3T9XB

Glutamate bound to a double cysteine mutant (v484c/e657c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLCREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKCFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9xB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9xB02
5TPAB 2F78A 1MQHA 2GRVA 3A09A 1OIBA 4FE8A 1B6HA 1D4NA 3W9VA 2XD2A 3LSLA 5H8QA 4GD5A 1HSLA 4F29A 4F3BA 5K2XA 1B4ZA 4LP2B 2P0SA 1GR2A 4OTEA 5I58B 4AQ4A 1MDP1 1BP5A 1UTBA 3N94A 4ELPA 4R9GA 3DP6A 3MQ9A 2H5YA 1JVXA 3FV1A 2DXRA 1US5A 5EHMA 4KPTA 3ILUB 2D21A 2X7QA 3KG2A 2GFEA 2I3WA 4XTCQ 4Q5TA 3U92A 2R9JA 3K00A 1MXXA 3TTKA 1LGBC 3A3CA 3FUZA 4X48A 4N07A 2QS1A 4MH5A 1N7XA 2Q88A 5H8NA 4R6KA 4F31B 4HW8A 4KHZE 3VFJA 3CR9A 5JTYA 2H25A 1FQBA 3V83A 5TP9A 1QULA 2ZYNA 2F6PA 2P1SA 3PU5A 4M4GA 4FATA 3UP9A 2Y7RA 1F9BA 4LVQA 4OESA 5DVFA 4JBZA 1N0TA 1ZLQA 4PFUA 2NUVA 3HV1A 4N6PA 3ECRA 1ZKBA 2FNCA 4R9FA 1A7LA 3K4UA 3EHSA 1IXHA 1Q35A 1LB8A 3H6UA 1QW0A 4G68B 4GVOA 3GBAA 3PUYE 4IB2A 3VVDA 1MXZA 1Y4CA 4KYDA 4G8NA 1B5IA 1R6ZA 3KSJA 1LCFA 5L9MA 3EHTA 5I57B 2VGQA 5ISUA 2ALUA 3G3HA 2UXAA 3OMBA 1N7WA 4M1VA 1XVXA 4GXAA 4YB5A 1S50A 3K02A 1DSNA 3TCGA 5J1DA 1SW5A 3K1MA 1S9TA 1SVXB 2ZNTA 4DXCA 1LCTA 5LOMA 2OWTA 2QJEA 5I58A 3OOAA 4HS7A 3IOTA 4FJPA 3JZJA 4EXKA 4OEUA 1B7ZA 4P11A 4Q30B 1D9VA 3BBRA 3FD3A 3MPKA 1ZU0A 3FIRA 2UVHA 3KOTA 1MQIA 3RLFE 2DXYA 3HPIA 3U8QA 1POTA 3FATA 4I1DA 3OEKA 3USDA 4F2QA 2YLNA 5AA3A 4ONYA 2DWJA 1O64A 2IA4A 3T9XB 1KWHA 1LFGA 4GOTA 3C35A 2XHDA 3M8UA 3Q26A 1FQDA 3I6VA 4P0IA 4UACA 1LFHA 2I3VA 4QFNA 2G29A 1B46A 4QSCA 2PBWA 4IGRA 3TYHA 3AXFA 4F1VA 3ODBA 1HSEA 3IJXB 3PUXE 5I59B 2HFBA 3OSQA 5AA1A 3ZS6A 2QMWA 3OXNA 1MH3A 2WKYA 3LUYA 3N6UA 3WAEA 3T22A 1M5DA 2XXTA 3QSLA 4H67A 4WXJA 2A5SA 2ZMBA 3SEWA 2FYIA 1ZJLA 3K2DA 4XKNA 2H4IA 4BDRA 1NFTA 4K3FA 4TLMB 1OLAA 1QUJA 2XX7A 3EQ1A 2F97A 3G3FA 1IXIA 1XS5A 1B3FA 3TCFA 4GRKA 1OMPA 3PD8A 4LQ2A 3O9PA 2RF1A 1B5JA 3CFZA 2XXVA 5M2VA 3K6UA 4EQBA 2OBGA 1B58A 3IO4A 4FECA 1MY3A 1AIVA 4IO2A 3SESA 3EPEA 1H45A 2RCBA 2HQ0A 1LSTA 2Y7IA 4QFPA 1LAHE 2XXWA 3TODA 4RPOA 3TMGA 2IEEA 3E4RA 2OK2A 5H8FB 3PPRA 5I84A 2E1SA 2PX1A 2XXYA 1VFDA 3MZ1A 1DPPA 4RY1A 1DTGA 2XXHA 2F8DA 4XKQA 1B1XA 4HCWA 4NF6B 2Q9TA 4LONB 4GL0A 3UA8A 2DVCA 1FTMA 4G77A 5AA2A 4U4SA 1AOVA 1GGGA 3GLBA 1A40A 5DTBA 3KBRA 3S9MC 3SKPA 4THIA 4IO5A 4QSEA 2Y84A 2B3BA 1UIUA 1NNKA 3KN8A 4DXBA 5AA4A 2XD3A 4U1ZA 5H8QB 3T9UA 4G8MA 3CG1A 5JK4A 4GIZA 1N84A 4N13A 1N3WA 3DELB 2BJJX 3W9WA 3THIA 3FJGA 1UTHA 3MVXA 2I4BA 2XX9A 3M3FA 2O1LA 2HZKA 5L9OA 4JSDA 2FA7A 3IJOB 4LZ5A 1PBPA 5FHMA 2QS2A 3MZ9A 3UGWA 1NNPA 1TXFA 3S9EA 2O6AA 5KDTB 1OLCA 3CI8A 4EUOA 3MP8A 4ZEBA 3RUMA 4KQPA 2O7IA 1O63A 4OVJA 1QKAA 1NKXA 3Q27A 4IO6A 4QRZA 4I9DA 3O97A 1YPNA 4ND9A 3LSXA 3KGCA 2AYSA 3CSBA 4ESXA 3CFLA 4H5FA 5CMKA 3HCQA 1IXGA 3TQWA 3N5LA 4FORA 4OETA 3HO7A 1P1WA 1ZMGA 4U23A 1TFAA 3TZAA 4L17A 1FQFA 1B7UA 1BKAA 3H6VA 4NF6A 2V93A 3IOUA 5FTHA 4O3AA 4KFQA 3IORA 2Q2CA 4OHNA 4NF4A 4YAHX 2UVIA 1JW4A 5I2KA 3IOWA 2QS3A 5BUUA 1FQAA 3T66A 2ZXTA 1I6AA 4NF8B 1SW2A 2DE3A 4YU0A 4X1BA 5HM4B 1IZ1A 1XC1A 3PPPA 2OJTA 4DDDA 4F1UA 3MP1A 4O3BA 1WODA 2XXIA 3WAFA 1B0LA 2O84X 3G3JA 1L5TA 4R2BA 3MUQA 2DWAA 2LAOA 3SEUA 3S9NC 2O1MA 4YB7A 3CG3A 4H1XA 2PYYA 3PPQA 3RGYA 1MQDA 2F7CA 1QUKA 4I62A 3FVGA 4PFTA 5KDTA 2DVZA 4Z0IA 3TKDA 5ELVA 3CFXA 4JSOA 3VE1B 3TTLA 3B6TA 4NMYA 4R2FA 5JEIA 1MXWA 4DCYA 3TEPA 1JW1A 2OLBA 4FEDA 4ESWA 4YMAA 1TFDA 3VVFA 4QHQA 3Q25A 3IO6A 5H8HA 4JDFA 1OQGA 1BIYA 2I4CA 2HXWA 1B3GA 1FW0A 1FQCA 4F18A 1JNFA 3W15C 1NH8A 4C1UA 3JV9A 4ZEFA 5EYFA 5CI5A 2DWIA 3UIFA 3I5OA 1R9QA 4EQ7A 1O7TA 1MY4A 1A55A 4QFKA 1R1NA 3LR1A 3O28A 4TLLB 3H7MA 1LLSA 1M5BA 3FJ7A 3G3GA 1MPDA 3MWBA 1US4A 4E0XA 2Z8EA 5EHSA 2NOOA 4G4PA 4OYVA 3FXRA 3OD7A 1LAFE 4NF8A 1Y1MA 3A3UA 2I0CA 3MZBA 1CE2A 4MFIA 3N26A 3VLWA 1A54A 3O6IA 2ZNUA 3VXBA 4QFOA 3K01A 4OQOA 2RKMA 4DLDA 1MPCA 3H06B 3B6QA 2QMXA 3K0VA 3LC8A 2GHBA 3KN7A 3G3KA 5ICQA 2QS4A 1PEBA 4U4XA 1UIVA 3SEXA 3O29A 1AH5A 2ESNA 4HTGA 1LBCA 4H8IA 3O6HA 4ZDMA 1B0HA 2RC9A 5DVJA 4ZE8A 3G3IA 1N76A 4QFLA 4BDOA 3K1PA 1OVBA 4PP0A 3SEVA 4LQ5A 1Y4TA 1Z7NE 3TUSA 1QKBA 1SI1A 4YKIA 4H65A 4FAJA 4GXSB 5AA2B 3VDFA 3FVOA 5TU0A 1N3XA 1Y9UA 4OFOA 4NE4A 3PUWE 3FV2A 2HEUA 2F7AA 2D5WA 5AA4B 2PT2A 2XXXA 3HN0A 1H3DA 1M5EA 3MBPA 4HCYA 1ANFA 4GFRA 4IO7A 2V25A 1B52A 4ZE9A 3PMWA 3ILTB 4AB5A 2ZYMA 3TCHA 1EZPA 3MC2A 2M8CA 3MP6A 1UTHB 2V3UA 3ONMA 4LZ7A 4RXLA 4RA1A 1P1QA 1H44A 1A99A 5ITPA 3V8XB 4KYSA 1I6QA 2THIA 4U2RA 3O2AA 3E9XA 4NF5A 2AIXA 3K6VA 3SETA 2GH9A 4YZZA 1DPEA 4H8JA 4NWCA 1D3KA 4DE8A 3TTNA 3FASA 3UORA 1SQYA 2O69A 2NVUB 3FVNA 3C32A 2Z23A 1JQFA 2H9BA 3RQTA 1SW1A 2OCUA 4AB6A 3T93B 1ZIUA 2AL4A 4ZEDA 1YCJA 2PVUA 3BFTA 2Q8JA 1P99A 1VSOA 3DLNA 5F1QA 4DZ1A 1XVYA 3GBBA 3QXMA 2ZYKA 3C4MA 3V5AA 3IAZA 2O68A 4IY6A 1M5CA 1MRPA 3S2VA 3M3LA 3RT8A 4PFYA 4G68C 1OQHA 2OWSA 4TOZA 1USYH 3HSTA 4BDQA 1B2HA 3L6GA 1YAEA 5ICTA 4NF4B 2ZNSA 2VD3A 3CSGA 3TTRA 1QJMA 3T9HB 5I2KB 3RPWA 1I6BA 2PT1A 3OEMA 3P7IA 4F2OA 2V3QA 4R6HA 3SDFA 3H6WA 3H4ZA 1SW4A 4E0WA 5A5XB 3VLVA 1BTJA 2R6GE 1DTZA 4OZ9A 1FTOA 5FHOA 1CB6A 2QL3A 1NNFA 1LBBA 2E0SA 5CRYA 1EZ9A 1MPBA 1B40A 3TDJA 2CMOA 3OO7A 3RT6B 5CC2A 5FTIA 1FTJA 1HSJA 3KJTA 4JB7A 1MY2A 3PV0E 1XT8A 2Z8DA 4ZZEA 4G8HA 2QRYA 4KCCA 1IUDA 2AL5A 5F7VA 4FIMA 4X9TA 5K2YA 3EF7A 3QUFA 3RY3A 4JWYA 5L9SA 5DYHA 1MY1A 4R75A 2D3IA 1EU8A 4GQOA 4F3SA 5KZTA 4MF3A 4ELOA 1ZBMA 5H8HB 4YMBA 3RTWB 4ZEIA 1Y3PA 3N6TA 1SYIA 3MJNA 3IOVA 3K1NA 4KD5A 5KCJB 3E13X 3I3VA 1B05A 3K6WA 1Y1ZA 2VHAA 1TWYA 4LZ8A 4RYAA 1LAGE 1ZTYA 4Q0CA 2H98A 1NH7A 2Y7WA 3PMVA 4ELQA 1P1NA 3MVZA 3PUVE 1B32A 4ECFA 3DP4A 2ANJA 3PD9A 2Z22A 4PQJA 3O66A 3R6UA 4YB6A 3B7DA 1FTLA 3C33A 5FHNA 3R7XA 4EF2A 4OEVA 1GTKA 4H5GA 5A5XA 3IX1A 1NL5A 4Z7EA 3MW0A 3C36A 4IY5A 2DWHA 2F7BA 1PB8A 1WVJA 4OMBA 3UN6A 4YICA 3VLUA 4EF1A 2Y7PA 2I0BA 5CMMA 1QVSA 4X1DA 4OENA 1VE4A 2O51A 4U22A 4JWOA 1DOTA 1FTKA 5DEXA 4PETA 4MLQA 1SDXA 2RC7A 3FZVA 1B3LA 3BKIB 3MVWA 1MQJA 1URSA 2REGA 4OERA 5IKBA 3H03A 2XXRA 3DP8A 2RCAA 3MPLA 4RK2A 5BWJA 2VP1A 2DS9A 4MBPA 1P1UA 2RC8A 1GVCA 1UQWA 4QSDA 4R72A 4F19A 3FXUA 4ZS9A 2NWJA 1RKMA 3KOSA 2Z8FA 3C9HA 3R26A 2A5TB 4JWXA 5CBRA 1XOCA 4EQ9A 3RN8A 1PBQA 3H6TA 4C1TA 1M5FA 4NWDA 3C31A 5KCJA 1YTVA 3C34A 1B51A 3T96B 4GWOA 1LFIA 3QUJA 3FXQA 2F35A 1Y3NA 2P2AA 3V89B 1USYE 3TPAA 3CVGA 3GZGA 1MY0A 4BDLA 4JXIA 4Q8RA 4ELRA 4YKKA 4WEPA 5B7DA 1JVYA 4NF5B 1A8EA 4U21A 2F34A 2UVJA 5H8SA 4RNSA 2CZLA 4KI0E 5TPAA 2HAUA 3HHFA 3KFMA 4DIGA 2VOZA 2RINA 1JEUA 5CMCA 3KJ7A 2I6EA 2QSXA 3F11A 5I56B 3LBSA 3KZGA 2XXPA 4PE5B 3FVKA 2KLFA 2XX8A 1POY1 3Q29A 4EDPA 2I58A 1H43A 4POXA 3OENA 2Y7KA 3S4UA 4U1OA 3QIMA 2X7PA 1SYHA 2ONKE 5DT6A 4QF9A 1XHYA 2I49A 1URDA 1VR5A 1P1OA 4F22A 2UYEA 1NMUA 4POWA 4FEBA 4TQUQ 2ZYOA 3G7WA 3S9LC 4F3GA 4R73A 4XKRA 3IL1B 1MG1A 2A5TA 2DOJA 1JW5A 1FCKA 1LAXA 1RYOA 4KYEA 2X26A 2F6GA 4ISUA 5AE4A 2W7YA 3TTMA 4R6YA 1NNTA 4LUBA 4YKJA 5IAIA 1AL3A 3IK6B 1PDAA 1ELJA 1N04A 3D4CA 2Q89A 3PPOA 1TT1A 3HHGA 3U1OA 4BLAA 4RK9A 4MLVA 5CM6A 4ZZAA 1RYXA 3KSXA 3KN3A 4G68A 4F1YA 1BLFA 3VV5A 4I8CA 3TQLA 3IB2A 2YJPA 1MDQA 4OFJA 3GXAA 3CRBA 1R9LA 2V84A 2HAVA 5CMBA 3PPNA 1Q1KA 2I48A 5I57A 2ONSA 4WEDA 5DVIA 4H0WA 3ZKLA 3JYRA 3U93A 1I69A 4RJZA 3EHUA 3QK6A 4IGTA 2OZZA 1MM6A 4ZEKA 2ONRA 5I56A 3OO6A 4YKPA 2F36A 1JETA 2B65A 4GF8A 4NTLA 4XIGQ 2XXQA 3B6WA 4KR5A 2XXUA 1IXCA 2PMSA 4G2ZA 2DYXA 4GLIA 5HBCA 1MXYA 2HCAA 1SI0A 5I2NB 1PB9A 1VFEA 1B3EA 5AA2D 2GHAA 1S7YA 1LB9A 5L8DA 1OVTA 3K6XA 1Z7ME 2F5XA 1B7HA 1MQGA 3T9VA 5CBSA 1PB7A 1GV8A 2QPQA 3H3GA 2O7UA 2DSFA 3QAXA 3MAMA 1EH3A 5HPQA 3EN3A 4F39A 1MXVA 4OXVA 1SD3A 4RPNA 3MVYA 1A8FA 3IR1A 2V3TA 1WDNA 1MM7A 3VVEA 4O3CA 4ZECA 5I59A 1DMBA 1JEVA 3RTFB 1T0KA 2DE4A 3PMXA 3SERA 1QUIA 1MS7A 3LSFB 1AMFA 3E3KA 4PFWA 2ABHA 1D9YA 3U94A 3PGFA 3FJMA 3M3KA 3D4GA 1UTBB 5DEXB 1Y3QA 2DE2A 1B1HA 3TELA 2Q2AA 4WKMA 1B9JA 2UVGA 2H99A 1IIWA 1IQ7A 1B4HA 4LATA 4H6DA 3FGSA 3CIJA 1II5A 4DCXA 4DXUA 1Y20A 3IB1A 4LA9A 1B5HA 3VXCA 4XKPA 3IB0A 3L6HA 3TAJA 2NXOA 3TFLA 3QYTA 2DQVA 4NEDA 3LSWA 5B70A 5H8NB 4EXLA 4UA8A 2YPNA 2R71A 3OO9A 4OWDA 5JTYB 3Q28A 5ITOA 3SEYA 2DP8A 5TP9B 1FQEA 1IITA 4KCDA 1B3HA 2UYFA 4IO3A 5H8FA 3UK4A 3OSRA 2B3FA 4C0RA 4OFLA 5I2NA 1PC3A 1MH4A 3KEIA 3ZSFA 3BFUA 2HZLA 1MXUA 1SBPA 3RNNA 4GL8A 4IO4A 2VD2A 3OO8A 4R74A 1J1NA 4BDNA 2REJA 3O6GA 3PUZE 1H76A 1IEJA 4BDMA 3ZKKA 3DM0A 4P0GA 3U72A 4F3PA 2G93A 4XXUA 1URGA 3OELA 1ATGA 1EZOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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