3TJBA

Crystal structure of wild-type human peroxiredoxin iv
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
170
structure length
170
Chain Sequence
LSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Reduced and of Oxidized Peroxiredoxin IV Enzyme Reveals a Stable Oxidized Decamer and a Non-disulfide-bonded Intermediate in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-4
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 56
structure length 170
sequence length 170
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tjbA00
3FZ4A 4I5QA 4BWSA 4KGIA 4V1Ag 5AIXA 3TRXA 4TW5A 2RUFA 4I6XA 3TJJA 5G5FA 3TKSC 4EDYA 3KGKA 5B7CA 3TOTA 2FLSA 4IP6A 2GLRA 2LUSA 2RIIA 5ECLB 1DE1A 1ST9A 4DSSB 1OKTA 1YKCA 2VL3A 3S9FA 2XPDA 2DBCA 4V2NA 2FHEA 4NV2A 4AJ6A 1YY7A 1OYJA 4PUFC 4DVCA 1R26A 5J41A 5ENUA 1OKDA 2B7KA 1Z7PA 3IR4A 2O7KA 2V1MA 3RAZA 2PVOC 5J3RA 4MJEA 3F0IA 4GQCA 5DBQA 5A5KA 2G2QA 2IN3A 1KTEA 4OWYA 3IK9A 3I69A 2HLSA 3GFKA 2WS2A 3L9VA 4K9ZA 3GV1A 2H30A 4HDEA 3ZMKA 3PINA 2C0DA 2YWNA 1GSQA 4L8EA 3TJKA 3A2VA 4EL1A 1G7OA 2K18A 1UC7A 2XBIA 1PKWA 2JSZA 3GL5A 1BX9A 3VLNA 4CDOA 1SJZA 2F8AA 4MF5A 4WR5A 3GKMA 2C8UA 3L9UA 2PWJA 4O32A 3QAVA 3FHKA 2XC2A 1QFNA 5CRGA 4EVMA 2C3TA 1XCCA 2GQMA 1FHEA 5DALA 5L71A 2OACA 4IN0A 1QUWA 2QGVA 1ILOA 1THOA 2M72A 1O81A 3HVSA 3VI5A 2VO4A 2C80A 4N10A 1Z7RA 2OE3A 3EC3A 1Z6MA 1OE7A 2XHFA 1M99A 4KE3A 2L6DA 3H1NA 1MDKA 1XWCA 4V2LA 1AQVA 2C0GA 2WDUA 1MD4A 3DD3A 1XW5A 2B5YA 2F9SA 1LJRA 5IMDA 3FEUA 4FH8A 3RPPA 2GSQA 4K6XA 2R2JA 4Q5NA 5CREA 1TK5B 2CAQA 3H4KA 4L5OA 4XHMA 1Q98A 3D4TA 1BG5A 5HFKA 4EC0A 2YN1A 3F4TA 1PKZA 1Z3EA 3ZIJA 3BBYA 3TDGA 2YV7A 3F3QA 2VAFA 3FW2A 1DBYA 1ZZYA 4L0WA 3GA4A 1I9DA 4ZB8A 4K2DA 1V9WA 5GAND 3TOUA 2I81A 1FOVA 5JWQB 2E2GA 1F3BA 3G7IA 3BD2A 1EWXA 1OC9B 2OBIA 3M9KA 4TVEA 5ECMB 3ZTLA 4PNFA 5AGYA 5ID2B 1W89A 4MP4A 2H72A 2YJ7A 1PL1A 1T4ZA 4WF4A 5DVBA 3KMNA 4N0ZA 1B9YC 3HVVA 5A4WA 3ZIVA 4F2IA 1SJ6A 3Q19A 1J08A 2C4JA 3TJFA 3HXSA 3TGZA 1OAZA 1AAZA 1WE0A 2AHEA 4Q5QA 2O89A 5E59A 4MPGA 4POKA 3NZNA 3ERWA 2HYXA 3UBLA 1G0TA 5D8IA 1PN9A 4ULXA 1XOBA 1JZWA 1R5PA 1OC3A 2HE3A 2H6XA 2L5LA 1Y6EA 1YZXA 2H73A 1V2AA 3HYPA 1E6BA 1T7PB 17GSA 2JSYA 4TXOB 5HFGA 1WRYA 2J9HA 3TCOA 4MJAA 2L6CA 2RM5A 5JCGA 3ZVJA 2HZEA 3MDKA 2PGTA 4K1FA 3RBTA 3VWUA 2VL2A 4IQ1A 5J4UA 3IV4A 2YJHA 5D9WA 2E7PA 4HQSA 4F9ZA 2KLXA 2MMAA 1U3AA 4L5LA 1HNAA 4G2EA 4YQUA 1HD2A 3TRPA 1ZGNA 6GSSA 2GZZA 3F6DA 1EP7A 4HZ2A 2EIQA 3ERFA 3FZ9A 3QFBC 5DDLA 1M2AA 3CXGA 4MA9A 6GSVA 1K0BA 4OFMA 2A2SA 4XRAA 2MMOA 2FY6A 3IDVA 5GZZB 1TU8A 2TIRA 3ED3A 3HZ8A 1O8XA 3GKXA 1K0AA 1PSQA 2REMA 2HI7A 2LRCA 3GH6A 2V41A 3VWWA 1OVNA 1M2DA 1K0OA 2IFQA 2K8SA 1GWCA 4POLA 4H86A 1N8JA 4P3YB 4XS4A 2WFCA 1PGTA 3HA9A 3ZRDA 3P90A 3FY7A 3QAWA 3TB2A 1AC1A 3UOMA 3ZREA 3GSTA 4RQRA 4TR1B 1Q4JA 2V6KA 3H79A 4X0XA 3ZL5A 2M80A 3UAPA 3DRNA 2H1BA 3D22A 1GTIA 4TN8A 1WMJA 12GSA 3BCKA 3I9V2 4GSTA 2KOKA 2LS5A 3LXZA 4ZB9A 1SL2B 3EINA 3IRAA 3IXRA 3DXBA 4GSSA 2DIZA 3IA1A 2MYGA 1J9BA 4NV5A 3GH9A 1GL8A 5A4VA 3TKRA 3TKSE 5AISA 2PBJA 1O7UA 2LNSA 4JBBA 1X9WB 5IMCA 2I9HA 1Y25A 1CQGA 4K8MA 4QL9A 1A8LA 2X99A 3TKSA 2Z9SA 2CX3A 1X0RA 2RUEA 4PGTA 2NVLA 4Z7XA 3P8WA 3RPNA 3UARA 4GXZA 2X8HA 1V98A 5J9CA 3APOA 2LV3A 1XIYA 1SK0A 3R2QA 4WF5A 1S3AA 3M8NA 1GULA 4YQVA 1GUKA 3IOSA 3C73A 1TKDB 2DJ1A 4IELA 3QCPA 2FA8A 3LG6A 4ZIJA 1M9BA 3LYPA 2FWHA 3A5WA 4JR6A 1Z5YE 3GYKA 4G9HA 3UBKA 1TRSA 1MDIA 2P0GA 1A2LA 2A4VA 4KA0A 3W6GA 4TR0A 4DSSA 1F37A 2GDRA 4QQ7A 2DIYA 3VPTA 5C00A 5DQSA 2L4QA 1PX7A 2H71A 4D73A 1S3DA 3A3TA 1A8YA 2F3MA 3C8EA 4NAXA 1V57A 1AQXA 5G31A 3WD6A 5ECQB 1GUMA 4KW6A 3TJBA 3ISOA 4KX4A 4Q5FA 3LXTA 3WGEA 2H1DA 4LL4B 4OFTA 4YQMA 3M3MA 3TKPA 3HJPA 2K9FA 5G5EA 1A23A 2CX4A 5DJLA 4BPYA 1FW1A 1T3BA 2WZ9A 5D9TA 2IMFA 3E9JB 3QAGA 4IBPA 1ZYEA 3KJYA 3C1SA 1SU9A 3O3TA 2D2ZA 2H6YA 3FYGA 3US3A 4JZQA 3EMXA 3KMOA 1LU4A 3ERGA 3TKQA 6GSWA 3MNGA 1B9XC 1NSWA 3CTFA 1ZL9A 4IHUA 4XS1A 4IJ3A 4KH7A 2CQ9A 4MCUA 3KXOA 4F03A 2EIRA 3QOUA 4X43A 2HZFA 1K0NA 3UL3A 2FWFA 1TRUA 2QKEA 4PNGA 13GSA 4IGJA 4TRXA 5IMFA 2JZRA 4TXVA 2FGXA 4WETA 3N9JA 1USBA 3ME8A 3GHAA 5IPHA 2L5OA 1XBSA 2V2GA 3GUSA 1HQOA 3LFLA 2V32A 3QPMA 1OE8A 1X9SB 5D93A 5IMAA 2VIMA 3ZMLA 3GKKA 4BVXA 4GLTA 3L0HA 1GTUA 3LYKA 2CT6A 2VCWA 1SD9A 1YEPA 1EEMA 2FWEA 4MZCA 1X5EA 4GRFA 3N5OA 5HR2A 1EV4A 2DMMA 2V6OA 1H4OA 4E8EA 3ZFLA 3KM6A 4GF0A 2VD1A 3GIXA 2LRNA 1SL1B 4JE1A 3L4NA 3C71A 16GSA 1SYXA 3DGQA 4LLRA 1ON4A 4GTUA 1HNBA 2ZCTA 5ID2A 2WJUA 2FWGA 2N5AA 1VGLA 20GSA 4X1UA 1XPVA 1KNGA 1ERUA 5ECRB 5E4WA 1XWGA 1NHYA 2PERA 5ECSA 1SKSB 1X5CA 5LCZA 2NBSA 1MD3A 3M0FA 3HDCA 4Q5RA 3KP9A 4HU7A 2JZSA 1B48A 4FIWA 1UVZA 3HHVA 3KCMA 2PMTA 2AJQB 4LL1B 5F07A 1JHBA 4NWYA 3E0UA 3TRQA 3FZAA 3HKRA 1F6MC 3MWHA 3IE3A 3P7XA 2QSIA 3VURA 2KHPA 4BL7A 2HNLA 2IIYA 3ME7A 3VI7A 3UVHA 3L78A 4FYBA 4HI7A 4HQZA 4TXOA 4ZL9A 2VCQA 3LWAA 3QFAC 4XIHA 3F63A 3DWVA 4BA7A 1TI3A 3P2AA 1URMA 3VPQA 4I8BA 2JL4A 2GZYA 4J56E 3RHBA 4N0VA 5DAKB 5IO2A 4POBA 2ALBA 4DSRA 1AW9A 2OKAA 4ID0A 4WR4A 5CRWA 1FB0A 4KCAA 1TRVA 2E0QA 1EOGA 2L59A 3FRCA 2OADA 1EGOA 2DC5A 3D4MA 4CW9A 2R37A 4LMWA 3OR5A 2NPBA 5JCWA 4PQ1A 1X9MB 1GSFA 5FHIA 1GH2A 6GSYA 1RK4A 4BVYA 1X5DA 3SBCA 1VF1A 1ZCPA 1V58A 2WGRA 2H66A 4PQHA 2LJKA 3DIEA 4K7NA 1J0FA 3GX0A 3H93A 4WBJA 3E3EA 4EE0A 1U3IA 2H0GA 3GL3A 3QDNA 2B6MA 2HT9A 4WEYA 19GSA 5JCUA 1QQ2A 3IAM2 4J2FA 1AUCA 5JWRB 1TW9A 5G1LA 5IMVA 1B4QA 4RQXA 2LEGA 5J5NA 2PPTA 3GURA 3NOFA 2YWOA 1GTBA 4TR1A 3Q74A 3GMFA 2FUG2 4QL7A 2IJYA 2YWIA 2B7JA 4LMVA 4MF6A 1W4VA 1PA3A 1O8WA 3CBUA 2JADA 3QD9A 4KDUA 5ECOB 4ZBBA 1K3YA 5KN3A 5ECIB 2VM1A 3RHCA 2GT5A 2WCIA 3LQ7A 1DE2A 1KBNA 1AQWA 2CVDA 2LNTA 4GWRA 1V40A 2CVKA 5LNKe 3CSHA 2VCTA 4G10A 4ZL8A 2K8VA 3A2XA 5HFIA 4MJCA 4XTSA 2XPEA 3CYNA 2G0FA 2YWMA 1WP0A 4TKYA 1VRSD 2KUCA 5G2ZA 5DCHA 2KP2A 1B8XA 3D0ZA 5B8BA 4O7HA 3APSA 3O76A 3KZQA 2B5XA 1GTAA 4NPBA 1O85A 2HRNA 1XXUA 1TI1A 3ZVJD 1XVWA 14GSA 1FO5A 1LBKA 3IAS2 1BAYA 1JZRA 2LTKA 1YJ6A 1PMTA 2DJ2A 1HNCA 1H75A 4KSMA 3D21A 2IL3A 3EYTA 4LA1A 4ZXGA 5EL8A 2VUPA 5KEJA 3IHQA 5KN1A 4JEDA 4KNDA 1HYUA 3WYWA 1SJIA 4ZL7A 1O73A 2LRTA 3Q6OA 4MDCA 1XWBA 4I2UA 3F8UA 2C1YA 1U88A 3KH9A 1WIKA 3UIWA 2ES7A 3KIJA 3WGXA 5IPGA 2GQKA 5ECHB 1C72A 1JLWA 3D6IA 1CQHA 4L0UA 3PH9A 3HZ4A 4BWQA 2XBQA 5F8BA 1EEJA 2VM2A 1BYEA 1TXXA 5GSSA 3HJOA 1VF3A 1YF1A 2X8CA 1ZYQB 1S3CA 1JZDA 1WJKA 4J57E 3UEMA 5EVOA 2GSTA 3WT1A 4KB3A 3VFIA 1XZOA 3H8QA 18GSA 2IPAA 2M46A 4G19A 1ERVA 3LGCA 1EGRA 4KDYA 3MAKA 1ERWA 5F0GA 3QMXA 4OD7A 2OA7A 1ZOFA 2TRCP 5H5QA 2AYTA 1ML6A 2H19A 3LORA 1KEBA 2O8VB 4RUVA 3GRXA 1SKWB 3GTUB 3M9JA 5CRHA 1UA5A 3ZZXA 2FCHA 1YKAA 2EC4A 2HSHA 4O92A 4HOJA 1U6TA 1XFLA 1TK8B 5CAXA 1PQNA 2GZPA 4OFNA 1JLVA 4XS6A 5GAPD 5ECKB 4IVFA 2EIOA 4GCIA 3GSSA 1EP8A 22GSA 2LQQA 1SK2A 5CRDA 4V2MA 4ZB6A 2CAIA 4ECJA 3KP8A 1MTCA 3J7Yb 3EU4A 1FG4A 3AY8A 1XVQA 2CV4A 3KTBA 1EOHA 3ZFBA 1PL2A 6GSUA 3IPZA 3L9SA 2F8FA 1NM3A 4FYCA 3GKNA 2YV9A 10GSA 1OC8A 3U5RE 5IQYA 1GSSA 1FVJA 2N5FA 2VOCA 2C0EA 5FWGA 2MZCA 5AN1A 3M1GA 5ELAA 5DQYA 2GQLA 5F05A 9GSSA 1U87A 3EMPA 1PD21 4HUAA 2VLTA 1K3LA 1TK0B 1GLPA 5LD0A 3TJGA 2R5GA 5AIVA 1I5GA 2GT6A 2DLXA 4WBRD 2HSYA 2WB9A 5ABRA 4MPFA 1TOFA 2AB6A 4MH3A 1VF2A 1R4WA 1YDKA 2AAWA 1G6WA 4TR4A 1MDJA 3KD0A 4ECIA 1SYRA 4ILFA 4D73B 5KN2A 2FA4A 4GSNA 2NDOA 4MJBA 2H0HA 2YZHA 2MBSA 5HR3A 5INYA 1IYHA 3HVXA 1E2YA 1SKRB 3F3RA 4K0NA 1GSEA 4YH2A 5DAKA 1SD8A 2JZTA 5G1KA 2VD0A 5C04A 3BCIA 1GSDA 1NW2A 5HR1A 2DJKA 5IMZA 1T00A 2DJJA 2CZ2A 3FR3A 1OC9A 1K3OA 4AJ7A 1GNEA 4OMVA 2JU5A 4ZILA 4AF2A 2YPMA 5FT3A 3KTLA 3LSZA 2I1UA 4IJIA 1A24A 1TP9A 4IS0A 2L57A 3MSZA 2B3SA 1GRXA 3ZYWA 3DMLA 1MEKA 4ISDA 3O6TA 4PUAA 3I43A 4RI6A 4KSOA 1K0DA 2GSRA 4ACSA 1NHOA 1GSYA 1SK1A 4KUNA 5A4UA 2H74A 3UJ1A 2QC7A 2ZNMA 2C0FA 4YAPA 3DEXA 4OCEA 2PVQA 5EPFA 4JRRA 1RW1A 1K0MA 5DCGA 2LSTA 1F9MA 1FVKA 2AUVA 2ZUPA 4OO5A 2JACA 4EUYA 2FD3A 1XOAA 4I97A 4XRDA 5D73A 2H01A 4FO5A 4FYUA 4GQFA 1F3AA 2YP6A 5CNWA 1GLQA 2LJAA 4CHSA 2B1LA 5CO3A 3WGDA 5KN0A 2I4AA 2P31A 5CP1A 1WWJA 2GVPA 4MH2A 2E2MA 2B1KA 4F0CA 2A2RA 4HEA2 3W8SA 5ECNB 4PQIA 5D96A 2ON5A 4PX1A 2GTUA 2BMXA 5J9BA 2YOIA 4IW9A 3EURA 4HJMA 1SENA 4K7OA 5IM9A 1A0RP 3F9UA 5IOWA 1YF0A 1ZMAA 4WXTA 5EY6A 1IYIA 2C3NA 4O5RA 1THXA 4HJ2A 5ELGA 1QXHA 5DALB 2KP1A 3SWLA 2GSSA 2YCDA 4MMMA 4MK3A 3EU3A 1VF4A 5B6MA 4KAEA 2RM6A 5IO0A 1G6YA 2ON7A 4EXJA 2CZ3A 5IIZA 3FR6A 4EO3A 6GSTA 5H5RA 4NHZA 1XWKA 2VLVA 3HY2A 3I6AA 2GGTA 4YAVA 1XWAA 3ZITA 4DSQA 4MF7A 2VCVA 2H0IA 2DJ0A 8GSSA 3QR6A 3IK7A 1PRXA 4OCFA 2J23A 5HR0A 4AGSA 2DJ3A 6GSXA 3WT2A 3F4RA 1M0UA 3FKFA 1TJDA 2H70A 3CRTA 2DSAA 2C3QA 5CYYA 2H6ZA 1T1VA 1O6JA 1XW6A 1F2EA 3G7YA 2H8LA 3DKSA 2BJXA 4ECCA 4MLYA 4N30A 4E8HA 1G7EA 2OBKA 3UMAA 1BJXA 2DMLA 5JWOB 2YANA 3DVWA 2MMNA 4POMA 4TOPA 4HZ4A 5B8AA 5COHA 4ECBA 3Q18A 3IBHA 3F6FA 3GX8A 3J7Yk 3C7MA 3DVXA 2MMZA 1JFUA 4AJ8A 2AV4A 5F06A 1PX6A 1A0FA 2BTOT 4JU5A 7GSSA 1ERTA 1EZKA 2LJRA 4NHWA 2PU9C 4DEJA 3BJ5A 2FNOA 2R4VA 2IMKA 2YNXA 3KH7A 4K7IA 4WKWA 2VLUA 3G7JA 3ZLPA 3FZ5A 3IC4A 1R5AA 2O85A 3CMIA 4HS1A 2WULA 1GP1A 1M2BA 3GTUA 3CSIA 3HD5A 1FB6A 2P5QA 5B6NA 1B4PA 3PR8A 2IWTA 3F4SA 3HJMA 4TR3A 2H1GA 2HXKA 1Z6NA 1R7HA 3D5JA 3NIVA 1QK8A 5D9XA 4F0BA 2O87A 2VCXA 3CRUA 1TTZA 3BOAA 1QGVA 4PXOA 3UVTA 2HZEB 4V1Ap 4IKHA 3VWXA 2OE0A 2X8GA 2PN8A 3APQA 4IP1A 3FK8A 4OO4A 4N11A 3EWLA 1Z9HA 4ML1A 2IMDA 4JR4A 1N2AA 1AXDA 3GN3A 3LJRA 1T8EB 1M9AA 3VK9A 3HCZA 2RLIA 5DJMA 1WPIA 2X64A 1ABAA 4XCSA 3DYRA 2MBTA 2VL2C 4I2TA 2B5EA 2I3YA 3LEFA 4K0GA 4MABA 1BQ7A 2H75A 4EF0A 1GNWA 4HU9A 2OE1A 3JCML 2CA8A 4NXIA 2LKUA 3PGTA 4KCEA 2HRFA 5HQPA 3EVIA 2IFQB 4NMUA 1EV9A 1UN2A 5D9VA 5ECPB 2GS3A 3C1RA 2IMEA 4RI7A 3CSJA 4XS4B 1TDIA 4EKZA 3G9BA 2F51A 1ACVA 2YZUA 1A2JA 2H76A 3V1WA 2LQOA 4IQAA 1SL0B 1RQMA 3CTGA 2HFDA 1DSBA 3A2WA 1WOUA 1TU7A 1GUHA 3FR9A 4MZWA 4EDZA 3RDWA 3KEBA 5H5SA 1DUGA 1QMVA 5GSTA 3VWVA 2R3XA 1YQ1A 4KDXA 3GNJA 11GSA 3K8NA 1AIUA 5G30A 2VL9A 2WRTA 1JZOA 1BEDA 1A2MA 1TRWA 2PUKC 1T4YA 2L4CA 2N5BA 4MZBA 3EE2A 2H1AA 3U6VA 1GSUA 2VCZA 1K0CA 2CVBA 2OJLA 4ML6A 4F82A 2IMIA 2R6KA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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