3SN6R

Crystal structure of the beta2 adrenergic receptor-gs protein complex
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
475
structure length
443
Chain Sequence
NIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILTKTWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGRCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein/hydrolase
source organism Bos taurus
publication title Crystal structure of the beta2 adrenergic receptor-Gs protein complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isofor
total genus 148
structure length 443
sequence length 475
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
R PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
R PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3sn6R01
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3sn6R02
233LA 2F95A 2ZIYA 183LA 4EXMA 1L09A 5JJEA 1L77A 2B6YA 5AHZA 4LDOA 1S53A 5AWZA 107LA 1L72A 3F8VA 3SB6A 3SBAA 214LA 1L81A 1S52A 5B0WA 131LA 1G0KA 236LA 258LA 4ARPA 231LA 3SN6R 1OV5A 2LCBA 1E12A 2BRDA 4XT3A 1LGWA 1AT9A 2ZFEA 5B6ZA 262LA 4QIDA 159LA 3BVDB 3QBKA 184LA 1L0KA 5DYSA 1KW7A 4G7RB 5H2IA 238LA 3HANA 1L95A 3HH4A 1R2NA 1D2WA 3HH5A 4EPFA 3HARA 175LA 2LNLA 108LA 199LA 242LA 2B74A 4S0WA 1JTMA 4YXAC 4DJHA 1BRDA 3AM6A 4HWLA 1QTCA 218LA 225LA 5H2KA 3HDEA 1C6EA 4N4WA 1L59A 4BVNA 4X32A 4I7LA 1L91A 2R4RA 3C8RA 3ABWA 3S3BB 2NTGA 2RBQA 1ZURA 1D9WA 1C67A 3FADA 1L63A 3C80A 163LA 3UZAA 1D3JA 5B2NA 1QS5A 2B70A 5H2PA 3QBGA 1CV5A 1L80A 1C6HA 219LA 1XJIA 1L73A 1OVJA 4JQ6A 2B6XA 3D4SA 1L83A 1L98A 1LYFA 115LA 2Y02A 1C3WA 152LA 1L0MA 191LA 1P37A 1QTHA 2NTWA 4JR8A 2LZMA 3DN0A 3SB5A 1GU8A 1QTBA 1KGBA 2RAZX 5H2HA 1L43A 4GPOA 5B6YA 4NC3A 1L36A 4XTLA 4BEZA 4OO9A 4QI1A 3EMLA 2ANXA 3NYAA 1L26A 3OE9A 1QT3A 1MGYA 3HUQA 3QJQB 127LA 2B75A 1SX2A 3QAPA 1L40A 1VJMA 2OTYX 1HZXA 3F9LA 3HT7A 171LA 1L14A 2B73A 3G3VA 3HTGA 151LA 4W57A 123LA 1C61A 1C6JA 1CU0A 4IAQA 4KLYA 1P46A 4DAJA 1C6CA 2OTZX 4ARQB 5DHHA 178LA 4W56A 2L78A 1IW9A 2JAFA 3DN4A 1SWYA 4I7PA 1P7SA 1L66A 240LA 5FJGA 4W52A 130LA 2ZZLA 1U19A 3SB7A 253LA 162LA 1P8IA 4UG2A 257LA 4FA7B 5B34A 1QT6A 1L57A 3GULA 1DYFA 155LA 1T6HA 1OWYA 2ANVA 211LA 1QT4A 3GUJA 103LA 2RBNA 3DDLA 2F93A 4W53A 4N6HA 4Y9HA 1L47A 3C83A 1F88A 3GUPA 4G70B 3C82A 1G07A 3CDQA 4A4MA 1LI3A 232LA 3NY9A 4QRYA 3HDFA 1L9HA 1C63A 1L53A 1L23A 3EH5B 1LW9A 2RH1A 4PJZA 129LA 1L31A 1QT8A 3DN8A 3QBIA 1OYUA 2B6WA 138LA 4LZMA 1C8RA 1XIOA 1T97A 4YXCA 1QHJA 110LA 1L15A 2Y01A 144LA 2HPYA 1SSWA 197LA 250LA 150LA 1BRXA 1L49A 102LA 1L41A 4J4QA 1C6IA 1DYDA 1L71A 1QTZA 1L0JA 4PXFA 3LZMA 3K2RA 229LA 3DKEX 5DHGA 1L06A 4HYJA 1PXRA 4I7NA 1TLAA 1L90A 1L38A 1C6MA 5J7AA 156LA 4EA3A 3S3CB 192LA 174LA 4EKRA 1L93A 3EH4B 216LA 1GZMA 1P3NA 1KG9A 1X0K1 118LA 1L97A 149LA 4LDEA 1L58A 2OE9X 3V2WA 3QJUB 2B6ZA 1L28A 113LA 4L6RA 4MD1A 2X72A 4IB4A 1CU5A 1L10A 227LA 1DZEA 4GP5B 2I1XA 5AHYA 145LA 1S54A 1L22A 4ARMB 1L88A 3RZEA 241LA 1L86A 2B7XA 1E0PA 1XEPA 4GYCA 3OE6A 176LA 1C6KA 244LA 1L79A 1DYGA 249LA 4X1HA 2QPEB 2KS9A 1P36A 122LA 2M3GA 1P2LA 4XXJA 1P8UA 2Z73A 1JQUA 220LA 3C9MA 1L51A 4WW3A 2I21A 2KSAA 1LYDA 2KSBA 111LA 247LA 4W51A 4ARQA 3OAXA 1KY0A 2YCYA 3UG9A 3G3XA 4KNFA 1G0QA 209LA 1P64A 1P2RA 1QSQA 2F32A 2RBOA 4IAPA 1L13A 3HT6A 1FBKA 1LWGA 3DN3A 4PK0A 4W55A 1TN5A 2WJLA 4BWBA 1L64A 128LA 1L39A 3EH3B 1L20A 1L19A 1C68A 5B6XA 1KMEA 1C65A 1LI6A 1OWZA 186LA 228LA 185LA 172LA 2IGCA 3FI5A 1CV1A 158LA 1JV6A 2I35A 234LA 2Q9DA 1L70A 157LA 255LA 4K5YA 2VT4A 2YDVA 1L18A 2F2QA 3VW7A 189LA 222LA 3AYNA 4MQTA 1P6YA 4I7MA 3ODUA 161LA 1CU2A 2HUKA 4I7OA 1D3MA 3QDCA 3X3BA 126LA 1L61A 3DNAA 1T8FA 3HT9A 5G54A 5LWEA 3CODA 4N4YB 3G3WA 1L27A 4YX7C 2OE7X 2RB1X 2OE4X 1G0JA 166LA 5H2OA 1L69A 2L6XA 1L76A 1L07A 1X0SA 3QJRB 1C6NA 1L92A 3SB9A 1D2YA 3RFMA 3UTXA 1L37A 147LA 5BR2A 1G0MA 3NY8A 3SB8A 3VG9A 1M0KA 165LA 4G7SB 4AMIA 4FAAB 1LYHA 1L03A 4I7JA 5KKHA 3DMVA 4ARJA 4G72B 4EJ4A 1L52A 2RBSA 1CUQA 4I7RA 196LA 1L65A 4MD2A 3S3DB 223LA 217LA 1L17A 224LA 2A4TA 1C6GA 4GBRB 1C6AA 1C8SA 1L85A 1F50A 4L35A 1GUEA 4OV0A 1CV0A 1QT7A 1LN6A 1Q5JA 3QBLA 1SWZA 1D3NA 3HUKA 3KJ6A 5EN0A 2PEDA 2Y03A 1L32A 6LZMA 1CWQA 1C6PA 3HAOA 5B6WA 1L55A 5BR5A 1CVKA 1PXSA 4LDLA 1WTHA 1KY1A 4FBZA 173LA 3GUNA 1L89A 4UHRA 1FBBA 2OU0X 3DMZA 3QJSB 1R84A 2I20A 1LYIA 3ZEVA 3HTDA 146LA 1QUHA 1G0PA 1X0I1 5ITEA 1PQKA 1G0LA 1QT5A 3GUOA 187LA 4E97A 1BRRA 5G53A 2YCZA 1TN0A 2CUUA 2B72A 212LA 2F47A 3C7ZA 4ARMA 2NTUA 120LA 1KNIA 1CV3A 1G06A 1EPYA 1KG8A 1UCQA 2J4YA 1L05A 2OEAX 3HWLA 3X3CA 251LA 2YDOA 261LA 3NS0A 1L08A 170LA 1SSYA 3DN2A 1T8GA 1CU3A 3VHZA 200LA 1S8JA 1L96A 5B35A 1C6LA 4W54A 4GP8B 1PQOA 4XTNA 4IARA 1L16A 1P5CA 4XT1A 1ZYTA 3VI0A 1JFPA 1QTDA 5H2LA 5A45A 1L84A 2AT9A 4EIYA 167LA 5H2JA 2G87A 5ITCA 3P0GA 230LA 5A8EA 4FPDA 221LA 195LA 3CDRA 4GRVA 3FA0A 3L64A 5G2CA 1LWKA 1QSBA 1M0MA 3A7KA 3S8FB 3QJTB 213LA 3UTWA 5H2NA 215LA 3C7WA 1C6FA 1L04A 3DN1A 3PBLA 1QTVA 1LGXA 260LA 3SBBC 4EPIA 5I14A 239LA 1EHKB 1DYAA 1QUDA 1L67A 190LA 1OVKA 140LA 1LYEA 3MBVA 1M0LA 3C8SA 5JJNA 1L30A 2RBRA 3HASA 3L2XA 1L87A 3GUMA 4I7SA 3VVKA 5A44A 119LA 1L24A 2HULA 2RB2X 4ARLA 4BV0A 1L75A 3UZCA 1BM1A 1DYEA 3ZPQA 1XJUA 5TGZA 1L99A 205LA 5LZMA 2EI4A 1C66A 1L25A 3CDVA 3C81A 2HUMA 3WQJA 4AMJA 1L33A 1JGJA 259LA 1QUGA 3NSBA 112LA 3UTYA 1G0GA 160LA 2O7AA 1L44A 4GBRA 1LPYA 1KS3A 181LA 243LA 1CV4A 1PQIA 3PQRA 1LLHA 1L54A 5AZDA 3C7YA 109LA 3GUKA 3VGAA 4EKPA 3QJVB 2RB0X 137LA 1L46A 3OE8A 4XTOA 1P56A 3DQBA 1LI2A 1DYCA 148LE 1S51A 246LA 125LA 1ZWNA 3PWHA 1C6QA 1QKOA 1G1VA 3OE0A 2RAYX 1JTNA 4BEYA 2QARC 1QS9A 1C6BA 1PQJA 206LA 1H2SA 4G71B 5AX1A 201LA 4I7KA 1F4ZA 143LA 3UONA 226LA 1L74A 245LA 4BUOA 164LA 1KW5A 104LA 2QB0B 1K28A 1C62A 1D3FA 169LA 1Q5IA 1L34A 2Y00A 1S8LA 1L45A 4EKSA 1IXFA 235LA 254LA 1L68A 252LA 1L62A 256LA 142LA 210LA 4HYXA 3QAKA 4AQNA 114LA 1L48A 3HT8A 1CUPA 3CAPA 5C1MA 1L56A 5F8UA 1NHBA 3HAQA 1DYBA 1PQDA 4GP4B 3C9LA 2Z6BA 3HTFA 1QM8A 168LA 1L29A 1H68A 2JAGA 5H2MA 4MQSA 1QUOA 5AX0A 1I6SA 2B6TA 3S8GB 2O4WA 1LGUA 1AP9A 3DN6A 1L01A 5JJJA 4I7TA 3HH3A 1UAZA 1C60A 3T45A 2LC9A 4PXKA 141LA 2WJKA 3AYMA 3RUNA 1PQMA 1B6IA 182LA 2O79A 3HU8A 2Q9EA 1OV7A 180LA 2RBPA 5G36A 3UTVA 3PXOA 1L00A 1L35A 3JR6A 2YCWA 1QKPA 5B6VA 1PY6A 1LYGA 7LZMA 2OU8A 188LA 1L11A 3V2YA 2QPDB 3HUAA 1CV6A 1L94A 1C6TA 2Y04A 3CDOA 3DMXA 3COCA 2R4SA 1C64A 1XMEB 5G28A 3HH6A 1L21A 1LYJA 3HTBA 4W58A 1XJTA 3GUIA 1CX7A 4DKLA 5ETZA 1L82A 1G1WA 3HU9A 2KSYA 3ZPRA 5G2DA 1L12A 3C8QA 4W59A 1T8AA 1SX7A 4JKVA 2YCXA 4I7QA 3PDSA 1P8HA 2Z55A 1L60A 1CU6A 4G7QB 4MBSA 3REYA 177LA 198LA 4X31A 5G2AA 139LA 1CX6A 1L50A 237LA 1JV7A 4ZPUA 4WAVA 3CDTA 2OU9A 1O0AA 1IW6A 1L02A 2NTHA 1L42A 4EKQA 248LA 1C69A 1VGOA 3HAPA 4TL3A 1CTWA 1OVHA 1C6DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XJDA 2ZIYA 1LAAA 4EXMA 1IEEA 4LDOA 4C5FA 107LA 1L72A 3SB6A 3SBAA 1S52A 236LA 1QDRA 4NHSA 4WLYA 4RLNA 3QNGA 1OUIA 2C8OA 3WULA 5A3EA 4J0LA 2ZFEA 4ET9A 5DYSA 3W6DA 238LA 1IOCA 3A91A 3HH4A 2F2NA 1SLYA 108LA 199LA 242LA 2B74A 1JTMA 4YXAC 1QTCA 218LA 1UICA 3HDEA 1DI5A 3TMUA 3TXBA 1MLCE 1C67A 1IR7A 3HBEX 3C80A 3UZAA 1HMLA 2B70A 5H2PA 1CV5A 1GBOA 1L73A 4ML7A 1LHKA 115LA 152LA 1L0MA 2YBNA 191LA 2EIZC 3N9CA 2BQIA 3SB5A 1GU8A 2BQEA 5H2HA 5B6YA 4XTLA 4BEZA 1DPXA 2Z37A 1DQJC 1MGYA 3HUQA 3P68A 2B75A 1SX2A 1GEVA 2YBJA 1F6RA 5II3A 2OTYX 1IY4A 4X3BA 2B73A 3A96A 4KLYA 1REXA 1XGPC 4NGYA 178LA 4W56A 2JAFA 1LKRA 1SWYA 1P7SA 1D0LA 1L66A 162LA 5HMJA 4UG2A 5B34A 1L57A 1DYFA 1GFRA 2F93A 4N6HA 1LOZA 2ZQ3A 1YL1X 3C83A 3C82A 5J7CA 1YQVY 4WM1A 1L9HA 1WQRA 4NGJA 3LYOA 1C63A 3EH5B 1C7PA 1AT6A 3WYHA 129LA 1QT8A 1ZVHL 3QBIA 2Y01A 144LA 2HPYA 1D6PA 1NBYC 150LA 1L41A 2YBMA 4GCFA 1SQ2L 4PXFA 3K2RA 4GCDA 229LA 2BQGA 4EMNA 3GXKA 1L90A 1RE2A 5APFA 1C6MA 3A90A 2BQCA 156LA 3S3CB 8LYZA 4D9ZA 118LA 1L97A 4G4CA 1L58A 1YAMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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