3SN6R

Crystal structure of the beta2 adrenergic receptor-gs protein complex
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
475
structure length
443
Chain Sequence
NIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILTKTWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGRCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein/hydrolase
molecule keywords Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isofor
publication title Crystal structure of the beta2 adrenergic receptor-Gs protein complex
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 148
structure length 443
sequence length 475
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
R PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
R PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3sn6R01
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3sn6R02
1L93A 4GP8B 5JJJA 1BRXA 3CDTA 4JR8A 3F8VA 1L31A 1L43A 1XJTA 1L84A 2PEDA 1C6FA 1D2YA 123LA 4W54A 5H2IA 4ARPA 5EN0A 257LA 3SB8A 1P56A 2HULA 3HUKA 3QJVB 1L33A 1C6HA 3DMZA 3AYNA 4I7RA 1L91A 1C6BA 1C61A 236LA 4MBSA 4PXFA 1L59A 1CU0A 1L46A 247LA 185LA 108LA 4I7LA 4I7OA 3QJUB 1G0QA 1L65A 3PWHA 3LZMA 1L61A 3FI5A 3NYAA 3HUQA 1T97A 2RBQA 2ZFEA 196LA 3ODUA 4EJ4A 2B6TA 3G3XA 3PQRA 199LA 1KY1A 1QT8A 2Q9DA 2YCZA 1QUOA 1C6NA 152LA 1FBBA 5H2LA 5H2MA 2L6XA 205LA 1L62A 3QAKA 3OE6A 3C82A 1GUEA 3HUAA 1G0KA 1ZWNA 3C7WA 3UZCA 5B6ZA 1C6PA 1G0MA 1P7SA 1UAZA 213LA 3UTWA 1C63A 1NHBA 146LA 3C9LA 1C6GA 3C9MA 1L01A 3VHZA 2R4RA 189LA 1AT9A 4EA3A 3S3BB 1DYFA 1L34A 191LA 1L50A 2F2QA 3RFMA 1P2LA 1C6EA 1QSQA 1F4ZA 118LA 1PQKA 1B6IA 2F47A 1P36A 3HASA 1S8JA 3HAPA 3QBGA 2OTYX 3QAPA 4XTNA 1P6YA 1L10A 3FA0A 215LA 1L94A 2J4YA 1L17A 1P5CA 1O0AA 3HH5A 1L97A 4W52A 1P46A 3CODA 4TL3A 1SX2A 4AMIA 3C8RA 261LA 1QT5A 2F93A 163LA 3DDLA 4OV0A 3K2RA 1CV4A 1L53A 1CUPA 1CX6A 1L00A 1PQMA 5H2KA 1QT4A 2B75A 138LA 5G53A 2X72A 4BVNA 4KNFA 5BR5A 1K28A 1L19A 3SB7A 3QJQB 1L05A 1P8UA 1OV7A 197LA 3CDVA 1G06A 2LNLA 2Z73A 1L73A 4BEZA 1LGXA 4Y9HA 2RAZX 1L08A 1T6HA 2RBPA 3EMLA 1KMEA 186LA 224LA 4G72B 1R2NA 4X32A 1LWKA 4QRYA 3X3CA 2B73A 1L23A 4GYCA 2ZIYA 5J7AA 1P3NA 2LZMA 2RBOA 1CU2A 2F95A 2B72A 148LE 4MD2A 1G0GA 3EH3B 254LA 3C7ZA 4L6RA 3DMXA 2O7AA 1L47A 115LA 4I7KA 1JV7A 210LA 161LA 1DYGA 2B74A 3DKEX 1C6CA 3GUNA 233LA 1KS3A 1LYHA 4ARJA 4BUOA 127LA 1LYJA 1P8IA 219LA 1CX7A 1L95A 1DZEA 5AX1A 5G2AA 4GPOA 1QTZA 4FBZA 175LA 1SSYA 1L71A 2Y01A 4W58A 3NS0A 165LA 1PQDA 3HAOA 1C67A 1SSWA 1L72A 1L88A 1QKPA 218LA 3QBKA 1GU8A 3BVDB 145LA 1QTHA 4XT3A 143LA 2NTHA 3KJ6A 3EH4B 1L51A 2RBSA 1U19A 1C6IA 2HUKA 2QB0B 119LA 1LGWA 4PJZA 5G2CA 1OVHA 5A8EA 1D2WA 4EPFA 1CUQA 1P2RA 177LA 1OWYA 1C3WA 5LZMA 3ABWA 178LA 5H2NA 3S8GB 4I7QA 248LA 258LA 3PXOA 3ZPQA 3SN6R 5A45A 4S0WA 4EXMA 198LA 1X0K1 1ZURA 3UTVA 5DHGA 3VG9A 1XJUA 2YCWA 3QBLA 1QT6A 1BRRA 1S52A 2QPEB 2O79A 3NSBA 173LA 1QTBA 245LA 1LI6A 2RBRA 2RBNA 1LYIA 246LA 1T8AA 1IW9A 1L54A 1L38A 3HWLA 1CV1A 3SB6A 4EKSA 3G3WA 3HT8A 139LA 2F32A 4W53A 256LA 3NY8A 142LA 3OE8A 3OE9A 4I7JA 5TGZA 4YX7C 3G3VA 3PBLA 4GP5B 159LA 2BRDA 2JAFA 2I20A 1LI3A 4G7RB 156LA 112LA 1L9HA 104LA 4ZPUA 1QT3A 222LA 1G0PA 1LYFA 2OU0X 157LA 4G7SB 1L12A 1XMEB 2LCBA 2B6ZA 221LA 1L41A 4PXKA 1L39A 1M0KA 2KSYA 2OE7X 2Y04A 3SBBC 3CAPA 4MD1A 3CDRA 4I7NA 4I7MA 169LA 3SB9A 1LYEA 3VVKA 1L81A 126LA 4AQNA 3FADA 1LLHA 237LA 1L56A 250LA 4GBRB 5AZDA 2HPYA 3T45A 2OU9A 4LDEA 2Y02A 5B6XA 3C83A 1I6SA 1L0KA 1C62A 4BEYA 1L15A 1SWYA 1LYGA 3HH6A 2QARC 4W57A 4HYXA 1LYDA 1C60A 4W55A 201LA 1L67A 3HTBA 1H2SA 1FBKA 5H2HA 1L63A 3C81A 1EHKB 170LA 114LA 4MQSA 1QT7A 5FJGA 3NY9A 4N4YB 2B7XA 192LA 1L25A 2RB2X 3WQJA 5AX0A 3VI0A 1L37A 1CTWA 4G71B 5KKHA 1L70A 131LA 1S53A 2RH1A 4OO9A 3QBIA 2IGCA 1L32A 1LN6A 1L55A 3QJRB 128LA 4QI1A 1L0MA 149LA 1X0SA 4KLYA 5B35A 3DN4A 2G87A 3HARA 4E97A 3UG9A 184LA 147LA 1KY0A 3VW7A 1L80A 181LA 1KW7A 1QUDA 1C6LA 1KNIA 4EIYA 1EPYA 1G1WA 1L29A 3X3BA 3HU9A 253LA 1L92A 3QDCA 4YXAC 1BM1A 1L89A 4HWLA 1C6JA 1DYAA 1L02A 1L74A 3OE0A 4J4QA 1C6QA 1IXFA 1TN5A 1Q5IA 1C6AA 2ANVA 107LA 1OV5A 2B6XA 5B6YA 1F50A 2LC9A 1T8GA 214LA 2OE9X 1L85A 211LA 3F9LA 5AHYA 1L18A 5LWEA 1L22A 4X31A 2NTGA 1PXSA 2RB0X 5DHHA 4A4MA 4W51A 4XTOA 3DN2A 4UG2A 1L99A 2ZZLA 4IARA 2I1XA 1XEPA 3HANA 3AYMA 1D3MA 129LA 2OU8A 1JV6A 1JGJA 3CDOA 1PQIA 262LA 111LA 231LA 1G07A 1VJMA 3DN8A 1L90A 1L21A 150LA 1L60A 1L0JA 212LA 4K5YA 1S8LA 4JKVA 2OE4X 1WTHA 103LA 1L40A 1L79A 1QS5A 2YDOA 187LA 2I21A 3UTYA 3HT7A 223LA 4ARMB 1C69A 2B70A 144LA 1JFPA 3HU8A 140LA 1C68A 6LZMA 164LA 1L35A 1SX7A 4I7SA 122LA 1L77A 4WAVA 1JTNA 3HDEA 1X0I1 5G54A 1D3FA 1CU5A 1L57A 1L07A 1QSBA 1ZYTA 4MQTA 1L44A 3S3CB 1HZXA 1H68A 259LA 4JQ6A 1LW9A 2RB1X 160LA 1C6TA 239LA 4XTLA 4G70B 130LA 1TLAA 3A7KA 1L48A 244LA 3UTXA 5B2NA 1IW6A 1CU3A 5H2PA 232LA 3RUNA 110LA 1QKOA 3SBAA 1L96A 1LI2A 1PY6A 1L82A 1LGUA 102LA 1QTCA 217LA 1L14A 4GBRA 4XXJA 1MGYA 5B6WA 4FPDA 1KGBA 238LA 1C6KA 4QIDA 141LA 3AM6A 3C7YA 1DYDA 2Q9EA 1L03A 2AT9A 1C8RA 4IAQA 1CV5A 3QJTB 183LA 1L27A 4FAAB 1QTVA 155LA 4LDOA 113LA 4YXCA 4ARQB 3L2XA 1C8SA 4XT1A 1L30A 1L49A 4FA7B 166LA 2O4WA 1QHJA 5B34A 5H2JA 2NTWA 2OEAX 5JJNA 4DKLA 1L09A 1C65A 1DYCA 1L20A 220LA 5F8UA 1OYUA 200LA 4EKPA 3DQBA 1PXRA 2KSAA 3OAXA 4WW3A 230LA 4LDLA 252LA 2RAYX 3GUPA 2Y03A 4HYJA 1L13A 3MBVA 5AHZA 4AMJA 1D9WA 1E0PA 1CV0A 1E12A 3QJSB 3D4SA 3GUOA 151LA 3ZEVA 3ZPRA 1L58A 3L64A 3V2YA 1L75A 1P37A 234LA 1JTMA 1PQOA 240LA 227LA 4IAPA 3CDQA 1R84A 2Y00A 2YDVA 4BV0A 4UHRA 216LA 1DYBA 3REYA 1P64A 2KS9A 3GUMA 3S8FB 1G0JA 1LPYA 5AWZA 1L24A 1QM8A 1L04A 4DJHA 235LA 1P8HA 4W59A 226LA 4NC3A 5ITCA 2M3GA 1L86A 1C6DA 1L26A 1L76A 1S51A 4ARLA 3JR6A 251LA 5G28A 225LA 4EKRA 1CWQA 195LA 3VGAA 3HT6A 2WJKA 4W56A 4LZMA 1G0LA 1QUHA 3P0GA 162LA 3HTGA 229LA 171LA 1CVKA 4L35A 167LA 1GZMA 4EKQA 5G36A 2OTZX 1D3NA 3C80A 3DNAA 176LA 2B6WA 1F88A 4G7QB 1L68A 1OWZA 3HH3A 5C1MA 1KG9A 3HTFA 1JQUA 5G2DA 120LA 1L45A 2ANXA 182LA 4N6HA 2WJLA 1L52A 206LA 7LZMA 2JAGA 2YCYA 1T8FA 1L83A 5B6VA 1C6MA 3PDSA 1D3JA 5H2OA 1PQJA 2CUUA 243LA 1L64A 2Z6BA 1L36A 2EI4A 2VT4A 4BWBA 4ARMA 2A4TA 2I35A 2R4SA 190LA 2HUMA 3DN0A 137LA 1BRDA 1TN0A 1M0LA 5JJEA 125LA 1CU6A 1QTDA 1XIOA 1SWZA 3V2WA 5B0WA 168LA 1CV6A 1L69A 1QUGA 1CV3A 2YCXA 249LA 5DYSA 3GUJA 3HAQA 3C8SA 241LA 1OVKA 1M0MA 174LA 3HDFA 1UCQA 1L66A 158LA 2L78A 3GUKA 5A44A 1C66A 2KSBA 3DN1A 1QS9A 3SB5A 2Z55A 4GRVA 3COCA 209LA 180LA 3HT9A 1L06A 4I7PA 3EH5B 1G1VA 5BR2A 260LA 5I14A 1VGOA 2B6YA 2NTUA 4IB4A 1L98A 1L42A 1AP9A 1DYEA 4I7TA 4PK0A 228LA 2QPDB 4GP4B 188LA 242LA 172LA 1L16A 255LA 1L11A 3HH4A 3DN6A 1KG8A 1C64A 4EPIA 3RZEA 3GUIA 3UONA 3UZAA 1Q5JA 3S3DB 4DAJA 5ETZA 1L28A 4X1HA 1KW5A 4ARQA 1XJIA 109LA 3C8QA 1LWGA 4N4WA 3HTDA 1OVJA 3GULA 3DMVA 3DN3A 1S54A 1L87A 5ITEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DD7A 4A7DA 1L84A 1D2YA 2IHLA 4ARPA 5EN0A 1GHLA 4I7RA 1L91A 236LA 1L59A 4AXTA 247LA 108LA 1G0QA 1L65A 3HBHA 196LA 3ODUA 1IOSA 5KXZA 5B05A 3CT1A 3PQRA 199LA 5H2LA 1GB6A 1LMPA 2D4KA 1NKHA 1LSGA 4ET9A 4H9AA 2YBLA 1BHZA 4H93A 2Z18A 1G0MA 213LA 4XJIA 5B1FA 4J1BA 4ETAA 1J1XY 5EBHA 1IC5Y 2F2QA 1C6EA 1B6IA 3A90A 1S8JA 1LZRA 5LVGA 3AW6A 1IX0A 3CT5A 2J4YA 2ZWBA 2BQJA 3CODA 1VATA 4KT3A 1OUJA 1GFUA 2F93A 1JJ0A 4H92A 4I8SA 4J0LA 4OV0A 1CV4A 1Z55A 3B6LA 1QT4A 4E3UA 4BVNA 4KNFA 3QJQB 4WO6A 1JJ1A 1LYOA 2Z73A 5KXPA 1BB3A 4BEZA 1LSMA 4XJFA 4G72B 1GF7A 4ETEA 1R2NA 1GB0A 1LWKA 1LHHA 3A67Y 2B73A 4GCFA 1IC4Y 5IHGA 1GF9A 3VWOA 4PRQA 4WLDA 2ZIYA 1IORA 1CU2A 5LAFA 5FELA 148LE 254LA 4L6RA 1L47A 1B7MA 1UIAA 2B74A 3GUNA 4ARJA 127LA 219LA 3WMKA 2I25L 1QTZA 2GV0A 1JTOL 4H9IA 1C67A 1SSWA 1L88A 2D6BA 218LA 4ZFPA 1FKVA 4OOTA 4XT3A 3KJ6A 1GBYA 1L51A 1U19A 2QB0B 119LA 1OVHA 2EQLA 1D2WA 2Z12A 4EPFA 1P2RA 177LA 1B7RA 4PHIA 4NGVA 1T3PA 1GB9A 248LA 3PXOA 4HV1A 198LA 1X0K1 3AGHA 1ZURA 5DHGA 3E3DA 5JENB 2O79A 2Y8PA 1WQNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4JKV A;  2OE4 X;  1WTH A;  103L A;  1L40 A;  1L79 A;  1QS5 A;  2YDO A;  187L A;  2I21 A;  3UTY A;  3HT7 A;  223L A;  4ARM B;  1C69 A;  2B70 A;  144L A;  1JFP A;  3HU8 A;  140L A;  1C68 A;  6LZM A;  164L A;  1L35 A;  1SX7 A;  4I7S A;  122L A;  1L77 A;  4WAV A;  1JTN A;  3HDE A;  1X0I 1;  5G54 A;  1D3F A;  1CU5 A;  1L57 A;  1L07 A;  1QSB A;  1ZYT A;  4MQT A;  1L44 A;  3S3C B;  1HZX A;  1H68 A;  259L A;  4JQ6 A;  1LW9 A;  2RB1 X;  160L A;  1C6T A;  239L A;  4XTL A;  4G70 B;  130L A;  1TLA A;  3A7K A;  1L48 A;  244L A;  3UTX A;  5B2N A;  1IW6 A;  1CU3 A;  5H2P A;  232L A;  3RUN A;  110L A;  1QKO A;  3SBA A;  1L96 A;  1LI2 A;  1PY6 A;  1L82 A;  1LGU A;  102L A;  1QTC A;  217L A;  1L14 A;  4GBR A;  4XXJ A;  1MGY A;  5B6W A;  4FPD A;  1KGB A;  238L A;  1C6K A;  4QID A;  141L A;  3AM6 A;  3C7Y A;  1DYD A;  2Q9E A;  1L03 A;  2AT9 A;  1C8R A;  4IAQ A;  1CV5 A;  3QJT B;  183L A;  1L27 A;  4FAA B;  1QTV A;  155L A;  4LDO A;  113L A;  4YXC A;  4ARQ B;  3L2X A;  1C8S A;  4XT1 A;  1L30 A;  1L49 A;  4FA7 B; 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 5G36 A;  2OTZ X;  1D3N A;  3C80 A;  3DNA A;  176L A;  2B6W A;  1F88 A;  4G7Q B;  1L68 A;  1OWZ A;  3HH3 A;  5C1M A;  1KG9 A;  3HTF A;  1JQU A;  5G2D A;  120L A;  1L45 A;  2ANX A;  182L A;  4N6H A;  2WJL A;  1L52 A;  206L A;  7LZM A;  2JAG A;  2YCY A;  1T8F A;  1L83 A;  5B6V A;  1C6M A;  3PDS A;  1D3J A;  5H2O A;  1PQJ A;  2CUU A;  243L A;  1L64 A;  2Z6B A;  1L36 A;  2EI4 A;  2VT4 A;  4BWB A;  4ARM A;  2A4T A;  2I35 A;  2R4S A;  190L A;  2HUM A;  3DN0 A;  137L A;  1BRD A;  1TN0 A;  1M0L A;  5JJE A;  125L A;  1CU6 A;  1QTD A;  1XIO A;  1SWZ A;  3V2W A;  5B0W A;  168L A;  1CV6 A;  1L69 A;  1QUG A;  1CV3 A;  2YCX A;  249L A;  5DYS A;  3GUJ A;  3HAQ A;  3C8S A;  241L A;  1OVK A;  1M0M A;  174L A;  3HDF A;  1UCQ A;  1L66 A;  158L A;  2L78 A;  3GUK A;  5A44 A;  1C66 A;  2KSB A;  3DN1 A;  1QS9 A;  3SB5 A;  2Z55 A;  4GRV A;  3COC A;  209L A;  180L A;  3HT9 A;  1L06 A;  4I7P A;  3EH5 B;  1G1V A;  5BR2 A;  260L A;  5I14 A;  1VGO A;  2B6Y A;  2NTU A;  4IB4 A;  1L98 A;  1L42 A;  1AP9 A;  1DYE A;  4I7T A;  4PK0 A;  228L A;  2QPD B;  4GP4 B;  188L A;  242L A;  172L A;  1L16 A;  255L A;  1L11 A;  3HH4 A;  3DN6 A;  1KG8 A;  1C64 A;  4EPI A;  3RZE A;  3GUI A;  3UON A;  3UZA A;  1Q5J A;  3S3D B;  4DAJ A;  5ETZ A;  1L28 A;  4X1H A;  1KW5 A;  4ARQ A;  1XJI A;  109L A;  3C8Q A;  1LWG A;  4N4W A;  3HTD A;  1OVJ A;  3GUL A;  3DMV A;  3DN3 A;  1S54 A;  1L87 A;  5ITE A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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