The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
32
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sequence length |
118
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structure length |
118
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Chain Sequence |
b'ASRYLTDMTLEEMSRDWSMLIPKQKVAGPLCIRMDQAIMDKNIILKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSLPGHTAEDVKNAVGVLIGGLEANDNTVRVSETLQRFAW'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Non-structural protein 1
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| publication title |
Conservation of a crystallographic interface suggests a role for beta-sheet augmentation in influenza virus NS1 multifunctionality.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Influenza a virus
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| molecule tags |
Protein binding
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| total genus |
32
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| structure length |
118
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| sequence length |
118
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-05-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3P38 A; 3EE8 A; 3EE9 A; 3P39 A; 3D6R A; 3L4Q A; 3OA9 A; 4OPA A; 3F5T A; 4OPH A; 3P31 A; 3KWI A; 3O9R A; 3O9Q A; 3KWG A; 3O9U A; 3RVC A; 2GX9 A; 3O9S A; 2RHK A; 3O9T A; 3M5R A; 2KKZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2PFU A; 1QHA A; 1N5Y A; 3MAQ A; 3LL3 A; 4CJP A; 5LMU K; 2F9T A; 2V7Y A; 4H0X B; 3NFA A; 1QS4 A; 1BQM A; 4FL9 A; 2H3G X; 1O13 A; 3AAP A; 4B9U A; 5J2P A; 4PUO A; 4CJV A; 3TAP A; 3IAY A; 2HND A; 2FLO A; 4GNI A; 1T44 A; 1Z25 A; 4Y0W A; 1XC9 A; 3WXJ A; 2I5J A; 3K5N A; 3FFK B; 4CE9 A; 3QNO A; 4Z94 A; 1L3U A; 1TYQ B; 5LMN K; 3AY9 A; 1RTI A; 2UYT A; 3CYM A; 3WXL A; 3VQQ A; 4HCC A; 2EX3 A; 2E5L K; 1NGE A; 4DFJ A; 4DUY K; 1BI4 B; 2YHY A; 3NF9 A; 2CGK A; 3EYZ A; 1C0U A; 1S3X A; 3V1O A; 2FXU A; 4CZE A; 3SV3 A; 2VQE K; 3PSI A; 2RPI A; 4FWN A; 2WON A; 1QE1 A; 1XHX A; 1NMD A; 3VA3 A; 3G25 A; 4CZL A; 5I9E B; 3NVK A; 1VSM A; 4LD0 A; 2P5O A; 2BAN A; 3C7N A; 1DKG D; 2P9S B; 3L3U A; 4K25 A; 1MWM A; 2Q3S A; 3PLA A; 3DXK A; 3LAN A; 3O5B A; 1S1U A; 1NK5 A; 4YDU C; 3RRG A; 4QS7 A; 4R79 A; 3QEX A; 3NGZ A; 4CFD A; 4B9Q A; 3T3F A; 5JLF A; 1NJW A; 1EQY A; 1YIJ N; 2QWM A; 1WUA A; 3KTQ A; 1QTM A; 1VSL A; 2F8T A; 4CK2 A; 1BGX T; 5FPE A; 3CC4 N; 1HPM A; 3OBW A; 3DOL A; 4K43 A; 3CJC A; 1ATN A; 4G1Q A; 4FK0 A; 1RT4 A; 1BU6 O; 1TKX A; 4XH4 A; 1NK7 A; 5BN8 A; 4H4O A; 4DV7 K; 4H8K A; 4HUG A; 1E4G T; 1RIL A; 3TAB A; 2XY8 A; 4B3T K; 4BDY A; 3PX6 A; 1U4B A; 3OJU A; 4O8U A; 3CJ1 A; 5F0X A; 1BUP A; 2HMP A; 4CJE A; 4CK1 A; 4CFB A; 3MX5 A; 4FM2 A; 3DOK A; 4YOR A; 1VRU A; 4NYN A; 2VWK A; 1U47 A; 1KLM A; 3NH1 A; 4DTM A; 4DSK A; 4FLZ A; 3K57 A; 3QBW A; 3NHG A; 3NF6 A; 2F4V K; 1NMN A; 4J2D A; 3H08 A; 1RCH A; 1Z26 A; 2WUS A; 4M3T A; 4CJ4 A; 1NK0 A; 5FRN A; 2QWR A; 2P9I A; 1SL2 A; 4KB1 A; 4CJ3 A; 4DS4 A; 2HBM A; 2FF6 A; 4FJX A; 5BPM A; 3WNF A; 2HOE A; 4X66 K; 3C6H A; 3BEX A; 5JS1 A; 3NAE A; 1JLQ A; 2JLE A; 1SKS A; 1TK0 A; 2D0P A; 3AA4 A; 1VSJ A; 3QET A; 5AJ3 K; 3TTF A; 1ILY A; 3T19 A; 3HPO A; 4N41 A; 4FJ9 A; 4BRI A; 3VGM A; 4JKF A; 4B3S K; 4IDK A; 2B5J A; 2XRI A; 1FJG K; 4YOT A; 4M63 C; 3A5L C; 1D9D A; 4DV2 K; 3IRX A; 4LH5 A; 4NCA A; 3AA3 A; 5CE3 A; 3HO1 A; 2WC9 A; 4U7B A; 5KGW A; 3OTO K; 1ZBF A; 4WFA L; 1KLN A; 3PIO L; 2NRZ A; 4EAH D; 5C2D A; 3TR8 A; 1IKV A; 1XMQ K; 3CJA A; 1HMV A; 4OKE A; 4M45 A; 3SUQ A; 3O80 A; 3O6W A; 3GOI A; 4JKA A; 1DTQ A; 2LSN A; 4FZZ A; 3DAW A; 4OVL A; 1W2B M; 3AO5 A; 5F1X A; 4DS5 A; 5HP1 A; 1XUP O; 1RDA A; 3IFR A; 4GVM A; 5HRP A; 1YUW A; 4DWI A; 2DFH A; 2F9W A; 4E7L A; 1KAY A; 1IBL K; 5HL7 L; 1JXE A; 1P90 A; 3P83 D; 4DFM A; 1GOC A; 1MWK A; 1J6Z A; 1JJ2 M; 4YY3 K; 3CJ9 A; 2ZQB A; 4DSJ A; 4AHT A; 4AM7 A; 2Y1J A; 1ASV A; 1VQO N; 4DQI A; 3SZ2 A; 1I94 K; 1XC3 A; 1CXQ A; 4BC4 A; 4LF7 K; 3IUC A; 1IKY A; 4FWQ A; 2GTD A; 3SMS A; 4I7F A; 2IC3 A; 4I9L A; 1FXX A; 2NNW A; 3CI5 A; 2JWK A; 4BWM A; 3ZSR A; 4DU3 A; 3T1H K; 3TI0 A; 4KHU A; 1KAZ A; 3H1Q A; 3NGY A; 4KV8 A; 1KSP A; 1HLU A; 4JS5 A; 3K9J A; 3U9Z A; 4OLB A; 1D9F A; 4CBX A; 1VSE A; 4FZX C; 4KKO A; 2P5G A; 2QTD A; 2ZM6 K; 4YDU A; 5AQH A; 2BE2 A; 3OYH A; 3OA9 A; 4DCH A; 4BRM A; 1QVF M; 5BR8 K; 1TAU A; 4M3U A; 4RW7 A; 5B8H A; 4GW6 A; 3OW2 M; 1Y97 A; 2GWJ A; 4QOZ B; 3VQC A; 4WCE L; 1SUQ A; 1MU2 A; 3AO4 A; 1HR0 K; 4B1Z A; 3SQ0 A; 1EWQ A; 3ASM A; 2DFE A; 3J8A A; 4FJN A; 2DPN A; 1ASW A; 1JLF A; 2P9I B; 5JVG L; 2Z1H A; 2NRT A; 4H0P A; 4FLX A; 3VQ8 A; 4DSE A; 4OLA A; 1U45 A; 3WXK A; 3KLH A; 3AVJ A; 3C94 A; 3LDP A; 3DRR A; 4YOU A; 1VQK N; 4CEA A; 1NKC A; 2WOM A; 4FPB A; 4LF8 K; 2YHW A; 3CCE N; 5KTQ A; 2KZZ A; 2W6L A; 5AQM A; 2Z1I A; 4BC5 A; 3QEW A; 1UA0 A; 3HPH A; 2O8D B; 1WB9 A; 4BR5 A; 3DM2 A; 4NLB A; 4DFK A; 2KZM A; 4M41 A; 1RBV A; 1RBS A; 3MXJ A; 4CEO A; 2ASO A; 2W41 A; 3O8M A; 5CZ2 A; 3EZ5 A; 3M8R A; 2Q36 A; 4KHP K; 1LW2 A; 2GUP A; 4WE1 A; 4WF9 L; 4IOA L; 2ZF5 O; 1SAZ A; 2BDP A; 4F3T A; 1HYV A; 3ENO A; 4U67 L; 3CCU N; 3V9W A; 4O55 A; 2AJQ A; 3KVG A; 5A2Q O; 3U3Y A; 4C8L A; 2OZM A; 5CY4 A; 2ZGY A; 4JI5 K; 5JLH A; 2F8S A; 4UQG A; 4NCG A; 5LL6 Z; 2E6L A; 4LSN A; 3IDH A; 3H45 C; 3MWT A; 2E6M A; 3ZYY X; 1FKO A; 4NXM K; 1C1B A; 3O9U A; 4WQ4 C; 3W3D A; 5TKW A; 4DTO A; 3KLE A; 2HHT A; 3I33 A; 2B6A A; 5IWA K; 3OJS A; 5JVH L; 2AP1 A; 5AQF A; 3H3O B; 5M1F A; 3JYT A; 4IWV A; 4BRQ A; 4CED A; 1XWL A; 2D4W A; 3MK6 A; 2VWB A; 4CZJ A; 1L3S A; 4FJI A; 2YHB A; 4CF2 A; 2HF3 A; 2KFZ A; 3WNE A; 4I9Q A; 1IV0 A; 3V9Z A; 4FJ7 A; 3DWL A; 4M3X A; 4DFP A; 4CFA A; 5AZJ B; 1JLC A; 4Z4F A; 3CHW A; 1YAG A; 5C25 A; 4DR2 K; 4Z4I A; 3BY5 A; 1NG9 A; 1BL3 A; 4RWT A; 4J2E A; 4CJQ A; 3ENB A; 4ZHR A; 4MDB A; 5H1S Q; 4KAZ A; 1RDU A; 3VQ4 A; 3AVF A; 2YI1 A; 3U6F A; 3LAK A; 4CGF A; 2CH5 A; 3LDO A; 3LM2 A; 3MN7 A; 1H1V A; 1P8Z A; 3KWI A; 4FO0 A; 1R0A A; 4BR9 A; 4CJL A; 1W7A A; 4X62 K; 1WOQ A; 4BRP A; 1NGJ A; 3L2U A; 5GAG P; 3MXI A; 2IAJ A; 4M3Y A; 1KTQ A; 4KHQ A; 2G8W A; 4H0O A; 1ITG A; 2HBJ A; 3KLG A; 5SWM A; 4DV0 K; 4M3W A; 1JXB A; 3IKM A; 4H03 B; 3ZSX A; 3VTH A; 3ZX0 A; 5C42 A; 4BRG A; 4JKC A; 4XIU A; 3K5O A; 3PX4 A; 3CFO A; 1D4X A; 4KTW A; 3OYG A; 3DMJ A; 1NJY A; 3VQ9 A; 3DXM A; 5M1P A; 3QES A; 4PWD A; 2YHX A; 2WTU A; 3ZSY A; 4B1Y B; 1BI4 A; 4HVJ A; 1TV6 A; 3EE9 A; 4BAC A; 1IKW A; 2YNF A; 1BIZ A; 3NF7 A; 3BZC A; 5LY3 A; 4FPA A; 4FLW A; 3TPQ A; 1QZ5 A; 2KW4 A; 3FZM A; 3LPT A; 2P9S A; 1WSG A; 2Q0U A; 4Q5V A; 5HRN A; 3NF8 A; 4BRL A; 2HF4 A; 1TK5 A; 4N76 A; 4A61 A; 1SQK A; 1RT7 A; 3QIO A; 2IVP A; 5AZI B; 1BCM A; 4C1N I; 3THY A; 3CET A; 1BIS A; 1TKT A; 1TKZ A; 3PY8 A; 2FC0 A; 3HRG A; 4IJN A; 3D0P A; 4EFH A; 2CH6 A; 4MQ3 A; 2YNG A; 4M3R A; 4DTX A; 4I2P A; 2QI2 A; 1HKG A; 3VET A; 3QO9 A; 1NKB A; 3LPU A; 4ICL A; 3J80 O; 4LF5 K; 4X64 K; 4YOX A; 3AVH A; 5EXW A; 1UWB A; 1X3M A; 4E7K A; 3CC2 N; 3PX0 A; 1KVC A; 3VGK A; 1HJR A; 2YX6 A; 2FSJ A; 5EOY A; 3MN9 A; 4CJ5 A; 3P31 A; 2G8U A; 3OYD A; 1J9A A; 1NGG A; 2HVI A; 5BRF A; 3DLB A; 4E1J A; 1OH6 A; 4CJK A; 3HTV A; 4CER A; 3GG4 A; 2OAN A; 3TTC A; 2GX9 A; 3E1Y A; 3H3N O; 4KHS A; 3KK1 A; 2PYJ A; 1YVU A; 3WNG A; 4W5Q A; 3QIP A; 3JS6 A; 4IG0 A; 3I0R A; 3EY1 A; 3U3G A; 5AQN A; 4CGI A; 1GLB G; 4A5A A; 4E89 A; 4KH4 A; 1DEJ A; 1S9E A; 2VG7 A; 3K2P A; 3VPZ A; 2XY6 A; 4JI1 K; 1HNV A; 3WQT A; 1DT9 A; 5EX5 A; 4CJU A; 1RT6 A; 1S6Q A; 3V81 A; 1A5W A; 4BWJ A; 1SL1 A; 2OCE A; 1L3T A; 1YJN N; 1ZBS A; 4LF9 K; 3NGI A; 4WQ4 A; 3RTV A; 5BRE A; 5KPR A; 1VSK A; 3DYA A; 1VQ5 N; 2IDO A; 4FWM A; 2IOC A; 2QWN A; 3C65 A; 4CEE A; 4H0V B; 1YT3 A; 1SZ2 A; 3BGR A; 4BRH A; 2P9P B; 1S1T A; 3O1B A; 1Q18 A; 4DQ8 A; 4DR5 K; 3S3N A; 1XHZ A; 3VQP A; 1NM1 A; 3DLH A; 4A59 A; 3KK7 A; 1MDU B; 4OKK A; 3AVC A; 1U6Z A; 1GOB A; 1HNI A; 2OYQ A; 4O44 A; 3ZSO A; 1S1W A; 5M1K A; 1YJW N; 3QDK A; 4QS9 A; 1Y64 A; 3UKR B; 1VQ7 N; 4W5R A; 3J7Z O; 3AVG A; 3V1R A; 4A2A A; 3DXM B; 4PQU A; 4LC9 B; 5AQV A; 4W5O A; 4DLG A; 3VQA A; 2E2P A; 3EE8 A; 3OS2 A; 3CQ8 A; 4WQ5 C; 1XNR K; 2ZE2 A; 3JSM A; 3SQ4 A; 4JKD A; 4QS8 A; 5K14 A; 5AQS A; 3F2K A; 3RSE A; 2OPS A; 1VQ9 N; 3KIO A; 1BCO A; 3SAH A; 4B1X B; 3HJF A; 2HHU A; 3A2F A; 3TSQ A; 1I3A A; 3LP2 A; 3O9Q A; 3KWG A; 3QFU A; 1X1P A; 3OYC A; 3V9S A; 2E4L A; 4DKW A; 1W0H A; 1EWR A; 4CF0 A; 1TVR A; 1WLJ A; 3O9S A; 1YIT N; 3RMC A; 3THY B; 1NJZ A; 1ASU A; 5CYM A; 1IG9 A; 3FGU A; 2FBX A; 1EKE A; 5TKY A; 3KZB A; 5JS2 A; 1S9G A; 3AAR A; 4AM6 A; 3HOT A; 3SPZ A; 2G8H A; 1IBM K; 1RBT A; 4CJR A; 3C0B A; 2Q1N A; 3THX A; 1QQN A; 3EL2 A; 3HM8 A; 3LM9 A; 1UA1 A; 4YOY A; 3MX2 A; 3HST B; 1E4F T; 3E66 A; 3L3V A; 4NB4 A; 1YJ9 N; 4FM1 A; 4Q0B A; 5AQO A; 2V52 B; 3HK2 A; 2KQ2 A; 5C15 A; 1NK8 A; 2VGN A; 3O4Q A; 4MDA A; 4HWI A; 1SV5 A; 1IO2 A; 3FFI A; 3V1Q A; 5ELZ A; 3O4N A; 3B6O A; 1WN7 A; 2OTJ N; 3RMD A; 3AVN A; 1YTA A; 2Q0R A; 3EN9 A; 3P39 A; 5T7B A; 1TL1 A; 2Q97 A; 2QK9 A; 3AVB A; 4BE0 A; 3SUP A; 4CJ7 A; 4A62 A; 3B6P A; 1NLV A; 1KCF A; 1QZ6 A; 1V4T A; 4LH4 A; 4DV1 K; 3I0S A; 1KRP A; 1M90 O; 4PKG A; 3RVC A; 4FJM A; 1QHT A; 2FSN A; 3SJH A; 1ZXO A; 4DU4 A; 2BGG A; 1LOT B; 1GLD G; 3DLG A; 1RBR A; 1T6C A; 2E88 A; 3VQB A; 3SNN A; 1GOA A; 2GEL A; 4CZI A; 2HHS A; 4WFN L; 4C8M A; 2O8D A; 3BF1 A; 4BC2 A; 1UOC A; 1W9H A; 4MO5 A; 2IGI A; 4PL8 A; 4NLC A; 4BVP A; 2O8E A; 4IO8 A; 2PY5 A; 1JKH A; 3R6M A; 5GAD P; 1S5J A; 3NMU A; 2QWL A; 4DMN A; 3RRH A; 4AQY K; 2GUI A; 1VQN N; 2YNH A; 3E9P A; 3VEY A; 4JS4 A; 2ATQ A; 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3R1X A; 4N56 A; 4AHS A; 3EEQ A; 4KPY A; 1RFQ A; 4E19 A; 4KO0 A; 2A40 A; 5D3G A; 1HYS A; 1K8K A; 1T6D A; 1N8R O; 4KI4 A; 2G8K A; 3V9U A; 2ZJQ L; 3QIN A; 3VEW A; 1W97 L; 2V51 B; 3TSU A; 3NH2 A; 2ITG A; 4BRN A; 5GAE P; 1JL1 A; 5J2M A; 1NJX A; 1S6P A; 3MEC A; 3RR7 A; 3WQU A; 2QXF A; 5BRH A; 2FBV A; 3AGK A; 1S22 A; 2ZJP L; 4ELT A; 1BG3 A; 4M42 A; 3E01 A; 1TAQ A; 1OH7 A; 4B3M K; 3GDQ A; 2YHA A; 1X9M A; 4KRE A; 3O3H A; 2HB5 A; 2HHX A; 1IJJ A; 1WSJ A; 3QML A; 5CZ1 A; 3VA0 A; 3DLK A; 3OS1 A; 2VQF K; 3M8Q A; 4JRP A; 2O8E B; 5AZI A; 1U49 A; 4K8Z A; 1X9J A; 1E3M A; 4CIF A; 2HHQ A; 4OX9 K; 4JLH A; 4F2R A; 2YKM A; 5FPD A; 3LDQ A; 3VF6 A; 4BGB A; 3FE1 A; 4CHZ A; 3ZEU B; 2VG5 A; 1Q9Y A; 3U9D A; 4FWS A; 4H5V A; 5HLF A; 3AVA A; 2XO7 A; 3ZSW A; 5DM6 L; 2P9L B; 3L2W A; 1C1C A; 4GV3 A; 3TAG A; 4CJS A; 3HXM A; 3U4L A; 5CHI A; 3LDN A; 4IZ9 A; 4CVN E; 3OS0 A; 4CHN A; 2O4I A; 2X6S A; 3J81 O; 1HNW K; 5DK5 A; 4EZ6 A; 1IG8 A; 3CCL N; 3AO3 A; 3CCQ N; 3CCS N; 5I42 A; 4Z4H A; 3PO4 A; 2W42 A; 1VHX A; 2O8B B; 4IFE A; 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