3RVCA

Effector domain of ns1 from influenza a/pr/8/34 containing a w187a mutation
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
118
structure length
118
Chain Sequence
ASRYLTDMTLEEMSRDWSMLIPKQKVAGPLCIRMDQAIMDKNIILKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSLPGHTAEDVKNAVGVLIGGLEANDNTVRVSETLQRFAW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Conservation of a crystallographic interface suggests a role for beta-sheet augmentation in influenza virus NS1 multifunctionality.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Non-structural protein 1
molecule tags Protein binding
source organism Influenza a virus
total genus 32
structure length 118
sequence length 118
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.330 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3rvcA00
2RHKA 3O9TA 3OA9A 3F5TA 3P31A 4OPAA 3D6RA 3EE9A 4OPHA 3RVCA 3KWIA 2GX9A 3KWGA 3O9UA 3P39A 3O9SA 2KKZA 3O9RA 3L4QA 3P38A 3EE8A 3M5RA 3O9QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BG8A 3TAFA 5TKWA 2A42A 3LPTA 3V9WA 4ZTFA 1RT1A 4F8RA 1YI2N 4BE1A 1XC9A 5GAGP 2PY5A 3VEOA 2HBLA 2X78A 3S3NA 4FVUA 4JKHA 1RNHA 3VGMA 5FROA 3M8QA 3VEVA 3DLBA 5AQMA 5GIOA 4AF1A 3HOTA 3WNHA 4W5OA 1QE1A 1U4BA 1NGHA 3CCMN 3LM9A 4ZHRA 4JKGA 3UKRB 1BG3A 4JLHA 4RTFD 4HCCA 4FWOA 1WLJA 3UKUB 3A5LC 3O1WA 5C10A 4EHTA 3OYFA 4X62K 3K9JA 2P9IB 4CESA 3OVNA 3CCSN 4B9QA 2OCEA 3WXKA 3M1FA 4CJ5A 3JYTA 1NGFA 3QO9A 3VENA 3L2RA 3KLIA 3PO4A 1NGJA 2QXFA 3BZCA 4DR4K 1Y64A 3L3VA 1VRTA 4JKAA 3T1YK 4N47A 2E88A 3D2FA 2ASPA 1KLMA 3GDQA 4NLBA 1WAFA 4FM1A 3NAEA 3FZHA 4CK2A 1HYVA 5LJVA 5BR8K 3OA9A 2UU9K 4B1ZA 4CIGA 3V6DA 3AO1A 3IMXA 3FR0A 1LW2A 4CIFA 1Y97A 4YNQA 2PFUA 4AHRA 3C7NA 4B1VA 4BRKA 1HX1A 4CF8A 3ISNC 1GLDG 1TUUA 1Z05A 4I6MB 4KRFA 3G4SN 3KLGA 2E4LA 4CGJA 3EE8A 4DQIA 4JKBA 4F2RA 2QWRA 5BPMA 2GEMA 1HR0K 3WXLA 5CYMA 4CJ3A 4DR7K 1G15A 2IAJA 1JLCA 4FJ5A 3BF3A 2XHBA 3HP9A 2GWKA 2J4RA 4BC5A 2YKNA 3ZT2A 4JHDA 2WOMA 1HNVA 2HSTA 4CEAA 4M45A 4DR5K 2QA4N 2RE2A 4BQZA 1NOZA 4KO0A 4B1UB 1E3MA 3H3OB 1C6VA 4H5NA 4YHHK 2IDOA 4PA1A 5FDLA 3J7AP 1RBRA 2EX3A 3M8RA 4CF1A 3AA3A 4GKKK 1HJOA 1NJZA 4CIEA 3H6EA 3IDHA 4RCHA 3HP6A 3ZT0A 2E1YA 3NMUA 4JEPA 4J2AA 3NBPA 1ZC6A 3AO5A 1NGBA 2D5RA 2YHWA 3NCIA 3L4IA 3DXKB 3F5TA 1T3VA 3WNEA 5F0XA 2D4WA 3N4PA 4CJWA 3HM9A 1JLGA 2HNDA 4CJLA 1HKGA 2HHTA 2NUBA 4L8RB 5AQKA 3KK1A 3NDKA 2ZE2A 3AVBA 3SBTA 3MMVA 1RTHA 1KC8O 2ETJA 1RT7A 4PY5A 2NLXA 1N5YA 1HMVA 1WSEA 2W6LA 4CJPA 3OYAA 4NB4A 3PLAA 3DAWA 3ZX2A 4JI7K 2Q97A 1IKXA 1OVQA 4IO9L 4Z4GA 1CXQA 4NYFA 4JAXA 3U3YA 3AVFA 4IOAL 2F9TA 4DQRA 1BI4A 1OVYA 5KQDA 1L3VA 2AP1A 3KKSA 1J53A 4A5BA 1BIUA 4Z4CA 1KQSM 3EKSA 2DY4A 4O8KA 3DXMB 3ITHA 3C65A 3W0LA 2ZJRL 3TABA 2UUBK 3G10A 4KPYA 2ASOA 3J7YP 3NGZA 5GADP 4XH5A 4H5RA 2A1SA 1M90O 3C94A 3OW2M 1Q8IA 2O4IA 3HT3A 4DSEA 3VQDA 2QWNA 3KWIA 5AQLA 4IZ9A 1RT5A 2G8KA 4ILHA 3A8YA 1CZ9A 1SKRA 3EY1A 4X64K 1XNQK 3CC4N 4WFAL 1BQMA 1IKWA 4BRIA 4JKCA 4BRGA 3K57A 3MXJA 5FPMA 3MEDA 1RTDA 3WNFA 1GLAG 3O4QA 4H0VB 4E3SA 1SUQA 2W40A 5FPNA 3O3GA 3SBGA 4X65K 4RW9A 3MWPA 4BRFA 2NRZA 1VQ8N 3MCAB 1IBMK 4FZZA 4FVMA 3H45C 3WT0A 1TK5A 1HRHA 4B8CA 3C95A 4HTLA 3BEXA 2P9LB 1NGEA 2AJQA 3CCEN 1N32K 3SYZA 5AQXA 4B1XB 2FBYA 3BP8A 2F8TA 4FJNA 2F8SA 3SLCA 2Z1GA 4DMNA 4I7FA 2IGIA 4LY7A 2KKZA 4FWQA 3KIOA 3UKRA 2VGMA 4DSJA 1QVFM 3O8MA 4ID5A 1GOBA 3TAMA 1EQYA 3UKUA 3HSCA 2F9WA 1NGAA 2IIRA 2BANA 1DKGD 3DRPA 4H0PA 3LDNA 3U4LA 2P9IA 4YDUA 3LWLA 3LZJA 1G99A 4CZFA 3LDOA 1NMNA 4EIAA 5KPTA 1LWCA 4E19A 4OPJA 2ZM6K 3VA0A 4HTUA 1SV5A 2QEXN 3L3UA 1A5VA 1KAZA 2HMIA 5BRFA 2P5GA 1BOTO 2UXBK 4B3SK 1MU2A 3SUPA 1I3AA 3OYEA 4H0TB 2OTLN 4Z4IA 4DQPA 3KVGA 3VQQA 5LL6Z 5BN8A 3F2KA 1IH7A 4B9LA 2DPNA 3AA4A 5DK5A 1QTMA 2G8HA 3LP0A 4IFYA 5A2QO 2FSKA 2NRWA 3TPQA 3O80A 2UUAK 3CETA 1D9FA 3A5MC 4Z4EA 4DV7K 1CXUA 1ASWA 1IBLK 5JLFA 3FE1A 4FLVA 4B9MA 3B6PA 5ADXA 4O5BA 1Q81O 4I6MA 1X3MA 2YCHA 3TTDA 4MLEA 5AQZA 1JCGA 2VWJA 2Z1JA 1X9MA 1D8YA 1YITN 1JCFA 5EU7A 4CK1A 2YNGA 1SL0A 3KLHA 4UQGA 4CZGA 5C42A 3AVLA 5HP1A 2O8EB 2KTQA 5AJ3K 3RRHA 4C8OA 4WQ5C 4AHSA 3DYAA 1R0AA 3AY9A 3WQTA 2YJEA 3AAQA 4E1MA 3DWLA 5EXWA 4W5RA 2RHKA 2A3ZA 4JI6K 2FBXA 1VSHA 3QINA 1Q9YA 4E7HA 1TAUA 1GLCG 4M63C 4U67L 3M6GA 4FWMA 4DV4K 1NGDA 3E01A 4J2EA 3FFKB 4FLZA 4JI8K 1ZBUA 4NCAA 1JKHA 4BE0A 2BUPA 4IJAA 3VQ8A 2XRIA 3SAHA 4G1QA 3O08A 3FZMA 2FBVA 4FK4A 3VQPA 4H5VA 1HQEA 4CJ7A 3DXKA 4LF4K 4CF9A 3SMSA 1YXQA 3VF6A 3PO5A 3V1OA 1QS4A 1ATNA 3A2FA 1MDUB 1REVA 1NKBA 3MECA 1U45A 3VF2A 1L5UA 3SJHA 1CZAN 2VYPA 4DSFA 3RMBA 1S6PA 3RRGA 3LDQA 2VG6A 4DWIA 3BF1A 3O6WA 3CC2N 5JVGL 2BH1A 1RDDA 2NRTA 1XMOK 1XNRK 3CQYA 3H1QA 1EWRA 3SPYA 4Z4FA 4DLEA 3C6UA 4NLCA 4BC3A 2O8DB 4FWPA 2OPSA 4BVPA 3DLLL 3DOKA 2CH5A 4ELVA 2GX9A 4RG8A 4ELUA 2ZJQL 1S9GA 4FWNA 4FZYA 4CW7B 4DF8A 3V1RA 4ILJA 2Q3SA 3CJAA 1E4GT 3A0IX 3PX4A 3QLHA 3NGYA 3TR8A 1BDGA 3MCPA 3LDSA 3K9KA 4X66K 2ZWHA 5AQVA 3DXMA 4CHZA 1C0MA 3MN7A 5AZIB 4BGBA 1XHXA 2V7ZA 4A2BA 4CJQA 3D7EO 5GIPA 1TK0A 2HNZA 5BRHA 4IXCA 4H4OA 4KAZA 5I42A 3MWTA 3V1QA 4PHTX 1EXQA 3HJFA 4CFBA 4B3OA 3SK3A 3K5MA 2D0OA 2FC0A 3THXB 4NXNK 4CHPA 4AH9A 4BROA 1N33K 3U3GA 4E0DA 5EX5A 4FLXA 1VSJA 2YNFA 1T44A 2DTUA 3RR8A 3UIQA 2H3GX 3OYLA 2LSNA 4CHQA 2X74A 4FWRA 4E7KA 2HBKA 1JLAA 4C8LA 2GELA 4CERA 5D3GA 3I0SA 3LZIA 3VQBA 1YJWN 1LAWA 2P9LA 4CHNA 2W41A 1WSIA 1IO2A 1VQLN 5E26A 4M3XA 3O9UA 3V81A 2QTDA 3DLKA 2E2PA 2E1ZA 3U9ZA 4K41A 5KQ8A 2WC9A 1YVUA 2Y1JA 2BDPA 3GOIA 4CK3A 3EO3A 1HYSA 1NU0A 5C12A 4DUYK 2BTFA 3H08A 5M1PA 4CGHA 2YHXA 4W5TA 3IAYA 1TKXA 1RT3A 4CGIA 1YIJN 3E1YA 3WXMB 2VG7A 4E7LA 3OYKA 5C2DA 3DMJA 2QK9A 4H5WA 1C1AA 3QESA 4E1NA 2PBDA 4DFJA 1S1XA 3CCJN 1EO1A 4WQ4A 3S41A 4RW6A 4A61A 4DTUA 1KVAA 1HPMA 1U48A 2PZSA 4LF6K 3DOLA 4JK7A 1J5OA 3L0QA 5BN9A 4RW7A 1JLQA 1KAYA 1EP4A 1QVGM 4HUEA 4FOIA 5CZ1A 3OJUA 4HVJA 2HVHA 4F3TA 3MEGA 4B08A 1U6ZA 3SQ1A 4CGGA 3ID8A 3P5JA 3KD1E 5M1OA 3FZKA 3ID6A 4I9LA 3KLFA 3HBTA 4DCHA 4V19S 3O9QA 1NK0A 3AAPA 1D5AA 1HJRA 2YV0X 5CY4A 3IUCA 3FGUA 4M3WA 1W0HA 1UOCA 1OH7A 4DU1A 3AGRA 4BRCA 4BDYA 4FJ9A 1DTQA 1RBUA 1WSJA 2Q1NA 3CCQN 4FJMA 5HRNA 4DSKA 1VAZA 3RMAA 4GV3A 3D0PA 4CD3A 1V4SA 3SI6A 1RBVA 1QZ6A 4Z94A 3SAFA 2WTUA 5AZJB 2WUSA 4AM6A 4IKFA 5C0YA 3NH1A 3CCLN 1NNEA 4C23A 1ASUA 4PL8A 3ASMA 5AQHA 2XY6A 3B8AX 3WQUA 3JXUA 4CJKA 1FW6A 3JAMO 4BR2A 3K0SA 3OYIA 2O8EA 2D1KA 1SKWA 4CBXA 4W5NA 3OY9A 3B6OA 1HYZA 4YOTA 2B5JA 1JJ2M 4DR3K 3O4WA 3L2VA 3G6EN 1KXPA 3FLCO 5AQGA 2ZJPL 1LWEA 4CJSA 4I2QA 1A5WA 3HVTA 5CYQA 3EE9A 2OYQA 3VQ5A 3OYBA 5AQJA 1XC3A 4CF2A 4IDKA 1QHTA 3CM6A 3KJVA 1W2BM 1N8RO 2DFFA 3TANA 3L4QA 4EP5A 1DTTA 2G8WA 4DSLA 5C25A 1YT3A 4KTQA 5KTQA 4FLWA 4KHQA 3TTCA 2VG5A 3F9KA 4CEDA 2KHOA 3ULEB 3VEWA 4YORA 4CEEA 4FJIA 3T3FA 3H1VX 3BDPA 4LFBK 5KGWA 4FJGA 3P39A 4HUFA 4KHSA 2I7NA 3K5OA 3TAGA 4AQYK 3HXMA 2P5OA 4KBOA 4BQLA 3MX2A 3LALA 3AVGA 4JNEA 3QMLA 3O1BA 3QDKA 4CZEA 3SV3A 1KRPA 1VSLA 5BREA 4WF9L 2PAVA 3P83D 2VWBA 4QS8A 3G71N 4FCYA 3SUQA 1S5JA 1TK8A 4CFAA 2O8DA 4M3YA 4LF8K 2IC3A 2OZMA 4DUZK 5BR9A 1X9SA 4L3QA 4JYAK 2YNIA 3ENHA 4OGEA 2HHSA 3MN6A 5F1XA 3SMPA 5AQNA 1MWMA 1Q82O 3RMCA 2E5LK 4KB0A 2IVOA 3A5NC 3THVA 4DKWA 4ZTJA 1VQPN 1NK6A 1ESVA 4NCGA 1GLFO 3LANA 3AO4A 3C0BA 1IJJA 4C8NA 2QXLA 3VQ7A 4CJVA 2O8BB 1J9AA 2NRVA 4OJRA 3F73A 4C8MA 3TAQA 3EZWA 4DV2K 1O13A 3Q7BA 5AZIA 2YHYA 2X6NA 3MN5A 3CF5L 2VQFK 4FYDA 4F3OA 1X9WA 1BIZA 4FWSA 4KH4A 1NGIA 1IKVA 1C0UA 1S9EA 2HVIA 2A41A 2A40A 4KHWA 1HUXA 2HMPA 1DT9A 3KD5E 3ZSXA 4BDPA 3THXA 4YY3K 1HNZK 2WONA 4H5TA 2D0BA 2RPIA 2P9NB 4IJNA 4LD0A 4JD2B 1ILYA 4GNIA 4FK0A 5HRPA 4CZJA 1SS6A 3L2UA 4JRPA 1MWKA 3RMDA 5AQSA 3PSFA 1U04A 4HWIA 3E9PA 1NJYA 4MO5A 2QM1A 2R7YA 3L2QA 5BPLA 4KFBA 3CPWM 1GOCA 1Z25A 1GLEG 4CI6A 3QBWA 1QQCA 3BUZB 2JWKA 3OJSA 4FJ8A 4AHTA 3CQXA 1XQSC 4JV5K 3L2WA 3AVJA 1FK9A 2HHHK 3NVMA 3QEXA 3N4QA 3W3DA 1S1VA 3R1XA 1C1BA 3GG4A 3OTOK 1XI1A 1B9DA 4FLYA 2JLEA 2CGKA 1ZYQA 3R3LA 1KAXA 2RKIA 5J2NA 1L3UA 4XH1A 4BG9A 5AQWA 3DLEA 4JK8A 2ITGA 3P38A 1KVBA 2OZSA 4KHUA 5LY3A 3CXCM 2Q36A 3D2EB 4N76A 5E84A 5FRNA 4CEOA 4BRHA 1KVCA 1FXXA 3LDLA 3ZSOA 4BC2A 4DR1K 4H4MA 3HRGA 2GWJA 4F4KA 4Z4HA 4QS9A 1TL1A 1W97L 3ATUA 1J5EK 2P9UB 1BCOA 2YHAA 4K43A 1RDBA 3D45A 1XUPO 3CMAN 4CZMA 4LC9B 4CVNE 1VQMN 2E6LA 3EEQA 5TKYA 1OH5A 3OYGA 5J2PA 3O3FA 3QERA 2O8FB 4LSLA 4IG0A 3SJJA 4N41A 4G9ZA 4HUGA 5DM6L 4O8UA 4H0YB 1RGIA 5AFUH 1D4XA 2A6AA 4CZKA 1QQNA 3I8DA 1ASVA 3WEEB 3T1HK 4FM2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2RHK A;  3O9T A;  3OA9 A;  3F5T A;  3P31 A;  4OPA A;  3D6R A;  3EE9 A;  4OPH A;  3RVC A;  3KWI A;  2GX9 A;  3KWG A;  3O9U A;  3P39 A;  3O9S A;  2KKZ A;  3O9R A;  3L4Q A;  3P38 A;  3EE8 A;  3M5R A;  3O9Q A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4BG8 A;  3TAF A;  5TKW A;  2A42 A;  3LPT A;  3V9W A;  4ZTF A;  1RT1 A;  4F8R A;  1YI2 N;  4BE1 A;  1XC9 A;  5GAG P;  2PY5 A;  3VEO A;  2HBL A;  2X78 A;  3S3N A;  4FVU A;  4JKH A;  1RNH A;  3VGM A;  5FRO A;  3M8Q A;  3VEV A;  3DLB A;  5AQM A;  5GIO A;  4AF1 A;  3HOT A;  3WNH A;  4W5O A;  1QE1 A;  1U4B A;  1NGH A;  3CCM N;  3LM9 A;  4ZHR A;  4JKG A;  3UKR B;  1BG3 A;  4JLH A;  4RTF D;  4HCC A;  4FWO A;  1WLJ A;  3UKU B;  3A5L C;  3O1W A;  5C10 A;  4EHT A;  3OYF A;  4X62 K;  3K9J A;  2P9I B;  4CES A;  3OVN A;  3CCS N;  4B9Q A;  2OCE A;  3WXK A;  3M1F A;  4CJ5 A;  3JYT A;  1NGF A;  3QO9 A;  3VEN A;  3L2R A;  3KLI A;  3PO4 A;  1NGJ A;  2QXF A;  3BZC A;  4DR4 K;  1Y64 A;  3L3V A;  1VRT A;  4JKA A;  3T1Y K;  4N47 A;  2E88 A;  3D2F A;  2ASP A;  1KLM A;  3GDQ A;  4NLB A;  1WAF A;  4FM1 A;  3NAE A;  3FZH A;  4CK2 A;  1HYV A;  5LJV A;  5BR8 K;  3OA9 A;  2UU9 K;  4B1Z A;  4CIG A;  3V6D A;  3AO1 A;  3IMX A;  3FR0 A;  1LW2 A;  4CIF A;  1Y97 A;  4YNQ A;  2PFU A;  4AHR A;  3C7N A;  4B1V A;  4BRK A;  1HX1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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