The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
56
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sequence length |
151
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structure length |
151
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Chain Sequence |
GPRSMAPTPESDKLKSEGNAAMARKEYSKAIDLYTQALSIAPANPIYLSNRAAAYSASGQHEKAAEDAELATVVDPKYSKAWSRLGLARFDMADYKGAKEAYEKGIEAEGNGGSDAMKRGLETTKRKIEEANRGAEPPADDVDDAAGASRG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A structural model of the Sgt2 protein and its interactions with chaperones and the Get4/Get5 complex.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Chaperone regulator
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| source organism |
Aspergillus fumigatus
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| molecule keywords |
Hsc70 cochaperone (SGT)
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| total genus |
56
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| structure length |
151
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| sequence length |
151
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| ec nomenclature |
ec
3.1.3.16: Protein-serine/threonine phosphatase. |
| pdb deposition date | 2011-07-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF13181 | TPR_8 | Tetratricopeptide repeat |
| A | PF13414 | TPR_11 | TPR repeat |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Alpha Horseshoe | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4ME2 A; 3Q15 A; 4HOT A; 2L6J A; 3LCA A; 5KJN A; 2FO7 A; 2DBA A; 3QWP A; 4CDR A; 1WM5 A; 4LEU A; 2YHC A; 2VGX B; 3ZHE A; 3FWV A; 2E2E A; 3Q5M A; 3FP3 A; 3R9A B; 4J0U A; 5DBK A; 3UPV A; 4WNF A; 2UWJ G; 1HZ4 A; 4HOU A; 4NQ0 A; 4JHR A; 5FZR A; 5JJ6 A; 2Q7F A; 2XEV A; 3U4T A; 5FJY A; 1KT1 A; 1NA0 A; 2AVP A; 3LY9 A; 3ULQ A; 2UY1 A; 3AS8 A; 3LY7 A; 3KD7 A; 3QWV A; 3AS4 A; 4XI0 A; 4J8E A; 1HH8 A; 2PL2 A; 3TGO A; 4WND A; 3ZN3 A; 3ASG A; 4WUY A; 5HQ8 A; 4GA2 A; 3CKB A; 5EX3 A; 5FT9 A; 3N71 A; 3GYZ A; 5D0O D; 2XPI A; 4CGV A; 4N2Q A; 3CEQ A; 4IN3 B; 3GZ2 A; 3CK8 A; 4CGW A; 5AYW D; 2FF4 A; 3OXG A; 4UQZ A; 4GZ3 A; 4G25 A; 5LCW J; 3MEK A; 3VTX A; 4G23 A; 4GPK A; 4BT8 A; 4KBQ A; 3CKC A; 3UUX A; 1QQE A; 4I17 A; 1ELR A; 4BWR A; 2VQ2 A; 3SZ7 A; 4AY6 A; 3VTY A; 4I2Z A; 4I1A A; 3TG5 A; 4B94 A; 1TJC A; 4G2V A; 3HYM B; 4GYW A; 3ASF A; 4ABN A; 4RG9 A; 4GA1 A; 1W3B A; 1ZU2 A; 5BT1 A; 3S7B A; 4WNG A; 5DIZ A; 2C0L A; 5KJM A; 4JA7 A; 4XIF A; 3BEE A; 2HYZ A; 4N3B A; 3OXF A; 2MHK A; 4Y6C A; 4GYY A; 2R5S A; 5A6C A; 3ESK A; 2XCB A; 4NRH B; 3Q4A B; 4I9E A; 4GZ5 A; 4J8F A; 4J8D A; 3ZHE B; 2YQ8 A; 3S7F A; 2VGY A; 3CK9 A; 3JYS A; 1ELW A; 3E4B A; 5CCM A; 4GCN A; 4O6F A; 2LSU A; 4YVO A; 4Y6W A; 4UQY A; 2XGS A; 3PDN A; 5G04 C; 5EX0 A; 3ZGQ A; 2OND A; 1NA3 A; 2PQN A; 4F3V A; 2UY1 B; 4YND A; 1OUV A; 2VYI A; 2XGM A; 3CVL A; 2BUG A; 2KCK A; 1PC2 A; 4KYO B; 4N5C A; 4HOS A; 4U0U A; 3ZFW A; 4I9C A; 3PE3 A; 2J9Q A; 1IHG A; 2C2L A; 3LYA A; 4UQX A; 3LY8 A; 4WNE A; 4G26 A; 5ARF A; 2HO1 A; 3ZPJ A; 2KCL A; 4N2S A; 3KS2 A; 4H7X A; 2FEZ A; 3URZ A; 5EKQ D; 4BTB A; 5BNW A; 4YVQ C; 3WXX A; 5KJK A; 4U04 A; 4GA0 A; 4BT9 A; 1KLX A; 4W9R A; 3KAE A; 5A7D B; 2WQH A; 3S7J A; 1E96 B; 4AY5 A; 5G05 C; 3RO2 A; 1ZBP A; 4JA9 A; 5G04 J; 3Q47 B; 4G24 A; 4N3C A; 2KC7 A; 3MKR A; 3S7D A; 3PE4 A; 2Y4U A; 3U3W A; 2HR2 A; 2VSN A; 3EDT B; 5JJT A; 1Y8M A; 4I2W A; 4APO A; 1XNF A; 2NC9 A; 2VGX A; 3O48 A; 4RG6 A; 5D0Q D; 3UQ3 A; 1KT0 A; 2IFU A; 4N39 A; 3CVN A; 4UI9 C; 2IF4 A; 1NZN A; 3NF1 A; 3RIB A; 1QZ2 A; 2Y4T A; 4KXK B; 2I6H A; 2FI7 A; 2GW1 A; 3MV3 B; 3LPZ A; 2P58 C; 3QWW A; 5G05 J; 2XCC A; 4N3A A; 4AM9 A; 1IYG A; 4A1S A; 4UI9 K; 3CVQ A; 3RO3 A; 3AS5 A; 5LCW C; 1HXI A; 2KAT A; 3OXL A; 3Q49 B; 3MV2 B; 1P5Q A; 3CVP A; 3GW4 A; 3CV0 A; 4U0Z A; 3MA5 A; 2FBN A; 4H7Y A; 2XGO A; 2PZI A; 3GZ1 A; 4AIF A; 3RJV A; 3FFL A; 5HI7 A; 3IEG A; 3CK7 A; 2WPV A; 5BW8 C; 1YA0 A; 2PQR A; 2OOE A; 3ASH A; 4GZ6 A; 1A17 A; 4G1T A; 4GYO A; 3LKU A; 4JL0 A; 4UI9 J; 4U0S A; 1B89 A; 2V5F A; 1WAO 1; 5FZS A; 5FZQ A; 3TG4 A; 3QDN A; 3RKV A; 4HOR A; 2JLB A; 5CHE E; 4EQF A; 1FCH A; 3QKY A; 4HOQ A; 5FTP A; 3K9I A; 5ARG A; 2VSY A; 4XI9 A; 5CCL A; 2LSV A; 5C1D A; 3RU0 A; 5KJL A; 3SF4 A; 3QOU A; 5M72 A; 2LNI A; 4GCO A; 2C0M A; 4BTA A; 4U07 A; 2QFC A; 5JJ7 A; 3ASD A; 2KCV A; 3TAX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1EDU A; 5HS0 A; 4ME2 A; 4AXH A; 2L6J A; 2FO7 A; 3O4Z A; 4CDR A; 1WM5 A; 1V55 E; 1BPO A; 3Q5M A; 3R9A B; 3DSX A; 1NL4 A; 3U9W A; 4WNF A; 4HI8 A; 2AW6 A; 3DSS A; 1LD7 A; 4HOU A; 2R17 C; 4E85 A; 2Y1L E; 1OCO E; 3CVU A; 4YDW A; 1HF8 A; 2B6C A; 1NA0 A; 3IXE A; 1NP7 A; 2YHE A; 4A63 B; 5AQA A; 4YDE A; 2F37 A; 1PY1 A; 3AS8 A; 2J08 A; 2FUL A; 1TNY A; 3QAQ A; 3CLJ A; 3QWV A; 5EDS A; 3EIJ A; 4J8E A; 1UG3 A; 2ZGG A; 4EBA G; 3ZN3 A; 4ANU A; 5BPP A; 4ATG A; 5FT9 A; 3LJN A; 3FUM A; 4HLE A; 4K03 A; 4U63 A; 3GYZ A; 3ML8 A; 2XPI A; 4CGV A; 2IJG X; 4LSZ E; 5ENR D; 5CBN A; 4IN3 B; 1OXJ A; 4GZ3 A; 4FJZ A; 5LCW J; 2PM7 A; 4YDY A; 4J7W A; 4I17 A; 1EYH A; 2XPZ A; 3L16 A; 3ENE A; 3ZEF A; 2EQX A; 2KZT B; 1N11 A; 4V3I A; 3T8M A; 3W9G A; 4F1P A; 2OV8 A; 2NXP A; 3D9O A; 2XEE A; 4G2V A; 3HYM B; 5AN8 A; 1Z3X A; 1UJJ A; 4WAF A; 4DUI A; 3DSW A; 2Y3A A; 1W3B A; 4GA1 A; 3LVR E; 4WNG A; 4QQI A; 4XE0 A; 3NOG D; 2XZT G; 4N3B A; 3G2V A; 3UX4 A; 5CEA A; 3OXF A; 2GRN B; 2IEJ A; 5A6C A; 3EU9 A; 3LVQ E; 3L08 A; 3G2U A; 4CRW A; 3DEO A; 1OWL A; 2F0Y A; 4R7L A; 3Q4A B; 3Q9U C; 4GZ5 A; 4J8F A; 1LD8 A; 1N4P A; 5EIL A; 1S70 B; 3SFZ A; 1H2V C; 2IOL A; 2F8Y A; 2BKK B; 3E4B A; 4K5A B; 4UWH A; 3ABK E; 4JEH A; 4O6F A; 3Q7F A; 1IQU A; 2AXU A; 2V4H C; 3JUI A; 2WMN A; 3ZGQ A; 3RRM B; 3AU4 A; 1BI7 B; 3UT7 A; 1KZP A; 2LAH A; 2H6H A; 5AQ9 A; 3UMV A; 2VYI A; 3S2A A; 2KCK A; 4B89 A; 5AQB A; 3PZ1 A; 4KYO B; 3LS8 A; 4E6H A; 1IHG A; 2C2L A; 4F1S A; 2AJA A; 4G26 A; 4U95 D; 1SQM A; 1OCR E; 4CEM A; 2RG8 A; 2KCL A; 3ZYL A; 4N2S A; 3BU8 A; 4GZD A; 4HRL A; 2OCC E; 2M63 A; 5CRV A; 3URZ A; 4BTB A; 4YVQ C; 3MKQ B; 5HKP A; 5BV1 A; 4RLY A; 4BT9 A; 1KLX A; 3KAE A; 4DX7 D; 2X6F A; 2J4B A; 1YCS B; 3S7J A; 2WXK A; 3ZYQ A; 3QB2 A; 3QNK A; 3FU5 A; 4EZL A; 1ZBP A; 4B8C B; 2CFU A; 4RQI A; 3OAW A; 1PAQ A; 2WQ7 A; 2X38 A; 4C0E A; 4A1G A; 1OWP A; 2Y4U A; 3U3W A; 3HIZ A; 5CMY A; 3PEV B; 3FUH A; 3R7R A; 2WXG A; 3HVE B; 4N5Q A; 1Y8M A; 4APO A; 4JC8 A; 2NC9 A; 2R03 A; 1OY3 D; 3Q9N C; 3FTX A; 3PS6 A; 4N39 A; 2KM4 A; 3SGH A; 3DPD A; 4EPZ A; 2IF4 A; 2WB2 A; 3RIB A; 4KXK B; 2GW1 A; 2WXP A; 3LPZ A; 2P58 C; 1O1T A; 2EIN E; 3QWW A; 1DNP A; 2JEK A; 2R59 A; 5BV0 A; 3CGH A; 4UI9 K; 3CVQ A; 1LTX A; 3KEZ A; 2R05 A; 3TWX A; 3OXL A; 1AP7 A; 1TN7 A; 1KZO A; 4DI4 A; 5EYP F; 3GW4 A; 4U0Z A; 4C0M A; 4FP7 A; 3B13 A; 4FHK A; 5G2N A; 3MA5 A; 2ETC A; 2FBN A; 2XGO A; 3GZ1 A; 2Y0B G; 1QYM A; 3E32 A; 3HXC A; 2WPV A; 5BW8 C; 1YA0 A; 3Q75 A; 2L6B A; 3AG2 E; 4AVX A; 3J5Q B; 2CHZ A; 5AIJ A; 3BUA A; 2XEN A; 4GZ6 A; 5B1B E; 1A17 A; 4GYO A; 3LKU A; 1H2U A; 4Q96 A; 2WXQ A; 4UI9 J; 4U0S A; 3EUV A; 2I2O A; 3L9T A; 2LAI A; 3SD5 A; 3TG4 A; 3QDN A; 3TJP A; 3V79 K; 4EQF A; 2WXF A; 2MYO A; 2DVW A; 5JHA A; 2J8S D; 4Q69 A; 4HLL A; 1N4R A; 1MJ0 A; 5ARG A; 4XI9 A; 3L17 A; 5KJL A; 3FDH A; 3TWQ A; 1HG5 A; 4B8A A; 4GCO A; 4BEP A; 3C3R A; 3I5P A; 4K5B A; 3ULY A; 1XGW A; 2XHE A; 3EHQ A; 3ZXP A; 4AOF A; 3AU5 A; 2QFC A; 3ASD A; 3NAW A; 4I43 A; 3Q15 A; 1N0R A; 3FTV A; 3I4G A; 4NIK A; 4B0Z A; 2VSO E; 2VGX B; 4HNA D; 4GMJ A; 3UM2 A; 1E90 A; 4M7C A; 1UN9 A; 3ZW3 A; 3PNL B; 2XQ0 A; 4PS8 A; 1O1R A; 3UPV A; 2UWJ G; 3E34 A; 3ZVV A; 3CVW A; 4NQ0 A; 3FUF A; 4JHR A; 5JJ6 A; 1WY6 A; 2MRI A; 4F6R D; 2XEV A; 3U4T A; 5FJY A; 4YDO A; 1D8E A; 1KT1 A; 2DYR E; 2AVP A; 3LY9 A; 3ULQ A; 2UY1 A; 1JPL A; 1MZC A; 3CST A; 3LY7 A; 2BTD A; 5E76 A; 2LUH A; 2IQC A; 4C9B B; 1E8X A; 1L5J A; 3AS4 A; 4BFR A; 3TWS A; 3HG0 D; 4XX5 A; 1TR4 A; 3TGO A; 4HBD A; 3B7B A; 3SFX A; 2X6I A; 4DLQ A; 3DRA A; 3UKR G; 3TWR A; 4WUY A; 4GA2 A; 3CKB A; 3W9F A; 5T4Y A; 3TWT A; 3D9H A; 1BD8 A; 1TN6 A; 1NI1 A; 5CRU A; 3N71 A; 2YNQ A; 3ISM C; 3E37 A; 3IV0 A; 5LX8 A; 3D9J A; 2A5U A; 3GZ2 A; 3NOC D; 3FUI A; 4L2Y A; 4ANX A; 2FF4 A; 3OXG A; 4UQZ A; 1D8D A; 1MX2 A; 4G25 A; 2WQ6 A; 3LDZ A; 2LO6 A; 4GU5 A; 5J90 A; 2QY7 A; 4JHJ A; 3GZS A; 3CHO A; 1ELR A; 1RZ4 A; 4FLB A; 4CZ2 D; 3TG5 A; 1E8W A; 4LNG A; 3CHQ A; 4KMO A; 4GYW A; 4L2L A; 1Y6I A; 3ASF A; 4GTS A; 1HX8 A; 3MJW A; 4ACK A; 3MZL B; 2P9S G; 4JA7 A; 4XIF A; 3BEE A; 3ZUV B; 3V30 A; 5FIN A; 4GYY A; 4ZHB A; 3DBS A; 2XCB A; 4Q94 A; 2KXP C; 1HO8 A; 2GRR B; 4TUM A; 5LP0 A; 1EPU A; 3ESL A; 4J8D A; 3V31 A; 1S64 A; 3CK9 A; 4FLH A; 3BG0 B; 3TXN A; 3HRA A; 2R02 A; 4WWP A; 3T9K A; 4EZJ A; 4AEZ C; 3C72 A; 4LUN U; 3UIN C; 2L0T B; 3F6Q A; 4Y6W A; 2XGS A; 3PDN A; 3L82 A; 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