3SEUA

Zn-mediated polymer of maltose-binding protein a216h/k220h by synthetic symmetrization (form iii)
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
b'EGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEHAFNHGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An approach to crystallizing proteins by metal-mediated synthetic symmetrization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 125
structure length 366
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3seuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3seuA01
4NWDA 3TTKA 3K6XA 1US5A 4JWYA 2DE4A 3TMGA 4YICA 1FQDA 3FD3A 4OEUA 5HPQA 2I49A 2P1SA 3PPPA 1HSJA 3R6UA 4KFQA 3RY3A 3C9HA 1B5IA 2I48A 3PUVE 4EQ9A 4O3CA 5CC2A 4ZECA 4R75A 4F3BA 4HS7A 2O1LA 4BDOA 2YLNA 3TTRA 5J1DA 5I57B 4DIGA 3MAMA 4YB6A 1I6QA 3LSWA 1OMPA 4F19A 3MUQA 4F3SA 4ONYA 4KQPA 1RYOA 1BLFA 3MPKA 3MZBA 1XS5A 2DVZA 3H6TA 1L5TA 3PV0E 3C4MA 2X7QA 1Q1KA 2F6PA 4YAHX 3FV2A 3UN6A 1XVYA 3FXUA 1HSLA 5H8SA 4G8NA 1I69A 4JB7A 1B5JA 2O7UA 4HCYA 3BFUA 4DLDA 1R6ZA 1SW2A 2F97A 2H98A 5AA4B 3KG2A 4H1XA 2RCAA 5ICTA 1SI1A 3DP6A 2R9JA 4BDLA 3CFLA 3VXBA 5CBSA 4IGTA 1PEBA 3FATA 3RT8A 3FJMA 5I59B 3VLWA 1RYXA 4NTLA 3MP1A 1B3FA 1NNKA 3G7WA 3MZ1A 3WAEA 1Y4CA 2V3TA 3MVYA 1B5HA 4XIGQ 4LATA 4ZE9A 1M5BA 3K00A 1XOCA 4IO2A 1QVSA 2Y7RA 5I56A 4RA1A 5H8HB 2FNCA 5CI5A 3RTFB 4O3AA 2Q9TA 4Q0CA 4LUBA 1BKAA 1OQHA 2UYEA 3TELA 1B05A 1Y20A 3HN0A 3O6GA 3MWBA 5DYHA 1UQWA 1RKMA 4P0GA 3I5OA 4RK2A 2RKMA 5AA2D 1BIYA 5KCJB 3G3KA 4ZEFA 3RGYA 4XKRA 3IB1A 2F78A 3U92A 5AA3A 2Q88A 2H4IA 1I6AA 2XXPA 4RJZA 4ZZEA 5KZTA 3W9WA 3EN3A 4UA8A 4IY5A 3PUYE 2THIA 3K01A 3DP8A 2GHBA 5M2VA 1M5EA 2DXYA 3S9NC 2H5YA 3M8UA 1MPDA 3JZJA 3M3KA 2XXVA 3C35A 5CMKA 2Q89A 3PUXE 2WKYA 1D4NA 4KCCA 4I8CA 2H9BA 1FTMA 5AA2A 5H8FB 4N6PA 2O68A 3SEXA 3RLFE 4LZ7A 2AYSA 1LAHE 4GIZA 3SKPA 1MDQA 2HAVA 2UVGA 3UGWA 3TZAA 1UTHB 1MY1A 5CMBA 4F31B 1VSOA 3A3CA 3QUJA 4PE5B 3V5AA 3PUZE 3WAFA 3BKIB 4KI0E 2NXOA 3T9VA 2HFBA 1P1NA 4PFYA 4R2FA 2YPNA 2VGQA 4ELRA 1JNFA 1PC3A 3MVXA 4LZ8A 4N13A 2UVIA 4DCYA 1POTA 3I3VA 4IB2A 1D9YA 4LQ5A 4H65A 1A54A 1FTKA 3HV1A 3TCHA 2REJA 4F18A 1MG1A 3KN3A 1JVXA 4ISUA 3N94A 2Y7IA 1N7WA 4E0WA 3DELB 4RPOA 1NKXA 4FIMA 1P1OA 2FA7A 3SDFA 4KHZE 4GWOA 1R1NA 3ILUB 4Q30B 3S2VA 1A55A 1OLCA 1TFDA 1QJMA 3B6QA 1LLSA 3IB2A 5AA1A 2M8CA 2Y84A 4BDNA 3PD9A 3RNNA 5CRYA 4FJPA 3SESA 1MXVA 2QPQA 3RTWB 4X1BA 4NF6B 3VDFA 1MY3A 3GZGA 1B7HA 4WEPA 2I4CA 3IO6A 1R9QA 5FTHA 4JWOA 3QK6A 1MY0A 3O66A 4I62A 1N7XA 5HBCA 4F2QA 1D3KA 3OSQA 3MBPA 1T0KA 1WVJA 4IO7A 3O29A 4YZZA 2ZXTA 3QSLA 5FHMA 2XXRA 1SDXA 3OO9A 3GLBA 2H99A 3C34A 4OETA 5H8NA 2PYYA 3HSTA 4YKKA 1B32A 4NEDA 3C36A 3FV1A 2Y7WA 1MQGA 2R71A 2ESNA 3T9HB 2E0SA 3M3FA 1MPCA 1EZPA 5JEIA 1OLAA 3CG1A 1B7UA 1FTJA 3CI8A 4QFNA 3KSJA 3EHTA 5I56B 1LFIA 2ALUA 3C33A 3TKDA 4G77A 1MM6A 2O6AA 3KSXA 4WKMA 4ZEKA 2HEUA 5A5XB 4FE8A 4ZDMA 1MDP1 4Q8RA 5FHOA 1EZ9A 1JEVA 3JYRA 3D4GA 3PGFA 3QAXA 3N26A 4ECFA 4PP0A 3U94A 1SVXB 3OELA 3FXQA 1B7ZA 4F3GA 1N3XA 3KGCA 4BDQA 2D21A 5FHNA 1AH5A 1H44A 2DE2A 3QYTA 4JWXA 1LSTA 2GFEA 3VLVA 4F1VA 4O3BA 1NNPA 2W7YA 3K1NA 4QSCA 1LB9A 2X26A 1P99A 3RUMA 3Q27A 4EXKA 3EF7A 4GF8A 3O2AA 1ZTYA 4OTEA 4N07A 5DEXA 4P11A 2F34A 4FEDA 3IORA 2IA4A 2O7IA 5AA2B 2HCAA 4ESXA 4ZEDA 2VOZA 4GXAA 4KYDA 2HZKA 3K4UA 2NVUB 1URDA 2AL5A 2QS1A 4ND9A 3IO4A 3HCQA 4F29A 1IQ7A 4NF6A 5KDTA 1B0HA 3U93A 1NH7A 4FATA 3IB0A 3S4UA 3CFZA 4GOTA 2I3WA 3MVWA 4MLVA 3IOUA 3ZKLA 5CBRA 1Z7ME 2XD3A 3T9UA 1B6HA 3ODBA 4LONB 4ELQA 1MQDA 2E1SA 4OMBA 1Y1ZA 4LZ5A 4OVJA 2DP8A 5F1QA 4OHNA 5CMCA 1B0LA 4U23A 3TPAA 2B3BA 3K6VA 5JTYB 4YKPA 5I2NA 2NOOA 3H7MA 2OJTA 2PVUA 4YKJA 4ZE8A 1USYE 1MS7A 2P0SA 3PPRA 1MM7A 3ONMA 4QSEA 3S9LC 5CM6A 1LB8A 4Q5TA 3PPNA 1PB8A 1SD3A 4WEDA 4JDFA 1F9BA 5H8QB 5L8DA 2ZMBA 2X7PA 3RQTA 2V84A 3FVOA 4Z7EA 2HZLA 1ZLQA 1MXUA 3VXCA 4EF2A 1IUDA 2XXHA 1SW4A 4KD5A 2XXTA 3UA8A 3N5LA 4G8HA 3PD8A 3TCGA 2XXYA 4GVOA 4U4SA 2XHDA 4OFOA 5A5XA 1VR5A 4XKNA 1OVBA 1QKAA 1P1UA 3KFMA 3LSXA 1FQFA 1AL3A 1N3WA 4JSDA 3TODA 5K2YA 3FVGA 2A5SA 2GRVA 2Z22A 3S9MC 2F8DA 1FQAA 1QUIA 2A5TA 2VD2A 2VD3A 2O84X 1LCTA 3KJTA 1CB6A 2V93A 2VP1A 3MVZA 5F7VA 4IO3A 2ONSA 4KR5A 4LQ2A 4GL8A 1ZU0A 1H76A 1LCFA 4QFKA 4YKIA 1MQIA 4UACA 2V25A 3OENA 1B2HA 2D3IA 3KJ7A 1POY1 5H8NB 1II5A 3TTNA 5I2KB 3FJ7A 1NNFA 1NNTA 1QUKA 1SW1A 2ZNSA 2DYXA 4LVQA 2Z8FA 2QMXA 3MW0A 1PBPA 1JETA 1SBPA 4R6HA 3QIMA 3LR1A 2V3UA 2XXQA 4KCDA 3ECRA 2UVHA 3RT6B 1SI0A 4GFRA 4DXCA 3HO7A 1FTOA 2DVCA 2XXIA 2DQVA 1LAXA 4MF3A 2QS4A 1GV8A 2Y7PA 1IXHA 4KPTA 4YMAA 1FCKA 4G8MA 4FEBA 2I3VA 5ITOA 3ILTB 4QSDA 3B6WA 4E0XA 4F3PA 3PPOA 1A7LA 1O63A 1IZ1A 3QXMA 1IXCA 3K1MA 5JTYA 3LUYA 2Z23A 2O51A 2I0BA 3TQWA 1YPNA 1J1NA 2HXWA 5IAIA 2PT2A 3L6HA 1Y3PA 5L9OA 1EZOA 1ZKBA 4POXA 4TQUQ 2F35A 1ZMGA 2GH9A 5DVIA 4G2ZA 4EDPA 4K3FA 4AQ4A 3Q26A 5H8QA 2BJJX 2XX8A 1MQHA 4GRKA 1Y3QA 3ZS6A 4OEVA 3VVDA 4BDRA 3L6GA 4I1DA 4RY1A 5DEXB 3U8QA 4AB6A 4F2OA 1FTLA 1TT1A 2GHAA 3CVGA 1DSNA 2OCUA 3KOTA 3O6HA 1URSA 3MC2A 4X48A 2Q8JA 3H3GA 5DVJA 3OXNA 3MJNA 4GQOA 3CSGA 5I58A 1MY4A 4FECA 4G4PA 5KDTB 1OVTA 5DT6A 5ISUA 2KLFA 1DPEA 3GBAA 4M1VA 1WODA 1VE4A 3CIJA 2PMSA 4EQ7A 2F7AA 4U2RA 4U1OA 3EHUA 5ELVA 4R72A 1B4ZA 1ATGA 1P1QA 4PETA 4H67A 1ANFA 1H3DA 1MH4A 1H45A 1OQGA 5BUUA 3OD7A 4F1UA 1LGBC 1MXZA 1UIVA 4IGRA 2B65A 5I2NB 2FYIA 2DWHA 3OO8A 4HW8A 1B51A 3PU5A 2V3QA 4OFJA 3FVNA 3B7DA 3R7XA 4QFOA 3TYHA 5L9SA 5I2KA 3E4RA 2I58A 3H06B 4OQOA 3SEWA 4ELPA 5B70A 1XHYA 1SQYA 4HTGA 3R26A 2QS3A 2LAOA 3F11A 3E9XA 4XKPA 4RNSA 5TU0A 3TTLA 1B9JA 1LAGE 4LA9A 2P2AA 1SYIA 4G68C 3G3FA 1EU8A 3MP6A 3CRBA 3VFJA 1NFTA 1WDNA 3PPQA 1QULA 4NE4A 4DXUA 5FTIA 1XC1A 2OK2A 1DMBA 3DP4A 4R2BA 4H8JA 4QF9A 2OBGA 1JVYA 4AB5A 1Z7NE 3U1OA 3K6WA 5K2XA 1GVCA 5JK4A 2ZYNA 4L17A 2A5TB 4ESWA 3CFXA 4IO6A 4RK9A 1O7TA 2QMWA 1MH3A 1IXIA 1N0TA 3USDA 4H5FA 3W9VA 2DSFA 2ABHA 3MQ9A 4F22A 5I84A 2PBWA 2DXRA 1UTBA 3S9EA 1B3HA 1A8EA 3CG3A 1AOVA 4Z0IA 1I6BA 4RXLA 1Y1MA 1PBQA 3FXRA 1DTZA 4F1YA 3N6TA 4BLAA 3BFTA 2OWTA 1SW5A 4OZ9A 4HCWA 1N04A 3A3UA 4JSOA 4FORA 1JW1A 4X9TA 3UP9A 1A40A 4FAJA 3RN8A 1S50A 4NF5A 2XX9A 4OESA 2OLBA 5EHMA 2QL3A 1JEUA 2Z8EA 2ZNUA 3C31A 4OYVA 2I0CA 3SEUA 1KWHA 4NMYA 3G3JA 3T9XB 3K02A 4YU0A 5TPAA 2F7BA 5TP9B 1PB9A 1S9TA 3CR9A 3LBSA 1TXFA 4H6DA 3HHGA 4YB5A 1M5FA 1B40A 3K6UA 2QSXA 3V83A 4NF8B 4BDMA 3W15C 4ZEBA 3UORA 4YMBA 2F6GA 4I9DA 3G3GA 3KOSA 3ZKKA 3OEMA 1LFHA 5CMMA 2ZYMA 1OIBA 1B52A 3M3LA 3OO7A 4H8IA 3KEIA 4H0WA 4ELOA 2RINA 4KYEA 4U1ZA 3P7IA 2O1MA 3VVEA 4GLIA 1MXXA 3IR1A 1TWYA 2QRYA 4IO4A 2D5WA 1IEJA 2DWIA 4P0IA 1S7YA 3O28A 4IY6A 1BTJA 3I6VA 4MFIA 1D9VA 4R6YA 4XKQA 4C1TA 2DWAA 2G93A 1B46A 3FJGA 5LOMA 4LP2B 3OOAA 2ZNTA 1LAFE 1NL5A 3KBRA 1YCJA 3SETA 3LC8A 3IOTA 4M4GA 3H6VA 3SEYA 1P1WA 1FQCA 2RF1A 4OERA 3FUZA 3E13X 4JBZA 3VLUA 1PDAA 2UVJA 5I58B 4G68B 1B3LA 3PMVA 4JXIA 2F5XA 4KYSA 4OFLA 3IJXB 1Q35A 1B4HA 3GBBA 4R73A 3CSBA 1ZIUA 2QS2A 3BBRA 3JV9A 1LFGA 1QW0A 3DM0A 2O69A 4DE8A 1Y3NA 1Y9UA 4R9GA 1VFEA 1EH3A 4OENA 4DDDA 3E3KA 3V8XB 2DS9A 4PFWA 1GGGA 3KZGA 1B3GA 1MXWA 3IJOB 1A8FA 2RC9A 2I6EA 4POWA 1MPBA 3FZVA 2XXXA 2ONKE 3SEVA 4MH5A 2PT1A 4ZZAA 1JQFA 2QJEA 3TFLA 1AMFA 1DTGA 2XX7A 3SERA 2AL4A 5ITPA 5I57A 4RYAA 3FASA 5EHSA 2RC7A 3IX1A 3Q29A 1MQJA 4C0RA 3RPWA 5BWJA 3B6TA 3H4ZA 1NMUA 2RC8A 4DXBA 1ELJA 2RCBA 5TP9A 2F7CA 4ZS9A 1XT8A 2Y7KA 3VE1B 2H25A 2UYFA 3H03A 3HPIA 3OSRA 2AIXA 4EF1A 4NF4B 4ZEIA 1MY2A 4GD5A 2DOJA 1MRPA 1NH8A 1N84A 4WXJA 4NF8A 2Q2AA 1JW4A 2UXAA 3GXAA 3PMWA 1R9LA 2NWJA 1LBCA 3LSLA 3OMBA 1QUJA 3EPEA 4MLQA 3H6UA 2IEEA 2CZLA 1IITA 5AA4A 3HHFA 1TFAA 4YB7A 1DPPA 3QUFA 1ZBMA 1CE2A 3KN7A 3Q25A 3OO6A 3OEKA 3EHSA 2REGA 3MPLA 4PQJA 1FQBA 1UTBB 3AXFA 5IKBA 3ZSFA 4TLLB 2ANJA 5I59A 2ZYOA 3VV5A 4THIA 5DTBA 3PUWE 1XVXA 4IO5A 2I4BA 3K0VA 2OZZA 2NUVA 1LBBA 1B58A 5HM4B 3IOVA 2Q2CA 3G3IA 3MZ9A 4NF5B 2XXUA 2CMOA 4F39A 5H8HA 4G68A 2HAUA 3V89B 1N76A 3D4CA 1GR2A 3TTMA 3K2DA 3EQ1A 1YAEA 1US4A 3IK6B 5TPAB 4OXVA 4X1DA 3UIFA 4EQBA 5ICQA 3UK4A 4R6KA 4DCXA 3T93B 3G3HA 4QFPA 3Q28A 1GTKA 3C32A 4NWCA 3O97A 4QFLA 1IXGA 4U21A 5KCJA 3O6IA 4R74A 2HQ0A 3TEPA 4TLMB 3IOWA 2XD2A 3LSFB 3T96B 4EUOA 5AE4A 3PMXA 5EYFA 2YJPA 1A99A 3H6WA 4XXUA 1H43A 2XXWA 3U72A 2R6GE 2ZYKA 3KN8A 3DLNA 1YTVA 1B1XA 1VFDA 5DVFA 1B3EA 4XTCQ 3TAJA 4C1UA 1ZJLA 1USYH 2PX1A 5L9MA 4R9FA 5H8FA 1FW0A 3FIRA 2DWJA 4GL0A 3THIA 3FGSA 2OWSA 4GXSB 1BP5A 3IAZA 3IL1B 1B1HA 1HSEA 3T22A 2Z8DA 3TDJA 2ONRA 1QKBA 4RPNA 1UTHA 4NF4A 5B7DA 3TQLA 4U22A 4EXLA 4PFTA 1O64A 1URGA 4QRZA 1IIWA 3TUSA 3K1PA 1Y4TA 4MBPA 4TOZA 4DZ1A 2G29A 4OWDA 3VVFA 3O9PA 1DOTA 3FVKA 4U4XA 1M5CA 1PB7A 3T66A 3A09A 3MP8A 1MXYA 1SYHA 3TCFA 2VHAA 1UIUA 2B3FA 4PFUA 2F36A 1FQEA 1M5DA 4H5GA 1AIVA 3N6UA 2DE3A 4QHQA 1JW5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5F24A 4NWDA 3TTKA 3K6XA 1US5A 4JWYA 1NUZA 2DE4A 3TMGA 4YICA 3T0JA 1FQDA 3FD3A 4OEUA 5HPQA 2I49A 2P1SA 3PPPA 1HSJA 1LBXA 3R6UA 4KFQA 3RY3A 3C9HA 1B5IA 2I48A 3PUVE 4EQ9A 4O3CA 5CC2A 4ZECA 4R75A 4I3EA 5T3JA 4F3BA 3FXBA 4HS7A 2O1LA 4BDOA 2YLNA 3TTRA 5J1DA 5I57B 4DIGA 3MAMA 4YB6A 1I6QA 3LSWA 1OMPA 5IZ3A 4F19A 3MUQA 4N91A 4P1EA 2Q8MA 4ONYA 4F3SA 4KQPA 1RYOA 1BLFA 3MPKA 3MZBA 3U65A 1XS5A 1FJ9A 2DVZA 3H6TA 1L5TA 3PV0E 3C4MA 2X7QA 1Q1KA 2F6PA 4YAHX 3FV2A 3UN6A 1XVYA 3FXUA 1HSLA 5H8SA 1IMFA 2WYKA 4G8NA 1I69A 4JB7A 1B5JA 4P8BA 2O7UA 1BK4A 4HCYA 4JVCA 2P3VA 3BFUA 4DLDA 1R6ZA 1NV7A 1SW2A 2F97A 3QMFA 2H98A 5AA4B 3KG2A 1FPLA 4H1XA 2RCAA 5ICTA 1SI1A 3DP6A 2HPGA 2R9JA 4BDLA 3CFLA 3VXBA 5CBSA 4IGTA 1PEBA 4G61A 3FATA 3RT8A 3FJMA 5I59B 3VLWA 4MEVA 1RYXA 4NTLA 4AS5A 3MP1A 1B3FA 1NNKA 3G7WA 3MZ1A 3WAEA 1Y4CA 2V3TA 3MVYA 1B5HA 4XIGQ 4LATA 4ZE9A 1M5BA 3K00A 1XOCA 4IO2A 1QVSA 2Y7RA 5I56A 4RA1A 5H8HB 2FNCA 4I3YA 5CI5A 3RTFB 4O3AA 2Q9TA 4Q0CA 4LUBA 1BKAA 1OQHA 2UYEA 3TELA 1B05A 1Y20A 1NUXA 3HN0A 3O6GA 3MWBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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