3S9NC

Complex between transferrin receptor 1 and transferrin with iron in the n-lobe, room temperature
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
674
structure length
511
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYDKSDNCEDTPEAGPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSDVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title How the binding of human transferrin primes the transferrin receptor potentiating iron release at endosomal pH.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Transferrin receptor protein 1
total genus 115
structure length 511
sequence length 674
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3s9nC02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3s9nC01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3s9nC03
4GD5A 3G3HA 2WKYA 3O6HA 3VDFA 3U8QA 4ZECA 1B32A 4X9TA 3RT8A 2Z8FA 5JTYA 5IAIA 2ZNTA 4L17A 1LAFE 1FQEA 4IGRA 3PU5A 1NNFA 2RINA 5TP9A 1MS7A 1LSTA 4YMAA 1US5A 3PPOA 4TLMB 4FAJA 2DWJA 2KLFA 1MQHA 3CR9A 5HPQA 3RUMA 1OLCA 3G3IA 4GWOA 4F22A 3MVYA 4NWCA 1JW5A 3FVNA 2O1LA 2Y7IA 3T9UA 5H8SA 1SVXB 1MDQA 1B7ZA 1XOCA 1BIYA 1N3XA 5I56B 2PT2A 4ZS9A 1J1NA 2V3QA 4XKRA 3FVKA 4YZZA 2F34A 3GBBA 3CSGA 5AE4A 4ONYA 3O66A 3F11A 1YAEA 3BFUA 1LAHE 1LBBA 1MXXA 1N7WA 1B58A 1LFHA 5I56A 4JB7A 4EXKA 4DXCA 1YPNA 4U21A 4XKPA 3TCHA 3DP6A 1TT1A 1EU8A 2ANJA 4RK2A 1DTZA 3GLBA 3QUFA 4FATA 2W7YA 2XXYA 4R6HA 1QW0A 3C4MA 2QS1A 1Z7NE 1CE2A 1B3EA 3E3KA 4THIA 4NF4B 4F3BA 1NL5A 1M5CA 4ESXA 1II5A 2ONSA 4ZEDA 3ONMA 5FHNA 1AMFA 4NF8B 1N84A 3N94A 4RYAA 3IOVA 5FTHA 3KSXA 4LQ5A 1B2HA 4R72A 4WKMA 1OVBA 4H65A 3I5OA 1P99A 3O29A 3ZKKA 4NF4A 2M8CA 5FHMA 3AXFA 2UYFA 3H6WA 2NWJA 1B1HA 4C0RA 2O1MA 4NF8A 2UYEA 3RTFB 1DPPA 1F9BA 4N6PA 3TTMA 3V5AA 4F1YA 1B5IA 5I59B 1B3LA 1MG1A 3RTWB 1N3WA 3OOAA 4PQJA 1P1QA 3MQ9A 4OYVA 1HSEA 2YJPA 1ZIUA 5L9OA 1A99A 1HSLA 2PT1A 4BDMA 3O28A 3PMXA 3HCQA 5HM4B 3QK6A 1OLAA 3V8XB 1CB6A 4NTLA 4XIGQ 3IX1A 3K2DA 5I59A 1PBQA 1FTKA 3S9MC 4F2OA 2XXUA 1PB8A 4OWDA 1PEBA 4KYEA 3K1MA 5TPAB 3FGSA 1WDNA 3KJTA 3K1PA 1SW4A 4NE4A 4LP2B 1GR2A 1B40A 1FQBA 4ZE9A 2HZKA 5EYFA 2D21A 2RCBA 1NH7A 1B4ZA 2XXWA 3KZGA 2UVIA 4IY5A 3MZ1A 3V89B 4KYDA 1FQCA 5CRYA 3EHSA 4EF1A 1B51A 3KN3A 2XX7A 5BWJA 5DVJA 5TPAA 1B4HA 3PGFA 4YKIA 4YMBA 1I69A 3OXNA 4LZ7A 2ZYOA 1LAXA 5A5XB 3A3CA 3HSTA 2NXOA 3S4UA 4YU0A 2AIXA 2VOZA 3CFZA 2B3BA 3OO9A 3OEKA 1URSA 1US4A 1Q35A 4TLLB 4KYSA 2Y7WA 4RY1A 3PUVE 4WEDA 1LFIA 4OETA 1FQAA 2DOJA 5H8HB 5A5XA 1FTOA 1A55A 4FECA 2Y84A 3H6UA 4EQ7A 3PUXE 3OMBA 2DP8A 1Y1ZA 2P1SA 3ECRA 2O7IA 4EUOA 4ISUA 3B6WA 4JXIA 4NEDA 3FV2A 2NUVA 1P1WA 4F3GA 4K3FA 3RPWA 3CFLA 5H8HA 4GXSB 3LUYA 4AB5A 3N6UA 1IITA 4R74A 4BDLA 1LBCA 5B70A 4OEUA 1RKMA 1GVCA 5ISUA 2H98A 4RXLA 1H3DA 2V84A 2RKMA 2R71A 3D4CA 2GHAA 1XC1A 1TFDA 4ZDMA 1FCKA 3PV0E 3IOWA 3CVGA 3M3FA 3E9XA 3WAFA 5KCJB 1H45A 4OENA 3PPPA 4R9FA 3TTKA 4KQPA 3LR1A 2XXQA 1QUJA 2H99A 5BUUA 4I9DA 1B1XA 4PE5B 2NVUB 2ZMBA 1UTBB 4ELQA 4GL8A 2HZLA 1H44A 4F31B 4F19A 2DWIA 4TQUQ 4ZEFA 5LOMA 4YAHX 1R6ZA 2NOOA 3PMWA 2RC9A 5CBSA 3QXMA 4GQOA 1OMPA 4F39A 1JW4A 1FQDA 4C1UA 2F35A 3I6VA 4ECFA 1DPEA 1UTBA 1IXHA 2DVZA 2Q2CA 2QL3A 3QYTA 3PUWE 2I3VA 4KFQA 1B7HA 1JNFA 4TOZA 3SEVA 1I6QA 4FE8A 3V83A 1LB9A 1MM7A 1JEUA 4OESA 5IKBA 4GIZA 4JWXA 3PD8A 3VFJA 3FXUA 3MPLA 4E0XA 5DTBA 4UA8A 3IB0A 5ICTA 4JSOA 5H8NB 2HXWA 1NH8A 1MQJA 3O97A 4HTGA 3K0VA 1BKAA 1PBPA 2UVHA 1VE4A 2Z23A 3MUQA 3IJXB 4EQ9A 2VD2A 3H4ZA 3UK4A 4H5FA 5CI5A 1MXYA 3MVXA 4U1ZA 1O64A 3BBRA 1JEVA 2F5XA 5DT6A 3SESA 1DSNA 5H8NA 3K00A 5ITPA 2UVGA 3TZAA 3B6QA 4BDOA 4RK9A 3TYHA 2F7CA 5I2NB 3TTRA 4R2FA 3KOTA 2OZZA 3OELA 4GOTA 4LA9A 4LATA 4H8IA 3K01A 1MXWA 5CC2A 3OO7A 2RCAA 3RLFE 1LLSA 3S2VA 4GL0A 3TAJA 1H76A 2OWTA 1M5DA 5I2NA 4RNSA 1Y1MA 2RC7A 1FTJA 2LAOA 3M3LA 2XXIA 4OTEA 2I4CA 4IB2A 2AL5A 1B7UA 3G3KA 3FIRA 3FXQA 1SW2A 1NMUA 2DSFA 1NNKA 5F7VA 3DELB 5HBCA 2E0SA 4C1TA 2XXHA 1BP5A 1QVSA 4PFTA 1Y3PA 4ZEKA 4DXBA 3I3VA 4H1XA 1P1OA 3DP8A 4MF3A 4BDRA 1GGGA 3BFTA 1URGA 4U2RA 4DLDA 1MDP1 3PUZE 4FEBA 3ZS6A 3G3FA 2GHBA 4F3SA 5DVFA 2IA4A 4NWDA 5CBRA 2DVCA 4WXJA 1A8EA 3FASA 3OO8A 4FEDA 2FA7A 5TU0A 4LONB 3CFXA 1A7LA 4Q5TA 3VLWA 4Z7EA 4P11A 1MY0A 2DXRA 3C36A 1NFTA 2PMSA 1N04A 3EN3A 1IXGA 3C31A 2YPNA 2F7BA 3C34A 1IZ1A 1S50A 3IJOB 4ND9A 3MP8A 1A40A 4PFUA 4FJPA 5K2YA 1RYOA 4YICA 1MQGA 1PB7A 1HSJA 4HCWA 3C9HA 3QUJA 3B6TA 3O2AA 5AA2D 4EF2A 3VXCA 2O7UA 1AIVA 3FV1A 4F18A 2I6EA 3D4GA 3KFMA 1SI0A 3S9EA 3T9XB 4IO7A 1B9JA 4NMYA 3IB1A 2XD3A 2HEUA 1VFDA 3CG1A 1VFEA 3IL1B 5EHMA 4KD5A 1B52A 3MAMA 2ZXTA 1IUDA 2ESNA 5CMCA 4Q30B 3C32A 3U72A 4EXLA 1SI1A 1NNTA 3Q28A 3PMVA 4F1UA 3VXBA 3ZKLA 1I6BA 1FQFA 5CM6A 3L6HA 4N13A 2F78A 1DTGA 1IIWA 2DE4A 1MPBA 3TMGA 2DWHA 2ABHA 2PBWA 3UP9A 1FTMA 4LQ2A 1P1UA 1JVXA 3TQWA 2UXAA 4PETA 5L8DA 3LSLA 5H8FB 3HO7A 4NF6B 2GFEA 2HCAA 1USYE 2QS4A 4GVOA 1B3GA 4MFIA 4DZ1A 4OQOA 1MQDA 4DIGA 1ZBMA 2R9JA 4F2QA 1H43A 1MXVA 3UORA 3QSLA 2RF1A 1B6HA 1UIUA 4BDNA 2Q9TA 4QFKA 4H5GA 1LCTA 4FORA 4NF5A 3JYRA 5H8FA 1FW0A 2X7PA 3G3GA 2ALUA 4NF6A 3SKPA 1MPDA 1POTA 3K1NA 1JW1A 4R75A 3KJ7A 3PD9A 4GRKA 1NNPA 4OFJA 4RA1A 3FJGA 4ZE8A 4I8CA 3N5LA 3M3KA 4H6DA 2PYYA 3KN8A 1DOTA 2F6GA 3RGYA 3QAXA 2BJJX 1ZMGA 2H5YA 3O6IA 4BLAA 1ZLQA 4G77A 5FHOA 1MQIA 2XHDA 2QSXA 2QS3A 4H67A 1YCJA 5ITOA 1MM6A 5AA4A 1M5FA 3MBPA 2Y7KA 4M4GA 4X1DA 4AQ4A 5DVIA 3SERA 3FATA 5I58A 2THIA 1D9VA 4ELPA 4QF9A 5KDTB 2P2AA 5EHSA 3IR1A 1PDAA 5AA1A 2I3WA 4Q0CA 3SEYA 3FVOA 2F6PA 1XVXA 4P0IA 3T93B 3RN8A 1IQ7A 3U92A 4X1BA 4RJZA 2ZYNA 1B0LA 1MXZA 2OCUA 3H3GA 3SEUA 1EH3A 1ATGA 3T22A 3U93A 5KDTA 3OENA 4F3PA 3LSXA 4KI0E 2Q8JA 1MY4A 4OMBA 3A3UA 1JETA 4DXUA 1PC3A 4O3CA 4IO4A 2VD3A 4X48A 3M8UA 3MVWA 3VE1B 3K6WA 2XXTA 1MXUA 3ZSFA 4OZ9A 1EZOA 1JVYA 3G3JA 4H8JA 4MH5A 1Y3QA 2HAUA 4QHQA 2XXXA 2GH9A 2G93A 4R6KA 2IEEA 5L9SA 1MH3A 5JEIA 3T96B 4OFOA 3N6TA 4QFOA 1LCFA 1TFAA 1M5EA 2VHAA 4DCXA 2P0SA 3EHTA 2FYIA 4U22A 3RT6B 5AA3A 2DWAA 1DMBA 2QJEA 2H4IA 2DS9A 2ZYMA 3CRBA 2XXPA 5K2XA 3HHFA 3MP1A 4XTCQ 3EPEA 1VR5A 4YB7A 4IO3A 2G29A 3HHGA 4EQBA 4GLIA 1OQHA 3MPKA 1ZJLA 1R9QA 1B3HA 1Y20A 4UACA 4LZ8A 1Y9UA 4ZEBA 1ZU0A 2UVJA 2PX1A 3TUSA 1VSOA 3JV9A 3OD7A 3CSBA 1EZPA 3UN6A 2OBGA 2I0CA 1FTLA 5AA2B 1Z7ME 4G68B 3P7IA 4O3AA 1RYXA 4OEVA 3CIJA 3S9NC 2QMXA 4HS7A 2CMOA 1S7YA 3FVGA 4KCCA 1QKAA 3EF7A 2O69A 3OSQA 3MZ9A 1MH4A 3E4RA 1SYHA 5AA2A 3K6XA 5DEXB 1GTKA 4G68A 4MBPA 1IEJA 3MVZA 3RNNA 1QULA 4RPNA 4XKNA 4JSDA 3H6VA 2O68A 4OVJA 5I57B 5L9MA 1TXFA 3T9VA 4G8MA 1GV8A 2H9BA 4G8HA 1MY2A 3LC8A 4LVQA 5DEXA 4U4XA 2Y7RA 3H03A 3LBSA 3PUYE 2OJTA 4PFWA 3T9HB 3C35A 3MW0A 2D5WA 4JWYA 4BDQA 4G4PA 3BKIB 3IK6B 2R6GE 1LB8A 4FIMA 4ESWA 4JBZA 3IB2A 5I57A 3W9VA 3IOTA 4R2BA 4LUBA 2I49A 1A54A 4HCYA 3VV5A 4R9GA 4F1VA 1QUIA 3KOSA 4DE8A 1B05A 3IORA 3R7XA 4KHZE 1ZKBA 3MC2A 1P1NA 1N7XA 3TTLA 1MY1A 3FXRA 3UIFA 3SEWA 4F29A 3S9LC 1MY3A 4ZZAA 4POXA 3EHUA 2FNCA 1OQGA 2ZNUA 2CZLA 1B5JA 3TFLA 1SW1A 1BLFA 1XHYA 1UQWA 3RQTA 3CG3A 4PP0A 3H7MA 3FZVA 1SW5A 2QMWA 5M2VA 3LSWA 1SYIA 3W15C 1M5BA 5CMBA 4JWOA 2XX9A 1R9LA 3E13X 2RC8A 3TPAA 4ELOA 5ELVA 3IAZA 3MP6A 4YB5A 1ELJA 4E0WA 2Q2AA 3KN7A 4WEPA 4LZ5A 2QS2A 3TQLA 3OO6A 4YKPA 3T66A 4ELRA 5FTIA 1IXIA 3O9PA 4G68C 2Z8EA 3DLNA 2F7AA 3KG2A 3DP4A 4QFLA 3O6GA 4QSCA 3UA8A 2H25A 3VLVA 2VP1A 2REGA 3DM0A 1L5TA 2A5TB 1SBPA 3GXAA 3GZGA 1T0KA 1OIBA 1LFGA 5I2KB 3Q27A 4GFRA 4YB6A 4ZZEA 3TTNA 3R26A 4OXVA 3TDJA 1IXCA 4U1OA 4KCDA 1R1NA 5F1QA 4GF8A 1OVTA 2DXYA 2A5TA 4IO6A 2Q89A 5CMKA 1SDXA 1QKBA 4Z0IA 5I2KA 4I1DA 3VVEA 4G8NA 2Z8DA 3U1OA 1B5HA 3H06B 2V93A 1TWYA 4I62A 1WVJA 3N26A 4P0GA 4NF5B 4QFPA 1UTHB 1Y4TA 3KSJA 5JK4A 3ILTB 4ZEIA 4QSEA 1XVYA 3K6VA 4POWA 5KZTA 2O51A 3TCFA 1BTJA 2O84X 4R73A 2F8DA 2V25A 1PB9A 1USYH 2OWSA 2PVUA 2V3UA 1Y4CA 2F97A 1QUKA 4EDPA 3QIMA 1UTHA 4H0WA 1UIVA 2F36A 3FD3A 1KWHA 3TELA 1I6AA 4QFNA 1EZ9A 5H8QB 2XD2A 2YLNA 1O63A 3R6UA 4IO2A 2REJA 3VVFA 4Q8RA 1Y3NA 3HPIA 4YKJA 3VLUA 5AA4B 3THIA 3K6UA 5B7DA 2XXRA 3WAEA 5J1DA 2ONRA 3ODBA 5I58B 4MLQA 2I58A 1MPCA 1ZTYA 4HW8A 2OLBA 5CMMA 2Z22A 3KGCA 1N0TA 2GRVA 5H8QA 1O7TA 2HAVA 1SD3A 3SEXA 2AYSA 2X26A 4M1VA 2Y7PA 2V3TA 4DDDA 4N07A 2Q88A 1D3KA 2VGQA 3SDFA 4O3BA 4G2ZA 1JQFA 3OSRA 4AB6A 4IGTA 3HN0A 5ICQA 3JZJA 1YTVA 4KPTA 3L6GA 2XXVA 5I84A 3HV1A 2HFBA 3MWBA 4JDFA 3PPRA 3Q25A 3TKDA 2ONKE 1ANFA 2DE3A 1A8FA 3K02A 1URDA 1B46A 3U94A 4R6YA 3FJMA 2ZYKA 3TEPA 2B65A 3FJ7A 2I0BA 2E1SA 3USDA 2OK2A 2X7QA 1SQYA 3SETA 4XXUA 3GBAA 2XX8A 3TODA 4XKQA 4U23A 1Q1KA 1WODA 2I48A 5KCJA 3PPQA 2DE2A 2I4BA 3PPNA 3VVDA 3K4UA 3RY3A 1QJMA 2QRYA 3A09A 2HQ0A 3H6TA 1LGBC 4U4SA 2O6AA 2B3FA 4QSDA 3CI8A 2DYXA 4GXAA 5DYHA 3Q26A 2D3IA 3IO4A 3G7WA 1D9YA 4OHNA 4RPOA 4YKKA 1N76A 1D4NA 3MJNA 1AH5A 3IOUA 3LSFB 1XS5A 2DQVA 2AL4A 3IO6A 3ILUB 3KBRA 2QPQA 2ZNSA 1AOVA 3OEMA 1AL3A 3W9WA 4DCYA 3UGWA 3EQ1A 2A5SA 4OFLA 1B3FA 3C33A 4IY6A 5JTYB 3MZBA 4PFYA 4QRZA 3TCGA 3FUZA 1POY1 5TP9B 1B0HA 3B7DA 1MRPA 4MLVA 3Q29A 3KEIA 1LAGE 4OERA 1NKXA 4IO5A 4KR5A 1XT8A 1S9TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FPBA 4GD5A 3G3HA 2WKYA 3O6HA 3VDFA 3U8QA 4ZECA 1B32A 4X9TA 3RT8A 2Z8FA 5JTYA 5IAIA 2ZNTA 4L17A 1LAFE 1FQEA 4AS5A 4IGRA 3PU5A 1NNFA 5EYGA 2RINA 5TP9A 1MS7A 1LSTA 4YMAA 1US5A 3PPOA 4TLMB 4FAJA 2DWJA 2KLFA 1MQHA 3CR9A 5HPQA 2FVZA 3RUMA 1OLCA 3G3IA 4PFBA 4GWOA 4F22A 3MVYA 4NWCA 1JW5A 3FVNA 2O1LA 2Y7IA 3T9UA 5H8SA 2P3VA 1SVXB 2Y5KA 1MDQA 1B7ZA 1XOCA 1BIYA 1N3XA 5I56B 2PT2A 4ZS9A 2B4MA 1J1NA 2V3QA 4XKRA 2XWIA 3FVKA 4YZZA 2F34A 3GBBA 3CSGA 5AE4A 4ONYA 3O66A 1LBYA 4PAFA 3F11A 1YAEA 3BFUA 4HE2A 1LAHE 1LBBA 3KC0A 1MXXA 1N7WA 1B58A 2P3NA 1LFHA 5I56A 4JB7A 4EXKA 4DXCA 4JVIA 1YPNA 4U21A 4XKPA 3TCHA 4PBHA 3DP6A 1TT1A 1EU8A 2ANJA 4RK2A 1LBXA 1DTZA 3GLBA 3QUFA 4FATA 2W7YA 4N8YA 2XXYA 4MNPA 4R6HA 1QW0A 2Q8MA 3C4MA 2QS1A 1VDWA 2R8TA 1Z7NE 1CE2A 1B3EA 3E3KA 4THIA 1NV7A 2CZIA 4NF4B 4F3BA 1NL5A 1M5CA 4ESXA 1II5A 2ONSA 4ZEDA 3ONMA 3HFUA 3FXBA 5FHNA 1AMFA 4NF8B 1N84A 3N94A 4RYAA 3IOVA 5FTHA 3KSXA 4HE1A 4LQ5A 1B2HA 4R72A 4WKMA 1OVBA 4JVCA 2WBBA 1FBFA 4H65A 3I5OA 1P99A 2QVVA 3O29A 3ZKKA 4NF4A 2M8CA 5FHMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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