3SBBC

Disulphide-mediated tetramer of t4 lysozyme r76c/r80c by synthetic symmetrization
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
PMNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVCGILCNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title An approach to crystallizing proteins by metal-mediated synthetic symmetrization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 57
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3sbbC00
1PQOA 157LA 2A4TA 113LA 258LA 257LA 123LA 2HUKA 1CTWA 1QUGA 1CV5A 170LA 1QTDA 3FA0A 200LA 241LA 165LA 3G3XA 4I7LA 1L62A 1L53A 1DYEA 225LA 1P7SA 1KNIA 180LA 3HTGA 1C6AA 6LZMA 4ARLA 178LA 231LA 2OTZX 2OE7X 3V2YA 161LA 108LA 1C6JA 2B72A 4YX7C 1C6QA 3EMLA 1G07A 3HH5A 1L01A 1L27A 4DAJA 3SBBC 1L44A 1L71A 4I7OA 222LA 1L98A 1QT5A 211LA 1L55A 3V2WA 1D3NA 1L47A 3HH3A 2NTHA 1QTVA 3HT8A 119LA 3GUJA 3C8RA 1L82A 188LA 1QTBA 155LA 4I7KA 1LYGA 2OU9A 126LA 4AQNA 4W53A 2LC9A 4ARQB 1LW9A 209LA 3CDVA 1T8FA 2QB0B 4W54A 2OTYX 1L57A 130LA 1L14A 4I7JA 1L36A 5I14A 1CU6A 1L38A 3DNAA 2RBQA 4ARQA 1OVKA 1L10A 3OE0A 216LA 1ZURA 110LA 1C6PA 1L81A 1G0JA 3RUNA 4EKSA 1LGWA 1KY0A 3L2XA 1L06A 255LA 1C63A 3C7YA 237LA 3SB6A 1L04A 250LA 3PBLA 1SSYA 1CV1A 1L05A 1L91A 1CU3A 2RBOA 4GRVA 1OWZA 159LA 4GBRB 1L88A 1LWGA 1C6HA 3ODUA 3DN8A 2LCBA 1XJTA 1SWYA 150LA 1L68A 236LA 3GUIA 1L51A 3DMXA 1C6DA 1CVKA 158LA 1P64A 1D2WA 185LA 111LA 1G06A 229LA 1LYFA 3HT6A 1G0MA 1LGUA 3GULA 4W51A 3C7ZA 122LA 1DYDA 1L87A 183LA 3DN6A 182LA 156LA 107LA 162LA 1C62A 2O4WA 3SN6R 233LA 1P2RA 2RBSA 4OO9A 1C6IA 219LA 5LZMA 2B6TA 218LA 114LA 1K28A 191LA 2HUMA 2RBRA 1L35A 249LA 1G0LA 1L86A 1L84A 3VW7A 260LA 4LDLA 2OEAX 192LA 3DMZA 1L70A 160LA 228LA 248LA 2RH1A 1L85A 1QTCA 1ZWNA 4I7QA 4W57A 2B75A 2RB0X 234LA 1OV5A 3CDTA 212LA 1L03A 3FI5A 1L69A 1L0KA 1L26A 1P5CA 256LA 1TLAA 1L60A 4W58A 1CV0A 1SX7A 235LA 2RB2X 4YXAC 3OE6A 146LA 4EJ4A 3HDFA 1L39A 4W59A 195LA 1L33A 2O79A 140LA 1C6LA 1T97A 3PDSA 4W56A 1L46A 4W52A 1PQJA 4I7MA 109LA 221LA 1L08A 3JR6A 240LA 3C8QA 4W55A 1PQDA 246LA 4EXMA 1L09A 232LA 1L32A 1LLHA 1L67A 139LA 245LA 149LA 1LYDA 196LA 1C6MA 127LA 1C6NA 1L07A 3DN4A 238LA 2LZMA 210LA 3HT7A 1OYUA 262LA 1D3MA 1DYGA 1L0JA 1JQUA 1SX2A 1B6IA 199LA 1L21A 1L59A 1OVJA 1LPYA 142LA 2ANXA 3GUOA 3HUKA 215LA 1L12A 205LA 1ZYTA 1L92A 190LA 1G0GA 1CU0A 2Z6BA 4ARMB 138LA 3HWLA 1L30A 253LA 1L95A 4EPFA 1L19A 1G1VA 217LA 1P3NA 1DYCA 1L97A 1CV6A 1L58A 252LA 2F47A 198LA 1L31A 1L16A 3GUMA 4S0WA 1OVHA 1QS9A 3F8VA 2B6ZA 3C7WA 4ARMA 120LA 4LDEA 3NY9A 1L93A 1CV4A 1KW7A 1KY1A 1PQMA 184LA 2B73A 3HT9A 187LA 4IAPA 1JTMA 1QT8A 181LA 1L89A 1L42A 147LA 1P46A 2RAZX 1SSWA 189LA 1L99A 1L24A 1L48A 1L52A 1QT3A 1L40A 112LA 1D9WA 169LA 224LA 1NHBA 1T6HA 1QT6A 1L20A 3HUAA 1CV3A 3OE9A 3HTFA 242LA 3HDEA 1DYAA 2B6XA 4E97A 4ARJA 1L37A 1D3JA 129LA 144LA 1L29A 2ANVA 141LA 3CDOA 1I6SA 103LA 2B7XA 230LA 3HU9A 1WTHA 1QUOA 1C60A 1L13A 1C6GA 1L28A 251LA 131LA 1L75A 259LA 2RBNA 1XEPA 1L72A 173LA 1L65A 172LA 3DN0A 1CUQA 143LA 3HH4A 175LA 1CX7A 3HUQA 1L17A 1LI6A 2RBPA 137LA 1LYHA 1L83A 2QARC 1C6EA 4PK0A 128LA 3D4SA 1P56A 1C61A 115LA 176LA 243LA 1P6YA 3SB9A 1L00A 247LA 3CDRA 4LDOA 1L34A 4K5YA 2O7AA 3OE8A 1L61A 4I7NA 102LA 118LA 2F2QA 1C66A 1LWKA 1T8GA 1L54A 1QS5A 1L94A 1L66A 4I7RA 1L80A 1QSBA 1P36A 3C82A 1P37A 166LA 1L50A 1PQIA 4DJHA 2F32A 1G1WA 171LA 1KW5A 1G0PA 214LA 7LZMA 1LI3A 1QUHA 186LA 4I7SA 1C64A 2L78A 1C65A 1LYEA 1C68A 163LA 1DYFA 220LA 2B6WA 148LE 1C6KA 3C80A 3HTBA 1XJUA 2B70A 174LA 1C6FA 2IGCA 2OE9X 3DN2A 4EKRA 1OV7A 3HH6A 1LYIA 4EKPA 1D3FA 1L41A 167LA 1L15A 1C67A 3GUNA 1L74A 1C6CA 3UONA 3SB8A 1L63A 1G0KA 1DYBA 4LZMA 1QSQA 1QT7A 244LA 3NYAA 1L77A 1KS3A 3DMVA 223LA 3SB5A 125LA 1L25A 1QT4A 1JTNA 213LA 2OE4X 2OU8A 1C6TA 2RAYX 177LA 1CU5A 2HULA 1L49A 3G3VA 1EPYA 1L11A 1L96A 1CX6A 1L64A 1L22A 4I7TA 226LA 1L90A 152LA 3C83A 3FADA 4EPIA 1LYJA 1C69A 2NTGA 3GUPA 197LA 104LA 1SWZA 2Q9DA 254LA 3HU8A 164LA 2RB1X 3RZEA 3C8SA 3LZMA 1CUPA 1L73A 1L18A 2B6YA 1L02A 1OWYA 4EKQA 1P2LA 3CDQA 1LI2A 3C81A 4I7PA 2OU0X 3G3WA 4PJZA 3DN3A 1QTZA 1L23A 1LGXA 1PQKA 239LA 1CU2A 1L76A 1C6BA 1D2YA 3F9LA 1L56A 3GUKA 1QUDA 1L45A 151LA 3L64A 1L43A 4DKLA 3QAKA 3DKEX 145LA 3DN1A 2B74A 2CUUA 3K2RA 1G0QA 4ARPA 1L79A 4YXCA 3NY8A 3SBAA 3HTDA 4ZPUA 3SB7A 206LA 1QTHA 201LA 2Q9EA 227LA 1T8AA 261LA 168LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
157LA 1HEMA 1V7SA 1DKJA 1BB5A 1CTWA 5KKJA 1LCNA 5HLLA 170LA 3FA0A 3G3XA 4I7LA 3W6FA 1P7SA 180LA 1REXA 4XJFA 161LA 1C6JA 4UWNA 4N9RA 4B4JA 1L27A 1LMNA 3SBBC 1GB7A 1LZDA 3G3BB 1AM7A 4R6CA 2BLXA 1LAAA 3A94A 4NSGA 211LA 2CGIA 1L55A 3ATOA 4QY9A 5ILFA 5L9JA 4H93A 1QTVA 1GB6A 2CJLA 155LA 4I7KA 4XJBA 2LC9A 4ARQB 209LA 4I7JA 3W6BA 2FYCA 5I14A 1LMQA 1LSBA 2DKVA 1F6RA 1GFTA 3CT5A 1YAOA 1B7QA 2A7DA 216LA 1GBWA 1L81A 1G0JA 5LVIA 1GPQC 5HNLA 1LGWA 1KY0A 255LA 1JKAA 3C7YA 5KKIA 1CV1A 3FI7A 1L05A 1NBZC 1L88A 3DN8A 2LCBA 1IP2A 2DQFC 1OQMA 2DQJY 5FDJA 185LA 3HT6A 1LYFA 3AZ7A 3C7ZA 1L87A 1GBZA 1F10A 1BB7A 1QTEA 4C5FA 183LA 182LA 107LA 2O4WA 3AZ6A 3RU5A 4OO9A 1C6IA 219LA 4H8ZA 1UA6Y 4QGZA 1WTMA 1IWZA 2RBRA 1JJ1A 1CJ6A 4GCFA 4GCDA 1GHLA 1NMMA 4P2EA 1AKIA 4UWUA 2RH1A 1BB3A 1L85A 1OV5A 4DD3A 1JJ3A 1A4VA 4W58A 3T36A 1SX7A 235LA 2RB2X 146LA 1I56A 2HEAA 1GB8A 1L33A 2O79A 1IOSA 1HEQA 3PDSA 1L46A 133LA 4I7MA 1IWWA 4B1AA 4GCEA 1LSYA 1UIEA 4EOFA 1H87A 246LA 232LA 1JHLA 4Z41A 1BB6A 4J7VA 1CJ8A 1LYDA 1C6MA 3W6EA 127LA 1C6NA 210LA 3HT7A 3ZVQB 1DYGA 1L0JA 1B6IA 1OVJA 3A6BY 1WQQA 1YKYX 3HBHA 1UIFA 5DLAA 1G0GA 2BQGA 1L30A 1EQEA 9LYZA 4NHSA 3EXDA 1G1VA 1GF9A 4ETAA 1DYCA 1I20A 2F47A 4H9EA 1LZNA 3GUMA 5LA8A 4ET8A 3C7WA 4YENA 120LA 4IATA 4CGEA 4LYZA 2ZNXY 1LHLA 5F9UA 184LA 4PGJB 3CT0A 5HMJA 1L89A 1L42A 2RAZX 1P46A 3A6CY 2FBBA 207LA 5APCA 1V7TA 1IC5Y 1L24A 1QT3A 4LYMA 224LA 4WL7A 2A7FA 1GF7A 1T6HA 1KIPC 1FLYA 1CV3A 4D9ZA 3OE9A 3A8ZA 154LA 4A7DA 2B6XA 3WU7A 4TTDA 3A67Y 4LYOA 2ANVA 1NDGC 2WARA 1LMOA 4EMNA 3CDOA 1I6SA 4H9IA 4ZFPA 1YL0X 1UICA 1BQLY 4O34A 4N5RA 1JIYA 4LGKA 1GXXA 4NWEA 1L13A 1L75A 1GE0A 2YBMA 2F4GA 1GEVA 1YIKA 2BQDA 1B7MA 4LT1A 4DD7A 1OUHA 4IASA 5E9RA 1LYHA 4NHPA 5KXTA 1C6EA 3D4SA 2MEAA 3T6UA 1LSNA 1IP1A 1P6YA 4MSTA 4NSHA 4H92A 4LDOA 1GAZA 3OE8A 5IELA 4I7NA 2YBJA 1GE2A 2F2QA 1T8GA 1BVXA 1L54A 4HTQA 4TWSA 1IC4Y 1LJ4A 4I7RA 1P2CC 1IX0A 5LVHA 1BB4A 1L50A 1LSCA 1KW5A 2EIZC 3LYZA 1DZBX 2GV0A 5KXYA 3GXKA 3WL2A 2MEHA 1LYEA 1C68A 3LN2A 8LYZA 1IWVA 1DYFA 1GF3A 1GE3A 1NF5A 1YL1X 3HTBA 1DPWA 1C6FA 3TXIA 2OE9X 2Z12A 1B7SA 2IHLA 3QY4A 2DQCY 1LSGA 2BQLA 2YBIA 4H94A 1C67A 3GUNA 1IP5A 1QT7A 3DMVA 1WVUA 223LA 1VDTA 4WO6A 4DD9A 1OUFA 2BLYA 1CU5A 1L49A 2BQNA 5DM9A 5JENB 1D0LA 1HSWA 2ZWBA 1CX6A 4QEQA 4Z46A 4EPIA 3GUPA 197LA 4N0JA 104LA 2VB1A 2Q9DA 2LZ2A 5HNCA 1HF4A 1L18A 2B6YA 1P2LA 3AGHA 4HJYA 193LA 4ETEA 3C81A 3ATNA 1REZA 5FCPA 1GB3A 3WU8A 4H9AA 1L23A 1LGXA 4HJVA 1CU2A 1D2YA 3GUKA 1LSMA 3L64A 4DKLA 3QAKA 3DKEX 5LYTA 145LA 1B7PA 1LZ9A 3AGIA 1G0QA 4M6DA 1L79A 2MEDA 4G4CA 4H8YA 4H9BA 3BKHA 206LA 2ZIKA 4WOAA 201LA 1T3PA 5LYMA 2Q9EA 1T8AA 4XADA 261LA 2XTHA 257LA 4WM3A 4BADA 3AZ5A 5I53A 200LA 4WLXA 4IJ4A 1L53A 5I4YA 1G7JC 225LA 3HTGA 1C6AA 5D5FA 178LA 231LA 2OTZX 108LA 4GN5C 1UC0A 1IWYA 1C6QA 3EMLA 3HH5A 4LZTA 2ZIJA 1XGTC 1L98A 2PC2A 5KXKA 1CKDA 4DDAA 1HFYA 1JSFA 3HH3A 2NTHA 1GFHA 3C8RA 4J0LA 1TEWA 1NHEA 188LA 2BQKA 2OU9A 4AQNA 4DQ5A 1CKHA 4ETCA 3AZ4A 2I6ZA 3N9EA 4W54A 130LA 1GBYA 1XSFA 1MLCE 2IFFY 1L36A 1CU6A 1XEKA 3W6CA 3DNAA 2RBQA 1OVKA 1YILA 3OE0A 4XN6A 1ZURA 110LA 1LZ1A 1DI4A 3RUNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 157L A;  1HEM A;  1V7S A;  1DKJ A;  1BB5 A;  1CTW A;  5KKJ A;  1LCN A;  5HLL A;  170L A;  3FA0 A;  3G3X A;  4I7L A;  3W6F A;  1P7S A;  180L A;  1REX A;  4XJF A;  161L A;  1C6J A;  4UWN A;  4N9R A;  4B4J A;  1L27 A;  1LMN A;  3SBB C;  1GB7 A;  1LZD A;  3G3B B;  1AM7 A;  4R6C A;  2BLX A;  1LAA A;  3A94 A;  4NSG A;  211L A;  2CGI A;  1L55 A;  3ATO A;  4QY9 A;  5ILF A;  5L9J A;  4H93 A;  1QTV A;  1GB6 A;  2CJL A;  155L A;  4I7K A;  4XJB A;  2LC9 A;  4ARQ B;  209L A;  4I7J A;  3W6B A;  2FYC A;  5I14 A;  1LMQ A;  1LSB A;  2DKV A;  1F6R A;  1GFT A;  3CT5 A;  1YAO A;  1B7Q A;  2A7D A;  216L A;  1GBW A;  1L81 A;  1G0J A;  5LVI A;  1GPQ C;  5HNL A;  1LGW A;  1KY0 A;  255L A;  1JKA A;  3C7Y A;  5KKI A;  1CV1 A;  3FI7 A;  1L05 A;  1NBZ C;  1L88 A;  3DN8 A;  2LCB A;  1IP2 A;  2DQF C;  1OQM A;  2DQJ Y;  5FDJ A;  185L A;  3HT6 A;  1LYF A;  3AZ7 A;  3C7Z A;  1L87 A;  1GBZ A;  1F10 A;  1BB7 A;  1QTE A;  4C5F A;  183L A;  182L A;  107L A;  2O4W A;  3AZ6 A;  3RU5 A;  4OO9 A;  1C6I A;  219L A;  4H8Z A;  1UA6 Y; 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