3SEVA

Zn-mediated trimer of maltose-binding protein e310h/k314h by synthetic symmetrization
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEHELAHDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
publication title An approach to crystallizing proteins by metal-mediated synthetic symmetrization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 120
structure length 370
sequence length 370
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3sevA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3sevA01
2ANJA 3GLBA 1SW1A 3RTWB 2FYIA 4H6DA 2NUVA 1LSTA 3H06B 3K6WA 2XX7A 4C1TA 3FD3A 1MH3A 1SW2A 1Y4CA 1N7XA 3P7IA 3PUVE 3FVOA 4ISUA 1MG1A 3OOAA 1MY2A 4GXSB 2O7UA 3RT6B 3OO6A 1POY1 1TFAA 3TQWA 2RKMA 2V25A 4NTLA 1MY3A 1KWHA 4P11A 3MVYA 1SI1A 3PGFA 3TQLA 2D5WA 1QKBA 4C1UA 3KN3A 3TPAA 1URDA 2QMWA 3H6TA 4QFOA 5EHSA 2GH9A 3IK6B 5A5XB 2I0CA 2B3FA 3I6VA 4OQOA 3FXRA 3RY3A 3JZJA 3CRBA 3PPOA 1BLFA 3HO7A 5KZTA 3KOTA 3OO8A 1H43A 2H5YA 5HPQA 1GTKA 2ESNA 3EHSA 1OVBA 3CVGA 4EQ7A 1B9JA 3W15C 4HCYA 3T9HB 4AB6A 1QJMA 3OENA 5I84A 1LBCA 4OZ9A 1PBPA 3RN8A 4PP0A 3G3IA 3PD8A 2Y7PA 4GD5A 3GBAA 2PT2A 1OVTA 1JQFA 3O29A 4R74A 4KI0E 1B40A 5AA2B 3HHGA 3JV9A 1SYIA 1ZTYA 4MLVA 1SDXA 3PUYE 2HAUA 1NKXA 2FNCA 3HN0A 3KJTA 1XC1A 1B52A 3K02A 1S9TA 2ZNUA 2DS9A 3QUJA 4G68B 2QS4A 1B4HA 5I58B 3G3GA 4OFOA 2HFBA 3M3LA 2XXRA 4QHQA 1UTBB 3UK4A 3H6UA 3RGYA 2I48A 3R7XA 4ZEIA 1A99A 1FQCA 4IY6A 2Q2AA 5AA2A 1NMUA 2AIXA 4H67A 4KQPA 2Z8FA 1RKMA 3Q26A 1MY0A 5I57B 5FHNA 2F5XA 2ZYNA 1Q35A 3IO6A 1P1WA 5ITOA 1PB7A 1B5HA 3U8QA 5BWJA 1WODA 5DTBA 1B3FA 4LZ7A 3IAZA 5I58A 3S9LC 3FASA 3LUYA 1H76A 1US4A 5L8DA 2XXYA 5CI5A 4R6HA 2E0SA 1P99A 1HSLA 2ZMBA 3KBRA 3HV1A 4KCCA 1LAHE 4BDMA 5H8FA 2M8CA 2ONRA 4HW8A 4F1UA 1B58A 1DPPA 3DLNA 3U72A 2X7QA 1B7UA 1Z7ME 4U21A 1OLAA 1MPDA 4Q30B 1IXCA 2H25A 3IJXB 1D9VA 1I6AA 2I4BA 1A8FA 3N6TA 4DXUA 4F22A 1US5A 1N0TA 1FQFA 3DELB 4YU0A 1P1QA 3T66A 1PB8A 4EQBA 3K0VA 4U4SA 1O7TA 5CMBA 4ZZEA 1SI0A 2RC8A 3CG1A 3CI8A 1O63A 2XXXA 4EQ9A 5H8HA 1QUJA 1Y4TA 1B6HA 4LUBA 4IY5A 3MVWA 1SW5A 4X1DA 3MPKA 1ZU0A 3E9XA 3KJ7A 1GR2A 2QMXA 3MP8A 1JVYA 1LAFE 1VSOA 4YKPA 4O3AA 4OXVA 4X9TA 4WKMA 3O6GA 1R9QA 3D4CA 4JBZA 3ZSFA 4BDQA 2ZNTA 4PFTA 3OXNA 2Y7WA 4G4PA 1ZIUA 3VV5A 4K3FA 2PYYA 1PB9A 1FQAA 4QFLA 3ZKKA 2KLFA 3HHFA 3VXBA 4JWOA 4ZEDA 4E0XA 1SW4A 4NMYA 5DT6A 3K6XA 2XXTA 2HCAA 4OWDA 3AXFA 3OSRA 4Q5TA 3O6IA 1TXFA 4H1XA 2CMOA 5TPAB 1M5EA 2O51A 2DE3A 3OO7A 3MBPA 1UIUA 3EQ1A 3MUQA 3FVNA 4Q0CA 3TTMA 3M3KA 1MH4A 4IGRA 1USYH 3MC2A 1IXIA 3QXMA 4EDPA 3CIJA 1B7HA 3Q29A 4ND9A 1H3DA 3PD9A 1IUDA 4GVOA 2DSFA 5HM4B 1B4ZA 3S2VA 3FATA 1MDP1 1J1NA 1MQIA 2DVCA 3PPNA 4LZ5A 4F3GA 3RT8A 2V3TA 4ESXA 3VLUA 1PBQA 1NL5A 3SEUA 3CFXA 1LAXA 3U1OA 1D9YA 3UORA 4F1VA 3CSGA 4F3SA 3DP4A 1YTVA 3DP8A 5CMKA 5H8SA 4DCXA 1QVSA 4DLDA 1B7ZA 3S9NC 3OO9A 4H5GA 3ILTB 3TCHA 1ELJA 1DSNA 4GXAA 1JVXA 5FHOA 1I69A 4M4GA 1IIWA 4DDDA 2F7BA 4RXLA 1IQ7A 4LP2B 2V3QA 1S7YA 3IOVA 3MZ1A 1USYE 3TAJA 2Q89A 1LB8A 4QF9A 1IZ1A 2QRYA 5AA2D 3G3FA 3O66A 1N04A 3B6QA 4ECFA 2F35A 1EZ9A 1JNFA 3PUWE 3L6GA 5KDTB 3OEMA 4P0GA 3RNNA 1VFDA 3PUXE 2X26A 2XX8A 4F18A 3VLWA 2UVGA 4XKNA 3K6VA 3VVEA 2DVZA 4ZE9A 3TKDA 1YAEA 3SKPA 4KCDA 3TFLA 3Q28A 1YCJA 1LGBC 3L6HA 5DVJA 1UTHA 3K6UA 1MPBA 2DE2A 3LSXA 2F6PA 4KD5A 1H44A 1EU8A 1MXXA 1JW1A 1B0LA 3MQ9A 1SBPA 3QIMA 3KEIA 4KYSA 4RPOA 4LZ8A 3K2DA 2B3BA 4IO6A 1RYOA 3C32A 2UYEA 1DOTA 5DVFA 1OIBA 3TDJA 1BIYA 5IAIA 4G68C 4F2OA 4DZ1A 4JWXA 2DYXA 4R73A 4DCYA 5DYHA 4THIA 4FATA 2V3UA 2PVUA 2HAVA 5TU0A 1MM6A 2OWSA 5CBSA 1A8EA 2O84X 2NVUB 2Q8JA 4F1YA 2QS3A 4H8IA 2XXWA 3N26A 4PQJA 5ICQA 4GOTA 4BLAA 2QSXA 1M5FA 2H9BA 2E1SA 4FIMA 5L9OA 4WXJA 3SESA 3S9MC 4GIZA 4NF5B 4NE4A 2NXOA 3QAXA 1TFDA 4QSCA 1N84A 2I0BA 3H3GA 1OMPA 3OD7A 1IXGA 3PUZE 3IORA 3UP9A 4ZEFA 1B3EA 4GRKA 4QFPA 4UACA 4R9FA 4TLMB 4X1BA 3TTNA 2REJA 2DOJA 3SEXA 4MLQA 4R75A 3ZS6A 4ELRA 4LA9A 4R2FA 3TTKA 1UQWA 3PPPA 1XVYA 4OFLA 3R6UA 4RJZA 5A5XA 3BKIB 4OERA 1O64A 2GHBA 4IO7A 4QFKA 5TP9B 1N76A 4H8JA 4I62A 2G29A 1PDAA 1MY4A 2UYFA 4OFJA 2YPNA 2V84A 5ICTA 3IL1B 4JSDA 1ATGA 5IKBA 4U23A 3LSFB 2P0SA 3C9HA 2VP1A 3G7WA 2XHDA 3KSJA 1MQGA 4EUOA 4GL0A 1ZMGA 4PETA 3U93A 3UN6A 3EF7A 4U4XA 1I6BA 3GXAA 3N5LA 4GFRA 5CM6A 3IO4A 5KCJB 3TTRA 4XXUA 1QUIA 4FEBA 2F8DA 2Z8DA 1GVCA 4KYEA 1B3GA 3VE1B 1PEBA 3G3HA 4G68A 4XKRA 1FW0A 4U22A 2VHAA 1H45A 5AA3A 1URGA 1UTBA 1ZJLA 1ZBMA 5CMMA 4YMAA 3FJMA 1II5A 3GBBA 2CZLA 4KYDA 4FEDA 3G3JA 2REGA 3N94A 2UVIA 1AOVA 4MH5A 4YAHX 3TELA 3B7DA 1B0HA 4PFWA 3T93B 3FGSA 2IEEA 3V83A 2PMSA 5I57A 3D4GA 2WKYA 3FV1A 1A55A 3WAFA 3BBRA 2OJTA 4R6YA 2F6GA 4YMBA 4ZS9A 5AA4B 3OSQA 4N07A 5ITPA 3T9UA 4OETA 4YB7A 3IJOB 1UIVA 2RF1A 2Y7RA 4TQUQ 4RK2A 3IOUA 1RYXA 5JEIA 3TYHA 4Q8RA 2GRVA 1WDNA 2O69A 4H5FA 3KSXA 2F97A 2PT1A 4UA8A 4O3BA 3CG3A 4F29A 2O6AA 3MWBA 1P1UA 3FVKA 1Y1MA 3HPIA 2OZZA 1NNTA 3PPQA 2XXPA 3MZ9A 4LQ5A 4EF1A 1OLCA 5FTIA 1PC3A 2R9JA 4YB5A 1NNKA 4G8HA 1AL3A 4YICA 5I56B 3MJNA 3O6HA 1BKAA 4XTCQ 1LLSA 2V93A 3BFUA 5AA1A 2R71A 3A3CA 5I59B 1R9LA 1JW4A 3DP6A 1QULA 2ONKE 2GHAA 3C35A 3VVFA 3MZBA 1ANFA 2A5TB 2XD3A 3QK6A 3FZVA 4HS7A 3RPWA 4BDLA 2ZNSA 4YKIA 3M3FA 3B6TA 5I56A 5CC2A 4M1VA 2XXUA 1MM7A 1DMBA 3K01A 2OWTA 3OMBA 4G77A 2I49A 1NH8A 2I3VA 3FVGA 4ELQA 3LSLA 1N3XA 2D3IA 5TPAA 1FQBA 5FTHA 4I8CA 4U1ZA 3TUSA 2HEUA 1EZOA 3SERA 4IB2A 4ZDMA 4OHNA 1LFIA 4U1OA 2OCUA 2ZXTA 3QUFA 2A5TA 4F3BA 4RA1A 1B5IA 1LCTA 3KOSA 3IB0A 4KFQA 3C4MA 4F39A 1MPCA 3VXCA 2XX9A 3FJ7A 3UGWA 5AE4A 1FTJA 4DXBA 1FTOA 3PU5A 3ONMA 1FTKA 2YLNA 3TCFA 4RK9A 4NF6B 1HSJA 2H4IA 3IB1A 3V5AA 3JYRA 1MY1A 1QKAA 5JTYB 2H99A 3PMVA 1IITA 1MQDA 2IA4A 1LFHA 4FECA 1ZLQA 4BDOA 3FXUA 3W9WA 2Y7IA 4JWYA 4R72A 3LSWA 4ZE8A 4HTGA 5K2XA 2QS1A 5L9SA 4NWCA 1NNFA 1TT1A 3UIFA 3ODBA 4NF6A 4DXCA 3DM0A 3M8UA 4TOZA 3OEKA 3FXQA 5JTYA 1CB6A 4ELPA 3PPRA 3H7MA 4NWDA 1NNPA 4X48A 3V8XB 2OLBA 4IO5A 4JDFA 4IGTA 3K4UA 4QRZA 4KR5A 2BJJX 1SYHA 3CR9A 5I2NB 1AMFA 4H0WA 2F36A 4FJPA 4ONYA 2PBWA 1QW0A 1Y3PA 2XD2A 4OENA 2UXAA 3PMXA 2VGQA 3W9VA 1D4NA 3EN3A 4ELOA 3ILUB 3MP1A 5KDTA 3I3VA 3FV2A 3RLFE 3KN8A 2Z23A 1MQHA 1MDQA 4LONB 1TWYA 1IEJA 4IO2A 4JB7A 2I4CA 2FA7A 3GZGA 4EXLA 4DIGA 3E13X 1B3LA 1AIVA 5EYFA 4YB6A 2DWAA 2RCAA 3EHTA 1CE2A 1M5CA 3KG2A 5BUUA 1SVXB 2OK2A 4F3PA 1DTGA 2G93A 3H6WA 5CBRA 2PX1A 1FTLA 4KHZE 3N6UA 1LFGA 1R1NA 3O9PA 2I3WA 4XKQA 1JEVA 3ECRA 5CRYA 2DWIA 4G8NA 4I9DA 3U92A 2I6EA 2XXVA 2AYSA 1B2HA 5DVIA 4GWOA 1B1XA 4RY1A 4OEUA 4OESA 4NF4B 3Q25A 1B46A 4OMBA 3SEWA 3MAMA 2OBGA 4R9GA 4EF2A 4O3CA 4GL8A 3ZKLA 1AH5A 1MXVA 5LOMA 4ZZAA 3KGCA 3R26A 2LAOA 1OQGA 2NWJA 4NF5A 1FQEA 3MPLA 1WVJA 3EHUA 1ZKBA 3WAEA 4GQOA 2Y7KA 2W7YA 3E4RA 1R6ZA 3LC8A 4QSDA 4NF4A 4ZECA 4RYAA 1BTJA 4R6KA 2VD3A 1MXUA 1S50A 4QFNA 5ELVA 2O1MA 4F2QA 3PMWA 1XS5A 1POTA 3H03A 4IO4A 2Q2CA 2DQVA 3FJGA 2Q88A 1URSA 5TP9A 2F7AA 2DP8A 4RNSA 1HSEA 2HXWA 4JXIA 4TLLB 4JSOA 3TEPA 1EH3A 1JETA 1GV8A 2O68A 1VR5A 1XHYA 3LBSA 4YKKA 2R6GE 4BDRA 5K2YA 1P1OA 3TMGA 2D21A 3K1PA 4ESWA 3LR1A 1B1HA 3T9VA 4F31B 5H8FB 1B32A 5CMCA 2Q9TA 3I5OA 2F7CA 5KCJA 2UVJA 2ZYMA 3KFMA 4G2ZA 4AB5A 4YKJA 3BFTA 3K1NA 1MS7A 3B6WA 4C0RA 2DXYA 1QUKA 1I6QA 2ONSA 3MVXA 4OEVA 1Y20A 1MRPA 4QSEA 4F19A 2NOOA 3SEYA 1DTZA 1T0KA 5F1QA 1DPEA 1SQYA 4FE8A 4R2BA 3F11A 1LCFA 5H8HB 4P0IA 1EZPA 1XT8A 4MFIA 3T9XB 2DE4A 1B3HA 1D3KA 2ZYKA 1JEUA 3RUMA 1P1NA 3T96B 3USDA 3UA8A 2DWJA 3FIRA 1NH7A 3CSBA 2HZLA 1M5BA 4LATA 5AA4A 2QJEA 2THIA 2AL5A 1F9BA 1A54A 2P1SA 1BP5A 3QSLA 2HZKA 4NEDA 5FHMA 3CFZA 4YZZA 1XVXA 1FTMA 3IOWA 1MXZA 2Y84A 2O1LA 1YPNA 2UVHA 3HSTA 4GF8A 4WEPA 1LBBA 1LAGE 4PE5B 4XKPA 4POXA 3U94A 3OELA 3K00A 4ZEBA 1VE4A 4PFUA 4N6PA 5B7DA 4AQ4A 5B70A 1NFTA 2O7IA 4LQ2A 1OQHA 1Z7NE 2ABHA 1L5TA 2QS2A 3RQTA 5H8QB 4U2RA 5I2KB 3HCQA 4MF3A 3G3KA 2RCBA 1Q1KA 2QL3A 3EPEA 3KZGA 5J1DA 2Z22A 2HQ0A 4HCWA 4I1DA 3S9EA 2GFEA 4L17A 4OTEA 3RTFB 5I59A 2RC7A 1Y3NA 4POWA 4FORA 3THIA 4Z7EA 5F7VA 3O97A 3TODA 4NF8B 4E0WA 1B05A 2F34A 3IOTA 2ZYOA 4RPNA 2DWHA 4IO3A 4Z0IA 3C34A 2RINA 3IR1A 5H8QA 3KN7A 2VOZA 5I2KA 3H6VA 3VFJA 5ISUA 3CFLA 1VFEA 1B5JA 1N3WA 5JK4A 2X7PA 3A3UA 4OVJA 3C33A 2ALUA 3VDFA 1LB9A 3IB2A 2P2AA 2XXIA 2XXQA 4NF8A 2Z8EA 5DEXB 1JW5A 2XXHA 3C36A 4FAJA 1Y9UA 1MXWA 1MXYA 5EHMA 2QPQA 3H4ZA 1SD3A 3C31A 2AL4A 3SDFA 3QYTA 1MQJA 3T22A 1FCKA 2DXRA 1B51A 2YJPA 4DE8A 4EXKA 2F78A 3MVZA 3O28A 5L9MA 1A7LA 3O2AA 5DEXA 3E3KA 1UTHB 4BDNA 2A5SA 1A40A 3MW0A 1Y1ZA 3MP6A 2VD2A 4LVQA 3Q27A 3FUZA 2RC9A 1GGGA 3TZAA 1M5DA 3IX1A 4OYVA 5H8NB 3SETA 4KPTA 4GLIA 3SEVA 3A09A 3VVDA 4PFYA 3K1MA 1IXHA 4N13A 3VLVA 4MBPA 1FQDA 2H98A 1XOCA 4H65A 1Y3QA 5HBCA 5M2VA 4ZEKA 3TTLA 4G8MA 4WEDA 3PV0E 3V89B 1N7WA 4XIGQ 2I58A 3S4UA 5I2NA 3TCGA 5H8NA 2B65A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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