3T7QA

Endothiapepsin in complex with an inhibitor based on the gewald reaction
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Endothiapepsin
publication title Endothiapepsin in complex with an inhibitor based on the Gewald reaction
rcsb
total genus 86
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2011-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t7qA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t7qA01
2QI4A 4GJDA 5AHCA 4Y3SA 3SM1A 4ER4E 3SAAA 2WF0A 4YCTA 5P60A 3GW5A 4Z2ZA 4R95A 2BPYA 3LZUA 1QBUA 2WL0A 5OZQA 5P3JA 2NXMA 2WEAA 5P3FA 3TKWA 2I4DA 1B6KA 5ISKA 5P4UA 3VV6A 5P6XA 3T7XA 4RZ1A 5HD0A 1BXOA 2PYNA 5P7KA 5P2BA 1T6GA 4Y3GA 5FIVA 2ZHRA 3KM4A 5P1JA 4DJWA 2PYMA 1D4KA 2HB2A 1SMRA 5HDUA 3TPJA 5P13A 5P5EA 4L7GA 5OZVA 2RSPA 5P2MA 1K2CA 3VYFA 2QMFA 3VFAA 4CPQA 1F7AA 5P1WA 4EPJA 8HVPA 2HPFA 3I25A 3OQKA 5P1ZA 2HAHA 3KMXA 3OWNA 5P0AA 5SY3A 5OZAA 1EPPE 1YT9A 2WEZA 2O4SA 1B11A 3LZSA 1D4LA 4YDFA 1PPME 2XYFA 1LYBA 4D85A 3LIQA 5P4YA 3NLSA 1HEFE 2FMBA 5P5HA 4I0HA 4OD9B 1YTHA 5P8MA 5P4LA 5P3RA 4Y38A 5P5DA 1FQ5A 3PSUA 1XN3A 3VLBA 3D20A 5P7IA 4RVIA 3PBZA 5P5IA 2QHYA 4B1EA 2P3CA 5OZKA 6UPJA 4DH6A 1ZSRA 1HSGA 5P81A 2FXDA 5P8EA 1WBMA 5OZ4A 5OZSA 1UH7A 1MUIA 4CPWA 5DPZA 3R2FA 1ER8E 4YA8A 4ER1E 5P6ZA 3VFBA 3Q6YA 4KE0A 2I0DA 3QPJA 2BPWA 4I0GA 4RCDA 5P0JA 3SA4A 5HE7A 5P3XA 3NWQA 1AJVA 2QK5A 4GYEA 4H1EA 1DAZC 5P71A 2WJOA 3TOFA 4EJDA 5KQXA 2ZHTA 4K4PA 2VNMA 2QI3A 2NMZA 4CPTA 4DQGA 2AOEA 1MIQA 4Y58A 3NUOA 1SDVA 4Y50A 5F01A 4OBDA 5P73A 1E82E 2UXZA 2BKTA 3UDHA 4EXGA 3QN8A 5P7AA 5OZHA 5P1GA 3OU4A 5OZ2A 3FNTA 1FQ4A 4D89A 5P7UA 5KOSA 3OOZA 3TLHA 5P1VA 4RCEA 4K4RA 5P58A 5B18A 4AA8A 1TSQA 4F75A 5P5XA 3MSKA 5F00A 3KDDA 4NJTA 5HDXA 5P7YA 5P0EA 5P3BA 5OZTA 1NPAA 4B05A 3G6ZA 2O4KA 3OQ7A 5OZRA 2QI1A 3ZKQA 3SLZA 1LF2A 1VIJA 2B7ZA 4GMIA 4MC1A 1META 5P36A 5DR4A 3QRSA 2EWYA 4XXSA 5P4ZA 5OZJA 4AUCA 1EBYA 5UPJA 2HS2A 4Y3AA 4FLGA 1MPPA 1XE5A 4Y4WA 1LEEA 5P0MA 3NYGA 3O9AA 4ZPGA 4IVSA 2Q64A 1BDRA 1XL2A 4OBHA 2Q55A 4PYVA 3QAAA 1G2KA 4YD5A 1W51A 4R91A 2NNKA 5OZWA 5P4QA 4Y4ZA 3ZPSA 5OZ6A 4DPIA 5P51A 1HVHA 1ZBGA 4FM8A 5OYWA 5P7SA 1CZIE 5DGUA 3RSXA 3NU3A 3ZKMA 5P8OA 5P83A 1KJ7A 4X2LA 5OZ3A 4R93A 2QP8A 1DW6C 3M9FA 1HRNA 3WB5A 5P7ZA 3UDQA 3OAGB 1PPLE 3FV3A 2RKGA 6APRE 2Z54A 4Y3MA 3ZOVA 4ACXA 4J54A 1HVLA 4GJ7A 3EM6A 4PPHA 5P53A 5P7QA 4RYGA 3NU4A 5P2LA 2QZLA 5P2SA 2RMPA 3I7EA 1U8GA 2ZJKA 5P41A 5IVTA 2CENA 3PSYA 4YE3A 2R8NA 1EPNE 1BIMA 4Y43A 1BDQA 2G27A 5P8BA 3RSVA 4FSLA 1EPOE 4ZSPA 4HA5A 3UDKA 3VF5A 4J1CA 5P8QA 4HZTA 1APTE 1J71A 5P87A 2PWRA 5P04A 4JECA 5P0HA 3HVGA 5P3UA 2VKMA 5JG1A 3PBDA 1ZPAA 4GJ5A 3RU1A 3HBOA 3PB5A 3DV1A 1XL5A 3K4VA 5P38A 4KUPA 3H0BA 5P0BA 2CEJA 2ZJHA 4GJ9A 5OYSA 2A1EA 3IN3A 1MVPA 4Y5LA 4NKKA 4Q5MA 3Q3TA 2ZJMA 5P0NA 5BWYA 2NR6A 4DJOA 4OBZA 5P02A 3IXOA 5P70A 3K1WA 3EBZA 5P5LA 3ZPTA 5P75A 1HPOA 1QRPE 1LF4A 4CKUA 5P4KA 1NSOA 4YBFA 1LYWA 5P8HA 2I4XA 5P4DA 5OZ8A 3FX5A 5OYVA 2Z4OA 3KDBA 5P4WA 1TQFA 4Y4AA 5P2OA 1APWE 5P61A 4YCYA 2VNNA 3QS1A 1DIFA 2UPJA 5P4OA 4I0FA 4Y48A 2AZ9A 5P8VA 3IXJA 3SA3A 3UQUA 3R1GB 3O9FA 2OHMA 3DK1A 2P3BB 4RVJA 5P6CA 5P5OA 3VLAA 4Y5PA 5P2QA 3IVHA 5P2WA 3FNUA 2VJ9A 2OHPA 3GI4A 5P46A 4GJBA 1MT7A 1APVE 3IN4A 4ZSRA 1D4JA 1W5WA 3OXVA 2PWCA 2VIZA 3UDRA 3OGQA 1FMBA 3OADB 1FG6C 5P5WA 3L5EA 1T7JA 4NJUA 2FGVA 4CPSA 2NXLA 2PH8A 4RGHA 5APRE 3CYWA 3EL5A 5P3ZA 5SY2A 3VYDA 4FRKA 3L5BA 5P78A 4Y3HA 4CPUA 5P72A 3UDNA 3MSLA 2OHSA 2PSVA 1SBGA 5P5MA 1AZ5A 3HDKA 1AVFA 4DQEA 4X7IA 1D4IA 3CMSA 2VJ7A 2IRZA 3O9CA 1AJXA 4DJYA 1MRXA 3EKWA 4UPJA 1FB7A 3INEA 1MT9A 5P4CA 3KFPA 5P1RA 2AOIA 1IBQA 2Q11A 4Y4XA 4J17A 1B6MA 3TL9A 2O4PA 4DJQA 2R5PA 5P6OA 3K4VC 3ZLQA 1Q9PA 5P49A 4R92A 5P5RA 4DJPA 1YM4A 5P57A 3OGPA 3D1XA 1MRWA 4RVXA 4WY6A 5P2CA 2WF3A 3QI1A 5OZPA 2ER9E 3FIVA 1ZJ7A 1NH0A 4N00A 2MIPA 2PSGA 2QU2A 1GNNA 5P7TA 5OZ0A 1M0BA 5IVQA 4LXMA 2H6TA 4EQ0A 5P43A 1HEGE 1GVTA 4EQJA 2G94A 1HXBA 5DGWA 2AOGA 1DPJA 5P80A 5P40A 5P62A 4DQFA 1LYAB 5EZXA 1FLHA 1F34A 2F3EA 1HSHA 5DQ5A 2WKZA 4HDFA 1GVWA 5OZMA 4DV9A 2QNQA 1C6ZA 4DJVA 4QJ7A 2V11C 5I3XA 4YD7A 2P3AA 1ZPKA 5P09A 4AA9A 3NDWA 2B8VA 5P17A 5P55A 4GJAA 3O9LB 4I11A 2Q5KA 5HU0A 3ER3E 1KJ4A 5P85A 1E5OE 1ZP8A 2UY0A 2IEOA 1HTGA 5P12A 1MSNA 5P3MA 5I70A 3EL4A 1LYBB 4RROA 5P0KA 5P20A 3EKYA 3UPJA 1B6JA 3H5BA 5P42A 3R4BA 5KR0A 5P8RA 4Y45A 5P7FA 4MC9A 5OZGA 3GI6A 5P0UA 4FRJA 2QNNA 5P7BA 4OC6A 4EP2A 5P1QA 3EKQA 3WSJA 5HDVA 3RTHA 5COPA 1FG8C 3NU5A 2O4LA 2AZ8A 3LZVA 4Z4XA 1MESA 1Z1RA 2ZGAA 4L1AA 4I0DA 3VSWA 5OZ1A 4Y36A 4I1CA 3O9DA 1ZAPA 4EJLA 1EC1A 1HVJA 1ME6A 4Y3TA 4Y4BA 4PZXA 5P2FA 4Y44A 2OHLA 5P19A 1DMPA 4EYRA 4J1KA 2Q15A 4Y3PA 3KF0A 5P1HA 5P6QA 4TRYA 5P1KA 4I0EA 1EBZA 2SAMA 2R9BA 5P8GA 5P7JA 4J0YA 3BVBA 4LXAA 1KJHA 5BRYA 2VJ6A 5AH6A 1K2BA 5P5KA 4LBTA 2B7FA 3PWMA 3FKTA 5P7XA 3ZKNA 1SMEA 2B42A 5P7LA 5P24A 5P2XA 3A2OA 1HTFA 3S43A 4Y5EA 3OXWA 5I3WA 1JLDA 1G0VA 5P3DA 3OU1B 4EJKA 1BVGA 3HAWA 1W5VA 3OQAA 2HPEA 2FDDA 4YHQA 3D1YA 1AIDA 2IQGA 3OU4B 5P34A 5P1MA 5P8LA 3L58A 2QCIA 3DV5A 3L5DA 4F74A 3GGAA 3NU9A 3QIHA 5P01A 3PI5A 3BUGA 5P4GA 3KDCA 4CP7A 5OZCA 1Z8CA 4Y3LA 1TCXA 4TVGA 3WZ6A 5P4BA 3LPJA 4J55A 3G70A 3S2OA 5P37A 3LPIA 4Y57A 1HIHA 4J1FA 4HE9A 5P16A 3UDJA 3LHGA 5P10A 5DQCA 4QJAA 3LIXA 2QI5A 4Y5AA 1HIVA 2NTRA 4I0IA 4FSEA 4KE1A 1OHRA 5P6JA 3UQXA 2QHCA 1WKRA 4JPEA 4Y5KA 2FXEA 1Z1HA 1BWBA 3O99A 4Y4TA 5P8TA 4R8YA 2QI6A 2B8LA 3JW2A 4DQHA 4WTUA 4B1CA 4AZYA 5DQ1A 4HEGA 2HC0A 1FQ7A 1ODXA 2F80A 3AIDA 5P8AA 2ZJIA 4FRIA 1EPRE 4ZPFA 1HVSA 1T7KA 5P6PA 3T3CA 5P3KA 3NXEA 5AH7A 1A8KA 5P0TA 1FEJC 3TH9A 3I6OA 1SGZA 7HVPA 1HTEA 3PEPA 2H6SA 3I8WA 2QD8A 1TW7A 2PSUA 1PSNA 5DR0A 2OF0A 2I4VA 2V12C 3O9BA 2AVOA 3MWSA 3DCRA 3SM2A 3D1ZA 3DJKA 4Y5GA 5P3HA 1IZDA 3KYRA 3EKTA 3OU3A 3CIBA 5P0CA 3CKRA 5P7WA 3URJA 3HW1A 2G69A 4EWOA 5P76A 3PMYA 4DJRA 3ZKIA 4Y41A 1LZQA 5OZ9A 4OD9A 1T3RA 5P44A 4S1GA 4XKXA 5P4FA 5P5GA 4Y4EA 3URLA 1K6TA 5P03A 5P08A 3SPKA 4Y5CA 3PJ6A 5P6IA 5P4HA 4FGXA 5P1LA 3NWXA 1T6EX 5P0RA 2IS0A 4BFDA 2PH6A 4H3FA 5ER2E 3BXSA 5OZZA 2QNPA 3SFCA 4GIDA 4TVHA 1HPXA 5P0VA 5P74A 5BS4A 3FNSA 2ZHVA 2WF2A 1SIVA 5P67A 5P0PA 2JYSA 4FCOA 5P8KA 5COOA 5P1BA 5P8IA 1NPVA 1HHPA 1D4HA 3EC0A 4YOAA 5IE1A 3CICA 4Y3EA 3TPLA 1MTRA 1WBKA 3OXXA 3HVPA 3INDA 4PEPA 5OYTA 5P1SA 4FL8A 1LS5A 5P0LA 2G1NA 1ODYA 2J9JA 4I0JA 5IS4A 5P0OA 4CPXA 4H3IA 3PGIA 3S56A 4XX4A 5P2EA 5P2GA 1FGCC 5OZBA 2QI7A 3QRMA 2I4WA 4D83A 3B7VA 5P4MA 1D4SA 3EL9A 5ENMA 5P86A 5HVPA 4J0ZA 3U7SA 3WZ8A 1TZSA 4RYCA 3L5CA 3EM3A 3SKGA 5P15A 4LAPA 3GGXA 4KB9A 5E5JA 5P0YA 5P3YA 5HU1A 5JFPA 5P3CA 3LIZA 4IVTA 4Z50A 1SGUA 2Q63A 3EMYA 5P4XA 1GVVA 2WEBA 4Q1YA 2I4QA 2PK6A 5C9BA 5P1PA 3R0YA 7UPJA 3L59A 1HBVA 2HB4A 5P5NA 3OTSA 4YCKA 5P1IA 1B5FA 3BXRA 4L7HA 4Y4UA 4Y3JA 3NU6A 5JFUA 1VIKA 3CYXA 1FFIC 2R43A 3CIDA 3SO9A 1APUE 3MSJA 3RTNA 3OQFA 4FAEA 1DP5A 5P7OA 5OYRA 2V13A 1BXQA 1T7IA 5P7MA 3BC4A 4B78A 5P4NA 2WECA 3KN0A 5P1EA 2WF1A 3NXNA 4YBIA 5OZ5A 5P1TA 5P2JA 1G6LA 5DQ2A 5P6LA 4Y3XA 5P1OA 4OBJA 1QDMA 5P0IA 2ZJLA 5P4EA 4FM7A 4EXHA 2O40A 4JOOA 4A6BA 3EL0A 2HS1A 2V0ZC 2QZXA 4K9HA 1A94A 3TPRA 5OZLA 5KQYA 3C9XA 1HVIA 4XX3A 5P88A 5P3AA 5OZ7A 5P69A 5P59A 2QMGA 3OAGA 5P32A 1SP5A 2HM1A 1MTBA 2ZYEA 3S7LA 1IZIA 3UHLA 2APRA 5P3OA 3KFNA 3AUPA 3LINA 1FKNA 1HOSA 2OHRA 3S54A 4B0QA 4Y5BA 2G1OA 1CMSA 4L6BA 4Y3WA 3OHHA 2R3TA 2AOJA 3LZYA 1KJGA 5KAOA 1NPWA 3ER5E 4WY1A 1TSUA 3TNEA 5P29A 3VEUA 1KZKA 1SH9A 2QZWA 1IVQA 4DFGA 5P3QA 4I8WA 4MC6A 1CPIA 2P3DA 4HVPA 3S8IA 1ENTE 1MT8A 3L5FA 1QBRA 3IVIA 5P3TA 5P4RA 4FM6A 1HVCA 4RCFA 4Q1WA 3UDYA 4F73A 4GB2A 5PEPA 4Y56A 2ER7E 3KFSA 3LITA 2FS4A 1GVXA 5OZDA 1B6LA 4GJ6A 1HSIA 5ENKA 3T6IA 3OUDB 4YOBA 2G1YA 5P05A 5P25A 5P5SA 5P54A 5C9FA 5JODA 5P5TA 1YG9A 2XFKA 4Z22A 1K6CA 1SDTA 3OY4A 3NDXA 5P0XA 5P0GA 4J1IA 4NPTA 5KR2A 4J5JA 5P8DA 1IZHA 2PK5A 3S45A 1FQ6A 3I2LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2QI4 A;  4GJD A;  5AHC A;  4Y3S A;  3SM1 A;  4ER4 E;  3SAA A;  2WF0 A;  4YCT A;  5P60 A;  3GW5 A;  4Z2Z A;  4R95 A;  2BPY A;  3LZU A;  1QBU A;  2WL0 A;  5OZQ A;  5P3J A;  2NXM A;  2WEA A;  5P3F A;  3TKW A;  2I4D A;  1B6K A;  5ISK A;  5P4U A;  3VV6 A;  5P6X A;  3T7X A;  4RZ1 A;  5HD0 A;  1BXO A;  2PYN A;  5P7K A;  5P2B A;  1T6G A;  4Y3G A;  5FIV A;  2ZHR A;  3KM4 A;  5P1J A;  4DJW A;  2PYM A;  1D4K A;  2HB2 A;  1SMR A;  5HDU A;  3TPJ A;  5P13 A;  5P5E A;  4L7G A;  5OZV A;  2RSP A;  5P2M A;  1K2C A;  3VYF A;  2QMF A;  3VFA A;  4CPQ A;  1F7A A;  5P1W A;  4EPJ A;  8HVP A;  2HPF A;  3I25 A;  3OQK A;  5P1Z A;  2HAH A;  3KMX A;  3OWN A;  5P0A A;  5SY3 A;  5OZA A;  1EPP E;  1YT9 A;  2WEZ A;  2O4S A;  1B11 A;  3LZS A;  1D4L A;  4YDF A;  1PPM E;  2XYF A;  1LYB A;  4D85 A;  3LIQ A;  5P4Y A;  3NLS A;  1HEF E;  2FMB A;  5P5H A;  4I0H A;  4OD9 B;  1YTH A;  5P8M A;  5P4L A;  5P3R A;  4Y38 A;  5P5D A;  1FQ5 A;  3PSU A;  1XN3 A;  3VLB A;  3D20 A;  5P7I A;  4RVI A;  3PBZ A;  5P5I A;  2QHY A;  4B1E A;  2P3C A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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