The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
32
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sequence length |
118
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structure length |
118
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Chain Sequence |
ASRYLTDMTLEEMSRDWSMLIPKQKVAGPLCIRMDQAIMDKNIILKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSLPGHTAEDVKNAVGVLIGGLEANDNTVRVSETLQRFAW
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Influenza a virus
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| publication title |
Conservation of a crystallographic interface suggests a role for beta-sheet augmentation in influenza virus NS1 multifunctionality.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Non-structural protein 1
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| total genus |
32
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| structure length |
118
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| sequence length |
118
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-05-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RHK A; 3KWI A; 3O9U A; 2KKZ A; 3KWG A; 4OPH A; 4OPA A; 3EE8 A; 3EE9 A; 2GX9 A; 3F5T A; 3O9S A; 3D6R A; 3M5R A; 3O9Q A; 3RVC A; 3OA9 A; 3O9R A; 3L4Q A; 3P31 A; 3P38 A; 3P39 A; 3O9T A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4XH5 A; 3V1Q A; 1WAJ A; 2IDO A; 4NLB A; 2KW4 A; 4IWV A; 3OYE A; 2HF4 A; 3I56 N; 4FK4 A; 4B9V A; 1NGJ A; 5AZI B; 4A2A A; 4FJN A; 3HO1 A; 3CC2 N; 4IOA L; 4F8R A; 5GIN A; 3M1F A; 1HPM A; 1KFD A; 4BDY A; 5AQK A; 1NK8 A; 5KGX A; 3LM2 A; 4JKF A; 4CJS A; 3OYB A; 5C0Y A; 2PYL A; 4FW2 A; 3DM2 A; 5AZJ B; 2WOM A; 3D2E B; 4X66 K; 1A5X A; 1U2V B; 3NH2 A; 5HLF A; 3BZK A; 4RW8 A; 2XY5 A; 4NCB A; 3K0S A; 4M3W A; 3TAB A; 3CFO A; 1TKZ A; 4CEQ A; 3VQC A; 2Q36 A; 1SL2 A; 4IOX A; 1ATS A; 4DU1 A; 1DTT A; 1W9H A; 5AQW A; 3AO2 A; 2Q0R A; 4KRE A; 3TSU A; 4CJV A; 3VEN A; 5SWM A; 4BRH A; 5BR8 K; 4XIU A; 4CES A; 1IKV A; 3O8M A; 3TI0 A; 3A2F A; 4B9T A; 2ZE2 A; 4BC3 A; 3RMB A; 3TAR A; 3ZSW A; 4J8F A; 1NGE A; 3U3Y A; 4FZY A; 2F7T A; 1W0H A; 1VRT A; 1VQM N; 1GLF O; 1HNZ K; 4OVL A; 2A1S A; 5CZ2 A; 5J2N A; 4E89 A; 5IWA K; 3DOK A; 1VAZ A; 4IDK A; 3VER A; 1ATN A; 2F96 A; 4MO5 A; 3ZSO A; 1Q18 A; 3AVI A; 3CET A; 4M3U A; 3KIO A; 1GOA A; 1I94 K; 1OH5 A; 4LF4 K; 4OLA A; 2O8D A; 1T44 A; 2J4R A; 3SLC A; 1NKE A; 3JAM O; 4KO0 A; 5BN9 A; 3SMS A; 3FZF A; 3VGK A; 2DFH A; 4MLE A; 1Z25 A; 3EKU A; 1I3A A; 3L4Q A; 2ASO A; 2QWL A; 3IFR A; 3T7Z A; 1YHQ N; 1BGX T; 3J7Y P; 2KKZ A; 2VWK A; 1ATR A; 1UOC A; 2ZGY A; 3OJU A; 3SI6 A; 4FLX A; 5J1E A; 3FFK B; 4FXD A; 3ZSY A; 3CCQ N; 4KH5 A; 3QLH A; 1LWE A; 4WQ4 A; 4RG8 A; 4BR0 A; 4E7L A; 3WQU A; 1S6Q A; 1ZXO A; 3UIQ A; 1ASU A; 3VMF B; 3KD1 E; 1HNI A; 2DY4 A; 2P9P B; 2E1Y A; 3NF9 A; 3UKU A; 3EZW A; 5AR0 A; 1RT7 A; 3OBY A; 2A40 A; 5HRR A; 1VSM A; 1GLC G; 1S3X A; 1VRU A; 3O9S A; 2G8U A; 1U47 A; 4CGF A; 4DV4 K; 2XO7 A; 4CFD A; 2QEX N; 3CCU N; 3EO3 A; 3MX2 A; 4BG9 A; 4O55 A; 1MDU B; 1KQS M; 4L3Q A; 4W5R A; 3L2W A; 4B3S K; 1GLE G; 1HLU A; 1SKR A; 3AVN A; 2RPI A; 4J2B A; 1V4T A; 1YJW N; 2OPR A; 1HRH A; 2UU9 K; 3CIP A; 3ZT0 A; 1VSJ A; 3R8E A; 3UKR A; 4CHP A; 3TAQ A; 3SZ2 A; 5DK5 A; 1NOZ A; 4H03 B; 2HHT A; 1KFS A; 2NRH A; 3O3G A; 2O8C A; 4A2B A; 4BRQ A; 4EFH A; 1BIZ A; 3G71 N; 4CJU A; 3KD5 E; 3SK3 A; 4IBN A; 3AV9 A; 3CQ8 A; 5M1N A; 4CHY A; 2I5J A; 4FWP A; 2V7Z A; 3EZ5 A; 4O5F A; 5KRT A; 5FPN A; 2E1Z A; 3D45 A; 3CXC M; 3AAQ A; 3RMD A; 3MEC A; 4JS4 A; 2O8B B; 1UA0 A; 4DV2 K; 5C2F A; 1LAV A; 1MA9 B; 4I6M A; 2YV0 X; 2NRZ A; 3FR0 A; 4H5W A; 4CZI A; 4FOI A; 4LSN A; 4DG1 A; 3H3O B; 2HVI A; 4ICL A; 2D4W A; 4CZJ A; 1IG8 A; 1QSS A; 2AA4 A; 4BVP A; 4DR4 K; 4DSK A; 2A42 A; 1WBD A; 2B6A A; 1BI4 A; 4FZX C; 1I39 A; 2B4J A; 3M8P A; 1EKE A; 4Z4E A; 4RTF D; 2HBJ A; 1Q86 O; 3LZJ A; 1JLQ A; 1YTU A; 2F4V K; 1QQO A; 2E4L A; 3LP3 A; 4EZ6 A; 4FWK A; 4ZTF A; 4FL9 A; 1MWK A; 2HMI A; 3QBW A; 3AVL A; 1JKH A; 3TSQ A; 5JIC A; 3EEQ A; 5CZ1 A; 1NGG A; 2FF3 B; 3VQE A; 3MMV A; 3ZEU B; 2E2N A; 1LW0 A; 1RBV A; 5BRH A; 2P5G A; 3VEV A; 4E3S A; 3PY8 A; 2QWN A; 4C8O A; 2HBM A; 3VN5 A; 4O4G A; 4A59 A; 3PO5 A; 5AFU H; 1GLJ O; 1SUQ A; 4J2E A; 4O0I A; 2ZQB A; 3ZSZ A; 3NAE A; 4N5S A; 1X9S A; 4OGE A; 3CF5 L; 4Q0B A; 4M3X A; 3KLF A; 4DTN A; 2V52 B; 3VET A; 3I0R A; 4C8K A; 2GEM A; 3EE8 A; 4JAX A; 4IOC L; 4H0P A; 2Q1N A; 3AVC A; 3WXJ A; 4JKC A; 3LDP A; 1Q9X A; 1S22 A; 3QET A; 1BIS A; 1TKX A; 4JD2 A; 2YHW A; 1KAZ A; 3DLE A; 1XNQ K; 2FF6 A; 4AHR A; 4CJR A; 2GTD A; 4BR5 A; 3A5L C; 1IKW A; 2OPS A; 1SZ2 A; 4Z4G A; 1U49 A; 4KB1 A; 3MCA B; 5BRD A; 3WEE B; 4CK2 A; 1ZBH A; 3AVA A; 3ZET A; 1TK0 A; 4CEZ A; 1QZ5 A; 2Z1H A; 2V51 B; 1QHA A; 1JCG A; 2QWO A; 3NHG A; 1T8E A; 2PAV A; 4DR3 K; 3VQ6 A; 1RT3 A; 2QA4 N; 1S5J A; 3PV8 A; 2YNF A; 1WB9 A; 1D4X A; 4FO0 A; 4DUY K; 2VQF K; 2KFN A; 1JCE A; 1N34 K; 4W5O A; 1JLA A; 4DTO A; 2HNZ A; 3N4P A; 4FM1 A; 5B8H A; 3D2F A; 3WXK A; 5AQM A; 2G8H A; 3G10 A; 3DXM B; 4QAG A; 3A8Y A; 4B1U B; 2ASP A; 5C42 A; 1U6Z A; 2H3G X; 3HPH A; 3TU5 A; 4DHY A; 1OH7 A; 1EO1 A; 1HMV A; 4K43 A; 5ADX H; 3OYH A; 2QWM A; 4A5B A; 3OYG A; 5LL6 Z; 2G8I A; 1FJG K; 4ILJ A; 3O9R A; 3LDL A; 4ZHR A; 3V6D A; 3ZT4 A; 3TAM A; 3FZK A; 1W2B M; 4JRP A; 1ZBF A; 3S9H A; 4B3O A; 5GAD P; 3CC7 N; 1DT9 A; 2NRR A; 4DFP A; 2ZF5 O; 3CJC A; 4B1X B; 4JYA K; 1IBM K; 2VWB A; 4BWM A; 2CGK A; 2RF2 A; 1VQ8 N; 3J7A P; 5LMU K; 1XHX A; 2P5O A; 2A6A A; 3ZT3 A; 5AQX A; 3SPY A; 1S9G A; 3MAQ A; 4O5B A; 3SV4 A; 3D7E O; 5CE3 A; 1RBS A; 2BAN A; 5F1X A; 3OYC A; 1RT2 A; 3E9O A; 3BGR A; 1HKC A; 4CW7 B; 3VEO A; 4LSL A; 2KHO A; 3T1A A; 4FSV A; 2D0A A; 2B5J A; 4CGI A; 4E1N A; 1NMD A; 3VEX A; 3TAE A; 2GWK A; 3CCM N; 4AHT A; 3J80 O; 4E7H A; 1BO5 O; 2DFE A; 4OPJ A; 2HNY A; 1C0M A; 2QXF A; 1V4S A; 4G1Q A; 1YAG A; 4I2Q A; 5CHI A; 4OKE A; 4M63 C; 4CHN A; 2E8A A; 1YT3 A; 3PSF A; 4BQL A; 3THW B; 3NGY A; 4JI1 K; 4FJX A; 1IBK K; 1FK9 A; 4H8K A; 1HJO A; 3H1Q A; 4B9U A; 1HPZ A; 5FDL A; 4ILH A; 1NOY A; 1OH6 A; 3QIO A; 4BR7 A; 3LM9 A; 5AQQ A; 1KLM A; 1QVG M; 4DF4 A; 3VEZ A; 3CCE N; 4M3Z A; 5SZT A; 3WXI A; 4CFA A; 1RBT A; 1LWF A; 3QBX A; 2UXB K; 2Z1I A; 4GVM A; 3I8D A; 5AQY A; 1SKS A; 4JKB A; 2P9L A; 3F73 A; 4DUZ K; 1IJJ A; 3DAW A; 1UAX A; 4JI7 K; 4CZE A; 3RSE B; 3BY5 A; 3AA3 A; 4V19 S; 2RE2 A; 1KSP A; 3U6F A; 1KC8 O; 3LWM A; 3OS0 A; 2JWK A; 5AQS A; 4Y0W A; 2WTU A; 2P9S B; 1K6Y A; 4IEI A; 2ZJP L; 4JNE A; 3O1W A; 5JMV A; 4DR1 K; 1GLA G; 3QEX A; 4AH9 A; 1U45 A; 1TYQ A; 3HRG A; 4BRI A; 4JS5 A; 4DV1 K; 3E9L A; 4B8C A; 1HNW K; 5K14 A; 2RN2 A; 5CYM A; 3LAM A; 2HW3 A; 3QFU A; 2VQE K; 3MN5 A; 2ITG A; 3AA5 X; 2YHX A; 1RT6 A; 3PX4 A; 3KKR A; 3MN9 A; 3L3U A; 4JRQ A; 3THX A; 1JJ2 M; 3T3F A; 2GUP A; 2WFB A; 3Q7C A; 4LFB K; 2G8K A; 3AAR A; 4FK0 A; 2PFU A; 3SBG A; 3HZ6 A; 5CR4 A; 4DQ8 A; 3KWG A; 4CE9 A; 1WSG A; 4DSF A; 1YXQ A; 4FCY A; 4HCC A; 3IS9 A; 3SQ1 A; 4E0D A; 4DKW A; 2E6M A; 4DFJ A; 2IVP A; 2V7Y A; 5ELZ A; 4WQ5 C; 3MDQ A; 4I9L A; 3JSM A; 1YI2 N; 1SV5 A; 3DLK A; 1B92 A; 4Z4F A; 2FBX A; 1GLD G; 1KRP A; 3V81 A; 3KKS A; 4RW6 A; 2I7P A; 1DEJ A; 3IKM A; 3I33 A; 2GUI A; 2HF3 A; 4CJQ A; 1L3V A; 4B3M K; 3F9K A; 4N56 A; 4DLE A; 5LJV A; 1RTD A; 3BF3 A; 1EQY A; 1GOB A; 4BG8 A; 4RCH A; 3AGR A; 3KLH A; 2F8T A; 1XC3 A; 3VQ8 A; 2KZZ A; 1BIU A; 3R3L A; 4FPA A; 5JVH L; 4C8M A; 4DS4 A; 4CGH A; 1EET A; 1JLG A; 3KLE A; 2KQ2 A; 1U04 A; 3HK2 A; 3CJ7 A; 3QER A; 3CJA A; 3E9P A; 2X6S A; 3CI5 A; 4H5T A; 4E7I A; 3PX0 A; 2BE2 A; 3OA9 A; 2YKM A; 2Z1J A; 1SQK A; 1WSJ A; 1S1V A; 4BVO A; 1BHL A; 3OYD A; 2HHQ A; 3IAY A; 1P8Z A; 5AFU A; 3ENB A; 3JYT A; 1WSH A; 4X64 K; 5HRN A; 3SQ4 A; 2FXU A; 3V9Z A; 3IMX A; 4CJ5 A; 3THY B; 3SUO A; 3CPE A; 4W5T A; 2YX6 A; 1F21 A; 3ISN C; 3PIP L; 4CGD A; 3VTI A; 4K0K K; 4DSJ A; 2WBN A; 3H46 O; 5KTQ A; 4OLB A; 3MWT A; 4MLH A; 3TWH A; 1EWQ A; 2O8F B; 5EU7 A; 3L6Q A; 3CQX A; 2Z1G A; 4J2A A; 4FWO A; 4ELU A; 3ITH A; 4JEP A; 5JLH A; 1Q82 O; 4JKG A; 4DF8 A; 3U9D A; 3CM5 A; 1QVF M; 3WXL A; 3CER A; 3P5J A; 4CED A; 4F3T A; 5C25 A; 5AZI A; 3DLB A; 4B1Z A; 3NE6 A; 4CGG A; 1NJW A; 3CCV N; 3GDQ A; 3AA4 A; 3SPZ A; 5BPM A; 4CEB A; 2UXD K; 4DFM A; 1ILY A; 4BRC A; 3K59 A; 1N33 K; 3NF6 A; 3LAL A; 1NWK A; 3K5M A; 1VSE A; 2OZS A; 1J5O A; 3F2K A; 1QS4 A; 3G0Z A; 5AZJ A; 3L0Q A; 3EN9 A; 4E19 A; 4DTM A; 2D1K A; 1K8K B; 1LW2 A; 1U2V A; 2ZD1 A; 2E5L K; 1D9D A; 4HCB A; 2QTD A; 3OYF A; 4UY8 O; 1TL1 A; 3OYJ A; 2JGU A; 1RDD A; 4FVM A; 1XHZ A; 1N36 K; 2OTJ N; 3QEW A; 3QB0 A; 3MEG A; 2BDP A; 4FLY A; 4KB0 A; 1K9M O; 3FZM A; 3RRH A; 1BL3 A; 2G8W A; 4CJE A; 4KI6 A; 1HYS A; 3GBT A; 4CJF A; 3J81 O; 4IO9 L; 4HTU A; 1CZA N; 3E66 A; 4CZK A; 5ADX A; 3L3V A; 3L2U A; 3O4N A; 5FRM A; 3U3G A; 3E01 A; 3OS1 A; 1NU0 A; 3P39 A; 1LV5 A; 1WSF A; 4B1W B; 4BE0 A; 4BRF A; 4CF8 A; 4EHU A; 3KK7 A; 4O8U A; 4YOV A; 3HVT A; 1M90 O; 3NF8 A; 4DWI A; 3GG4 A; 3TAF A; 4WCE L; 2UUC K; 4BRD A; 1Z05 A; 4DS5 A; 2ZJR L; 3SAF A; 4DSL A; 5J2M A; 1D8Y A; 4DU4 A; 4GV9 A; 3CCS N; 1NJY A; 2P1J A; 2YHY A; 3IRX A; 2O8C B; 3K57 A; 2D5R A; 4I2P A; 2YNI A; 4FPB A; 4MFB A; 4B1Y B; 3THV A; 3ULE B; 4U7B A; 3FGU A; 2XY7 A; 5EOY A; 4L8R B; 5DM7 L; 1IG9 A; 4CZM A; 4OPK A; 4H5V A; 4BGA A; 1YIT N; 1RT4 A; 3R9P A; 4A61 A; 5AQZ A; 1Z6R A; 3D6R A; 2F9W A; 4RW7 A; 4JI4 K; 1NK0 A; 2YHB A; 5KQD A; 4KTZ A; 4LFA K; 2OYQ A; 4K25 A; 3WUH A; 1D9F A; 3NMU A; 4K42 A; 1HQE A; 4FLT A; 4DTR A; 4N47 A; 1Q8I A; 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1C0F A; 5EVZ A; 3TAG A; 4IEE A; 5JS1 A; 4OO1 J; 5E41 A; 4FOE A; 3U4L A; 4JKA A; 1KVA A; 3H1V X; 5AQF A; 3BF1 A; 3SNN A; 5AQV A; 2FSN A; 3O4W A; 5AQR A; 4ZTJ A; 1ZBU A; 3T1Y K; 1C0U A; 2PBD A; 3O3H A; 4C8L A; 3VQD A; 3HJF A; 3NH1 A; 3P4I A; 4MQ3 A; 4GMJ B; 5A2Q O; 2X78 A; 4DR5 K; 5GAG P; 4EP4 A; 3V1R A; 1ZBL A; 3ZEU A; 1C1B A; 4NYF A; 2E2O A; 4GW6 A; 3VA0 A; 3ZSR A; 3AO4 A; 1BA1 A; 1J6Z A; 4CVN E; 2YCH A; 1RBR A; 1TKT A; 2F9T A; 4YOY A; 1X9W A; 3TTC A; 4YHH K; 4KHW A; 5HRP A; 1RTJ A; 1OKJ A; 2ZJQ L; 3CC4 N; 2HBL A; 4B9S A; 1XQS C; 4Z0U A; 4A57 A; 1QQC A; 4JHD B; 3NCI A; 1NK7 A; 1KVB A; 2Q3S A; 3LP1 A; 2KZM A; 3OBW A; 3RRG A; 4IXC A; 3NGI A; 1NGH A; 4I9Q A; 1DTQ A; 1S6P A; 3IG1 A; 4IG3 A; 1GLB G; 4DV6 K; 4HUF A; 3LAK A; 3V9W A; 2KFZ A; 1TAQ A; 4CEO A; 5J2Q A; 4AHS A; 1IO2 A; 4DB3 A; 3ULD A; 2PYJ A; 4O0J A; 3C65 A; 2OZM A; 1E3M A; 5MLC Q; 1NG9 A; 4AHC A; 4H0V B; 5E26 A; 4AM6 A; 1KXP A; 2BGG A; 1ASV A; 2NRW A; 4FLW A; 1W7A A; 4DR6 K; 3SYZ A; 4WFN L; 4FJG A; 4M3Y A; 1WNS A; 1YJ9 N; 4J2D A; 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