3TCO | Genus

Total Genus 30

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	30
sequence length	106
structure length	106
Chain Sequence	EDVTLVLTEENFDEVIRNNKLVLVDCWAEWCAPCHLYEPIYKKVAEKYKGKAVFGRLNVDENQKIADKYSVLNIPTTLIFVNGQLVDSLVGAVDEDTLESTVNKYL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystallographic and spectroscopic characterizations of Sulfolobus solfataricus TrxA1 provide insights into the determinants of thioredoxin fold stability. pubmed doi rcsb
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Sulfolobus solfataricus
molecule keywords	Thioredoxin (TrxA-1)
total genus	30
structure length	106
sequence length	106
chains with identical sequence	B, C
ec nomenclature
pdb deposition date	2011-08-09

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00085	Thioredoxin	Thioredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3tcoA00

3UIWA 3C73A 1V40A 3GRXA 2GT6A 1U3AA 1VF2A 4NAXA 5IO0A 1W89A 3VPTA 1BG5A 4H86A 3QAGA 3BBYA 4V2MA 1GLQA 3IRAA 1O7UA 2PVOC 3F6FA 1R4WA 2PPTA 4CW9A 18GSA 1PX6A 2GGTA 1F2EA 1A2JA 2RLIA 3U5RE 4Q5QA 3ZVJD 4MCUA 1WMJA 5EL8A 2I4AA 3ZFLA 2CVKA 5IQYA 4GSTA 4PQHA 1ILOA 5DCGA 2FWHA 1ERTA 2H19A 1WOUA 1YZXA 4KCEA 5B8BA 3LJRA 2QKEA 5CP1A 2LV3A 3GYKA 4AF2A 2C3TA 2WB9A 1GRXA 1XOBA 2H76A 3GA4A 4WR5A 1J0FA 3D4TA 1X9MB 1AQWA 5L71A 3WT2A 1X9WB 4MZCA 2H0GA 1TRUA 1TDIA 4AJ6A 3GSSA 2MMNA 4ZB9A 2DJ2A 4XRAA 4FYCA 1YQ1A 4LMVA 3EMPA 5JWOB 2IIYA 3BCKA 1SJZA 1G7OA 1ERUA 1FW1A 3HHVA 2DJ1A 3LFLA 1ERVA 3DVWA 1XBSA 5DDLA 3IAS2 3HVXA 4ACSA 1RQMA 4EDYA 3D4MA 2MZCA 1R26A 1OYJA 3SWLA 5HR2A 2PN8A 3VPQA 1IYIA 2M80A 3W6GA 2N5FA 5AN1A 4RI7A 4JR6A 2WULA 1K0AA 3EYTA 1JLVA 3ZITA 3J7Yk 3VI7A 1KBNA 2C0FA 5G1LA 20GSA 1KNGA 1XWKA 5E4WA 1URMA 3UVTA 4JBBA 1BAYA 4ECBA 5F05A 3ZMLA 1FOVA 1QQ2A 1XVQA 2FGXA 2VCVA 2H73A 4HS1A 4XS4A 2NDOA 4K7IA 1YY7A 2DSAA 3L9SA 1F6MC 5J9CA 5H5RA 1V98A 1VF4A 4IQAA 3VWUA 2IFQB 3WT1A 4OMVA 2P31A 1SYXA 4YAPA 5HR1A 5JWQB 2BMXA 2QSIA 4GLTA 1Q98A 2K18A 5ELAA 2KP1A 4QL7A 1K0BA 4BWQA 4MF6A 4IP6A 3HVSA 2ALBA 2P5QA 4OCFA 3C1RA 5JCUA 2VOCA 4IP1A 1AUCA 3C71A 2XPEA 4ZB6A 3EE2A 1RK4A 5ECRB 5IIZA 4TR4A 5FHIA 2PUKC 2VCWA 4ECIA 5D9VA 2VLUA 1B4PA 1LJRA 2IJYA 4J2FA 2K6VA 4KAEA 2HZEA 2KHPA 5EPFA 1OC3A 2ZNMA 2O7KA 5DBQA 2VLVA 3I6AA 10GSA 4ZL7A 5A4VA 2WRTA 3M9JA 1O81A 4I6XA 3MDKA 3IC4A 5DJMA 2X64A 1K0MA 2HI7A 5HR0A 3UBLA 3AY8A 4G10A 4K7NA 4XS6A 1TK0B 1VGLA 1WWJA 1M9BA 2L4CA 1JLWA 2LRCA 3GIXA 1YEPA 2VM1A 4L0UA 1O6JA 5JWRB 2LQOA 1HYUA 2PWJA 2DIYA 2AB6A 2HZFA 4D73B 4J56E 5H5SA 2QC7A 3FHKA 2JSZA 6GSTA 4KDUA 3BOAA 4HJ2A 1ABAA 5DQSA 4IQ1A 5LCZA 3IOSA 4NHWA 1AC1A 5AIVA 2L6CA 3GV1A 2H0IA 4POBA 3E9JB 3CSHA 5D96A 19GSA 4IW9A 3K8NA 1WJKA 2OACA 2NTOA 1ZMAA 4PURA 1Q4JA 3HA9A 3PR8A 4MJBA 1MEKA 4BVXA 3A2VA 3S9FA 3IDVA 1QFNA 1U88A 2VLTA 2BJXA 4HU7A 3CSJA 5ECKB 4PXOA 7GSSA 1PRXA 1GSDA 3FW2A 1A0RP 1VF3A 5ECSA 3Q74A 2VL9A 3ISOA 5KEJA 3ZTLA 4F82A 4AJ7A 4NXIA 1M2AA 1DBYA 1NHYA 4O92A 2YJ7A 2CQ9A 1T4ZA 3HKRA 1Z9HA 1B4QA 2YZHA 1Z5YE 14GSA 3UJ1A 1TK8B 4EO3A 22GSA 2O85A 2I1UA 1QK8A 1Z6NA 4POLA 3FR3A 2OE0A 4HI7A 4JRRA 3G9BA 2RUFA 1GTIA 3MNGA 1MDIA 4MH2A 5IMZA 4KB3A 4TR1B 1J9BA 2DC5A 1YF1A 4F0BA 5EVOA 4ZXGA 5H5QA 4TXOB 3TDGA 4NWYA 3LEFA 3QAWA 2TRXA 3F3QA 1X0RA 3GFKA 3PH9A 1XXUA 1HNBA 2KUCA 4MZBA 2H6XA 2XC2A 4NPBA 2RM5A 4TRXA 3FRCA 1M2DA 1YDKA 3ZYWA 2YANA 3DD3A 1M0UA 4NV5A 3GL3A 3QPMA 5D9WA 2LTKA 2AYTA 1OC9B 3KTLA 1YKAA 3EU3A 3RBTA 3I69A 1B48A 5FWGA 2IPAA 3GKKA 3N9JA 4HQZA 3FR9A 3QD9A 4DSSB 2GSSA 4YAVA 5AIXA 4FYBA 1U6TA 1XW9A 3H93A 1GTAA 1Z6MA 5ID2B 5DAKA 2L5LA 1SL2B 3F0IA 3ZLPA 3L0HA 3LG6A 2GSTA 4K0NA 1TI3A 5AISA 2R4VA 2FHEA 13GSA 1FVKA 5IPGA 1B9YC 3F6DA 1N8JA 3M9KA 2B5YA 4EVMA 3LSZA 3P8WA 1XZOA 1GSUA 2LKUA 3TJJA 2H01A 2CZ2A 5EY6A 3KZQA 4I2TA 2VUPA 4KX4A 2CVBA 3F3RA 1AXDA 2B7JA 4HQSA 3EMXA 6GSXA 2IWTA 4K7OA 1GH2A 1PL1A 5HFIA 5CRWA 2YP6A 1XW5A 3D0ZA 4MJEA 5B7CA 1SD8A 1KEBA 3IR4A 1TJDA 5D9XA 1G6WA 1NSWA 3GN3A 1Y6EA 4OFNA 4MZWA 3ME7A 2R5GA 3TKRA 6GSYA 2IMIA 2GLRA 4WR4A 4JR4A 2FLSA 1K0OA 2TRCP 2HE3A 1EZKA 2WGRA 4Q5FA 1LU4A 4LMWA 4N0VA 3KMNA 2H0HA 2GQLA 4PX1A 4G9HA 4V1Ag 1UA5A 2VCQA 3WYWA 1BJXA 1M9AA 4I2UA 1T4YA 2V1MA 3I9V2 1U87A 2HXKA 2IMDA 3M3MA 4GWRA 3QR6A 4ID0A 1PA3A 4OFMA 1HQOA 2WDUA 5G5FA 3ZIVA 2LNTA 3VLNA 1JZDA 5J9BA 5CREA 1B8XA 3RHCA 3GHAA 2JSYA 2NBSA 5ENUA 2M46A 3PINA 3Q6OA 2ES7A 2A4VA 2H74A 4PGTA 3GH9A 4KH7A 2C0DA 2VCZA 2G2QA 3IE3A 1GTBA 2EC4A 2AJQB 2XBIA 2B1LA 1F37A 3FEUA 1PMTA 4EL1A 1TRSA 1GUMA 3CMIA 3VFIA 3M1GA 2MMOA 5CRHA 1A24A 2HRNA 2VO4A 1OE7A 5HQPA 3IAM2 2M72A 4K6XA 1ZCPA 3A2XA 3VURA 1EEJA 2HNLA 3KEBA 1EP7A 4JEDA 4TR0A 3APQA 1F3AA 4KUNA 4ML6A 1K3LA 3KP9A 2LRNA 2VD0A 2V6OA 4POMA 4HU9A 1Z7RA 3LQ7A 1TXXA 3MSZA 5D93A 1V58A 3DXBA 1NM3A 4PNFA 2KOKA 3HJPA 3WGDA 1AW9A 2MMAA 4F2IA 2GTUA 2E2GA 3DEXA 5KN1A 2DJKA 3A2WA 2YNXA 3RHBA 5C04A 4N30A 4ZBAA 2JACA 1Y25A 4RUVA 2OKAA 2VL3A 1OE8A 2KLXA 2CZ3A 4ECJA 3FY7A 3LGCA 2N5AA 1ZOFA 1I5GA 3ERFA 4NV2A 4ZIJA 2YN1A 2V6KA 5ELGA 1O8XA 4KA0A 4KSMA 2H1AA 3GSTA 3FZAA 4MLYA 3FK8A 2OA7A 1F3BA 1GWCA 4ZILA 1PKZA 2PMTA 1V9WA 2CV4A 2FD3A 2R3XA 4WETA 1GSYA 1A2MA 1YJ6A 2E2MA 4I97A 4MDCA 1JZWA 1XFLA 1YF0A 5ECIB 2AHEA 3BJ5A 2WFCA 4X0XA 4EE0A 3EWLA 4N0ZA 3IHQA 4OO5A 1E2YA 5IMDA 4CHSA 3V1WA 3F4RA 3QFBC 2L59A 1USBA 2YOIA 5ECMB 3VI5A 3TOUA 3H79A 3KH7A 4EKZA 2HLSA 3QCPA 1C72A 4TN8A 4ZB8A 5LNKe 1NW2A 3GTUA 3F8UA 3LYKA 1YKCA 1KTEA 5DQYA 3U6VA 1HNCA 1AQVA 3KP8A 4L8EA 3GL5A 6GSUA 5A4UA 1CQHA 2H30A 4XTSA 1TI1A 4GRFA 1EV4A 4IJIA 2EIQA 2RUEA 2E0QA 4RI6A 5ECOB 3IA1A 1MD3A 1SKWB 3EURA 3M0FA 4MJAA 4HZ2A 3ZMKA 5ECPB 1A0FA 3KXOA 3O76A 3JCML 1EV9A 4KGIA 4K9ZA 2N5BA 2GSQA 2YWIA 4O32A 1N2AA 1X9SB 3TJBA 4POKA 3DIEA 5AGYA 4GSSA 2FY6A 5ECQB 4XCSA 2I81A 4EXJA 1PX7A 3CBUA 2LRTA 1GNWA 1TU8A 1PN9A 1S3AA 3GX0A 2H1DA 1A8LA 5J5NA 2X99A 3DKSA 1TP9A 3I43A 1OC8A 2IL3A 4ML1A 3E0UA 1K3YA 2XBQA 3KM6A 1QGVA 4PQ1A 2OBKA 2B3SA 2BTOT 5IMFA 4WBRD 4OWYA 3DVXA 6GSWA 4P3YB 5DALB 4G19A 4FIWA 4JE1A 1FVJA 3IBHA 2F9SA 1GULA 1UVZA 4DSRA 4KW6A 1T1VA 2YZUA 4WXTA 2CX4A 2L57A 1K0NA 5D9TA 3TJKA 1PQNA 3QFAC 3NZNA 4ZL9A 2HSHA 3WD6A 4XHMA 3GKXA 2C0GA 2H70A 1SJ6A 2Z9SA 1XOAA 4TOPA 5B8AA 1TW9A 2LQQA 3A5WA 3FYGA 3GH6A 2HT9A 4JU5A 4IKHA 4K2DA 1A23A 4PUAA 1XCCA 1X5DA 1BEDA 2F8FA 4HEA2 4YQVA 2FNOA 2WCIA 4PQIA 3TKSE 4MH3A 3TJFA 3ZZXA 1ZL9A 4HJMA 4TXVA 2ZUPA 5KN2A 3E3EA 2RM6A 2H1GA 1YEXA 1G6YA 1XWBA 1SJIA 4BA7A 2OADA 2L4QA 1BQ7A 2NPBA 3GMFA 5B6NA 1QUWA 2YPMA 1XVWA 4YQMA 2CX3A 4HDEA 1SD9A 4L5OA 4WBJA 3NOFA 5G1KA 5HFKA 3M8NA 1VF1A 2X8GA 1G0TA 4ZL8A 1GL8A 2PGTA 2GT5A 4YQUA 2IFQA 3QOUA 1GTUA 2J23A 4ISDA 1XWAA 1SYRA 3P90A 5CYYA 4EC0A 4LL1B 5KN3A 3D6IA 3TCOA 4F03A 4O5RA 5CRGA 4L0WA 5J41A 2PBJA 4X43A 2C8UA 2YV9A 4MA9A 2F51A 2KP2A 3RDWA 1NHOA 2A2SA 1S3CA 1PL2A 2F8AA 3DWVA 1A2LA 3RPPA 1SKSB 4QQ7A 4PUFC 3HDCA 2DMLA 1SL1B 1EGRA 3HZ8A 4LL4B 3HZ4A 3CTGA 3TRXA 4EF0A 5CO3A 3F4TA 2JZRA 1S3DA 2LSTA 1SENA 3G7IA 3TOTA 4WF5A 1GLPA 4V2NA 4GQCA 4MPGA 2PERA 8GSSA 2C3NA 3TUEA 1RW1A 4OD7A 3P2AA 2R2JA 3UMAA 16GSA 1PD21 2XPDA 2DMMA 3LXTA 2ON7A 1V57A 3GURA 2DJ3A 3FZ5A 4KDYA 1ON4A 4AGSA 1QXHA 4MF7A 5CAXA 4YH2A 3GNJA 2HZEB 1IYHA 4D73A 1TTZA 1EWXA 2FA8A 1HNAA 1GSFA 3LWAA 3CXGA 4I5QA 2TIRA 5E59A 2AV4A 4F0CA 4XIHA 2VD1A 1W4VA 2QGVA 3IPZA 4I8BA 1E6BA 1WRYA 2IMKA 6GSVA 5C00A 3N5OA 5KN0A 3MAKA 2H1BA 2YJHA 4HZ4A 2H6ZA 3PGTA 2WJUA 2B5XA 1ERWA 3RPNA 4GXZA 1PKWA 1XWGA 3FZ9A 3IK7A 1XIYA 4K0GA 4TVEA 3HD5A 4TKYA 5DALA 3TB2A 2YWMA 3GUSA 3ME8A 4GF0A 3VWWA 2C0EA 1GP1A 1K0DA 2CA8A 1GNEA 5IO2A 1T8EB 1SL0B 3G7JA 4DEJA 3UARA 4LLRA 4Z7XA 3F9UA 4F9ZA 3ZRDA 3KD0A 1SK2A 3LXZA 2VIMA 4DSQA 4RQXA 1EEMA 2IMEA 4FO5A 1T00A 2LJRA 2LNSA 5IOXA 4KSOA 3APOA 3WGXA 2XHFA 2B7KA 3ZL5A 1AIUA 3BD2A 3EU4A 1G7EA 4QL9A 4JZQA 1H4OA 2GQKA 9GSSA 1DSBA 1XW6A 3SBCA 2D2ZA 3HJOA 2CVDA 2H6YA 2VCTA 5COHA 2IN3A 2HRFA 3G7YA 3EINA 4MJCA 5G2ZA 1UN2A 4KDXA 3L9VA 2DJJA 3KCMA 5JCGA 4TR1A 3H4KA 4TXOA 4MPFA 2O89A 2R37A 4KE3A 4ZBDA 2LS5A 2F3MA 3L4NA 2LEGA 3GKMA 3H1NA 1SK0A 2VL2C 3IK9A 1T7PB 5DCHA 1EOGA 4AJ8A 4BPYA 5J3RA 2P0GA 3Q18A 4IN0A 4E8HA 3R2QA 4IS0A 1O85A 2WS2A 2X8HA 1TK5B 1SU9A 4PNGA 2GVPA 5D8IA 3TKSC 2LJAA 1ZGNA 2JZSA 5G5EA 1WE0A 5G31A 1OC9A 4J57E 3CSIA 2HYXA 4IBPA 5J4UA 1B9XC 1BX9A 3LORA 2LUSA 1EOHA 4DSSA 2FWEA 2K9FA 1M2BA 3KIJA 5ID2A 1FHEA 5A5KA 2H75A 12GSA 1R5PA 1EGOA 2YCDA 1JZRA 2X8CA 2GZYA 1TKDB 1TU7A 4MK3A 1SKRB 2FWFA 3TKQA 3D5JA 2REMA 4V2LA 2V41A 2K8SA 1PGTA 2MMZA 4ZBBA 3C7MA 3J7Yb 1GSEA 1JFUA 3WGEA 5IMAA 4LA1A 1UC7A 2V2GA 4TW5A 3A3TA 3W8SA 1M7TA 1K3OA 1MDJA 5G30A 1OVNA 2K8VA 2DBCA 1WPIA 1GUKA 1O8WA 5DAKB 3DRNA 4HUAA 3DGQA 2J9HA 1J08A 5ABRA 1O73A 2C3QA 3HYPA 3UVHA 5B6MA 4E8EA 2JU5A 5ECNB 3D21A 5GAND 2P5RA 2HSYA 3CRUA 4WEYA 2YWNA 2H8LA 4ILFA 1F9MA 4O7HA 2A2RA 1Z7PA 2HFDA 3F4SA 4BVYA 1ZYQB 2EIOA 2DJ0A 1TRWA 1THOA 1GSSA 1XWCA 5ECHB 4X1UA 3GKNA 3CTFA 3OR5A 3DYRA 3QMXA 4NHZA 3ED3A 1ST9A 2JZTA 2O87A 1OKTA 1BYEA 4GQFA 2G0FA 2LJKA 2OBIA 1U3IA 2DLXA 1HD2A 3L78A 4HOJA 6GSSA 3QDNA 4K1FA 1FO5A 5IM9A 2I9HA 3KMOA 1H75A 4ULXA 2VCXA 5IMCA 5A4WA 3H8QA 3US3A 3ZIJA 1ACVA 1TOFA 2CAIA 5JCWA 1ML6A 2B6MA 3O3TA 4XRDA 5GZZB 5INYA 1FG4A 4IGJA 5HR3A 4RQRA 2MYGA 3FZ4A 4NMUA 4BWSA 4Q5NA 1DE1A 3VK9A 3NIVA 4G2EA 2C4JA 1ZZYA 5F06A 3KGKA 4BL7A 4XS1A 1EP8A 3IXRA 1FB0A 1R5AA 2AUVA 5IPHA 1VRSD 5D73A 2GQMA 2WZ9A 1AAZA 5FT3A 3UAPA 1AQXA 1TRVA 2PU9C 4K8MA 5HFGA 1A8YA 2H71A 3DMLA 2GZZA 2H72A 1WP0A 1FAAA 4OO4A 3VWXA 2ON5A 4DVCA 2E7PA 4MP4A 3TGZA 4KCAA 2MBSA 2C80A 3BCIA 3TRQA 2GSRA 5F07A 3APSA 2C1YA 1MD4A 3GX8A 3KTBA 3KJYA 1MTCA 2RIIA 2PVQA 3ERWA 2OE3A 2CT6A 4N11A 1QMVA 1K0CA 3ZFBA 3Q19A 4Q5RA 2L6DA 3HVVA 4GCIA 3QAVA 4MMMA 3W8JA 1PSQA 1JHBA 2R6KA 1SK1A 3UL3A 2JADA 2JL4A 1V2AA 2GS3A 2VL2A 1FB6A 1GUHA 2FA4A 1THXA 1R7HA 4EDZA 4CDOA 2EIRA 3CYNA 1JZOA 3L9UA 3CRTA 2FUG2 3TJGA 5CRDA 4KNDA 4N10A 2NVLA 4IJ3A 2CAQA 3KH9A 2V32A 4TR3A 3HY2A 1GSQA 1DUGA 5F8BA 1LBKA 2GZPA 3TKSA 4IVFA 5F0GA 1XPVA 5LD0A 1M99A 3C8EA 3HCZA 1OAZA 2VM2A 2L5OA 4FYUA 3HXSA 4WF4A 3EC3A 5IOWA 2FCHA 2H66A 4V1Ap 1X5EA 2MBTA 4XS4B 3RAZA 3LYPA 4GSNA 2YV7A 3FR6A 2YWOA 3TKPA 2OJLA 3F63A 3O6TA 3D22A 3P7XA 3ZREA 3UOMA 2IMFA 4FH8A 5CNWA 5IMVA 2FWGA 3IV4A 1WIKA 1T3BA 2VAFA 4GTUA 4OCEA 5GAPD 4L5LA 4IELA 5GSTA 17GSA 1Z3EA 3EVIA 3ZVJA 4OFTA 2ZCTA 2B5EA 1DE2A 3MWHA 3GTUB 2AAWA 5DVBA 4EUYA 1MDKA 2I3YA 5ECLB 11GSA 5DJLA 3TRPA 1CQGA 3C1SA 3VWVA 1OKDA 2O8VB 4WKWA 3ERGA 3FKFA 3UEMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3TCOA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations