3S1XA

Transaldolase from thermoplasma acidophilum in complex with d-sedoheptulose 7-phosphate schiff-base intermediate
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
223
structure length
223
Chain Sequence
MKIFLDTANIDEIRTGVNWGIVDGVTTNPTLISKEAVNGKKYGDIIREILKIVDGPVSVEVVSTKYEGMVEEARKIHGLGDNAVVKIPMTEDGLRAIKTLSSEHINTNCTLVFNPIQALLAAKAGVTYVSPFVGRLDDIGEDGMQIIDMIRTIFNNYIIKTQILVASIRNPIHVLRSAVIGADVVTVPFNVLKSLMKHPKTDEGLAKFLEDWKKVSPDGKLIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Probable transaldolase
publication title Twisted Schiff base intermediates and substrate locale revise transaldolase mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Thermoplasma acidophilum
total genus 87
structure length 223
sequence length 223
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2011-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3s1xA00
1W0MA 3NQCA 1K3UA 1SO6A 1YDNA 1RV8A 3LERA 1F6PA 4WY0A 4M6PA 3DH7A 4JX6A 2F7FA 1PCWA 2OCZA 3ZWSA 4HNNA 3M43A 4MYXA 1WBHA 1A5BA 1UBSA 1E51A 2PRHA 3VCRA 3MBDA 3DFQA 4JXCA 3FIGA 5AHEA 3LM7A 5CGQA 1XI3A 4GUJA 1PCKA 2AGKA 3KRSA 1SR9A 2VKZG 4NXSA 5HWJA 1QOPA 3IIOA 3STFA 4CNOA 1I2PA 5K2ZA 1H7RA 2V0TA 3TE9A 2R91A 3W85A 3EX3A 2QCLA 1G67A 3DFTA 2I14A 2J24A 2CFFA 2ZZ1A 1AK5A 4MFEA 5LNSA 4DO5A 1TSIA 3LHZA 1KM5A 4RZ4A 3UD6A 3T4CA 3DU0A 1VYPX 1Q6LA 2Y6ZA 3M5ZA 1MEHA 3W23A 4IMFA 4X2RA 3TAKA 2NX3A 1WXJA 1OF8A 5LKYA 3SW6A 1L6WA 2NV1A 4FNSA 4TX9A 3R13A 1GVRA 1G7VA 1YXYA 5EA9A 4JYFA 5BNKA 1QFEA 4EOUA 4M6VA 1U83A 3PAJA 1NVMA 2PURA 1K7XA 3RNDA 3C52A 5KSWA 1B9BA 4JEQA 4U28A 1S5WA 1TTJA 3BW2A 2VXNA 2QEZA 3WK2A 1QAPA 3TMLA 1TRIA 1I2QA 3E02A 1X7FA 2EF9A 4PTNA 3HOJA 4GUIA 5AC6A 1DJQA 2WSRA 3LCHA 5DCEA 4LY8A 1KM6A 1H61A 3P74A 5K3VA 1W37A 2DP3A 2QKFA 3SGUA 4YWIA 3LHTA 4X22A 3IEBA 4FNTA 3VNDA 4M7SA 4FNPA 2CZDA 4FX8A 2R94A 3CEPA 1JUBA 4UFJA 3PF3A 3HJZA 3W70A 3H55A 1OG0A 3DI0A 3MP4A 4JICA 3BLIA 2HTMA 1OJXA 2EGZA 3IGUA 3GIYA 3KRZA 3NNTA 3M1ZA 2P1FA 1NEYA 5G4WA 3HQ1A 3E96A 4ZVJA 5BMXA 4DEFA 2XN1A 1TQXA 4LRTA 5DXYA 1SUXA 2J27A 2VFGA 4S1FA 4A3UA 5ABTA 3W73A 5HNRA 5G2HA 4NXKA 4KWWA 4DF0A 3STCA 3N2MA 2NWSA 3HF3A 4AWSA 1ZAIA 1PV8A 4O16A 3FEMA 1F5ZA 2ZRXA 4ADUA 2QDGA 5I3HA 1ZNNA 2BXVA 1XUZA 3OVPA 3GB6A 1LROA 3GDMA 4HKPA 1DHPA 4PH6A 1JUKA 3KHJA 3MI2A 1O4UA 1QPRA 4IMGA 2Y7GA 6ALDA 3I6RA 1HL2A 2D73A 2Q3OA 1T96A 4UMCA 3U6WA 3W3OA 4ZL1A 1B3OA 4KKXA 3SY5A 3GYEA 2Z0IA 3P84A 1VCVA 3DFSA 4TR9A 3LRMA 3G1XA 3RU6A 3WFAA 1OK4A 1DKWA 3O16A 1D3HA 3STEA 3W7GA 4ZQNA 3JRKA 3GX9A 1XC4A 2BSLA 1P0NA 4N02A 4MY8A 2YW3A 3A24A 3C2VA 5BMWA 3S9YA 5CZ0A 3GLCA 3BG3A 1K02A 3TUUA 2A7PA 3LXBA 3EWUA 3BVJA 1KFKA 3NO5A 1ME9A 3W76A 3TNOA 1YDVA 3IIVA 5LZLA 1A5SA 4WD0A 1SO3A 5FF0A 3PULA 4UMAA 3IGXA 1FWNA 4NZFA 3T7VA 3R5EA 2Y61A 4OV9A 5TIMA 1G4TA 3MW7A 1R2SA 3PR2A 4O52A 3LCWA 1KM2A 3OA3A 1XM3A 1BEUA 2H8ZA 2YR1A 5LHEA 1DBTA 3IIPA 2ISSA 2B7NA 2YFOA 3ZFHA 2VFFA 4DO6A 2DZTA 3WJWA 4Y8FA 1C8VA 3T78A 1VZWA 1FUYA 4O19A 4QISA 4IX0A 3HGRA 2ZRUA 5IM51 1YPFA 1W56A 1EIXA 2W0UA 1KV5A 3B04A 2YFNA 5F2MA 4Y9AA 3HG5A 1Q3NA 3TCEA 1ME8A 4LVAA 5G4EA 4MJMA 3UNDA 3EWYA 4NJJA 4FO4A 3NDOA 3L65A 1VCFA 4JIPA 4O53A 4NNBA 2FIQA 3CEUA 3QF0A 2QCHA 3W7NA 4DBDA 2WNNA 4PA8A 5AHIA 3TSMA 1W3NA 3THQA 1F2JA 2FJKA 1O5KA 4UC5A 1GPWA 3EXSA 1EEPA 4YCPA 3KVLA 3LGEA 5L9FA 3QFEA 4JDBA 1VRDA 3R8RA 4POCA 3O06A 1GWJA 4BWLA 3H53A 3LCLA 4EF9A 3PUDA 4UXDA 4M6QA 4LVFA 1OVDA 3NZRA 1QWGA 3M5VA 1FCVA 4UNLA 3QJAA 4XTIA 3LOTA 2ZFAA 3INPA 2VFIA 2WPBA 3G3MA 2TYSA 1AW2A 4BI5A 4GUHA 3NM1A 3BG9A 5BOOA 2X1SA 4IUOA 3LHYA 2C16A 4FNRA 3U2OA 2QCNA 2A6NA 4C1LA 1TV8A 4GUGA 5HWNA 4WUIA 4WOZA 3DI1A 3LI1A 4A21A 3CWNA 3TR2A 2FQIA 4O1BA 2BTMA 3G1YA 4NX5A 3GDKA 4D2JA 3O63A 3CPRA 3N2XA 2GOUA 2YPIA 1OFQA 2HSAA 5G1TA 1SZEA 1K8YA 4JTUA 4Z1BA 4CCDA 4IX2A 4MKNA 3T44A 5LNVA 3TW7A 4AWTA 2PRLA 3BLEA 4O0KA 3EX4A 3ABQA 4QQ3A 3S5NA 3QRHA 3L0NA 5AB3A 1K7FA 2Z2UA 4E2BA 4ZQRA 2A7RA 4UTJA 3LI0A 2FDSA 2E5BA 5AHFA 2Y7EA 3TA6A 1TTIA 3MI6A 5FF3A 3V75A 3QSTA 4UCGA 3W2JA 3FJLA 1XDMA 1XXXA 4I9AA 1TPFA 2GPTA 3WJSA 1V7YA 1K8ZA 1RPXA 4DELA 1ALDA 3NPXA 5J5RA 5HWMA 5DLCA 4JX4A 3QEZA 4NJGA 3GVGA 4AB4A 3DFNA 1EP2A 2F84A 1X1ZA 3EXRA 3KAOA 5GVJA 2C13A 4QNEA 3TQKA 3TH6A 3N9RA 1O95A 3LRLA 4WXYA 1H62A 3MYPA 2FPYA 2DJLA 1OX5A 2ZCGA 4ONVA 4GXMA 2CW6A 4KWVA 3S1WA 1YXDA 1K7EA 4GNJA 5G5IA 1LP6A 1OYCA 4CNPA 1NF7A 4N6EA 3W1MA 1RQBA 2WOQA 3EWBX 2VFDA 1FQ0A 2NXHA 3KVKA 1DORA 2WO5A 3UY8A 3HPSA 1Z41A 4LVBA 1HO4A 1TYGA 1VLIA 3MUXA 5CSSA 1JUEA 2RFGA 4O12A 1R46A 1UUOA 4MPQA 5EYWA 4O1CA 5F2LA 1H1ZA 4JYDA 3UYCA 3C61A 4XWUA 3GR8A 1B4KA 4KFPA 3BPWA 3W7HA 3QMSA 2A0NA 2Y89A 3FOKA 4OT7A 4H6KA 5D2YA 1VPXA 3W2MA 1KBIA 2ZRZA 3M5YA 5AFDA 4LVDA 3KX6A 4Z08A 4FXSA 4ALDA 3F1QA 3G18A 4O8RA 3LTYA 2YYTA 2CZFA 3GDTA 3M9YA 4P2VA 1OF6A 4O4VA 2G96A 4XBSA 3C56A 3DHFA 3UXAA 4WY0F 3N19B 1VLWA 3EWZA 2RDUA 1JQXA 3S5ZA 3L68A 1WYIA 3W1XA 5HUOA 2FTPA 3CTLA 4XKYB 1Z44A 4OE7A 5DXXA 3K30A 5F2GA 4IGHA 3TC7A 3NR0A 3DKJA 3VE9A 4K8EA 2X2GA 4QSHA 1RR2A 3IVSA 1SQ7A 1W3TA 3LLDA 1RZMA 4CQ8A 3IRDA 4K37A 1GG1A 4K7YA 4C1KA 2JBMA 1YTEA 4JTEA 4N6FA 3L5AA 2X30A 4O1AA 3P8JA 1X8FA 3PY2A 4UNKA 2GQAA 3DZ1A 3PG8A 5E93A 1FXQA 4UTIA 2CU0A 4HN4A 2CLOA 3PSVA 4NNAA 3BGGA 1P0KA 1TIMA 1JJKA 2A1YA 4OHQA 3MI3A 3CM4A 1HG3A 4WY0B 3NG3A 3WK3A 4A2RA 2H6RA 2E6FA 4NUWA 1SO5A 1P4CA 2ATSA 3B05A 5FI8A 3UWUA 2QCDA 3A23A 2VFEA 1NSJA 3SECA 3NL5A 2P10A 3MWAA 3ZWTA 3OHIA 1J4EA 1WV2A 1GTHA 5G2IA 3G24A 3V1PA 5FEWA 2ATMA 2V2HA 3EXTA 4RKAA 1A50A 4N9BA 3D0CA 3NQ2A 1LOQA 1THFD 3B03A 1OHLA 4AH7A 2B7OA 5LNRA 3WK0A 3QMRA 4UTWC 2YCEA 3O15A 3PBYA 1F74A 3IVUA 5D2WA 3ZS4A 1JULA 5F1VA 4PC8A 4R33A 4N9DA 4JTTA 2GJNA 4MLJA 5DCDA 2CLEA 4QM1A 1YTDA 3CWOX 1A5CA 2Y62A 2H90A 2GQ8A 3LBMA 5F2IA 3EB2A 4QNWA 1FWTA 2VEMA 2ISWA 4DF1A 3QMTA 5F1UA 3CB8A 2QCCA 2RDWA 1U5JA 4O13A 1EA0A 1J5TA 5LHFA 1ML1A 3HGJA 3STGA 4AHOA 1JCMP 4ORMA 1LOLA 1LLZA 3B06A 1WDWA 1SPQA 2V5BA 2OX1A 1GVOA 1UCWA 2QJGA 1H5YA 3TSBA 3SFKA 5KITA 2NX1A 1KW1A 1JR1A 3FFSA 1QPQA 4LWWA 4OGZA 2NLIA 3OVQA 5FF2A 4MLRA 1VJIA 1CW2A 4I7UA 4CQ9A 3QPZA 3P60A 4JS3A 5DCBA 4NX0A 3S1VA 2IQTA 2DORA 1M7PA 3VKJA 2H3DA 3CC1A 4J9JA 4AHQA 1S5VA 2E6AA 3PVFA 3LXCA 4HPJA 2JK2A 4Y90A 1SZGA 1H7PA 3O07A 4DXVA 3TU9A 3C2OA 5G1YA 2NUXA 3CHVA 1YADA 3LHVA 4LS0A 1VYSX 2CLMA 1XUUA 1FCQA 1W31A 1RQEA 1UB3A 3PBWA 5K9CA 3GKAA 1KFBA 4FX7A 3NAVA 1W1ZA 1W5QA 3LBCA 1G4PA 1FWSA 2YXGA 1A5AA 1ZJIA 1M6JA 1QOQA 2AAMA 4AWUA 1OFOA 1TPWA 4JY9A 1TPH1 1VGAA 4LV4A 2QJHA 2QUUA 3IIXA 1TPVA 4Y6GA 2V8ZA 1EUAA 2R14A 3HPXA 1EX5A 1TTQA 2WSYA 4QAIA 4MZYA 3W1PA 1BWKA 4TMBA 3L9CA 2OMAA 1LOSA 1KLZA 1S3HA 4YCOA 1LRTA 3BK0A 5EKYA 1MEWA 3DAQA 4BI6A 3BG5A 3S42A 4O10A 1G6CA 3UZ5A 3CQ0A 2FLIA 1DOSA 4NJKA 1LBFA 3RLVA 3Q2DA 1KA9F 4FIRA 3G3DA 1R2TA 2GUUA 4WX2A 4R34A 4PFMA 1IXOA 5FEXA 3W7DA 3Q94A 1AW5A 2EPHA 3DFOA 4AF0A 1ZFJA 3A21A 3G1AA 4U4MA 1FWWA 6TIMA 2DJXA 2YGYA 4R53A 1L2UA 4TIMA 3I68A 3USBA 2NXGA 3DFPA 2J9ZA 1GYLA 3HIJA 3OVRA 4RZ6A 5EY5A 3RFAA 4B5NA 4UR7A 5AHLA 4OQVA 1LBLA 3B0VC 1GVFA 2DZVA 3BW3A 1GTEA 3LLFA 2AQWA 3N73A 1NFBA 2VC6A 1JCNA 2GVJA 3MYOA 4YMZA 4HSNA 5D38A 1N8FA 1QO2A 2FB3A 2DZPA 4N4QA 5CZJA 3UPBA 3W7LA 4GUFA 3HG3A 3L66A 4O17A 4JIQA 5TQLA 1JCLA 4GBUA 4O4WA 1QNVA 3I65A 1MEIA 4ZQMA 4RV8A 1XL9A 4XTDA 5H2ZA 3IVTA 1WA3A 2ALDA 4HHPA 4K39A 4UUIA 5C5YA 4FNQA 1SW0A 3C0JA 3NQMA 3LCIA 1I8JA 1H1YA 2BX7A 2PE4A 1W5MA 3ABRA 4MJZA 3TX9A 4KFNA 1FDYA 1FBAA 1YTKA 1GQNA 3MJYA 2YZRA 4OWGA 4GJ1A 4WQ6A 3LHUA 4K36A 4Q4KA 3DXIA 3W7MA 1GZGA 3BW4A 3L0GA 5L6UA 1C29A 3SR7A 1D9EA 3CLMA 3TJLA 5AHMA 3LX9A 3UY7A 3R12A 1LYXA 4JDYA 4AHPA 2W6RA 2ZZ7A 3GR7A 3A5FA 1UJPA 4XQ6A 3W7JA 1N55A 3NL3A 4O15A 2Y7DA 4M5PA 4RR4A 4EVZA 2JGQA 1DV7A 4N2YA 4JR5A 1F05A 1KFCA 2HS8A 1WX0A 5T26A 3ANYA 3N9SA 1TPB1 3LTSA 1EPXA 1H50A 1RQHA 3L2IA 4LRSA 3UXDA 2QUVA 4OU1A 5D05A 4MUZA 1EWEA 3UPWA 3E12A 3E49A 4LUIA 3TJXA 1LDCA 4HT3A 3G0XA 1ZHAA 1R47A 3GZ3A 3LCGA 5C6MA 1SZFA 3P62A 3TIMA 3W2LA 5LSMA 2H8XA 2A7NA 4MVAA 1ME7A 4JD4A 4LC8A 2J88A 4LT9A 1Q6RA 4RX0A 3G22A 1W5OA 2VEPA 3NL2A 3NQDA 1ZALA 2QUTA 3EEGA 4DBEA 3I7SA 3M7WA 1OX6A 1LBMA 4RCXA 5C2XA 2G5WA 3PBVA 4IOTA 1VR6A 1B57A 5D03A 2JKEA 1SO4A 2B4GA 2J6XA 1QR7A 2TSYA 2CLHA 4PEKA 2Q8LA 2EHHA 5LGZA 1CX9A 1GG0A 1ZAHA 3BV4A 3IIZA 3PUOA 4IQLA 4BF9A 5C55A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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