3TJKA

Crystal structure of human peroxiredoxin iv c245a mutant in reduced form
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
b'LHLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVAPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Reduced and of Oxidized Peroxiredoxin IV Enzyme Reveals a Stable Oxidized Decamer and a Non-disulfide-bonded Intermediate in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-4
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 64
structure length 195
sequence length 195
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tjkA00
3HJMA 3NIVA 4WR5A 3GYKA 3ZZXA 3IAM2 1RW1A 2VO4A 2I1UA 4KGIA 1R7HA 4TN8A 1A2MA 5D96A 3ME7A 2E2GA 5LNKe 4MMMA 1YF1A 2HRNA 2K18A 1MEKA 4JR4A 1SYRA 1TW9A 2R37A 2L5OA 3EMPA 5KN2A 1EGRA 2V2GA 2L5LA 1TU8A 4MLYA 2H76A 4EKZA 1F2EA 4WXTA 4F0CA 2YV9A 4XS6A 1A23A 19GSA 4HUAA 4TR3A 4V2NA 2XC2A 2FWGA 1GSQA 2LJAA 5ELGA 1U6TA 3GH9A 1S3CA 2R5GA 1WIKA 1NHOA 2PBJA 4IELA 5J4UA 1FW1A 2H74A 1H75A 3P8WA 4EC0A 2IJYA 4O32A 3QFAC 4MH2A 5J5NA 3KH9A 3H4KA 3RPPA 1DSBA 4TR1B 5FT3A 2H1GA 5EVOA 3ZIVA 1CQGA 4K0NA 4I2UA 4PURA 1QMVA 4BL7A 2DJ0A 2YZUA 3GH6A 2VLUA 1PA3A 2V41A 5F0GA 1EGOA 1Y6EA 3QD9A 5KEJA 1PMTA 5F05A 3N9JA 1ZYEA 2YP6A 1GTUA 2MMOA 4V1Ap 1TK5B 1MDKA 4HZ4A 2V6OA 2PVOC 3HD5A 1DE2A 2YZHA 3WYWA 4LMWA 1A8LA 3NZNA 2LJKA 5J9BA 2H71A 1I9DA 1U3AA 3C8EA 4RI6A 5C04A 4KCEA 4MZBA 1V98A 4CDOA 3LFLA 1N2AA 2RM5A 1WE0A 4ISDA 5KN0A 2YWMA 4OFMA 3KEBA 4XHMA 3ZMLA 2F8FA 2FA8A 1TOFA 1EEMA 2HSYA 1HNCA 2QGVA 1XW5A 5JCGA 5J41A 4MP4A 4K7NA 1ILOA 4TKYA 1X9MB 1SL1B 1ACVA 3QAGA 2CVKA 5DCHA 5IIZA 4OWYA 2VIMA 3D4TA 4GCIA 4YQUA 1MTCA 2K9FA 2I4AA 2P5RA 3M8NA 1JFUA 4RI7A 4K8MA 3LXZA 4MJBA 1JLVA 2X8CA 3HHVA 2XPDA 4F03A 2M46A 3QOUA 3KP8A 2NBSA 3ERFA 4IVFA 2NPBA 1E6BA 3KCMA 1JZWA 4POBA 1RK4A 1UVZA 3F4TA 2M80A 2NVLA 1O73A 3TUEA 1DBYA 4FYBA 3GIXA 1M0UA 2OE1A 2VAFA 1T8EB 3FZ5A 3LXTA 1VF3A 4TXOA 1WRYA 4MH3A 3W8SA 5D9WA 4RQXA 5ECLB 4MJEA 5AISA 2OBIA 3GSSA 3DVWA 3ISOA 2IMFA 2O87A 2F8AA 2RLIA 1HYUA 3IK7A 1XXUA 2OBKA 5CAXA 2GVPA 2VL3A 2L4CA 1X5CA 3FEUA 4EDYA 3TGZA 1K0CA 5ECOB 1QFNA 2E2MA 2FY6A 4MJCA 3F8UA 1WMJA 4PGTA 2LKUA 3KTLA 4FYCA 3N5OA 2IMDA 4F2IA 3FR3A 1GH2A 1QUWA 1Z7PA 5ECMB 3GKKA 2DIZA 5IOXA 4K1FA 3JCML 5E59A 1FO5A 3D21A 4XS4B 2LJRA 3A3TA 3WT1A 3MWHA 3ERWA 5ECNB 2VM2A 2G0FA 2YNXA 1UC7A 1SU9A 3F0IA 5HR2A 2HLSA 4NXIA 3TRXA 5ELAA 4TVEA 4N0VA 3RDWA 4EUYA 1GLQA 5IMVA 3ERGA 3G9BA 2H72A 1E2YA 1BJXA 3LGCA 5DALA 1FVKA 3WGXA 2AV4A 2GTUA 1G7OA 3HVXA 3HVSA 1W4VA 3FRCA 1HNAA 1SD9A 5A5KA 3O76A 1URMA 3DIEA 1K0BA 1GSUA 2DJ3A 3C7MA 3GRXA 5HR1A 4MCUA 1F3BA 1XW6A 5A4UA 1H4OA 3UOMA 3EMXA 2GZYA 3D22A 5IMZA 1WWJA 5JCWA 4I2TA 3QR6A 2P5QA 4AGSA 2CZ3A 3ZRDA 3G7YA 4NPBA 2YWIA 5GSSA 4TXVA 2CA8A 4V1Ag 5KN3A 3IK9A 6GSYA 1ZL9A 2RUFA 4I6XA 9GSSA 5G5FA 1BEDA 2GSSA 2PVQA 3G7JA 4YAVA 2WULA 4Q5QA 2FGXA 2PU9C 4YQMA 1V58A 1FAAA 1J9BA 3U5RE 3ZLPA 3HYPA 4IW9A 4FYUA 2VM1A 4GSNA 4XTSA 3H8QA 3KMNA 2J23A 2VCXA 3OR5A 1VF2A 2VCQA 3UVTA 1YEPA 2FUG2 4PXOA 3H79A 4IP6A 4PQIA 4DVCA 4IGJA 1USBA 2LNSA 4OFNA 2DJ1A 1AIUA 3CBUA 3FW2A 4WF4A 4GRFA 3F4RA 2JSYA 3HJPA 3TKRA 5AGYA 2DLXA 4ZIJA 3LJRA 3A2XA 1FVJA 5IOWA 1U3IA 3GV1A 4EF0A 1A2LA 4P3YB 1BG5A 3H1NA 4LL1B 1K3YA 2QC7A 5G1KA 2O7KA 1BX9A 3C73A 5A4WA 2DJJA 2VCTA 2N5BA 3KMOA 3IDVA 5B6NA 4KNDA 1OE7A 1YQ1A 3CRUA 2PWJA 1V2AA 4ZXGA 2HRFA 4MABA 2LQOA 5D9XA 1N8JA 1J08A 2HYXA 2HNLA 3CSJA 3P90A 1AUCA 2B7JA 1XOAA 4BVYA 1W89A 1XW9A 4Z7XA 5JWOB 2K6VA 2RUEA 2DMMA 2ALBA 4OCEA 2AB6A 1GULA 2DBCA 2JZTA 5D9TA 1GSDA 1TK8B 1SJ6A 3SBCA 1T00A 3BOAA 3W8JA 1PX6A 4D73B 2CVBA 2B5XA 4I5QA 4ZL8A 11GSA 4DEJA 5IMDA 5B8AA 4PQ1A 4KX4A 2GT6A 4OO4A 2VUPA 3QPMA 1MDJA 2FWEA 2DSAA 4MJAA 4Q5RA 2I81A 5LD0A 3GTUB 1K3LA 2BJXA 2MMAA 3IPZA 5D8IA 5ECHB 5HQPA 1V40A 2GGTA 3TDGA 3US3A 3SWLA 4G2EA 2YWOA 2MBTA 3TJGA 1TTZA 4KSMA 3A5WA 2C8UA 2V1MA 3C1RA 4G9HA 1Z7RA 2PN8A 2R6KA 1ZCPA 4XS1A 1LJRA 2HFDA 1ZGNA 2GQKA 4HJ2A 3UBLA 2H70A 1F6MC 3RPNA 1JZOA 2JZRA 2CX4A 1XWKA 3NOFA 4HU9A 2E0QA 2WB9A 2H8LA 1AC1A 5F06A 3KP9A 3QAVA 3CTFA 3EURA 1OC9A 4L5LA 5IQYA 5H5SA 1HD2A 4K6XA 1EOHA 22GSA 1SK1A 3KXOA 5FWGA 3F63A 1B4PA 2CZ2A 2MMNA 4ILFA 1IYIA 1V9WA 2LRNA 5A4VA 5DJMA 2FD3A 5ECSA 3TCOA 1BAYA 1GTBA 1M2BA 3A2WA 1SD8A 1YDKA 2FHEA 6GSUA 2C0GA 5GSTA 2VL2A 1AW9A 3L9VA 2WCIA 4CHSA 4GQCA 3V1WA 3D0ZA 2CV4A 2GT5A 2GQLA 3AY8A 3HZ4A 5JWQB 4ZB6A 3ZITA 1BYEA 1KEBA 2ZCTA 8GSSA 1M9AA 1A2JA 4GLTA 1V57A 1J0FA 4ZBAA 5F07A 4CW9A 3APSA 2VL9A 2IMIA 4HU7A 5HFKA 3UEMA 5F8BA 4AJ8A 3IBHA 3PGTA 4WBJA 4AJ6A 2NDOA 4F0BA 4EE0A 2FLSA 2LSTA 2DJ2A 5AIVA 3C71A 5GAPD 2C3NA 2JADA 4WEYA 2KUCA 1G6YA 3KH7A 2JSZA 1JLWA 4POMA 3BCKA 3KTBA 5J3RA 1UA5A 3M3MA 2OACA 18GSA 1TI3A 2TIRA 1O81A 1EV4A 13GSA 5DBQA 4QL7A 1Q4JA 3C1SA 4G10A 5IPHA 2GLRA 4O92A 1M9BA 1XWCA 4DSSA 5DVBA 3FR9A 2XHFA 2YCDA 1ERUA 3VI5A 4QQ7A 5IO2A 4TR0A 5DAKA 4OFTA 2CAQA 3UMAA 1MD4A 1NHYA 2X99A 5IMCA 2IFQB 1R5PA 1U88A 5G31A 3CRTA 2TRCP 1GNWA 1XBSA 1S3AA 3TOUA 1VF1A 2H1AA 1X9SB 3M1GA 2B5YA 1XWBA 4JRRA 1XPVA 2IWTA 3VWVA 3FR6A 4WF5A 4AF2A 4L0WA 1SENA 2GSTA 4KDXA 3F6FA 3CYNA 3IR4A 1WOUA 3UJ1A 4TRXA 5INYA 1PD21 3FZAA 3BBYA 1TU7A 4N30A 4Q5FA 3BCIA 2ON7A 1TRWA 4HS1A 5DJLA 1GL8A 3VURA 14GSA 4E8HA 3CSIA 5IPGA 5ECKB 4IHUA 5ID2A 3E3EA 4N0ZA 4FIWA 4J57E 1JZRA 4IJIA 2B1KA 3RHCA 1TKDB 3PINA 5AN1A 3CMIA 2HZEB 2AUVA 4GQFA 2H75A 1TRVA 3GX8A 2H6ZA 4IBPA 2EIQA 2MMZA 1AXDA 3APQA 3VWUA 3P2AA 1KTEA 4ECBA 1EP7A 1HNBA 5HFGA 3D5JA 4HZ2A 4KA0A 2XBQA 2H6YA 1TK0B 5IM9A 3VK9A 2I9HA 3QFBC 3GX0A 1NW2A 4WR4A 1B9YC 4H86A 2XPEA 2V6KA 1PKZA 1JHBA 3ZREA 2LQQA 2LS5A 4O7HA 3GUSA 6GSSA 2H30A 1XOBA 3HY2A 4JZQA 4NHWA 1GTIA 2OE0A 2H73A 1Y25A 1QGVA 2H0GA 4GXZA 5ENUA 4GSSA 4KW6A 4JU5A 2H0IA 3O3TA 4FH8A 1GSSA 4RUVA 3KGKA 1QQ2A 3FZ9A 2IMKA 2H1DA 3GNJA 4NMUA 2X8HA 4HQSA 2VCWA 4ULXA 2CVDA 3EINA 4GWRA 4OCFA 3CTGA 3KZQA 2OA7A 2H0HA 6GSVA 1TJDA 2BTOT 1R26A 1R4WA 1M2AA 3RAZA 1QK8A 5DQYA 4HQZA 3J7Yb 4MF5A 1TP9A 2GZPA 3LSZA 1F9MA 4ZB9A 3GURA 2C4JA 2TRXA 2YWNA 1FB0A 2GSRA 1Z5YE 5D93A 1YEXA 3FKFA 2Z9SA 1B48A 1X5DA 1EV9A 3LG6A 3H93A 4POLA 4ECIA 3I9V2 3DD3A 1EEJA 1GWCA 2L6CA 1OAZA 1ERVA 3FK8A 3BD2A 4BA7A 4F82A 1G6WA 1YJ6A 4V2LA 5JCUA 1Z6NA 3W6GA 1T7PB 4IP1A 1PL1A 3EWLA 1I5GA 2H1BA 4JBBA 4X1UA 1F3AA 2YJHA 3DVXA 2A2RA 3ZTLA 1GNEA 3EE2A 4RQRA 2B1LA 3IC4A 1LU4A 3KD0A 2P31A 4ZL9A 1MDIA 4XS4A 1YZXA 3IA1A 3M9JA 2L59A 1NSWA 4IQ1A 2C0FA 3DRNA 3GKNA 3L0HA 5B6MA 1EZKA 1A24A 3HDCA 3GA4A 2F51A 3FHKA 3ZFBA 4PNFA 3IAS2 4DSRA 1O8XA 2FWHA 2PUKC 2K8VA 2B7KA 3O6TA 1MD3A 1GSYA 2EIOA 2JU5A 3ZMKA 2BMXA 1OC3A 3KM6A 1OKDA 2JACA 3EU4A 2VCZA 1K3OA 2HSHA 3UIWA 2HI7A 3MNGA 3GSTA 4DSQA 2LV3A 2FWFA 5IMFA 3QAWA 4KUNA 3VWWA 2DC5A 3Q18A 1YKCA 3P7XA 2OADA 4AJ7A 5C00A 2X64A 2O8VB 3EVIA 1SL0B 1NM3A 2C1YA 2MYGA 1TI1A 2L6DA 2AYTA 3HCZA 3F4SA 1EOGA 3DYRA 3IRAA 2K8SA 2GZZA 3ZL5A 2RIIA 5CNWA 3Q19A 2O85A 3Q6OA 5DDLA 1PX7A 3FY7A 3ZIJA 2CQ9A 2IN3A 2YJ7A 5E4WA 3IXRA 3GKMA 5CO3A 1X9WB 3HZ8A 5CP1A 4G19A 4HJMA 1PRXA 2EC4A 1R5AA 3TJFA 3VWXA 5G5EA 2QSIA 4MPGA 2HZFA 3R2QA 4TXOB 4PNGA 3CSHA 3TKPA 3KIJA 2LUSA 3HA9A 2C0EA 1K0MA 4JR6A 4MK3A 4PUAA 3EYTA 1WPIA 5G1LA 2REMA 4ACSA 2R2JA 3HXSA 3L9UA 2YANA 1ZOFA 2H01A 4BPYA 1FB6A 1ML6A 4WKWA 5ID2B 1OKTA 3I69A 3IHQA 4I97A 1GUMA 1ABAA 3IV4A 4ZBBA 2LNTA 4NHZA 4BVXA 3UAPA 3IE3A 1XVQA 2JL4A 4E8EA 5DQSA 1GLPA 12GSA 4OD7A 2MBSA 2VLVA 3GHAA 3D6IA 1AQVA 1SJZA 2OE3A 2DMLA 3IOSA 3QMXA 3LEFA 5ECIB 4NV2A 2NTOA 1O6JA 2EIRA 1O8WA 2H19A 1LBKA 3ZYWA 4ZILA 2HXKA 2AJQB 2AHEA 1YY7A 2H66A 3TRQA 1FHEA 1B4QA 2VD1A 2IIYA 5CRGA 5CRWA 3EU3A 1THXA 4EVMA 2KOKA 3TB2A 4HEA2 2H6XA 4D73A 5DALB 5J9CA 5H5QA 1A0FA 2IL3A 2HE3A 2KP2A 1XZOA 17GSA 1Z3EA 4YH2A 2B5EA 4KSOA 3F3QA 4GTUA 2IPAA 4ZB8A 4HDEA 3GTUA 4X43A 3TKSC 3ZVJA 2WJUA 3F3RA 3TJBA 2JZSA 1RQMA 2WGRA 1XIYA 1OE8A 2YV7A 5KN1A 1SL2B 4XRAA 1KNGA 3TJJA 4KDYA 2OKAA 1PL2A 4JE1A 4Q5NA 3TRPA 1A8YA 1GSEA 5AIXA 1XVWA 4V2MA 1ST9A 2PGTA 2N5FA 1Q98A 4YQVA 5EL8A 3L4NA 2LTKA 1OVNA 5ECRB 4J2FA 1VRSD 3ZFLA 2X8GA 5IO0A 3QDNA 2G2QA 2WZ9A 3LYPA 1T4ZA 1T3BA 2J9HA 1FG4A 2YOIA 4IS0A 3WGEA 3U6VA 1PQNA 1S3DA 1XFLA 4XCSA 3L9SA 2CX3A 5CREA 3J7Yk 2M72A 1THOA 3E9JB 6GSTA 4IN0A 1WJKA 3UBKA 2C3QA 3APOA 2O89A 2A4VA 1M7TA 3VI7A 1SKWB 4OMVA 1SK0A 1SYXA 3VPQA 5ECQB 4K0GA 3EC3A 3F9UA 4EXJA 4MPFA 4PUFC 5DCGA 4GF0A 4EL1A 1TDIA 2FA4A 3MSZA 1C72A 1T4YA 1ZMAA 1GSFA 2C0DA 5LCZA 4XRDA 3PH9A 4TOPA 5B8BA 3QCPA 3MAKA 1WP0A 4N11A 2KP1A 1O7UA 4GSTA 4TR1A 3L78A 5HR3A 3UARA 1X0RA 2A2SA 2PMTA 2WS2A 2VCVA 4QL9A 4K9ZA 2KLXA 1SJIA 1X5EA 3KJYA 2GDRA 4K7OA 4O5RA 4HI7A 1TRSA 3VFIA 1UN2A 1G7EA 1QXHA 5G30A 2PERA 3GL3A 4L8EA 3DKSA 1Z9HA 4ECCA 1IYHA 2V32A 1JZDA 4HOJA 4KDUA 4KH7A 4BWQA 4KB3A 3GN3A 4JEDA 2YPMA 4WBRD 4L0UA 3LQ7A 4MZWA 4WETA 3ZVJD 4MDCA 4ECJA 1GP1A 5D9VA 4MF6A 1YKAA 2F9SA 1ON4A 3ME8A 3K8NA 4YAPA 4IKHA 5D73A 3FYGA 4K7IA 5G2ZA 4NWYA 3PR8A 1EP8A 1B9XC 1A0RP 2QKEA 4PX1A 4NV5A 5GZZB 4MA9A 4L5OA 2FCHA 3TOTA 1K0NA 4I8BA 5EPFA 3FZ4A 1SK2A 2IFQA 2XBIA 3WD6A 1Z6MA 2C3TA 1GUKA 2LEGA 5COHA 1FOVA 2GQMA 1HQOA 5EY6A 3VLNA 2C80A 3A2VA 1K0OA 2KHPA 2WFCA 2VOCA 2D2ZA 3RBTA 2PPTA 3TKSA 4F9ZA 1SKRB 4POKA 3DEXA 3Q74A 5HFIA 5JWRB 2FNOA 3E0UA 2B3SA 3F6DA 2I3YA 2YN1A 2WDUA 1TRUA 2GS3A 1PSQA 1BQ7A 1XCCA 2IMEA 1B8XA 3GFKA 4BWSA 2L57A 3M9KA 1GUHA 2VL2C 2CAIA 1ERWA 2R4VA 3G7IA 5H5RA 1OC9B 1DE1A 2VLTA 4LL4B 2R3XA 1XWGA 1PKWA 3ED3A 4K2DA 3BJ5A 5ABRA 1PGTA 4TR4A 3TJKA 5L71A 1YF0A 2HZEA 3LWAA 4PQHA 1OYJA 3I6AA 1SKSB 4KCAA 2WRTA 1ZZYA 1G0TA 4IJ3A 3DMLA 4ML1A 2E7PA 3RHBA 2GSQA 5CRHA 10GSA 1EWXA 4OO5A 2OJLA 2DIYA 3TKQA 3WT2A 2CT6A 6GSWA 4LLRA 3UL3A 1AAZA 1DUGA 4NAXA 5ECPB 2F3MA 1VGLA 3MDKA 1KBNA 3VPTA 3HKRA 2RM6A 5GAND 1OC8A 2AAWA 1K0DA 4J56E 4ML6A 3TKSE 4N10A 1ERTA 1M99A 3GKXA 1GTAA 3DXBA 2P0GA 4KE3A 5IMAA 5FHIA 4ZBDA 5B7CA 4MF7A 3GL5A 4ID0A 1O85A 4EO3A 1AQWA 3M0FA 1GRXA 3GMFA 20GSA 1VF4A 4XIHA 4IQAA 1CQHA 1U87A 2HT9A 1TXXA 4EDZA 3LORA 2VD0A 1AQXA 1K0AA 5HR0A 3HVVA 4ZL7A 1T1VA 1F37A 2N5AA 2LRTA 3I43A 2MZCA 3LYKA 4LA1A 3DGQA 2ES7A 3UVHA 2LRCA 1M2DA 16GSA 2ON5A 5CYYA 1PN9A 2B6MA 3DWVA 3S9FA 4TW5A 2ZUPA 4DSSB 2DJKA 5CRDA 3HJOA 3CXGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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