3TEPA

Lytr-cps2a-psr family protein with bound octaprenyl pyrophosphate lipid and magnesium ion
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
SEYSLSVAVLADSEIENVTQLTSVTAPTGTDNENIQKLLADIKSSQNTDLTVNQSSSYLAAYKSLIAGETKAIVLNSVFENIIELEYPDYASKIKKIYTKGFTKKVEAPKTSKNQSFNIYVSGIDTYGPISSVSRSDVNILMTVNRDTKKILLTTTPRDAYVPIADGGNNQKDKLTHAGIYGVDSSIHTLENLYGVDINYYVRLNFTSFLKMIDLLGGVDVHNDQEFSALHGKFHFPVGNVHLDSEQALGFVRERYSLADGDRDRGRNQQKVIVAILQKLTSTEALKNYSTIINSLQDSIQTNVPLETMINLVNAQLESGGNYKVNSQDLKGTGRMDLPSYAMPDSNLYVMEIDDSSLAVVKAAIQDVMEGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A widespread family of bacterial cell wall assembly proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule tags Transferase
molecule keywords CPS2A, Integral membrane regulatory protein Wzg
total genus 125
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03816 LytR_cpsA_psr Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.260.150 Mainly Alpha Orthogonal Bundle 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 3tepA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tepA01
2UVJA 3H4ZA 4ZS9A 2M8CA 3S2VA 3GXAA 4BDQA 3D4GA 1Y1MA 2ZYMA 3FVKA 3GBAA 4RK9A 2ZYOA 5EHSA 1A40A 2A5SA 4H5FA 4NF8A 4EQ7A 2UYEA 5DYHA 1LAGE 3LR1A 1A55A 1PC3A 1Y3NA 3O6GA 5I59A 4PETA 3S9NC 2F78A 3MQ9A 1LB8A 3JV9A 1Q35A 1MM6A 1VFDA 4LA9A 3W9WA 4OERA 5CMBA 1QW0A 2HZKA 1ZJLA 3T66A 2FA7A 3GZGA 3OELA 4KPTA 2DWIA 4EDPA 3MW0A 4FORA 2DXRA 2GFEA 4THIA 2H4IA 2NUVA 2OWTA 1S7YA 1PB9A 3FUZA 5CM6A 4UACA 1P99A 1SW4A 1B5IA 1XOCA 2F8DA 1B3HA 2HEUA 2VHAA 2Y7PA 2P2AA 2Z8FA 3PV0E 4G4PA 3PMVA 1B7ZA 3TYHA 4EF2A 5I58B 2XHDA 2XXXA 2O7IA 3QYTA 2REGA 2Y7RA 4PQJA 5A5XA 4Q8RA 2Q88A 4U21A 3E3KA 1YCJA 1LBCA 3KGCA 2R9JA 4MH5A 3PPNA 1M5BA 3TTLA 5BUUA 4R6YA 3EPEA 3K1PA 2UXAA 3MWBA 1MQHA 3FJ7A 5JTYB 4IO4A 2XXYA 5TP9B 3FIRA 3HV1A 3PMXA 3A3CA 5K2XA 4BDNA 1R1NA 2GHBA 4RK2A 3DM0A 4NTLA 5ITPA 4KR5A 1B9JA 2H98A 2P1SA 2NXOA 3H6TA 3GBBA 2ONRA 4ZE8A 3FZVA 2PVUA 4AB5A 1PDAA 1NNFA 2X26A 3N26A 4WKMA 1A7LA 1I6AA 1NNTA 1PB7A 2Y84A 3FV1A 2DXYA 4GL0A 2NWJA 4G68C 1MXVA 3G7WA 1D4NA 3G3JA 2V3QA 2RC7A 3RUMA 5AA1A 1MQGA 1FQCA 2AIXA 1F9BA 4PFTA 5CRYA 3IORA 4U1OA 2ZYKA 4ZEFA 5K2YA 3O6IA 3U72A 4Q0CA 3MZBA 1UIVA 1IIWA 1BTJA 3OENA 4QHQA 1RYOA 1MXYA 2E0SA 2D21A 2F7AA 1VSOA 2O68A 1B46A 2VD2A 3GLBA 4I1DA 2PX1A 3CFZA 4HCYA 3VVEA 1FCKA 2ZYNA 1B3LA 3VLWA 3DP8A 5ITOA 2AL5A 4JWYA 4YICA 2H25A 5DEXB 1B5HA 4OETA 2THIA 1DTZA 2ALUA 5AA2A 1UTBA 1N3XA 2Z8EA 5I84A 3K6VA 1MG1A 4EXKA 4OZ9A 1XT8A 5DTBA 4EQBA 5BWJA 1QULA 4OVJA 3CG1A 3OO7A 4R9GA 4FAJA 2PT1A 4BDOA 5KZTA 3C31A 3MBPA 3K00A 3IO6A 4ND9A 3VVFA 3HHGA 4OXVA 1I69A 3B6WA 4GWOA 4DDDA 1QUKA 1JQFA 2HQ0A 1JW1A 3CSGA 1O7TA 4KYEA 4QSDA 4XKPA 2G93A 1SW5A 4GIZA 3UORA 4ELOA 4QF9A 2KLFA 2QSXA 3O28A 4XIGQ 1R6ZA 1NNKA 4XKQA 2I6EA 1Y4TA 4I62A 3ZSFA 3DLNA 4Z0IA 2F7BA 2NVUB 3M8UA 4O3AA 3SEVA 4KI0E 1Y3QA 3H06B 3TTRA 4FATA 1MQDA 3A09A 1H45A 3CG3A 3TEPA 4OEUA 4XKNA 1Z7ME 1SI1A 4I8CA 3MVWA 1ZU0A 3EHTA 3E9XA 3HN0A 4KYDA 3N94A 3VE1B 4HTGA 1MXZA 3MAMA 4OENA 3OEKA 2DE2A 4ONYA 4TLLB 3RT8A 4EF1A 3KG2A 3AXFA 2XX7A 4H5GA 3USDA 4JWOA 1B3FA 1B52A 2X7PA 3EHUA 5CBSA 2UVHA 4LZ8A 3R26A 3LSXA 3FXUA 1AIVA 5I59B 1USYH 3G3FA 4ECFA 4RJZA 3ZKLA 4ZEBA 1SQYA 1MDP1 2DE3A 4R74A 2DSFA 3RLFE 3PMWA 1B4HA 4R75A 1B3GA 3M3LA 1MPCA 2ZNTA 2OLBA 4G77A 5TP9A 5A5XB 1WVJA 4JDFA 3G3GA 4ELQA 2YJPA 3K6UA 4YKJA 1N7XA 2ONKE 1GV8A 3K4UA 3VVDA 5AA4A 2A5TA 4R6KA 3MEJA 1US4A 3FJMA 5H8HB 5I57A 1CE2A 1H3DA 3T9UA 3TCHA 5IKBA 2QMXA 4DCYA 3PD9A 3TQWA 3MZ1A 1URDA 1FTMA 3C32A 1DTGA 3MVXA 5CMMA 3O6HA 5FTIA 1ZLQA 1GVCA 4BLAA 1XC1A 4P0GA 1DMBA 1JW4A 1P1QA 1VFEA 1LFIA 3B7DA 4IB2A 4PFUA 5FHMA 4ESXA 2Q89A 1TXFA 1ZIUA 1B32A 3K02A 4P11A 4ZZAA 4G8MA 4IO6A 4E0WA 1TFAA 3IJXB 3KBRA 4NF8B 3PE5A 5ELVA 3RY3A 1MXWA 2RKMA 2UYFA 3OEMA 3R6UA 1LCTA 2QMWA 1Y1ZA 4GXAA 3CSBA 4IO5A 2GRVA 4M1VA 4R2FA 3JZJA 2AL4A 4BDRA 3QAXA 3EF7A 4X48A 5HBCA 4P0IA 4YB6A 2Q9TA 5JEIA 1JEUA 2I3WA 3O9PA 1CB6A 4JWXA 4H1XA 4LQ5A 4N13A 4GQOA 1OLAA 4OWDA 3IL1B 4ELPA 5CC2A 2DWJA 3OO6A 2I48A 4YAHX 3RT6B 1XVXA 4YZZA 1AOVA 1AL3A 3RTWB 3FVNA 3S9LC 2R6GE 4LONB 4U23A 4XTCQ 5KDTB 4F3PA 3JYRA 1QKAA 3U8QA 4WEPA 4YKPA 2IEEA 3I5OA 2QRYA 3Q25A 4U22A 1XS5A 1ZTYA 3IOUA 3KJ7A 1OQGA 4NE4A 1JNFA 2RC9A 1NFTA 3TCGA 1B2HA 3PPOA 5TPAB 1DSNA 4BDMA 1ZKBA 3TQLA 2ZNUA 2O6AA 1QUIA 1M5DA 4XKRA 4R9FA 1AH5A 3IB0A 2QPQA 3H7MA 4RXLA 3RNNA 1UTHA 3VV5A 1JW5A 3KJTA 4KCDA 3SKPA 3IOVA 2B65A 3IO4A 5KDTA 1H44A 2H5YA 3QUJA 3IAZA 3FXQA 3I6VA 3P7IA 4HCWA 4YKKA 3D4CA 3PD8A 3IX1A 4QFNA 3TAJA 1UQWA 1TT1A 2DS9A 2Y7KA 4DLDA 4E0XA 4OFLA 2F97A 3RPWA 3W9VA 2XXRA 5CMKA 2V25A 4F39A 2O69A 1MPDA 1MPBA 2OBGA 4X1BA 3K1NA 4DIGA 1TFDA 1IEJA 1A8EA 1B7UA 4FJPA 1LFGA 5IAIA 3WAEA 1P1UA 1SD3A 2VGQA 3SEYA 3ILTB 4GD5A 2RCBA 3FASA 5L9OA 1QVSA 2PYYA 4FE8A 2D5WA 4WEDA 5HPQA 3VLUA 1LFHA 2Z22A 3MC2A 2O1MA 4GF8A 1FTOA 3MVZA 4JXIA 4RA1A 4LVQA 1RKMA 3UP9A 5H8FA 1SDXA 2PT2A 1D9YA 2UVIA 1UIUA 4JSOA 2DE4A 3KSXA 2DQVA 4PFWA 3MJNA 3OO8A 4POWA 5L8DA 1A99A 1NNPA 4O3CA 4F3BA 4F18A 2F5XA 1AMFA 1UTBB 3KEIA 3PUZE 2DP8A 3L6GA 3CIJA 4GFRA 5L9MA 1LAFE 1M5FA 3KOTA 3O66A 4H8IA 1POTA 4R72A 1EH3A 2A5TB 4RY1A 4ESWA 4R2BA 4OTEA 4GXSB 2OK2A 1II5A 1J1NA 2Q2CA 4GRKA 2Y7IA 4KCCA 3T96B 4BDLA 3IB2A 3H6VA 1MS7A 4F1VA 3K0VA 1SVXB 3K6XA 3T9VA 2FNCA 4F3SA 1MY3A 3OMBA 1KWHA 1NH8A 2DVZA 3H6UA 3Q26A 2I0CA 5H8QA 1FW0A 3SERA 4LATA 1M5EA 3MUQA 1B1XA 2QS2A 2XXVA 1FQEA 2HAUA 1R9QA 2XX9A 4R73A 5FHNA 4ZEKA 2IA4A 3TTMA 1EU8A 1JEVA 3B6TA 2V3TA 3KFMA 4FEBA 2Q2AA 2HCAA 3K01A 4G8HA 4M4GA 5I2NB 1L5TA 2B3FA 4DXCA 4N6PA 2ABHA 4NWCA 3TDJA 4QFKA 5H8HA 4JSDA 3TMGA 3WAFA 1PBQA 3H6WA 1N0TA 4DE8A 4YMBA 2E1SA 3V89B 4OQOA 1QJMA 1M5CA 1MDQA 1IXHA 1ATGA 4KQPA 1GGGA 2DWHA 3N6TA 3PPPA 4G68B 4OEVA 4EXLA 4F19A 3FGSA 1NKXA 1XHYA 2FYIA 2P0SA 3ECRA 1GTKA 3FVGA 1VE4A 2UVGA 4MLQA 4X1DA 5EYFA 2CMOA 3S9MC 1O63A 2XXQA 4OHNA 4F29A 3IK6B 3MP1A 2F35A 3SEWA 3UA8A 1LB9A 4NF6A 1PB8A 3PUYE 3U94A 3UIFA 1OIBA 1NH7A 2QL3A 1BP5A 5I56A 3VXCA 2XD3A 3FV2A 2OJTA 4IGRA 4F22A 2F36A 1EZOA 5KCJB 3FXRA 3OSRA 4FIMA 3EQ1A 5CI5A 4ZZEA 1LLSA 4IY5A 3FJGA 3LC8A 3PUXE 4NF4A 4ZDMA 3TPAA 4LQ2A 4QFPA 2I4CA 1MQIA 1YTVA 3C4MA 5AA4B 3K2DA 1BIYA 2G29A 3W15C 4MFIA 3SEXA 5JK4A 3QXMA 4RNSA 4OYVA 2XXIA 4U4SA 3T22A 2DYXA 4FECA 4F1YA 3CVGA 5I57B 1EZPA 1TWYA 5F1QA 2I4BA 4QFLA 5LOMA 3U93A 5H8NA 3E4RA 1Y4CA 3DELB 3CI8A 4O3BA 4QRZA 4H0WA 3HPIA 3UK4A 3HCQA 5KCJA 4TOZA 3PGFA 3OD7A 3MVYA 1SW1A 2RF1A 3TUSA 3V83A 1WODA 4OFOA 1B6HA 4QSEA 1R9LA 3IR1A 3Q29A 2HAVA 4POXA 4C1UA 1OMPA 3HO7A 1YAEA 3VLVA 2GH9A 3LBSA 3S9EA 4NF5A 4MBPA 3V5AA 1PBPA 3DP6A 1B05A 2XXWA 5HM4B 3UGWA 3QUFA 1YPNA 3KZGA 5J1DA 5AA3A 4KD5A 1IZ1A 1LBBA 3THIA 2OWSA 3QIMA 3R7XA 2B3BA 1ZMGA 3MPLA 3PUWE 1VR5A 4IO2A 1ELJA 3C35A 1A54A 1B51A 2VOZA 1UTHB 2I49A 2ZMBA 4LP2B 1I6QA 3M3FA 5H8QB 3RTFB 3SESA 1I6BA 1JVXA 1B1HA 1Y9UA 2O84X 2PMSA 3Q28A 3G3KA 4KHZE 4KFQA 3ILUB 2RCAA 2HFBA 5I2KB 3N5LA 3TTKA 4DXUA 2QS4A 1XVYA 3LUYA 3TCFA 4ZEDA 1LCFA 4YB5A 4PP0A 2H99A 2I58A 5H8NB 1Y3PA 2RC8A 2H9BA 1FTLA 3OO9A 1D9VA 1MY4A 3KN3A 4JB7A 3NXHA 1MY0A 3EHSA 1HSJA 3I3VA 2XXHA 1BKAA 3TFLA 3LSLA 2XD2A 5L9SA 3PU5A 5CMCA 1OVTA 1LSTA 2AYSA 5EHMA 3U92A 1MQJA 3O97A 4EQ9A 3C34A 4F1UA 3A3UA 4RYAA 1SYIA 2W7YA 2XX8A 4OBMA 3LSWA 3MPKA 2RINA 4IO7A 4G68A 1IXCA 1S50A 4H6DA 1NMUA 5FTHA 2I3VA 4PFYA 3SEUA 5AA2B 5B70A 1N76A 3NROA 1MH4A 1N84A 1OVBA 3ZKKA 1P1NA 5F7VA 4I9DA 3SETA 1B5JA 1JVYA 1EZ9A 1OQHA 3MP8A 2VD3A 4U2RA 1OLCA 2CZLA 2F6PA 1B58A 2GHAA 2QS1A 1B0HA 1PEBA 1URSA 3FATA 1JETA 3M3KA 4AB6A 3T9HB 4C0RA 5M2VA 5CBRA 4F31B 3H03A 4Q30B 4IY6A 1LGBC 1FTKA 3ODBA 2XXPA 1DPEA 1SYHA 2DVCA 3E13X 3KN7A 3MP6A 4NF6B 3T93B 3RGYA 5DVFA 3Q27A 3KSJA 4RPOA 1H43A 3CR9A 4GVOA 3BKIB 4OMBA 3HSTA 5ISUA 3BFTA 4YKIA 1P1OA 2ZNSA 1LAHE 1URGA 1US5A 4TQUQ 3OSQA 1BLFA 2LAOA 1MY2A 3L6HA 4H65A 2Y7WA 4UA8A 3TODA 3TELA 1MY1A 1QUJA 3IOTA 4EUOA 4Z7EA 5I56B 1IXGA 2QJEA 1Y20A 1SI0A 2HZLA 3OOAA 3PPQA 4G8NA 3VXBA 1A8FA 2ZXTA 2V93A 4ZE9A 5I2NA 1B4ZA 2DWAA 3BFUA 1LAXA 3B6QA 3CRBA 3K6WA 4OFJA 2PBWA 3TZAA 3DP4A 1Q1KA 4R6HA 4LUBA 4DCXA 1FQFA 4U1ZA 3C9HA 3HHFA 4IGTA 1T0KA 1FQDA 1O64A 4RPNA 4OESA 3VFJA 1MRPA 5DVJA 1DOTA 4Q5TA 1B7HA 2V84A 3F11A 3O2AA 2ONSA 3KN8A 4H8JA 4L17A 4ELRA 1FTJA 4ISUA 3CFXA 2WKYA 5FHOA 4AQ4A 1N3WA 4QSCA 1IITA 1SW2A 4F2QA 1HSEA 1DPPA 4NF5B 4XXUA 3QK6A 4HW8A 5JTYA 3C36A 4JBZA 1POY1 2NOOA 4DZ1A 2D3IA 5H8FB 1H76A 1N7WA 2HXWA 3TTNA 3ZS6A 4YMAA 2R71A 5ICTA 3T9XB 5ICQA 5I2KA 2XXUA 3RQTA 2I0BA 2Z23A 1MXUA 2YLNA 1USYE 1IXIA 3PUVE 1B0LA 3KOSA 1S9TA 4GOTA 2F7CA 4DXBA 2F6GA 3V8XB 2Q8JA 3EN3A 4F3GA 3OWQA 1WDNA 3G3IA 4N07A 2ESNA 2O51A 2DOJA 4YU0A 3QSLA 4DE9A 5DVIA 1D3KA 2XXTA 1MM7A 4HS7A 5H8SA 1P1WA 3IOWA 3LSFB 4QFOA 4ZEIA 1IQ7A 4FEDA 5I58A 3IJOB 3PPRA 4K3FA 4GLIA 1SBPA 3IB1A 3K1MA 4G2ZA 3VDFA 1ANFA 3OKZA 2ANJA 2OZZA 3H3GA 1HSLA 1FQAA 2VP1A 3TKDA 4NF4B 1QKBA 1RYXA 1FQBA 2F34A 2X7QA 4F2OA 1B3EA 3FVOA 2QS3A 3U1OA 1N04A 1Z7NE 1MXXA 2OCUA 1MH3A 2REJA 3CFLA 4GL8A 3G3HA 3S4UA 3ONMA 5AE4A 4IO3A 4MLVA 1B40A 1NL5A 4KYSA 3UN6A 1IUDA 4ZECA 2BJJX 3QFIA 4YB7A 4X9TA 4LZ7A 2O1LA 4MF3A 4U4XA 4C1TA 1ZBMA 3BBRA 5B7DA 3FD3A 2O7UA 5TU0A 2YPNA 4PE5B 4H67A 4NMYA 5TPAA 1GR2A 5AA2D 3O29A 3N6UA 5DEXA 5DT6A 3C33A 4NEDA 3RN8A 3MZ9A 4LZ5A 2V3UA 4WXJA 2Z8DA 4NWDA 3OXNA 4TLMB 3SDFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3S2VA 3D4GA 2ZYMA 4RK9A 2ZYOA 3GUUA 4H5FA 1LAGE 5I59A 3O6GA 3S9NC 3JV9A 4N17A 4OERA 3T66A 3GZGA 4PFRA 2DWIA 4FORA 1S7YA 1PB9A 3B50A 1JH9A 2F8DA 3TYHA 5I58B 3PMVA 2HXRA 3F51A 2XXXA 5ESYA 2REGA 2Y7RA 4YG7B 4EZIA 5A5XA 4U21A 1LBCA 3KGCA 2R9JA 5EQ8A 4R6YA 3EPEA 5J16A 3PMXA 3A3CA 1R1NA 5GAGi 4NTLA 2P1SA 2NXOA 2PVUA 2M4HA 2IVQA 3N26A 4O94A 2PXDA 2RC7A 1MQGA 1FQCA 2AIXA 1X2LA 4ZEFA 2VPOA 1QB2A 2BJIA 2D21A 5DT2A 1ZS4A 4HCYA 1FCKA 1RDYA 1FJ6A 1YXIA 1B5HA 1AWBA 4OETA 5AA2A 2P3NA 1UTBA 2R8TA 4OZ9A 1RZRD 4OVJA 4R9GA 4BDOA 3MBPA 3VVFA 1QUKA 1JQFA 2HQ0A 3CSGA 4QSDA 4N4UA 1SW5A 4HXVA 4MHFA 2QSXA 4QF9A 3O28A 2VEOA 1YYZA 4XKQA 2I6EA 4I62A 3OMTA 4O7IA 4O3AA 1Y3QA 3H06B 4OEUA 4XKNA 2V3CC 4I8CA 1ZU0A 3EHTA 3E9XA 4OVQA 4QBAA 1B3FA 2X7PA 3HZIB 4LZ8A 3GN5A 2PUDA 1USYH 4ECFA 4RJZA 3M3LA 2OLBA 3UFDA 4GBWA 4JDFA 3G3GA 4MNPA 1K9ZA 3K6UA 5EYHA 3MEJA 1US4A 3PD9A 3MZ1A 1URDA 2XXKA 1GVCA 1P1QA 1VFEA 4IB2A 4PFUA 4ESXA 3NDBB 3K02A 3IJXB 4NF8B 3PE5A 4GXAA 2RKMA 2UYFA 3OEMA 3R6UA 2J7UA 4BDRA 2GRVA 2I3WA 1CB6A 4MX6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1MH3 A;  3G3H A;  4MLV A;  2YBD A;  4O8M A;  4PAK A;  4YB7 A;  1X57 A;  2AXU A;  3FD3 A;  2O7U A;  1DCU A;  2YPN A;  4PE5 B;  2GZU A;  5TPA A;  3KC0 A;  3O29 A;  3N6U A;  5DT6 A;  4NED A;  3RN8 A;  3A29 A;  2HPG A;  3BIG A;  4X4F A;  5KDT B;  3SDF A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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