3S9NC

Complex between transferrin receptor 1 and transferrin with iron in the n-lobe, room temperature
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
674
structure length
511
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYDKSDNCEDTPEAGPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSDVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title How the binding of human transferrin primes the transferrin receptor potentiating iron release at endosomal pH.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Transferrin receptor protein 1
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 115
structure length 511
sequence length 674
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3s9nC02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3s9nC01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3s9nC03
3W9WA 3IO6A 1A8FA 4HS7A 4PP0A 4FORA 4YKPA 4MLVA 3G3JA 3QXMA 3UORA 3HCQA 1JETA 3DP6A 4FEDA 4XKQA 1EZOA 3IO4A 3MPLA 2PT2A 5L9OA 1MH3A 4YMBA 4NEDA 4ZECA 2Q2CA 3U92A 1AIVA 1LLSA 4FATA 3MVWA 1PB9A 1LB9A 3ZS6A 2I6EA 1D9YA 1JQFA 4F29A 2I49A 4OXVA 5KDTA 4QFLA 4EF2A 2CZLA 2B3FA 1UQWA 1M5EA 4AB5A 1QKAA 3OO8A 3MW0A 3OO6A 3HN0A 1QVSA 3VDFA 1MXUA 1GGGA 1I6BA 1MM6A 3SEUA 5AA4B 1B5HA 2ZNSA 5CMKA 4PQJA 1RKMA 4R74A 5CM6A 1VFDA 3O28A 3WAEA 3KOSA 4GL8A 1DMBA 1NNFA 5H8FB 4GIZA 4Q30B 4M4GA 1GR2A 3OMBA 2H5YA 3S9LC 5JTYA 5KCJB 3LSLA 1MXYA 5TU0A 1LSTA 3G7WA 1NH8A 4JSDA 1B7ZA 4DXCA 1SBPA 1LBCA 3KOTA 1IITA 3OEMA 1MQIA 1SW4A 4KYSA 4H0WA 1PEBA 3T93B 4LZ8A 1MQGA 1OVTA 1UTHB 4YB5A 1AL3A 4OTEA 4ONYA 1DTGA 4GL0A 4M1VA 3U94A 1QJMA 2DXRA 4IGRA 4LP2B 5HBCA 5ELVA 5DT6A 3GZGA 3Q28A 1FW0A 1Y1ZA 1R6ZA 3L6HA 4U1ZA 1A55A 1D3KA 1I6AA 3FZVA 3O97A 4N07A 3TQWA 5KDTB 4LQ5A 2WKYA 3MZ9A 3AXFA 1FTLA 3GBAA 2CMOA 1R9QA 4QRZA 4NF8B 1B5IA 3VFJA 1LGBC 1LAXA 3FXUA 4NF5A 5AA2A 3KZGA 1FQDA 4ZEDA 1US4A 3FVNA 5I59B 1FQEA 2PVUA 4ND9A 3O9PA 1IQ7A 4G68C 2F6PA 4IY5A 3KN8A 4WEPA 1R1NA 2GFEA 1URDA 3IOWA 5EHMA 1LFHA 3SKPA 1MXXA 4OERA 2W7YA 1II5A 3I6VA 4G77A 5DEXA 1URGA 3MP1A 3S2VA 2PT1A 4GFRA 5LOMA 4GXAA 5DVJA 1OLAA 1OVBA 1XC1A 2R9JA 1P1QA 3MC2A 4EQ7A 2G93A 5JTYB 4TQUQ 1VE4A 4KCCA 1IIWA 1US5A 2HAUA 1B3LA 2OJTA 1KWHA 4IO3A 2GHBA 2DWHA 1JVYA 4JDFA 1UIUA 1LFGA 1B5JA 1YTVA 3PMVA 4I62A 4H65A 1ZJLA 4KYDA 4X1DA 3CIJA 3PPNA 3SETA 2X26A 1UIVA 3K2DA 2H99A 1A8EA 4RYAA 3MVXA 5I2NA 4U4XA 4OFOA 3N94A 3RTWB 3PD9A 4PFYA 2R71A 4RK9A 2XXUA 2XXXA 4GRKA 2ZNTA 5F7VA 4HCYA 3SERA 4QSCA 3PUZE 2I58A 2XXIA 5JEIA 4NWCA 2O6AA 1J1NA 1NKXA 3G3HA 3W9VA 1N76A 1IXCA 5I2KA 3CR9A 2DOJA 4IB2A 1OLCA 2QSXA 2XXRA 4KHZE 3T22A 4GOTA 3TMGA 4IO2A 5DEXB 2F7AA 1QUJA 1GVCA 3MPKA 5CMCA 4N13A 2QS4A 3L6GA 4R75A 3PPRA 4ZS9A 1B9JA 3W15C 3V8XB 2O68A 4MFIA 3UGWA 1MM7A 1B3HA 4HTGA 3TKDA 1TT1A 4UA8A 3S4UA 1OMPA 2FYIA 3UP9A 4OEVA 3RLFE 2A5TB 3TCFA 3F11A 4R6KA 5JK4A 1GTKA 1MXWA 1BTJA 3TODA 4TLLB 4ESWA 5L9MA 5M2VA 1FQBA 3TCGA 1FCKA 1OQGA 3FJ7A 1ZU0A 1P99A 3VE1B 4YKIA 2HEUA 2DS9A 4H8JA 4OHNA 4EXKA 4GVOA 5I2NB 3T9XB 2XXTA 3PUWE 1N3XA 3P7IA 1HSJA 3G3FA 4JWXA 3T96B 3IL1B 1O64A 5H8NA 2I4CA 5AA4A 4U22A 5TP9B 2VP1A 3O2AA 4F22A 4WKMA 5I56A 2UVIA 1MDQA 4OZ9A 3Q25A 4Q5TA 3BFUA 5I2KB 1MY1A 5CI5A 4YZZA 4MLQA 3MP6A 4QF9A 4OWDA 4FEBA 4YMAA 4H5FA 3G3GA 4PFTA 1PB7A 3GLBA 1B58A 3RPWA 2XXVA 1POTA 4F1YA 1IZ1A 2F97A 5DYHA 2YPNA 1B3GA 1ELJA 3G3KA 1LCTA 1S9TA 1B4ZA 4AQ4A 1Z7ME 1MPCA 3OOAA 1UTHA 2Y7PA 4G8MA 2D5WA 3LSFB 1SD3A 2DE3A 4IO6A 3FV1A 1OQHA 2UXAA 3T9VA 2DQVA 3G3IA 4JB7A 1Y9UA 1QUKA 4P0IA 4EF1A 3FIRA 3S9MC 4NF8A 2RCAA 3PPOA 3IJOB 4GD5A 3CFXA 2HXWA 1ZBMA 4HCWA 3KBRA 1EZPA 2F78A 5H8NB 3HO7A 4G68B 1JEUA 4JXIA 2I0BA 5I59A 5L9SA 4F3GA 2HQ0A 3TTNA 2PBWA 2RC8A 5I56B 3TCHA 1B1HA 2XX7A 2FA7A 3H03A 3RY3A 3QIMA 3SEXA 3RT6B 4OETA 3Q27A 4JBZA 4ECFA 1NNKA 4R9FA 2D3IA 3B6QA 3ZKLA 1QULA 2F35A 1HSLA 3KFMA 4PFUA 3MBPA 3PUYE 1B51A 4BDMA 1A40A 3DP8A 3MAMA 3IORA 1I69A 4NE4A 3IB1A 3PPQA 4ELOA 4QFNA 1SVXB 1P1UA 4I9DA 4R6YA 3MJNA 1Q1KA 4OFJA 4FE8A 4RK2A 5IKBA 4YAHX 3C35A 2F8DA 1N3WA 4QSEA 2XXHA 2ZNUA 4N6PA 3FJGA 5EHSA 1H3DA 4FECA 1B2HA 5BWJA 1FQFA 1ATGA 1SW2A 2ABHA 3CRBA 1O7TA 4FJPA 1YCJA 3IB0A 1SQYA 3A3UA 1USYE 2ESNA 3PU5A 1T0KA 4EDPA 1R9LA 5H8HA 4NF4A 4R72A 3BFTA 5A5XB 3N6UA 3RT8A 2Y7RA 3QAXA 1FTMA 3EQ1A 4ZE9A 4F18A 1B0LA 5B70A 4OVJA 3MQ9A 1N7WA 4IGTA 1DPEA 4G4PA 4E0XA 1Y3PA 2OLBA 5ITOA 4ISUA 3K6VA 4OYVA 1L5TA 2ZYMA 3SEVA 3LUYA 5ISUA 1Y1MA 1MS7A 3K6UA 2NVUB 4F3BA 1NMUA 1H45A 3FV2A 3FASA 3K02A 3FJMA 1ANFA 4R6HA 4JSOA 5KZTA 1FTJA 3IK6B 2KLFA 4LZ7A 2B65A 3B7DA 3IB2A 3PMXA 1AMFA 2YLNA 3HPIA 3UN6A 2A5TA 1JEVA 1B05A 1BKAA 3IX1A 3B6WA 2REGA 5K2XA 2NOOA 2AYSA 3QSLA 2THIA 2O1LA 4KD5A 3DLNA 4TLMB 1MPBA 1NL5A 2ZYNA 3TAJA 1B52A 3Q26A 1NNPA 1NFTA 1MQJA 2V3TA 4Q8RA 3ILUB 5CRYA 2HZKA 1HSEA 3VV5A 5DVIA 1EZ9A 3UA8A 1P1NA 4MBPA 5FTIA 5H8HB 4NF4B 4YU0A 4H8IA 1SI1A 3KN3A 3KSJA 4U21A 5TPAA 4O3BA 2DSFA 5ITPA 3CFLA 2QRYA 2HCAA 3QUFA 1H76A 3O6IA 5TP9A 2F7BA 2O7UA 2O51A 3GXAA 2UYFA 4X48A 1NNTA 3KJTA 4OESA 1QW0A 4KPTA 5AE4A 4QFKA 1B3FA 2Q2AA 1PBPA 1B7HA 3EHUA 4RXLA 3VLVA 3C4MA 4FAJA 1H44A 4PETA 1D9VA 4KR5A 2ONSA 3QUJA 1MY2A 2VD3A 1ZMGA 4IO4A 2XXQA 1LAHE 3M8UA 3OENA 5CMMA 2V25A 1N84A 3ZKKA 2ALUA 2OZZA 3T9UA 3H6UA 4RNSA 3C9HA 2ANJA 3O6HA 3EHTA 1Q35A 2GRVA 5DTBA 1P1OA 3T66A 4Z7EA 1UTBA 3SDFA 2H98A 1LCFA 3OEKA 4YB7A 4U1OA 2V84A 3C31A 3ODBA 4DDDA 3RN8A 3K01A 2OK2A 4F31B 1AH5A 2XHDA 4I1DA 1TFDA 1PDAA 2IEEA 3H6TA 3MVZA 4LQ2A 2RINA 3IOVA 4ELPA 4LZ5A 4R2BA 3D4GA 3HHGA 3OELA 3ECRA 4H6DA 4TOZA 3K6XA 1S7YA 5H8SA 1POY1 4Z0IA 3MUQA 1LB8A 2AL4A 2QJEA 2I48A 2UVJA 3TTLA 3FATA 3OO9A 3FXQA 2REJA 3PMWA 3ZSFA 2Q89A 2Y84A 3PGFA 1F9BA 2AIXA 2DWJA 3R6UA 2O84X 2VGQA 5FHOA 3TTMA 1MPDA 3Q29A 3T9HB 5TPAB 2XD3A 4G68A 5H8QB 4R9GA 4P11A 3C36A 3JZJA 5AA1A 3KEIA 3H7MA 4X1BA 1TWYA 3CSBA 4F39A 1M5FA 5AA3A 2Y7KA 4MH5A 4XXUA 3C33A 2O69A 5I57A 3O6GA 2RC9A 4R2FA 3VXBA 4DXBA 3RQTA 2UYEA 5CC2A 4WEDA 4RA1A 1A99A 3TFLA 2XXPA 5CBRA 4QSDA 2ZYOA 4LUBA 2VD2A 4NF6A 1B7UA 4LONB 2DP8A 2F6GA 3FVKA 1ZTYA 2AL5A 1UTBB 3H4ZA 4K3FA 4NTLA 3CSGA 3MZBA 4C0RA 2ONKE 3UK4A 4BLAA 1VSOA 1SW1A 1PB8A 3I3VA 2DYXA 3C34A 4POWA 1SDXA 2QS1A 5F1QA 2NXOA 3RNNA 3LC8A 3KN7A 3V89B 2QMXA 3A09A 2H4IA 4ZEIA 4OFLA 4F3PA 1JNFA 4U4SA 4YB6A 3TELA 4F1UA 4ESXA 1Y3NA 1SW5A 3LSXA 5A5XA 1XHYA 2DWAA 1D4NA 2OCUA 1WDNA 1I6QA 4FIMA 3OO7A 3PV0E 3GBBA 2VOZA 4ZEKA 2XD2A 1TXFA 3E13X 4OEUA 2O7IA 4DLDA 3EHSA 4QFPA 1URSA 3DELB 5FHNA 4EUOA 3PUXE 4G8HA 4LATA 3V83A 4QHQA 1A54A 2F5XA 5I57B 1RYOA 1GV8A 3SEWA 4ZZAA 4OQOA 3K1MA 4H67A 3H6VA 3BBRA 3B6TA 3M3KA 3E9XA 4RPOA 3UIFA 3MP8A 2RKMA 4GWOA 3S9EA 1MDP1 4NF6B 3PUVE 3U72A 1IEJA 3C32A 4WXJA 3K6WA 2F34A 2Y7IA 4I8CA 4R73A 3U1OA 3E3KA 2H9BA 2YJPA 2XXYA 4BDOA 1ZKBA 1SI0A 3DM0A 4LVQA 2RF1A 2I0CA 3OXNA 3QK6A 1N7XA 5ICQA 4P0GA 4EQ9A 2V3UA 4XKPA 2OWTA 4O3CA 4JWYA 2Z23A 2ONRA 2RCBA 1Y4CA 4XTCQ 4DE8A 1SYHA 3EPEA 1MQHA 4F1VA 1B40A 2Z8DA 1FTOA 3O29A 4KQPA 2I3VA 2E0SA 1XVXA 4PE5B 3M3FA 1N0TA 3FVOA 2DE4A 1SYIA 3CI8A 1B3EA 5L8DA 1LAGE 2DE2A 1IXIA 4DZ1A 4BDRA 1B1XA 3I5OA 2NUVA 5FTHA 3JV9A 3SEYA 3CFZA 2DVCA 1DPPA 1MQDA 4ZEBA 3FXRA 1DSNA 3PD8A 3OSQA 1B46A 3R7XA 5I58A 1DTZA 1LAFE 2PX1A 1EU8A 1Y20A 3JYRA 3TZAA 2I4BA 4L17A 4BDNA 1JW5A 4H1XA 2Y7WA 1XT8A 4KI0E 4H5GA 4JWOA 4NMYA 4U2RA 4IO7A 2Q8JA 3LBSA 3OD7A 4G8NA 4GLIA 3O66A 1BLFA 4F3SA 1ZIUA 1H43A 5DVFA 1B6HA 3CG1A 1JVXA 4BDLA 1S50A 3VVFA 3TEPA 4XIGQ 2D21A 4DXUA 4U23A 3VVDA 1DOTA 2HZLA 3TYHA 4OENA 4DCYA 5IAIA 4XKRA 1JW1A 2OWSA 2V93A 3CG3A 2IA4A 3ONMA 1CB6A 1LFIA 4RY1A 5HPQA 1QUIA 3N6TA 1M5CA 2E1SA 1VR5A 4LA9A 3DP4A 2PYYA 3E4RA 3RUMA 1VFEA 1B32A 2QPQA 3U93A 2XX8A 5B7DA 3TUSA 2HFBA 4GF8A 4GXSB 4KFQA 4RJZA 3VLWA 3TTRA 3R26A 2XX9A 1IXHA 2M8CA 2Z8EA 4DIGA 1P1WA 3V5AA 1CE2A 2H25A 4C1UA 1ZLQA 2UVHA 5H8QA 4C1TA 3EN3A 4YKJA 3SESA 3KGCA 1WVJA 5EYFA 3IR1A 2NWJA 3LR1A 5FHMA 1AOVA 3D4CA 2FNCA 2DVZA 4ZE8A 3U8QA 2ZYKA 2R6GE 4PFWA 5I84A 4G2ZA 5HM4B 4ZZEA 3H6WA 5CMBA 2A5SA 3KG2A 3VVEA 5I58B 4KYEA 4NF5B 5AA2B 1M5DA 1XOCA 3K00A 3M3LA 3MWBA 1NH7A 2G29A 4ZEFA 1MY3A 3A3CA 1MG1A 3VLUA 1QKBA 4EQBA 3IOTA 5ICTA 2PMSA 1PC3A 3HV1A 3QYTA 2QS2A 4YKKA 1OIBA 3THIA 1XS5A 1MXVA 3USDA 4YICA 2P0SA 3HSTA 5J1DA 1EH3A 2XXWA 2P2AA 4ELQA 3K1NA 4IO5A 4Q0CA 1MY0A 1Y4TA 2O1MA 3IJXB 3S9NC 2X7QA 3VXCA 1A7LA 4EXLA 1XVYA 3K4UA 1MH4A 2QMWA 2ZMBA 2OBGA 1MXZA 4IY6A 1B4HA 3N26A 4MF3A 4E0WA 2BJJX 2B3BA 3TPAA 4POXA 5K2YA 2LAOA 2V3QA 3FVGA 4ZDMA 1IUDA 4OMBA 3LSWA 4XKNA 4ELRA 3IAZA 1FTKA 3H06B 1BP5A 1BIYA 1FQAA 3K1PA 2Z22A 3EF7A 1MY4A 4F19A 2QL3A 3FUZA 5BUUA 1B0HA 4HW8A 3ILTB 4KCDA 3RTFB 2HAVA 1LBBA 2P1SA 2UVGA 2GHAA 4GQOA 5CBSA 3MZ1A 3TTKA 3IOUA 4X9TA 3PPPA 2X7PA 1N04A 1USYH 3FGSA 2F36A 2RC7A 1JW4A 1YPNA 4DCXA 1WODA 1TFAA 4NWDA 2Z8FA 3CVGA 1RYXA 3MVYA 3TQLA 2QS3A 1Z7NE 4QFOA 2F7CA 1FQCA 1M5BA 2GH9A 2VHAA 3KSXA 1Y3QA 4RPNA 3N5LA 3BKIB 3WAFA 4UACA 3KJ7A 2DXYA 5H8FA 2Q9TA 3RGYA 1O63A 1IXGA 1YAEA 1PBQA 3OSRA 3TDJA 1MRPA 4BDQA 5KCJA 2Q88A 3FD3A 4F2OA 3K0VA 2I3WA 4F2QA 5AA2D 4O3AA 4AB6A 3HHFA 4THIA 3H3GA 2ZXTA 2DWIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3W9WA 3IO6A 1A8FA 4HS7A 4PP0A 4FORA 4YKPA 4MLVA 3G3JA 3QXMA 3UORA 3HCQA 1JETA 3DP6A 4FEDA 4XKQA 1EZOA 3IO4A 3MPLA 1NV4A 2PT2A 5L9OA 1MH3A 4YMBA 5LTCA 4NEDA 4ZECA 2Q2CA 3U92A 1AIVA 4PC9A 4MMPA 1LLSA 4FATA 3MVWA 1PB9A 2QVUA 2CZIA 1LB9A 3ZS6A 2I6EA 1D9YA 1JQFA 4F29A 2I49A 4NF0A 4OXVA 5KDTA 1NV2A 4QFLA 4EF2A 2CZLA 2B3FA 1UQWA 1M5EA 4AB5A 1QKAA 3OO8A 3MW0A 3OO6A 3HN0A 1QVSA 3VDFA 1D9QA 2FVZA 1MXUA 3T0JA 4N15A 1GGGA 1I6BA 1MM6A 3SEUA 5AA4B 1B5HA 2ZNSA 5CMKA 4PQJA 1RKMA 4R74A 5CM6A 1VFDA 3O28A 3WAEA 3KOSA 4GL8A 1DMBA 1FJ9A 1NNFA 4GWSA 5H8FB 4GIZA 4Q30B 4O94A 4M4GA 1GR2A 3OMBA 1EYKA 2H5YA 3S9LC 1FBEA 5JTYA 5KCJB 4P3LA 3LSLA 1MXYA 4PFRA 5TU0A 1LSTA 3G7WA 1NH8A 4MNCA 4JSDA 3BIGA 1B7ZA 4DXCA 1SBPA 1LBCA 3KOTA 1IITA 3OEMA 1MQIA 5EQAA 1SW4A 4KYSA 4H0WA 1PEBA 3T93B 4LZ8A 1MQGA 1OVTA 1UTHB 4YB5A 1AL3A 4OTEA 4ONYA 1DTGA 3RPLA 4GL0A 4M1VA 3U94A 1QJMA 2DXRA 4IGRA 4LP2B 5HBCA 5ELVA 5DT6A 3GZGA 2JJKA 3Q28A 1FW0A 1Y1ZA 1R6ZA 4N4UA 3L6HA 4U1ZA 1A55A 1D3KA 1I6AA 3FZVA 3O97A 4N07A 3TQWA 5KDTB 4LQ5A 2WKYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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