4A 4Z4HA 1NGGA 3NF6A 1NGAA 2B6AA 1GLBG 4YDUA 1P8ZA 2QW9A 3DLKA 1LAVA 5TKYA 1VQMN 4Z4CA 3VEOA 4B3MK 3C0BA 3M1FA 5BPLA 2P9NB 4BRMA 3HP9A 1HKBA 4FWNA 4N5SA 3IAYA 1KFDA 3ZSVA 4J2BA 3WNHA 4B1YB 4C1NI 3O3GA 1WB9A 1VRTA 3OJSA 4DR6K 3LDNA 3VQ9A 4ELUA 4DUZK 4FM0A 1D8YA 1OVQA 1RTIA 3K5OA 4DTSA 3IFRA 3NGZA 3HK2A 3PLAA 3DAWA 2HSTA 1HLUA 3B8AX 1FKPA 4MFBA 3AA5X 3NAEA 3NMUA 4I9QA 4DS4A 3ULEB 4B9LA 4K41A 5A2QO 4CCHA 1YUWA 4H5TA 5AQJA 1KLNA 4CEAA 1YAGA 2HHUA 3N4PA 3QLHA 3I8DA 4JI0K 2AJQA 3MXMA 4KTQA 4C8OA 2O8FA 4JKCA 4IDHA 4CJFA 4XH5A 3E01A 3O9SA 1TKXA 4JI2K 3V81A 4IG0A 4W5NA 2O8BA 4OPKA 4DMNA 1IKXA 5AQMA 4CEEA 3AVIA 1J5EK 4H0YB 4U67L 3NH0A 1LW0A 3SUNA 2NNWA 1NK9A 3KLFA 3DXMA 4GMJB 2PZSA 5J2NA 5KGWA 4OKJA 2HVIA 4I7FA 2OTJN 4WCEL 1K6YA 4M3XA 1TV6A 4O5BA 3OYKA 1JCGA 3T1HK 3QETA 1LWEA 1W9HA 3FZKA 3H1QA 4OX9K 4C1NK 2VYPA 3KK3A 2XY5A 1YF5L 5HBMA 4K25A 3CCSN 4BRHA 1WSIA 4DTMA 1KFSA 3C6AA 3OYJA 2E6LA 2VGMA 4ZHRA 1HX1A 3SQ1A 2YCHA 1NNEA 3AVCA 3KD5E 2PBDA 4FPAA 2NUBA 1W7AA 3MWTA 4HTLA 1BISA 2NRTA 3VQ5A 4Z4FA 2YHWA 1OKJA 3NE6A 5GAGP 4KH6A 2P9KB 1ZBLA 2JWKA 1VSKA 1NKEA 4NXNK 2VGNA 3L4QA 5HOOA 5F0XA 4J2AA 1EO1A 3CHWA 4IKFA 3AO4A 4ISGA 5E26A 3CM5A 3PX4A 3KK1A 3MXIA 2Z1JA 4ID1A 4BC2A 3RMDA 4LC9B 3ZSOA 3NCIA 2P5OA 3LDOA 4PUOA 3WXMB 3R1XA 4CD1A 2KFNA 1U6ZA 3CIPA 3K2PA 3QEWA 1FJGK 1EWQA 2FSJA 5JS1A 4UQGA 2D0AA 4O44A 1YVNA 1Q9YA 3WXJA 3NH2A 3H3OB 4H5NA 3KD1E 3UKUA 4CERA 4GVEA 2FXUA 4JKFA 2W41A 3RVCA 5AQVA 4FLZA 1Y97A 3VQCA 4WQ4C 3TANA 2VG7A 3OYGA 3BF1A 4FK0A 4GV3A 4AQYK 3LZJA 3AO1A 1RDCA 2FF6A 4PHTX 4FW2A 4AHVA 3EKUA 2YNGA 4IOXA 3Q7CA 2G8UA 1HMVA 5DM7L 4IJNA 5BPMA 4CJKA 1ILYA 4AHCA 1NK4A 3AVAA 1O1WA 4N56A 3KVGA 4WQ5C 1T03A 4CESA 3NVMA 3V9XA 2Q0RA 4M3RA 3V1QA 3SV4A 5E84A 3A5NC 5ADXA 1S72N 4F4KA 4KHPK 4DU1A 4AH9A 3QNOA 4CF1A 1RBTA 4JI3K 4CJRA 1NK7A 1NMDA 3HI0A 5M1FA 1VQKN 2G8VA 1GLAG 2IOCA 5GADP 2EX3A 3TPQA 2I7PA 4Z0UA 4DFPA 3P31A 1NOYA 4JD2A 4E7LA 4BACA 3O8MA 1VSLA 3TAMA 4V19S 3EO3A 2QK9A 2AP1A 3P38A 1LWFA 2IVNA 1V4TA 1WAJA 1ZYQA 5MLCQ 4MO4A 2HHHK 4LH4A 3PX0A 1DLOA 2VCPA 4QOZB 1WAFA 2IIRA 4CJTA 1GLDG 1NLVA 2WONA 1HKGA 5EVZA 4IOCL 4KHSA 1G99A 4DTOA 1RDUA 1VSJA 1HQUA 1BO5O 4A5BA 1REVA 4I2PA 3F5TA 3ID8A 2W42A 4LH5A 3HSCA 4IOAL 4BQLA 1TL1A 3CD6N 1HRHA 4KTZA 5DK5A 2Q1NA 2ZWHA 4Y1CA 1WSJA 3E1YA 1JLFA 1GLEG 3DLEA 3U9ZA 4B3TK 2G8WA 5CZ2A 4Z4EA 5EXWA 3WUHA 1VQ9N 2DFFA 5E41A 2RHKA 3L3UA 3CF5L 1KRPA 3O4WA 4PY5A 4YOTA 3MEEA 1GLLO 4QS8A 1X3NA 4CJ5A 3KKRA 1VSHA 5BRHA 3LP0A 1CZBA 3VMFB 4ISFA 3DXKA 1T6CA 4K42A 3I55N 1XHXA 1ZXOA 4NCGA 3SAGA 4JRPA 4B1ZA 1QSLA 1N34K 4JKEA 1GOAA 2ZF5O 1H1VA 4BR5A 3OA9A 3ZT1A 2KHOA 3DI6A 3WNEA 1NBWA 1T6DA 1WN7A 1EXQA 4FOIA 4CJ4A 1ATSA 4H4MA 1GLJO 3MWPA 2G8FA 4HCBA 1M90O 2IC3A 4G9ZA 4CEQA 1TUYA 3RMCA 2KQ2A 3V9UA 4GV9A 4JS5A 4CJEA 1NKCA 4BC5A 1BWFO 2HHSA 3KWIA 5AQOA 1DEJA 4E89A 3JAMO 4H0VB 5HRPA 4DV5K 2QWPA 4FO0A 3WNGA 2BE2A 2YKMA 3W3DA 4IJAA 3CCUN 1E4FT 3AVBA 1N8RO 1LAWA 4J2DA 2P1JA 1RGIA 5LJWA 1KLMA 3CC7N 3H1VX 4AHRA 5AQYA 3OJUA 3O3HA 4OKKA 3O5BA 4LSLA 3WEEA 3M3ZA 3SK3A 1CZ9A 3C65A 5CHIA 1A5VA 4F3TA 2IGIA 3PIPL 1U2VB 1BIUA 1ITGA 3T7ZA 1JCEA 2OPRA 4DCHA 4CJQA 5DM6L 3OVNA 5AQIA 3E9LA 4KO0A 2XHBA 3HOSA 4B1WB 3GG4A 3TTCA 4KKOA 2A6AA 4FWKA 3SPZA 1JLAA 4FJLA 3VQBA 4RG8A 4CJWA 4M3WA 1Z25A 3NF7A 4LY7A 3MK6A 4CIGA 3NGYA 2F9TA 4NLBA 1QTMA 4JI7K 4JHDB 3CPWM 4M3YA 4FW1A 3ZT0A 3G71N 2Z1GA 1D4XA 2UYTA 2YJEA 1WBDA 2A3ZA 3I0RA 2BGGA 3OBYA 2D0CA 4A61A 1NGDA 2OA8A 3CM6A 5HL7L 4JKHA 4BRLA 4OKEA 3L2WA 2FBYA 4PQUA 1KD1O 1RT3A 1SKWA 4H0XB 3N4QA 4JN4A 1Z6RA 1GLFO 1L5UA 3T1YK 1CZAN 4DQIA 3QBXA 1I94K 4YOVA 3VQEA 3O3FA 5HROA 2HNDA 2HHXA 3V1OA 1RBUA 1W2BM 3O1WA 5SWMA 1RFQA 3UIQA 1XC9A 2BH1A 1HUXA 1J54A 3NDKA 2GWJA 3OHRA 2KZMA 4NB4A 2O8CB 1Q81O 3HBTA 3O9RA 3J8AA 4KRFA 3VA0A 1EX4A 1R59O 5TKWA 4B1XB 3MN9A 4FJJA 3D2EA 1TVRA 3OYCA 2CGKA 1BGXT 3QDKA 4E7IA 2UXBK 2VQEK 1F21A 2HF3A 4W5OA 3JXUA 3O9TA 4IDKA 5CYQA 3H45C 4CFCA 4DQQA 5B8HA 5C42A 3ENHA 3HPOA 1M1KO 2BDPA 2YHBA 4O5FA 3DMJA 4C8LA 4DTJA 4BREA 1RTDA 5AQTA 4JI8K 1MWKA 2WTUA 2ZQBA 4JKGA 4ZTFA 1YVUA 3P39A 3WNFA 4YFUA 2JWLA 4DQPA 4IFYA 5KRSA 2KW4A 2YNIA 1B9FA 1JXEA 5BN8A 3LPUA 4G1QA 3NH1A 5LMUK 3A2FA 4E7JA 1K9MO 1W97L 4WQ4A 4LFCK 4N76A 4I2QA 3LM9A 1RCHA 4OPAA 3AAPA 3P4IA 3H08A 2E2OA 3FGUA 4W5QA 4CBXA 5H1SQ 4BR7A 4BRDA 1JLQA 2O8DA 4E7KA 3KJVA 4XH4A 1VK0A 3NFAA 3BF3A 3LPTA 4FWLA 3THWA 2HNYA 2O8FB 1ATNA 4JKBA 5IWAK 1SL0A 4IG3A 3K59A 4AM7A 3NGIA 1S5JA 4FVMA 3K5LA 4WQ5A 4DTNA 4FZXC 2UUCK 4FJGA 5M1PA 3CJ7A 4YORA 3DXMB 1VSDA 4CJVA 1OH6A 1KAXA 4CECA 3JS6A 3DLLL 1E4GT 5AQSA 4CZLA 1TYQA 2E6MA 2NRHA 5AJ3K 1RDDA 1BCOA 4DQRA 3AVJA 1TKDA 4CF9A 1VRUA 5F1XA 1K8AO 4PKGA 4CHOA 2E2NA 4FJNA 3P1GA 2V52B 3GL1A 1YTUA 3MN5A 4B9SA 3AVHA 3L4IA 3ENOA 5AFUA 4A57A 4JS4A 4ELTA 1BA0A 1ZC6A 3CCJN 4O0IA 1RDAA 4BG9A 4I6MA 2WUSA 3UE5A 2DFEA 3MXJA 3RWUA 3HL8A 3S3NA 2CH6A 3A5MC 3ZETA 1BI4A 5HRSA 4IO8A 1VQ8N 4DSIA 1BA1A 1MU2A 4DLGA 4X64K 2NRRA 3LWLA 1L3SA 3DLRA 3CCEN 2P51A 3RMBA 3TI0A 3C94A 3LDPA 4JYAK 1JCFA 1Q9XA 1X9WA 3RR8A 2WC9A 3CCVN 5EU7A 1KAYA 4PL7A 1OH5A 4B3SK 1GOCA 4KV8A 1VSMA 3THYB 4MLHA 3IKMA 1BL3A 1HNVA 4CHPA 4DTPA 3UKUB 4A59A 4HUEA 4Z4IA 1RT6A 4N41A 3THXA 1NJXA 4M45A 4Z4GA 5F2RA 3IDHA 1JLCA 1VQ6N 5BR9A 5GINA 4BRAA 1KC8O 2Q3SA 3CMEN 4FWMA 1QQNA 3HTVA 2IDOA 1RT2A 3KLGA 5AQPA 4ICLA 2G8KA 3HPHA 3OYAA 4FM2A 4B9NA 3DRSA 4JK8A 4KAZA 4E7HA 4UY8O 4DR3K 3RSEA 3TAGA 2Q2RA 2CGJA 3KIOA 3TSUA 1X1PA 3AVGA 2GEMA 4X65K 3WXIA 4FWPA 4O8KA 3QESA 2GTDA 1XMOK 3AVFA 3SYZA 4BY9C 3K9KA 1TUUA 4TSXA 1YJNN 3A8YA 3TAFA 2HBLA 5JLHA 3K58A 1IBLK 1HPZA 4O55A 3KLEA 3VEYA 1CXUA 1X3MA 1QVFM 3DYAA 1ZBFA 2KLAA 5FRNA 3CI5A 2FSKA 1CXQA 4CJ3A 1NGHA 3TSPA 3QICA 1O13A 3CJ1A 1QQCA 1KVBA 1LV5A 4JD2B 2E2QA 2HHQA 2Q97A 4FLTA 3AARA 2ATQA 1RT1A 4KBOA 2Q31A 4CF0A 3THYA 5I42A 2IAJA 3VETA 4IEEA 4KTWA 3QO9A 2V7ZA 4JK9A 4EHTA 4C23A 1FXXA 1WOQA 2CH5A 2X6SA 4BROA 3L2RA 1NK8A 2UXDK 5HP1A 4IZ9A 3FZHA 4FJKA 4M63C 5AQWA 4CBWA 2GX9A 4DR5K 2OZMA 4DKWA 4GVMA 1S1WA 4EFHA 2F8SA 5EX5A 3S3MA 4FLYA 1T05A 4LF4K 4DF8A 3G4SN 4NCBA 4B8CA 3M8SA 4E1JA 3WXLA 1HNIA 1XNQK 1QZ5A 3OYFA 4DV7K 3LL3A 1BUPA 3ASMA 4DSFA 3VGMA 1ASUA 3ZX0A 3FE1A 3VEWA 1SS6A 5DMRA 3UB5A 4NYNA 2KZZA 1LW2A 3CPEA 3VTIA 3CFOA 1Q8IA 1BQMA 3OYMA 3HSTB 2YNFA 4BDZA 3BGRA 4FOEA 5JVGL 1J6ZA 3WT0A 3O4NA 3DLGA 2RF2A 2W40A 3DXKB 2A1RA 2JGUA 3GOIA 3HOTA 1YXQA 2QKBA 3M5RA 4DQSA 4CGGA 1RT5A 2LSNA 4JI1K 1RNHA 5J1EA 3ITHA 4BDPA 2YV0X 3IRXA 2F9WA 1Y64A 4Y1DA 1T3VA 2ZE2A 3BEXA 3QEVA 3MAQA 1HYZA 3ZX3A 3TR8A 3L0QA 4YOWA 3DWLA 4DQ8A 4CJ7A 1JL2A 2VQFK 1U04A 3TTDA 3HM9A 1TKTA 4FVUA 3VPZA 1JJ2M 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4OPA A;  3O9S A;  2RHK A;  3O9T A;  3P39 A;  3P31 A;  4OPH A;  3EE9 A;  3KWI A;  3OA9 A;  3EE8 A;  3L4Q A;  3O9Q A;  3P38 A;  3F5T A;  3O9U A;  3D6R A;  2KKZ A;  3O9R A;  3M5R A;  3KWG A;  3RVC A;  2GX9 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2V51 B;  4BVO A;  4DV2 K;  3K0S A;  4O0J A;  1N6Q A;  3ISN C;  4H4O A;  5AQL A;  1XI1 A;  1YIJ N;  4FWQ A;  3QML A;  5JIC A;  1IG8 A;  3SQ0 A;  1XUP O;  4ID5 A;  1YHQ N;  4RW8 A;  3C6H A;  1RTH A;  3TAE A;  3VN5 A;  3D45 A;  2RE2 A;  4LF7 K;  1NK0 A;  5AZJ A;  3AO3 A;  4FJH A;  3P5J A;  4OVL A;  4JHD A;  2HBJ A;  2Q36 A;  2F4V K;  4HWI A;  4DV6 K;  5AFU H;  4WFN L;  4GY2 B;  3VQ7 A;  3C6U A;  4FYD A;  1C0T A;  5CE3 A;  3LZI A;  4LF5 K;  4BG8 A;  3M8R A;  4B3O A;  3D7E O;  2UUB K;  2W6K A;  1D5A A;  3PY8 A;  2UU9 K;  3MX2 A;  2A5X A;  2FBT A;  3ZSY A;  3DOK A;  1NJI O;  1TK5 A;  5KPR A;  3CER A;  3MCP A;  1VQ4 N;  3EYZ A;  4FK4 A;  2X74 A;  4OPJ A;  4FWR A;  5AZI A;  4CJP A;  3IUC A;  2D1K A;  3EZW A;  3R8E A;  3OTO K;  4JI5 K;  1YIT N;  3D2F B;  3TU5 A;  1Q7Y O;  4HTU A;  4CEF A;  1HJO A;  4HUG A;  1SL1 A;  5BPN A;  1MA9 B;  4FLW A;  1XC3 A;  3VEN A;  1U48 A;  4OLB A;  3KWG A;  1GLC G;  2FF3 B;  1EP4 A;  2O8B B;  3SMS A;  4OGC A;  3VF4 A;  4DB3 A;  5KRT A;  3J7Y P;  3HO1 A;  2O8C A;  1IKV A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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