3T36A

Crystal structure of lytic transglycosylase mlte from eschericha coli
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
183
structure length
183
Chain Sequence
DYTNPPWNAKVPVQRAMQWMPISQKAGAAWGVDPQLITAIIAIESGGNPNAVSKSNAIGLMQLKASTSGRDVYRRMGWSGEPTTSELKNPERNISMGAAYLNILETGPLAGIEDPKVLQYALVVSYANGAGALLRTFSSDRKKAISKINDLDADEFLEHVARNHPAPQAPRYIYKLEQALDAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title On the Mechanism of Peptidoglycan Binding and Cleavage by the endo-Specific Lytic Transglycosylase MltE from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endo-type membrane-bound lytic murein transglycosylase A
total genus 66
structure length 183
sequence length 183
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 4.2.2.n2: Peptidoglycan lytic endotransglycosylase.
pdb deposition date 2011-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3t36A00
5HMVA 1REXA 3A93A 1KXXA 1NMMA 1C08C 4HPEA 1C10A 4HPIA 4NGWA 3A91A 4DD3A 4BADA 4WL6A 4R0FA 2YBJA 2YBNA 1D9UA 4ETEA 3LYZA 1LSBA 4LT3A 3WXUA 5K7OA 5KY1A 1ZV5L 3A34A 3MGWA 4G49A 3ZVQB 1QIOA 4N8ZA 5LAFA 4ET9A 4PJ2C 4XJIA 1AKIA 1UBZA 2F4GA 2FYCA 1ALCA 2W1LA 1B7MA 3AGGG 1HENA 5DM9A 4QY9A 4ZFPA 3OK0A 5F9XA 2Y8PA 2HEEA 1LZCA 3P65A 1DQJC 4DDCA 1UIGA 1IR8A 1NDMC 2D4IA 3AZ6A 1LYZA 3RNXA 4OWBA 5I4XA 1W08A 5L3IA 5LXWA 2W1MA 1TBYA 4C3WA 1YKYX 1QDRA 2DQAA 3A6CY 3LZ2A 4YOPA 5F9UA 3W6EA 1I20A 1YQVY 1LKRA 1UIAA 1XSFA 2ZIKA 4HJYA 4J1AA 1HFZA 5B1FA 5KXZA 4ETBA 4LT2A 4XJHA 1J1XY 1KIRC 4B4JA 4DD7A 1UA6Y 4Z98A 3A95A 2XJWA 4I0CA 1NDGC 9LYZA 2DBTA 4NHIA 3FE0A 3AZ4A 3M3UA 1YANA 2HTXA 5C6IA 3TXJA 5I4WA 1OP9B 5A3EA 4N1CC 2YVBA 5KXPA 5HNCA 1JWRA 6LYZA 1CKHA 3A67Y 2MEAA 1UIBA 1N4FA 4ETCA 3AZ7A 1LZ8A 4DDAA 4PPOA 4DD9A 4WLXA 4KPMA 2I25L 4ETAA 4C5FA 5KXTA 1IY3A 4X3BA 1JPOA 1F10A 2Z12A 3LZTA 2XBRA 4H9BA 4LYCA 5FDJA 5DLAA 4NG1A 3BKHA 4N1EI 3W6BA 1GF3A 3AB6A 4GCCA 4UWVA 1OUHA 2AUBA 1LJIA 1IC7Y 4NGIA 1P2CC 1YKZX 4PRQA 3D3DA 2EKSC 1IOQA 1IEEA 3TMUA 1IO5A 4MCKA 1IOCA 1BWHA 5LA5A 1LZYA 2DQDY 1OUCA 1GBWA 1NF5A 1TEWA 4W94A 1LHMA 3WL2A 2DQEY 1G7JC 2LYOA 3ATNA 1LYYA 1J1PY 1GEVA 3AJNA 4HJZA 4XENA 5APFA 1YROA 4NG8A 3TXFA 1TCYA 2Z2FA 2BQHA 1KIQC 4OWEA 1ZVYB 3ZVQA 5LVHA 2ZQ4A 4WLTA 1JKDA 1GBZA 2BQLA 4H92A 5HLLA 154LA 3A3RX 3A94A 1IP2A 3W6AA 2Z18A 207LA 3TXGA 5B05A 1LMAA 3IWRA 1LJ3A 1CKGA 1YIKA 1OQMA 2YDGA 2Z2EA 4XJFA 2Z38A 4J1BA 4WM4A 3P64A 5I5QA 5HQ1A 4B1AA 1RI8B 2Z39A 1LZEA 2ZQ3A 4HSFA 2ZNXY 1IWZA 1UIEA 1FBIX 3A92A 4HV2A 4NGLA 3IJVA 1GB7A 4H9IA 1XEJA 3AW7A 5KXRA 4H8XA 4KT3A 4LT1A 1BHZA 1LZSA 1HFXA 1MLCE 1DPWA 8LYZA 4WG7A 5AMYA 2BQBA 5J7CA 1ZMYL 1T6VL 1FKVA 1HSXA 5KXMA 1BQLY 3W6CA 1G7HC 4YF2A 4Z46A 1IP5A 1JKAA 4EMNA 1LJJA 1HC0A 3G3BB 1IOTA 1NKHA 3A90A 4R6CA 5KXOA 1HFYA 1WQPA 1C7PA 1VEDA 3CT1A 1JTPL 4NGZA 3WPKA 1LZ5A 2A7FA 1LMNA 3FI7A 1GB9A 1LZ9A 1OUAA 3QY4A 1LSYA 1V7SA 1TDYA 4H9AA 1OUIA 3WXTA 2BQAA 5APEA 4WLDA 2HEFA 1OUBA 1LJKA 1FLWA 1RFPA 3WW5A 1GWDA 4CFOA 1GFHA 2CWIA 4H90A 4D9ZA 1B5XA 4G4HA 1REMA 1GF7A 1IC5Y 1VDTA 2HU1A 5LVIA 1GFRA 1WQQA 1HEMA 1LSPA 1WTMA 193LA 1JKCA 1IP1A 4RDSA 1NWGA 3WYHA 1C46A 1LMCA 4M4OA 1BWIA 1JJ3A 4WG1A 2BLXA 2I26L 1B5VA 1FLQA 4NGYA 4XYYA 4NY5A 4H91A 2MEGA 5B06A 1B7RA 4AXTA 4H1PA 2CJLA 1AT5A 1LTMA 3WVXA 2HEBA 3EO5A 1GBOA 1IP3A 1H6MA 2BQCA 2YBHA 2XBSA 1LPIA 2W1XA 2BPUA 1JKBA 1NBYC 1H87A 1GF5A 2DKVA 3EBAB 2FBDA 1IWWA 3ATOA 4B4EA 3WUMA 1BB7A 1RCMA 4Z3MA 2HUBA 1A4VA 1IR7A 1XFPL 1VDPA 1W6ZA 2Q0MX 1AT6A 1MELL 1JJ1A 2D91A 3EMSA 4IATA 1B7SA 4NGVA 1KXWA 4L41A 3TMVA 1HEPA 1LZTA 1LJFA 1DZBX 1JIYA 1F6RA 5FELA 4QGZA 4WM3A 1GB8A 1VFBC 1RJCB 5LVKA 1GAYA 1LZGA 4DC4A 1BGIA 2IFFY 3AGIA 3CSZA 5I53A 4TTDA 1GFJA 3IJUA 1FKQA 1GAZA 2EIZC 4WOAA 3ZEKA 2BAAA 2YBMA 4YEMA 1B5ZA 2BQIA 5L9JA 3CSRA 6LYTA 2EPEA 3WUAA 5M1YA 1GHLA 4B49A 1LHLA 1SLYA 5F14A 1OUGA 2HEAA 2G4QA 4NSHA 1GE0A 3WPLA 1IP7A 1IWXA 1PS5A 1LSZA 1QSWA 4FJRA 1IOSA 1FLYA 4CHXA 4HP0A 4NWHA 4MR1A 4J7VA 4NEBA 2PC2A 5ILFA 1XGUC 1LZ1A 1EQ4A 2MEDA 4NHSA 1LJ4A 4ET8A 1LSFA 4RLNA 1GFGA 4DD2A 1UIFA 4FDYA 1YILA 3A96A 4ML7A 5LYZA 4LGKA 2GV0A 1LZDA 1WVUA 2HECA 4XN6A 2EQLA 1B7LA 1GE3A 1IWYA 2DQHY 4QDNA 5ILCA 4BAPA 1LJHA 1WQRA 1WTNA 3HFMY 4CFPA 4NSJA 194LA 5IDDA 3QE8A 1IR9A 5DN4A 5I4YA 3G3AB 2BLYA 5II3A 2HU3A 1C45A 1REYA 1REZA 1XGTC 1CKCA 3AW6A 3CT0A 1IWTA 4WLYA 1DKJA 1LJEA 4NSGA 4XJDA 2MEEA 3SP3A 3AYQA 2MEIA 1UIHA 3P66A 1LCNA 3EXDA 4HV1A 7LYZA 1GDWA 4B4IA 1JTTL 3B0OA 2HEDA 1IY4A 1LSMA 3WU9A 1UC0A 1LMTA 2G4PA 4BS7A 2DQJY 1B7QA 1PZYA 1CKFA 1QUSA 5FCPA 2F2NA 1XGRC 1GBYA 3M18B 4O34A 4OOTA 4Z41A 4H8YA 5HNLA 3A6BY 1GB6A 2I6ZA 3RT5X 1QDTA 1GE2A 1VDSA 1YAOA 2BQEA 4GCDA 2YSSC 2ZNWY 4N5RA 2D4JA 5B07A 2MEFA 1NHEA 1FDLY 1LOZA 2RSCA 1HEOA 2ZYCA 2X0AA 3KAMA 2FBBA 2MECA 4WM1A 1GE4A 5C6JA 5FEKA 1VDQA 5FHWA 2BQFA 1QTKA 3HBEX 5LA8A 1LHKA 3AZ5A 4WL7A 1KXYA 2LHMA 5KXLA 4PGJB 1HHLA 2D6BA 1UACY 4NHTA 5E4PA 4N9RA 1BB6A 1GB5A 3HBHA 4NIJA 4U3XB 4WO6A 3TXDA 3TXIA 1IWVA 5KXYA 1JSFA 2D4KA 5DL9A 1HERA 4EOFA 4WMGA 4TUNA 1BWJA 2G4NA 4KXIA 5KXKA 1ZVHL 1GF8A 4H9HA 3LN2A 4CJ2A 5KXWA 4YEOA 4CGEA 3N9CA 3B0KA 4OWHA 4WM6A 3GXKA 1LHJA 1EQEA 1GFVA 1A2YC 1HELA 1JHLA 4IJ4A 4LFPA 1D6QA 1GDXA 1QQYA 3AGHA 4HTNA 1DXJA 1CJ9A 3QNGA 5LYMA 132LA 3LYTA 5I54A 4NHQA 1TAYA 4OWAA 4ETDA 1JEFA 1GFTA 1LSCA 2MEBA 1LJGA 4GN5C 4ZIXA 153LA 1DPXA 2ZYPA 5APDA 1GF9A 2YBLA 1LZ4A 3LYMA 3LYOA 4UWNA 4W96A 4XADA 3WMKA 1FN5A 1GFUA 1IP6A 3BKVA 4RLMA 4AGAA 1B9OA 1GXXA 1LZ6A 1WQNA 4QEQA 1GBXA 1SQ2L 1IX0A 1BVXA 2DQIY 3TXHA 1NBZC 1GB2A 1HNLA 1UICA 1B0DA 1D0MA 1DI3A 1OUEA 1YAQA 2BQMA 2C8OA 4H9FA 4TX7A 3WU8A 4MSTA 4GCFA 1B5YA 1LKSA 5T3FA 1QSAA 2CDSA 3WULA 3T36A 1E8LA 1B7NA 4WM2A 4GLVA 4OWCA 1BB4A 4GCEA 5LVJA 1O23A 2A7DA 2WARA 3TMWA 2H5ZA 1DI5A 4HJVA 5IELA 2ZWBA 2F4AA 1F0WA 3B0IA 1YL1X 1D6PA 4NFVA 1FLUA 1BB3A 1LAAA 1LSNA 2IHLA 4TWSA 1CJ6A 2LYMA 3P4ZA 4A7DA 4TSCA 3HBDA 1HF4A 1YKXX 3LHMA 4NWEA 2H9JA 1OUJA 4XJBA 3J6KA 1GFAA 1BB5A 1QUTA 3CT5A 4B0DA 2FYDA 1JTOL 4HTKA 4LYTA 1GF6A 4DYGA 3D9AC 1LMQA 3P68A 4NGOA 3A8ZA 1VAUA 5D5CA 1G7MC 5KKIA 3J4GA 1LSDA 4G4BA 3B6LA 4H8ZA 4E3UA 1OUFA 5LVGA 3N9AA 1JISA 1Z55A 4RW2A 3TXKA 1J1OY 1LHHA 5L3HA 3TXEA 2BQJA 2BQNA 4H93A 4H9CA 1AZFA 4ZEEA 1F6SA 3WH1A 4NSIA 5LAGA 1JJ0A 1CJ8A 4GLAA 5KXXA 1EQ5A 4OW1A 1JSEA 5LIOA 5KXSA 4NHPA 4H94A 1LYSA 5F81A 1YL0X 2XTHA 1IP4A 1GPQC 1UIDA 5C6LA 1GF0A 4KL7A 4UWUA 1B7OA 1HMLA 3A3QA 3CB7A 3E3DA 2BQGA 1IWUA 5LYTA 2F30A 1BVKC 1LMPA 4II8A 3W6DA 3CQLA 1OUDA 4G9SA 4DDBA 2W1YA 1GEZA 5APCA 3WUNA 1LSEA 2VB1A 4ANRA 1LMOA 5JENB 2ZILA 1IIZA 1XEIA 4G4CA 1UCOA 4N0JA 1T3PA 2MEHA 3W6FA 133LA 2NWDX 5KJ9A 1IORA 3VWOA 1KIPC 2ZIJA 3N9EA 4H9EA 5E9RA 1WVVA 4GN3A 1LJNA 1XGPC 3WW6A 5F16A 3WU7A 4J0LA 2LYZA 5IHGA 3WVYA 4RW1A 4YM8A 3T6UA 1LHIA 1GB0A 3RW8A 3K3TA 4LYBA 3RZ4A 4PRUA 1VATA 1C43A 5A3ZA 4WM5A 2CGIA 1DI4A 4IASA 1QTEA 4NGKA 4PHIA 4OOOA 5EBHA 2C8PA 1I56A 1JITA 1YAPA 2B5ZA 4I8SA 4P2EA 1IC4Y 1LZNA 1DKKA 1GXV2 208LA 4NGJA 5B59A 4HTQA 5B1GA 1EL1A 2DQGY 2LZ2A 2DQFC 1B5WA 3B72A 1G7LC 3WPJA 1RE2A 1AM7A 1B5UA 4DD1A 2Z37A 1CKDA 1LZRA 2BQOA 1CNSA 3OJPA 3GXRA 2YBIA 4WO9A 4M6DA 4LYMA 3ULRA 1GFKA 1HMKA 1LSAA 1GB3A 3RU5A 4BAFA 1IVMA 4LYZA 5HMJA 1D0LA 1GBSA 4GCBA 4LFXA 1HEQA 1GF4A 1XGQC 1I1ZA 2DQCY 1YAMA 3TMXA 135LA 4GN4A 2H9KA 5DN5A 1G7IC 1HSWA 1GFEA 3CSQA 1LZBA 4XJGA 4DD0A 1INUA 1JUGA 4YENA 5FSTA 5LINA 1D0KA 4DWXA 2BQKA 1GD6A 4DT3A 134LA 1V7TA 1LYOA 5KKJA 3TXBA 1LZAA 2N5ZA 2Z19A 1NQIA 1HEWA 1WQOA 1CJ7A 1GE1A 4LYOA 1B7PA 1LSGA 1XEKA 4LT0A 3F6ZA 3W3EA 1UUZC 1WQMA 5KXNA 2BQDA 4TSBA 5D5FA 4LZTA 2LZTA 1B2KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1REXA 1KXXA 1NMMA 1C08C 1C10A 4NGWA 3ODUA 4WL6A 143LA 4W55A 2YBNA 3SB8A 152LA 5K7OA 1C64A 2NTGA 1L50A 2F4GA 1B7MA 3OK0A 3L64A 2Y8PA 2HEEA 1LZCA 1DQJC 163LA 3AZ6A 5LXWA 1YKYX 1G0KA 2DQAA 1DYGA 261LA 4ZPUA 4XJHA 4DD7A 1KS3A 3HDEA 3AZ4A 1OP9B 171LA 3FA0A 1JWRA 2MEAA 1N4FA 1SWYA 4KPMA 2I25L 162LA 4ETAA 4X3BA 1F10A 4GCCA 2Q9EA 1YKZX 2EKSC 1IOQA 1OUCA 1TEWA 3CDQA 1LYYA 4AQNA 3HTGA 232LA 253LA 3AJNA 4HJZA 3TXFA 1QT8A 2BQHA 2Z2FA 4OWEA 199LA 3ZVQA 1L55A 1G0QA 4WLTA 1GBZA 5HLLA 3G3VA 2RBPA 1IP2A 3A94A 2LCBA 2Z2EA 1L99A 3P64A 5HQ1A 3GULA 2Z39A 3A92A 4NGLA 3IJVA 1HFXA 1MLCE 1DYDA 8LYZA 2BQBA 5J7CA 1L60A 5KXMA 4PK0A 3W6CA 1IP5A 3DN2A 1NKHA 3A90A 4R6CA 1HFYA 1SWZA 1C7PA 1VEDA 3CT1A 3FI7A 1OUIA 3WXTA 4WLDA 1L72A 1CV0A 2HEFA 1FLWA 1L81A 164LA 4DQJA 4CFOA 1B5XA 4G4HA 165LA 221LA 1NHBA 1BWIA 1JJ3A 2BLXA 2I26L 223LA 1B7RA 5B06A 1AT5A 1L42A 244LA 210LA 1H6MA 2Z6BA 1LPIA 2W1XA 177LA 4YXAC 1IWWA 3ATOA 3WUMA 4Z3MA 3D4SA 1A4VA 1XFPL 182LA 1JJ1A 2D91A 3EMSA 4IATA 1KXWA 3TMVA 248LA 4DAJA 4QGZA 3G3WA 3SB6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5HMV A;  1REX A;  3A93 A;  1KXX A;  1NMM A;  1C08 C;  4HPE A;  1C10 A;  4HPI A;  4NGW A;  3A91 A;  4DD3 A;  4BAD A;  4WL6 A;  4R0F A;  2YBJ A;  2YBN A;  1D9U A;  4ETE A;  3LYZ A;  1LSB A;  4LT3 A;  3WXU A;  5K7O A;  5KY1 A;  1ZV5 L;  3A34 A;  3MGW A;  4G49 A;  3ZVQ B;  1QIO A;  4N8Z A;  5LAF A;  4ET9 A;  4PJ2 C;  4XJI A;  1AKI A;  1UBZ A;  2F4G A;  2FYC A;  1ALC A;  2W1L A;  1B7M A;  3AGG G;  1HEN A;  5DM9 A;  4QY9 A;  4ZFP A;  3OK0 A;  5F9X A;  2Y8P A;  2HEE A;  1LZC A;  3P65 A;  1DQJ C;  4DDC A;  1UIG A;  1IR8 A;  1NDM C;  2D4I A;  3AZ6 A;  1LYZ A;  3RNX A;  4OWB A;  5I4X A;  1W08 A;  5L3I A;  5LXW A;  2W1M A;  1TBY A;  4C3W A;  1YKY X;  1QDR A;  2DQA A;  3A6C Y;  3LZ2 A;  4YOP A;  5F9U A;  3W6E A;  1I20 A;  1YQV Y;  1LKR A;  1UIA A;  1XSF A;  2ZIK A;  4HJY A;  4J1A A;  1HFZ A;  5B1F A;  5KXZ A;  4ETB A;  4LT2 A;  4XJH A;  1J1X Y;  1KIR C;  4B4J A;  4DD7 A;  1UA6 Y;  4Z98 A;  3A95 A;  2XJW A;  4I0C A;  1NDG C;  9LYZ A;  2DBT A;  4NHI A;  3FE0 A;  3AZ4 A;  3M3U A;  1YAN A;  2HTX A;  5C6I A; 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 1KIP C;  2ZIJ A;  3N9E A;  4H9E A;  5E9R A;  1WVV A;  4GN3 A;  1LJN A;  1XGP C;  3WW6 A;  5F16 A;  3WU7 A;  4J0L A;  2LYZ A;  5IHG A;  3WVY A;  4RW1 A;  4YM8 A;  3T6U A;  1LHI A;  1GB0 A;  3RW8 A;  3K3T A;  4LYB A;  3RZ4 A;  4PRU A;  1VAT A;  1C43 A;  5A3Z A;  4WM5 A;  2CGI A;  1DI4 A;  4IAS A;  1QTE A;  4NGK A;  4PHI A;  4OOO A;  5EBH A;  2C8P A;  1I56 A;  1JIT A;  1YAP A;  2B5Z A;  4I8S A;  4P2E A;  1IC4 Y;  1LZN A;  1DKK A;  1GXV 2;  208L A;  4NGJ A;  5B59 A;  4HTQ A;  5B1G A;  1EL1 A;  2DQG Y;  2LZ2 A;  2DQF C;  1B5W A;  3B72 A;  1G7L C;  3WPJ A;  1RE2 A;  1AM7 A;  1B5U A;  4DD1 A;  2Z37 A;  1CKD A;  1LZR A;  2BQO A;  1CNS A;  3OJP A;  3GXR A;  2YBI A;  4WO9 A;  4M6D A;  4LYM A;  3ULR A;  1GFK A;  1HMK A;  1LSA A;  1GB3 A;  3RU5 A;  4BAF A;  1IVM A;  4LYZ A;  5HMJ A;  1D0L A;  1GBS A;  4GCB A;  4LFX A;  1HEQ A;  1GF4 A;  1XGQ C;  1I1Z A;  2DQC Y;  1YAM A;  3TMX A;  135L A;  4GN4 A;  2H9K A;  5DN5 A;  1G7I C;  1HSW A;  1GFE A;  3CSQ A;  1LZB A;  4XJG A;  4DD0 A;  1INU A;  1JUG A;  4YEN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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