3T9XB

Glutamate bound to a double cysteine mutant (v484c/e657c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLCREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKCFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9xB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9xB02
1B1XA 1ATGA 3CFZA 5JTYB 3JYRA 4IO6A 1POTA 1FQBA 5I57A 4POXA 1OLCA 4FEDA 2CZLA 4E0XA 3K1NA 3KOTA 4F3BA 1Y3PA 2GFEA 5KZTA 4G68B 2H5YA 2XXHA 2O6AA 1Y3NA 2NVUB 1EZPA 3DP4A 5HPQA 4DZ1A 4MBPA 3IJOB 4X1BA 5BWJA 1S50A 4LATA 4NF8A 2RINA 1D4NA 3U92A 3ILUB 1VFEA 1YTVA 4F1VA 3FATA 3PMXA 1M5CA 1N84A 1XHYA 4MFIA 2H25A 2OJTA 5ELVA 2DWAA 4GQOA 1SQYA 4M4GA 4QFPA 1ZMGA 1IZ1A 1IXIA 1OIBA 2V3QA 5H8NA 2HCAA 3B6TA 4OYVA 5I58B 2XD2A 1FQDA 4DLDA 4IGRA 5I56B 1LGBC 3OEMA 4ZEIA 4YKKA 1Q1KA 2UYEA 3P7IA 3O29A 1MXWA 4OETA 3IO6A 3MZ9A 4XKNA 4L17A 3IOUA 2DS9A 2ONSA 2V84A 2R71A 4NWCA 3Q28A 1N7XA 2VHAA 1US5A 4KI0E 1GTKA 4N6PA 1R9QA 2D3IA 1Y9UA 4EQBA 4HS7A 1PBPA 4LUBA 3K01A 4DXCA 4RPOA 1B3EA 2H98A 3C9HA 3TTRA 2IEEA 3DELB 1B7UA 4I8CA 1RKMA 3SEVA 1PB8A 2A5SA 4LZ8A 2THIA 3T96B 5K2YA 4BDMA 4OZ9A 2XD3A 3VLUA 2Q88A 3A3UA 4RK9A 4DXBA 5CMBA 2DXYA 2PT1A 2QS3A 2ZNSA 3VLVA 1MY0A 1SYIA 3C34A 5IKBA 2UVHA 4ELRA 3V5AA 5HM4B 3EHUA 2F6PA 2NUVA 2OWSA 5FHOA 1JVXA 2V93A 4GVOA 4XKQA 4QFOA 4F19A 4OFJA 4H5GA 5DT6A 4OENA 3H03A 4LONB 3S2VA 1XOCA 4HW8A 3T66A 1VSOA 3H4ZA 1LAGE 4EQ7A 1BP5A 4NF4A 3GZGA 5I59B 3HO7A 2GRVA 2Q2CA 2XX8A 2M8CA 2ZYOA 5AA1A 5ICTA 1DTGA 1XT8A 3C31A 1SW1A 3TFLA 2ZYKA 1MPBA 4DXUA 1TWYA 3OENA 3FXUA 2O7IA 3LR1A 4R9FA 4RPNA 3GLBA 1ZU0A 3FUZA 4F1UA 4BDNA 1GGGA 1A99A 4IO3A 2E0SA 2V3UA 4G77A 3G3FA 4ELPA 3F11A 3HPIA 3CFLA 4F2OA 3LSWA 3PPPA 3PU5A 4JDFA 3W9WA 2Y84A 4G8HA 2ESNA 3MWBA 3EN3A 5H8HA 3SEUA 2WKYA 3T9XB 4YB7A 3LUYA 3EHSA 3I3VA 1ELJA 4C1UA 1B5HA 4WKMA 1MH3A 3VXBA 2F6GA 5HBCA 2XHDA 4I62A 1POY1 3CSGA 4JXIA 3GBBA 5I2KB 3IJXB 1GVCA 3MJNA 1B52A 1LFHA 4XXUA 4N13A 4U2RA 3PPQA 5JTYA 3IK6B 2F5XA 1MDQA 4LZ7A 1B9JA 1MRPA 5B70A 4ZE9A 1F9BA 2BJJX 2NOOA 4G68A 1R9LA 4ZEBA 4YMBA 4BLAA 4NTLA 3G3GA 1SD3A 3T93B 2F97A 3ONMA 3FIRA 4OFOA 1B0HA 3WAFA 1FQEA 3C36A 1WDNA 4OMBA 3K4UA 5TU0A 4IO4A 2O1LA 3OEKA 3TPAA 4G68C 3K6VA 2I3WA 4PETA 3IX1A 4TLLB 4U4XA 1JQFA 2OK2A 3RT6B 4YB5A 2NXOA 2Z23A 1IXGA 3QSLA 3DM0A 2F34A 1B32A 3PPRA 1MY4A 3K2DA 5I84A 1TFAA 1D3KA 5I56A 1A8FA 3FASA 4GL0A 2V3TA 2OZZA 2RKMA 3VXCA 3ILTB 4NEDA 1FW0A 4RJZA 2DVZA 4DDDA 3U1OA 3VVEA 3LSFB 2E1SA 4C0RA 3MUQA 1AOVA 3HHFA 4RK2A 4P0IA 3ZS6A 1QULA 1IXCA 2QMXA 3E3KA 3QIMA 3RTFB 4FJPA 3M8UA 3PPOA 3OO7A 4H67A 1BKAA 4Q5TA 3PUYE 4BDOA 4OTEA 3PD8A 4MLQA 3FV1A 4TOZA 3TCGA 2VP1A 4HCWA 3O6HA 2FNCA 4NE4A 3IR1A 3K6XA 2YLNA 3DLNA 4NWDA 2RC9A 2CMOA 4JB7A 3U8QA 3OMBA 1LCTA 1B6HA 1NH7A 1N7WA 4F18A 5BUUA 1TFDA 3MAMA 3MVWA 4QF9A 4JBZA 2H99A 3U94A 1KWHA 2ALUA 4WEDA 4U21A 3PD9A 3G3IA 4NF5B 3E13X 4GIZA 3RUMA 1Z7ME 3FVGA 2QJEA 1LAFE 1SW5A 1ZKBA 1SW2A 2DE4A 1WODA 4LQ2A 3RY3A 4GF8A 3KN8A 3HV1A 4F3PA 3IB1A 4KCCA 3TELA 3KSJA 3GXAA 3N6UA 3CFXA 2HAUA 3RGYA 3KOSA 4ISUA 4F3SA 2GHBA 1IUDA 1IEJA 3TTKA 4LQ5A 3EQ1A 1QUJA 3MP8A 3TMGA 5I59A 2Z8DA 3FVNA 4G8MA 5EHMA 3IAZA 2O1MA 1Y4TA 1EU8A 2I49A 1NMUA 2XXIA 1FTJA 1H44A 5F7VA 2F36A 5FTIA 1QJMA 3OOAA 3OELA 3MQ9A 4KPTA 2UVJA 1IIWA 1QUKA 4OWDA 4DCYA 4YKPA 4AB6A 5TP9B 4QHQA 2XXPA 4EF1A 3MZBA 1HSLA 3O2AA 4LZ5A 5CMMA 4TQUQ 2UYFA 3H6WA 3E9XA 1VFDA 1TT1A 3PGFA 2DOJA 2ZYMA 1A55A 2R9JA 3IOWA 4PFWA 4NF6B 1CB6A 4EUOA 1LFGA 2ABHA 4KD5A 2OBGA 3SESA 4R75A 1FCKA 4LP2B 4R73A 3TUSA 4OFLA 4U23A 3FJGA 1URGA 3S9EA 4LA9A 2XXRA 3R7XA 3SKPA 2Z8FA 2RCBA 4JSOA 1JW1A 1MPCA 1FQFA 2Y7KA 1EZOA 3VLWA 5I2KA 3FZVA 1L5TA 1H43A 2PMSA 4P11A 4O3AA 2DSFA 1HSEA 3OO6A 3L6GA 2XXYA 1IXHA 3A09A 3H06B 1B3GA 3UN6A 3ZKLA 1FQAA 1LLSA 4ZEDA 4ESXA 2B65A 4ZS9A 3TYHA 3ZKKA 3JZJA 1QVSA 1MQDA 4U22A 4FE8A 4MLVA 3K6UA 3SEYA 1B40A 4YZZA 4KCDA 1DMBA 5CBRA 1YAEA 3S9MC 2AL4A 4BDRA 2DWHA 2D5WA 3OO9A 2B3BA 3KJTA 3G3JA 1S9TA 1B4ZA 1ANFA 1LB8A 3FXQA 4H0WA 5I2NB 2OLBA 2ZNTA 1M5DA 1Z7NE 1PDAA 4EQ9A 3A3CA 2QPQA 4WEPA 3O97A 4GL8A 2ZNUA 4R74A 5CRYA 3LSLA 4G4PA 3UK4A 1D9VA 1DTZA 3BKIB 4I1DA 2Z22A 1ZBMA 1XC1A 1ZJLA 2X7PA 4FIMA 1FTMA 4RXLA 1MPDA 4AB5A 1N04A 3QUJA 1LB9A 1DOTA 1SYHA 4EXKA 3CR9A 3IOTA 2ONRA 1MQJA 2F35A 1A40A 2REGA 3SERA 3RN8A 3PUXE 1QKAA 3GBAA 2B3FA 5AA3A 4DIGA 4FEBA 1LBBA 2IA4A 3O6IA 3W9VA 1NNPA 3MP6A 5FTHA 1FTKA 1B7HA 3G7WA 3WAEA 1I6AA 3KSXA 4ZZAA 2HQ0A 1JW5A 1AH5A 5H8SA 3DP6A 3TTNA 1MH4A 1I6QA 3KZGA 1B3FA 1D9YA 2HZKA 5H8QA 5M2VA 4KYSA 1P1QA 4RYAA 1UTBB 3UORA 2O84X 2I0CA 1BLFA 3LSXA 5CMKA 2AIXA 1MQHA 3MW0A 4I9DA 3O28A 4QSDA 4R6YA 1NL5A 4PFUA 3MZ1A 3S4UA 2XXUA 3IB2A 1MQIA 2OWTA 3QK6A 3K02A 4EF2A 1SBPA 5DEXB 4PFTA 2ZYNA 1MXXA 3N6TA 3KN7A 1QW0A 1R1NA 3TTLA 5ITOA 4IGTA 1H3DA 3Q25A 4KFQA 1HSJA 5L9OA 3S9LC 4OEUA 3LBSA 1EZ9A 4GOTA 3E4RA 4F1YA 3SDFA 1US4A 3PUWE 3T22A 4UA8A 3SEWA 1PB7A 5JEIA 1B2HA 3H7MA 2RF1A 2HFBA 2I4CA 1MY3A 4PP0A 3M3KA 2HAVA 1XS5A 2O51A 3C32A 5DTBA 4R72A 3V83A 1AL3A 2DWJA 3OSRA 4H5FA 2VD3A 1XVYA 3OO8A 1MXZA 5CI5A 4RY1A 1B7ZA 3LC8A 1JEUA 2DYXA 4POWA 5I58A 4ESWA 1O64A 4ZZEA 4R6KA 5TP9A 4O3BA 1B0LA 2GHAA 2F8DA 3OXNA 5L9MA 2D21A 4F39A 4NF4B 3O6GA 1JVYA 1N0TA 3CVGA 3OD7A 4Z7EA 2F78A 4OQOA 4ELOA 5F1QA 1A7LA 3FJMA 1P1OA 4IB2A 4NF6A 3R26A 4IO5A 2LAOA 3C33A 3G3HA 3H6TA 3QAXA 3MVZA 3K1PA 3PMWA 3B7DA 1OVTA 1LAHE 4R2FA 2O68A 1CE2A 4MF3A 3MBPA 3I6VA 4OHNA 3PPNA 3Q27A 4YKJA 1MQGA 3VV5A 3O9PA 3IO4A 5EYFA 4IY6A 4R6HA 1TXFA 1LAXA 5CC2A 1T0KA 2Y7PA 2RCAA 3KEIA 4JWXA 4R9GA 1LCFA 4RA1A 1B51A 2AYSA 2REJA 3RTWB 1PBQA 4MH5A 5AE4A 1MM7A 1S7YA 4HTGA 3M3LA 4KHZE 3DP8A 4JSDA 2Q2AA 4H8IA 4GD5A 2XX7A 1B46A 3K00A 4GFRA 1JNFA 2I48A 3K6WA 4YICA 4XTCQ 1B3HA 2YJPA 4GXSB 1OLAA 5DVIA 1M5BA 5TPAB 4Q8RA 2XXVA 3TCFA 4OESA 1O63A 3T9HB 1WVJA 4KQPA 3CRBA 4OXVA 5I2NA 1J1NA 3V8XB 4ELQA 1UQWA 3MC2A 5ITPA 2DE3A 1UTHB 2DWIA 4F31B 1I69A 5IAIA 4H8JA 1QUIA 4N07A 3CI8A 2FA7A 1P1NA 1JW4A 1FTLA 4LVQA 3OSQA 1URSA 5AA2B 4U4SA 1USYE 3K1MA 1P1UA 2QS2A 3BFTA 4ND9A 1SI1A 4FATA 5ISUA 4Z0IA 4GLIA 3RLFE 4E0WA 3VDFA 4XIGQ 3VVDA 4YB6A 1Y20A 5FHNA 1NFTA 2A5TB 2PBWA 2XXQA 5AA4B 1OMPA 2RC7A 3S9NC 1MY1A 5L9SA 4ONYA 1I6BA 2QSXA 2I4BA 4XKPA 1MG1A 4G2ZA 1XVXA 2Q8JA 2DQVA 3C35A 3H3GA 1USYH 1ZTYA 3C4MA 2F7AA 4QSEA 1A54A 3ECRA 4KR5A 3CSBA 3PMVA 1Y4CA 4EDPA 3H6UA 1MM6A 5A5XB 3IOVA 3D4GA 1N3XA 3MPLA 3MP1A 4IY5A 4YKIA 1UTBA 4TLMB 2VGQA 1SW4A 4KYEA 2O7UA 2ONKE 1M5EA 1MXYA 3MVXA 4R2BA 3R6UA 3HN0A 1VR5A 3HSTA 1OQHA 4OERA 5DEXA 3KJ7A 1B4HA 2YPNA 1N3WA 4UACA 3W15C 3TDJA 3KG2A 4YU0A 1URDA 4GXAA 3TZAA 3G3KA 1Q35A 4KYDA 4GRKA 2DXRA 1BTJA 2Z8EA 3N26A 4HCYA 2VOZA 3FD3A 5H8FB 3EHTA 1H76A 2OCUA 3QYTA 4G8NA 1RYXA 2HZLA 2VD2A 2I0BA 1DSNA 3VE1B 4FORA 5KDTB 5JK4A 2UVGA 3HCQA 4Q30B 2P1SA 3AXFA 5KCJB 2UXAA 5I57B 3MPKA 2H4IA 2PVUA 3VFJA 1NNTA 1QKBA 4THIA 4FAJA 4IO7A 4XKRA 2ZXTA 1NNKA 4F22A 2XXTA 3TQLA 3T9VA 2QS1A 4ECFA 5K2XA 4JWYA 1MDP1 5CMCA 5FHMA 2ZMBA 3QXMA 1NNFA 4F3GA 2QL3A 3RPWA 4NF8B 4X48A 3L6HA 1OVBA 3V89B 4U1ZA 1R6ZA 4ZECA 2PYYA 3B6QA 4QFLA 1ZIUA 3JV9A 3SEXA 2DP8A 1M5FA 2HEUA 1AIVA 3D4CA 2KLFA 1OQGA 3O66A 3RNNA 1P99A 4OVJA 1SDXA 3EF7A 3KGCA 5AA2D 2V25A 3UA8A 5H8NB 3FV2A 1SVXB 1N76A 2DE2A 4JWOA 1MXVA 1YPNA 1UIVA 4FECA 4F29A 4PFYA 3M3FA 1II5A 2P0SA 2R6GE 2X7QA 3RQTA 1B1HA 1FTOA 3TKDA 3TQWA 3B6WA 3BFUA 2XXWA 1LSTA 3U93A 3KN3A 3ODBA 2O69A 5LOMA 1UIUA 1B5IA 1PB9A 1PEBA 2H9BA 2QMWA 4C1TA 3N5LA 3USDA 1SI0A 1JEVA 4NF5A 5DYHA 5DVJA 1GV8A 5TPAA 1Y1MA 3PUVE 1B3LA 2G29A 3IORA 4ZE8A 4BDQA 4ZDMA 1O7TA 3PUZE 3BBRA 1LFIA 3T9UA 1EH3A 3MVYA 4M1VA 3IB0A 4PQJA 1UTHA 4QSCA 3PV0E 2Q9TA 4H65A 3TODA 1ZLQA 1B5JA 2I58A 3HHGA 1DPEA 2GH9A 1GR2A 2F7BA 2ANJA 3I5OA 1IQ7A 2AL5A 5J1DA 1IITA 1Y1ZA 5AA2A 2DVCA 5ICQA 3KBRA 5DVFA 5CM6A 2HXWA 3SETA 3UP9A 4DE8A 2PX1A 2XX9A 4OEVA 1H45A 5L8DA 4F2QA 2A5TA 4X1DA 1PC3A 2QS4A 5CBSA 5AA4A 3FVKA 2P2AA 1VE4A 2RC8A 4RNSA 2F7CA 3CG1A 2Y7WA 4QFNA 3CIJA 3IL1B 3Q29A 2X26A 4AQ4A 3FXRA 5A5XA 1NH8A 5B7DA 3RT8A 2Q89A 4YAHX 1MS7A 3THIA 2XXXA 3FGSA 4NMYA 3FJ7A 3UIFA 4IO2A 1Y3QA 2Y7RA 1FQCA 2G93A 4DCXA 1LBCA 1YCJA 4K3FA 4H1XA 4ZEKA 3TEPA 3TAJA 4X9TA 3TCHA 2I6EA 3ZSFA 3VVFA 3CG3A 4U1OA 4YMAA 4ZEFA 3EPEA 4Q0CA 3H6VA 3K0VA 4GWOA 3UGWA 1NKXA 1A8EA 2I3VA 2QRYA 5EHSA 5H8QB 4BDLA 5H8HB 4P0GA 2PT2A 4QRZA 1JETA 2UVIA 2FYIA 5H8FA 4O3CA 4WXJA 3TTMA 3KFMA 1B05A 2W7YA 1MXUA 1DPPA 2Y7IA 1MY2A 1B58A 3Q26A 3U72A 1RYOA 4H6DA 4EXLA 5KDTA 4QFKA 1BIYA 4PE5B 3QUFA 1AMFA 1P1WA 3FVOA 3N94A 2NWJA 5KCJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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