3TC7 | Genus

Total Genus 100

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	100
sequence length	251
structure length	251
Chain Sequence	PRYLKGWLEDVVQLSLRRPSVRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKDPSGLDVERDPIEYAKFMERYAVGLFISTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMYDFIVKESQIDDAYNLGADTVALIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIIINDENDLDIALRIGARFIGIAARDWETGEINKENQRKLISMIPSNVVKVAKEGISERNEIEELRKLGVNAFLIGSSLMRNPEKIKELIEGSLE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Sulfolobus solfataricus p2
publication title	Exploration of alternate catalytic mechanisms and optimization strategies for retroaldolase design. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Indole-3-glycerol phosphate synthase
total genus	100
structure length	251
sequence length	251
ec nomenclature	ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date	2011-08-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00218	IGPS	Indole-3-glycerol phosphate synthase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3tc7A00

3QYQA 5DBUA 4K8EA 1QOQA 5K9XA 1QAPA 3RK8A 5CKSA 3W7EA 1S5VA 1Q6OA 5DCDA 1W3TA 1R47A 4R33A 2XN1A 1LM1A 2W79A 4ONVA 2TRSA 2VFEA 3GXTA 4TMBA 3DFQA 3B4UA 3LV6A 4OU1A 4KWWA 2VEMA 3M5XA 2QCCA 1W54A 2A21A 2HTMA 5AHMA 3R8RA 2C18A 5KSWA 3NQ6A 2HSAA 1EEPA 4R53A 4JDBA 3ABOA 2Q8LA 3BARA 3LRLA 4FXRA 2TYSA 1TPFA 3GYEA 4NNCA 1H7XA 4JTEA 2FLIA 4NJGA 4KFPA 2O7QA 5FEWA 1LBLA 3E0IA 1QPOA 4GUJA 2B7OA 3W71A 4K7YA 1RV8A 2OZ0A 6ALDA 4Y9AA 3TQVA 4LS1A 5D04C 3T40A 5BMXA 3DGRA 4O52A 3THAA 3KAOA 1LORA 1FQ0A 2V5LA 3QZEA 1SR9A 2QUTA 3E12A 5L6UA 3C61A 3KVMA 3LERA 1KM5A 3B0VC 2ATMA 1R2TA 4GJ1A 5AHFA 2YSWA 3L66A 1MXSA 4GE8A 3GK0A 1O94A 1SZGA 3L5MA 3STFA 1TPUA 4POCA 5AHLA 3V75A 5LNSA 4WOQA 3LHTA 4M6QA 3GDLA 3TAKA 1KM2A 1VPXA 1SO3A 3NQ8A 3KVKA 3UZ5A 1TIMA 2W0UA 4DO5A 3HG4A 2ZZ1A 4JY8A 5I3HA 4WZHA 3L67A 4CQ8A 4KFNA 1P0NA 3R2GA 3DFTA 4FHAA 1GYNA 2ISVA 3NL3A 5A5WA 2ZBTA 4FX7A 3KRZA 1KFLA 5HMSA 4MFEA 2VEKA 1VC4A 4RX0A 3QMTA 3A22A 3C2OA 5AHNA 3NPXA 2CZDA 1MZHA 3N9RA 3FIGA 4NZFA 4IQLA 5EMUA 3IGUA 3F4WA 4QAIA 4Z08A 2YDAA 1Q6LA 4MZ8A 4HNUA 3MBDA 3GDRA 1TRDA 1TPB1 4GBUA 1TTJA 1RPXA 3QH2A 4JEQA 3OHIA 4IUOA 1SZNA 3TXZA 4UUIA 3PSWA 1H1ZA 1XBZA 3MBFA 2C13A 3W7HA 3EX1A 5F1VA 1EWDA 1UCWA 4JTGA 4FNPA 4KWVA 1NFBA 4ZQCA 3FFSA 4CLMA 4R7JA 1JCNA 3GNNA 3MP5A 4N02A 2E6DA 1YPIA 5EKYA 2EPHA 4PH6A 3ABRA 3HGSA 1ICPA 4XQ6A 1GQNA 2NXHA 2OCZA 4JICA 4O18A 1THFD 3I65A 3W7QA 4WXYA 1FY6A 1XDMA 1LZOA 1KFEA 1OJXA 1FDJA 3GDMA 3GB6A 4BK9A 1CI1A 3ATZA 2YYTA 5CPNA 4ALDA 3W85A 4IPJA 4O1CA 4P2VA 3L9CA 1WQ5A 1LRNA 3NPVA 1G6CA 2JK2A 3TNOA 2NWRA 1YXDA 5CPOA 1H50A 3DHFA 2DJLA 4XUGA 1X1ZA 2RDUA 2DU2A 2NV1A 3MI3A 2QF7A 3QQ0A 3T7VA 3I7RA 4MY9A 2FDSA 3BG3A 2WO5A 4XTIA 1FCQA 3BW2A 1YLVA 2CLEA 3QW3A 4JNMA 3C2RA 1WBHA 4JXCA 3TMQA 1RQHA 1KA9F 3LHVA 1EUNA 1VS1A 3MO7A 1GVRA 3CHVA 1XKYA 4O16A 4UC5A 1KFBA 4C1LA 4FIQA 2P0OA 1ZFJA 4MUZA 4Q4KA 1JUBA 3L0KA 3G3MA 1EPXA 1OX4B 4GWEA 4UR7A 4X3ZA 2ZTJA 1VJIA 1YXCA 5U7SA 3QPYA 1FWWA 3BPWA 2H3BA 1WV2A 1PIIA 2DZXA 3UPWA 1M7PA 5LHEA 3RMJA 2H90A 4ADUA 2YGYA 5CG7A 2VXNA 1TQJA 4JR5A 2J24A 4AWUA 3EXSA 2DJXA 5LSMA 3STEA 3HB9A 1SFJA 2DP3A 3MP4A 1TQXA 4IMEA 3LLDA 4PTNA 3HPZA 2GVLA 1EWEA 4RV8A 3WFAA 2J88A 5D05A 1F05A 1Z44A 1PVNA 2V2CA 1EUAA 1OFQA 1SSGA 5HUOA 1W8SA 1XCFA 3SGZA 3CC1A 6TIMA 3WK1A 3TSDA 1W5OA 3A5FA 3IVTA 4LY8A 3NL6A 1TO3A 2QUUA 1WX0A 4HPXA 4Z1CA 1NAL1 2KZHA 1GJPA 3G1FA 2GOUA 4NNBA 1OFPA 5AC8A 2CFFA 2V2DA 2IQTA 2V81A 3PUOA 1EIXA 3TH6A 3R89A 3BG9A 4MPQA 4AAJA 2A4AA 3M47A 4LU0A 2EHHA 3U2OA 4AF0A 2VC6A 1O95A 5LZLA 1TYGA 1ALDA 1KFKA 1W56A 4LC6A 3TW6A 1FCVA 3FEMA 3LCLA 3LCGA 3RU6A 2NX9A 4FNTA 3O6YX 1D9EA 1R2SA 2E6YA 3NDOA 5FF3A 4O0ZA 1FWNA 3ATYA 1JULA 3QF0A 4P61A 1XUZA 4N9DA 4CNPA 5HWMA 3Q2DA 3LHZA 4UCGA 4OE7A 1K8YA 3W73A 4IMCA 1VYRA 3GLCA 3W6YA 1T96A 4GC4A 1KTNA 4A3UA 1HUVA 4ADTA 2ZA2A 5KINA 3LV5A 3P8IA 2VOMA 4O17A 5EY5A 5D32A 4JTLA 4O4VA 3L65A 2ZYFA 3TSBA 1TPH1 1FBAA 1KLYA 5J5DA 4XKYA 1G69A 3TU9A 3A21A 3W1TA 3TXVA 2FJKA 1KLZA 2XFWA 3NA8A 4M7TA 3UZJA 2Y70A 5HQEA 1GTEA 5DN1A 2QAFA 4IOTA 4UTLA 3LB0A 3S5OA 2BZNA 1F2JA 1TV5A 3M5VA 2H6RA 5EYWA 4BI7A 4IMGA 3NG3A 1A53A 4OBTA 3TDFA 2ZZ3A 1FXQA 1JUKA 4AF0B 1TCDA 3DFNA 1WXJA 3LTSA 4JTFA 5D38A 4YXGA 5K3VA 3A9IA 5KMYA 3UY8A 3TC6A 1OX5A 1SZEA 2QCDA 4UMBA 5AC7A 4UTWC 1RQBA 1A5CA 1G4SA 3NR0A 1S3HA 1Z42A 1X7FA 3NQCA 5DCBA 3WJWA 3P74A 3BLIA 2C14A 4MY8A 1BKSA 3LCFA 1G4TA 3WJZA 1QDSA 3FS2A 3OEXA 1RD5A 2BWGA 5F4SA 1M6JA 4HIBA 3EX2A 3PG9A 5AYZA 5K9CA 1DHPA 1KM6A 1DJNA 4MKNA 4AHPA 3NQ7A 1PE1A 3I68A 4LVAA 2NXGA 2DORA 4IPIA 7TIMA 3SR7A 3G0XA 3P8JA 1W3NA 5HUPA 3O07A 2VFHA 1B4KA 1FXPA 2Y85A 4XKYB 1RZMA 2FIQA 3WJSA 3GKFA 3C2VA 4O10A 3ELFA 1VGAA 1SO5A 3M7WA 1H7WA 1L6YA 5F2GA 3DH7A 5G1TA 3MYOA 3NAVA 2YFOA 1K03A 1IXQA 2O7SA 4ORMA 3W7CA 3G18A 2GJNA 3EWUA 1RVGA 4GNJA 2E5CA 4O19A 4BI6A 2QCEA 1MEIA 1L6WA 3QEZA 4RCXA 3UNDA 4ORIA 1W37A 2J27A 3PAJA 5I3KA 3TAOA 2QCDB 3UWVA 2V2HA 1G67A 4AB4A 1B9BA 4YMZA 3MYPA 3W7RA 4I7WA 4LVFA 2QJGA 2PRLA 1JRCA 3N73A 2WKJA 2ZRYA 3B03A 3NL5A 1HO4A 3B8DA 1TTIA 4LT9A 1VR6A 3W1QA 4CNNA 2E6AA 2BX7A 3QPZA 1T0OA 3N34A 4JGDA 1K8XA 1TREA 1ICQA 4Y90A 1KFCA 4CCCA 3G1AA 3TR2A 1AK5A 5D33A 1PV8A 1XUUA 1TB3A 4Q32A 1P1XA 1OFAA 4U28A 4DF0A 5BNKA 1DQXA 3QSRA 5DLCA 3UWZA 1PCKA 4ZVJA 3DKJA 1JRBA 1SPQA 2Z0IA 1A50A 1P0KA 4NJHA 2Q3OA 3FKKA 1F5ZA 3MHGA 3O6CA 4S2BA 1NF7A 4O4WA 1KM4A 1I2QA 3DU0A 1ZNNA 4R34A 2CZEA 1JJKA 4DO4A 4AHOA 3ANYA 3TFCA 4FIRA 3UWWA 1PL9A 1B4EA 3LI1A 3PS7A 1QPRA 2ZRUA 3N2MA 1C29A 2DZPA 1SW3A 4DELA 1C9DA 4JYEA 3HGRA 4H6KA 3HF3A 3EWZA 2X1SA 3W1UA 1O4UA 4ZQMA 2OT0A 4JX4A 3W75A 1WAUA 4IWWA 3RFAA 3CEUA 3HOJA 3C52A 2R14A 4GUFA 3RNDA 1GEQA 2DZUA 2QEZA 2I9EA 2E5BA 3GR8A 1GVFA 2X1RA 1H7PA 1H60A 3W88A 2V30A 3THQA 5CZ0A 4CQAA 3T4CA 1DORA 1KM3A 3DHDA 3VKJA 4N4PA 1K7EA 5I3JA 3M6YA 4YL2A 3O05A 5DELA 3P61A 1WDWA 4ZMGA 2FB3A 2GQ9A 1AW2A 3G1DA 4LVGA 4NU7A 2DZSA 2BLEA 1B3OA 1PS9A 3EWXA 1Z48A 2A1YA 3NOEA 3SZ8A 5EBUA 4O1AA 4TIMA 4O57A 3VFLA 2B0MA 3W1NA 1ONRA 2OX1A 5KZDA 4NXKA 1SO4A 4RR4A 2ZQ0A 3S1WA 2VEPA 3NVTA 2CLKA 1VCGA 4UFIA 2PRHA 2Z6JA 1UUOA 2NWSA 3W2JA 3DFPA 4I7UA 1GPWA 1OABA 4BI5A 3DFSA 1QPNA 4MYXA 2CLMA 2ZZ5A 3S1VA 4OV4A 1OF8A 3EXTA 2ABAA 5I3GA 3ABSA 3JS3A 4DXVA 1FWSA 1G7VA 3CWNA 2NV2A 4FEZA 4PA8A 3G1VA 5F4WA 3CEPA 1UASA 3M0ZA 3WK2A 3W86A 4ZQNA 3MWAA 3IV3A 3L5AA 3KFTA 3P67A 4UTTA 3G1YA 1TPWA 1O5KA 2Y89A 3NQDA 4NT0A 5LNWA 4I7VA 2WNNA 4ICNA 3LXCA 3EEGA 5SWUA 1HL2A 5C54A 2ZZ2A 4WQ6A 1P5BA 5G1YA 5G5IA 3TQKA 1AL8A 1NF0A 5HR6A 3S1UA 3FKRA 2QR6A 3C2FA 1QFEA 3UWUA 1KTCA 4YCPA 3O63A 4AH7A 3ZR4A 3KVJA 3Q94A 3H55A 3PR2A 5CZTA 3DBPA 2W6RA 4DEFA 3GDTA 2WOQA 3P5YA 4UNLA 3UD6A 4NJIA 1VHNA 4PC8A 3I7QA 3MI6A 4YCOA 4DQWA 2PURA 4M19A 3CIWA 4LNYA 1MO0A 1TPVA 2P10A 2QKFA 3BLFA 2LLEA 1OX4A 4EIVA 3L2IA 1H62A 3S1XA 3EX6A 1I2OA 2B7QA 2FFCA 2V8ZA 2CW6A 1IXNA 5HR7A 1VLIA 3S5YA 3C6CA 4TMCA 2VENA 1YDOA 5AC6A 4O0KA 4Z1DA 4QITA 2C19A 4N2YA 5K4XA 4HPJA 3A23A 4LV4A 4PODA 4NQ1A 4JTHA 1QCWA 2QCHA 2WQPA 3FYPA 2TSYA 2ZZ6A 2J9XA 4IX2A 3A24A 4JDYA 1KM1A 3T55A 3IRDA 1VH7A 3L5LA 1F74A 3G0UA 1H61A 3HG3A 3C2EA 1OG0A 5FEPA 3LTPA 5HULA 3MW7A 4GRSA 4RLIA 1L6SA 3B04A 3BK0A 3GZ3A 1UBSA 5LKYA 1N8FA 4UNKA 2CWNA 2X1UA 3T44A 1I4NA 3NGJA 5FEXA 4M6VA 4HN4A 4JTSA 4JTIA 2C3ZA 4X2RA 3NNTA 4LW7A 4YLWA 4FX6M 4WJEA 3MMTA 2YYUA 4LS2A 1JR1A 3EXRA 3TIMA 5IBXA 1FCBA 3LHWA 2ZRZA 4UMAA 3W76A 2FQIA 3LCHA 1ME8A 3QC3A 5HNRA 4N4QA 1KM0A 4UTJA 3L0GA 4KKXA 5BW6A 4W9TA 3W84A 2WSYA 4N9CA 5E0KA 1A5BA 3FLUA 5G4WA 3RLUA 1TTPA 4WX2A 1OYCA 2WJZA 2GVJA 5CSSA 1LRTA 4Q33A 3NQGA 3MHUA 1YXYA 3STGA 4GUHA 4A22A 2A5HA 3OG3A 4O1BA 4O28A 4NNAA 4H4IA 3W7JA 1N55A 4JD4A 1YADA 4JTKA 4PCFA 3CT7A 5D2YA 3SW6A 3CWOX 2A2IA 1SQ7A 1KW1A 3P80A 2HMCA 4N6FA 2C15A 4UFJA 5AFDA 1OFBA 3LDVA 1VQTA 3LLFA 1I45A 3EX4A 3W7LA 2ZCGA 1AW5A 2RFGA 1DVJA 4QJ1A 3O8AA 3W2NA 3LTYA 1U5JA 3BG5A 3DENA 2E5DA 1NEYA 2RDWA 4OV9A 5MHBA 2CLIA 2EAWA 1H51A 2I1OA 4JX6A 3HG5A 4HNVA 1AG1O 4XBKA 4EF8A 1VLWA 3SSJA 1VCVA 1UJPA 2ZA3A 3NEVA 1YYAA 3UQNA 2TMDA 4GXMA 2Y6ZA 1OYAA 2E68A 3P84A 3C8FA 3S9YA 2Q8ZA 3DZ1A 5DXYA 3IIXA 4RZ4A 4HT3A 1ZCOA 3UY7A 5D02A 4Y6GA 1Q3NA 1MEHA 1XC4A 4M5PA 3QJAA 4BR1A 2PRMA 4FO4A 2NXIA 1GG0A 4IMDA 3C0JA 4L4MA 4JTTA 1BEUA 2C0AA 4DF1A 1TJRA 4QISA 4CCDA 4O53A 2ZFAA 2P1FA 3BGGA 1SO6A 3PB2A 3HG2A 3TKFA 4D2JA 3NXFA 1UUMA 5LHFA 5AYYA 4N9EA 3BW4A 2Y63A 3U6WA 3HPSA 1DOSA 3M5ZA 4FXSA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3TC7A

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