3RVCA

Effector domain of ns1 from influenza a/pr/8/34 containing a w187a mutation
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
118
structure length
118
Chain Sequence
ASRYLTDMTLEEMSRDWSMLIPKQKVAGPLCIRMDQAIMDKNIILKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSLPGHTAEDVKNAVGVLIGGLEANDNTVRVSETLQRFAW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Protein binding
source organism Influenza a virus
publication title Conservation of a crystallographic interface suggests a role for beta-sheet augmentation in influenza virus NS1 multifunctionality.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Non-structural protein 1
total genus 32
structure length 118
sequence length 118
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.330 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3rvcA00
2RHKA 3KWIA 3O9UA 2KKZA 3KWGA 4OPHA 4OPAA 3EE8A 3EE9A 2GX9A 3F5TA 3O9SA 3D6RA 3M5RA 3O9QA 3RVCA 3OA9A 3O9RA 3L4QA 3P31A 3P38A 3P39A 3O9TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XH5A 3V1QA 1WAJA 2IDOA 4NLBA 2KW4A 4IWVA 3OYEA 2HF4A 3I56N 4FK4A 4B9VA 1NGJA 5AZIB 4A2AA 4FJNA 3HO1A 3CC2N 4IOAL 4F8RA 5GINA 3M1FA 1HPMA 1KFDA 4BDYA 5AQKA 1NK8A 5KGXA 3LM2A 4JKFA 4CJSA 3OYBA 5C0YA 2PYLA 4FW2A 3DM2A 5AZJB 2WOMA 3D2EB 4X66K 1A5XA 1U2VB 3NH2A 5HLFA 3BZKA 4RW8A 2XY5A 4NCBA 3K0SA 4M3WA 3TABA 3CFOA 1TKZA 4CEQA 3VQCA 2Q36A 1SL2A 4IOXA 1ATSA 4DU1A 1DTTA 1W9HA 5AQWA 3AO2A 2Q0RA 4KREA 3TSUA 4CJVA 3VENA 5SWMA 4BRHA 5BR8K 4XIUA 4CESA 1IKVA 3O8MA 3TI0A 3A2FA 4B9TA 2ZE2A 4BC3A 3RMBA 3TARA 3ZSWA 4J8FA 1NGEA 3U3YA 4FZYA 2F7TA 1W0HA 1VRTA 1VQMN 1GLFO 1HNZK 4OVLA 2A1SA 5CZ2A 5J2NA 4E89A 5IWAK 3DOKA 1VAZA 4IDKA 3VERA 1ATNA 2F96A 4MO5A 3ZSOA 1Q18A 3AVIA 3CETA 4M3UA 3KIOA 1GOAA 1I94K 1OH5A 4LF4K 4OLAA 2O8DA 1T44A 2J4RA 3SLCA 1NKEA 3JAMO 4KO0A 5BN9A 3SMSA 3FZFA 3VGKA 2DFHA 4MLEA 1Z25A 3EKUA 1I3AA 3L4QA 2ASOA 2QWLA 3IFRA 3T7ZA 1YHQN 1BGXT 3J7YP 2KKZA 2VWKA 1ATRA 1UOCA 2ZGYA 3OJUA 3SI6A 4FLXA 5J1EA 3FFKB 4FXDA 3ZSYA 3CCQN 4KH5A 3QLHA 1LWEA 4WQ4A 4RG8A 4BR0A 4E7LA 3WQUA 1S6QA 1ZXOA 3UIQA 1ASUA 3VMFB 3KD1E 1HNIA 2DY4A 2P9PB 2E1YA 3NF9A 3UKUA 3EZWA 5AR0A 1RT7A 3OBYA 2A40A 5HRRA 1VSMA 1GLCG 1S3XA 1VRUA 3O9SA 2G8UA 1U47A 4CGFA 4DV4K 2XO7A 4CFDA 2QEXN 3CCUN 3EO3A 3MX2A 4BG9A 4O55A 1MDUB 1KQSM 4L3QA 4W5RA 3L2WA 4B3SK 1GLEG 1HLUA 1SKRA 3AVNA 2RPIA 4J2BA 1V4TA 1YJWN 2OPRA 1HRHA 2UU9K 3CIPA 3ZT0A 1VSJA 3R8EA 3UKRA 4CHPA 3TAQA 3SZ2A 5DK5A 1NOZA 4H03B 2HHTA 1KFSA 2NRHA 3O3GA 2O8CA 4A2BA 4BRQA 4EFHA 1BIZA 3G71N 4CJUA 3KD5E 3SK3A 4IBNA 3AV9A 3CQ8A 5M1NA 4CHYA 2I5JA 4FWPA 2V7ZA 3EZ5A 4O5FA 5KRTA 5FPNA 2E1ZA 3D45A 3CXCM 3AAQA 3RMDA 3MECA 4JS4A 2O8BB 1UA0A 4DV2K 5C2FA 1LAVA 1MA9B 4I6MA 2YV0X 2NRZA 3FR0A 4H5WA 4CZIA 4FOIA 4LSNA 4DG1A 3H3OB 2HVIA 4ICLA 2D4WA 4CZJA 1IG8A 1QSSA 2AA4A 4BVPA 4DR4K 4DSKA 2A42A 1WBDA 2B6AA 1BI4A 4FZXC 1I39A 2B4JA 3M8PA 1EKEA 4Z4EA 4RTFD 2HBJA 1Q86O 3LZJA 1JLQA 1YTUA 2F4VK 1QQOA 2E4LA 3LP3A 4EZ6A 4FWKA 4ZTFA 4FL9A 1MWKA 2HMIA 3QBWA 3AVLA 1JKHA 3TSQA 5JICA 3EEQA 5CZ1A 1NGGA 2FF3B 3VQEA 3MMVA 3ZEUB 2E2NA 1LW0A 1RBVA 5BRHA 2P5GA 3VEVA 4E3SA 3PY8A 2QWNA 4C8OA 2HBMA 3VN5A 4O4GA 4A59A 3PO5A 5AFUH 1GLJO 1SUQA 4J2EA 4O0IA 2ZQBA 3ZSZA 3NAEA 4N5SA 1X9SA 4OGEA 3CF5L 4Q0BA 4M3XA 3KLFA 4DTNA 2V52B 3VETA 3I0RA 4C8KA 2GEMA 3EE8A 4JAXA 4IOCL 4H0PA 2Q1NA 3AVCA 3WXJA 4JKCA 3LDPA 1Q9XA 1S22A 3QETA 1BISA 1TKXA 4JD2A 2YHWA 1KAZA 3DLEA 1XNQK 2FF6A 4AHRA 4CJRA 2GTDA 4BR5A 3A5LC 1IKWA 2OPSA 1SZ2A 4Z4GA 1U49A 4KB1A 3MCAB 5BRDA 3WEEB 4CK2A 1ZBHA 3AVAA 3ZETA 1TK0A 4CEZA 1QZ5A 2Z1HA 2V51B 1QHAA 1JCGA 2QWOA 3NHGA 1T8EA 2PAVA 4DR3K 3VQ6A 1RT3A 2QA4N 1S5JA 3PV8A 2YNFA 1WB9A 1D4XA 4FO0A 4DUYK 2VQFK 2KFNA 1JCEA 1N34K 4W5OA 1JLAA 4DTOA 2HNZA 3N4PA 4FM1A 5B8HA 3D2FA 3WXKA 5AQMA 2G8HA 3G10A 3DXMB 4QAGA 3A8YA 4B1UB 2ASPA 5C42A 1U6ZA 2H3GX 3HPHA 3TU5A 4DHYA 1OH7A 1EO1A 1HMVA 4K43A 5ADXH 3OYHA 2QWMA 4A5BA 3OYGA 5LL6Z 2G8IA 1FJGK 4ILJA 3O9RA 3LDLA 4ZHRA 3V6DA 3ZT4A 3TAMA 3FZKA 1W2BM 4JRPA 1ZBFA 3S9HA 4B3OA 5GADP 3CC7N 1DT9A 2NRRA 4DFPA 2ZF5O 3CJCA 4B1XB 4JYAK 1IBMK 2VWBA 4BWMA 2CGKA 2RF2A 1VQ8N 3J7AP 5LMUK 1XHXA 2P5OA 2A6AA 3ZT3A 5AQXA 3SPYA 1S9GA 3MAQA 4O5BA 3SV4A 3D7EO 5CE3A 1RBSA 2BANA 5F1XA 3OYCA 1RT2A 3E9OA 3BGRA 1HKCA 4CW7B 3VEOA 4LSLA 2KHOA 3T1AA 4FSVA 2D0AA 2B5JA 4CGIA 4E1NA 1NMDA 3VEXA 3TAEA 2GWKA 3CCMN 4AHTA 3J80O 4E7HA 1BO5O 2DFEA 4OPJA 2HNYA 1C0MA 2QXFA 1V4SA 4G1QA 1YAGA 4I2QA 5CHIA 4OKEA 4M63C 4CHNA 2E8AA 1YT3A 3PSFA 4BQLA 3THWB 3NGYA 4JI1K 4FJXA 1IBKK 1FK9A 4H8KA 1HJOA 3H1QA 4B9UA 1HPZA 5FDLA 4ILHA 1NOYA 1OH6A 3QIOA 4BR7A 3LM9A 5AQQA 1KLMA 1QVGM 4DF4A 3VEZA 3CCEN 4M3ZA 5SZTA 3WXIA 4CFAA 1RBTA 1LWFA 3QBXA 2UXBK 2Z1IA 4GVMA 3I8DA 5AQYA 1SKSA 4JKBA 2P9LA 3F73A 4DUZK 1IJJA 3DAWA 1UAXA 4JI7K 4CZEA 3RSEB 3BY5A 3AA3A 4V19S 2RE2A 1KSPA 3U6FA 1KC8O 3LWMA 3OS0A 2JWKA 5AQSA 4Y0WA 2WTUA 2P9SB 1K6YA 4IEIA 2ZJPL 4JNEA 3O1WA 5JMVA 4DR1K 1GLAG 3QEXA 4AH9A 1U45A 1TYQA 3HRGA 4BRIA 4JS5A 4DV1K 3E9LA 4B8CA 1HNWK 5K14A 2RN2A 5CYMA 3LAMA 2HW3A 3QFUA 2VQEK 3MN5A 2ITGA 3AA5X 2YHXA 1RT6A 3PX4A 3KKRA 3MN9A 3L3UA 4JRQA 3THXA 1JJ2M 3T3FA 2GUPA 2WFBA 3Q7CA 4LFBK 2G8KA 3AARA 4FK0A 2PFUA 3SBGA 3HZ6A 5CR4A 4DQ8A 3KWGA 4CE9A 1WSGA 4DSFA 1YXQA 4FCYA 4HCCA 3IS9A 3SQ1A 4E0DA 4DKWA 2E6MA 4DFJA 2IVPA 2V7YA 5ELZA 4WQ5C 3MDQA 4I9LA 3JSMA 1YI2N 1SV5A 3DLKA 1B92A 4Z4FA 2FBXA 1GLDG 1KRPA 3V81A 3KKSA 4RW6A 2I7PA 1DEJA 3IKMA 3I33A 2GUIA 2HF3A 4CJQA 1L3VA 4B3MK 3F9KA 4N56A 4DLEA 5LJVA 1RTDA 3BF3A 1EQYA 1GOBA 4BG8A 4RCHA 3AGRA 3KLHA 2F8TA 1XC3A 3VQ8A 2KZZA 1BIUA 3R3LA 4FPAA 5JVHL 4C8MA 4DS4A 4CGHA 1EETA 1JLGA 3KLEA 2KQ2A 1U04A 3HK2A 3CJ7A 3QERA 3CJAA 3E9PA 2X6SA 3CI5A 4H5TA 4E7IA 3PX0A 2BE2A 3OA9A 2YKMA 2Z1JA 1SQKA 1WSJA 1S1VA 4BVOA 1BHLA 3OYDA 2HHQA 3IAYA 1P8ZA 5AFUA 3ENBA 3JYTA 1WSHA 4X64K 5HRNA 3SQ4A 2FXUA 3V9ZA 3IMXA 4CJ5A 3THYB 3SUOA 3CPEA 4W5TA 2YX6A 1F21A 3ISNC 3PIPL 4CGDA 3VTIA 4K0KK 4DSJA 2WBNA 3H46O 5KTQA 4OLBA 3MWTA 4MLHA 3TWHA 1EWQA 2O8FB 5EU7A 3L6QA 3CQXA 2Z1GA 4J2AA 4FWOA 4ELUA 3ITHA 4JEPA 5JLHA 1Q82O 4JKGA 4DF8A 3U9DA 3CM5A 1QVFM 3WXLA 3CERA 3P5JA 4CEDA 4F3TA 5C25A 5AZIA 3DLBA 4B1ZA 3NE6A 4CGGA 1NJWA 3CCVN 3GDQA 3AA4A 3SPZA 5BPMA 4CEBA 2UXDK 4DFMA 1ILYA 4BRCA 3K59A 1N33K 3NF6A 3LALA 1NWKA 3K5MA 1VSEA 2OZSA 1J5OA 3F2KA 1QS4A 3G0ZA 5AZJA 3L0QA 3EN9A 4E19A 4DTMA 2D1KA 1K8KB 1LW2A 1U2VA 2ZD1A 2E5LK 1D9DA 4HCBA 2QTDA 3OYFA 4UY8O 1TL1A 3OYJA 2JGUA 1RDDA 4FVMA 1XHZA 1N36K 2OTJN 3QEWA 3QB0A 3MEGA 2BDPA 4FLYA 4KB0A 1K9MO 3FZMA 3RRHA 1BL3A 2G8WA 4CJEA 4KI6A 1HYSA 3GBTA 4CJFA 3J81O 4IO9L 4HTUA 1CZAN 3E66A 4CZKA 5ADXA 3L3VA 3L2UA 3O4NA 5FRMA 3U3GA 3E01A 3OS1A 1NU0A 3P39A 1LV5A 1WSFA 4B1WB 4BE0A 4BRFA 4CF8A 4EHUA 3KK7A 4O8UA 4YOVA 3HVTA 1M90O 3NF8A 4DWIA 3GG4A 3TAFA 4WCEL 2UUCK 4BRDA 1Z05A 4DS5A 2ZJRL 3SAFA 4DSLA 5J2MA 1D8YA 4DU4A 4GV9A 3CCSN 1NJYA 2P1JA 2YHYA 3IRXA 2O8CB 3K57A 2D5RA 4I2PA 2YNIA 4FPBA 4MFBA 4B1YB 3THVA 3ULEB 4U7BA 3FGUA 2XY7A 5EOYA 4L8RB 5DM7L 1IG9A 4CZMA 4OPKA 4H5VA 4BGAA 1YITN 1RT4A 3R9PA 4A61A 5AQZA 1Z6RA 3D6RA 2F9WA 4RW7A 4JI4K 1NK0A 2YHBA 5KQDA 4KTZA 4LFAK 2OYQA 4K25A 3WUHA 1D9FA 3NMUA 4K42A 1HQEA 4FLTA 4DTRA 4N47A 1Q8IA 1E4FT 2IVOA 3T69A 3HL8A 4CEEA 1SS6A 3OYIA 3L8BA 3MX5A 4CEFA 3SAGA 3HPOA 3S3MA 3L2RA 3S41A 4FLUA 4BRAA 1CLQA 3TTFA 1VQ5N 2NZTA 3AVKA 2A41A 3KLIA 1QHTA 3KHYA 3H3NO 3M6GA 4LF9K 2HVHA 2E2QA 3LP0A 5C2DA 2O4IA 4Z4HA 2ETJA 1T6CA 3MK6A 5I3UA 4B9LA 4FWRA 3DRPA 4NCAA 5J2PA 3C94A 1W97L 4WE1A 4JI2K 4BE1A 4H5RA 2VG6A 3G4SN 3LL3A 4B3TK 2WONA 4B08A 2YNGA 3NBPA 4WQ5A 3AO3A 3DWLA 4M7YA 4CD3A 1WSIA 1RT1A 1U48A 4NXNK 4EZ9A 2VG5A 1J53A 2A1RA 4IFEA 4BRNA 1BCOA 3KWIA 3ZX2A 4WFBL 3M8QA 3VESA 1IBLK 5GIOA 2HNDA 4OPAA 2GX9A 3M5RA 4JK8A 1TL3A 1U4BA 3O3FA 3PIOL 3HBTA 2O8BA 3DXKA 1WOQA 3QEVA 3WNFA 2ATQA 3QIPA 4BREA 5I9EB 1JL2A 3AGKA 3CG7A 4M42A 5AQUA 4CFBA 4FWSA 3VF4A 3BP8A 3L2VA 3A5MC 4IDHA 3DI6A 3MCPA 3HSCA 1LCUA 4IFYA 2KLAA 4BY9C 4K41A 4NLCA 2QW9A 3EY1A 4FLVA 1VQ6N 1C0FA 5EVZA 3TAGA 4IEEA 5JS1A 4OO1J 5E41A 4FOEA 3U4LA 4JKAA 1KVAA 3H1VX 5AQFA 3BF1A 3SNNA 5AQVA 2FSNA 3O4WA 5AQRA 4ZTJA 1ZBUA 3T1YK 1C0UA 2PBDA 3O3HA 4C8LA 3VQDA 3HJFA 3NH1A 3P4IA 4MQ3A 4GMJB 5A2QO 2X78A 4DR5K 5GAGP 4EP4A 3V1RA 1ZBLA 3ZEUA 1C1BA 4NYFA 2E2OA 4GW6A 3VA0A 3ZSRA 3AO4A 1BA1A 1J6ZA 4CVNE 2YCHA 1RBRA 1TKTA 2F9TA 4YOYA 1X9WA 3TTCA 4YHHK 4KHWA 5HRPA 1RTJA 1OKJA 2ZJQL 3CC4N 2HBLA 4B9SA 1XQSC 4Z0UA 4A57A 1QQCA 4JHDB 3NCIA 1NK7A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2RHK A;  3KWI A;  3O9U A;  2KKZ A;  3KWG A;  4OPH A;  4OPA A;  3EE8 A;  3EE9 A;  2GX9 A;  3F5T A;  3O9S A;  3D6R A;  3M5R A;  3O9Q A;  3RVC A;  3OA9 A;  3O9R A;  3L4Q A;  3P31 A;  3P38 A;  3P39 A;  3O9T A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4XH5 A;  3V1Q A;  1WAJ A;  2IDO A;  4NLB A;  2KW4 A;  4IWV A;  3OYE A;  2HF4 A;  3I56 N;  4FK4 A;  4B9V A;  1NGJ A;  5AZI B;  4A2A A;  4FJN A;  3HO1 A;  3CC2 N;  4IOA L;  4F8R A;  5GIN A;  3M1F A;  1HPM A;  1KFD A;  4BDY A;  5AQK A;  1NK8 A;  5KGX A;  3LM2 A;  4JKF A;  4CJS A;  3OYB A;  5C0Y A;  2PYL A;  4FW2 A;  3DM2 A;  5AZJ B;  2WOM A;  3D2E B;  4X66 K;  1A5X A;  1U2V B;  3NH2 A;  5HLF A;  3BZK A;  4RW8 A;  2XY5 A;  4NCB A;  3K0S A;  4M3W A;  3TAB A;  3CFO A;  1TKZ A;  4CEQ A;  3VQC A;  2Q36 A;  1SL2 A;  4IOX A;  1ATS A;  4DU1 A;  1DTT A;  1W9H A;  5AQW A;  3AO2 A;  2Q0R A;  4KRE A;  3TSU A;  4CJV A;  3VEN A;  5SWM A;  4BRH A;  5BR8 K;  4XIU A;  4CES A;  1IKV A;  3O8M A;  3TI0 A;  3A2F A;  4B9T A;  2ZE2 A;  4BC3 A;  3RMB A;  3TAR A;  3ZSW A;  4J8F A;  1NGE A;  3U3Y A;  4FZY A;  2F7T A;  1W0H A;  1VRT A;  1VQM N;  1GLF O;  1HNZ K;  4OVL A;  2A1S A;  5CZ2 A;  5J2N A;  4E89 A;  5IWA K;  3DOK A;  1VAZ A;  4IDK A;  3VER A;  1ATN A;  2F96 A;  4MO5 A;  3ZSO A;  1Q18 A;  3AVI A;  3CET A;  4M3U A; 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 1NOZ A;  4H03 B;  2HHT A;  1KFS A;  2NRH A;  3O3G A;  2O8C A;  4A2B A;  4BRQ A;  4EFH A;  1BIZ A;  3G71 N;  4CJU A;  3KD5 E;  3SK3 A;  4IBN A;  3AV9 A;  3CQ8 A;  5M1N A;  4CHY A;  2I5J A;  4FWP A;  2V7Z A;  3EZ5 A;  4O5F A;  5KRT A;  5FPN A;  2E1Z A;  3D45 A;  3CXC M;  3AAQ A;  3RMD A;  3MEC A;  4JS4 A;  2O8B B;  1UA0 A;  4DV2 K;  5C2F A;  1LAV A;  1MA9 B;  4I6M A;  2YV0 X;  2NRZ A;  3FR0 A;  4H5W A;  4CZI A;  4FOI A;  4LSN A;  4DG1 A;  3H3O B;  2HVI A;  4ICL A;  2D4W A;  4CZJ A;  1IG8 A;  1QSS A;  2AA4 A;  4BVP A;  4DR4 K;  4DSK A;  2A42 A;  1WBD A;  2B6A A;  1BI4 A;  4FZX C;  1I39 A;  2B4J A;  3M8P A;  1EKE A;  4Z4E A;  4RTF D;  2HBJ A;  1Q86 O;  3LZJ A;  1JLQ A;  1YTU A;  2F4V K;  1QQO A;  2E4L A;  3LP3 A;  4EZ6 A;  4FWK A;  4ZTF A;  4FL9 A;  1MWK A;  2HMI A;  3QBW A;  3AVL A;  1JKH A;  3TSQ A;  5JIC A;  3EEQ A;  5CZ1 A;  1NGG A;  2FF3 B;  3VQE A;  3MMV A;  3ZEU B;  2E2N A;  1LW0 A;  1RBV A;  5BRH A;  2P5G A;  3VEV A;  4E3S A;  3PY8 A;  2QWN A;  4C8O A;  2HBM A;  3VN5 A;  4O4G A;  4A59 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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