3SBCA

Crystal structure of saccharomyces cerevisiae tsa1c47s mutant protein
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
b'VAQVQKQAPTFKKTAVVDGVFDEVSLDKYKGKYVVLAFIPLAFTFVSPTEIIAFSEAAKKFEEQGAQVLFASTDSEYSLLAWTNIPRKEGGLGPINIPLLADTNHSLSRDYGVLIEEEGVALRGLFIIDPKGVIRHITINDLPVGRNVDEALRLVEAFQWTDKNGTVLPCNWTPGAATIKPTVEDSKEYFEAANK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Disulfide biochemistry in 2-cys peroxiredoxin: requirement of Glu50 and Arg146 for the reduction of yeast Tsa1 by thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin TSA1
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Oxidoreductase
total genus 64
structure length 195
sequence length 195
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3sbcA00
2F51A 1NM3A 3GL3A 2IMEA 4JU5A 4L5OA 3ZFLA 3LXTA 1YZXA 2FD3A 2WULA 4MABA 4ECCA 1J9BA 1V58A 2B6MA 5JWOB 1TJDA 3TKSC 2E2GA 3D5JA 4KAEA 3HKRA 2H71A 3BD2A 2ON5A 2DC5A 4HQSA 2O89A 2V32A 4X1UA 1PA3A 3QD9A 3VFIA 1Z6MA 2JSZA 3G7JA 3IAS2 4FH8A 4O5RA 4Q5RA 1A0RP 2GZYA 3GX0A 5GSTA 1YJ6A 4ECIA 1WJKA 4O32A 1T8EB 1K3YA 5E59A 4PX1A 2L6DA 4MK3A 1TK5B 5GAPD 1GH2A 4OCEA 3GHAA 5IMCA 2ZUPA 2H6YA 2X8HA 3EU4A 3DD3A 4OCFA 3ZZXA 1OE7A 3UVHA 2D2ZA 4OO5A 2YV9A 5JCUA 2R4VA 2VL2A 2WGRA 4ILFA 3BCKA 4MCUA 1U6TA 2OE1A 3HCZA 1OKTA 1XPVA 2G2QA 3QFBC 1GUMA 3VURA 3JCML 1K3LA 1YY7A 3UJ1A 1A2LA 1M2BA 3ZVJA 6GSTA 2DMMA 2N5AA 2B7KA 2WZ9A 3M1GA 1K3OA 2OBIA 5DBQA 5KN2A 2P31A 1GULA 2VL9A 5ECLB 3I6AA 4ZBBA 1GLPA 5A5KA 3WGDA 2GDRA 3FZ9A 3LORA 4GTUA 5B6NA 5HR3A 4POMA 3EMPA 4GLTA 3W6GA 3GH9A 2R2JA 3I43A 2EC4A 22GSA 1V9WA 1KBNA 1K0NA 1MDKA 2O7KA 4EVMA 1PL2A 1S3AA 3CTGA 1YF1A 4IHUA 1R26A 2ES7A 1QUWA 3TJGA 1Z7PA 4ZB8A 3EVIA 2JL4A 4JEDA 5ECRB 3WYWA 2GVPA 2C0GA 3CRTA 1I5GA 3KEBA 3FW2A 3ZVJD 3G9BA 2K18A 1K0AA 1PL1A 3RPPA 2F8FA 4E8EA 1BYEA 3Q6OA 1G6WA 1GL8A 2VCWA 3WGXA 3LYPA 2VCZA 1X5EA 5G2ZA 3H79A 4ML1A 5B8AA 2OBKA 2PERA 2LNTA 3FHKA 4GSSA 3EC3A 2F3MA 5D8IA 4WR5A 1EP7A 2O87A 2MMNA 1TP9A 2DBCA 1TTZA 3ZMKA 2WDUA 5J9BA 2OJLA 1XW6A 3LGCA 1URMA 3ZLPA 2NBSA 1JLWA 3F3RA 2KLXA 3QAGA 2H72A 2H1DA 1CQGA 1JZDA 1OVNA 19GSA 1OKDA 1GWCA 4HI7A 4NHZA 1HNBA 2GGTA 3UBLA 1GSFA 3TJBA 2RUFA 9GSSA 3D0ZA 4TKYA 2JZTA 3UMAA 2IIYA 1WWJA 1XFLA 1FOVA 1T4YA 1ACVA 1JHBA 2LKUA 1MDJA 10GSA 12GSA 1DSBA 1XVWA 2KP1A 5JCGA 2LRNA 4PQ1A 5DAKB 4E8HA 4ZL7A 3LSZA 5CYYA 2YJHA 1PKWA 3HJPA 1AQXA 2HT9A 1ERTA 2H0HA 4AJ7A 5G5EA 3TGZA 2IMDA 4GSTA 4MJAA 4N0VA 3TKQA 3GKKA 1YKAA 2R6KA 3KIJA 3P8WA 2CAQA 3J7Yb 2YP6A 3IK9A 2M72A 2JACA 2PN8A 5F07A 4F2IA 4OMVA 4YQMA 1ZYEA 5H5RA 1TK0B 2GT5A 1F37A 4DEJA 4Q5NA 4D73B 1NHOA 4JZQA 2QKEA 4ACSA 2L57A 4ZIJA 2GLRA 2C0FA 1THXA 2NVLA 4RQRA 3MAKA 4F82A 4IW9A 3IBHA 4NAXA 3GNJA 3N5OA 3ZFBA 4GF0A 3MSZA 4ZL8A 1MEKA 2B1LA 4XTSA 1OC3A 5CRHA 2FWFA 1ABAA 1K0MA 2R37A 4HOJA 5GAND 1H75A 3NIVA 4K6XA 4WBJA 3MWHA 2C0DA 4FYUA 1VGLA 1UVZA 1PGTA 4V2LA 1PKZA 2DJ1A 1V98A 4K7IA 5G1KA 4BA7A 1QXHA 3GKMA 1U3IA 1O7UA 2OE3A 4NXIA 4TR1B 2QC7A 4MPFA 2JZRA 3PGTA 2TIRA 3ZIJA 5C04A 2KUCA 2IWTA 4HEA2 3DMLA 1PQNA 4GQCA 1XWGA 2XC2A 2ALBA 3DYRA 2GQLA 3DKSA 5CAXA 1AUCA 4DSQA 2IMKA 3S9FA 1EZKA 4LL4B 3IR4A 1YF0A 5IMDA 1V2AA 1FVKA 1YDKA 1HNAA 1TXXA 3HYPA 4KDUA 1S3DA 3J7Yk 2X8GA 3HXSA 3ZL5A 1EEMA 1USBA 2DIZA 5IO2A 2H1GA 1GSDA 1EOHA 2MZCA 1WRYA 3SBCA 3IHQA 2CQ9A 2PPTA 4WKWA 1SYXA 4NHWA 2B5XA 2DJ3A 2KP2A 1MD3A 3ZIVA 4OD7A 5IOXA 1KTEA 3KM6A 5ELGA 1Z5YE 4KSOA 5DALB 1ZCPA 1BJXA 4YAPA 2FA8A 4LMVA 1SJ6A 1SK0A 4Q5FA 4RUVA 4MJCA 1TDIA 1ML6A 4X43A 3I69A 2LQQA 4XHMA 4V2MA 5A4VA 2FCHA 4IGJA 1CQHA 1M0UA 2FA4A 3QMXA 1XBSA 5ID2B 1JZRA 2YPMA 3FY7A 2GSSA 5CREA 1MTCA 3PH9A 4L5LA 2FY6A 3C1RA 1RQMA 4FYBA 4HS1A 1SK2A 2LTKA 4P3YB 3ZMLA 4EC0A 2C4JA 1E6BA 2PVOC 3VI5A 4K7NA 3SWLA 1TRWA 5GSSA 1GSYA 1A0FA 6GSXA 3LXZA 1EEJA 1TI1A 1XXUA 1OC9B 1A2JA 5ECKB 3IRAA 2YWOA 1Y6EA 4LLRA 4MP4A 4ECJA 2V6KA 3KMOA 2Z9SA 1Z7RA 4RI7A 2C1YA 5JCWA 1GUKA 2P5QA 3VPTA 2X8CA 2C3NA 1VRSD 4L0WA 6GSWA 5DAKA 3A3TA 2B1KA 1M7TA 1MD4A 7GSSA 3KJYA 3RHCA 1T7PB 4HU9A 4V1Ag 2FWHA 5HR0A 2LQOA 4IVFA 3IPZA 4PQHA 1GTUA 2YJ7A 1VF3A 3F0IA 3M8NA 3H8QA 2H8LA 5KN1A 5G31A 1B9XC 3DEXA 1XCCA 17GSA 3DRNA 2JADA 3MDKA 4LL1B 3HVXA 2TRCP 1SL0B 3GKNA 2LV3A 1XVQA 2OA7A 4D73A 1FB0A 1UC7A 2XHFA 1XW5A 3L9UA 3ZTLA 3VWXA 4TN8A 2C0EA 2H74A 3TKRA 2IMIA 1T3BA 1W4VA 1SK1A 4TXOB 4N11A 1EGOA 1C72A 1GNWA 2A4VA 4EUYA 3ISOA 1BEDA 4ID0A 4WF5A 2VCTA 5ECOB 1V57A 3DIEA 1SKRB 3E9JB 1EP8A 1F3AA 4RI6A 4MZBA 1GRXA 1OC8A 3BOAA 1KNGA 1QGVA 2L5OA 1AQWA 4TR1A 5LNKe 3A2WA 3ZREA 2OKAA 4MF7A 2R3XA 2H0IA 3A5WA 3R2QA 4RQXA 4KNDA 4LA1A 1T00A 3U6VA 2B5EA 5DQYA 4BL7A 4XRDA 3F3QA 3HZ4A 2FHEA 4WETA 4BWSA 4POKA 2KOKA 3TKSA 5EVOA 4K8MA 4F0BA 3RHBA 3Q18A 3HHVA 3TKPA 2C3TA 1PX6A 3QCPA 2K8SA 4V1Ap 2YZUA 3O6TA 2HFDA 4BWQA 3GUSA 4F03A 5E4WA 1BAYA 3D4MA 4Z7XA 4G2EA 5DCHA 5CNWA 2H70A 4GSNA 1DE2A 2YWNA 5AIXA 5DALA 2YN1A 2B3SA 1PSQA 1HQOA 2GTUA 3CMIA 5D9VA 4J56E 3UIWA 4MH3A 3RPNA 1U87A 3VWUA 4K0NA 2G0FA 2CZ3A 1R4WA 3HY2A 3ME7A 4WXTA 1SL2B 4QL7A 5J3RA 2A2SA 2LS5A 5ECIB 1GSEA 3FKFA 4EF0A 2DSAA 5ID2A 1J0FA 1ZZYA 3ERWA 5HFKA 1Q98A 4JRRA 5ECHB 4KCEA 1MDIA 2GQMA 3V1WA 2IL3A 3F4RA 5CRWA 3BCIA 3H1NA 1SJZA 1OE8A 1JFUA 3MNGA 5DCGA 1XZOA 5G5FA 1TOFA 3DGQA 3Q74A 5D73A 4HQZA 11GSA 4L8EA 4IP1A 5HQPA 2IFQB 2OE0A 4AJ8A 1OC9A 2CVKA 3HVSA 2XPEA 1HD2A 1B8XA 3FZAA 3GYKA 3KH7A 2FLSA 5DJMA 1M9AA 4TVEA 4OFNA 4ZILA 3F6FA 4DSRA 1QFNA 3EINA 4CHSA 3W8SA 4KDXA 2VCVA 5IOWA 1XWKA 5ELAA 1NW2A 1Z3EA 2O85A 3KCMA 2PUKC 4IJ3A 1O8XA 4GXZA 5EL8A 2CZ2A 3EMXA 1LBKA 5D9TA 2RM5A 2VLUA 4MZCA 3VK9A 4GCIA 2CVDA 2YNXA 2VAFA 5LCZA 2PBJA 16GSA 5H5SA 4ECBA 3G7IA 2WS2A 3CYNA 5D9WA 3O76A 4O92A 3FZ4A 4PUFC 2HSHA 2AV4A 4ZB9A 2C3QA 2XBIA 3F63A 2MYGA 1T4ZA 3HZ8A 5IQYA 3KTLA 3QDNA 4ZBAA 5F0GA 4NPBA 4TR4A 4TXOA 2GZZA 1XOAA 2PMTA 6GSUA 1OAZA 1WOUA 2N5FA 5C00A 3TRXA 2FWGA 2YZHA 2DJJA 4EKZA 2PGTA 1XWBA 3UL3A 3GN3A 3QAVA 3GMFA 3IAM2 1SJIA 1GTAA 4QQ7A 2VD0A 3TRQA 1SL1B 1PD21 1PX7A 2QSIA 4I97A 5G1LA 2LSTA 3GSSA 4OFMA 2M46A 2HZFA 3FZ5A 2YWMA 3OR5A 1N8JA 4YQUA 1Z6NA 3M0FA 2L59A 3QFAC 3LEFA 4MH2A 3IC4A 1GUHA 2L6CA 3M3MA 3HVVA 4V2NA 1QMVA 4KB3A 2DJ0A 3IE3A 1K0OA 3TUEA 4XS4B 1E2YA 3C73A 1Q4JA 1UN2A 1A23A 2FNOA 3KXOA 2H6XA 2BTOT 4EO3A 5F8BA 3FYGA 1ERUA 4AGSA 5IMZA 3H4KA 1WMJA 5HR2A 3IV4A 3VLNA 3NOFA 2E0QA 2LUSA 4GRFA 3UVTA 3WT1A 2HZEB 2PVQA 4XCSA 2VOCA 2ZCTA 5F06A 5KN0A 5IMVA 1X9SB 1FAAA 1WPIA 5ECQB 2LRTA 1T1VA 3N9JA 1R7HA 1K0CA 2V2GA 4L0UA 2C80A 1AQVA 2VCQA 5CO3A 3APOA 5KN3A 4WEYA 3TKSE 1M2DA 2VLVA 4K9ZA 2MMAA 2H01A 1GTIA 3LQ7A 3TJJA 4KUNA 2K8VA 2WRTA 1BX9A 2AJQB 4FO5A 4MZWA 4OO4A 2VO4A 1TKDB 4ML6A 3FRCA 2JSYA 3PINA 2CV4A 4BVXA 4MDCA 4CW9A 3AY8A 3EWLA 1PN9A 5IMFA 2N5BA 4FYCA 1O8WA 5IPGA 1EV4A 3APQA 1X5CA 1ERVA 1AAZA 3GFKA 1NSWA 1V40A 5DVBA 4BVYA 2IFQA 3IXRA 3VWVA 4KA0A 4MJBA 1ZMAA 1QQ2A 3L9VA 2KHPA 3E0UA 1DE1A 5HR1A 1O73A 3RBTA 2RM6A 8GSSA 2VCXA 1PRXA 3RDWA 3I9V2 4GQFA 4PURA 1ZGNA 4G9HA 2GS3A 1EV9A 2DIYA 2J9HA 1WE0A 4G19A 1OYJA 3QPMA 4K0GA 2O8VB 3TOUA 2FUG2 1GLQA 2HYXA 3WGEA 2IMFA 4WBRD 2CX3A 3F8UA 2I3YA 3KD0A 2OACA 3WT2A 3F4SA 5IPHA 1R5PA 3C7MA 4WR4A 2LJRA 2AB6A 5DDLA 1THOA 1XW9A 2I4AA 4K2DA 2VL2C 4TR0A 5HFGA 1FO5A 1K0DA 2HRFA 3ME8A 5ECNB 18GSA 3M9KA 1TRUA 1ZYQB 4MA9A 5COHA 2XBQA 1W89A 4F0CA 3P90A 3A2XA 5D93A 4HZ2A 3LFLA 4KDYA 3IA1A 1F2EA 1Y25A 2P5RA 2RUEA 5JWQB 4IQ1A 2VLTA 2HI7A 3KZQA 4ULXA 2CX4A 3QR6A 4DSSB 3CTFA 4PNFA 1FHEA 2YOIA 2DJKA 1GTBA 3GV1A 5ENUA 1A8YA 2X99A 4PQIA 2H19A 1ERWA 6GSSA 3TJKA 2HE3A 3DWVA 2VM1A 1WIKA 5J9CA 1PMTA 3IK7A 3LWAA 2EIRA 3CRUA 2I1UA 5AN1A 1LU4A 1X9WB 2CAIA 4X0XA 2A2RA 2VM2A 2MMOA 3KH9A 5ECPB 4EDYA 2H0GA 3K8NA 3FR9A 1LJRA 4EL1A 1UA5A 4IP6A 4PUAA 4TOPA 2B7JA 1F9MA 1R5AA 4XS1A 3ED3A 4XS4A 4EE0A 1SENA 5IM9A 4TW5A 13GSA 2JZSA 3UBKA 3RAZA 4IKHA 1GSQA 3HA9A 2I9HA 1B48A 4I8BA 1VF2A 3F4TA 1A24A 4JBBA 4HZ4A 3GURA 3FEUA 3FR3A 1JZOA 4AF2A 2HZEA 1GSSA 4MMMA 4PXOA 1X0RA 2H1AA 1X9MB 3C8EA 4KCAA 2E7PA 4AJ6A 1YEPA 5J4UA 2LJAA 1EGRA 3U5RE 3FK8A 1SYRA 1SU9A 3BBYA 4HJ2A 1XOBA 3L78A 1Z9HA 2K6VA 3DVXA 4NMUA 3QOUA 5CP1A 2QGVA 3UAPA 4NV2A 4CDOA 1S3CA 4KGIA 4PNGA 5B6MA 5B8BA 1FW1A 2ZNMA 5IIZA 1TU8A 3KTBA 5A4WA 3TDGA 3GL5A 1ST9A 3APSA 4I5QA 3ZRDA 4LMWA 3C1SA 3P2AA 3CBUA 4HJMA 1QK8A 4NWYA 2HNLA 3L4NA 1AC1A 2CA8A 2H30A 3D4TA 5AGYA 3GTUB 2PU9C 4O7HA 1TRSA 3GSTA 5INYA 2MMZA 3LJRA 3F6DA 4N10A 2LJKA 4I2TA 5L71A 2K9FA 2VIMA 4PGTA 2GSQA 3P7XA 2GT6A 4JE1A 1F6MC 4F9ZA 2RIIA 5D96A 4ZB6A 1XIYA 2F8AA 1F3BA 1U88A 2OADA 1XWCA 4IS0A 3HJMA 4XRAA 3CSHA 2AYTA 5CRDA 3QAWA 2REMA 2TRXA 1K0BA 1BG5A 2JU5A 1U3AA 4JR6A 2IPAA 2VD1A 5ABRA 5IMAA 3Q19A 3TJFA 4QL9A 3DVWA 3G7YA 4IELA 5AIVA 4OFTA 1YEXA 1B4PA 1G7EA 3VI7A 2VUPA 2GZPA 2R5GA 1I9DA 1A2MA 1AIUA 1EOGA 4TRXA 5ECSA 4KX4A 2H76A 2BJXA 1GSUA 4N0ZA 5J41A 4ZXGA 2HLSA 4HU7A 4YH2A 2AUVA 5DQSA 5EPFA 4J2FA 3D22A 2YWIA 3HD5A 1DBYA 5FHIA 1M2AA 2L4CA 2AAWA 3UARA 1FB6A 2AHEA 3CSIA 20GSA 2L4QA 3GX8A 1SD8A 3DXBA 3H93A 2YCDA 4DSSA 4POBA 3IOSA 2LEGA 1B4QA 4EXJA 4HUAA 2WJUA 2C8UA 2HRNA 2WCIA 1DUGA 1AXDA 4MF6A 3NZNA 1O81A 4DVCA 2FGXA 3KMNA 2VL3A 2H75A 3KP8A 4MJEA 2IJYA 5LD0A 3EURA 2X64A 2EIQA 3KGKA 3TOTA 1ZL9A 1HNCA 4IQAA 1M99A 2LRCA 3M9JA 3FR6A 1B9YC 3EYTA 1J08A 4I2UA 1O85A 3D6IA 2V1MA 4TR3A 2NDOA 3US3A 4KW6A 3GKXA 4KH7A 1KEBA 2GQKA 1TRVA 2NTOA 3W8JA 1HYUA 4KE3A 2ON7A 1EWXA 2GSRA 5D9XA 4JR4A 4KSMA 2FWEA 3E3EA 5AISA 4HDEA 1ILOA 1ZOFA 1XWAA 4XIHA 4OWYA 3UOMA 5EY6A 2CT6A 2GSTA 4MLYA 4MPGA 2H73A 5HFIA 1SKSB 2V6OA 1TW9A 1NHYA 5FT3A 1JLVA 1TI3A 4ISDA 4ZBDA 3EU3A 2J23A 2MBTA 1SKWB 5IO0A 1VF4A 2XPDA 2E2MA 5F05A 5J5NA 4IN0A 3UEMA 6GSVA 5FWGA 2HSYA 2RLIA 6GSYA 1H4OA 1G0TA 4H86A 3EE2A 2WB9A 1IYHA 1YQ1A 1GNEA 3TCOA 1ON4A 3L0HA 3GIXA 4MF5A 3GTUA 1WP0A 4YQVA 2I81A 1O6JA 1A8LA 4TXVA 2PWJA 1TU7A 3GA4A 3HJOA 4NV5A 4YAVA 1SD9A 1G7OA 3TB2A 2F9SA 3KP9A 2H6ZA 1N2AA 4IJIA 2H66A 3ERGA 5B7CA 2MBSA 5CRGA 1BQ7A 4FIWA 4K7OA 2IN3A 4J57E 1JZWA 4I6XA 3WD6A 3LG6A 5A4UA 2WFCA 1IYIA 5JWRB 1RW1A 4EDZA 2H1BA 3ZYWA 3GRXA 3GH6A 3LYKA 1GP1A 4IBPA 1VF1A 2P0GA 5ECMB 2DLXA 2L5LA 4XS6A 3O3TA 3VWWA 3D21A 1AW9A 3ZITA 4K1FA 3A2VA 3CXGA 4Q5QA 5H5QA 4WF4A 5G30A 1G6YA 2YANA 3PR8A 2YV7A 5KEJA 3BJ5A 5GZZB 1RK4A 3TRPA 14GSA 1M9BA 2EIOA 3L9SA 1TK8B 4POLA 4N30A 2DJ2A 2CVBA 4ZL9A 2DMLA 3CSJA 2HXKA 1FVJA 3C71A 3VPQA 4BPYA 1YKCA 2B5YA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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