3T93B

Glutamate bound to a double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t93B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t93B02
2B3FA 2DS9A 3SEXA 1VSOA 3MZ9A 2FYIA 3KZGA 2OWSA 5TP9B 2V3QA 3T9HB 3RPWA 1R9QA 1BP5A 5A5XA 3EHTA 3TQWA 3ONMA 3VE1B 3TODA 4G68B 3ECRA 1NNKA 3MBPA 4RJZA 1D3KA 2V3UA 5DVIA 4OERA 1IEJA 3RLFE 2P0SA 3TZAA 3UGWA 2DP8A 1US4A 3A3UA 1NNPA 2XXQA 1P1NA 3TTMA 2KLFA 4RXLA 5F7VA 4EF2A 4F3SA 2O7UA 5K2XA 5AA2D 2DVCA 4QSDA 4NEDA 2E0SA 1HSLA 1RYOA 4BDRA 2H4IA 5A5XB 1DOTA 1PB7A 1S7YA 4MLQA 2HEUA 1LFHA 3K6VA 4ZEBA 4GF8A 3MVZA 2QS1A 1TFAA 1Y1ZA 3OSRA 1II5A 4X48A 3M3FA 2Z22A 4F2OA 3LR1A 4GXAA 3PUXE 1B5JA 1SVXB 3SETA 3SEYA 1LAFE 3LC8A 3PPOA 3TDJA 5AA4A 2DSFA 2D5WA 1ELJA 1ZKBA 3M3KA 4PFUA 1A40A 2BJJX 4N13A 3CSGA 4OQOA 3H4ZA 3U94A 2AL4A 4C1UA 3ILUB 3R6UA 2F7AA 3T9VA 2F35A 3OSQA 3OD7A 1GVCA 3Q28A 1XC1A 4LZ7A 3IOWA 3O29A 2O68A 2P2AA 1B7HA 1MQHA 5KZTA 3L6HA 1YTVA 2ZMBA 4PE5B 2HQ0A 4OESA 4HW8A 1QKBA 2OLBA 3C33A 3FZVA 1UIUA 1ZMGA 4U1ZA 3DELB 2DXRA 4GWOA 1JQFA 2Q2AA 3VDFA 3EHUA 3AXFA 2PT1A 2IEEA 2GFEA 2Z8DA 1NH7A 3KN8A 5CBRA 3PPRA 4FE8A 4F1UA 3VXBA 4AB5A 4ESXA 4JDFA 1LAHE 4H67A 4ONYA 1VFDA 2NUVA 5DEXA 3V89B 1FQDA 2G93A 4LUBA 3QAXA 4YB6A 3FJ7A 2DWJA 4OFJA 4JSOA 2WKYA 1H76A 4P0IA 4POWA 2OJTA 2QPQA 1UTBA 4KYSA 3QYTA 4QFNA 4ZEFA 4QFLA 3PU5A 2RC7A 1MXYA 3N6TA 2G29A 1SW2A 4WEDA 5CRYA 4F1YA 2THIA 3OO6A 1FQCA 3BKIB 3KG2A 3VXCA 3IO6A 3H6TA 4IY6A 4G68C 2XXUA 1DSNA 2A5SA 2I0BA 3QIMA 1MY1A 3CIJA 5CMKA 3TQLA 3IJXB 2PMSA 3UN6A 3SERA 3B6WA 4QFPA 5BWJA 5I2KA 3IJOB 1B1XA 4RA1A 3HCQA 4OWDA 5CC2A 3W15C 4N07A 3FV1A 3G3FA 3IB2A 4NF5A 1SQYA 2DE2A 1L5TA 3R26A 3EN3A 4TLMB 3O66A 1ZLQA 2VGQA 2Y7PA 5ICTA 3IB0A 4F3PA 2DOJA 1I6QA 3THIA 1QUIA 3H6WA 2ONSA 1UIVA 4ZZAA 1LGBC 2O1LA 3OMBA 3OO9A 4PFYA 2XD3A 2Z8EA 4R75A 3Q26A 4YMAA 1GTKA 3BFTA 4H1XA 4RPOA 4OHNA 3UK4A 4BLAA 1QULA 2O84X 1PDAA 3PPNA 4LP2B 4YB7A 4Q30B 2O51A 4NF5B 3OOAA 2VD2A 1Q35A 3KOSA 1MM6A 1N7WA 3PD9A 1I6AA 5F1QA 4FAJA 1B58A 4IO4A 4BDNA 2XXVA 2F6PA 4HTGA 3F11A 3TTNA 3H7MA 3E13X 2YPNA 4E0WA 1UTHB 3T93B 1MQJA 1O63A 1VR5A 4IO2A 1IZ1A 4FEBA 4DLDA 4F1VA 3R7XA 1F9BA 4NF6B 2Q8JA 1JVYA 1URSA 3TCGA 1IXGA 3MUQA 1T0KA 3LUYA 1D9VA 4UACA 1USYE 4GQOA 3FIRA 3U72A 1A99A 5L9MA 2Z8FA 5AA3A 4MFIA 3C32A 3QSLA 5KDTA 3VV5A 3DLNA 3G3HA 2XXTA 3ILTB 1A8EA 3IB1A 3K6XA 4F22A 4LONB 5B70A 2RINA 2RF1A 3K1NA 4ESWA 2ZNTA 3VVEA 1D9YA 4QHQA 4IO5A 4MLVA 4ZEDA 4NF8B 3OXNA 1SDXA 5CMMA 1FQFA 4I62A 1MXWA 3FD3A 4L17A 3VFJA 5ITPA 4JBZA 1MQDA 4OENA 4OYVA 1CE2A 2ZYKA 1QUJA 3SESA 3I5OA 5EYFA 1MRPA 5KDTB 3QUFA 4X9TA 3PD8A 4GRKA 1LBBA 3K1PA 2P1SA 1USYH 4GOTA 3SEUA 4JB7A 1M5FA 3N6UA 4ELPA 3ODBA 1BIYA 3MZBA 1R6ZA 2QS3A 4I9DA 2F6GA 4WXJA 1S50A 3O9PA 1B32A 2F8DA 1JNFA 5BUUA 1JW1A 1LAXA 3RQTA 5DVJA 3MQ9A 3HSTA 1EH3A 3H03A 5AA2B 5IAIA 3S9LC 3M8UA 3ZKKA 5CMBA 3T96B 4M1VA 2HXWA 3HHGA 5M2VA 3IOTA 4C1TA 1SI1A 1M5DA 4X1BA 3Q29A 3VLWA 4KPTA 4Q0CA 4Z7EA 1B1HA 1URDA 4FEDA 1TFDA 2XXRA 1IUDA 2I4CA 4NWDA 1OVBA 3S4UA 1B4HA 3FXRA 2PT2A 4DCYA 4IY5A 2ALUA 2RC8A 4LZ5A 1M5CA 2HAVA 2UVGA 2IA4A 4F19A 4LQ2A 5ISUA 1N76A 1FCKA 3TMGA 4BDQA 4XKPA 1JEVA 1SW1A 1MY0A 4TLLB 2DE4A 1ZBMA 4OEVA 1POTA 4ZZEA 1ZJLA 3LSXA 4XKRA 4GIZA 4G77A 5ELVA 3IX1A 1EU8A 1TT1A 3MW0A 1Y20A 2F34A 4H0WA 1EZOA 1TWYA 5HPQA 3TYHA 4G8HA 1XOCA 1XHYA 4R73A 2AIXA 1P99A 3E9XA 5FHMA 4KYEA 4M4GA 3SKPA 4YKIA 4U21A 3IOVA 3BFUA 3TTLA 3TCHA 1N84A 3O2AA 1B05A 4IGTA 1TXFA 2QRYA 4TQUQ 4U4SA 4GFRA 4ZEKA 5I59A 3LSWA 1FQAA 1Y3QA 2XXHA 2FA7A 3A09A 1N0TA 3TELA 1AIVA 1Z7ME 3RUMA 5DYHA 3IAZA 4LATA 1QUKA 3OENA 1B9JA 3ZS6A 3VVDA 3C35A 1DTZA 2CZLA 4QRZA 5AA4B 1D4NA 2PX1A 3P7IA 3DP8A 2QL3A 1PBPA 1RYXA 2I3VA 1MDP1 4GL8A 5HBCA 4KHZE 5CI5A 1EZPA 5TPAA 1SYHA 4RK9A 2F78A 3S9EA 4THIA 4XXUA 4YMBA 4OETA 2NXOA 1LCFA 5I59B 3UA8A 1PB9A 4X1DA 1MY3A 5JEIA 4U1OA 4IO3A 3VLUA 2ANJA 2O69A 4QFOA 4KCDA 4QFKA 4G4PA 1US5A 2UYEA 4OFLA 3OEKA 4IGRA 3K4UA 3W9WA 4HS7A 1Y4TA 2REGA 2X26A 2GHAA 4K3FA 3KSJA 2QS2A 5TU0A 4F3GA 5I2NA 3GXAA 4GXSB 3FJGA 4QF9A 2F5XA 4PETA 4JWXA 1RKMA 5DVFA 2X7PA 1FQBA 5KCJA 4EQ7A 1B5IA 3PUZE 2W7YA 3RY3A 3HHFA 2I49A 3IOUA 1P1QA 4FATA 2YLNA 3C31A 4R74A 1MH3A 5JK4A 4R2BA 4UA8A 1B2HA 1A8FA 2GH9A 5ICQA 1LAGE 4OXVA 2I0CA 3MPLA 5H8NA 4U4XA 1WODA 1Q1KA 3TTRA 5DEXB 2DVZA 4JXIA 4ELQA 4PP0A 3RGYA 5H8HA 4U23A 2UVJA 3O97A 2I6EA 2HAUA 1UTBB 1XVXA 3V5AA 1MDQA 3G3KA 4IO7A 2R9JA 3FXUA 2Y7WA 2ESNA 4YICA 1ATGA 5KCJB 3MVXA 3KOTA 1DTGA 4WKMA 1N7XA 1MPBA 3QXMA 3FATA 4FECA 2VHAA 2F97A 4KD5A 1SBPA 3RTWB 4GLIA 1GGGA 3L6GA 1Y4CA 1YAEA 4LVQA 1DPPA 3MJNA 4Q8RA 4Q5TA 2PYYA 4H6DA 5L9OA 5J1DA 1IIWA 1XS5A 4XIGQ 4DE8A 4F3BA 5FHOA 4G2ZA 1I69A 1B7ZA 2F36A 4DXBA 3RNNA 5I2KB 3PMXA 5L9SA 1HSEA 2DWAA 3EPEA 1SI0A 1DMBA 1NL5A 3K1MA 3TEPA 5AE4A 2AL5A 2XX7A 2Q9TA 4R72A 4QSCA 3CR9A 1GV8A 2OCUA 1P1WA 3V8XB 1AMFA 1MXUA 3N94A 1IXHA 2O6AA 2RCAA 1BTJA 1Z7NE 1XVYA 3GBBA 2M8CA 1PBQA 3CG3A 3H3GA 2F7BA 2V25A 3HO7A 4EF1A 2AYSA 2Q88A 4ELRA 1VFEA 1R1NA 4ZE8A 2UVHA 2I4BA 4N6PA 3JZJA 3MVWA 2O7IA 4EUOA 3D4CA 4YZZA 3Q27A 3TAJA 3E3KA 4JWYA 1FTKA 1B6HA 2H98A 2Q89A 2QMWA 4F39A 3RT6B 1P1OA 2XHDA 1H44A 4OMBA 1MPDA 3M3LA 1ZIUA 1B3HA 4H8IA 1O64A 2DXYA 4DZ1A 1AOVA 4Z0IA 3FVKA 5AA1A 4POXA 3I6VA 3U92A 2I48A 3OO8A 1SD3A 4OTEA 4NF4A 1HSJA 2X7QA 3UIFA 3BBRA 1JW4A 3G7WA 3FVNA 4EQ9A 1NH8A 4BDMA 1B46A 4GD5A 1OQHA 2OK2A 4XTCQ 5TP9A 3O6IA 3ZKLA 1YCJA 1WVJA 1Y9UA 2UXAA 4MBPA 4YAHX 4YKKA 4G68A 4F2QA 3SEVA 4NE4A 3GBAA 5ITOA 1N3XA 4F18A 1ZU0A 3KJTA 1H43A 4H65A 1MY4A 1LBCA 2B65A 1LB8A 3SDFA 3LBSA 4NF4B 5CMCA 4C0RA 4DCXA 2E1SA 3KGCA 4U22A 1GR2A 4PQJA 5CM6A 3CVGA 3WAEA 3CG1A 1IQ7A 1BLFA 1JETA 1H45A 3O6HA 2V3TA 2VP1A 2V93A 1B3EA 2FNCA 3FJMA 2ZNSA 5EHMA 3T66A 3RT8A 3IO4A 4I1DA 4H5GA 5I56A 1MXXA 4LZ8A 4PFWA 3MAMA 1LCTA 2UVIA 2VD3A 3MZ1A 3U8QA 1MY2A 3GLBA 1B51A 1LSTA 3VVFA 1A54A 3PV0E 3K2DA 1Y3PA 4YB5A 2V84A 3RTFB 3MPKA 4ISUA 1EZ9A 2Y84A 5K2YA 5I84A 2XD2A 5H8SA 3T9XB 3EF7A 1O7TA 1J1NA 3MWBA 2I58A 4HCWA 3CI8A 5B7DA 1B0LA 3K01A 3HN0A 1I6BA 5I56B 2D21A 4IB2A 1NNFA 3FVOA 5CBSA 4OFOA 2Q2CA 3FASA 2ZYOA 3S9MC 2DYXA 2Y7KA 4EQBA 1OLAA 2GHBA 1MXZA 2H5YA 4XKNA 2QSXA 3MVYA 4ZECA 3T22A 4HCYA 4R9FA 4ECFA 4RPNA 2ZYNA 3U93A 1QVSA 3MP1A 3FGSA 2HZKA 2A5TA 2XXWA 1LFIA 2XXXA 2ZNUA 3QK6A 1QKAA 4TOZA 1MS7A 3H6VA 4OEUA 4R9GA 1B40A 3HPIA 1MH4A 4KCCA 3HV1A 2HCAA 4ELOA 2O1MA 4E0XA 3VLVA 4KQPA 4ZE9A 3B7DA 3KEIA 5DT6A 1ZTYA 3K00A 3UORA 3MC2A 2R71A 3FVGA 1VE4A 2ABHA 3EHSA 4XKQA 1AH5A 3C4MA 1QJMA 4YKJA 4ZEIA 3KFMA 1OIBA 2YJPA 2A5TB 5HM4B 1UQWA 4GVOA 4OZ9A 3CSBA 2DE3A 4G8MA 2H9BA 1B52A 3FXQA 3LSFB 2Z23A 3W9VA 3RN8A 4U2RA 2QS4A 1NNTA 3IK6B 3PUYE 2XXPA 3C9HA 1LLSA 4KFQA 1PEBA 1Y3NA 1IXCA 3IL1B 1B5HA 3K6WA 3IR1A 4I8CA 1SW5A 3O6GA 3CFZA 1URGA 4P0GA 4FIMA 4EDPA 3A3CA 3C34A 3CFLA 4YKPA 2RKMA 4DXCA 4DXUA 1LFGA 1B3GA 3IORA 3S2VA 3OELA 5TPAB 4FJPA 3KN7A 4YU0A 4O3CA 2ZXTA 1Y1MA 4O3BA 4NWCA 4RNSA 5H8FA 1MXVA 4MH5A 1PB8A 4P11A 1IXIA 3K0VA 2XX8A 4AB6A 1CB6A 3I3VA 1FTLA 2HZLA 1YPNA 2QMXA 1POY1 4RYAA 3KBRA 3V83A 1B7UA 3DM0A 2ONRA 2VOZA 2B3BA 3B6TA 2DWIA 2PBWA 4RY1A 1N3WA 3H06B 2DWHA 5I2NB 3G3IA 4AQ4A 3G3GA 4PFTA 3EQ1A 1FTJA 1N04A 4KYDA 3O28A 1B0HA 4F29A 4JSDA 4RK2A 1S9TA 3TCFA 5H8FB 3Q25A 4O3AA 4NMYA 3JYRA 3TPAA 5DTBA 5H8NB 3OO7A 1SYIA 4MF3A 2XXYA 3MP6A 1M5BA 3B6QA 2XX9A 3TFLA 3ZSFA 4BDLA 5H8QA 3JV9A 1DPEA 1SW4A 4LQ5A 2UYFA 2QJEA 1OLCA 2LAOA 1MQGA 5H8HB 2NOOA 5JTYA 1AL3A 3E4RA 2XXIA 1MPCA 4F31B 3FUZA 5FTIA 1UTHA 2GRVA 1B3FA 2RC9A 5FTHA 3MP8A 1JVXA 1MG1A 2NVUB 2DQVA 2I3WA 4WEPA 1FQEA 3T9UA 1FW0A 4FORA 1PC3A 4NF6A 3S9NC 2PVUA 3LSLA 4BDOA 4H8JA 3GZGA 3WAFA 1MM7A 3CFXA 3PPPA 4R6KA 4KR5A 4ZS9A 4NTLA 1XT8A 3KJ7A 2D3IA 1KWHA 4IO6A 5H8QB 4H5FA 1OMPA 2HFBA 2OWTA 1ANFA 3PMWA 1H3DA 3CRBA 5L8DA 5JTYB 1R9LA 3DP4A 4DDDA 5I57A 5IKBA 4OVJA 1LB9A 2OZZA 3N26A 1P1UA 2F7CA 5FHNA 4QSEA 2RCBA 3G3JA 3OEMA 3PMVA 1NMUA 3KSXA 3TTKA 4R6YA 3K02A 3KN3A 1M5EA 3SEWA 3D4GA 4LA9A 5I58A 3C36A 3TUSA 2H99A 2H25A 4JWOA 2ONKE 1JW5A 4DIGA 1NKXA 3PUWE 1FTMA 5LOMA 1NFTA 1FTOA 4NF8A 1B3LA 2Y7IA 3PPQA 3K6UA 3DP6A 4EXKA 3UP9A 4ND9A 5I57B 4EXLA 1A55A 1B4ZA 3U1OA 1IITA 2CMOA 2R6GE 3N5LA 2Y7RA 5EHSA 4ZDMA 1A7LA 4G8NA 1BKAA 3PGFA 4GL0A 5I58B 2ZYMA 2NWJA 2REJA 1OVTA 3QUJA 4R6HA 1QW0A 2OBGA 1WDNA 3TKDA 1MQIA 1OQGA 3PUVE 4KI0E 4R2FA 3H6UA 3FV2A 1JEUA 5AA2A 3USDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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