3TJKA

Crystal structure of human peroxiredoxin iv c245a mutant in reduced form
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
LHLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVAPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Peroxiredoxin-4
publication title Crystal Structure of Reduced and of Oxidized Peroxiredoxin IV Enzyme Reveals a Stable Oxidized Decamer and a Non-disulfide-bonded Intermediate in the Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 64
structure length 195
sequence length 195
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tjkA00
1UC7A 4AF2A 2C3NA 1TDIA 1T8EB 4FYCA 1GTAA 2EIQA 2GT5A 2VD0A 1JZDA 4F03A 4IN0A 4XIHA 3KMNA 1BEDA 5LNKe 2LTKA 3HVVA 1OKTA 3QCPA 4RI7A 3ZVJD 3DXBA 3M9JA 3KM6A 2V6KA 1VGLA 2CT6A 4N0VA 5EVOA 2V1MA 4OD7A 4WBRD 3HJOA 4ZL7A 1XBSA 2TIRA 1RK4A 1S3AA 3IA1A 4BVYA 3GSTA 4PXOA 3TJFA 1F9MA 6GSSA 4TR1A 1GL8A 1TW9A 2X8CA 3ERWA 4IJ3A 1EWXA 3VWVA 5JCUA 2WULA 4V1Ag 2AAWA 2IJYA 1SL0B 3F63A 3KXOA 1WJKA 4TXVA 2R5GA 4GF0A 5J9CA 5DALA 4ECIA 5ECSA 3UJ1A 3P7XA 2VCZA 3GKNA 4Q5QA 4XTSA 3GRXA 2DJ1A 2AHEA 2YN1A 1M7TA 2WDUA 3AY8A 4ULXA 3I69A 4JBBA 1B8XA 2NPBA 4WKWA 12GSA 3M1GA 4ID0A 4ZILA 5ECRB 1GUHA 5DAKA 4FH8A 4YAVA 18GSA 4TN8A 2ALBA 1R4WA 1F37A 5D9XA 3P8WA 4IW9A 1GTUA 4YH2A 2PMTA 1R26A 2HSYA 1XOAA 4WXTA 2K8SA 2WJUA 1PA3A 1SK1A 3UARA 4O32A 1O8XA 1I9DA 3GH9A 1NM3A 2KP2A 5G31A 1V98A 5D73A 3MWHA 5IPGA 5HFKA 2H8LA 5FHIA 1TP9A 2A2SA 4IHUA 1PQNA 1PL1A 2CVKA 1MD4A 2DC5A 4ZB6A 3NIVA 1XPVA 4WBJA 4FYBA 3L9SA 5E4WA 2V32A 4ZIJA 1TU8A 4K7IA 5ECKB 2B5XA 4G2EA 2YANA 3CRTA 4ZB8A 1YKCA 4G19A 4NXIA 1PX6A 2X8GA 5G1KA 2H71A 3LXTA 1WPIA 3DEXA 1AIUA 1ILOA 4IP1A 1MD3A 5L71A 3KTBA 3HA9A 1K3OA 3F0IA 4EDYA 4RQXA 1EOHA 4PNFA 5CYYA 4MZBA 1WRYA 1FB6A 3TOTA 3VFIA 4KSMA 4L0WA 2CZ2A 2JZTA 5ECIB 1SD8A 4KDYA 4HS1A 1TRVA 3ZVJA 4KCEA 2HNLA 1B4PA 3C8EA 1MTCA 4V1Ap 2QGVA 2O85A 3IK9A 2FWGA 4KB3A 3M3MA 5COHA 1QGVA 1B9XC 2HYXA 4EKZA 3DVWA 5H5SA 4N11A 5ECLB 3FY7A 2ON5A 5A4VA 2LJRA 1GTIA 3R2QA 4LL1B 3SBCA 2MZCA 5B8BA 1U3AA 1IYHA 3GL5A 3F3QA 2PVQA 4L0UA 3GTUA 3UVHA 5H5RA 4N10A 4EE0A 2PGTA 4O5RA 4MF7A 4MH3A 5IMDA 3BBYA 1FVJA 3GA4A 3DKSA 4AJ6A 2DMLA 1XWKA 2VIMA 2VLUA 2H66A 3GMFA 3HJPA 5FT3A 5CRDA 3O76A 1SU9A 2DMMA 3JCML 4JU5A 3GURA 2GLRA 3QMXA 3GSSA 3VWWA 1OC8A 3BD2A 1PL2A 5CRWA 4XS6A 4EUYA 4NV2A 3RBTA 5DCGA 3EYTA 1Z3EA 4IKHA 11GSA 4FO5A 3F8UA 3D0ZA 2FLSA 3DGQA 3FKFA 3IAS2 4POKA 4PQHA 2H73A 4OFTA 2PN8A 1XWAA 2GDRA 4YAPA 2EIRA 1M2BA 1JHBA 1ERTA 2GTUA 1V40A 2NTOA 3LG6A 22GSA 1BX9A 9GSSA 4J57E 4GLTA 1YEXA 3FZ9A 4PX1A 2DJ0A 1ML6A 1T7PB 5KN3A 6GSWA 4OFNA 4TRXA 4FIWA 3J7Yk 4L5LA 3F4RA 19GSA 1GSYA 1EV4A 3BCIA 3BJ5A 4MJEA 1LBKA 4OO4A 1USBA 1TI3A 1JZWA 5AIXA 3F6DA 1R5AA 2DIYA 1XOBA 3N9JA 3DWVA 5B7CA 2HZFA 1FHEA 1M9BA 4D73A 5ECOB 2FGXA 2R4VA 2EC4A 3ED3A 3HYPA 2DIZA 5F8BA 2NBSA 3KD0A 1Q98A 3HXSA 1OC9B 2RUEA 4OCFA 2E0QA 3GKXA 1W4VA 7GSSA 5EY6A 2RLIA 1HD2A 2FA8A 2PERA 3EU4A 4GWRA 2IN3A 3ZLPA 4IQAA 5IQYA 2J23A 1K0AA 4JEDA 4IJIA 4E8HA 3H93A 1BYEA 5HQPA 1TXXA 3VPQA 5AN1A 2GZPA 1O85A 4G9HA 4BWSA 2P5QA 1G0TA 2GS3A 2VM1A 2LQOA 4NMUA 2H0IA 4MF5A 1E2YA 1YF0A 1A23A 4X0XA 4MK3A 2RUFA 4QL7A 4HQSA 4ML1A 5AIVA 1K0MA 2H74A 1X5EA 3Q74A 1QMVA 1PSQA 2OE3A 1SD9A 2M80A 5IMZA 2C3QA 3A2XA 2N5BA 1UVZA 1ZOFA 1EEMA 3F4TA 1AQWA 1WMJA 4JR4A 5CAXA 4F82A 3TJKA 1T00A 2VM2A 3GFKA 1J9BA 2B3SA 1W89A 2VCVA 3ME8A 2G0FA 3GUSA 1CQHA 4NAXA 5HR2A 3US3A 2R37A 5C04A 2IIYA 1URMA 2PU9C 2H6YA 2C0DA 2VCQA 1FO5A 2AB6A 5ID2B 1DUGA 4K1FA 2BTOT 3IV4A 3UOMA 1PGTA 5CO3A 3TB2A 5F05A 1MDIA 2MMZA 3MNGA 2VD1A 4PUAA 3QAWA 4EVMA 4L5OA 3GN3A 2HLSA 1EP7A 3OR5A 3DYRA 2DBCA 4EDZA 2L6CA 4TVEA 5KN0A 2IFQB 2IWTA 2A4VA 4EL1A 3FHKA 1VF3A 3HHVA 3EVIA 2VL2C 3F9UA 5FWGA 3W6GA 1ERVA 4GQCA 5H5QA 3D21A 4IQ1A 1SK2A 4KE3A 1Z7PA 5D8IA 4ML6A 1SYRA 2ZNMA 2B7JA 2I4AA 3CTGA 2C80A 2Z9SA 4K8MA 4TXOB 5LD0A 2OBIA 1J0FA 4PUFC 4Q5FA 2YOIA 4HJ2A 4WF4A 5J41A 1UA5A 3CSJA 2YJ7A 2I9HA 5KN1A 1QUWA 1G7EA 2CX4A 1EP8A 2WS2A 2OJLA 3LSZA 3H8QA 4PURA 1OE7A 2FNOA 3EMXA 2LJAA 2QKEA 4MPGA 2CA8A 2VLTA 3S9FA 4GSNA 1O8WA 4F0CA 1SJZA 4MPFA 4PQ1A 3UVTA 2H1BA 5D9TA 3ZREA 5DBQA 2JSYA 1XFLA 1FW1A 3VLNA 2F3MA 4TW5A 5D9VA 4K7NA 1V57A 2H75A 2IL3A 1GH2A 3PGTA 4KCAA 4ZXGA 1AQXA 5A5KA 2KUCA 1FVKA 1V2AA 2GT6A 2LNSA 5ECHB 2B7KA 2KOKA 3HKRA 5DQYA 6GSUA 3FR3A 4XRAA 4KNDA 2LRNA 3BOAA 2IMKA 2H76A 5GAND 4MZCA 5ELGA 4ECJA 2LUSA 1FB0A 4OMVA 1KEBA 1FOVA 5JCGA 4RQRA 5G5FA 1X5DA 3E0UA 1O73A 2B5EA 1GWCA 3MAKA 3VI7A 3GKMA 2F8AA 2H30A 3FZ4A 1NW2A 2K8VA 4ILFA 4RUVA 5CREA 2V41A 3ERFA 1VF4A 2X99A 2QSIA 4ZB9A 4F0BA 3V1WA 4LMWA 1XCCA 3FW2A 1XWBA 4PNGA 2HRFA 4MA9A 2TRXA 5CRGA 4Q5NA 4O92A 4E8EA 4JR6A 4MLYA 1JLWA 4GXZA 2C8UA 2IPAA 3DRNA 4O7HA 3KTLA 2N5AA 3QD9A 4OCEA 5INYA 2I1UA 1GSFA 4EC0A 5IO0A 3LEFA 3L4NA 5JWQB 4CW9A 2QC7A 3ZMKA 1WOUA 1THXA 3TKQA 1PKWA 1SK0A 2M46A 1XW9A 1F2EA 2LRCA 3A2WA 3TRQA 2H1DA 4YQMA 2I3YA 2JZRA 2OADA 2R6KA 3RHCA 2FUG2 3CRUA 4V2MA 1I5GA 1GUKA 5HR1A 5EL8A 4YQUA 2K9FA 5JCWA 2HFDA 2D2ZA 3TKSA 3SWLA 1T3BA 1F3BA 1Z7RA 4Z7XA 1EZKA 2WCIA 3HZ4A 4KAEA 3APSA 1K0CA 3TUEA 4H86A 4DEJA 5CP1A 2LJKA 3G7JA 3C1SA 1N8JA 3M8NA 1ZGNA 4F2IA 3GX8A 4DSSB 3TCOA 1WIKA 1GULA 5D9WA 2HRNA 2F51A 2DJ3A 2VL3A 3KCMA 1SKRB 3N5OA 3GYKA 3WT1A 1YF1A 3HZ8A 2VLVA 1A8LA 3I6AA 3CSHA 3QFBC 3LQ7A 2VCTA 2MBTA 4TKYA 1SYXA 3ZIJA 1A2LA 1X9SB 3KH7A 1F6MC 3D4MA 1TRWA 6GSXA 4OFMA 5G2ZA 1OC3A 20GSA 3IK7A 3HD5A 1MDJA 5IOXA 2X8HA 4I2UA 5IIZA 1XIYA 3FZAA 2VAFA 4RI6A 3WGEA 3UAPA 1B9YC 5F0GA 2BMXA 1YJ6A 4I2TA 4HZ2A 4MH2A 3W8JA 2XBQA 1S3CA 4J2FA 4HQZA 3CMIA 2FY6A 1XXUA 2XC2A 2L4QA 1DBYA 1XW6A 3UIWA 1OC9A 3A3TA 3EMPA 1QQ2A 2XPEA 4TR0A 1M99A 3ZZXA 5A4UA 2FHEA 4KH7A 1M2AA 3ISOA 2ES7A 2YZUA 2ZCTA 2WB9A 3A2VA 2REMA 3HDCA 3HJMA 5AISA 1SKWB 5A4WA 3IAM2 1XWGA 3CTFA 2R3XA 4XS4B 1GP1A 2CX3A 1A0RP 1U88A 1V9WA 4L8EA 3EURA 4KW6A 1TI1A 4XHMA 1TU7A 2YWIA 4LMVA 1ZL9A 5IM9A 5KN2A 1PN9A 5ECNB 2PUKC 4EF0A 2GZYA 2YV7A 3QR6A 1A2JA 2MYGA 3FRCA 3H1NA 5D93A 2YNXA 4NWYA 3KP9A 3IBHA 4DVCA 3LORA 4MJBA 1DSBA 5IMVA 4KGIA 2G2QA 2AV4A 3CXGA 3KGKA 2DLXA 2NDOA 1WP0A 3KEBA 1A8YA 1OVNA 2VCWA 3GIXA 4WF5A 3ZIVA 2DSAA 3ZITA 14GSA 4OWYA 4ECCA 1TK5B 2FWHA 1WE0A 5IOWA 5ENUA 2IMIA 3EU3A 2KLXA 5ECQB 1Z6NA 5ID2A 2YZHA 2X64A 3GL3A 3H4KA 4CHSA 2C4JA 4CDOA 4NV5A 1FG4A 4MJCA 4GSSA 2V6OA 4PQIA 5EPFA 1JZRA 3FEUA 2L6DA 4MDCA 3KJYA 4WR4A 1JZOA 2JL4A 1NHOA 3E3EA 3WD6A 4K2DA 2OE1A 1JLVA 2OKAA 5ECMB 4KX4A 4F9ZA 1GSUA 1XZOA 1SL1B 1O6JA 3W8SA 4TR4A 2PPTA 4EXJA 2IFQA 2R2JA 3UEMA 5J9BA 3EINA 5JWRB 3FK8A 4JRRA 4IGJA 2KHPA 3U5RE 2GZZA 2B1KA 5C00A 4AJ7A 1O81A 1HNCA 3VWUA 4ZBAA 2RM6A 2GSTA 3D4TA 3TRPA 3LWAA 6GSTA 3QOUA 1E6BA 3ZFBA 4TXOA 1EV9A 3IDVA 1TK8B 1B4QA 2OACA 3LYPA 1A0FA 3PINA 2AYTA 4QQ7A 1U87A 3RDWA 3WT2A 2HXKA 1YDKA 4HI7A 1QK8A 4MMMA 2H1AA 4HEA2 2O87A 1DE2A 3CBUA 1U3IA 3TOUA 2P31A 3L0HA 2B5YA 1GNEA 2CQ9A 1PKZA 1EGRA 3IRAA 2LSTA 2GSSA 2HE3A 3HVXA 1HQOA 4MP4A 2CZ3A 1BAYA 2LV3A 5G1LA 1M2DA 5IMFA 1T1VA 2JU5A 2L4CA 2IMEA 3EE2A 2YWMA 3D22A 1H75A 4IP6A 1A2MA 1TOFA 4POBA 2C0EA 3UL3A 3Q6OA 2L57A 1G6WA 4J56E 2AJQB 3C1RA 3KH9A 2GSQA 5GSTA 3RAZA 2E7PA 1AXDA 3P2AA 2AUVA 1F3AA 1TRUA 5AGYA 2MMOA 2FWEA 2YCDA 4ZBBA 1SKSB 3F4SA 1PMTA 5ELAA 4EO3A 1Z9HA 2YPMA 4IS0A 2PWJA 5IPHA 1ERUA 3G9BA 4BA7A 1TKDB 2WGRA 3UBLA 2F8FA 3LGCA 3VK9A 4X1UA 1XVWA 4TR1B 1LU4A 4OO5A 3C73A 3F6FA 4I8BA 4WEYA 4IBPA 1YY7A 3VI5A 2FA4A 3QAVA 3KMOA 4IELA 2RIIA 4XRDA 1ZZYA 2PBJA 1WWJA 1ZCPA 2LRTA 3I9V2 2C1YA 4I5QA 3TGZA 2YJHA 3CYNA 3LFLA 2H1GA 3RHBA 5DALB 2OBKA 3HVSA 4G10A 1T4ZA 6GSYA 2WFCA 1UN2A 3Q19A 2LNTA 4LL4B 1ABAA 2YV9A 2IMDA 2N5FA 4FYUA 2B1LA 2LEGA 4HU9A 3IR4A 3FZ5A 1X5CA 3O3TA 2DJKA 1HYUA 3G7YA 3IC4A 5DAKB 1XW5A 5HR0A 3VPTA 1KNGA 3GH6A 5KEJA 4GRFA 3I43A 3MSZA 2WZ9A 4X43A 4KUNA 1AUCA 2CVBA 3GV1A 3VWXA 4MJAA 1X0RA 4NHZA 16GSA 2O89A 1ST9A 3GHAA 2VUPA 5F06A 1ZMAA 2PVOC 2A2RA 2C0FA 2C0GA 2F9SA 1VRSD 2LKUA 4IVFA 1YQ1A 2XPDA 2WRTA 5DJMA 4HU7A 1MEKA 2MBSA 4ZL9A 4NPBA 4KDUA 1H4OA 4AJ8A 2GVPA 4ISDA 3O6TA 2MMNA 1XWCA 4DSQA 3TJBA 1Z6MA 1SL2B 3NOFA 3ZFLA 3H79A 1ZYQB 1KBNA 3UMAA 1X9MB 1C72A 1YKAA 4MZWA 3TDGA 1AAZA 4HOJA 3D6IA 2BJXA 17GSA 3FR9A 5F07A 3HY2A 4GQFA 2VCXA 2I81A 1ON4A 1HNAA 3C71A 3HCZA 4TOPA 4K9ZA 1OKDA 1GTBA 1THOA 4XS1A 1OAZA 1GNWA 2H0GA 5IMCA 4JZQA 2E2MA 2CAQA 2GSRA 1PX7A 4HJMA 4LA1A 2C3TA 3KP8A 3EC3A 4I97A 5IO2A 1X9WB 1QFNA 4DSSA 3TJGA 3LXZA 3L78A 5LCZA 1XVQA 2JADA 3ZL5A 1K0NA 1BG5A 1AW9A 5B6NA 1TRSA 1TK0B 3F3RA 4MCUA 3GTUB 3GX0A 2XBIA 1J08A 1GSQA 1K0OA 4WR5A 2CVDA 3IXRA 4GSTA 3IOSA 4QL9A 1PRXA 2E2GA 4ZL8A 2VL9A 5J5NA 2DJ2A 3VURA 4POMA 4PGTA 4MF6A 4ZBDA 2IMFA 13GSA 3Q18A 5JWOB 1EEJA 1O7UA 2H70A 3WGDA 2VL2A 1K0DA 4KA0A 1ZYEA 1T4YA 3LJRA 1GSEA 1GLPA 2H6ZA 3E9JB 2ON7A 4N0ZA 4N30A 3CSIA 3KIJA 1OE8A 2YWNA 1R5PA 4ACSA 3ZRDA 2JACA 2P5RA 1K0BA 2KP1A 6GSVA 3QDNA 3EWLA 2H0HA 3ZTLA 4WETA 1RQMA 4MABA 1K3LA 2EIOA 3RPNA 4HUAA 2RM5A 2YWOA 2HI7A 3C7MA 3RPPA 4BPYA 5DDLA 2FCHA 1DE1A 3TJJA 2K6VA 3TKRA 4XS4A 1AQVA 5GSSA 4GCIA 5B8AA 4K0NA 5GAPD 3TKSE 2HSHA 1U6TA 2TRCP 1JFUA 3M9KA 4V2LA 4TR3A 4JE1A 4KDXA 1VF1A 1IYIA 2LS5A 3TKPA 2H19A 3D5JA 5D96A 3L9VA 1Q4JA 4KSOA 2OE0A 2ZUPA 3ZYWA 1B48A 4DSRA 3DD3A 3A5WA 3PR8A 1M9AA 4D73B 1VF2A 4BWQA 2YP6A 5DVBA 3PH9A 1HNBA 10GSA 4AGSA 1GLQA 2MMAA 1R7HA 1PD21 5HFGA 2H01A 3DIEA 2JZSA 2OA7A 2VOCA 1NHYA 2HZEA 2XHFA 2GQKA 4HZ4A 3QAGA 4XCSA 3TRXA 4K6XA 4Q5RA 4BL7A 3NZNA 5CRHA 3APQA 3WYWA 1K3YA 1Y25A 2HZEB 3QFAC 5B6MA 3FYGA 4K7OA 1EGOA 3FR6A 3LYKA 3U6VA 3L9UA 3QPMA 5HR3A 1M0UA 2L5LA 1SJ6A 1Y6EA 1V58A 5DJLA 2HT9A 3P90A 4K0GA 1FAAA 3GNJA 5CNWA 5HFIA 1ERWA 2DJJA 3GKKA 1GSSA 2FD3A 3TKSC 2GGTA 1BJXA 3BCKA 3MDKA 5E59A 2JSZA 5ECPB 1BQ7A 3ERGA 3APOA 1TJDA 5G30A 1AC1A 2H6XA 2L5OA 1ACVA 3G7IA 2V2GA 1EOGA 1G6YA 4P3YB 5GZZB 4GTUA 4ECBA 3DMLA 4HDEA 5DCHA 2CAIA 1N2AA 2P0GA 5ABRA 3J7Yb 3IE3A 3IPZA 1GSDA 1MDKA 1YZXA 3WGXA 1NSWA 2L59A 1SJIA 1LJRA 1S3DA 4LLRA 1GRXA 2GQMA 4NHWA 3ZMLA 2K18A 4YQVA 1YEPA 2VO4A 5DQSA 4BVXA 1TTZA 1SENA 2LQQA 2B6MA 1A24A 3IHQA 4I6XA 2M72A 2H72A 3M0FA 1G7OA 8GSSA 2CV4A 3ME7A 2FWFA 4V2NA 5J4UA 2NVLA 5J3RA 2O7KA 1QXHA 2O8VB 1CQGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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