3SEWA

Zn-mediated polymer of maltose-binding protein a216h/k220h by synthetic symmetrization (form i)
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
MKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEHAFNHGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title An approach to crystallizing proteins by metal-mediated synthetic symmetrization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 121
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3sewA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3sewA01
3MVZA 3M8UA 3MP8A 1UIUA 4N13A 4OETA 4I62A 3B7DA 3O97A 4EXLA 2GRVA 4AB6A 2VD2A 3SEUA 1OQHA 3RTFB 3T9XB 3MPKA 4F31B 1I6AA 1MDP1 2DWAA 3MVWA 3MVYA 3TZAA 4X48A 1LAHE 2B3FA 4P11A 1MXUA 3OD7A 3TAJA 5TPAA 4WEDA 4RNSA 3OELA 3TTLA 3KN3A 1CE2A 4BDLA 4IGRA 2H5YA 2H99A 3A3UA 1GVCA 4EXKA 4FEBA 2UYFA 3HN0A 4IO5A 5EHSA 2RC8A 4U4SA 3T96B 2XD3A 4F1VA 3THIA 5AA1A 5B70A 2AIXA 2PT1A 2I4CA 3DP6A 1B7UA 4DE8A 4ECFA 2ZYNA 2XXIA 1XT8A 2HAVA 1AIVA 4DCYA 1LAXA 4F3BA 5JEIA 3GBAA 3AXFA 3H6UA 3KSXA 2RINA 1M5DA 3PGFA 3RQTA 1LCFA 5I56B 2F97A 3OO9A 2UVHA 4H67A 4XKRA 3KZGA 4P0IA 1MQJA 4U1OA 2DE3A 5DTBA 4C1UA 2Y7IA 4NMYA 4IO7A 3VV5A 3DELB 2DE4A 3EHSA 1XS5A 3JYRA 1LLSA 3ZSFA 2RC7A 1MXXA 2I3VA 3K1MA 3LSLA 2XX8A 1LB9A 1JQFA 3MAMA 4PP0A 3FV1A 4QF9A 4ZEKA 5ELVA 4R74A 1I69A 4U4XA 2I0CA 4YICA 2DE2A 4G68A 1F9BA 2O84X 4GFRA 4LQ2A 1UTBB 2F8DA 3OEMA 3V83A 1TXFA 3VLWA 4GL8A 3KFMA 5I56A 2RF1A 5EHMA 1A8FA 1SW4A 1IUDA 4LZ5A 1P1QA 2ZYOA 3VVEA 1EU8A 5H8HB 4R9FA 3IB1A 2AL4A 3DP4A 3FASA 2ALUA 3G3FA 3Q29A 4G8NA 4NF6B 3T9UA 2Y7WA 1EZOA 3ILUB 4F2OA 3MWBA 3O29A 2NOOA 4YMAA 4IO4A 4O3BA 3IOUA 1MM6A 3IB0A 1H43A 3B6TA 4KCCA 3TODA 3QAXA 4BDOA 1A7LA 3S9NC 4R75A 1CB6A 3TMGA 4U2RA 5J1DA 4XTCQ 3KJ7A 4KI0E 4HTGA 5ICTA 1MS7A 4JDFA 1LAFE 3LSWA 1UTBA 1YAEA 1N76A 3CFXA 4TQUQ 1TFDA 2DSFA 2XD2A 3M3FA 4N6PA 2Y7PA 1B51A 4R6HA 2F5XA 3O28A 5EYFA 3FATA 3FD3A 5BWJA 2RCBA 5H8HA 4FE8A 1MDQA 4RPOA 5HM4B 3C31A 4NEDA 4FORA 1ANFA 5JK4A 1PC3A 2I58A 1H76A 3RY3A 1S50A 2E0SA 3IOTA 3EF7A 2XX9A 3SEXA 2VP1A 3U72A 4IGTA 2O7IA 4YZZA 3TEPA 3SESA 3WAEA 3LC8A 3UP9A 1RYXA 3PPRA 1GGGA 5ISUA 3MP1A 3ZS6A 5H8NA 4KCDA 4ZEFA 1Y20A 3EQ1A 1Y4CA 2Q2AA 4PFWA 4ZS9A 1JNFA 1M5EA 3TTRA 1DSNA 4ELPA 1GV8A 1MPBA 4DLDA 4ZZEA 4BDRA 2NUVA 5HBCA 1EH3A 4NF8B 3G3JA 3RT6B 1FQBA 3A09A 2I3WA 1AOVA 3OSQA 3K01A 2QMWA 1B3EA 3PUVE 4DCXA 3H6TA 2Q2CA 4R2BA 2ZXTA 3FUZA 5H8QA 4YKPA 1FQCA 2F34A 1FQFA 2DOJA 3MZ1A 3FXRA 4E0WA 5CMCA 2XXUA 3N26A 3HSTA 1AH5A 1II5A 4R6YA 2F78A 3GZGA 4Q0CA 3U94A 4XKQA 2OWSA 1LAGE 4QFKA 3EHTA 2UVGA 5TP9A 3W15C 1JW5A 3SEWA 3MVXA 3MBPA 2HZKA 2QS3A 4XIGQ 3R6UA 4OZ9A 1B5IA 1QKAA 5IKBA 2QS4A 3LR1A 2UXAA 2QS1A 1USYH 5CM6A 5L9MA 1SI0A 2X7QA 3K02A 1Y3QA 2O1LA 2PBWA 2DWJA 4RXLA 1JW4A 5I58B 4I9DA 1Z7ME 4OMBA 2XXXA 1DTGA 2RKMA 3SEYA 2Q8JA 2WKYA 3Q27A 5FHOA 4F18A 2DVCA 1ZIUA 5AA2A 3W9VA 4KFQA 4KD5A 2ONRA 1J1NA 1B3GA 4F3GA 1ELJA 1LSTA 2XXPA 4G8MA 4F19A 1AL3A 3TYHA 4RK9A 4NF4A 3WAFA 3V5AA 1A40A 1LFIA 3TTKA 3ZKKA 3M3KA 1P1OA 4OQOA 3K6VA 4GVOA 3SETA 3I6VA 4U22A 2NXOA 3CRBA 1Q35A 3I5OA 4JWXA 2DWIA 2XXTA 5I59B 3FZVA 1MH4A 1Z7NE 4OTEA 4Q5TA 4H65A 4ZEDA 3B6QA 3DP8A 4NE4A 4BDNA 3FVOA 4JXIA 2REJA 2DP8A 4Z0IA 5L8DA 1Y3PA 3H6WA 3KG2A 2DVZA 4DXBA 3PUXE 2F6PA 4G8HA 2I48A 4BDQA 4GD5A 3UN6A 3VE1B 4ZECA 3S9MC 3IO6A 3KSJA 4LZ7A 3C36A 4ND9A 1DTZA 5TU0A 2O51A 3FGSA 4GWOA 4OFLA 3K6UA 3G3KA 4YMBA 3PPPA 3CG3A 3OO8A 5I59A 5FTIA 1HSJA 1BTJA 4PFUA 1ZTYA 2R6GE 2P0SA 1LFHA 1OLAA 2Q9TA 1IQ7A 3GXAA 3BFUA 3C32A 5ICQA 3U8QA 3UORA 1B1XA 3ODBA 1FQEA 5IAIA 4YKJA 1R6ZA 5I57B 1PDAA 3D4CA 3PMVA 1US5A 3T66A 1B1HA 4LZ8A 1IXGA 3R26A 2CMOA 2GHBA 4YB6A 3G3GA 4H0WA 3FVGA 2PT2A 3IAZA 4F1UA 3OOAA 1JETA 3OMBA 2QSXA 2IA4A 2QJEA 2GH9A 1QULA 1NH8A 4G68B 1EZPA 3O9PA 4KYDA 2XXVA 2VOZA 4G77A 4IY5A 4ESWA 3VXBA 2REGA 4OENA 3HV1A 1B9JA 2O7UA 1LFGA 1JEUA 4GXAA 4OVJA 3A3CA 2ZNUA 3K1PA 4RA1A 2DWHA 4ISUA 3B6WA 5I57A 4OFOA 2PYYA 1NNFA 1LBCA 1R9LA 4PQJA 5I2NA 1MY0A 2UVIA 3VVDA 3V8XB 1SDXA 2LAOA 2THIA 1FTLA 3K4UA 5KCJA 1B05A 2HQ0A 5CMMA 5CBRA 3UIFA 2H25A 4TOZA 2B65A 1SW2A 2Z8DA 1IXHA 2ZYKA 3SEVA 4KYEA 3FVKA 4ONYA 5DEXA 3PPNA 1FCKA 1NNPA 3HO7A 2NVUB 2ANJA 1R1NA 4O3CA 1YTVA 2HXWA 3IOWA 4ZEBA 4GQOA 1NKXA 4YAHX 2P2AA 4QFPA 2V25A 3C35A 3S9LC 1B5JA 5K2YA 1H44A 4ZE9A 3EPEA 3C4MA 4R72A 1N04A 4XKNA 5K2XA 3KJTA 1SYIA 5H8SA 3PD9A 3HHGA 3LSFB 1N7WA 4IB2A 1TFAA 5AA4B 2DXRA 2ONKE 2D5WA 3LSXA 3BFTA 4Q30B 5FHNA 5CMBA 5H8NB 1MPCA 4F3SA 3OXNA 1QUIA 3H06B 1QKBA 1DPPA 3PD8A 1MQGA 1MG1A 5KDTA 1MRPA 1B46A 2DYXA 2D3IA 2H9BA 4QSDA 2QMXA 4KYSA 1B40A 1N7XA 3CIJA 2HEUA 1PB7A 4H5FA 3VXCA 1H45A 1NNTA 3U93A 3VDFA 3IOVA 5CC2A 1M5BA 4JBZA 1ZU0A 1IIWA 2ZYMA 2V3UA 1ZMGA 4YB5A 1Y3NA 4U1ZA 4EQ7A 5DVFA 5H8QB 4KQPA 3K00A 2VGQA 1JEVA 3VLVA 3L6HA 5AA4A 1A54A 2KLFA 3RT8A 1ATGA 1NFTA 4R73A 4QSEA 5FTHA 1OQGA 1FTKA 1OIBA 1USYE 3E9XA 4AB5A 2H4IA 1WDNA 2ESNA 4OYVA 3VVFA 2ZNTA 4RYAA 4GF8A 4YB7A 3CR9A 3KN8A 4OEVA 4OERA 1RKMA 2OCUA 2BJJX 3QUJA 4ZZAA 1Y1MA 4X9TA 5TP9B 1Q1KA 1RYOA 1ZKBA 2G29A 5JTYA 2O69A 4PETA 3ECRA 4GL0A 3TCFA 4F39A 3RTWB 4QRZA 3RUMA 4GIZA 3PUZE 4OXVA 1UTHA 2ONSA 1B6HA 4FATA 4E0XA 4MLQA 1XC1A 2Z22A 2Y84A 2PMSA 4WEPA 3ZKLA 1MY4A 4OESA 2Q89A 2G93A 3N94A 1NL5A 3ONMA 1B32A 3PMXA 1B4HA 3FJ7A 4L17A 1QUKA 2OJTA 1A8EA 1PB8A 5I2KA 4F29A 2ZNSA 1LGBC 1TWYA 5A5XB 5AA2B 1Y1ZA 2A5SA 3MC2A 1SQYA 3PUYE 4N07A 2X26A 1AMFA 1A55A 3PU5A 1MXZA 1BKAA 2YLNA 4TLLB 2HZLA 1SI1A 2XXRA 1MXYA 4NF4B 4U23A 2YPNA 4HCWA 2E1SA 1QUJA 4FECA 3D4GA 4UACA 5CMKA 2B3BA 1POY1 3EN3A 1MM7A 3MPLA 3OO7A 4DZ1A 3PUWE 1MPDA 2R71A 2AL5A 3MW0A 1B3LA 1A99A 4XXUA 2RCAA 5A5XA 4OEUA 1QW0A 3PV0E 5ITOA 1LBBA 4ELOA 2HCAA 4GLIA 2OLBA 2ABHA 2XXYA 4H1XA 3IR1A 4DXUA 5DVJA 4YU0A 3E13X 3KOTA 3N6UA 3IJOB 3C34A 3IB2A 4X1BA 1US4A 2W7YA 1IXIA 2HFBA 5F1QA 1URGA 3N5LA 1ZLQA 2F35A 4IO6A 2QS2A 3GLBA 4ELRA 3TUSA 1DPEA 2V84A 1JVXA 1B52A 5AA2D 1HSEA 1SD3A 4EF2A 3UGWA 3P7IA 4O3AA 2F7AA 3IJXB 1JW1A 3RLFE 4WXJA 4THIA 4KHZE 3TFLA 3RN8A 1FW0A 4G4PA 1VFDA 3K6XA 3T9VA 4DDDA 2V3TA 3CSBA 2FNCA 1N84A 3Q28A 1WODA 2XX7A 5DYHA 1IITA 4EQ9A 3K6WA 3TCHA 4IO3A 2I6EA 1TT1A 5BUUA 1FTJA 4NF5A 1URSA 3IX1A 5H8FA 1UIVA 2I0BA 3E4RA 2F36A 2QL3A 1KWHA 3Q25A 3QUFA 3CFZA 3VFJA 5KZTA 1O7TA 5F7VA 3QK6A 2GHAA 1P1WA 3K1NA 2RC9A 3I3VA 5M2VA 3CSGA 4FEDA 4H6DA 2DQVA 3FJMA 3TPAA 2QPQA 1IXCA 1B5HA 4RK2A 1L5TA 1H3DA 5I2NB 3RGYA 2Q88A 4UA8A 4QFLA 3H7MA 4KPTA 1BIYA 3KOSA 4MF3A 4DXCA 1NH7A 4FIMA 2NWJA 4YKIA 5KCJB 4OFJA 4RPNA 4MBPA 3FIRA 5CBSA 4H8JA 1S7YA 4DIGA 3T93B 3O66A 3FXUA 4LA9A 1FTMA 3H3GA 2O6AA 4ZE8A 1FQDA 4ESXA 3OSRA 3TTNA 2UYEA 2OBGA 5LOMA 2H98A 1B7ZA 5L9OA 1B7HA 1VFEA 5AE4A 2Z8EA 2Z23A 3E3KA 1YCJA 1P99A 3U1OA 5DEXB 1PBPA 2Y7RA 2I4BA 1B3HA 4HCYA 3OENA 4QSCA 2PVUA 3USDA 3S4UA 3TTMA 3U92A 3TELA 3LUYA 3O6HA 3K0VA 4F22A 2ZMBA 3G3HA 5HPQA 1VE4A 4F3PA 4HS7A 4Q8RA 3C9HA 2Y7KA 3DM0A 4G68C 5DT6A 3OEKA 1PEBA 1NNKA 4NWCA 3O6GA 3UA8A 4GOTA 1ZBMA 5KDTB 3MP6A 1IZ1A 2VD3A 4R6KA 1B58A 1S9TA 2OWTA 4FJPA 2M8CA 2IEEA 2X7PA 3PPQA 3OO6A 3FJGA 2DS9A 3TKDA 1YPNA 1NMUA 4OHNA 4QFOA 1DOTA 4R2FA 4BDMA 1MY3A 3K2DA 1MY1A 1SVXB 3JZJA 1BLFA 1OMPA 2F7BA 3IO4A 4MFIA 3KN7A 3KEIA 4LQ5A 3S2VA 3LBSA 2I49A 1URDA 2F6GA 3GBBA 4ELQA 4P0GA 1B3FA 1XVYA 2A5TB 5DVIA 2XHDA 3KBRA 5B7DA 4QHQA 4JWOA 4Z7EA 4PE5B 4PFTA 2OK2A 3MZBA 2V3QA 2O1MA 3TCGA 1QJMA 4RJZA 4LP2B 3N6TA 5AA3A 1P1UA 3W9WA 2O68A 1MXWA 3TQLA 1I6QA 4C0RA 1O64A 3H6VA 4TLMB 4LVQA 3V89B 2FYIA 2AYSA 1M5FA 1B0HA 4U21A 4LUBA 2XXWA 5JTYB 1HSLA 4NF6A 4K3FA 5CI5A 2PX1A 2D21A 1IEJA 1UTHB 2UVJA 4H8IA 2DXYA 1XVXA 1XOCA 3CI8A 4BLAA 2A5TA 3M3LA 1M5CA 1VR5A 3R7XA 4GXSB 3TQWA 2Z8FA 3T9HB 3QIMA 4EF1A 5I2KB 4EDPA 1D9VA 1N3WA 1SYHA 2XXQA 1R9QA 4M1VA 3MZ9A 1WVJA 4POWA 3VLUA 1MQDA 1GTKA 1DMBA 4QFNA 1OVBA 1D4NA 1N3XA 4NTLA 4EUOA 3DLNA 5FHMA 1Y4TA 1JVYA 3SDFA 1PBQA 4JB7A 4LATA 3SERA 4WKMA 4LONB 3CG1A 3EHUA 1MH3A 1B0LA 3F11A 1Y9UA 4G2ZA 1EZ9A 2VHAA 1D9YA 5I84A 1P1NA 3QXMA 4X1DA 3H4ZA 4M4GA 1I6BA 3Q26A 2R9JA 3FXQA 4NWDA 4OWDA 5CRYA 2F7CA 4NF8A 1BP5A 1POTA 3FVNA 1B2HA 3BBRA 4HW8A 2FA7A 1O63A 4IO2A 1MXVA 3IORA 4MLVA 1ZJLA 4JSOA 2GFEA 3CVGA 4ZEIA 1N0TA 2OZZA 3O2AA 3ILTB 1PB9A 4XKPA 3IK6B 2V93A 4C1TA 4AQ4A 3QSLA 4GRKA 1LB8A 3H03A 4F2QA 1MQHA 1XHYA 4EQBA 1UQWA 1FTOA 3JV9A 3QYTA 1OVTA 3T22A 5ITPA 1GR2A 3IL1B 4JWYA 3BKIB 1VSOA 4ZDMA 1FQAA 4PFYA 5L9SA 4FAJA 1D3KA 2YJPA 3KGCA 1B4ZA 3MJNA 3FV2A 3UK4A 4RY1A 3HHFA 3MUQA 1QVSA 3G3IA 1SBPA 3RPWA 4JSDA 3S9EA 3L6GA 4MH5A 2XXHA 4I1DA 1OLCA 3PMWA 4F1YA 3HPIA 3HCQA 3RNNA 4POXA 4IY6A 3CFLA 3O6IA 3TDJA 4NF5B 4H5GA 1LCTA 1MY2A 2QRYA 3PPOA 2P1SA 3SKPA 5H8FB 2HAUA 4I8CA 4KR5A 5TPAB 3G7WA 1SW5A 3MQ9A 1MQIA 5I58A 1T0KA 1SW1A 4YKKA 4R9GA 3C33A 2CZLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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