3SEVA

Zn-mediated trimer of maltose-binding protein e310h/k314h by synthetic symmetrization
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEHELAHDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An approach to crystallizing proteins by metal-mediated synthetic symmetrization.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 120
structure length 370
sequence length 370
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3sevA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3sevA01
1MRPA 3G3FA 3FXRA 4YAHX 4N6PA 3QIMA 1JW4A 1ZLQA 1FTMA 3OSQA 5DYHA 1JEUA 3RGYA 3TTNA 2DWIA 5ITOA 2P2AA 3N5LA 4R75A 5HM4B 1USYE 4OVJA 3S9NC 3FXQA 5CBSA 3QUJA 5KCJA 3AXFA 4BDOA 2QS4A 1FQAA 3HCQA 3JV9A 4PFUA 2Z8FA 4GQOA 4YB5A 3DM0A 4ZZAA 1LBCA 4ISUA 4NF6B 4YMAA 5EHMA 2I49A 4F2QA 1A54A 3T9XB 1I69A 3A3CA 3C4MA 3ZKLA 1O64A 3MPKA 1YCJA 4NWDA 3T22A 1MY2A 3PUXE 4TQUQ 3TCHA 2I0CA 1MG1A 3O6IA 4F2OA 1SD3A 4NEDA 4I1DA 1I6QA 5TU0A 3O29A 4EXLA 3TEPA 1NFTA 3IL1B 5I56A 2UVJA 3MZ1A 1SW4A 3RPWA 3LBSA 3JYRA 1MQIA 4RY1A 3UGWA 3OO6A 2RC7A 2Z23A 1UTBA 4YICA 1MXWA 4QSDA 5DTBA 3V8XB 4IGTA 1B46A 1IEJA 3RTFB 5TP9B 3LSXA 1B0LA 1N7WA 1P1QA 2XD3A 4LZ5A 4M4GA 5M2VA 1GVCA 4LUBA 4XKRA 3U1OA 3A3UA 3VV5A 4DE8A 5AA3A 2XX8A 3F11A 1TFAA 1YTVA 2ZMBA 3U94A 5AA2D 3PMXA 1OMPA 1US4A 4F29A 4NF8A 4ND9A 2V3UA 4UA8A 1LFGA 2F97A 2YJPA 4ESWA 4F3PA 4GF8A 5DT6A 5AA4A 4I8CA 1NNTA 4OQOA 1AMFA 5L9MA 3TTRA 3CSBA 5EYFA 5K2YA 1SI0A 4F19A 3G3KA 1B4HA 4U1ZA 4F3SA 1MY4A 3TFLA 5I2NA 1MPDA 2PVUA 3H06B 4G8HA 3UP9A 4Q0CA 3VLVA 1SYHA 1D9YA 1ZTYA 4OWDA 2Q8JA 1B32A 1MH3A 3MVZA 1B3LA 1QVSA 3ONMA 1JQFA 1MM6A 4M1VA 1PBQA 4ZE9A 1SW5A 3UK4A 1SYIA 3RTWB 3SDFA 5I58A 2A5TB 1R1NA 1B1XA 2QSXA 1US5A 2I48A 3IK6B 2O7IA 1LSTA 5CMBA 4F1UA 2E1SA 2Q9TA 4XTCQ 3G7WA 1HSLA 2E0SA 2VOZA 5ELVA 2V93A 3K6VA 1H45A 3KOTA 1EZPA 3PV0E 4RK2A 3HN0A 3KSXA 2ESNA 1O7TA 1Y3QA 4O3BA 4Q5TA 1XOCA 2F7BA 1QUIA 2O7UA 2OWTA 4QFNA 3R26A 1N84A 4GFRA 1NNPA 2DYXA 3TQWA 3G3JA 2XX9A 4U22A 2F35A 4NF5A 1VE4A 4OENA 4EF2A 4F18A 1SW1A 5CM6A 2A5SA 2XXQA 3W9WA 1OLCA 5JEIA 1P1UA 2DVCA 2ONRA 3BFTA 1D3KA 2PBWA 3BKIB 3M3KA 4XKPA 3TKDA 5KCJB 1BLFA 1F9BA 1B58A 2O1MA 3K1MA 4U4XA 4X1BA 4ZZEA 4DCXA 3MAMA 5H8FA 5FHNA 1B7ZA 1QJMA 2G93A 2Y7IA 3CI8A 1S50A 3N94A 1MS7A 4JB7A 4YU0A 2YLNA 4ZECA 2ZYKA 1N7XA 2Y7RA 3FJGA 3FATA 1MPBA 3KG2A 3MZ9A 5I2KB 4R6KA 4X1DA 2V3TA 2NWJA 3RT8A 3MVWA 4C0RA 3QSLA 4JXIA 4KPTA 5FHOA 3HHFA 2O84X 4OETA 4HW8A 1P1OA 4JWOA 1QUJA 2HCAA 1N3WA 2ZNTA 3PPNA 4IO3A 3FASA 4BDQA 4WEDA 3FUZA 1URDA 3IB1A 1A99A 2AYSA 2WKYA 4N13A 4OEUA 4R2FA 4HTGA 2CMOA 4DLDA 1R6ZA 1ZBMA 4R73A 3O6GA 3S9LC 1JW1A 1PB8A 5I57B 3KOSA 3E13X 1ATGA 3RN8A 3T93B 1IXCA 3B7DA 1FTJA 1MXXA 1ZIUA 3K02A 3MP1A 5TPAA 3RLFE 2Q2CA 3MZBA 2XXRA 1GTKA 3CVGA 3ODBA 4EQ7A 1ZJLA 4HS7A 2G29A 2XXVA 4YB7A 2ABHA 3C33A 4TLLB 1M5CA 4WXJA 3TCGA 2XXWA 3Q25A 2FYIA 4LZ7A 3TMGA 4C1UA 2OLBA 5BUUA 3PPPA 3O2AA 3MVXA 1FQFA 3V89B 5H8NA 2XXXA 3D4GA 2NXOA 3SEXA 5ITPA 4AQ4A 3I3VA 3KZGA 4G8NA 3EHUA 2RCBA 3SEUA 3V83A 1URSA 2QS2A 3KJTA 5A5XA 1LFHA 1AIVA 1B5JA 4UACA 2BJJX 2DXRA 3C35A 1H3DA 4POWA 2A5TA 3TPAA 1TXFA 1XC1A 2RF1A 1FTLA 4O3CA 5EHSA 4ECFA 4EUOA 3RUMA 3M3FA 5CRYA 3VLUA 2F36A 1B4ZA 2HXWA 1Y9UA 5F1QA 1OQGA 5AA1A 4IO2A 2RC8A 3MW0A 4U23A 4HCYA 2DE4A 3HV1A 4KQPA 4O3AA 2B3FA 4PQJA 2H25A 4X9TA 3LUYA 4YKJA 4R9GA 1UIUA 3T66A 3MVYA 3KFMA 1LLSA 2ANJA 2H99A 1FQDA 2RCAA 2UVHA 1Q35A 2ZNSA 2ZYNA 4GVOA 4L17A 1BIYA 2DWHA 2QMWA 4GLIA 2OK2A 3K4UA 3U8QA 4G77A 4KYDA 2ONKE 2VGQA 4NF4A 1CE2A 5DEXB 2PYYA 2F7CA 1GR2A 3MJNA 2H9BA 1GGGA 3CG1A 3IJOB 1I6BA 2FA7A 3HO7A 4E0XA 2Q2AA 1MQGA 1YPNA 1JEVA 4OXVA 1D4NA 1ELJA 1VR5A 3CG3A 3CR9A 3U72A 4EXKA 4GD5A 1JVYA 4H0WA 4ZEKA 3TDJA 2Z22A 1LCTA 3W15C 1NNFA 1B05A 3KN3A 3O6HA 5H8SA 4R2BA 4BLAA 5CMMA 4XKNA 3KSJA 3O66A 2B3BA 1DTZA 2GFEA 2I0BA 3GLBA 4YKIA 2PX1A 4FORA 3OEMA 2F34A 2R6GE 4MH5A 2QPQA 2X7QA 4OZ9A 4WKMA 1ANFA 3FVGA 4YZZA 3EPEA 4MFIA 1XVXA 5FHMA 1PEBA 1WODA 3P7IA 4PE5B 4AB5A 2I58A 5DVIA 3TZAA 1Y4TA 1B40A 4R6YA 2RINA 3SEVA 4EQ9A 5L9OA 4FE8A 4FJPA 4IB2A 2REGA 3EHTA 3FZVA 3CFZA 2VP1A 3G3IA 1A40A 3N6TA 4FEBA 2V25A 1NNKA 3O28A 3OOAA 3O9PA 4P0IA 5FTIA 4Z7EA 3UA8A 3UIFA 1IUDA 2F8DA 1Y3NA 2X26A 3TTLA 4H6DA 1LGBC 1A55A 2O69A 3RNNA 5JK4A 3SERA 1OVTA 4JDFA 3N6UA 3OO9A 3VVEA 3QUFA 1IZ1A 3DP8A 3LC8A 3PD9A 1IXIA 2IEEA 3MP6A 5CC2A 5LOMA 1HSEA 4IO4A 4XIGQ 3PGFA 3T96B 3FJ7A 1WVJA 1LAFE 1H44A 1MDQA 1Z7NE 3PUVE 2I4BA 2PT2A 4G68B 4GL0A 2OZZA 4NE4A 1MQHA 3T9VA 2P1SA 2QRYA 2RC9A 2H98A 2DWJA 2M8CA 2Y7PA 1MXVA 2AIXA 3K01A 2X7PA 4QSCA 3SEWA 3SKPA 1P99A 5A5XB 4AB6A 1UTHB 3G3HA 4JSDA 3W9VA 4DXCA 1EZ9A 4FECA 4PFTA 1P1WA 1XS5A 1II5A 2UVIA 4RYAA 5DVFA 3S2VA 5KDTB 1VFEA 1QW0A 5B70A 3WAFA 3FIRA 5I56B 4H5GA 3SESA 2NUVA 4LZ8A 4R72A 3USDA 1M5FA 3KGCA 4YKPA 3R7XA 3U92A 4E0WA 5JTYA 2DOJA 2LAOA 4DXBA 1BP5A 4FAJA 1ZMGA 3OMBA 4KYSA 1Y1ZA 3G3GA 4FEDA 2QL3A 3H4ZA 5H8FB 5I59A 1LB8A 1SDXA 5ISUA 3QK6A 3CIJA 4PFWA 2HFBA 3TAJA 3IOWA 1YAEA 3H3GA 3D4CA 2I3WA 1DTGA 3FXUA 1B52A 3TUSA 4IO7A 3KBRA 3MWBA 1MXZA 4OFLA 4YKKA 4ZEFA 3EF7A 4LVQA 2KLFA 4ELOA 1R9QA 3PPQA 4LQ2A 1NH7A 3FVOA 3TTMA 4BDMA 3IOVA 2D5WA 4RNSA 1OQHA 4KFQA 4F1YA 1ZU0A 4N07A 2XXYA 4G68A 2UVGA 2O1LA 3N26A 3PU5A 3TCFA 3Q26A 3FVNA 2DWAA 2HAVA 1H43A 2OJTA 2THIA 4GL8A 4Z0IA 1A8FA 2Z8EA 3PD8A 1EU8A 4NF6A 2CZLA 2VD2A 3K6WA 4NF4B 1EZOA 1UTHA 4KYEA 4MBPA 4H8JA 3I6VA 4P11A 5AA2B 5I58B 4ZS9A 3IO6A 1B5HA 4K3FA 2UXAA 1S9TA 3O97A 4H65A 1A7LA 1AH5A 4FATA 1IXHA 3DLNA 3OO7A 4F39A 5K2XA 4BDNA 3VXBA 2HQ0A 2QS1A 4KD5A 4EF1A 1FCKA 2XXTA 1FQBA 4RPNA 3VLWA 2DSFA 4KCDA 3TTKA 2YPNA 4POXA 3K1NA 3KN8A 1I6AA 3B6TA 1USYH 3M8UA 1UIVA 3KN7A 1MY3A 2QS3A 1RYOA 1B3EA 3OEKA 1MM7A 2B65A 3HHGA 1LAGE 1TWYA 2XD2A 3Q28A 4GRKA 4H8IA 3VVDA 4BDRA 5BWJA 1TFDA 1IIWA 3H03A 3TELA 2DQVA 1JVXA 3C32A 3V5AA 5AA2A 1FQEA 3M3LA 1FQCA 1DPPA 4H5FA 1MH4A 2DE2A 4KHZE 4P0GA 3ZS6A 1LAXA 1SVXB 4GWOA 2Y7WA 4MLQA 2AL5A 3IO4A 3K0VA 1XVYA 1PB7A 4GXSB 3TODA 2R9JA 4GOTA 4G68C 3UN6A 3B6WA 1QKAA 3CSGA 4OESA 3FGSA 5I2KA 1T0KA 2Y84A 3IAZA 3OELA 4NWCA 2R71A 4ELRA 3E3KA 3UORA 3B6QA 3WAEA 3DP6A 5F7VA 1JNFA 3E9XA 4NF8B 5L8DA 1DPEA 1RYXA 3E4RA 3PPRA 3S4UA 4BDLA 2PMSA 1MQDA 3OO8A 4IY5A 4YMBA 2XX7A 2D21A 2D3IA 1FW0A 4DDDA 1OIBA 5J1DA 1B3FA 4KCCA 2DS9A 3IOUA 4DCYA 1SBPA 3DELB 4IY6A 3QAXA 4PFYA 3L6HA 3K1PA 4RK9A 4OYVA 4DXUA 2ZXTA 1TT1A 1MDP1 4OFOA 1GV8A 1POY1 3Q27A 3RY3A 4G4PA 4QFKA 5B7DA 1J1NA 4F3GA 4ELPA 3ZSFA 1M5DA 1QUKA 1IITA 4LQ5A 5DVJA 3DP4A 1M5BA 4TOZA 1NMUA 5H8HA 5ICTA 4U1OA 4RXLA 5H8QB 3S9EA 3CFLA 2HZLA 5IAIA 3KEIA 1H76A 3K00A 3QXMA 2DXYA 4WEPA 3VFJA 4ELQA 3K6XA 3PPOA 3H7MA 1EH3A 1IQ7A 3PUZE 3T9HB 4OERA 1Y1MA 1LCFA 5ICQA 2H4IA 2FNCA 3HSTA 3THIA 1HSJA 1B7UA 1NL5A 1M5EA 2H5YA 2OBGA 5L9SA 2XHDA 4LONB 4ZEIA 1WDNA 2GRVA 4X48A 4TLMB 2O6AA 4G8MA 5I84A 1DMBA 1PB9A 2F6PA 2OWSA 2Y7KA 3JZJA 5CBRA 1MXUA 1MXYA 3H6UA 3A09A 1IXGA 5KDTA 2O51A 4EDPA 4ZDMA 1CB6A 1B3HA 3CFXA 4G2ZA 2XXIA 3K6UA 3OD7A 1AOVA 5H8QA 1LAHE 2W7YA 4QFPA 3U93A 5AE4A 1OLAA 3T9UA 3LSWA 1Q1KA 3BFUA 3ILUB 1N3XA 1Y20A 2ALUA 3OXNA 3H6WA 4OHNA 4QFOA 3RT6B 3OSRA 4PETA 4U21A 1Z7ME 4GXAA 1MY1A 1OVBA 2F7AA 4XKQA 5HPQA 2I6EA 4RPOA 2Z8DA 1N76A 1PBPA 4NMYA 4R6HA 1PC3A 2XXUA 1VFDA 2Q89A 3C31A 3RQTA 3FVKA 1URGA 1ZKBA 2ONSA 3PMVA 1Y3PA 1XT8A 3VDFA 4MLVA 3ILTB 3MUQA 3SETA 4PP0A 3KJ7A 4GIZA 4IO6A 1FTOA 2AL4A 4JBZA 4JWYA 4LP2B 3MPLA 4H67A 4OEVA 5H8NB 3PUYE 1XHYA 2VHAA 1B3GA 2VD3A 4EQBA 2Q88A 3IB0A 4OFJA 3I5OA 1O63A 4ZEDA 5I59B 1S7YA 3VVFA 2QJEA 1N04A 3IOTA 5I57A 3TYHA 1R9LA 3C9HA 2P0SA 2HZKA 2XXHA 5TPAB 1NH8A 4OMBA 3OENA 4LA9A 3C34A 4THIA 3EN3A 3MC2A 1KWHA 2ZYOA 1MPCA 4IO5A 5CMCA 4I62A 3PUWE 2F6GA 3GZGA 4HCWA 1LBBA 3PMWA 1AL3A 1B1HA 1JETA 1BKAA 2XXPA 5IKBA 2HAUA 2V84A 1LB9A 2NVUB 2HEUA 4DIGA 1B51A 3HPIA 3LSFB 2F78A 1B2HA 5CMKA 3K2DA 4I9DA 4QHQA 5H8HB 2IA4A 4KR5A 1B5IA 4XXUA 1B7HA 5DEXA 1SQYA 3EHSA 1D9VA 1DOTA 3GBAA 4R74A 3ZKKA 1SW2A 2I3VA 2PT1A 2DP8A 2QMXA 3GBBA 3H6TA 4U2RA 5FTHA 1DSNA 4ESXA 4F1VA 5AA4B 1FTKA 2F5XA 4Q30B 3SEYA 1UQWA 4DZ1A 1MQJA 3GXAA 3TQLA 3IB2A 3VE1B 5I2NB 2GHBA 1JW5A 3IJXB 3H6VA 3R6UA 4RJZA 1MY0A 4F31B 3FV1A 3FJMA 1Y4CA 1PDAA 2RKMA 3MP8A 4YB6A 3EQ1A 4JSOA 2REJA 3C36A 1SI1A 2DE3A 4JWXA 1B9JA 1L5TA 2V3QA 2UYFA 4MF3A 4ZEBA 1P1NA 3Q29A 4U4SA 4NF5B 3MBPA 4F3BA 4Q8RA 3FV2A 2UYEA 3ECRA 3CRBA 1B0HA 2O68A 3LR1A 1UTBB 4H1XA 5JTYB 3IX1A 3IR1A 5TP9A 4ONYA 2GHAA 4FIMA 4QF9A 4RA1A 4QSEA 3LSLA 3BBRA 4QFLA 1POTA 1B6HA 2I4CA 2OCUA 1A8EA 1BTJA 2ZYMA 4LATA 3QYTA 4QRZA 4F22A 4KI0E 5HBCA 1NKXA 2GH9A 4ZE8A 4OTEA 4C1TA 1VSOA 1LFIA 4IGRA 4R9FA 1RKMA 5CI5A 3MQ9A 4NTLA 3S9MC 2NOOA 3IORA 3L6GA 1N0TA 1QULA 3VXCA 2ZNUA 5KZTA 1QKBA 3FD3A 2DVZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MRPA 3G3FA 3FXRA 3QIMA 1FTMA 1NV7A 1JEUA 2DWIA 3FXQA 3ISPA 3HCQA 4YMAA 3T9XB 3E78A 1YCJA 4NWDA 3O29A 4EXLA 2UVJA 3MZ1A 3RPWA 3OO6A 2RC7A 1UTBA 1MXWA 3RTFB 1B46A 3HFUA 4M4GA 5M2VA 3U1OA 3A3UA 3U94A 1YTVA 4P56A 4NF8A 2V3UA 4UA8A 2YJPA 1RDYA 2FVZA 5DT6A 5AA4A 1NNTA 1AMFA 5L9MA 5ISUA 4U1ZA 1MPDA 4DI3D 4G8HA 3MVZA 1B3LA 1SW5A 2I48A 3IK6B 1LSTA 5CMBA 2E1SA 2E0SA 5ELVA 1XOCA 2OWTA 1QUIA 1N84A 4NF5A 4OENA 1VE4A 4HE1A 4F18A 2A5SA 5EQAA 4N6DA 3BFTA 4XKPA 5KCJB 3TKDA 3K1MA 4X1BA 4ZZEA 4PAKA 5FHNA 3N94A 5EQ7A 2Y5KA 4C0RA 3QSLA 4KPTA 4OETA 1QUJA 1NV1A 5LDZA 4BDQA 1URDA 3IB1A 4HE2A 2CMOA 3S9LC 4QBAA 4MAGA 1IXCA 1FTJA 3MP1A 2Q2CA 3MZBA 2WX9A 4TLLB 4G61A 3V89B 3D4GA 4AQ4A 4G8NA 3EHUA 1URSA 2QS2A 3KJTA 2BJJX 3C35A 3TPAA 4EUOA 5CRYA 3KBZA 2HXWA 1Y9UA 4HCYA 4PFRA 4X9TA 3LUYA 2F3BA 2H99A 2UVHA 2ZNSA 2QMWA 4LN5A 4KYDA 1CE2A 3MJNA 2B4LA 2Q2AA 1MQGA 4OXVA 4MCOA 3CR9A 2XWKA 3TDJA 1NNFA 3KN3A 4PFBA 4PFIA 2B3BA 2GFEA 2I0BA 3GLBA 4OZ9A 4WKMA 2X7QA 4MFIA 1PEBA 1WODA 3P7IA 4R6YA 4FJPA 4IB2A 3EHTA 4OERA 4DXCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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