3SEWA

Zn-mediated polymer of maltose-binding protein a216h/k220h by synthetic symmetrization (form i)
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
MKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEHAFNHGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title An approach to crystallizing proteins by metal-mediated synthetic symmetrization.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 121
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3sewA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3sewA01
3K01A 1MXYA 1US5A 1Y1MA 1MXZA 4HTGA 4TQUQ 1DOTA 1EZOA 1F9BA 1MQJA 4RA1A 4ZEBA 5TPAB 5CMKA 5K2YA 2Z8DA 3LC8A 4ZS9A 5AA4B 3O6IA 3E4RA 3OEMA 4P0GA 3CVGA 4R9GA 3O66A 5TP9B 4FAJA 1Z7NE 1B1HA 1JEVA 2AYSA 2Y84A 1NH7A 4KYSA 2F34A 5M2VA 2ALUA 2XX8A 3MZ1A 1OLAA 1B0HA 4XKQA 3IB2A 3EPEA 2ZNSA 4F1VA 1JW1A 2G29A 1T0KA 4F39A 5CRYA 3ONMA 3MVWA 3H3GA 2NVUB 3GBBA 3MJNA 1SBPA 5KDTB 4KYEA 5K2XA 1MQIA 3QUFA 3V8XB 1B4HA 1OQGA 3TYHA 1D4NA 3BKIB 5AE4A 1H45A 5KCJA 1OVTA 2WKYA 3G3KA 2GRVA 3MZBA 1R1NA 4N07A 1NNFA 3IOUA 1LBBA 3H4ZA 3KSXA 3BFTA 1XVXA 2GFEA 3EHTA 4YAHX 3S9LC 1MXWA 5KZTA 3SEUA 2QMWA 2VP1A 3VVDA 4WKMA 4ELRA 3MWBA 5CMCA 1N04A 1B46A 4ZZAA 1JEUA 4G8MA 2X7QA 5I2KB 3S2VA 1LAXA 5AA1A 2PX1A 3W15C 2D5WA 4YMAA 1A55A 4O3AA 2VOZA 2A5TA 4IO6A 2DOJA 5BUUA 1UTHA 4F18A 3Q25A 3RY3A 4O3CA 1GVCA 3RT8A 4ELQA 1R9LA 4PP0A 1OVBA 1IUDA 3MAMA 3SETA 1M5EA 4F19A 1URDA 3VE1B 2DWJA 3FXRA 4YKIA 2OJTA 2DS9A 4IO5A 3OOAA 4MBPA 2XX9A 2I4CA 4NTLA 4Q8RA 4O3BA 4GIZA 1OMPA 3AXFA 1I6QA 3FVOA 1SQYA 2Q2CA 3GXAA 1ZBMA 1D9YA 4BDRA 4LP2B 5LOMA 2PVUA 1SI0A 3VVEA 3T22A 4QFLA 3TTRA 2QS2A 4WEDA 4X9TA 3PMXA 3ILUB 1MS7A 3DP6A 1FQEA 3PUWE 2XHDA 4EF2A 4BDLA 1AH5A 1J1NA 4IY5A 2XXWA 4DXCA 1MQHA 3LSLA 4XKRA 3OENA 3MBPA 3IB0A 3N26A 4PFTA 1B51A 4NF8A 1FCKA 1DTGA 4KQPA 1QUIA 3SDFA 2UXAA 3W9VA 2E0SA 3IK6B 2HFBA 3UGWA 2DXYA 4FEBA 4OMBA 4GVOA 3OMBA 1FTKA 3LSXA 3PPPA 3SEXA 1FQAA 1JETA 4F3PA 4MFIA 4NMYA 4Z7EA 1RKMA 3GBAA 1Y20A 1EZPA 2GHAA 3Q29A 1LBCA 2O6AA 3D4CA 2F35A 4M4GA 1HSEA 3KG2A 4KCCA 4OWDA 1LSTA 3MP6A 4H5FA 3H03A 3TTMA 3U93A 3P7IA 1FQFA 4RNSA 4JSOA 1LFHA 4ZEIA 4FIMA 5KCJB 3T66A 1URSA 2O7UA 2RKMA 1JW5A 5EHMA 1FQDA 1NFTA 3K2DA 4NWCA 4R73A 3ZSFA 5H8HA 1QULA 3OO6A 1QUJA 1DSNA 1LAGE 2V93A 1IIWA 5AA2A 4UA8A 2G93A 4OFJA 2GH9A 2YPNA 2DVZA 3V83A 5F7VA 3UIFA 3PPRA 1M5BA 3TDJA 3B6TA 2A5TB 3RT6B 2QS1A 2F97A 4LONB 2I0CA 1UTHB 3M3FA 1A7LA 2FA7A 4KI0E 1AIVA 5B7DA 2F8DA 4ISUA 3R7XA 2R6GE 4R6KA 4YB6A 3FVNA 1DPEA 4IGRA 2VD3A 2ONRA 3IX1A 2QS3A 4GFRA 3PD9A 3FVKA 3KJTA 1SW5A 1TFAA 2Q2AA 3A3UA 2VGQA 3Q27A 4OHNA 4BDMA 2UYEA 3K6VA 4HCWA 4R72A 2O84X 4NE4A 3MUQA 2DE4A 1ZKBA 3B6WA 2ZYOA 2AL5A 1LAHE 2NXOA 1Y1ZA 1GGGA 3KN3A 2QSXA 1SYHA 3IOWA 4IO2A 5H8QA 4H8IA 1TWYA 4H65A 4RJZA 1EU8A 4DE8A 4RY1A 3RLFE 2E1SA 3MZ9A 2UYFA 5F1QA 3MQ9A 1D3KA 1IXGA 4LATA 4EXLA 3RGYA 3MVYA 3TCFA 4U23A 1YAEA 3UP9A 1A40A 3IORA 1XHYA 4H67A 4M1VA 1B2HA 4POWA 4NF8B 3DP4A 1ZU0A 2I4BA 1NH8A 3K0VA 4YZZA 2XX7A 2M8CA 3RUMA 2V3TA 4OEVA 1SW4A 3ZKLA 1A99A 2REJA 1SW1A 3DP8A 1Y4CA 1XC1A 4DLDA 2XD2A 3C9HA 2DP8A 4U1OA 4OENA 2Y7PA 3KOSA 3R26A 4Q30B 1B3HA 2F6PA 4ESXA 4YKJA 1DMBA 5I58B 3MC2A 3FIRA 5DEXA 3WAEA 3C4MA 2O1MA 3EQ1A 3PUZE 1I6AA 4NF6A 5CM6A 1QKBA 5IAIA 2QRYA 4H5GA 3PMWA 3K4UA 2V84A 5H8HB 3PD8A 3FVGA 2DE2A 1BKAA 4JWYA 2B65A 2XXTA 3Q26A 1M5FA 5AA2B 3VXBA 4G77A 2P0SA 1NNTA 1O7TA 5CC2A 4LZ7A 4QFOA 2A5SA 4RK9A 4X48A 3SEWA 2F7CA 5I56A 1B5IA 5JEIA 1MPDA 3BFUA 5L9OA 2HEUA 5L9MA 3OSQA 3CRBA 2ANJA 1YPNA 1WDNA 1LLSA 1MQDA 1A54A 1B52A 2Y7KA 3FD3A 1YTVA 1PEBA 3ZKKA 2ABHA 3SKPA 3TODA 4ESWA 5L9SA 1FW0A 3IO6A 3OELA 4ONYA 2QJEA 3I3VA 5JK4A 4KCDA 3O28A 5I2NA 5H8FB 1B3LA 3FGSA 2NOOA 2I3VA 1R6ZA 3MPKA 1UQWA 4YMBA 4G68B 1MXUA 3QYTA 3KBRA 3H6TA 1DTZA 3FXQA 1UIUA 1FQBA 2P1SA 3G3JA 5H8QB 2QL3A 4P11A 4R6YA 1USYH 1O64A 3PUXE 1PDAA 2DVCA 4OETA 1B7HA 1LCTA 5CBSA 1XVYA 2X26A 4GXAA 1PB9A 2DWIA 2RC9A 3C32A 3IO4A 3O29A 3LSWA 5TU0A 5L8DA 1QUKA 1HSLA 4F29A 2UVIA 2ZMBA 2D21A 1LB9A 3N94A 4EQ9A 1N3WA 3VFJA 4BDNA 4XIGQ 4TOZA 3CI8A 2F6GA 1ELJA 1MPCA 1ZJLA 3IAZA 4HS7A 2QS4A 4HW8A 1OIBA 1B5HA 1ZLQA 1MY4A 3T9VA 2F78A 5CMMA 2O1LA 4Q0CA 2V3QA 5DTBA 4UACA 3FJMA 1IXIA 1N3XA 4MLQA 1B5JA 4LQ2A 2CZLA 1GV8A 4U2RA 3T96B 4IY6A 3TPAA 3HHGA 1XS5A 2IA4A 3U1OA 4OYVA 4MH5A 3DLNA 3I6VA 2XXXA 5DEXB 4F31B 1QJMA 5BWJA 2OCUA 1ZMGA 4XXUA 4YB7A 4NF6B 5DT6A 3FJ7A 5I59B 4MLVA 3U92A 3PPNA 2H98A 3VXCA 4JXIA 3CSBA 3KN8A 1MY2A 2H99A 4QFKA 3CSGA 2HCAA 2KLFA 1II5A 4C0RA 3KFMA 2BJJX 3VV5A 1PBPA 4L17A 1H3DA 1MDQA 2I6EA 1Z7ME 1FTJA 4BDOA 4U4SA 4QF9A 5I56B 3PMVA 5EHSA 5ITOA 1B3GA 3U94A 4DIGA 1R9QA 1IITA 3E13X 3OEKA 1N7WA 2REGA 3G3GA 2CMOA 4JDFA 3TCHA 4ZECA 1Y3NA 3S9EA 3TTNA 3FATA 3HN0A 3V89B 2I58A 3FJGA 4OQOA 4KFQA 4E0XA 2R71A 2O69A 3KSJA 1MY3A 4GF8A 4AB5A 4OZ9A 5CI5A 3HPIA 2I48A 4LZ8A 1OQHA 2XXYA 2B3BA 1M5CA 3IJOB 5I58A 4XKPA 1MH3A 2V25A 5I2NB 4U22A 3F11A 1IQ7A 4JSDA 3UN6A 3VVFA 4C1TA 2Q89A 1SDXA 4KR5A 4DCXA 3KN7A 2XXUA 4ZE8A 4G2ZA 2I3WA 4ZZEA 2HZKA 1VFEA 1P99A 3LBSA 2ONSA 3RQTA 3HCQA 2NWJA 3FZVA 4R6HA 5ICQA 4FECA 2Z23A 4BDQA 3T9HB 3PUYE 1VSOA 3PU5A 4NF5A 2XXIA 4E0WA 3EHSA 4OXVA 1BLFA 5J1DA 1LFIA 1MM6A 4PFUA 2HXWA 2AL4A 4P0IA 4ZEKA 5ICTA 4C1UA 2Z8FA 1XOCA 5DVIA 1P1WA 3C34A 2I0BA 4F2OA 2ZYNA 3KJ7A 2Y7RA 3KZGA 4QRZA 1B3FA 2H9BA 2HAUA 3T9UA 5H8FA 4FORA 2D3IA 4GD5A 5B70A 5DVFA 4PETA 2DE3A 3LR1A 3R6UA 4GL0A 3B6QA 1O63A 4G68A 4DXBA 3GZGA 1YCJA 5A5XA 1CE2A 1H76A 1LGBC 3K6WA 5FTHA 2THIA 3G3IA 1B0LA 3MP8A 3C35A 3L6HA 3FUZA 4YKKA 3K00A 3S4UA 1KWHA 4ELPA 3TKDA 2XXRA 2RF1A 2F7AA 3PGFA 4TLMB 2O7IA 4EDPA 1MPBA 3VDFA 3RPWA 1A8FA 2ZNUA 4RYAA 2ZNTA 4Z0IA 3K6XA 3OSRA 1PB8A 1WVJA 5I57A 1P1NA 1NL5A 3JYRA 1MM7A 1P1QA 2Y7WA 1QKAA 1JVXA 2OZZA 3MP1A 4FE8A 4LA9A 1NKXA 1USYE 4AB6A 2B3FA 2XXQA 2ONKE 3EF7A 1JW4A 5JTYA 1ZTYA 2PT2A 2UVJA 2FNCA 1B58A 4DZ1A 1GR2A 4F1YA 1ZIUA 4OTEA 4XKNA 4PQJA 1SW2A 1SVXB 3IJXB 1POY1 2H25A 2LAOA 2Q9TA 1P1UA 3G7WA 3QAXA 2ESNA 4LVQA 1P1OA 3HV1A 2PYYA 5I59A 1CB6A 2PT1A 1EZ9A 1POTA 1URGA 4ELOA 3H6VA 1B3EA 3KGCA 2P2AA 1S9TA 3U72A 3M3LA 1SD3A 4F22A 2XXHA 4MF3A 3N5LA 2DXRA 3A09A 4GOTA 1MRPA 1QVSA 3GLBA 5ELVA 3LUYA 4NF5B 3IL1B 4R9FA 3QXMA 1WODA 5HPQA 4I1DA 3PPOA 3PUVE 2Z8EA 2HAVA 1SYIA 2NUVA 1QW0A 2RINA 1AL3A 3T9XB 4BLAA 1TXFA 4F1UA 3E3KA 3RNNA 5HM4B 1UTBA 3QSLA 1LCFA 4WXJA 4JBZA 1B4ZA 1JQFA 4KHZE 1IZ1A 3U8QA 2XXVA 2QMXA 2H4IA 4RPOA 2F36A 3QUJA 4F3GA 4QFNA 5FHMA 4EQBA 3ECRA 4OERA 3MW0A 4H6DA 4AQ4A 4GL8A 3RTFB 3SEYA 2FYIA 4NEDA 2OLBA 1B6HA 4EF1A 5HBCA 5A5XB 3L6GA 4K3FA 4DCYA 1I69A 1AOVA 1N0TA 4LQ5A 4X1BA 4OEUA 4DDDA 3KOTA 4RK2A 1NMUA 3TQLA 1H44A 2ZYMA 3CG1A 4NF4B 3QK6A 2I49A 1B40A 1AMFA 1EH3A 1Y9UA 4KD5A 3C36A 4U1ZA 4IGTA 3FXUA 3H06B 2DWHA 5H8SA 3OO8A 3PPQA 1N84A 3V5AA 1PC3A 4R75A 2XXPA 2HQ0A 3TUSA 1S7YA 3WAFA 4U21A 5I57B 1Q1KA 1MXVA 5ISUA 1B32A 2GHBA 2ZXTA 4GLIA 2OWSA 3TZAA 1L5TA 4PFYA 4FEDA 4ZE9A 1MDP1 1BP5A 1IEJA 5JTYB 3T93B 3S9NC 5EYFA 5DYHA 3I5OA 4H0WA 1JVYA 3MVXA 4QHQA 1VFDA 4THIA 1N76A 5IKBA 5FTIA 3FASA 3UORA 1Q35A 2Y7IA 3CG3A 4KPTA 4H8JA 3O2AA 4JWOA 3HO7A 2OBGA 4TLLB 3TTKA 2RC8A 1TFDA 1LFGA 1RYXA 4NWDA 3CIJA 2VHAA 1D9VA 1FQCA 4PFWA 4YU0A 3FV2A 4IB2A 4YKPA 4KYDA 1VR5A 4G4PA 1NNKA 5H8NA 1B7ZA 3RN8A 3CFLA 3SESA 3VLWA 4ND9A 3H6WA 4ZDMA 3LSFB 1B7UA 4X1DA 3IB1A 1US4A 4QFPA 3UA8A 4I8CA 4U4XA 1MH4A 3EHUA 4GQOA 3B7DA 2YLNA 3IOTA 1VE4A 2Q88A 1PBQA 3C31A 4XTCQ 3K1MA 2O68A 1M5DA 1ATGA 4FJPA 2RCAA 1NNPA 4QSDA 2Z22A 3ODBA 5FHOA 1IXHA 1UTBB 1BIYA 3M3KA 3K1PA 3KEIA 2F5XA 4IO4A 4EQ7A 3OO9A 3DELB 1FTMA 1MY0A 4OFLA 3VLVA 4GWOA 1H43A 3O6GA 3S9MC 1LAFE 5TPAA 4RXLA 1GTKA 3TMGA 1Y4TA 5AA4A 1RYOA 3EN3A 4WEPA 4IO7A 2DQVA 4DXUA 5AA3A 1LB8A 5TP9A 3RTWB 3SEVA 2OK2A 2IEEA 4JB7A 3O97A 3USDA 3CR9A 4ZEDA 3G3FA 4G8HA 5FHNA 2DWAA 3VLUA 3QIMA 1N7XA 2UVGA 2HZLA 3N6TA 4R2BA 4GRKA 3DM0A 5AA2D 4LUBA 5CBRA 3H7MA 3HSTA 3K1NA 3C33A 4H1XA 1MY1A 2RCBA 2X7PA 5KDTA 4RPNA 3E9XA 1SI1A 2W7YA 4QSEA 3IOVA 1FTOA 1S50A 3K6UA 3IR1A 3SERA 3M8UA 3UK4A 2YJPA 2UVHA 4R2FA 2V3UA 4N6PA 3MVZA 1OLCA 2DSFA 2PBWA 3TTLA 1BTJA 3OD7A 1I6BA 5CMBA 3THIA 1IXCA 2F7BA 3TQWA 3Q28A 2O51A 4I9DA 4NF4A 3K02A 4PE5B 2VD2A 4YB5A 3MPLA 1Y3QA 4IO3A 1B1XA 3O9PA 1MG1A 2RC7A 2AIXA 2XD3A 4FATA 1MXXA 5H8NB 2OWTA 5I2KA 4Q5TA 4GXSB 4JWXA 3HHFA 3JV9A 3TELA 1TT1A 3H6UA 3TEPA 3TAJA 4N13A 3A3CA 4F3SA 1ANFA 1UIVA 3N6UA 4G68C 4EUOA 3OO7A 4OVJA 4EXKA 4YICA 4QSCA 3D4GA 3G3HA 3ILTB 3PV0E 4ZEFA 1DPPA 3JZJA 2PMSA 2DYXA 2ZYKA 3BBRA 2QPQA 3TCGA 2R9JA 4HCYA 4POXA 4I62A 1A8EA 3W9WA 4F3BA 4ECFA 1HSJA 1XT8A 3O6HA 3CFZA 5DVJA 4F2QA 3OXNA 1JNFA 4G8NA 3ZS6A 4OFOA 1MQGA 4OESA 1B05A 1Y3PA 4R74A 3FV1A 5I84A 5ITPA 2H5YA 1PB7A 1B9JA 4LZ5A 1FTLA 3TFLA 3CFXA 2Q8JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FBCA 3K01A 1FPEA 1MXYA 3KC1A 1US5A 4GWSA 1Y1MA 1MXZA 4HTGA 4TQUQ 2P3NA 1DOTA 1EZOA 1F9BA 1MQJA 4RA1A 4ZEBA 5TPAB 5CMKA 5K2YA 4QXDA 2Z8DA 3LC8A 4ZS9A 5AA4B 3O6IA 5EQ9A 3E4RA 1G0IA 1LBXA 3OEMA 2XWIA 4P0GA 3CVGA 4R9GA 2PFYA 3O66A 5TP9B 4FAJA 4N4UA 1Z7NE 5EQ8A 1B1HA 1JEVA 5T3JA 2AYSA 2Y84A 1NH7A 4KYSA 5IGAA 1FPKA 4HXVA 2F34A 5A5LA 5M2VA 2ALUA 2XX8A 3MZ1A 1OLAA 1B0HA 4XKQA 3IB2A 3EPEA 2CEYA 2ZNSA 4F1VA 1JW1A 2G29A 4P1EA 1T0KA 4F39A 4GWXA 5CRYA 3ONMA 2XA5A 3MVWA 3H3GA 2NVUB 3GBBA 3MJNA 1SBPA 5KDTB 4KYEA 1CNQA 5K2XA 1MQIA 1FPFA 3QUFA 3V8XB 1B4HA 1OQGA 4PAIA 3TYHA 1D4NA 3BKIB 5AE4A 1H45A 5KCJA 1OVTA 3ROJA 2WKYA 3G3KA 2GRVA 3MZBA 1VDWA 1R1NA 2HXRA 4N07A 1NNFA 3IOUA 1LBBA 3H4ZA 3KSXA 3BFTA 1XVXA 2GFEA 3EHTA 4YAHX 3S9LC 1MXWA 5KZTA 3SEUA 4PAKA 2QMWA 2VP1A 3VVDA 4WKMA 4ELRA 3MWBA 5CMCA 1N04A 1B46A 4ZZAA 1JEUA 5LTCA 2WBBA 4G8MA 2X7QA 4O7IA 5I2KB 3S2VA 1LAXA 5AA1A 1FBGA 2PX1A 3W15C 3IFAA 2D5WA 4YMAA 1A55A 4O3AA 1LBWA 1IMCA 4P56A 2VOZA 2A5TA 4IO6A 2DOJA 1NV0A 5BUUA 1UTHA 4F18A 3Q25A 4X8RA 1NUZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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