3TCOA

Crystallographic and spectroscopic characterization of sulfolobus solfataricus trxa1 provide insights into the determinants of thioredoxin fold stability
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
b'EDVTLVLTEENFDEVIRNNKLVLVDCWAEWCAPCHLYEPIYKKVAEKYKGKAVFGRLNVDENQKIADKYSVLNIPTTLIFVNGQLVDSLVGAVDEDTLESTVNKYL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystallographic and spectroscopic characterizations of Sulfolobus solfataricus TrxA1 provide insights into the determinants of thioredoxin fold stability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin (TrxA-1)
source organism Sulfolobus solfataricus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 30
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tcoA00
4KNDA 2GT5A 4TXVA 4ZXGA 2CZ3A 5D73A 1SJZA 3I9V2 1XZOA 1M99A 3CSIA 3WT1A 3BCKA 3MNGA 3IK9A 1MD3A 1MDIA 2L59A 1KBNA 3VWVA 4NHZA 3RAZA 1F2EA 4IN0A 2REMA 4GCIA 1H75A 1B9YC 5KN1A 4MH3A 3GTUA 3DD3A 3L0HA 4RQRA 4O5RA 2WDUA 4KUNA 1AUCA 10GSA 3GNJA 1DUGA 3BD2A 2B7JA 2GLRA 5G1KA 4PXOA 3LWAA 2WZ9A 2ZUPA 1NSWA 2K8VA 1PQNA 3KMNA 1U6TA 4DVCA 2CT6A 3KGKA 2G0FA 1FO5A 4V2LA 1EZKA 1W89A 2GT6A 3J7Yk 2GQKA 1R26A 3F3RA 1TTZA 1OKDA 6GSVA 1GSEA 3PINA 4MDCA 5IOWA 3HZ8A 4O32A 1O7UA 3MSZA 5CRWA 2H72A 3F4SA 1THOA 2HFDA 4XS4A 2K9FA 4L0UA 5J3RA 2WRTA 2J23A 3GRXA 4V1Ag 3ZIVA 4E8EA 2A4VA 4WBRD 1EGRA 1ERWA 1DE1A 3WGDA 3CRTA 2CV4A 5J9BA 3ZVJD 2ON7A 4ECJA 1A0RP 1A23A 1TI1A 2MMOA 3MAKA 5A5KA 2OADA 1K0MA 2FNOA 3CTFA 4IW9A 1YF1A 1WP0A 3E3EA 3UVHA 2XC2A 4KGIA 4Q5QA 2F8FA 3CBUA 3TDGA 3EU3A 1OAZA 5DALA 4KB3A 2KUCA 4MZCA 2VLTA 4L0WA 4QL7A 5ECPB 2GGTA 3J7Yb 2WCIA 4PGTA 2LJAA 5IPGA 3BCIA 4ZIJA 4TR1B 2PMTA 3HJMA 1PMTA 3UOMA 3C71A 1XBSA 1Z7RA 4OCFA 3RHCA 4N0VA 1SKRB 3TKSE 4HOJA 3DVWA 3TJBA 2L5OA 4IP1A 4IBPA 4HI7A 3A3TA 4MLYA 4TVEA 2XHFA 3DYRA 1SD9A 5IQYA 1HNCA 1K0CA 4G19A 2RM6A 3ISOA 5AIXA 1A2JA 5H5RA 5ID2A 1XOBA 4IVFA 5G5EA 1OE7A 2R6KA 1B8XA 1GNEA 1JZOA 5HR1A 1IYHA 4Q5NA 4TR3A 5F06A 3F0IA 1EEMA 5ECNB 2GSQA 2FWEA 3KJYA 3ERWA 1ACVA 5AN1A 2EC4A 4KSMA 3GN3A 4MK3A 2GVPA 4KX4A 1GSFA 4PNGA 3G7IA 4HJ2A 4OFTA 3G9BA 1V2AA 4I97A 4GXZA 1N2AA 2WB9A 2DJKA 4TRXA 5JWOB 3CTGA 2MMNA 1O8WA 4XRDA 3UL3A 2IMFA 4K9ZA 2LJRA 3ZIJA 1SKWB 3M1GA 6GSWA 1K3LA 2WJUA 1OVNA 1BJXA 1A8YA 4BPYA 2R37A 4JEDA 3UAPA 1SK2A 1ZOFA 3U5RE 2RUEA 3A5WA 3TKRA 2F9SA 3Q74A 3EE2A 3D0ZA 1JZWA 1GSQA 3GKKA 3CYNA 3E0UA 3US3A 3TRQA 4HJMA 2CVBA 2GSRA 1U3IA 3VI5A 4K8MA 1R5PA 5A4UA 4ULXA 1OE8A 1QK8A 2DLXA 2I3YA 1URMA 1PGTA 5ECIB 2C3NA 3IXRA 2O87A 2X99A 3GSTA 4CW9A 7GSSA 4H86A 4NAXA 1BG5A 4PUFC 2C80A 4I2TA 4V2NA 1Z6MA 4KH7A 4N11A 4KDXA 3SBCA 2H70A 3QR6A 3KP9A 5CRDA 1A2LA 2DMLA 2C8UA 3GHAA 1C72A 4BA7A 2VM2A 1SU9A 2BJXA 3LGCA 2OA7A 3Q6OA 2BTOT 2XPEA 1ZMAA 3LYKA 2YZHA 2LJKA 3TJJA 3HCZA 4WBJA 1EV4A 1BYEA 3NZNA 6GSSA 4BL7A 4D73A 1HNBA 1K0DA 4ECBA 5COHA 2DJ2A 2GSSA 1TW9A 3GUSA 3RHBA 3FKFA 2FCHA 2B3SA 4EVMA 3G7YA 5HR3A 4EE0A 3L9VA 2LRCA 1EOHA 4OO5A 2IMKA 4YQMA 3DEXA 4Q5RA 3IDVA 2PN8A 2IIYA 1SL2B 3L4NA 2GQMA 2P5RA 4LA1A 4RQXA 3ME7A 2FA8A 1Q4JA 1K3YA 4RI7A 1PD21 2V32A 3K8NA 3EVIA 1EP8A 4RI6A 1WJKA 3MDKA 1YZXA 2H1DA 3TOTA 16GSA 1M2BA 2YWMA 1QFNA 4POLA 5CRGA 2LQOA 2GZYA 2R2JA 3W8JA 2DJJA 3D21A 5ECLB 2GTUA 3IAM2 4KW6A 4K1FA 1TU7A 5F07A 2P5QA 4DSRA 2C3TA 2YWNA 4TXOA 3IRAA 1G7EA 1VGLA 4FYCA 1GH2A 4X0XA 1ML6A 3HVSA 3GSSA 4G10A 2LQQA 3FR6A 4NV2A 1TK0B 1X9WB 2AAWA 2PUKC 5G30A 3MWHA 1X9SB 4TXOB 2LS5A 1B48A 4DSSA 3TJKA 2X8GA 1O8XA 4TR4A 4XIHA 2HSYA 2N5FA 3EMXA 3IR4A 2E2MA 2P31A 3GYKA 4GTUA 1NW2A 1DE2A 3QFAC 1FB0A 4LL1B 1GLPA 1GTBA 3GIXA 3VPTA 5D8IA 1WPIA 1N8JA 4IKHA 1M0UA 3F6DA 1WE0A 1F3AA 1V98A 1U87A 1XW5A 2QSIA 5EVOA 2B1LA 1VF4A 2MYGA 2IJYA 5GAND 2OE3A 3CMIA 3P2AA 1V58A 2YWOA 1YF0A 1YKCA 2OACA 5IMZA 1TRWA 2K18A 5B7CA 1MTCA 2VIMA 1M7TA 1NHYA 3EYTA 5A4WA 1F9MA 1GULA 1M2AA 5JCWA 2C4JA 3LSZA 4V1Ap 1EWXA 1FHEA 2DBCA 3QAVA 6GSTA 3QAWA 5JCUA 5ECSA 1XPVA 1TKDB 1T3BA 3V1WA 1T1VA 2OKAA 3PGTA 1OC8A 3G7JA 1RK4A 4GQFA 3I69A 3UEMA 5B8AA 4EDZA 3QDNA 4MA9A 2MBTA 1WRYA 3HJPA 3QFBC 4MJCA 3W6GA 5IMFA 1ZYQB 2PVOC 3GKXA 2I1UA 3D22A 3VWUA 3H1NA 3ZMKA 4KA0A 2CVKA 3H79A 2WS2A 2VCWA 3IHQA 1QUWA 5CYYA 1AW9A 5JWQB 3VK9A 2B5YA 3GL3A 3E9JB 2ALBA 3GX8A 2VCXA 1OC3A 1PKWA 3ED3A 3HHVA 4WEYA 1J08A 2CAIA 2DMMA 1K3OA 2A2RA 1XWCA 3KD0A 4F0BA 2I4AA 2V6KA 2HYXA 4NHWA 1USBA 1BEDA 1S3DA 5CP1A 3GTUB 4MJEA 1G6YA 2LTKA 5IMVA 3QPMA 2VM1A 5ECQB 4F82A 2NDOA 5IPHA 1ZL9A 3ZITA 4ZB9A 2TRCP 3W8SA 5IOXA 1FW1A 4Q5FA 1EP7A 1F6MC 2V2GA 1XFLA 5D9VA 5ELAA 1V57A 1AAZA 2C3QA 6GSYA 3KZQA 1PL1A 2B5EA 2H0IA 5IMCA 2I81A 2WFCA 2F8AA 3RBTA 2L4QA 1UVZA 2E0QA 3FZ4A 4MCUA 1Q98A 1VF2A 4YH2A 3APSA 2HT9A 1SJ6A 1B4QA 2V41A 5JWRB 5D9TA 5F05A 3TJFA 4KDYA 2NVLA 3FRCA 3HYPA 4XS4B 3H93A 4TN8A 1K0NA 1HNAA 1T4ZA 5J5NA 4I2UA 1HQOA 2GDRA 2L5LA 3CXGA 5A4VA 4N10A 1OC9A 2LNTA 5JCGA 5C00A 4JR4A 4PNFA 4N0ZA 4OD7A 4IS0A 4ZBDA 2XBIA 4IQ1A 4G2EA 3CSHA 3TB2A 1OC9B 2VCQA 5DALB 4PQ1A 4OFMA 3TOUA 3M9KA 3LORA 1BAYA 18GSA 1UC7A 2HI7A 3ME8A 1F37A 1GUKA 1QMVA 2QC7A 2F3MA 1FG4A 6GSUA 3FY7A 2VL2A 4ZILA 1XCCA 1JLWA 2H6YA 5H5SA 3NOFA 4BWQA 4ISDA 2GZPA 3N9JA 2IFQA 2H1AA 3QMXA 1T7PB 5FHIA 4TKYA 3TGZA 3M8NA 4L5LA 3ZYWA 4FH8A 2PVQA 2H8LA 5ID2B 2B6MA 2X8HA 3M3MA 4PQHA 5GSTA 3HVVA 5IO0A 1ZZYA 1S3AA 2AV4A 4L8EA 4J2FA 3LEFA 1JFUA 2IWTA 2JADA 3GL5A 3L9UA 3LQ7A 1TK8B 2KOKA 4HU9A 4WF5A 4YQVA 1ERUA 3FR3A 3C73A 1ZGNA 2DSAA 2L57A 1SKSB 4OFNA 2JL4A 1YQ1A 4MF6A 4MZBA 4EF0A 1WOUA 4TOPA 5ECMB 1CQHA 1EOGA 2HNLA 3GX0A 5AISA 2LSTA 1ZYEA 4K0NA 2B7KA 4I6XA 1WIKA 3GKMA 4F0CA 4MF7A 5G1LA 5LCZA 2XPDA 1J9BA 3ZL5A 2ZCTA 2IMIA 5DDLA 4KE3A 3C8EA 1QGVA 2LNSA 1UN2A 4POMA 1O73A 5G2ZA 1M2DA 1PSQA 1G7OA 4K0GA 3ZRDA 5CO3A 2IMEA 5B8BA 5KN3A 1GSUA 4AF2A 3TRPA 2VD1A 5HFIA 3UMAA 2MMAA 1A24A 4XCSA 1IYIA 2R5GA 2YV7A 4MP4A 2LRTA 4WR4A 1GSYA 4FYUA 2H01A 1SD8A 3EU4A 3IV4A 5E4WA 2VL2C 9GSSA 3C1RA 4X43A 8GSSA 3HJOA 4EO3A 2DIYA 4JRRA 4GQCA 2FLSA 4OWYA 3O76A 4K7OA 4MPFA 1H4OA 1QXHA 1ABAA 1GLQA 1DSBA 3PH9A 4NWYA 1Z7PA 3EC3A 2C1YA 2YANA 2YNXA 4DSQA 3ZLPA 3FEUA 3Q19A 12GSA 2YV9A 2R3XA 3LFLA 1Z9HA 2PWJA 1AQWA 2TIRA 4POKA 4TW5A 5C04A 4IHUA 1GTIA 3BBYA 4CDOA 1XIYA 2X64A 3H4KA 5DCGA 3LYPA 3AY8A 1TK5B 1TU8A 3QCPA 1TP9A 2YN1A 3GKNA 2WGRA 5HFGA 4D73B 3A2XA 4ID0A 1A2MA 5CREA 3D5JA 1YEXA 3ZVJA 3EMPA 3HXSA 1M9BA 1QQ2A 5G5FA 3O3TA 5ABRA 4ML6A 5INYA 1PRXA 2Z9SA 3C7MA 1SK1A 1FOVA 2JU5A 2MBSA 5IMAA 3C1SA 4G9HA 4AJ7A 2F51A 3KIJA 3VPQA 1V40A 1SYRA 4ZL8A 1I5GA 1V9WA 5G31A 1T00A 3UJ1A 1SK0A 2HRNA 2B1KA 4LMVA 5D9WA 3I6AA 1B4PA 22GSA 2VCTA 2K6VA 3M9JA 4XRAA 1MD4A 1TOFA 2FHEA 3UARA 1KEBA 3RDWA 1JLVA 2H71A 3L9SA 2KP1A 2GZZA 5DAKA 1XWAA 4WXTA 4LMWA 4YQUA 2FA4A 2IL3A 4HZ4A 3R2QA 3WYWA 3BJ5A 2R4VA 3TKSA 4PQIA 2O8VB 2AUVA 2I9HA 2FUG2 1O6JA 2H66A 2LV3A 3ZMLA 2L6CA 1XW9A 2C0DA 3FHKA 4Z7XA 5IM9A 3KH9A 3IE3A 4QL9A 4DSSB 1TRUA 2KHPA 1XWKA 2H6XA 4IJIA 1LU4A 1SJIA 2LRNA 4PURA 5LD0A 1SL1B 1I9DA 1EGOA 1MDKA 1GSSA 6GSXA 1ERVA 4BWSA 1G6WA 3TKPA 2H76A 4HZ2A 1JZDA 2LUSA 2H74A 1RQMA 5GZZB 4WKWA 1B9XC 4BVXA 1S3CA 3QOUA 1TXXA 1AQVA 4HU7A 5DQSA 2O7KA 1FB6A 2ES7A 2HSHA 1TRVA 20GSA 5DBQA 4GLTA 4IP6A 2YZUA 1TJDA 5D9XA 1UA5A 3H8QA 4RUVA 5KEJA 2VOCA 4GRFA 3P8WA 2VL9A 5IIZA 2V6OA 3KP8A 5L71A 2CAQA 4N30A 5J41A 4O7HA 3KEBA 1EEJA 3P7XA 3EURA 5AGYA 4V2MA 4E8HA 14GSA 4EKZA 1Z3EA 2EIRA 2OBIA 2RM5A 4YAPA 4J57E 2L6DA 1Z5YE 3TKSC 2TRXA 3FK8A 3WGEA 1CQGA 1A8LA 2GQLA 4CHSA 3M0FA 1RW1A 2EIQA 2IN3A 3DWVA 1PA3A 5KN0A 1FAAA 3TUEA 4BVYA 1FVJA 1X5DA 2H0GA 2RIIA 2FD3A 2N5AA 3OR5A 4HDEA 4EXJA 4NPBA 2M46A 3HY2A 1FVKA 2O89A 3NIVA 2E7PA 2OE1A 2FWFA 4ZL9A 2KLXA 4HS1A 3UIWA 3GH9A 1E2YA 1ST9A 2LEGA 4MJBA 4P3YB 2JACA 4MJAA 1GL8A 2H30A 4ZB6A 1AC1A 1KTEA 3HZ4A 3LG6A 1WWJA 3UBLA 3SWLA 2ZNMA 1R7HA 2LKUA 5ENUA 4KDUA 5HFKA 2YPMA 2PERA 1GNWA 5F8BA 4JZQA 4OO4A 5D96A 1PKZA 3VFIA 5HR0A 1GTUA 4ACSA 4TR1A 3F4RA 5CRHA 1ZCPA 3VI7A 3LJRA 4ZBAA 4ECCA 3FZAA 3JCML 2M72A 1NM3A 4QQ7A 3ZFLA 3U6VA 2C0FA 2DIZA 2P0GA 3F4TA 1O81A 5GAPD 2YCDA 1AXDA 3EWLA 1LJRA 4AJ6A 2AYTA 2E2GA 3FW2A 4WR5A 2D2ZA 4OCEA 11GSA 2J9HA 3HVXA 4F2IA 1BX9A 4L5OA 3D6IA 4K7IA 1XOAA 3A2VA 1OYJA 2IMDA 2PPTA 4ZL7A 2NBSA 2YP6A 1X0RA 1GWCA 1VF1A 1F3BA 2DJ3A 2KP2A 3ZREA 4LL4B 1OKTA 2N5BA 4EL1A 2JZSA 4KCEA 2HLSA 2IFQB 3GURA 2H1GA 2HRFA 1X5EA 3WD6A 4EDYA 3L78A 1KNGA 2JZRA 3A2WA 2JSYA 3F3QA 4GSSA 3KM6A 4KSOA 5DQYA 4HQZA 1YKAA 3DVXA 1XVQA 3KTLA 2JSZA 4I8BA 4MH2A 1DBYA 4HQSA 1G0TA 1AIUA 13GSA 1SYXA 3HD5A 3ERGA 3KTBA 3HDCA 4NMUA 1SL0B 1E6BA 1YEPA 2C0EA 2MMZA 3GV1A 2FGXA 17GSA 1X5CA 5CNWA 3F9UA 4NXIA 1Y25A 3F63A 5EL8A 2L4CA 1THXA 3F6FA 1GSDA 4GF0A 1X9MB 1K0BA 2OBKA 4MABA 3UVTA 3QAGA 3P90A 1ON4A 3DRNA 5E59A 1O85A 2VLUA 2IPAA 3VWXA 3S9FA 2H75A 3VLNA 2X8CA 4JBBA 2RLIA 2PGTA 1Z6NA 1XXUA 4DEJA 3CSJA 4ILFA 2H6ZA 4TR0A 3APOA 2NPBA 2PBJA 4PX1A 1TDIA 2VO4A 2OJLA 2VUPA 3KH7A 2DJ1A 3GFKA 1JZRA 4FYBA 3I43A 1HD2A 4JR6A 2K8SA 3F8UA 3BOAA 2QGVA 1ERTA 4K7NA 4MMMA 3RPPA 3TKQA 4IJ3A 4ZB8A 3UBKA 4PUAA 5H5QA 4HEA2 2WULA 1NHOA 2GSTA 1YJ6A 3CRUA 3DIEA 3IA1A 5ELGA 1XVWA 3Q18A 1K0OA 5ECKB 4POBA 1PN9A 2AJQB 4HUAA 2AHEA 4ECIA 3TCOA 4IQAA 4OMVA 2BMXA 1AQXA 2VCVA 3EINA 5EY6A 4K2DA 2CX3A 2H0HA 2FWGA 3ZFBA 1SENA 3O6TA 1VRSD 4MF5A 1M9AA 1XW6A 1GTAA 2RUFA 5FT3A 1A0FA 4O92A 1GP1A 2VD0A 3WT2A 2G2QA 4XS6A 4GSNA 4IGJA 5B6NA 4EUYA 1U3AA 2VLVA 1PL2A 4I5QA 2HZEA 4XHMA 4NV5A 1GUHA 1Y6EA 5FWGA 5DVBA 4JU5A 3IAS2 3GA4A 3QD9A 3IOSA 3TJGA 2HE3A 2VL3A 4AGSA 5ECRB 2B5XA 4X1UA 2H19A 3DMLA 3D4TA 2HZEB 5DJLA 2CX4A 2A2SA 5J4UA 1W4VA 1XWGA 5J9CA 3FR9A 3FZ5A 4JE1A 1PX7A 3HKRA 1GRXA 1R4WA 5GSSA 3HA9A 3IPZA 1WMJA 5KN2A 4EC0A 4FO5A 4IELA 5D93A 3ZTLA 1TI3A 2DC5A 4F03A 4WF4A 1MDJA 4FIWA 2M80A 5ECHB 1T4YA 3FZ9A 3DGQA 3D4MA 1YY7A 3VURA 4KCAA 4F9ZA 19GSA 2HZFA 3VWWA 3KXOA 3PR8A 2FWHA 2CA8A 4YAVA 5DJMA 2CZ2A 3GH6A 2NTOA 2H73A 5EPFA 2GS3A 3DKSA 3DXBA 5DCHA 1XWBA 5DAKB 1U88A 4AJ8A 2QKEA 3APQA 3KMOA 3IK7A 3KCMA 2EIOA 2HXKA 2CVDA 4ML1A 5F0GA 4KAEA 4MZWA 2FY6A 2H1BA 3FYGA 1EV9A 5AIVA 3IBHA 2YWIA 2V1MA 4XS1A 4J56E 1ILOA 1HYUA 4XTSA 3ERFA 5CAXA 1JHBA 1GUMA 2JZTA 3IC4A 1TRSA 1YDKA 2AB6A 2CQ9A 1PX6A 3LXZA 2VAFA 5IMDA 5IO2A 2C0GA 2MZCA 2VCZA 1T8EB 4WETA 1K0AA 3LXTA 4K6XA 5ECOB 4LLRA 3GMFA 3ZZXA 4GSTA 1LBKA 2XBQA 2DJ0A 5HQPA 5HR2A 1J0FA 4GWRA 2PU9C 1VF3A 2ON5A 1MEKA 2YJ7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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