The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
58
|
structure length |
58
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLDP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
High-Resolution Crystal Structure of Spectrin SH3 Domain Fused with a Proline-Rich Peptide.
pubmed rcsb |
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, brain
|
| molecule tags |
Structural protein
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| source organism |
Rattus norvegicus
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| total genus |
12
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| structure length |
58
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| sequence length |
58
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-08-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2L0A A; 2DA9 A; 2KXC A; 3QWX X; 5GJW B; 1VYV A; 1WLP B; 2DJQ A; 2LQW A; 2M51 A; 2W0Z A; 4LUE A; 3RNJ A; 4AFU C; 1I0C A; 1UFF A; 4HVU A; 4AFZ C; 2KYM A; 1NEB A; 1AWO A; 2CT4 A; 4AG1 C; 3UA7 A; 2ECZ A; 1AOJ A; 5HCK A; 1JEG A; 1I1J A; 2YUO A; 2HDA A; 1UTI A; 2DF6 A; 4CC4 B; 2ED1 A; 4FSS A; 3PE0 A; 2CH4 W; 1RLQ C; 3NPF A; 4AFS C; 5FWC A; 1PRL C; 2JM8 A; 3I5S A; 2EGC A; 1MUZ A; 3EHQ A; 5IHN A; 1SHG A; 2BTT A; 2EBP A; 1WFW A; 1H3H A; 4JZ3 A; 1PRM C; 1JU5 C; 4J9I A; 2W10 A; 1SHF A; 2LJ3 A; 1CKA A; 2CUB A; 1WXB A; 4K11 A; 1X6B A; 4J9C A; 2LJ1 A; 2DL4 A; 1AWX A; 2GQI A; 2H8H A; 1YNZ A; 5IH2 A; 1ZUY A; 1M3B A; 1U06 A; 1M3C A; 2K2M A; 2LNH B; 4RTX A; 3JV3 A; 3FJ5 A; 2J06 A; 4HVV A; 4F16 A; 1K0X A; 2KT8 A; 2SRC A; 1HD3 A; 1ZBJ A; 1YCS B; 1HJD A; 3VRY A; 1M30 A; 1T3S A; 3EG1 A; 1JO8 A; 2EPD A; 2F2W A; 4LNP A; 2VWF A; 3ULR B; 4IIO A; 4CC7 A; 2D8J A; 1UJY A; 2DX1 A; 2ROT A; 2X3W D; 5I22 A; 1GCQ A; 2PTK A; 1ARK A; 1BU1 A; 2ROL A; 4IIM A; 4R0K A; 3REB B; 1B3Q A; 2KRM A; 2C0O A; 2KRS A; 2YSQ A; 4E6R A; 2OI3 A; 1WDX A; 2NUZ A; 1W1F A; 2LMJ A; 4F14 A; 3VS7 A; 4J9H A; 2EYW A; 1PKS A; 2O9V A; 3NGP A; 1BK2 A; 2ED0 A; 2DBM A; 4JJC A; 1PWT A; 1W70 A; 2KYB A; 2FPD A; 1FYN A; 2DL8 A; 2FG0 A; 2LQN A; 2VKN A; 2KNB B; 2KT1 A; 2J6F A; 4JPB W; 2LP5 A; 4AG2 C; 2KR3 A; 2O31 A; 3H0I A; 1YWP A; 2RQR A; 1UEC A; 4HCK A; 2DLP A; 2FPE A; 1X6G A; 1QLY A; 3RBB B; 2DL5 A; 1AD5 A; 2RQU A; 3VRZ A; 1JQQ A; 2MIO A; 2RF0 A; 2QDL A; 2C0I A; 1G83 A; 1OOT A; 1UJ0 A; 1V1C A; 4OMM A; 2CSI A; 1M3A A; 1MV3 A; 2EQI A; 2DIL A; 4OMP A; 3O5Z A; 2BZ8 A; 3TSZ A; 2J7I A; 1S1N A; 3A98 A; 1AWJ A; 2GNC A; 1NG2 A; 4M4Z A; 2K7A A; 1H8K A; 1UDL A; 2ENM A; 2GBQ A; 2DYB A; 3R6N A; 2HSP A; 2KBT A; 3H0H A; 4A63 B; 2K3B A; 1T0H A; 2M0Y A; 3EGU A; 1ZUU A; 4JJD A; 1AEY A; 1WA7 A; 2J05 A; 4QT7 A; 1B07 A; 4HVW A; 1WXT A; 1TG0 A; 1X43 A; 1FMK A; 3I9Q A; 1NLP C; 3M0R A; 1ABO A; 2LZ6 B; 2F2V A; 3VS1 A; 4X1V A; 2KRN A; 1AWW A; 2V1R A; 4LE9 A; 4J9B A; 2O9S A; 4WCI A; 2EVR A; 2PZ1 A; 2GGR A; 1UGV A; 1U5S A; 1YWO A; 1AZG B; 4ZNX A; 4Y92 A; 1WIE A; 2ESW A; 3PVQ A; 1RI9 A; 2CDT A; 1X27 A; 2KXD A; 1ZX6 A; 1PHT A; 1YP5 A; 2SEM A; 2G6F X; 3PVL A; 1UHC A; 4JJB A; 2HEQ A; 2DMO A; 3REA B; 1BBZ A; 2GTO A; 1RLP C; 2CH4 A; 2LX7 A; 3SEM A; 1GCP A; 2D8H A; 2RMO A; 1PKT A; 2JXB A; 4RTV A; 3VS4 A; 3EG2 A; 4F17 A; 3KFV A; 1JXO A; 3UAT A; 1X2K A; 2V1Q A; 1M27 C; 1QCF A; 5IHI A; 4GLM A; 2HCK A; 3VS6 A; 4CC3 A; 2EGA A; 1EFN A; 1GBR A; 2J6O A; 1H92 A; 1YN8 A; 3THK A; 2MOX A; 2RQV A; 2JM9 A; 4EIK A; 2RQW A; 3VS5 A; 1KJW A; 1ZLM A; 1OEB A; 1Y57 A; 1Z9Z A; 2E5K A; 4J9G A; 1MV0 B; 2X3X D; 2FO0 A; 2AKK A; 2BZX A; 1GFC A; 2LJ0 A; 2RQT A; 2L3P A; 2DRM A; 2O2O A; 2VVK A; 2MCN A; 2A08 A; 2YUP A; 3H41 A; 4ORZ A; 2JT4 A; 5IXF A; 4J9E A; 5IHK A; 2B86 A; 2L3Q A; 5FWB A; 1A0N B; 1LCK A; 3IQL A; 1GBQ A; 2J6K A; 2NWM A; 5ECA A; 4J9F A; 1BB9 A; 2P4R A; 1QKW A; 1GCQ C; 3H0F A; 1E6H A; 1M8M A; 2EYZ A; 4ESR A; 3EG3 A; 2A36 A; 3UF4 A; 1UG1 A; 2DL7 A; 2JW4 A; 1WXU A; 1TUC A; 5EC7 A; 2F2X A; 3NHN A; 1NYF A; 2JS0 A; 1SRM A; 4J9D A; 2DM1 A; 2I0N A; 2FRY A; 3EG0 A; 1K0S A; 2CUD A; 2KE9 A; 2JS2 A; 4GBQ A; 2FRW A; 2DE0 X; 2L3S A; 1UHF A; 1X2Q A; 2KRO A; 1GFD A; 3VS2 A; 1QWF A; 1W6X A; 3I35 A; 2DL3 A; 1XOV A; 1K1Z A; 1CSK A; 2RPN A; 1T3L A; 2FEI A; 1NEG A; 3NMZ C; 4RTY A; 4JZ4 A; 2IIM A; 1VYU A; 2DBK A; 3ZL7 C; 1ABQ A; 3M0T A; 4RTW A; 4LUD A; 1GL5 A; 2FPF A; 1WYX A; 3VS0 A; 2AKL A; 2PNI A; 1K76 A; 1VA7 A; 2YUQ A; 5I11 A; 4OMQ A; 3GBQ A; 3EHR A; 2K9G A; 4RTU A; 2K6D A; 3U23 A; 4HXJ A; 4CC2 A; 2EYX A; 1AVZ C; 5FW9 A; 2GTJ A; 2DVJ A; 4RTT A; 2A37 A; 4Z88 A; 4Z89 A; 1OV3 A; 1QWE A; 2AZV A; 5GJV B; 4D8K A; 2KGT A; 4RTZ A; 1NYG A; 2ABL A; 2C0T A; 1T0J A; 3M0S A; 1KIK A; 1HSQ A; 2EYY A; 1E6G A; 1VYT A; 2RN8 A; 5IXB A; 2EW3 A; 1SPK A; 3SHW A; 4DEY A; 1N5Z A; 1OPL A; 2JMC A; 2LCS A; 2L2P A; 2XMF A; 1IO6 A; 1SEM A; 1E7O A; 2CRE A; 1RUW A; 2AZS A; 5L23 A; 1J3T A; 1KSW A; 2BZY A; 1ZSG A; 2EGE A; 3LH5 A; 2HBW A; 2RNA A; 1SSH A; 4OMO A; 1CKB A; 2JMA A; 1TUD A; 2CSQ A; 2DRK A; 2KEA A; 2YUN A; 4OML A; 1WX6 A; 1X69 A; 2K79 A; 3M0U A; 1UUE A; 3CQT A; 1U3O A; 3VS3 A; 2DNU A; 1PNJ A; 3C0C A; 4RUG A; 1AZE A; 4Z8A A; 1JXM A; 1ZUK A; 2EKH A; 3M0Q A; 4OMN A; 1NLO C; 1Y0M A; 3QWY A; 2YDL A; 4LN2 A; 2AK5 A; 4D8D A; 2JTE A; 1OPK A; 4AFQ C; 4DEX A; 1KFZ A; 2OJ2 A; 1K9A A; 1WI7 A; 1G2B A; 3TVT A; 4KRT A; 2YT6 A; 3I5R A; 3TSW A; 3M0P A; 1K4U S; 2D1X A; 1I07 A; 2A28 A; 1GRI A; 1SRL A; 2O88 A; 1Z9Q A; 2D0N A; 2OAW A; 1NM7 A; 1UE9 A; 1QKX A; 3UA6 A; 2CT3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4PJJ A; 4MDX A; 2LT1 A; 3QWX X; 2CZ6 B; 4PLI A; 3CCQ A; 1S72 T; 2QDY B; 1VQL A; 2DJQ A; 1VQ4 T; 2W0Z A; 4AFU C; 1EIF A; 1I0C A; 2DK3 A; 5HK3 A; 1RAC B; 1NEB A; 3CCE T; 4M7D G; 2WAC A; 3M57 A; 2YUO A; 1JEG A; 1UTI A; 3JCM e; 3PE0 A; 2QQS A; 1RLQ C; 5FWC A; 4A54 A; 4XU2 A; 2E3I A; 5IHN A; 2DJZ A; 3OMG A; 4E2F B; 2BKD N; 4R55 A; 2CP3 A; 2HMA A; 1VQ9 A; 2MK5 A; 1CKA A; 2CUB A; 1NE8 A; 5GAN j; 2QQ9 A; 4PFZ A; 1WQ7 A; 1I81 A; 4X9C A; 3CC2 Q; 1MNE A; 2K4Y A; 2DPP B; 5KYU B; 1G8X A; 1JBM A; 3EFO A; 2JNG A; 4HVV A; 3CCU T; 4XK8 E; 1K0X A; 1W4S A; 2KT8 A; 2SRC A; 1YHQ A; 2XDD A; 1HD3 A; 3EGD B; 5CKE A; 5FLX E; 4PJL A; 1JO8 A; 2DFU A; 1YJ9 T; 4BY6 B; 5I2S A; 3CCV T; 4IIO A; 5GMK j; 2E6N A; 3SB2 A; 3QPH A; 1QCO A; 1QCN A; 4MZP A; 3NTH A; 3REB B; 1Q86 U; 2KRS A; 4C8Q E; 3LWH A; 1VOM A; 5CO7 A; 5J3B A; 1HK9 A; 2OI3 A; 1WDX A; 4L6V 5; 2NUZ A; 5CKD A; 2LMJ A; 3FRN A; 4N0A A; 4F14 A; 4J9H A; 2EYW A; 1PKS A; 1BK2 A; 2ED0 A; 2DBM A; 2KY9 A; 1W70 A; 2FPD A; 4PNO A; 2VKN A; 2Y90 A; 4IUV A; 2G3R A; 5I21 A; 1IGU A; 3R6O A; 2LP5 A; 4AG2 C; 4C92 F; 4DA4 A; 2V26 A; 4M78 A; 4HCK A; 3CCS Q; 1BKB A; 1D09 B; 4M77 G; 2JVV A; 3G1J A; 4M75 A; 2GFA A; 2OTL T; 4FM4 B; 1OYX A; 2AIR B; 1QVF S; 2DTH A; 3VRZ A; 2DXC A; 2MAM A; 1OOT A; 3CCJ T; 2K5I A; 1VQN A; 2LRQ A; 1M3A A; 3HL8 A; 5LJ3 d; 2DIL A; 5LJ3 f; 3CMA A; 3LW5 E; 3O5Z A; 2BZ8 A; 1AWJ A; 4V2S A; 1M1G A; 2EJ9 A; 1RAI B; 3MHX A; 3JAM E; 1UGQ B; 1TH7 A; 3H0H A; 2K3B A; 1T0H A; 4QW2 A; 4PJO F; 2QAS A; 4CI0 C; 3QZ9 B; 3CPW S; 4HVW A; 2FHD A; 4DBF A; 3G71 A; 4VUB A; 3VUZ A; 1V29 B; 2KAF A; 5CKH A; 2YXY A; 1ABO A; 2F2V A; 4YTL A; 3MET A; 1G3Y A; 3OYE A; 1TU0 B; 2QTX A; 3JB9 J; 2PVO B; 1KC8 R; 2V1R A; 4LE9 A; 4OB3 B; 4WCI A; 1SKU B; 2XD0 A; 1X01 A; 2PVD B; 1IZ6 A; 2V8J A; 9ATC B; 1NJI C; 5GAN 3; 4Y92 A; 1WIE A; 3PVQ A; 1C1A A; 3A5Z B; 2E64 A; 4C92 D; 2KXD A; 3OS0 A; 3JCM g; 1ZX6 A; 1YP5 A; 4J7F A; 2SEM A; 2C06 A; 2YLC A; 4XTX A; 2QEX Q; 4E7K A; 1SSF A; 1BBZ A; 2X4J A; 5FU7 B; 2LX7 A; 1F1B B; 2D8H A; 2VAS A; 1PKT A; 1TSF A; 2F1L A; 5GAM e; 4HT9 A; 2JXB A; 3TCJ A; 3EG2 A; 3KFV A; 4BD3 A; 3RKY A; 2CS7 A; 2E10 A; 5GAO r; 2OTJ A; 5GAM h; 1M27 C; 1ZBX A; 4LDY A; 4JLI A; 4FSX A; 2RH2 A; 2EGA A; 3CD6 Q; 2J6O A; 1QW1 A; 1H92 A; 5HK0 A; 1K9M U; 3SDZ A; 4F7U F; 2PQW A; 2MOX A; 1RAE B; 3G6E Q; 4PJO D; 4EIK A; 3VS5 A; 1LPL A; 1VQ8 A; 1Z9Z A; 4J9G A; 1MMN A; 4Z02 A; 2L3P A; 3O8V A; 4PJO G; 2MCN A; 1VQO A; 5FRO A; 4WF2 A; 3CCR Q; 5KYU A; 3TQ7 P; 4E47 A; 4KGX B; 3I55 T; 5CAI A; 2JT4 A; 2RHY A; 2YWW A; 3OYG A; 4A4F A; 5IHK A; 2L3Q A; 3CBM A; 3QZ5 B; 1M5Q 1; 3A8M B; 3MKD A; 1H64 1; 1M8M A; 3CBP A; 1VQP Q; 2GCX A; 3EG3 A; 5GMK i; 1UG1 A; 2RI2 A; 1TUC A; 1VQK T; 2JS0 A; 1SRM A; 2DM1 A; 1DJ7 B; 4C92 B; 1MMD A; 2Y4Y A; 2JS2 A; 5DM7 R; 4M7A E; 1ZSZ B; 4C0G A; 4E7H A; 2L3S A; 2RA2 A; 3MEV A; 2YHT A; 4BE1 A; 4FYX B; 3L2Z A; 2M16 A; 3CME Q; 1QWF A; 1YCY A; 2ZPF B; 2EYQ A; 2DL3 A; 1IGQ A; 3OBY A; 2DEU A; 5A0D A; 2OX7 A; 1Q82 U; 2CYZ B; 1B34 A; 4JZ4 A; 2IIM A; 1M90 C; 3SWN C; 2HQX A; 3ZEH A; 2FPF A; 1WYX A; 3CC4 Q; 2CZ1 B; 2YUQ A; 5I11 A; 3OY9 A; 3EHR A; 2NUT A; 3U23 A; 4HXJ A; 4CC2 A; 1ACM B; 1NZ9 A; 3M55 A; 4BI8 B; 4DBR A; 2A37 A; 2XI9 A; 4BI4 A; 5FRN A; 5DLQ E; 2AZV A; 5GJV B; 1VQM T; 2CP7 A; 4D8K A; 2KGT A; 1NYG A; 4KUL A; 2ABL A; 3LYI A; 2EFI A; 3EGX B; 2EYY A; 4KH0 B; 1BYM A; 1VYT A; 1O75 A; 5J26 A; 2GFU A; 1Q7Y U; 2YRD A; 1SEM A; 2CRE A; 1RUW A; 1J3T A; 2BZY A; 5CKB A; 3PT9 A; 1KC8 C; 2DRK A; 3OYL A; 3KBG A; 2YUN A; 4OML A; 5EG2 A; 1VQ5 Q; 2D0Q B; 1YI2 Q; 1UUE A; 4XTW A; 3VS3 A; 4BUG A; 3PIO A; 2EKH A; 4C8Q F; 5FU6 B; 2YDL A; 4M78 G; 3M5A A; 1OPK A; 4EMG A; 5GAM g; 4M75 G; 1S72 Q; 2VC8 A; 1VQ4 Q; 2CZ7 B; 1EX4 A; 5LJ5 g; 2X9H A; 2L89 A; 2DZC A; 3CCE Q; 4IUT A; 2JTF A; 4XQ3 A; 1QMC A; 2L0A A; 3CPW P; 3S3O A; 1K8A C; 4JRI A; 2DA9 A; 5GAM d; 3HRU A; 1H3Z A; 4F7U B; 2LQW A; 4RG2 A; 4LUE A; 1VQ6 T; 1UFF A; 4KT0 E; 2P4T A; 4FYY B; 2JOY A; 4AFZ C; 2P0K A; 1BI3 A; 1YJW T; 2VXE A; 2ECZ A; 3UA7 A; 2M1H A; 4RCC A; 2DF6 A; 5CQX A; 2JN0 A; 1BI1 A; 2DD5 A; 1VQL T; 2RB6 A; 3GPL A; 5A0G A; 3PTA A; 1PRL C; 3JCM Q; 3F70 A; 2E4H A; 3EHQ A; 2YRV A; 2EBP A; 3CCU Q; 1H3H A; 3SD4 A; 4JZ3 A; 4J9I A; 2W10 A; 4BI3 A; 1SHF A; 1K73 R; 5KE3 A; 2O01 E; 4K11 A; 1G3W A; 1X6B A; 4J9C A; 1YJ9 Q; 4PJO C; 3CCV Q; 5HKC A; 4KGZ B; 4M7D F; 1YNZ A; 3JB9 G; 1WHL A; 2K2M A; 4PJM A; 4RTX A; 1ZA1 B; 4C8Q D; 3JV3 A; 4F16 A; 2DXB A; 5KYN A; 5LJ3 e; 1ZBJ A; 2OAU A; 1YCS B; 2IG0 A; 2RHI A; 3MPU B; 2KSS A; 2JZ2 A; 5CIU A; 4F04 B; 4E7J A; 2EPD A; 1GXI E; 2VWF A; 2DZ9 A; 3HSB A; 2X35 A; 4CC7 A; 2MMP A; 2P0Q A; 2ROT A; 2X3W D; 4FCY A; 1GCQ A; 2PTK A; 2XU8 A; 3OYC A; 4JUV A; 2ROL A; 4MMK A; 1B3Q A; 2YSQ A; 3PIP A; 3KUF A; 1SG5 A; 1WHJ A; 2E41 A; 3OMC A; 3X24 B; 1D1C A; 1ZSZ A; 2EQU A; 2OTL Q; 4KUI A; 3DLL A; 1W2B S; 3OW2 P; 2DL8 A; 2FG0 A; 2LQN A; 2K2V A; 3CCJ Q; 2VUB A; 3EFS A; 2LDM A; 1I5L A; 2KNB B; 4XU3 A; 2HAX A; 1YIT A; 1YWP A; 2RQR A; 1JB0 E; 3OS5 A; 3C4S A; 1UGP B; 1YBY A; 3OYY A; 4JS5 A; 2RF0 A; 4HKE A; 2C0I A; 4QVD A; 4M75 E; 1NJI R; 5L8R E; 3CCR A; 2LT4 A; 4OMP A; 3QDR B; 4M7D D; 3N5B B; 4DBQ A; 4E7I A; 3TSZ A; 2J7I A; 1S1N A; 2P84 A; 2FYK A; 3EGX A; 4N4H A; 2K7A A; 3GP8 A; 1H8K A; 1UDL A; 2GBQ A; 3JCM P; 5GAN 8; 2DYB A; 2HSP A; 4M77 F; 3EGU A; 3I56 A; 5GAN 7; 2DXT A; 4E7S A; 2E6Z A; 4RKU E; 1XQH A; 5GMK l; 1VQP A; 5GAO q; 3RR6 A; 2MWO A; 4UC4 A; 3QYH B; 2IPO B; 3NTI A; 1TG0 A; 3RMQ A; 3ASK A; 1IHV A; 3OYI A; 2LZ6 B; 1PD1 A; 1QVG P; 4X1V A; 2KRN A; 1G3S A; 1AWW A; 4KBM B; 4E7Z A; 2YRC A; 4HCZ A; 4XU0 A; 4J9B A; 3DB4 A; 3L1A A; 4IUU A; 3H9N A; 4GY5 A; 4QQ6 A; 3URG A; 1UGV A; 1YWO A; 1AZG B; 1VQ7 A; 2H3J A; 2CDT A; 2K3X A; 3VV0 A; 1KQS S; 3QDF A; 3P8H A; 3GNF B; 2QQB A; 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