3TEPA

Lytr-cps2a-psr family protein with bound octaprenyl pyrophosphate lipid and magnesium ion
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
SEYSLSVAVLADSEIENVTQLTSVTAPTGTDNENIQKLLADIKSSQNTDLTVNQSSSYLAAYKSLIAGETKAIVLNSVFENIIELEYPDYASKIKKIYTKGFTKKVEAPKTSKNQSFNIYVSGIDTYGPISSVSRSDVNILMTVNRDTKKILLTTTPRDAYVPIADGGNNQKDKLTHAGIYGVDSSIHTLENLYGVDINYYVRLNFTSFLKMIDLLGGVDVHNDQEFSALHGKFHFPVGNVHLDSEQALGFVRERYSLADGDRDRGRNQQKVIVAILQKLTSTEALKNYSTIINSLQDSIQTNVPLETMINLVNAQLESGGNYKVNSQDLKGTGRMDLPSYAMPDSNLYVMEIDDSSLAVVKAAIQDVMEGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords CPS2A, Integral membrane regulatory protein Wzg
publication title A widespread family of bacterial cell wall assembly proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule tags Transferase
total genus 125
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03816 LytR_cpsA_psr Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.260.150 Mainly Alpha Orthogonal Bundle 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 3tepA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tepA01
1Z7ME 2DXYA 1MRPA 3UA8A 4H65A 4Q5TA 1N3XA 4R74A 3OWQA 4LZ8A 4KCDA 5FHOA 2RC7A 4QSEA 1Y20A 1NH8A 3S9EA 1BKAA 2O84X 5I84A 3SEYA 1P1NA 3B6TA 2O1LA 1IEJA 3O2AA 4ZEKA 2XXWA 3TTNA 1R9QA 4IO2A 1IXHA 3HHFA 2Q9TA 4NF5A 1VR5A 3LSWA 3TTKA 4G2ZA 2FA7A 4DCYA 5H8QA 1ZMGA 5EHMA 3C9HA 5AA4B 1JEUA 1D9VA 5FHMA 2QJEA 2A5SA 3ONMA 5HBCA 4G8NA 4QHQA 4NF6A 4HCYA 1JW1A 5ISUA 2AYSA 2QL3A 3MUQA 1D4NA 3FVNA 4ONYA 5ICQA 4ZEFA 2Q89A 3MBPA 4F3SA 4H5FA 1HSJA 4Q8RA 4GL0A 3SEVA 3KN7A 4GXSB 4G8MA 3I5OA 3PD8A 3JYRA 3QIMA 3TMGA 4PP0A 4MBPA 2DSFA 1DTZA 4FEBA 1A55A 3VDFA 2Y7RA 2XD3A 3S9MC 2ESNA 2DWAA 2Y84A 3PUZE 3K6UA 2QRYA 4H0WA 1B3GA 5H8HA 3RPWA 1OIBA 3OO6A 3RTFB 1JVYA 4KPTA 3CFXA 1RKMA 1ANFA 1FTKA 1B05A 4NF5B 4KHZE 2X26A 3UIFA 3N6TA 4OQOA 1Y4TA 3RNNA 4U4SA 4O3BA 5CMBA 1MXXA 1SDXA 2REGA 3FGSA 1OLCA 1TFAA 3G3IA 1N3WA 1SI0A 3HV1A 1ZBMA 4EQBA 4U4XA 4NF6B 2XXUA 3PPQA 2R71A 4I8CA 3PMVA 4LQ5A 3AXFA 4PE5B 4TOZA 1TFDA 1B7ZA 5I2NB 5CM6A 4I9DA 4RYAA 2UVHA 1LAGE 1N7XA 3KOSA 3GXAA 2HFBA 4QRZA 4LUBA 5A5XB 3KFMA 2O51A 3OO8A 3T66A 2VGQA 4QF9A 3U94A 1UIUA 1MPBA 2RKMA 1MDP1 4LP2B 4HCWA 3PUWE 4IO3A 5AA2B 2F97A 3W9VA 3ZKKA 2ZYNA 3E4RA 1SW2A 3TQLA 1MH3A 2A5TB 4XKRA 3S9LC 3OENA 2IA4A 1NH7A 3IORA 3KOTA 3TKDA 3IR1A 5I59A 4BDLA 2Z8FA 5JK4A 4DZ1A 2ZYMA 3EHSA 3K1PA 2DWIA 1YPNA 1II5A 4F18A 2DVCA 3A3CA 1Q35A 4AB5A 3LSXA 3FV1A 3CR9A 4HW8A 1AOVA 3MW0A 4OFJA 3MC2A 3LR1A 4KCCA 1VFEA 2R6GE 1B3EA 2QSXA 3P7IA 2HCAA 2V84A 3W15C 4EUOA 5F7VA 3OELA 2VP1A 4DLDA 1LFGA 3Q28A 2GH9A 4NE4A 1MQHA 4P11A 1P1WA 2UXAA 4JB7A 4FEDA 3O9PA 1PB8A 1B2HA 2UYEA 2DE3A 1A99A 4ZZAA 1ZU0A 3G7WA 3V83A 2I3VA 1MH4A 2QS2A 1SQYA 2HZKA 1A40A 1VFDA 2OK2A 3FZVA 5I56A 3VFJA 1MM6A 4GVOA 3UP9A 4FATA 4EQ7A 4YB7A 4ZEIA 1FCKA 1SVXB 2RF1A 3Q27A 3O29A 3SETA 3OD7A 1TWYA 3D4GA 4KYEA 1UTBA 1VE4A 3H06B 3IB0A 2Q2CA 4U1ZA 1OVBA 3FJMA 4IY6A 3TYHA 2DYXA 3K4UA 5KZTA 1B7UA 2Q8JA 3NROA 3CI8A 1B7HA 3FVKA 4YB5A 4KYSA 4ELQA 1YTVA 1R6ZA 1LGBC 1B52A 2H4IA 3CSBA 4FJPA 3PUYE 4TLMB 1JVXA 4R6KA 3USDA 4N07A 3K1NA 2E1SA 4ELOA 4R2FA 3O28A 4YKKA 4X1DA 3QYTA 1DMBA 4NF4A 1TXFA 1ZTYA 3OSQA 5K2XA 3B6QA 3VLVA 4PFYA 2D3IA 3PE5A 4BDNA 2DOJA 1M5DA 2I4BA 2Y7PA 3H7MA 5DYHA 2QMXA 3TDJA 3IJXB 3O6GA 1M5EA 4OFLA 3O6IA 2RINA 4MLVA 4RJZA 3MZ1A 2XXPA 2YJPA 1GGGA 4FORA 1PB9A 2X7PA 1YCJA 4F1UA 3N5LA 1S7YA 1PDAA 3V89B 2YLNA 4YKIA 4HTGA 3CFLA 1J1NA 1UTBB 3TUSA 2VD2A 3MJNA 5I58B 1LBCA 4RXLA 3QK6A 5I2KA 4OENA 2OBGA 2ONKE 3Q26A 2HAVA 3UK4A 1QKAA 4Z7EA 4LZ5A 5IAIA 5KDTA 1DOTA 1MY4A 2GHAA 3MPLA 1YAEA 2REJA 3MQ9A 3H6WA 4RK9A 1FTMA 4H67A 3LSFB 1MG1A 1B4HA 3QAXA 2O68A 1FQDA 4NF4B 2QS4A 4F19A 1LAFE 1ZIUA 5DVIA 5AE4A 4ZE9A 3QXMA 2Z23A 3W9WA 2LAOA 3C35A 1LAXA 3KN3A 2O1MA 4G8HA 4YKJA 1BTJA 5H8NA 2G93A 3K6WA 1PC3A 1URDA 4H1XA 4QFLA 4DXCA 1EZ9A 3QUJA 2OWTA 2DP8A 3TTLA 4EF2A 1M5FA 3SKPA 4OYVA 4M1VA 4WEPA 3OKZA 3T93B 4QFKA 1IIWA 1MPDA 2R9JA 1IITA 5I2KB 1SYHA 1DSNA 3PU5A 1B5IA 3RQTA 1B5JA 4OETA 3EQ1A 4DE8A 2XX7A 5H8SA 3GBAA 4Z0IA 5L9SA 4OBMA 3V8XB 2XXVA 1BIYA 1EZOA 4DXUA 2GFEA 5F1QA 4OHNA 2XD2A 4GQOA 3VE1B 5CMCA 4G68B 1MXVA 5BWJA 5I57B 4YAHX 1BLFA 1ZJLA 3A3UA 1UTHA 2ONSA 4EXKA 4TLLB 2ZNSA 4OZ9A 5EYFA 2B3FA 3IO6A 4ZEBA 1ATGA 5H8NB 2ZMBA 4KFQA 2HXWA 2VD3A 1RYOA 4E0XA 2DWHA 2Q2AA 3TPAA 4IO5A 3RT6B 2Z8EA 3MZBA 4I62A 1FTOA 3RUMA 5TP9A 1SW4A 3H6UA 3M8UA 4NMYA 4R6HA 1I6AA 5JEIA 1MY0A 4ZEDA 3OMBA 1MY2A 4X1BA 2UVJA 4F29A 5IKBA 4OEVA 4DDDA 3DP8A 2GRVA 2I6EA 3N6UA 2RC8A 4YMBA 1MY1A 3MP1A 1NNTA 1DPEA 1MDQA 2F6PA 2ZYKA 4GXAA 5H8QB 2F6GA 1PB7A 4HS7A 1B0HA 3OOAA 2NUVA 4LA9A 2NXOA 3BBRA 3EF7A 1A54A 2CMOA 4F1VA 1NNFA 4OERA 2Y7WA 3WAFA 5K2YA 3ZKLA 2I0CA 1GV8A 1AL3A 2XXXA 4G77A 4M4GA 4ECFA 2X7QA 1FW0A 3TCHA 1IQ7A 5H8FA 4JWOA 1MQIA 2O69A 2OZZA 1B3FA 1I6QA 2P1SA 3K02A 3FXQA 4O3AA 4F22A 5TP9B 2DE2A 4PFWA 4UACA 3B6WA 3TEPA 3MVYA 5H8HB 1LFIA 3C31A 3EHTA 4P0IA 2AL5A 3H03A 2NVUB 1UQWA 5DTBA 1AH5A 2I48A 1FQBA 3S2VA 1USYH 1WODA 3OXNA 1US5A 4DCXA 4NWCA 5DVJA 3T9VA 5DVFA 3SERA 1NNKA 4JSOA 1OVTA 1H3DA 4R72A 3FVOA 2PMSA 4PETA 4H6DA 1MQJA 5B7DA 4IO7A 4FECA 3O66A 5FTHA 2HQ0A 4YZZA 2PT1A 5ITOA 4GLIA 2F78A 1LAHE 5JTYA 4IGRA 5H8FB 1NKXA 1P99A 4RPOA 4ELPA 1BP5A 3KBRA 5ICTA 3IJOB 3UN6A 5AA2D 1B46A 2OCUA 2V25A 1B9JA 3K0VA 5L9MA 1SW5A 3U93A 3M3KA 5I59B 5CC2A 1IZ1A 3DELB 1US4A 1URSA 3O6HA 3QFIA 1QKBA 3R7XA 4MFIA 2THIA 3PPPA 4F2OA 1SBPA 2FYIA 3MP8A 4GL8A 4POWA 4IO4A 4LZ7A 1P1OA 3HO7A 1O63A 2F5XA 3THIA 4RNSA 4AB6A 2Y7KA 1JEVA 1N0TA 4LVQA 4ESXA 1R1NA 4WEDA 4NEDA 1B3HA 1I69A 5AA1A 2F7CA 4H8JA 4IY5A 1LSTA 4JDFA 2V93A 1QULA 1PBPA 3FD3A 2UYFA 3CSGA 3IOUA 4ISUA 3U1OA 2O7UA 5M2VA 1EU8A 4R73A 4QFPA 5CBRA 5I56B 4NF8A 1A8EA 2RCBA 2I49A 3TFLA 3K00A 3LBSA 3ILTB 4JXIA 1ZKBA 3O97A 4EF1A 2F7BA 1Y3PA 1Y1ZA 3KSXA 3VXCA 2H5YA 3MP6A 3T9UA 3K1MA 2Y7IA 4KYDA 3V5AA 2E0SA 2XXTA 1N7WA 4RK2A 3C4MA 3QSLA 4FIMA 4BDMA 4C0RA 1B40A 3BFTA 1JQFA 1FQFA 1S50A 1L5TA 4DE9A 1P1QA 3UORA 4WXJA 1SW1A 4XIGQ 4EDPA 3IOTA 3T22A 3KJ7A 4GD5A 3M3FA 4FAJA 1JW5A 1F9BA 2XXRA 3LUYA 4ND9A 2XX8A 3GBBA 1N04A 4OMBA 1PBQA 4BLAA 2H98A 3KZGA 4TQUQ 1CE2A 3EPEA 4BDRA 4QSCA 4LQ2A 1NFTA 1N76A 4F31B 1XHYA 3PPOA 4RA1A 4RY1A 2DQVA 2ONRA 1P1UA 1B51A 4I1DA 4QSDA 1JW4A 2M8CA 1NMUA 1WVJA 3H6VA 1O7TA 1H76A 1MM7A 2DXRA 2DE4A 4FE8A 1DPPA 5B70A 5KCJA 1SD3A 3HSTA 1LBBA 5AA4A 4NF8B 4U1OA 1B58A 3E3KA 2F7AA 1B1HA 5DEXA 4BDQA 2O7IA 2Z22A 1I6BA 3SEUA 2RC9A 2UVIA 1D3KA 1SYIA 4AQ4A 3DP4A 1OQHA 4THIA 4GRKA 4RPNA 5HM4B 4ZE8A 5FTIA 3RY3A 4G68C 4ZDMA 3IX1A 4XXUA 3K2DA 3DM0A 2P2AA 2V3UA 2XX9A 3ZS6A 3SESA 4R75A 2H25A 4N6PA 2H9BA 2QS1A 4GWOA 1XVYA 2CZLA 3B7DA 1POY1 3G3HA 5KDTB 4H5GA 3JZJA 1OMPA 3KG2A 3KGCA 1JETA 2G29A 3CVGA 4OWDA 4ZS9A 5FHNA 1FQCA 4PQJA 3N26A 3RLFE 2XXHA 3N94A 3MPKA 4PFTA 1GVCA 5CMMA 4F3GA 3VV5A 1IXIA 5J1DA 4BDOA 2F8DA 2H99A 1MXUA 5CBSA 4OVJA 4YICA 3HPIA 3CRBA 2HAUA 3TQWA 1H44A 5KCJB 2V3TA 2HEUA 2ZYOA 3GLBA 5BUUA 4N13A 4KI0E 1QUJA 4EXLA 1PEBA 1FTJA 4F3BA 5DEXB 1OLAA 2GHBA 3SEWA 3PMWA 3MZ9A 3OEKA 3VXBA 1UIVA 2VHAA 3IOVA 3TZAA 1QW0A 3BKIB 5I2NA 3PGFA 3ECRA 4LATA 4EQ9A 3TTMA 4XKPA 3PPNA 5A5XA 2PBWA 4POXA 5DT6A 1XVXA 1LFHA 3S9NC 4ZECA 2F34A 5AA2A 3OEMA 3RT8A 4OXVA 3HN0A 4QFOA 3MEJA 3IO4A 3T9XB 3U92A 2A5TA 4XKQA 2B3BA 4OFOA 3G3JA 1D9YA 2XXYA 3PUVE 4LONB 1NNPA 3D4CA 2OJTA 1XS5A 4DXBA 3PV0E 4X9TA 3H6TA 4U21A 3FXRA 4C1UA 3K01A 1XC1A 1DTGA 3TAJA 2OLBA 5CI5A 4H8IA 3SDFA 1MS7A 3MVZA 3UGWA 2I0BA 1UTHB 4KR5A 2D21A 3TODA 1B5HA 2WKYA 1VSOA 3IL1B 2W7YA 4ZZEA 3FXUA 1RYXA 3HHGA 1B6HA 3RN8A 3IK6B 3RGYA 4YMAA 3L6GA 5ELVA 2DWJA 2F35A 1NL5A 3S4UA 3I6VA 2ALUA 4ESWA 3IAZA 3ILUB 3FUZA 2I3WA 1Y4CA 3SEXA 3IB2A 1GTKA 1KWHA 2ZNUA 3KSJA 1T0KA 1S9TA 3BFUA 3IB1A 1H43A 4U23A 2YPNA 3CG1A 3DP6A 3CIJA 4UA8A 3TCGA 3HCQA 3WAEA 2VOZA 4GOTA 4QFNA 4K3FA 4MH5A 4X48A 4KD5A 3KN8A 4JBZA 2QMWA 1ELJA 3A09A 3VLUA 4U2RA 3FASA 2RCAA 1MXZA 4OEUA 3FVGA 2HZLA 2PX1A 3C34A 4O3CA 1AMFA 3JV9A 2NOOA 3I3VA 3G3GA 3K6VA 1HSEA 3OSRA 4MF3A 4NWDA 3MVWA 1HSLA 1LB8A 1M5BA 3H3GA 4NTLA 1XT8A 3U8QA 4JWXA 1FQAA 1B3LA 1LCFA 4GIZA 3EN3A 4U22A 5TPAA 3G3FA 5HPQA 2AIXA 3PUXE 3FJGA 3ZSFA 3PD9A 3Q25A 4JSDA 1OQGA 3E9XA 1N84A 2P0SA 3DLNA 2V3QA 2KLFA 2I58A 1MPCA 1URGA 4PFUA 2Q88A 5AA3A 2XHDA 2DVZA 2UVGA 4C1TA 3VVEA 5I58A 1MXYA 4Q30B 4GF8A 1M5CA 1CB6A 4F2QA 2PT2A 1IXGA 3PPRA 1MXWA 3MAMA 3F11A 4JWYA 1MQGA 3U72A 1Y1MA 3OO7A 1WDNA 1GR2A 4GFRA 1LCTA 1R9LA 3L6HA 4L17A 2PYYA 4R2BA 2FNCA 3MWBA 3Q29A 4OESA 4IB2A 4XTCQ 4WKMA 2NWJA 2F36A 3VVFA 1EH3A 3G3KA 1AIVA 1O64A 1LLSA 4ELRA 5JTYB 2XXIA 2QPQA 3CG3A 5TPAB 3FIRA 1A7LA 4F3PA 1QUKA 3K6XA 4YB6A 1Z7NE 5TU0A 5L9OA 2AL4A 3KEIA 4R9FA 5CRYA 5L8DA 1B0LA 1H45A 2OWSA 4MLQA 2D5WA 1B4ZA 3FJ7A 3QUFA 4E0WA 3FATA 5LOMA 2DS9A 3VLWA 3VVDA 1Y3QA 3MVXA 3EHUA 5CMKA 4F1YA 1EZPA 1Y9UA 3KJTA 3TELA 3ODBA 1FQEA 1SI1A 4YU0A 3M3LA 3C32A 2I4CA 3PMXA 5ITPA 4IO6A 3LC8A 1MY3A 1LB9A 3R26A 4OTEA 3T96B 1IUDA 1JNFA 2ANJA 3NXHA 3C33A 1ZLQA 2ABHA 4DIGA 3RTWB 1QVSA 3FV2A 1IXCA 3TCFA 1FTLA 4R6YA 4F39A 2PVUA 2BJJX 2QS3A 1QJMA 1Q1KA 2Z8DA 3T9HB 4XKNA 1MQDA 4KQPA 3IOWA 1POTA 2ZXTA 4P0GA 3E13X 3H4ZA 3CFZA 2XXQA 2IEEA 3GZGA 4G68A 4IGTA 4YKPA 2B65A 5I57A 3TTRA 1TT1A 2O6AA 4G4PA 2ZNTA 1A8FA 3C36A 1QUIA 1B1XA 4Q0CA 1Y3NA 1B32A 3OO9A 4R9GA 3R6UA 1XOCA 3LSLA 5EHSA 1USYE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Z7ME 2LYPA 4MEVA 2XWKA 2DXYA 1MRPA 3HFUA 4PGNA 3UA8A 4H65A 4Q5TA 2PXQA 3LQXA 1N3XA 4R74A 3OWQA 2GZUA 4LZ8A 4KCDA 1HF0A 4X8RA 1G0HA 3QQ6A 5FHOA 2RC7A 4QSEA 1Y20A 1NH8A 3S9EA 1BKAA 4GWWA 2O84X 5I84A 3SEYA 3RPLB 1P1NA 3B6TA 2CSFA 1IEJA 2O1LA 3O2AA 1XI6A 2HXRA 2MQKA 3ZHMA 4ZEKA 2XXWA 3TTNA 1R9QA 1RPEL 4IO2A 1WH6A 1IXHA 3HHFA 2Q9TA 2PUGA 4NF5A 1VR5A 2PXLA 1JWLA 3LSWA 3TTKA 4G2ZA 2FA7A 4DCYA 5H8QA 4HE1A 1ZMGA 5EHMA 3RYDA 3C9HA 5AA4B 3ZHIA 1JEUA 1D9VA 5FHMA 4NQ8A 2QJEA 2MKZA 2A5SA 3ONMA 5HBCA 2LYKA 4G8NA 4QHQA 4NF6A 1YXIA 4HCYA 1JW1A 5ISUA 2AYSA 2QL3A 3MUQA 4N91A 1D4NA 3FVNA 1AU7A 4ONYA 5ICQA 2D5VA 1LBZA 4ZEFA 2Q89A 3MBPA 4F3SA 4H5FA 3OP9A 1HSJA 2XWIA 4Q8RA 4GL0A 3SEVA 3KN7A 4GXSB 4G8MA 3I5OA 3PD8A 1JH9A 5EQ9A 3JYRA 3QIMA 2PXPA 2JVLA 3TMGA 4PP0A 2PUBA 2KQZA 4MBPA 3ME5A 2DSFA 2YBDA 1DTZA 3NDBB 4FEBA 1ZZ7A 1A55A 3VDFA 2Y7RA 1FBFA 2XD3A 4JVCA 4N8GA 3S9MC 2ESNA 2DWAA 4GWXA 2Y84A 4N6DA 3PUZE 3K6UA 2QRYA 4H0WA 1B3GA 5H8HA 1NV1A 1U2ZA 4KXPA 1ZVVA 3RPWA 1OIBA 4Z5CA 4YBAA 1PNRA 2EWTA 3OO6A 3RTFB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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