3T66A

Crystal structure of nickel abc transporter from bacillus halodurans
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
476
structure length
475
Chain Sequence
EKHIHFLFNVSTNSLDPHVDMTYIPVRAGITETLVRVDEENVTIAPWLAESWDSTDGQHWTIKLREDVTFQNGKEMDAEAVKASLERALDESVAIENALKIDEIEADGYTLHITTKEPFPEFISELVNPNVSIIDVTEEDFTNHPVGTGPFALESFTPGSKLELVRYDEYWDGASKLDSVTFSFNEDASARSLALESGQADIVYRPEVESIETLQANEGIMVEATETFRTHNLTMNLDRDSLKDVNVRRAVDVLLDRQEIVDTIMLGYAEVADGPFIPTLPFAPSYEKKETGTDIAIQYLEEAGYTLENQMQKDGEPLHFTVLTYGSRAELPLIAQVFQSNAKQIGIEVEIRQIEVPEEYMASNRDWDLITYSNVTSPRGDAGYYLNATYHPTGALNFSSVNDPELTGIIDELNRTVDQDVRAKLTEQAAAYIDEQKIHSFLIHPSAVVAYDENKVKNWVTTRSEYYMITNQLDV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Nickel ABC transporter (Nickel-binding protein)
publication title Crystal structure of Nickel ABC transporter from Bacillus halodurans
rcsb
source organism Bacillus halodurans
molecule tags Transport protein
total genus 131
structure length 475
sequence length 476
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-07-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00496 SBP_bac_5 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 3t66A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t66A01
2O1LA 4GRKA 4ELOA 1B51A 1OMPA 2UVJA 2A5TA 1OVBA 5JTYB 4LUBA 1LBBA 3A09A 3VXCA 4NF8A 2I3VA 3H6VA 4YMBA 3UGWA 3RLFE 2W7YA 3QUJA 3OEKA 1QUJA 1URGA 1TFDA 2QMXA 1O7TA 1MQHA 4TOZA 1NMUA 3RTWB 2UYEA 1MXXA 2I58A 4MLVA 1GTKA 3A3CA 5BUUA 2G29A 3H6WA 4MLQA 5CMMA 4F31B 4EXKA 1SQYA 4I8CA 3LSFB 3HSTA 5DVJA 3G7WA 4OTEA 4QRZA 4C0RA 3O9PA 3RPWA 4ZEIA 3FIRA 1II5A 2B65A 3HV1A 4TLMB 3RQTA 2Y7PA 3TTKA 3T9VA 1D9YA 2HXWA 4OESA 3FGSA 4AQ4A 1B3GA 3QIMA 3IJXB 4EDPA 2IEEA 4ONYA 2DP8A 1WDNA 4ISUA 1N04A 3Q27A 1ZJLA 2GFEA 1DOTA 3U93A 3H3GA 3UP9A 3T93B 4OETA 1NNTA 3HO7A 1JVXA 4G68C 3UN6A 2ONSA 3W15C 3DRHA 4KHZE 2XXWA 4DIGA 4THIA 3KGCA 3TCGA 4XXUA 1CE2A 2WKYA 1QJMA 1QULA 4LZ5A 2ZYNA 3U72A 4XKQA 1URDA 2V3TA 3ZKLA 2G93A 3PPOA 4R73A 1N7WA 2Y7RA 5CMBA 1OIBA 1NL5A 3TTMA 4N07A 2LAOA 3VE1B 2OLBA 1R9QA 4XKPA 4OFLA 1EZOA 3N6TA 1MXYA 1LB8A 2Y7WA 2RCBA 1S9TA 2Z8FA 1XS5A 2DXYA 2H25A 5B70A 1Y4TA 1EZPA 3FASA 3CFXA 3U8QA 2P0SA 2O7IA 1IXIA 3K6VA 1AMFA 5J1DA 2VOZA 1QKBA 3TCHA 4PFTA 1J1NA 4PFYA 1FTOA 4X9TA 1POY1 3CRBA 4ZE8A 4R9FA 4ZEDA 1UTHA 1ELJA 1Z7ME 4NEDA 4R6HA 4Q8RA 3RY3A 4ESXA 3B6WA 3M8UA 3OELA 5DEXB 3OO6A 3TPAA 2HZKA 2XXVA 2GHAA 4QF9A 4PQJA 5A5XA 3PGFA 1I69A 2UVGA 5DYHA 5CM6A 4GFRA 3ZS6A 2AL5A 2ZYOA 1B2HA 1EH3A 2YLNA 4R6YA 3VLVA 4YB7A 3Q26A 1JEUA 1MXWA 1B7HA 2XXXA 2F7CA 1AH5A 4H1XA 2B3BA 5I57B 2ANJA 1MDQA 1MQDA 4NWCA 4ZDMA 4XKNA 1QUIA 1FQBA 1F9BA 2RC9A 2XXQA 2VD2A 3MZ1A 3R7XA 3EHSA 2ABHA 4IO3A 1MS7A 4I1DA 2DWJA 4P0GA 5BWJA 3H6TA 4O3BA 1MH3A 3QXMA 4OZ9A 1YPNA 1B05A 2I48A 4ESWA 2DVZA 3R26A 5KZTA 1FW0A 2A5TB 2XXHA 1B3EA 4QFLA 4POXA 1P1OA 2X7QA 2DE4A 2VHAA 1TWYA 4JB7A 1AL3A 1IEJA 3HN0A 1JVYA 2NOOA 2D3IA 1FCKA 1LSTA 4DXUA 1IQ7A 5F7VA 2UVHA 5K2YA 5FHNA 1FTKA 3VLWA 1M5BA 3RYAA 4N13A 3TFLA 2R71A 3KN8A 3K00A 1JW5A 1MXVA 1PB7A 5HPQA 1SW4A 5FHOA 5ICQA 4RK2A 3UA8A 1DSNA 3DM0A 3QUFA 3WAEA 1IZ1A 4LZ8A 1MQGA 1A40A 1MDP1 1B1HA 4OYVA 3E9XA 3HHGA 3IB2A 3IO6A 2D5WA 5AA2A 5L9OA 4GL8A 1A8EA 4EXLA 3HCQA 3VLUA 1Y1MA 3TELA 2PMSA 1BLFA 2Q9TA 4HTGA 3D4CA 4R2FA 5AA4A 3N26A 3KOTA 4RPOA 3ONMA 3PMXA 2KLFA 4DE8A 4HCWA 3M3LA 1MRPA 4H0WA 1B5HA 2PT1A 3VVDA 3IX1A 4NF6A 3OSQA 5CMCA 3TQWA 3G3FA 4LP2B 4JDFA 1FQAA 3KZGA 1QW0A 4QSDA 3S4UA 4G2ZA 5L8DA 1LAGE 1SI0A 2OWSA 2PBWA 2REGA 1SYHA 3KJ7A 4GL0A 4AB5A 2Q2CA 4AB6A 4LQ2A 5I59A 1MPCA 1B3LA 2VP1A 2DWAA 1S7YA 3LSLA 3TODA 2PVUA 2O7UA 5IAIA 2QS3A 1LB9A 1FTMA 5H8QA 1JW4A 2O84X 3ILTB 4RNSA 3G3JA 3TDJA 1IXHA 1B5JA 2YPNA 4HW8A 3LSWA 4Q0CA 4YB5A 4R72A 1PB8A 1Y4CA 4C1UA 4YU0A 3RNNA 1T0KA 4GVOA 2F7AA 2Y7KA 3K6WA 1Q35A 2Z23A 3CHGA 3C32A 1JQFA 1Q1KA 3PUVE 3FATA 1FQDA 4GD5A 1HSLA 1A8FA 4U23A 4OFOA 4KCDA 1UTHB 4DZ1A 5JK4A 3KSJA 3MQ9A 4NF4A 3TYHA 1Y3NA 2XXRA 5F1QA 4G68A 4F3BA 3K4UA 2B4LA 1MG1A 5A5XB 1UTBA 4G8NA 5FTHA 1ATGA 1FQFA 1A7LA 3PAMA 4OWDA 2F7BA 4ZEFA 2ALUA 4GLIA 3V5AA 4U1ZA 3FVNA 2YJPA 3O6PA 3SKPA 3I3VA 2E0SA 5CBSA 3CFZA 5M2VA 4POWA 3IOVA 5KCJA 2DXRA 2XX8A 2NWJA 4U21A 3PV0E 3OXNA 4EQ7A 2ZXTA 3EF7A 5FHMA 3IOUA 1GV8A 4LATA 3L6HA 1B5IA 3PUXE 2ZNTA 4DXBA 1LFHA 2QMWA 2QS2A 2ONRA 1US5A 2OWTA 3ECRA 4TLLB 5ICTA 4NMYA 1IITA 4M1VA 3S9NC 3MW0A 3DRFA 1N3WA 1Y3PA 2DE3A 3IOTA 2Q88A 1XOCA 4Z0IA 4C1TA 1JNFA 3T9UA 3TTLA 4TQUQ 3MJNA 1DTGA 3HHFA 1EZ9A 3TQLA 1US4A 4ZEKA 2R9JA 4OERA 1SW1A 2HFBA 4BDRA 4NF5A 4WKMA 2H98A 3H7MA 3T96B 1QUKA 3ZKKA 5H8NA 3S9EA 5FTIA 1Z7NE 4H8IA 4KYDA 4F2OA 3MAMA 2NVUB 1QVSA 3MBPA 3PPNA 2CZLA 3C4MA 1MPBA 4QFKA 3C33A 4L17A 2M8CA 1NNPA 4YKIA 3TMGA 4EQBA 2CMOA 3LBSA 3C34A 4R74A 3U92A 4F1YA 3T66A 2QRYA 3IL1B 2O1MA 3H06B 2AYSA 4RK9A 1I6AA 3JYRA 3SEUA 1ZU0A 4R6KA 1PBQA 2HQ0A 4N6PA 2QS4A 4KR5A 4H67A 3PUYE 5H8HA 3OENA 3RUMA 3B6TA 4JSDA 4U2RA 2E1SA 3T9HB 1USYE 1MY0A 4IB2A 3O97A 4R2BA 3T22A 1LFIA 3OMBA 5AA2B 1KWHA 3K6XA 4KYEA 3CI8A 1SBPA 2V3UA 1D4NA 4YB6A 3VVFA 2QL3A 2DE2A 4MF3A 3PMVA 4FAJA 4LONB 3B7DA 2X7PA 2PT2A 3TKDA 2OJTA 4H5FA 1VFDA 4XKRA 4M4GA 1JETA 5AA4B 3CSGA 4KQPA 4GOTA 3G3GA 3LUYA 3I6VA 1XT8A 5AA3A 4WEDA 3E13X 4YAHX 1D9VA 1LAXA 4QFNA 1A55A 3PD9A 1BIYA 3F11A 2DVCA 4NF6B 4FECA 2O6AA 1GGGA 2B4MA 1P1UA 4NWDA 3CR9A 4IO5A 4Q30B 1IXGA 1AOVA 1N76A 4Z7EA 1L5TA 3IO4A 1RKMA 3K6UA 3PD8A 1D3KA 1R9LA 1SYIA 3SESA 4DCYA 3DRKA 3OOAA 3HPIA 2OBGA 3VV5A 3Q25A 2F6GA 3IJOB 2AIXA 5I59B 4OMBA 4U4XA 5TP9A 4F1VA 1B0LA 1YTVA 5HM4B 2HAUA 4FIMA 4BDOA 4OXVA 2XX7A 3CIJA 3V83A 3VXBA 4F22A 1H44A 4G8MA 3IB0A 2X26A 5EHSA 4PP0A 3LSXA 3TUSA 3O6GA 1O64A 5H8QB 2RCAA 3CFLA 3S2VA 4U4SA 5I2NA 4ZZAA 2F36A 3FUZA 3M3KA 2H5YA 1WVJA 5I56A 2PYYA 4G77A 1LLSA 4LZ7A 4H8JA 4BDMA 4LA9A 2ESNA 2GRVA 2VD3A 4P11A 2ZNSA 3I5OA 3SETA 3BFUA 3UIFA 2F35A 1XC1A 3KN7A 4MBPA 1ANFA 3IORA 4ELPA 3C9HA 4NF4B 3MZBA 4G68B 3FZVA 4LVQA 4GF8A 3MP8A 2RC8A 3CG3A 3VDFA 1N3XA 4F29A 1BTJA 1BKAA 2QPQA 4DCXA 1OQGA 4F1UA 1UTBB 2Z8DA 3DRIA 3PPQA 1MH4A 3K1MA 3FTOA 4I9DA 3U1OA 4IY6A 3TAJA 2DYXA 1B46A 1VE4A 2XXUA 2H99A 1VSOA 3DP4A 4UA8A 2GH9A 4KCCA 1HSEA 5KCJB 3QK6A 3FXQA 3N94A 1TT1A 1M5FA 1MM6A 1AIVA 1LAFE 3K0VA 4YKPA 1OVTA 1XVXA 1MY3A 2FNCA 3KEIA 5AA2D 1B7UA 4IO4A 1NKXA 5CRYA 2HZLA 2O68A 3G3KA 4F18A 1QKAA 3W9VA 4U22A 2FYIA 3SEVA 2RKMA 1H45A 4FE8A 4IGTA 1P1NA 2HAVA 4F39A 5EYFA 4NF5B 2V93A 3T9XB 1MY2A 1P1WA 3CSBA 3R6UA 5TPAA 1XHYA 3EPEA 4ZECA 5H8NB 2Y7IA 1CB6A 1PBPA 2RF1A 4BLAA 5ITOA 1PEBA 1OLAA 5B7DA 3TCFA 2WOKA 3S9MC 1LAHE 1TFAA 3KBRA 3O6HA 3PPRA 2Z22A 1UIVA 3O29A 2P2AA 4EUOA 1SI1A 4RA1A 1R6ZA 4P0IA 4X48A 1FTJA 3IOWA 3K2DA 1B32A 2H9BA 5AE4A 5KDTA 1EU8A 2F5XA 1A54A 4OQOA 3O28A 2I6EA 3RGYA 3S9LC 3RT6B 3K01A 3MZ9A 2DWIA 5H8HB 3O66A 1NFTA 3IR1A 1URSA 1B3FA 3H6UA 2I4BA 4KI0E 2I4CA 2ZMBA 4BDLA 5I58A 1LBCA 1B9JA 1YCJA 2UVIA 1B3HA 3D4GA 3FVGA 2I0CA 4ND9A 1UQWA 2NUVA 5L9SA 3TZAA 3C31A 4YICA 3KN3A 1SW5A 4X1BA 3Q29A 3ZSFA 2D21A 4JWOA 4F2QA 4H6DA 4F3PA 4IY5A 1Y3QA 2I49A 3OEMA 1Y1ZA 2REJA 4YZZA 3SEYA 1Y9UA 3BFTA 2IA4A 2XXYA 4G4PA 2WOLA 4PFUA 1JEVA 3H03A 1OLCA 4IO2A 2AL4A 4X1DA 4QSCA 2XXTA 4JXIA 3TTRA 1DMBA 4KPTA 2NXOA 3KOSA 2XD3A 4HCYA 2I3WA 3B6QA 1LCFA 5TP9B 2DOJA 1SD3A 2UYFA 3OD7A 2DS9A 3MPKA 4JWYA 1XVYA 3N5LA 3RN8A 5DVFA 4NTLA 5ITPA 1PDAA 3CVGA 3O2AA 2H4IA 3DP8A 3JV9A 3OSRA 5K2XA 3A3UA 5I2NB 3BBRA 5I2KA 4JBZA 3VFJA 2O69A 5I56B 1MPDA 3M3FA 1ZTYA 4F3SA 4QFOA 2B3FA 1RYOA 4G8HA 1B7ZA 1A99A 3SEWA 1LGBC 2DSFA 3FXUA 4RJZA 1ZMGA 3UORA 4R9GA 3FV2A 1ZIUA 3MP1A 1M5EA 2HEUA 4GIZA 4U1OA 2V25A 1I6QA 1OQHA 3GBBA 3JZJA 1MM7A 4FATA 2DQVA 3PU5A 2THIA 1IXCA 2R6GE 3EHTA 5ISUA 1FQEA 3K1NA 3Q28A 1DTZA 4HS7A 4KYSA 4ZZEA 4OVJA 3K02A 4RPNA 4GXSB 3KG2A 5H8FA 5CC2A 3N6UA 3MVXA 3VVEA 4ELRA 2BJJX 3FD3A 2F97A 4ZEBA 1B58A 5TU0A 2FA7A 3FVKA 1MQIA 2XXIA 4BDQA 1MXUA 4K3FA 4RY1A 5JTYA 3O6IA 3GZGA 3QAXA 4XTCQ 1NH7A 4DDDA 4E0XA 1MY4A 3E4RA 3MWBA 1H43A 2F8DA 3V89B 3L6GA 4YMAA 1M5DA 3H4ZA 4YKJA 5L9MA 4E0WA 1NNKA 4QHQA 3OO9A 3RTFB 4F19A 5ELVA 1NH8A 5JEIA 3FV1A 3IK6B 3U94A 5CBRA 1SDXA 3FJ7A 4DLDA 1VR5A 3SERA 3MVYA 2Q89A 2OZZA 3AXFA 4OHNA 4BDNA 5H8SA 1LCTA 3P7IA 4XIGQ 5TPAB 1ZKBA 4JWXA 2DWHA 4IGRA 4FEDA 4OFJA 1UIUA 4NE4A 1N0TA 4ZS9A 5LOMA 2V84A 3SEXA 3RYBA 3DELB 3IB1A 1B1XA 4KD5A 5DTBA 2P1SA 1B4ZA 3BKIB 2RINA 4H5GA 3PMWA 3FJMA 4F3GA 3KJTA 2XXPA 4ZE9A 3EQ1A 4RYAA 1BP5A 4ELQA 1B52A 3V8XB 1MXZA 4I62A 4DXCA 3MP6A 5DVIA 5KDTB 3DRGA 1JW1A 5IKBA 2A5SA 1S50A 2VGQA 5CMKA 3MUQA 1I6BA 3UK4A 4GWOA 1PC3A 1DPPA 3LR1A 1MY1A 5I84A 1USYH 2ZNUA 3KSXA 4PFWA 4PE5B 1HSJA 5I58B 3ILUB 4OENA 1DPEA 2I0BA 5AA1A 4NF8B 3GXAA 1YAEA 4GXAA 1H76A 4O3AA 4KFQA 2Q2AA 4RXLA 1M5CA 4QFPA 3DLNA 1N7XA 4H65A 2PX1A 1TXFA 3LC8A 4OEUA 1FTLA 2RC7A 4JSOA 1SW2A 3SDFA 1WODA 2QS1A 3MVZA 4GQOA 1ZBMA 5HBCA 4MH5A 2XX9A 3CG1A 2QSXA 2F78A 1MQJA 1B40A 2WOPA 1GVCA 3LVUA 3EHUA 2OCUA 3C36A 4EQ9A 1Y20A 1LFGA 3OO7A 3K1PA 1B6HA 2ONKE 3MC2A 1O63A 3DP6A 5EHMA 2GHBA 4MFIA 2ZYKA 1PB9A 2Z8EA 3OO8A 3QSLA 1GR2A 5DEXA 3FXRA 3E3KA 3TEPA 2F34A 3IAZA 4R75A 5DT6A 1FQCA 4FEBA 4OEVA 2Y84A 4PETA 3THIA 3GBAA 3C35A 4LQ5A 5I2KB 1B4HA 1RYXA 3DRJA 4QSEA 3MVWA 4EF2A 4WXJA 3W9WA 2XHDA 3PUZE 3TTNA 3EN3A 1IIWA 1N84A 2HCAA 2F6PA 3GLBA 3FJGA 3FVOA 3QYTA 4EF1A 3KFMA 2ZYMA 5I57A 2V3QA 1VFEA 1NNFA 3PUWE 1IUDA 2XD2A 2Q8JA 1SVXB 3ODBA 5CI5A 4Q5TA 4ECFA 2O51A 1POTA 3G3HA 1P99A 4FJPA 4FORA 4IO7A 1B0HA 1ZLQA 4IO6A 3G3IA 3WAFA 5H8FB 1H3DA 3RT8A 4UACA 4YKKA 2UXAA 2OK2A 3PPPA 3MPLA 1P1QA 3USDA 1R1NA 4O3CA 4WEPA 2QJEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O1LA 4GRKA 4ELOA 1B51A 1OMPA 1YXIA 2UVJA 2A5TA 4GWSA 1FJ6A 4HE2A 1OVBA 5JTYB 4LUBA 1LBBA 3T0JA 3A09A 3VXCA 4NF8A 2I3VA 1NUZA 3H6VA 4YMBA 3UGWA 3RLFE 2W7YA 3ISPA 3QUJA 3OEKA 1QUJA 1URGA 1TFDA 2QMXA 1O7TA 1MQHA 4TOZA 4PE3A 1NMUA 3RTWB 2UYEA 1MXXA 2I58A 4MLVA 1GTKA 3A3CA 5BUUA 2G29A 3H6WA 4MLQA 4MJOA 5CMMA 4F31B 4EXKA 1SQYA 4I8CA 3LSFB 3HSTA 5DVJA 3G7WA 4OTEA 4QRZA 4C0RA 3O9PA 2GQ1A 3RPWA 4ZEIA 3FIRA 3LV0A 1II5A 2B65A 3HV1A 4TLMB 3RQTA 5IZ3A 2Y7PA 3TTKA 4MAGA 1LBXA 3T9VA 1D9YA 2HXWA 1RDYA 4OESA 1EYKA 3FGSA 4AQ4A 4I3YA 1B3GA 3QIMA 5I5PA 1RDZA 3IJXB 4EDPA 2IEEA 4ONYA 2DP8A 1WDNA 4ISUA 1N04A 3KC0A 3Q27A 4X8RA 1ZJLA 4UABA 2GFEA 1DOTA 3U93A 4XFEA 3H3GA 4PAKA 3UP9A 3T93B 4OETA 4NF0A 1NNTA 3HO7A 1JVXA 4G68C 5DW8A 3UN6A 2ONSA 3W15C 5I3SA 3DRHA 1YYZA 4KHZE 2XXWA 4DIGA 4THIA 3KGCA 3TCGA 4XXUA 2CEXA 1CE2A 2WKYA 1QJMA 1QULA 4LZ5A 5IGAA 2ZYNA 1YZ0A 3BIGA 3U72A 4XKQA 1URDA 2XWVA 2V3TA 3ZKLA 1NV6A 1NV3A 5IZ1A 2G93A 3PPOA 4R73A 5ESYA 1N7WA 1QGXA 2Y7RA 5CMBA 1OIBA 5ET7A 1NL5A 3TTMA 5ET8A 4N07A 2FVZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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