3T93B

Glutamate bound to a double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t93B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t93B02
2Z22A 4ND9A 3CIJA 3LBSA 1N0TA 4JWOA 2A5SA 4LP2B 3WAFA 1MPBA 3LSXA 4G8MA 2XXYA 1UTBB 3FATA 1XS5A 5L9MA 4KQPA 4DIGA 2O1MA 2QL3A 5L9OA 5KDTA 3FIRA 4RPOA 3M3KA 1RYOA 4YMBA 2V3QA 3OSQA 1LCFA 1Y3QA 2Z8DA 3I5OA 1XVXA 2H98A 2I49A 3TODA 3CI8A 4DXCA 4XTCQ 3U93A 3FJGA 1Y1MA 1R9LA 1MDQA 2ZYOA 3QYTA 3OELA 1R1NA 2Q89A 3R6UA 4C1TA 4YKJA 1A54A 4HW8A 3I6VA 1NFTA 3TMGA 3OO8A 3FD3A 2O68A 3VDFA 1M5DA 3PU5A 1POTA 3QAXA 3MWBA 5EHSA 3MJNA 4ZECA 4RYAA 1HSJA 2P2AA 2E0SA 1UTHB 4FJPA 3OD7A 4FE8A 1MY2A 2DOJA 3THIA 1FQFA 2I4BA 4P0GA 4ZEIA 3SEXA 1TFDA 4GD5A 4KPTA 4QSDA 4WKMA 3PUYE 3SETA 5CMBA 1IXGA 1M5EA 3RLFE 1YCJA 4Z7EA 4EUOA 2Y7IA 1DTGA 3EHUA 4R6YA 3T96B 4BDNA 3TYHA 2UVJA 1FTOA 4G68B 4EQ7A 2XXRA 3SDFA 3T9UA 1QKBA 2Q88A 4F19A 2YJPA 3SEWA 3T93B 5CC2A 3VLUA 4F1VA 2Y7PA 3TEPA 2HZKA 2A5TA 4YB5A 4IY6A 2DWAA 3PPPA 2ONKE 3IOUA 1SBPA 5AA4A 1AIVA 1MY3A 5I58B 4TLLB 1SW1A 2X7QA 5H8SA 4HS7A 3E4RA 1LGBC 5AA2B 2H9BA 2D21A 1SYIA 3UIFA 5DVFA 1BP5A 3EHSA 4QF9A 5I2KB 4PFWA 4GVOA 2FYIA 3RUMA 1Z7NE 3TDJA 3FJ7A 1D4NA 2Z23A 3FXUA 4MH5A 3U72A 1IXCA 3PPNA 3EQ1A 3CSBA 2I6EA 4XIGQ 1CB6A 1II5A 1XT8A 2PYYA 5KZTA 5ELVA 4R9FA 1FW0A 3BFTA 4H65A 1QVSA 5I59A 2VGQA 3G3HA 5FHOA 1MQGA 4IGTA 4NF8A 3VXCA 1JQFA 4LZ8A 1PC3A 2UVHA 4TOZA 3EPEA 4IGRA 3U8QA 2F6PA 5KCJB 4YKKA 1MY4A 5I2NB 2Y7WA 1EZOA 4R72A 4F1YA 1S50A 4M4GA 4KYEA 5ITPA 2DP8A 2F97A 3T66A 3ZS6A 2IEEA 2QS4A 2ZYNA 3FXRA 1JVXA 1B7HA 1LSTA 3OO9A 1PEBA 4KCCA 2NUVA 5BUUA 4NF6B 3H6TA 4TLMB 3WAEA 4ZE8A 4O3AA 2ABHA 4G68C 2O69A 4X1BA 3TTMA 2HAVA 4LQ2A 2QMWA 1USYH 1XVYA 1GR2A 3BFUA 3P7IA 2OWTA 1USYE 1OMPA 3K6WA 5ITOA 4AB5A 5TP9A 1B7UA 3RTWB 1DTZA 5CBSA 4GLIA 5JK4A 2NOOA 3KGCA 2OCUA 1RKMA 2XXXA 2PVUA 4N07A 4FECA 2ZNUA 3S9LC 4NMYA 1B3GA 2HAUA 1OVTA 3M3FA 3IB1A 2B3BA 3MQ9A 2V3UA 2G93A 3U1OA 3KBRA 3N94A 3O97A 3PUXE 1NNFA 2G29A 5TPAB 4OESA 4GL0A 3OSRA 4U21A 2AYSA 1PDAA 5I56B 1B3FA 3C31A 1VR5A 4GFRA 3O29A 3ZSFA 3UK4A 1QJMA 1FCKA 4IO4A 1S9TA 3IO6A 1B2HA 1UIVA 2AIXA 2UYEA 4HCWA 5H8QB 3TTNA 4KCDA 1US4A 1D9VA 1LLSA 5HM4B 3HHFA 3H7MA 4XKNA 4GRKA 4R2FA 5CMKA 1LFGA 3DP4A 3IAZA 3UORA 1ANFA 1FTKA 2RC8A 4EQBA 1H3DA 3TZAA 4G77A 5DT6A 5H8FA 3HPIA 3QXMA 1DPPA 2GHAA 1QULA 4QHQA 2ALUA 3TTRA 1FTMA 3O6HA 1S7YA 5A5XB 4OXVA 2XXHA 1ZU0A 5EHMA 4PQJA 4DCYA 3F11A 3G3FA 4H5FA 4I1DA 1LAXA 1JEUA 1H76A 1B1XA 3V89B 2UVGA 1B4HA 1GVCA 1UTBA 2Z8FA 3KN8A 3DP6A 3CFZA 3FVGA 3VVDA 3JZJA 2QMXA 2Y7RA 1KWHA 2GH9A 3MVYA 4LVQA 3IL1B 1IQ7A 3SESA 1B9JA 2D5WA 2NXOA 1N84A 2OWSA 2XXVA 3CFXA 5IKBA 2CMOA 3CSGA 4QFKA 1GV8A 1I6QA 2XX8A 4PP0A 4ZE9A 2ZYKA 5TU0A 1VE4A 2DVZA 2O7UA 3DP8A 1A8FA 3PUVE 3RY3A 2V25A 1SDXA 4AQ4A 4H0WA 1SI1A 3Q28A 1MXXA 2LAOA 3A3UA 5B70A 4U2RA 1B05A 2PBWA 2E1SA 1LB9A 3UA8A 2I4CA 2QPQA 3GLBA 1MM6A 3FUZA 4M1VA 3KJTA 4FEDA 3VLWA 3IOVA 5DVJA 4IO3A 4ZEDA 4RK2A 5H8HB 1Y3PA 2UXAA 3C35A 3CG3A 5ICTA 5CMMA 1NH7A 4ZEKA 1SW4A 1EU8A 3IB0A 1N76A 4HTGA 3FGSA 1H43A 3MPKA 3VFJA 4PFUA 1MXUA 5I57A 3S9NC 3B6TA 1NL5A 3RPWA 1DOTA 1FQAA 3TCFA 4XKQA 2O7IA 4OTEA 4OWDA 1MPCA 1A55A 1IEJA 1ZJLA 3MP6A 4ELQA 4LONB 1FQEA 4X9TA 1B3LA 3KEIA 1RYXA 1B58A 2RC9A 2PX1A 1A7LA 4IB2A 4U1OA 5I2KA 1MDP1 3IORA 2M8CA 1B5HA 4DXUA 3SKPA 1QUJA 3W15C 4NF5B 5F1QA 2YPNA 4U4SA 1OVBA 2O1LA 2DE4A 3C33A 3MZBA 3H6WA 3G3KA 4DDDA 2OBGA 1POY1 4OENA 2XXIA 5LOMA 2REGA 4U1ZA 1R6ZA 2HCAA 3K0VA 1N3WA 3MBPA 1B40A 2GFEA 3LSFB 1ZMGA 4DZ1A 2HEUA 2Y84A 3O28A 4H5GA 2B65A 3TFLA 2KLFA 1JW5A 5BWJA 3TUSA 3S9MC 2XXPA 3HO7A 3FXQA 1MY1A 4GL8A 4YICA 3OEKA 3KG2A 4PFYA 5ISUA 1VFDA 4YMAA 1D3KA 4R2BA 3OOAA 4QSCA 1L5TA 3B6QA 3K6VA 1LAHE 2REJA 4QFOA 1MXYA 2DSFA 4YB6A 3GBBA 1P1QA 5KDTB 1N7XA 3RQTA 5H8NA 1IZ1A 4POWA 4K3FA 1JW1A 3M3LA 4QFLA 5DEXB 2VHAA 3N6UA 3E3KA 3MVZA 1MPDA 3K02A 4OYVA 3IJXB 4PE5B 3FVOA 1T0KA 4GXAA 1HSEA 2DE2A 3CR9A 4RY1A 4F22A 3KOSA 1VSOA 3LSWA 1DPEA 3PUWE 2RF1A 4THIA 5AA2D 2QS2A 4C0RA 1GTKA 2OZZA 1H44A 1NNPA 3SEUA 3PV0E 3PPOA 2FNCA 3PMXA 5TPAA 3FZVA 1SQYA 3W9VA 2GRVA 2QSXA 1PB8A 1FQBA 1SW5A 1EZPA 4GF8A 3KSXA 1AOVA 2R6GE 1ELJA 2VP1A 2XXTA 1Y9UA 3K1MA 4KD5A 2W7YA 3K6XA 1PB7A 1VFEA 4KYSA 4ELRA 3D4CA 5K2YA 1P1WA 3LUYA 5DTBA 4OFJA 1MG1A 5H8QA 1MH3A 3PUZE 5AA1A 5CRYA 1FTJA 4G8NA 5HPQA 2A5TB 3S9EA 1LAGE 2P0SA 4RJZA 4EXLA 3S4UA 1LAFE 4FIMA 5AA4B 2B3FA 4XKRA 4KI0E 4RA1A 4DCXA 1IUDA 3VLVA 4MFIA 1B0HA 3Q25A 4OFOA 5CMCA 4BDRA 4IO5A 3EF7A 1HSLA 3K1PA 3VXBA 1EH3A 4GQOA 4GWOA 1IXHA 1DSNA 2F5XA 3KJ7A 1I6AA 1NNTA 3TCGA 1XHYA 4TQUQ 2FA7A 3H06B 2F7BA 1QKAA 4H8IA 1J1NA 2QJEA 2RINA 4F29A 4YB7A 3IOWA 1MQHA 4GXSB 2XXQA 4ZDMA 4NEDA 4PETA 4QFPA 2OK2A 3BKIB 5I59B 4H8JA 4L17A 3MC2A 3VE1B 4NF8B 1URDA 4POXA 5FTHA 5FTIA 5CM6A 1TXFA 2QRYA 2D3IA 3PD8A 5AE4A 4OZ9A 5JTYA 3MUQA 4DXBA 3GBAA 3KN3A 5M2VA 1XC1A 4BDOA 2UYFA 1MRPA 1BLFA 4GOTA 4NF4A 4Q0CA 4PFTA 3C4MA 3ILTB 3EN3A 4F2QA 3MVWA 3SEVA 3HSTA 3L6HA 5ICQA 1JNFA 3VVFA 1GGGA 4E0XA 4KHZE 4EF1A 4OHNA 3D4GA 4R6HA 2HFBA 3H3GA 4F39A 2AL5A 3LSLA 3JV9A 2XXWA 5EYFA 4ECFA 2I0CA 1DMBA 3K4UA 4U23A 1JETA 4BDQA 3E13X 4HCYA 3FVKA 1ZTYA 4R6KA 5TP9B 1OQHA 3C32A 1WVJA 4H1XA 4KR5A 4P0IA 2RC7A 3MW0A 3RGYA 3PD9A 2I48A 3SEYA 2UVIA 1OLAA 4LATA 2QS3A 4JXIA 4U22A 3OEMA 2F6GA 4I9DA 3TQLA 3L6GA 2DWIA 1SI0A 1M5FA 1NMUA 2DS9A 4XKPA 1TT1A 4LZ7A 4LUBA 4KFQA 1Q1KA 1PB9A 1JVYA 1XOCA 5HBCA 2ZYMA 4F2OA 3RNNA 3QSLA 1Y20A 4NWCA 5J1DA 4FORA 4YKIA 3I3VA 1MQIA 2F7CA 1O63A 3G3GA 3IOTA 3H03A 3OO6A 4LQ5A 3TCHA 1URGA 4G8HA 1UTHA 1LCTA 3DLNA 3FJMA 2BJJX 1B5IA 3PMVA 3IX1A 3QIMA 3USDA 2Q8JA 4IY5A 1LFIA 1B5JA 2DXYA 3MP1A 2OJTA 3TPAA 5H8FB 4EQ9A 4NE4A 1B52A 2Q2AA 3N5LA 4G68A 2F36A 4F31B 1B51A 2PMSA 3FVNA 2V84A 4Z0IA 4F3PA 2HZLA 2R71A 3R26A 1SD3A 2ZNTA 1P99A 2IA4A 1JEVA 1IIWA 3K6UA 5I58A 1AH5A 3B7DA 4OETA 3T9HB 3ECRA 4ELOA 3DM0A 2H25A 1QW0A 5AA2A 1LB8A 3H6UA 1M5CA 5JEIA 3HN0A 4OMBA 5DEXA 1Y4TA 3RT8A 4BDMA 4OEUA 2I58A 4ZZEA 3CRBA 1MXWA 2ZXTA 3ZKKA 3ZKLA 2DVCA 3G7WA 1SVXB 5I84A 1FQCA 1D9YA 1MH4A 2F35A 1URSA 5K2XA 5FHMA 5F7VA 2V93A 1Z7ME 4YU0A 3Q27A 4F1UA 1NNKA 1Y3NA 5KCJA 1WODA 4QRZA 3T9VA 1SW2A 2ANJA 3RTFB 5I2NA 4OQOA 4FEBA 3T9XB 4YAHX 2WKYA 1MY0A 2I3WA 3PMWA 1N04A 2P1SA 2VOZA 3ODBA 1ATGA 2I3VA 3VV5A 4GIZA 3K00A 1US5A 3O9PA 2DWHA 4QSEA 3TKDA 3RN8A 4FATA 4NF6A 4WXJA 1ZKBA 1LBCA 4OVJA 1UQWA 4N6PA 1LBBA 1LFHA 3TTKA 3SERA 2O6AA 3IR1A 4X48A 4DE8A 3K1NA 5I57B 2X7PA 1P1OA 3CFLA 4IO7A 4MBPA 4ZZAA 2PT1A 3ILUB 4DLDA 3O2AA 1ZIUA 2DYXA 3S2VA 3B6WA 2O51A 4RPNA 4ESXA 1IITA 4F3GA 4JWYA 4MLVA 1A40A 1YAEA 4EXKA 3CVGA 4EDPA 4JBZA 4MLQA 3GZGA 1P1NA 1I69A 4R74A 3Q26A 1N7WA 3PPRA 3KN7A 4ONYA 3DELB 3U94A 4U4XA 4RXLA 3N26A 4F3SA 5I56A 5L9SA 3MP8A 1B6HA 2VD2A 4JSOA 1B3EA 1O64A 2RKMA 3HV1A 1YTVA 3H4ZA 2ZMBA 5AA3A 1I6BA 3MZ1A 4R73A 4G4PA 4LZ5A 3QUFA 4P11A 4ELPA 3GXAA 4JDFA 2THIA 4I8CA 2ZNSA 1P1UA 1Q35A 1OLCA 2ONSA 1MQDA 3OENA 4F3BA 5DYHA 3EHTA 1MXVA 4UACA 2VD3A 1BIYA 4NWDA 2Q2CA 2XXUA 4WEDA 1B4ZA 4Q5TA 2NVUB 1H45A 3PGFA 2ESNA 3C36A 1TFAA 5CBRA 2NWJA 4Q8RA 4OERA 1OQGA 5H8NB 4KYDA 2XHDA 5L8DA 1NKXA 3MAMA 3K01A 1SYHA 2YLNA 3PPQA 2Y7KA 5A5XA 3O6IA 2HQ0A 2V3TA 3RT6B 3Q29A 2F8DA 3TAJA 4WEPA 4C1UA 1B3HA 1B0LA 4IO2A 3V83A 3E9XA 3KZGA 4OEVA 3HHGA 3G3IA 2DWJA 2H4IA 1JW4A 1AMFA 3C34A 3KSJA 4ZEFA 3R7XA 1B7ZA 3OXNA 1EZ9A 2DE3A 4H67A 3TTLA 3LC8A 1BKAA 3K2DA 1B1HA 2XD3A 2F7AA 3UGWA 3MZ9A 2XD2A 1IXIA 1YPNA 1MQJA 1A8EA 1PBPA 1WDNA 3ONMA 4MF3A 4QFNA 3T22A 2Z8EA 3JYRA 2OLBA 3QUJA 4ESWA 2AL4A 1QUIA 3FASA 1CE2A 1F9BA 1QUKA 1UIUA 3IB2A 1M5BA 2XX9A 2O84X 3LR1A 2Q9TA 4JB7A 2F34A 3KFMA 3TELA 1MS7A 2F78A 3O66A 2R9JA 4AB6A 3MVXA 2H99A 3KOTA 5H8HA 3A09A 4XXUA 3UP9A 1B46A 4UA8A 3G3JA 4E0WA 3M8UA 4RNSA 4OFLA 2ONRA 4O3CA 4H6DA 3IJOB 3OMBA 5FHNA 3VVEA 4O3BA 4RK9A 1MM7A 3MPLA 1O7TA 3CG1A 2PT2A 2GHBA 4JWXA 1PBQA 4R9GA 3QK6A 3A3CA 3HCQA 2XX7A 3V8XB 3H6VA 1A99A 1FTLA 5CI5A 5JTYB 5IAIA 1N3XA 4BLAA 4FAJA 2DXRA 2H5YA 3V5AA 2RCBA 5DVIA 1NH8A 1ZBMA 3O6GA 3BBRA 3C9HA 3FV2A 4NF4B 4NF5A 1Y1ZA 3UN6A 3FV1A 2HXWA 4YZZA 4NTLA 3W9WA 4ISUA 3IK6B 1Y4CA 3OO7A 4YKPA 1BTJA 4ZEBA 4Q30B 4JSDA 4EF2A 2I0BA 1MXZA 2QS1A 1OIBA 1ZLQA 4ZS9A 4R75A 1AL3A 1R9QA 2CZLA 1B32A 4G2ZA 4F18A 4N13A 4BDLA 3IO4A 4IO6A 2DQVA 3TQWA 4I62A 3N6TA 1TWYA 5B7DA 4X1DA 3AXFA 1FQDA 4LA9A 2RCAA 3U92A 2X26A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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