3T66A

Crystal structure of nickel abc transporter from bacillus halodurans
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
476
structure length
475
Chain Sequence
EKHIHFLFNVSTNSLDPHVDMTYIPVRAGITETLVRVDEENVTIAPWLAESWDSTDGQHWTIKLREDVTFQNGKEMDAEAVKASLERALDESVAIENALKIDEIEADGYTLHITTKEPFPEFISELVNPNVSIIDVTEEDFTNHPVGTGPFALESFTPGSKLELVRYDEYWDGASKLDSVTFSFNEDASARSLALESGQADIVYRPEVESIETLQANEGIMVEATETFRTHNLTMNLDRDSLKDVNVRRAVDVLLDRQEIVDTIMLGYAEVADGPFIPTLPFAPSYEKKETGTDIAIQYLEEAGYTLENQMQKDGEPLHFTVLTYGSRAELPLIAQVFQSNAKQIGIEVEIRQIEVPEEYMASNRDWDLITYSNVTSPRGDAGYYLNATYHPTGALNFSSVNDPELTGIIDELNRTVDQDVRAKLTEQAAAYIDEQKIHSFLIHPSAVVAYDENKVKNWVTTRSEYYMITNQLDV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of Nickel ABC transporter from Bacillus halodurans
rcsb
source organism Bacillus halodurans
molecule tags Transport protein
molecule keywords Nickel ABC transporter (Nickel-binding protein)
total genus 131
structure length 475
sequence length 476
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-07-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00496 SBP_bac_5 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 3t66A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t66A01
3GLBA 4YAHX 3H3GA 2HZKA 5TPAA 1A8FA 3QUFA 4F1VA 2D21A 3PD8A 4TLMB 4QHQA 4X48A 5DEXB 4G77A 5M2VA 4H65A 1BIYA 3KSXA 2QS4A 2XXHA 4U4SA 4ZEFA 4EQ7A 5AA3A 5I56B 1B6HA 3TAJA 4JWOA 3QAXA 2O1LA 2XXXA 3FVOA 3D4CA 3L6GA 3LBSA 2OBGA 3N6TA 2DYXA 1FQEA 4FEDA 3M8UA 3QSLA 4EXLA 5I56A 4GXSB 1PDAA 3IB0A 4IO4A 2PT2A 4ELOA 1XC1A 2QPQA 2REGA 5CMCA 4C1TA 1QJMA 3FVKA 4LP2B 1MQDA 1N3WA 2QS2A 1ZBMA 2VOZA 5F1QA 4H8JA 1S50A 1EU8A 1NH7A 3DRFA 3IR1A 1JETA 4OHNA 1MQIA 1A55A 3VXCA 1LFHA 4GQOA 2BJJX 1GV8A 1D3KA 1P1OA 3KGCA 1OQHA 5CM6A 4ZEBA 1B51A 3VFJA 3PU5A 4KYEA 1J1NA 2V3QA 3BFTA 2QSXA 2GHAA 5I84A 1FQDA 4DCYA 4F39A 4NTLA 4BDQA 1M5CA 3TTMA 4BDNA 3TFLA 1ZLQA 3K4UA 1A54A 5B7DA 1LB8A 1XT8A 2FNCA 2YLNA 2DWJA 1QUJA 3EHUA 2X7PA 3FJ7A 1Y4TA 5KDTA 4YMBA 1QW0A 1BKAA 5LOMA 3G3JA 3OO7A 3SEYA 4IO7A 1LLSA 2DVZA 2O51A 2B3BA 3JYRA 1N84A 3Q29A 1BP5A 1SW5A 2Y84A 3M3FA 3UORA 4DXBA 1PBQA 4DXUA 1B58A 3UP9A 2VP1A 1B7HA 4XKNA 1DMBA 3K6WA 1PB9A 2HXWA 3HCQA 3MZBA 4PP0A 5FTHA 1LCTA 4POXA 1DOTA 1Y3NA 2Q9TA 3HV1A 2WOLA 2UYFA 3DRIA 3C31A 2DWAA 4ONYA 1NKXA 1LBCA 3VLUA 3WAEA 5J1DA 2R9JA 3TTRA 1USYH 3S4UA 2B3FA 1R6ZA 4RK9A 3TDJA 3TELA 3FASA 1D9VA 3T93B 2F36A 1Y3QA 4XKPA 4K3FA 4ND9A 3G3HA 2OZZA 3MVZA 2HEUA 2FA7A 2I48A 3HPIA 4Q5TA 3I5OA 2ZYOA 1PB7A 3C33A 2HAVA 4OYVA 3T22A 3IOVA 4R2BA 4KCCA 4RJZA 1AOVA 1EZPA 3CHGA 1JW1A 4N6PA 3K1MA 4FORA 4NF4B 3KFMA 3PMXA 3MQ9A 4R6HA 4TOZA 1GGGA 4NE4A 4YB5A 3S9LC 4F3BA 4F3PA 5ICQA 4OESA 3MUQA 4NF4A 5DT6A 5BUUA 1R9LA 2Q89A 1IXCA 2R71A 1WDNA 2Z8EA 4U1ZA 3GXAA 3LSXA 2LAOA 3O9PA 1XS5A 3SEXA 1MH3A 3W9WA 2I4BA 2WOKA 1MG1A 4HCWA 3TQWA 3UN6A 1OLCA 3U92A 2F97A 2B4MA 1LGBC 4OETA 3PUZE 3FXUA 4R73A 1OQGA 4Q30B 5H8SA 5DYHA 3SKPA 4KD5A 2F8DA 1LSTA 1USYE 4G4PA 2A5SA 3RT6B 2RC7A 4TLLB 4R72A 4KI0E 4KHZE 4GF8A 2RINA 3C4MA 3ZKKA 3MPKA 4G8HA 1B52A 4PETA 2IEEA 2W7YA 5CMBA 1DPPA 1LCFA 1MY3A 1O63A 2VD3A 3EPEA 4GD5A 4I62A 1ZU0A 1B4HA 1B3EA 3G7WA 3O97A 3G3GA 5K2XA 3W9VA 3DELB 4DLDA 5DVIA 3PAMA 3BFUA 4BDRA 3TQLA 3L6HA 3PUVE 1N76A 4ZS9A 3IOTA 1MPCA 1OLAA 3FTOA 2DSFA 3K1NA 4YKKA 4QFOA 2H5YA 4G8MA 1PC3A 1MQGA 2QRYA 3FJMA 3QXMA 4XKRA 4QRZA 3Q28A 5TP9A 2PT1A 3BBRA 1OVBA 4QFPA 1JVXA 1UQWA 1TFAA 3EF7A 3CG1A 3RTFB 1FTOA 2NXOA 4YZZA 1LAHE 4X1BA 5I2NA 1M5BA 3FV2A 2F6PA 3PPRA 4GWOA 3TCHA 1SQYA 3ILUB 4H6DA 5AA2D 3E3KA 3CFXA 2H99A 4NWCA 1P1NA 3D4GA 1B7ZA 3W15C 2O7UA 4R75A 4DE8A 4GVOA 2YPNA 4FAJA 1P1QA 1MQHA 3KJ7A 1BTJA 4ELQA 2ZYMA 3M3KA 4DCXA 2PX1A 2ZXTA 3KN8A 3RYAA 2RC8A 4E0XA 1YTVA 1I6BA 3E4RA 1AIVA 4XKQA 4F31B 3OEKA 3TTNA 4PFYA 3S9MC 2G93A 1TFDA 1IXIA 1IEJA 3CR9A 4IGRA 3TODA 3R6UA 2Z8FA 1RYOA 2O69A 3RT8A 1IUDA 4UACA 3PUXE 4FJPA 3GZGA 4JWXA 1M5EA 3FATA 2O6AA 4QSCA 1EZOA 4F2OA 5A5XB 1ZTYA 2VGQA 4AQ4A 2ZNTA 4NMYA 4KPTA 2AIXA 1IZ1A 4LVQA 4F19A 3K02A 3HN0A 3O28A 1LFGA 4LZ7A 4DXCA 4ELRA 4ISUA 4F2QA 1MXYA 2DE3A 5HBCA 1WODA 4O3CA 3U94A 5EYFA 1B5IA 1MXXA 2DP8A 1PEBA 2Y7RA 4G8NA 3SEWA 1URSA 5B70A 4NF8B 3USDA 1B1HA 1FQBA 3SDFA 4P0GA 3IK6B 4MBPA 4NF5A 3OXNA 4OENA 3PPNA 1QULA 2HCAA 1O7TA 2R6GE 2VHAA 3IJXB 4NF8A 3HHFA 3RGYA 3U93A 3VDFA 2DWHA 4NF5B 4FECA 1QKBA 1MXWA 5I57A 4GOTA 3UK4A 1B05A 1GR2A 1H43A 2NUVA 2NWJA 2UYEA 4EUOA 3MVXA 3R26A 5I57B 1N7XA 1A7LA 3RUMA 2F7BA 3O29A 3N26A 1N3XA 3Q27A 5I59B 3OELA 1AMFA 1ELJA 2V84A 1URGA 2AL4A 4PFWA 3LVUA 2ANJA 2F7AA 2QMWA 1UIVA 3GBAA 3HSTA 3N5LA 2DXRA 2M8CA 2QS1A 3OD7A 5JTYB 5L9OA 3ILTB 3JZJA 3OSQA 2UVIA 3TYHA 2D3IA 1NNPA 1LAFE 3IOUA 1N7WA 3KEIA 4XTCQ 3UGWA 1YAEA 2GRVA 4Q8RA 4RK2A 5CMKA 5JTYA 1P1UA 4F1YA 3FGSA 1OVTA 1ZJLA 4KR5A 5TU0A 3KSJA 4WEDA 2XXWA 1ZIUA 4NWDA 3DRJA 3MVYA 3JV9A 3T9UA 3H6VA 1Y1ZA 3MC2A 1HSLA 4H1XA 4IO2A 4BDLA 3OMBA 3EQ1A 3G3IA 3TMGA 5AA2A 4ZECA 4MFIA 2XXVA 5H8FB 5BWJA 1LAXA 2DQVA 3FZVA 1OIBA 2XXUA 2I3VA 4F22A 4OEVA 2RKMA 5AA2B 3C36A 2H98A 3LSFB 4G68C 5HPQA 1DTGA 2HZLA 1OMPA 1LAGE 5H8HB 1NNKA 1TWYA 1JEVA 3CSBA 4L17A 1DTZA 1QUIA 3WAFA 3T96B 4YMAA 4XXUA 3PPPA 3TKDA 4GRKA 1FTMA 5TPAB 3FVNA 3P7IA 5AA1A 2F6GA 4FATA 2F5XA 1B2HA 3IORA 1SW2A 1SW1A 4RA1A 1H76A 1VFDA 4OMBA 1SD3A 4WEPA 2CZLA 2Y7IA 1Y4CA 2GFEA 3OO6A 4FE8A 4H67A 4LUBA 5FHOA 1JNFA 1US5A 2I3WA 2X7QA 3DRKA 5CRYA 3SEVA 3IX1A 4M4GA 5AE4A 4IY6A 4PFTA 1B9JA 2XXTA 4KQPA 1SI0A 3LSLA 1S7YA 2RCAA 5F7VA 3QUJA 4AB5A 1B32A 4ZE8A 4OVJA 5DEXA 2XXPA 4IGTA 3ODBA 3PPQA 1MXUA 5AA4A 3CRBA 3H03A 5DVFA 1YPNA 4HS7A 4E0WA 3K6XA 2XX9A 3E13X 2FYIA 3RTWB 2ESNA 2OK2A 4BDMA 4DDDA 1ATGA 1US4A 4RNSA 1B0HA 5AA4B 3BKIB 4HTGA 3KJTA 3I6VA 1B40A 3AXFA 1TT1A 4LZ5A 4X1DA 1URDA 4RPOA 1LFIA 3RQTA 2P2AA 5CI5A 4R9FA 4QSDA 3V8XB 1B3FA 4PE5B 1Y20A 2GHBA 3PUWE 5I58A 1ZMGA 4GL8A 2Z22A 3G3KA 4KCDA 1SW4A 5CC2A 3TCFA 5I58B 3T66A 1H3DA 1T0KA 1I6AA 1MY0A 3DLNA 2I4CA 1QKAA 3A3UA 4EQ9A 1POTA 3VE1B 2XD2A 4RY1A 1MRPA 2XXQA 4ZEDA 1F9BA 2B65A 2Z8DA 3ECRA 4U1OA 5L9MA 1MXVA 3V5AA 1FQFA 4ZZAA 1ZKBA 4JBZA 4OXVA 5DTBA 3CIJA 3FV1A 4IY5A 1JVYA 3K6UA 3KOTA 4ZZEA 4C1UA 4ZEKA 3TCGA 2PBWA 1MS7A 2E0SA 2XX7A 2G29A 3IB2A 2Y7PA 3HHGA 4WXJA 1SYHA 4G68B 5L8DA 4WKMA 2ABHA 2O1MA 1IXHA 4Z7EA 1MPBA 2E1SA 2ALUA 1MXZA 1P99A 1UTHA 3KZGA 4G68A 4HCYA 3SEUA 4EDPA 5KDTB 3IO4A 1B5HA 1B1XA 3LR1A 3PMVA 1MDP1 3K0VA 4U22A 4AB6A 1XVYA 4QFLA 1CB6A 2UVGA 4IO6A 4MH5A 4UA8A 1JW5A 3FVGA 3DM0A 1DSNA 5I2KB 4H8IA 3IOWA 4OFOA 3DP6A 3KOSA 2HQ0A 4LZ8A 1B3HA 3K2DA 5IKBA 2ZYKA 3MPLA 2F34A 2ZNUA 2A5TA 2Z23A 3FIRA 3ZSFA 2DVCA 2B4LA 4BLAA 1PB8A 3B6TA 4O3AA 1NFTA 3MP8A 4YU0A 5JEIA 1B3GA 3DRHA 1GTKA 1LB9A 2DE4A 2A5TB 2F7CA 2OWTA 2UVJA 3QIMA 4OFJA 1VR5A 5CBSA 1B0LA 3I3VA 3QK6A 1IITA 3H06B 4BDOA 3OOAA 1O64A 3FUZA 3O6GA 2OCUA 1UTBA 4U2RA 3TTLA 1MH4A 4OWDA 3VV5A 3H7MA 1XHYA 4POWA 1MY1A 3THIA 2QS3A 3FD3A 5FHNA 1QUKA 2Q2AA 2PVUA 3SERA 1VFEA 2NOOA 5EHMA 5H8FA 1Z7NE 4YKPA 3LUYA 3T9XB 4YKIA 4OERA 3Q25A 2PMSA 3VVFA 3KN7A 1RYXA 2UVHA 3VXBA 4F1UA 3OSRA 3PD9A 4H0WA 5H8HA 4ZDMA 3TUSA 1ANFA 2DOJA 5ISUA 2XXIA 5DVJA 3TTKA 1QVSA 3CFZA 2AL5A 3PPOA 2XX8A 2DXYA 4EQBA 4EF2A 4THIA 4YB6A 2IA4A 3RN8A 2I49A 2H9BA 3MP1A 4IO5A 4PQJA 2V3TA 4I1DA 3CFLA 4G2ZA 3OEMA 3SESA 3HO7A 1GVCA 4ESWA 3K6VA 3MZ1A 4OEUA 2O7IA 1FTLA 4KYDA 5EHSA 1JW4A 4JB7A 2AYSA 1NL5A 3O6HA 1Y9UA 3U1OA 2WOPA 2O68A 2Q2CA 4R6YA 3FJGA 2V93A 3IJOB 3KN3A 1MQJA 2OJTA 2X26A 3F11A 4JXIA 1L5TA 4R2FA 3IL1B 1POY1 2QJEA 1R9QA 3C9HA 3VLWA 3CVGA 4DZ1A 5I2NB 1IIWA 1A8EA 1I69A 3A3CA 3K00A 4RPNA 1H45A 1PBPA 4JDFA 4KYSA 4NF6B 3SETA 1II5A 2I6EA 3KBRA 4U4XA 5TP9B 4JWYA 2P0SA 3MBPA 4OTEA 1P1WA 3O6PA 2ONRA 2V25A 3OENA 2GH9A 2F35A 1BLFA 1RKMA 1TXFA 4NF6A 4NEDA 2Y7KA 4MLVA 4U23A 4Z0IA 4RYAA 4GLIA 1MPDA 3O2AA 5CBRA 2ONSA 5FTIA 4I9DA 2XXYA 1B4ZA 2HAUA 3T9HB 5ITPA 2REJA 3DP8A 1MDQA 1NNFA 3S9NC 5KZTA 1VSOA 1Q35A 4HW8A 2XXRA 3CG3A 1WVJA 1H44A 3MWBA 1D4NA 3S2VA 3U72A 2UXAA 1JQFA 3LC8A 2OLBA 2I58A 3PGFA 1Q1KA 1YCJA 4LATA 3VVEA 5JK4A 1DPEA 1A40A 2D5WA 1MY2A 4RXLA 4PFUA 3R7XA 3E9XA 3QYTA 1B3LA 2OWSA 3C35A 4ZEIA 1FTJA 1HSEA 1FQCA 2DE2A 3H6UA 3MJNA 4LONB 4MLQA 4Q0CA 1Y1MA 4U21A 4DIGA 5A5XA 3RY3A 3VLVA 2H25A 2WKYA 4LQ5A 4OZ9A 3IO6A 1M5FA 3T9VA 3VVDA 4EF1A 2RF1A 2Y7WA 5H8QB 4JSOA 1B5JA 1NNTA 2HFBA 4QSEA 5FHMA 3RPWA 3Q26A 4F3SA 2Q88A 2XHDA 5HM4B 1SBPA 3B6WA 4XIGQ 4F29A 4GFRA 2H4IA 3DP4A 3C34A 5H8QA 4C0RA 1SI1A 2P1SA 3N94A 5I2KA 3KG2A 4GL0A 4QFNA 5ITOA 1M5DA 2I0CA 5H8NB 1UTHB 4ELPA 1B7UA 4GIZA 2QL3A 3DRGA 3TPAA 3EHSA 3PV0E 4YICA 4ECFA 2NVUB 4YKJA 5I59A 5H8NA 1A99A 3MVWA 1MM7A 1S9TA 3H4ZA 4M1VA 3K01A 5ICTA 4P11A 2VD2A 3PMWA 2Q8JA 3S9EA 1FQAA 4IO3A 4FIMA 4R9GA 1VE4A 3B6QA 2CMOA 4O3BA 5IAIA 1FCKA 2ONKE 3ZS6A 1MM6A 1Z7ME 2ZNSA 3IAZA 3OO9A 3OO8A 1D9YA 3MW0A 1UTBB 1XVXA 3FXQA 1LBBA 1AL3A 4LA9A 4F18A 3A09A 4KFQA 1N04A 4I8CA 3V83A 4LQ2A 4X9TA 3H6TA 2O84X 1B46A 3N6UA 3IB1A 4P0IA 1FW0A 1NMUA 3V89B 1AH5A 4R74A 4GXAA 2YJPA 4MF3A 2PYYA 3MZ9A 3H6WA 2KLFA 4H5FA 3O66A 1KWHA 2V3UA 4QF9A 2DS9A 4YB7A 3U8QA 3EN3A 5K2YA 3EHTA 3ZKLA 3M3LA 4OFLA 1HSJA 3O6IA 1IQ7A 3G3FA 3FXRA 1N0TA 3K1PA 2XD3A 5L9SA 3CSGA 3RNNA 1SYIA 2ZYNA 1FTKA 1NH8A 4IB2A 4QFKA 4ZE9A 2F78A 2I0BA 4H5GA 4JSDA 4EXKA 3LSWA 3TEPA 2QMXA 1UIUA 3MP6A 1Y3PA 4N07A 1CE2A 4N13A 3ONMA 1EZ9A 5CMMA 1MY4A 5KCJB 1R1NA 1I6QA 5ELVA 3UIFA 4R6KA 3B7DA 3RLFE 3C32A 2DWIA 4TQUQ 3CI8A 2ZMBA 4OQOA 1IXGA 5KCJA 1SDXA 1SVXB 3GBBA 4FEBA 2THIA 3TZAA 4ESXA 1JEUA 1EH3A 3UA8A 2RC9A 4F3GA 3RYBA 3PUYE 2RCBA 1XOCA 3MAMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5TPAA 3PD8A 4X48A 2OX3A 3KSXA 1NV6A 4U4SA 3N6TA 3D4CA 1FQEA 4GXSB 3IB0A 2PT2A 4PDDA 4N8GA 1N3WA 2VOZA 1S50A 3DRFA 1JETA 4OHNA 3VXCA 4QXDA 2BJJX 4ZEBA 4OVRA 2MKZA 4KYEA 1J1NA 2QSXA 4F39A 4N15A 2PFZA 3TFLA 1ZLQA 1JP4A 1BK4A 5LDZA 2X7PA 1Y4TA 4NN3A 1NI9A 3OO7A 1N84A 1LCTA 1DOTA 1Y3NA 2L5VA 2WOLA 3C31A 2DWAA 4ONYA 1LBCA 4GX6A 3B8BA 3S4UA 1R6ZA 4RK9A 5DW8A 1D9VA 3T93B 2F36A 4ND9A 3HPIA 2ZYOA 3C33A 1PB7A 3IOVA 1JW1A 3K1MA 3PMXA 4F3PA 4NF4A 2Q89A 2R71A 3O9PA 3IFCA 3UN6A 1OLCA 1LGBC 3PUZE 3FXUA 1FPLA 4KD5A 1USYE 5ET6A 2PFYA 4TLLB 4R72A 4GF8A 1B52A 2IEEA 3LV0A 1O63A 3EPEA 2VD3A 1B4HA 3G3GA 3DELB 3BFUA 4BDRA 3IOTA 2DSFA 4QRZA 3QXMA 2PT1A 4OVSA 2F6PA 4H6DA 4N81A 3E3KA 2H99A 3D4GA 2O7UA 2YPNA 4FAJA 1P1QA 1MQHA 3A29A 3KJ7A 2ZYMA 3M3KA 4DCXA 4GX4A 4E0XA 4XKQA 1TFDA 1IXIA 1IEJA 1RDYA 1G0IA 1EZOA 1M5EA 1D9QA 1ZTYA 2VGQA 3ISPA 2AIXA 1K9ZA 4F2QA 4ISUA 5HBCA 4O3CA 4MNPA 1MXXA 2ZZVA 1FQBA 3IK6B 4MBPA 1QULA 2HCAA 1O7TA 5FBPA 2HXRA 3RGYA 3VDFA 1GR2A 2NWJA 4EUOA 5EQ7A 1N7XA 3RUMA 3O29A 2Q74A 3OELA 4PFWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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