3T66A

Crystal structure of nickel abc transporter from bacillus halodurans
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
476
structure length
475
Chain Sequence
EKHIHFLFNVSTNSLDPHVDMTYIPVRAGITETLVRVDEENVTIAPWLAESWDSTDGQHWTIKLREDVTFQNGKEMDAEAVKASLERALDESVAIENALKIDEIEADGYTLHITTKEPFPEFISELVNPNVSIIDVTEEDFTNHPVGTGPFALESFTPGSKLELVRYDEYWDGASKLDSVTFSFNEDASARSLALESGQADIVYRPEVESIETLQANEGIMVEATETFRTHNLTMNLDRDSLKDVNVRRAVDVLLDRQEIVDTIMLGYAEVADGPFIPTLPFAPSYEKKETGTDIAIQYLEEAGYTLENQMQKDGEPLHFTVLTYGSRAELPLIAQVFQSNAKQIGIEVEIRQIEVPEEYMASNRDWDLITYSNVTSPRGDAGYYLNATYHPTGALNFSSVNDPELTGIIDELNRTVDQDVRAKLTEQAAAYIDEQKIHSFLIHPSAVVAYDENKVKNWVTTRSEYYMITNQLDV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Nickel ABC transporter (Nickel-binding protein)
publication title Crystal structure of Nickel ABC transporter from Bacillus halodurans
rcsb
source organism Bacillus halodurans
molecule tags Transport protein
total genus 131
structure length 475
sequence length 476
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-07-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00496 SBP_bac_5 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 3t66A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t66A01
4LQ5A 2REGA 4YKJA 3HV1A 3M3FA 4BDMA 1SW2A 2HQ0A 4F22A 3MPLA 3K0VA 2F78A 1Z7ME 1B7HA 3Q27A 4GXAA 3DM0A 1WODA 3IJOB 3KSJA 1MDP1 1NFTA 4F3SA 3R6UA 3FJMA 3FXRA 4DCYA 3EHTA 2KLFA 2F36A 1QW0A 2AYSA 2PYYA 2F6PA 3H6WA 3K6XA 3FATA 4KYSA 3PMWA 1F9BA 3QUFA 5KDTA 5B70A 1D9YA 3BFTA 3VLVA 5AA2B 2CMOA 2O7IA 3MQ9A 4NF6B 1N3WA 4GIZA 3OO6A 3S9LC 5FHOA 4OEVA 4R2BA 3QAXA 1B5JA 5AE4A 1POTA 3TEPA 4UA8A 5TU0A 3G3HA 3O2AA 1NNKA 5DT6A 2GHBA 4HW8A 1ZMGA 4FJPA 1JW5A 1JW1A 1LBBA 5CBRA 1FQBA 4P11A 3G3IA 4ZDMA 1GVCA 1VFEA 1FQAA 4EXLA 1SW5A 2B4LA 4IO7A 5BUUA 4X9TA 4YZZA 1D3KA 2B4MA 3HPIA 3U94A 3D4GA 3SERA 2OBGA 3KSXA 2GH9A 5F7VA 3OXNA 3VFJA 3RUMA 4DXBA 2I48A 2ONSA 1UIVA 5I59B 4IO5A 4R74A 1N04A 4IB2A 1VR5A 1LCFA 3H03A 3O29A 1MM6A 3TKDA 4WKMA 1MQGA 2ZNUA 1SDXA 1JVYA 1MQIA 2FA7A 1YCJA 3K1MA 2IEEA 3TPAA 3U8QA 3G7WA 3CI8A 4NEDA 4DXUA 1FTJA 2QS2A 1S7YA 3IR1A 2QL3A 4IGTA 5A5XA 3RN8A 4F19A 4ZS9A 3MVWA 4RYAA 3S4UA 1IXHA 3DRJA 3FVNA 1USYE 2R9JA 1RKMA 5AA2A 3T9VA 1I6QA 1B32A 4MBPA 2V3TA 4KPTA 4DZ1A 2BJJX 4P0GA 1ZU0A 2RCAA 3O28A 4R75A 1URDA 4HS7A 4DE8A 3FIRA 1QKBA 1EZOA 4FEBA 1J1NA 4QSCA 4ONYA 5H8FB 3Q25A 4PP0A 4O3BA 4KYEA 5DTBA 3RGYA 1A54A 1RYXA 2NOOA 3HO7A 3O97A 3EPEA 1M5FA 4QRZA 1SQYA 3PMXA 2WOPA 3C35A 3W9VA 2QMXA 1QJMA 3K02A 3MBPA 3FV2A 4H67A 3M3LA 1MXXA 2HCAA 1PBQA 4GLIA 5I2KB 3TMGA 5H8HB 1UTBB 2HEUA 2I4CA 3FVKA 4U4XA 4UACA 2DE3A 3H3GA 4G8MA 4IO4A 2QS3A 4ELQA 1B5IA 3N6UA 4OHNA 4F3PA 2G29A 1LB8A 1NH8A 1FQCA 4AB5A 1L5TA 4G68C 3U72A 1NL5A 3IOTA 1CB6A 4U4SA 3EHUA 1JW4A 4BLAA 4NWCA 1IEJA 2D5WA 3MZ9A 3FZVA 3IO6A 1NNFA 2H98A 1POY1 1QKAA 1B0LA 3DLNA 4QFPA 3PPQA 4DDDA 1XVYA 1HSJA 4TLMB 1RYOA 3H4ZA 3T93B 4JWXA 1ELJA 1M5DA 3MVZA 4NMYA 4I9DA 1NH7A 3CHGA 1O7TA 3LC8A 4H8JA 2F5XA 3OO7A 3TTRA 1DPPA 3BBRA 2PT2A 3SETA 1YTVA 1TFAA 1MH4A 5FTHA 2I3WA 4QSEA 4FATA 2DOJA 1FQDA 4ZE8A 3VLUA 3MW0A 5AA4B 4BDQA 2G93A 2XXRA 2F7CA 4ELPA 2I0CA 1PC3A 3VLWA 4H5FA 3E13X 3MVYA 4QSDA 3QK6A 5TP9A 3TQWA 1QULA 2H99A 1N7WA 1LAHE 3D4CA 3PMVA 5FTIA 1PDAA 3SESA 3TELA 1OVTA 2A5SA 3LVUA 1D9VA 2F97A 3H06B 3I6VA 1QUIA 3WAEA 1MXVA 3V89B 4GQOA 4F1UA 3VVDA 1MPBA 4ZECA 4EF1A 4RA1A 3ZKKA 2VGQA 1MS7A 3OENA 3VDFA 4YU0A 3PUZE 3RT6B 4ISUA 4PETA 5BWJA 4NF4A 3O66A 5CMKA 2Q88A 3TYHA 1VFDA 5EYFA 3B6WA 2Y7KA 5JEIA 3MPKA 4X1DA 3G3GA 3KEIA 4H6DA 1B2HA 3I3VA 4OXVA 2W7YA 4R9FA 1B1XA 4XKRA 4FECA 3PUYE 4F2QA 2O6AA 1SYHA 2CZLA 5I58B 1LFGA 2E1SA 1B6HA 1GGGA 4KI0E 1YAEA 2ONRA 4X48A 2UVHA 3OO9A 4YKPA 2F34A 1AMFA 3PUVE 3MAMA 3QIMA 4PFTA 1R9QA 1MQHA 1P99A 3H7MA 5F1QA 2OWTA 4OFLA 1H3DA 2F35A 3T9XB 2OK2A 1UQWA 3AXFA 4PE5B 3P7IA 1IQ7A 4LZ5A 1A7LA 3IOVA 4LQ2A 3V8XB 3TAJA 4WEPA 1Q35A 2FYIA 3TTNA 1IXCA 1Y3PA 4G77A 2ALUA 4F29A 4U22A 3CG1A 4U23A 1IZ1A 3MUQA 1SYIA 3PPOA 2O68A 3FD3A 3SKPA 2I0BA 1LSTA 4XKPA 3SEVA 3OSQA 3UK4A 3H6UA 1MXUA 1B7UA 3V5AA 1OQGA 1P1WA 1N76A 3CRBA 1JEUA 1LB9A 1ZJLA 1MRPA 1H44A 1FQFA 3C4MA 1MPCA 4RK2A 3RTFB 3PD9A 2ABHA 3HSTA 2DS9A 5A5XB 2XXIA 4AQ4A 3OOAA 3FTOA 4OVJA 3MZBA 4I8CA 4Z7EA 1MQDA 3S9MC 4R72A 5HPQA 3B6TA 4LUBA 4KCDA 3Q26A 3PPNA 1EH3A 3SEXA 3B7DA 1FTLA 5I58A 1ANFA 3W9WA 3OMBA 3FUZA 1DTZA 3CVGA 4XIGQ 4THIA 2H25A 3K6VA 3TQLA 1R1NA 2V84A 4N07A 5I56A 5DVFA 3UIFA 3CSGA 2H5YA 3S2VA 2O84X 1OMPA 4NF5A 5CC2A 5KZTA 3T66A 3R26A 5I57A 1B05A 4Q8RA 3TCHA 4NTLA 3WAFA 4WEDA 4DCXA 3SEWA 4YMBA 4F39A 1KWHA 1MQJA 3QXMA 2V25A 1Y9UA 3THIA 3CG3A 4XXUA 5DEXA 4GF8A 4O3AA 4I62A 4M1VA 1WDNA 2Q2CA 5B7DA 4NF8B 3U93A 1SVXB 3IL1B 5H8QA 5CBSA 4ZZAA 5EHSA 2XHDA 4G68A 1LAFE 3PU5A 4F3GA 4GD5A 3EHSA 1GR2A 4TLLB 2LAOA 1EU8A 3BKIB 4PQJA 3RTWB 2AL5A 4XKNA 3GXAA 3A3UA 3OD7A 3TCFA 3FGSA 2WOLA 4POXA 4FIMA 3MZ1A 2D3IA 5KCJB 4H0WA 4O3CA 4TQUQ 1IXIA 4C1TA 4MLQA 1TT1A 1P1NA 4PFWA 1EZ9A 3KN7A 5ELVA 4HTGA 1QUJA 3IO4A 3TCGA 2OCUA 3ZKLA 1O64A 1PB9A 1R6ZA 3VVEA 1XVXA 5H8NA 3K1PA 1T0KA 5ICTA 1USYH 3QSLA 1M5EA 3IB1A 4YKIA 1FTMA 1OIBA 1P1QA 3CFLA 4DXCA 1JEVA 1DOTA 4OFJA 2V3UA 1NMUA 2VD3A 4R6HA 4RJZA 3IB0A 1JVXA 4P0IA 2Q8JA 3EF7A 1CE2A 3S9EA 2B65A 1MY3A 1US4A 4G8HA 2E0SA 5TP9B 3E3KA 4MF3A 3HHGA 3IOUA 1Y3NA 4K3FA 1BP5A 4F1YA 2UXAA 3OSRA 1A55A 2QPQA 2HXWA 3TUSA 5CI5A 4F1VA 1URGA 2XXVA 4NF8A 3HHFA 4M4GA 1DSNA 2DQVA 1FW0A 3C32A 3DRFA 4JSOA 3PPPA 4Q5TA 1US5A 3T96B 4Z0IA 2YJPA 4G2ZA 3K6WA 4GOTA 1FQEA 2THIA 3DP4A 4NF4B 3L6HA 2P2AA 1Y4CA 2I49A 1XC1A 2DXRA 4X1BA 2X7QA 4F18A 3KOTA 2RCBA 2H9BA 4YB7A 1PBPA 2ZXTA 1SI0A 2PT1A 2ZNSA 2PBWA 4GL0A 5KCJA 1SD3A 4I1DA 4GFRA 2I3VA 3GLBA 3O6HA 5IAIA 1S9TA 1I6AA 3PUXE 2DWAA 3ZSFA 3E4RA 1PB8A 3UGWA 2XD2A 2R6GE 4H1XA 2RKMA 2P1SA 2DWHA 1OLCA 4OEUA 3UA8A 1OLAA 2GRVA 3UN6A 2Q89A 3KJTA 3LSLA 2X26A 2Y7IA 2QJEA 1BLFA 5DVIA 4JB7A 4QHQA 1N0TA 4IO3A 1MY2A 4QFOA 3USDA 3VXBA 2ZMBA 4WXJA 3ZS6A 3UORA 1XS5A 2HZKA 2Y7PA 1YPNA 5ITOA 1IXGA 2XXXA 3PV0E 4YB6A 3CR9A 1B46A 2UYFA 3V83A 4JSDA 3IX1A 4RXLA 3U92A 1MH3A 1EZPA 3IB2A 4KCCA 3S9NC 3VXCA 3RLFE 4POWA 5DVJA 3KG2A 2F8DA 3L6GA 3KBRA 4Q0CA 4L17A 3IJXB 4GVOA 1B3HA 1LAXA 4F2OA 3MC2A 1B0HA 3JZJA 2RC7A 3ECRA 2Y7RA 5IKBA 3VE1B 2OJTA 2ZYMA 1VSOA 1N7XA 2UYEA 3LBSA 2F7BA 4JBZA 1B3EA 4XTCQ 1AOVA 4OFOA 2OWSA 1FCKA 2VD2A 4EQ7A 3HN0A 4IY5A 3CSBA 4LONB 1M5BA 3RY3A 3PGFA 2Z22A 1DTGA 4RPOA 3IORA 2VP1A 1P1UA 3KGCA 3UP9A 4JWYA 2DE4A 1MM7A 4G4PA 5I56B 1IIWA 3G3JA 1NNPA 3ONMA 5I2NA 4E0XA 2V93A 4BDRA 4NF5B 1LFHA 2XX9A 3M8UA 4LP2B 5I57B 1ZBMA 3MVXA 1SW4A 4C1UA 2O7UA 3MWBA 2NUVA 3N94A 2ESNA 2VHAA 1Y1ZA 1N84A 1B51A 5DEXB 5ISUA 2ZNTA 1B58A 3CFXA 1MPDA 4ZEIA 5AA3A 2V3QA 2ANJA 4LVQA 1B1HA 2XD3A 4YKKA 4OQOA 3DRGA 3CIJA 5H8QB 2HZLA 5CMMA 4PFYA 1SI1A 1LGBC 2B3FA 4XKQA 3GZGA 4YAHX 4F3BA 4G68B 1LCTA 4DIGA 3OELA 1B3GA 4IY6A 4BDOA 1O63A 5K2XA 2ONKE 4KHZE 4YICA 4DLDA 3O9PA 1BKAA 1XHYA 3KN8A 4C0RA 1H43A 2O1MA 5CMCA 1GV8A 4R9GA 3JV9A 1HSLA 3K00A 5K2YA 2XX8A 2OZZA 2VOZA 4YMAA 2HAVA 5JTYA 4JDFA 5TPAA 2ZYOA 4R2FA 1UTHA 1Y1MA 3SDFA 4MH5A 4QFKA 4KQPA 3OEKA 4JXIA 2OLBA 2Z8FA 3PAMA 3KN3A 3PPRA 3C31A 2ZYKA 1A8FA 4R73A 3C34A 1II5A 4N13A 3T22A 1B4HA 1JQFA 2GHAA 3DRHA 2XXHA 5H8NB 3FXUA 1ZKBA 3RNNA 2F6GA 4TOZA 1B40A 2F7AA 3RQTA 2QS1A 1B52A 1ATGA 1S50A 5FHMA 4JWOA 1I6BA 2O69A 4IO6A 1MDQA 1A8EA 3G3FA 5DYHA 4G8NA 1N3XA 1HSEA 2WOKA 3K1NA 3OEMA 3EN3A 4PFUA 3T9HB 3LSFB 4QFNA 3DP6A 2QMWA 2B3BA 1DMBA 4R6YA 3FVGA 4ZE9A 2UVGA 2DVZA 1AIVA 5CRYA 2DWIA 2AL4A 3Q29A 2PX1A 3TTKA 3BFUA 2XXWA 1Y3QA 4FAJA 2P0SA 4OMBA 4F31B 1PEBA 3SEUA 4KYDA 1MY0A 3LSXA 3DP8A 2RF1A 4U2RA 3FVOA 3IOWA 1OVBA 4OTEA 2DYXA 4KD5A 3ILUB 1IITA 2Q9TA 4MFIA 3TFLA 2A5TB 2XXPA 4EDPA 4IGRA 1A40A 1Q1KA 3GBBA 3K01A 3SEYA 5J1DA 3MJNA 4LZ8A 3K2DA 4OETA 2RC9A 4YB5A 4BDLA 4LZ7A 2R71A 4E0WA 3MP8A 1LLSA 1SBPA 4EUOA 4NF6A 3F11A 4QF9A 1Y20A 2IA4A 3PD8A 3IAZA 4GXSB 3K6UA 3QUJA 4OENA 3K4UA 3PUWE 3FJGA 4LATA 4ECFA 1IUDA 3O6PA 4ZEBA 4AB6A 5AA1A 1UIUA 1QVSA 1TWYA 4ZEDA 4FORA 1R9LA 2O51A 3N6TA 5L9SA 3ODBA 2I4BA 4LA9A 3MP1A 2DVCA 1PB7A 3N26A 3TTLA 5I59A 4EQBA 2D21A 1Z7NE 5L8DA 1B4ZA 2DWJA 1H76A 3W15C 1B5HA 2H4IA 1ZIUA 2QRYA 2Y7WA 4Q30B 4U1ZA 3FASA 1TXFA 3QYTA 3O6GA 4ELOA 2NVUB 4U21A 4KFQA 2PVUA 1AL3A 1D4NA 4MLVA 1I69A 2A5TA 3CFZA 1LFIA 2Z23A 2ZYNA 2Z8DA 4HCYA 2WKYA 1SW1A 1XOCA 2PMSA 3FJ7A 1MXWA 5CMBA 4OESA 1QUKA 2XXYA 5EHMA 2UVIA 1GTKA 2M8CA 5L9MA 3TTMA 2O1LA 3C33A 3G3KA 4EF2A 2DSFA 2Z8EA 1NNTA 1BTJA 3RYBA 5I2NB 2FNCA 3FV1A 1AH5A 3O6IA 1FTOA 2DE2A 5H8FA 4HCWA 4N6PA 4OERA 5HBCA 1B3LA 3U1OA 1Y4TA 3I5OA 2GFEA 2NXOA 4GRKA 4ESXA 2REJA 4ZZEA 4GWOA 5ITPA 2NWJA 3VVFA 4OYVA 4EXKA 4H65A 5CM6A 4ZEKA 1MG1A 3LR1A 1M5CA 3A3CA 3JYRA 3LUYA 3C9HA 5M2VA 3C36A 3TODA 3RT8A 5I2KA 5H8HA 1MXYA 1ZTYA 1UTBA 3FXQA 3RPWA 4ELRA 1A99A 3H6VA 4QFLA 1WVJA 1FTKA 1B3FA 1URSA 4H5GA 4H8IA 4NE4A 2I6EA 3TZAA 1MXZA 3KZGA 3MP6A 4ESWA 4NWDA 3R7XA 3N5LA 2XXQA 1OQHA 1MY1A 1JETA 2QSXA 3DRIA 1H45A 3VV5A 3KFMA 2I58A 5JTYB 5TPAB 3A09A 1UTHB 3KJ7A 2HFBA 3TDJA 3H6TA 3LSWA 3IK6B 5HM4B 4U1OA 5KDTB 3RYAA 2RC8A 2XX7A 5FHNA 3Q28A 4RY1A 1P1OA 1ZLQA 2QS4A 3GBAA 3T9UA 1MY4A 2YPNA 3ILTB 4RK9A 1LAGE 3HCQA 1XT8A 2Q2AA 4ND9A 5LOMA 2DXYA 2X7PA 4IO2A 4RNSA 5AA2D 2AIXA 5L9OA 4GL8A 3KOSA 3OO8A 4BDNA 2RINA 4FEDA 5ICQA 4ZEFA 5AA4A 1B9JA 3M3KA 3DELB 2DP8A 3E9XA 2HAUA 5H8SA 3DRKA 4R6KA 4RPNA 4KR5A 1NKXA 4OZ9A 2YLNA 4FE8A 1LBCA 2UVJA 1JNFA 3B6QA 5JK4A 5I84A 1DPEA 2Y84A 4EQ9A 1BIYA 3EQ1A 1B7ZA 1TFDA 1VE4A 2XXUA 4OWDA 2XXTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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