The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
32
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sequence length |
118
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structure length |
118
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Chain Sequence |
b'ASRYLTDMTLEEMSRDWSMLIPKQKVAGPLCIRMDQAIMDKNIILKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSLPGHTAEDVKNAVGVLIGGLEANDNTVRVSETLQRFAW'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Conservation of a crystallographic interface suggests a role for beta-sheet augmentation in influenza virus NS1 multifunctionality.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Non-structural protein 1
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| source organism |
Influenza a virus
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| molecule tags |
Protein binding
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| total genus |
32
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| structure length |
118
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| sequence length |
118
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-05-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3L4Q A; 3RVC A; 3D6R A; 3O9R A; 3P39 A; 3O9U A; 3P31 A; 3O9S A; 3EE8 A; 2KKZ A; 3EE9 A; 4OPA A; 3KWI A; 3F5T A; 3O9T A; 3O9Q A; 2RHK A; 3KWG A; 4OPH A; 2GX9 A; 3OA9 A; 3M5R A; 3P38 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1HJO A; 1V4S A; 1DT9 A; 3S3M A; 2UXB K; 4Z4H A; 3PO4 A; 5AQV A; 5KRS A; 3QFU A; 2F8T A; 4CED A; 5K14 A; 4DUY K; 1UA1 A; 4CHN A; 2P5G A; 1CZ9 A; 5KRT A; 3ZCM A; 2HHH K; 3UB5 A; 5J2M A; 2E1Y A; 4DR5 K; 3O9Q A; 5C10 A; 3WXI A; 4KFB A; 3AO2 A; 4A2B A; 4DTM A; 3A0I X; 3AO1 A; 3HYF A; 1NK7 A; 5EVZ A; 1E4G T; 1S1W A; 2YNG A; 1VRT A; 5SZT A; 3HI0 A; 4N47 A; 2XHB A; 1CZA N; 2YX6 A; 4G1Q A; 5GAG P; 3VF6 A; 4DF4 A; 4JEP A; 4LFC K; 4OGE A; 5GIO A; 1VQ6 N; 4M3Z A; 4DG1 A; 1ASU A; 3SV3 A; 1LCU A; 2E1Z A; 2GV9 A; 2HBM A; 1ATR A; 4DB3 A; 3TAN A; 1NGF A; 2FC0 A; 2ZJP L; 4BVO A; 2NRZ A; 2W6K A; 3ZEU A; 4KHW A; 3TTD A; 4FOE A; 1QVF M; 3L4I A; 2YJE A; 3N4P A; 4H0V B; 2KKZ A; 1N8R O; 1B92 A; 3J7A P; 4YOY A; 4PQU A; 2P9K B; 1CLQ A; 3K5M A; 4UY8 O; 2FBX A; 1TKT A; 4JI4 K; 4BAC A; 1XUP O; 4CJP A; 4M42 A; 2P9S A; 1J5O A; 1NGC A; 4XH1 A; 3WNE A; 4QCL A; 3BY5 A; 2P51 A; 4ISE A; 1SV5 A; 3CIP A; 3G4S N; 4BRA A; 4FW2 A; 3JXU A; 3Q7C A; 4WFN L; 5BPL A; 3LAK A; 4CJ7 A; 1R0A A; 2J4R A; 4BY9 C; 3GBT A; 3LZI A; 1DKG D; 4PY5 A; 2P9I B; 1NG9 A; 2G8F A; 4K42 A; 5DM6 L; 5AFU H; 4NB4 A; 1JKH A; 4IO8 A; 4O4G A; 5T7B A; 4GV9 A; 3TAG A; 1BGX T; 4H0O A; 4IDK A; 5CZ1 A; 3VA0 A; 4DQQ A; 1BIS A; 4DTR A; 5TKY A; 3DAW A; 3DYA A; 4JHD A; 4CJ4 A; 3GL1 A; 4BR9 A; 4H5W A; 4IEE A; 1BUP A; 1D5A A; 3H6E A; 1SL2 A; 2KLA A; 4K25 A; 2VQE K; 4IOA L; 2VGM A; 1X9J A; 4H5N A; 4GV6 A; 4Z0U A; 3T3F A; 4X66 K; 1RT1 A; 3SQ1 A; 2PY5 A; 1TAU A; 3SLC A; 4LD0 A; 3WXL A; 3GOI A; 4I6M A; 2O8D A; 1W0H A; 4CBU A; 3THV A; 4I9Q A; 4DQS A; 3DJC A; 4FSV A; 4HVJ A; 3DRP A; 4BE1 A; 3ZT1 A; 1CZB A; 5C2D A; 1TUY A; 3NGI A; 4FWM A; 3QIN A; 4U67 L; 4LF9 K; 3V9U A; 4KPY A; 2IS3 A; 2E6M A; 5BRH A; 4CK2 A; 3QDK A; 3QEW A; 2ZJQ L; 1VQK N; 3W3D A; 4N76 A; 3QB0 A; 4DQI A; 4JKD A; 3CCR N; 3JS6 A; 1C1B A; 1HR0 K; 4GNI A; 4GKK K; 5CZ2 A; 2HHT A; 3O9U A; 1X9M A; 3CC7 N; 4FJN A; 3CJ9 A; 3K9J A; 4YDU C; 3CET A; 3D45 A; 1RCH A; 1EWQ A; 4KTW A; 3O3G A; 3OBY A; 2HVH A; 4GMJ B; 4AM6 A; 1JCE A; 4Q0B A; 1C6V A; 3S9H A; 5AQN A; 4CZE A; 3CER A; 5C42 A; 3RMB A; 3RRH A; 3C6A A; 4KRF A; 2X6S A; 1EP4 A; 5BRE A; 3OJU A; 1XNQ K; 4FK2 A; 1ZBI A; 3L3U A; 3QO9 A; 3PSF A; 3SUO A; 1KAY A; 4CHO A; 1XWL A; 1BQN A; 2NLX A; 5I9E B; 1G15 A; 3EZ5 A; 4PUO A; 2A6A A; 1O1W A; 4EHU A; 3ZET B; 4B3T K; 3KZB A; 1L3T A; 1TYQ B; 3A2F A; 1U47 A; 3HVR A; 4CEE A; 1LV5 A; 1A5W A; 3LM2 A; 3QEP A; 3B6P A; 1T6D A; 1L3U A; 4BRK A; 2YNF A; 5I3U A; 1NK9 A; 1L5U A; 3KD5 E; 3O8M A; 2YNI A; 1EX4 A; 2FLO A; 4IEI A; 1RGI A; 4BC5 A; 4FZY A; 3A5M C; 1Y64 A; 3L6Q A; 3HBT A; 1HNZ K; 3ALY A; 3ZT2 A; 2O4I A; 3QBW A; 4BRO A; 3IDH A; 2KFZ A; 1JLF A; 3KLF A; 2W6L A; 5HRS A; 3SCX A; 3ZT3 A; 1JL1 A; 3TAM A; 5FPE A; 4OX9 K; 1NKC A; 4AHR A; 3F73 A; 3ID6 A; 4CJR A; 4GW6 A; 4HTL A; 3NHG A; 4AIL C; 3CCM N; 3O1B A; 2F96 A; 5FDL A; 4EZ6 A; 3SJJ A; 1UOC A; 1D9F A; 4KHS A; 4FW1 A; 4DR1 K; 4FWK A; 5LL6 Z; 4Z94 A; 3T1Y K; 3HOS A; 4O8K A; 2HF4 A; 4IG3 A; 3A5L C; 1VQ4 N; 2RE2 A; 3VTI A; 3C7N B; 3IRX A; 4B9V A; 3HM8 A; 1C0U A; 1J53 A; 5E41 A; 1WBB A; 3FZH A; 3TPQ A; 4AF1 A; 3FLC O; 5JVH L; 5C0Y A; 1D4X A; 3O08 A; 4DHY A; 4CZH A; 2P9U A; 3FZL A; 5ADX A; 2B6A A; 5F2R A; 2AJQ A; 2VG5 A; 4CK1 A; 1WUA A; 2Z1I A; 1W2B M; 1RBV A; 1D9D A; 1K9M O; 3P1G A; 3ZLJ A; 4ID5 A; 4FLX A; 3AVG A; 4ILG B; 4CJE A; 2E2O A; 2FSK A; 3QEV A; 4CD3 A; 1QHT A; 5JLH A; 2WC9 A; 1A5X A; 4N56 A; 3L2W A; 3TR8 A; 3O9T A; 4MDB A; 3V4I A; 3WXK A; 1EET A; 1W7A A; 1IBL K; 2G8V A; 2GEL A; 3L2U A; 4B9T A; 1VSL A; 1ASW A; 1TUU A; 2YNH A; 1M1K O; 3L2R A; 2E2P A; 3DOL A; 4BG8 A; 3MWT A; 3ZSO A; 3QET A; 3ZX0 A; 4FK0 A; 4DV6 K; 3AVM A; 3CCE N; 4YOX A; 1TVR A; 3CYM A; 2OYQ A; 3PX0 A; 1H1V A; 1YHQ N; 3VN5 A; 1RT2 A; 2H3G X; 3MCP A; 4NCB A; 3PV8 A; 1Y97 A; 5HBM A; 4DLG A; 1Z25 A; 2D0B A; 3C0B A; 1Q9X A; 3VEY A; 3NH0 A; 3N4Q A; 2ATQ A; 3EZW A; 3CPW M; 5BN9 A; 3B6O A; 4HCB A; 2FSN A; 4A61 A; 4JRQ A; 4V19 S; 1WNS A; 4MO4 A; 1GLL O; 1EO1 A; 5CY4 A; 1RT4 A; 4IDH A; 1T3V A; 4C1N I; 3CM6 A; 5GIN A; 3W0L A; 3LWM A; 3KWG A; 2ETJ A; 4OPH A; 2GX9 A; 3U8X A; 3AO4 A; 5FPN A; 1GLA G; 2ASO A; 1QQN A; 1YF5 L; 3E9O A; 2KZM A; 1ZBU A; 4E7H A; 3LAL A; 2EX3 A; 1HJR A; 3CHW A; 4RW6 A; 3G0Z A; 3I8D A; 4KHP K; 1VHX A; 5KPT A; 5AQX A; 1K8K A; 4M3R A; 2QTD A; 4CJT A; 1YTU A; 3L0Q A; 4DWI A; 4CEA A; 3KK1 A; 5HRO A; 3PUF A; 1JXB A; 3OYH A; 1FW6 A; 4PKI A; 3ENB A; 2FF3 B; 1T03 A; 2KTQ A; 4QS7 A; 3D6R A; 4U7B A; 3K59 A; 4FLT A; 4JI0 K; 4HUF A; 4JI6 K; 3D2F B; 3RSE A; 4CGJ A; 3HL8 A; 1EXQ A; 3NH2 A; 5GAH P; 1S6P A; 4BQL A; 3HT3 A; 3S3O A; 1ZC6 A; 3EY1 A; 1KVB A; 4E7J A; 1YUW A; 1T7P A; 2UUC K; 1ILY A; 4H0X B; 2D0A A; 4CJU A; 4CGI A; 4O5F A; 3QNO A; 3RSE B; 4NYF A; 1BCM A; 1RBU A; 4ILJ A; 4C8O A; 4F3T A; 2O8C B; 2Y1J A; 1ZYQ A; 3SI6 A; 3F9M A; 1QHA A; 2D1K A; 4JAX A; 4B3O A; 3ID8 A; 2NNW A; 1U2V A; 1K6Y A; 3TAR A; 4NYN A; 1U45 A; 5ELZ A; 1RT6 A; 4E89 A; 3G71 N; 4H5V A; 1HNW K; 4PHT X; 3PX6 A; 3ZT0 A; 1RBT A; 2FXU A; 4ZTF A; 4DV5 K; 1YI2 N; 4CFD A; 4DFM A; 2PFU A; 2ZF5 O; 1IJJ A; 1X3N A; 1S3X A; 4IO9 L; 3J7Y P; 3SMS A; 3TSU A; 1Q81 O; 4DU3 A; 4KTQ A; 5MLC Q; 3D2E B; 4FWQ A; 4EHT A; 1SKR A; 4BRQ A; 4FM0 A; 3I0R A; 4BRM A; 4RW7 A; 3ASM A; 2IVP A; 2BUP A; 3HO1 A; 4CE9 A; 4F8R A; 4JD2 A; 4LF5 K; 3LP1 A; 1JLE A; 1SS6 A; 4DFJ A; 1VQ8 N; 1F21 A; 2XRI A; 4FYD A; 1WSG A; 3AVH A; 4DFP A; 1D8Y A; 4DR6 K; 4CJQ A; 1DTT A; 1MU2 A; 4JI5 K; 1BU6 O; 1HKB A; 3HJF A; 4NCG A; 1BA0 A; 4F2S A; 2IIR A; 1MA9 B; 1E3M A; 2YI1 A; 2G8K A; 5C15 A; 3LDO A; 4DSL A; 1BIZ A; 1T8E A; 4O5B A; 2FBT A; 2E20 A; 3AVL A; 3DXM B; 4Y1D A; 2BE2 A; 4DR4 K; 4DR2 K; 1RDU A; 4CJS A; 1LW0 A; 1MWK A; 3HXM A; 4E3S A; 4K41 A; 1Z26 A; 1NBW A; 4R79 A; 5AJ3 K; 2F4V K; 1NM1 A; 1YAG A; 2HOE A; 4CJL A; 5CR4 A; 2Q0R A; 1Q7Y O; 3BZC A; 4C8N A; 3G10 A; 4JK8 A; 2Z1G A; 4K8Z A; 1HYS A; 3IFR A; 3A5O C; 4LY7 A; 2F7T A; 4KHY A; 1FKO A; 4B8A B; 4B9Q A; 3SYZ A; 4JKC A; 1BCO A; 4CHY A; 1FK9 A; 5AZI B; 3CC4 N; 1FKP A; 2DFH A; 4GVM A; 4CF1 A; 2CGK A; 5DK5 A; 1N33 K; 3ZT4 A; 3UKU B; 4OGC A; 3HZ6 A; 4IFV A; 3CMA N; 3TSP A; 4B9M A; 2PYL A; 1NGJ A; 1HQE A; 5F0X A; 4O0I A; 4BR4 A; 3SBG A; 2WBN A; 2UXC K; 1ESV A; 1JLG A; 2D4W A; 2I7P A; 2IAJ A; 5DM7 L; 3HM9 A; 2DTU A; 5AQZ A; 2QXF A; 5FRN A; 4A5B A; 1OVY A; 1OH6 A; 1NJI O; 2ZD1 A; 1UA0 A; 4DSE A; 4JKG B; 1QTM A; 4E7I A; 3OYC A; 1QQO A; 1SZ2 A; 4FJH A; 1S9E A; 3BF1 A; 4BC4 A; 4QS9 A; 1NK6 A; 1ITG A; 2Q0U A; 3L4Q A; 3QNN A; 4C8L A; 3CFR A; 1NGA A; 1WSE A; 4C1N K; 5E26 A; 3M3Z A; 1WB9 A; 4GKJ K; 4DS5 A; 1LWE A; 1RIL A; 4FVM A; 2VQF K; 2P9L B; 4IWV A; 4B9S A; 4IG0 A; 2XY5 A; 3K0S A; 3KK3 A; 4F2R A; 3TWH A; 2Q1N A; 3F5T A; 1UAX A; 5BR8 K; 1R59 O; 2X6N A; 4H8K A; 4FWS A; 3K5L A; 3VEZ A; 1JCG A; 2P9K A; 1KSP A; 3IAY A; 3DM2 A; 3H3O B; 3MXI A; 3MN6 A; 5AQW A; 4LF4 K; 4YOW A; 3VQE A; 4H4O A; 1BOT O; 4RW4 A; 4BG9 A; 3MDQ A; 1IKW A; 3EO3 A; 4MDA A; 4PL8 A; 1RDA A; 3THY B; 3ZSW A; 3SNN A; 1Z05 A; 4JKH A; 1VAZ A; 3VEN A; 1VK0 A; 2HNY A; 1ATN A; 4JLH A; 3M1F A; 2OPS A; 2Q97 A; 1BI4 A; 3T7Z A; 3L2V A; 3EN9 A; 4BRI A; 2P9I A; 4B8C A; 1HPZ A; 4E7L A; 5AQP A; 4YHH K; 1U48 A; 4IBN A; 4B1Y B; 1A5V A; 4FL9 A; 3FR0 A; 4JKB A; 1HUX A; 2PAV A; 5J2P A; 2G8H A; 2GEM A; 5CYM A; 1S1X A; 1KCF A; 1NGE A; 2YHX A; 3WUH A; 1BI4 B; 1WBD A; 4H4M A; 2Q2R A; 3V9Z A; 2Q3S A; 4DS4 A; 3T69 A; 1X1P A; 1KLM A; 3VF2 A; 4OPK A; 3V1R A; 4MFB A; 5KQ8 A; 1E4F T; 2QWM A; 4W5Q A; 2O8F B; 3G6E N; 3RVC A; 2E6L A; 4HUG A; 3TAQ A; 1QSY A; 3THX A; 2A41 A; 3DLL L; 3C6H A; 5EX5 A; 2VWB A; 3CF5 L; 3VQ6 A; 3KJV A; 1NJY A; 5EY4 A; 4AH9 A; 3P31 A; 5BN8 A; 4CJ5 A; 5CHI A; 1QZ6 A; 4Z4C A; 3HPO A; 1RTI A; 3AAQ A; 1HYZ A; 2PBD A; 2QKK A; 1L3S A; 4IKF A; 3CCJ N; 3THX B; 5D3G A; 3TSQ A; 5GAD P; 2P9N A; 3SPZ A; 3OS2 A; 4DSJ A; 4KKO A; 2NRH A; 1OH8 A; 2E88 A; 3FFI A; 1RNH A; 2XY8 A; 1RDD A; 4Y0W A; 3OYB A; 3E9P A; 3AVN A; 5IWA K; 4Z4E A; 3QER A; 4ISG A; 3CCQ N; 1KTQ A; 2P9N B; 3I55 N; 3WEE B; 2CGL A; 4FWO A; 4H5T A; 4IFY A; 4CEO A; 4X64 K; 3CXC M; 3TI0 A; 4FXD A; 3VES A; 3DWL A; 3NH1 A; 1O13 A; 4XH4 A; 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3V6D A; 3VQ7 A; 4JKF A; 4HHT A; 4FJK A; 4IXC A; 4IOC L; 3F2K A; 4DSK A; 5HOO A; 4PKH A; 4YOV A; 4ELV A; 2YKM A; 5M1P A; 3BDP A; 1JXE A; 2GTD A; 3KKS A; 4JI2 K; 4DUZ K; 1VQO N; 4DU1 A; 3LDP A; 3TTF A; 3MED A; 2XY6 A; 4K0K K; 3FZM A; 3MN5 A; 3MCA B; 3TAF A; 2P9P A; 4CEF A; 3OYD A; 3P83 D; 1XI1 A; 4LFB K; 2WOM A; 2ASP A; 3OYM A; 4E0D A; 3JSM A; 2OZS A; 3SQ4 A; 4GV3 A; 3K5N A; 4B08 A; 4CZK A; 4EIA A; 2WON A; 4LSN A; 2P9P B; 3DMJ A; 3JYT A; 5KQD A; 4LF7 K; 3RWU A; 4CHP A; 2A42 A; 3EYZ A; 5H1S Q; 1DLO A; 4DV0 K; 1Z6R A; 2ZGY A; 3SAH A; 3V9S A; 5F1X A; 2Q36 A; 2Z1J A; 3OYA A; 1BIU A; 1OVQ A; 1SKW A; 3KD1 E; 4CF2 A; 1VSF A; 3PIO L; 3HRG A; 3A8Y A; 4DCH A; 3ATV A; 2A3Z A; 1NK4 A; 2EWS A; 4BVP A; 3PX4 A; 1X9W A; 2LSN A; 3CCS N; 5AZJ B; 4M63 C; 4DU4 A; 1KLN A; 3OTO K; 3ZYY X; 1RDW X; 2ZWH A; 1T05 A; 3OYI A; 4KHQ A; 4CK3 A; 3CM5 A; 3EE9 A; 4W5O A; 4JI1 K; 3IKM A; 5JS2 A; 3UE5 A; 3C95 A; 5AQL A; 3P5J A; 1KAZ A; 4IOX A; 3ZSR A; 3SUN A; 3J8A A; 1DEJ A; 4H03 B; 4LF6 K; 3V9W A; 2AA4 A; 1HKG A; 3FGU A; 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