3TKDA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and cyclothiazide at 1.45 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Thermodynamics and structural analysis of positive allosteric modulation of the ionotropic glutamate receptor GluA2.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tkdA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tkdA02
3OSQA 3PUVE 2UYEA 3S9LC 2ZNUA 5L9OA 3FJMA 1M5BA 4MFIA 2IEEA 3GBBA 2DYXA 3OOAA 4M1VA 4G4PA 1USYE 3KSJA 4FATA 3EQ1A 1UTHA 1RKMA 2F36A 5I58A 1D9YA 4F19A 3MWBA 4RA1A 2QRYA 3TTMA 1LAFE 4G8HA 3SEYA 3HV1A 3LSWA 3EN3A 5HM4B 5DVIA 1MH3A 3C4MA 3JV9A 3O97A 1D9VA 2OWTA 4IO4A 5ICTA 3T9XB 2PYYA 4POWA 3HHFA 5IKBA 3O6GA 3K6WA 5AA2D 1AL3A 3H6VA 4EF2A 4P11A 3LUYA 2REJA 1EZOA 3L6HA 3KG2A 3TTRA 1P1OA 2DVZA 3G3FA 3U1OA 2OJTA 4BDQA 4KYEA 3OO8A 3FVOA 4H65A 1MPDA 2OK2A 3IR1A 4OERA 2XXRA 3TUSA 4PFUA 2HEUA 2OCUA 4ISUA 3T9UA 4OTEA 1LBCA 4OFLA 4TOZA 3HHGA 2O68A 2YLNA 1BTJA 4BDRA 4XXUA 1MPCA 1IITA 4R75A 5HBCA 5CBRA 3H6TA 3SEXA 1PC3A 2Z23A 4DCYA 4RXLA 1N04A 1SVXB 2ZNSA 4ZDMA 2V25A 3K1PA 3TDJA 3OEKA 2P0SA 3SERA 2Z8FA 1MY4A 3O9PA 4EF1A 4F1UA 2OZZA 4I9DA 4P0IA 4JWYA 5ITPA 3BKIB 5KDTB 1H43A 1N3WA 3U72A 3E4RA 3IB1A 4ESWA 2O69A 1XT8A 3KJ7A 4KD5A 1N0TA 4I8CA 3DP6A 5M2VA 3MUQA 3TAJA 4F3SA 3MP6A 4G68C 1IUDA 2D3IA 4X48A 2QJEA 1OQHA 1YAEA 4F3GA 1UTHB 5K2XA 3TPAA 1B40A 3LSXA 4R9FA 3T93B 4AB6A 4C1UA 4TQUQ 3THIA 1LB9A 2XXWA 4OMBA 2RF1A 2Q2CA 3WAFA 3QXMA 3TQWA 2NWJA 4G68B 4NE4A 3SETA 1MXXA 2H25A 5DT6A 3Q28A 2O84X 2V3UA 2F34A 3LC8A 4C0RA 5H8QB 5KCJB 1GR2A 3EPEA 4ZEBA 4OEVA 5LOMA 1VE4A 1P1WA 2VP1A 3VDFA 1H45A 1B3GA 1Y20A 2H99A 3VLUA 4PFYA 2XHDA 2CZLA 5H8HB 4Q0CA 3VE1B 1LB8A 4LVQA 2VD2A 4WEDA 4FECA 1NH7A 4ONYA 1N7XA 1IZ1A 1D4NA 3UA8A 4OYVA 3PPRA 3GZGA 1IXCA 4JWOA 4OESA 1O7TA 4NF4A 3W9WA 1RYXA 4KI0E 1B58A 4XKPA 2DWJA 4UACA 1XOCA 5JTYB 2DP8A 4ELQA 2PT1A 3K1NA 1Y4TA 1QKBA 5FTHA 4LUBA 3RNNA 3MC2A 4LP2B 4ZZAA 2PX1A 3HO7A 4POXA 3VLWA 5TU0A 3E13X 1JVYA 2XXVA 3D4GA 2I0BA 2QS2A 1M5DA 1ZMGA 1B0LA 2P1SA 3CRBA 2NVUB 2VD3A 1S9TA 3VV5A 2DXYA 3H4ZA 3DP4A 5DEXA 1VFEA 4H5GA 4MF3A 4BDNA 3UIFA 4OFOA 5KZTA 3E3KA 5H8FA 1IEJA 1BIYA 4H1XA 1SW5A 4GL0A 3SEVA 4IY5A 1MPBA 2O7IA 1B51A 2Y84A 3MPKA 2HQ0A 3IB0A 3W9VA 1I6AA 1LSTA 1VSOA 3IK6B 3K6XA 3PUYE 4KFQA 3N94A 2Q8JA 3O29A 2O7UA 3C32A 2NUVA 1USYH 1MM6A 3G3KA 3PUZE 4NTLA 4F2OA 2HAVA 3SKPA 2ANJA 3FVKA 4N6PA 1ZU0A 4RNSA 1XVYA 4LQ5A 3TCFA 4MLVA 2YPNA 2GH9A 4KCDA 1FTLA 2AIXA 4JB7A 3PV0E 4E0WA 2A5TA 2O51A 1Z7ME 1N7WA 1NH8A 2RCBA 3G3IA 1P1QA 2O6AA 3FASA 4EQBA 3H7MA 2HAUA 1QULA 1Y3PA 1M5FA 4RK9A 1JVXA 2DWAA 2AL5A 3HPIA 3Q26A 3CSBA 4OETA 1H3DA 3ILTB 2XX7A 3K1MA 4KHZE 4U22A 3IJXB 2QMWA 1QUIA 2FA7A 2DS9A 4YB5A 2RKMA 2XXTA 2ZYMA 3O2AA 3SEUA 2XD3A 1FTMA 3QAXA 5I56B 3TYHA 3CIJA 1DPPA 3MP8A 4LZ7A 2CMOA 3PPPA 1SDXA 3CR9A 3OEMA 1OLAA 4OVJA 2O1MA 3TMGA 4YB6A 2XXIA 4N13A 1Q1KA 4YKKA 3R7XA 4ZZEA 2THIA 2I4BA 4F3PA 1ZKBA 1SW4A 2XXPA 1B52A 2Y7WA 4ELRA 3K0VA 3GLBA 3JYRA 1FW0A 3RT8A 4EXKA 3FV1A 1Y4CA 1I69A 4M4GA 2Q2AA 5I2KA 1FQBA 2XXQA 3TFLA 5CBSA 4DXCA 1FQDA 1SYIA 5TPAA 1UTBB 3OELA 2PBWA 3BFTA 3MAMA 3CI8A 3IO6A 4HS7A 3T9VA 1FTKA 3MJNA 2Z8EA 4LONB 4ZE8A 2ZNTA 1ZBMA 3TTNA 4YKJA 2PT2A 4GIZA 4U4SA 4H67A 4I62A 3PMWA 2X7PA 1ZJLA 1LGBC 1S7YA 2A5SA 1MQJA 1A54A 1XC1A 5AA2B 5FHMA 2E1SA 3KOTA 4KQPA 2Q88A 5FHNA 1FQCA 3SEWA 2GRVA 4ELOA 1SD3A 2GFEA 3S9EA 4KYDA 4QFLA 4GLIA 4GF8A 2I49A 3RY3A 1EZ9A 2O1LA 4YAHX 3C34A 3EF7A 2QS4A 3IX1A 1MH4A 3RQTA 1FQFA 3IOVA 4F22A 4DIGA 1BP5A 2QMXA 3G3JA 5K2YA 3HN0A 1B1XA 5I2NB 1I6BA 5H8NA 3ILUB 1PEBA 5CM6A 4F3BA 4G2ZA 3ODBA 5F1QA 5FHOA 5I84A 3FXRA 3WAEA 3A3CA 2F7AA 5I57A 2XXXA 4OWDA 4OHNA 1US4A 3FUZA 3MVYA 1MG1A 4H0WA 3U93A 3LSLA 3KZGA 3OXNA 4YMBA 4NF6A 4U4XA 1UIVA 5ISUA 2X7QA 1NNKA 1NFTA 3IB2A 3G7WA 3IJOB 1TXFA 3UK4A 3RGYA 3MP1A 2ALUA 5CMCA 3GBAA 5CMKA 4AQ4A 1QUKA 3PPOA 4RY1A 1UIUA 2XX8A 1US5A 5EHMA 5I58B 1BKAA 5HPQA 1Y9UA 3ZKKA 4FE8A 3K6VA 2DE4A 2I4CA 1OLCA 4PP0A 4E0XA 4DXBA 2HZKA 4DDDA 4GL8A 1OQGA 4QFOA 1TFAA 1JW4A 2XXHA 1LFHA 2H9BA 3QSLA 3ZS6A 3OO7A 4Q30B 3K00A 3C9HA 1MXYA 1QJMA 5ITOA 5A5XA 5BUUA 4GQOA 5JEIA 1BLFA 2ESNA 1XS5A 1B3HA 4LA9A 2HFBA 5EHSA 2F7BA 4PQJA 1NNPA 1NKXA 3VXBA 2E0SA 4OQOA 4R2BA 5I59A 1MDP1 4G8NA 3SDFA 4R74A 1B5IA 3IO4A 5DVJA 1FTJA 3D4CA 1P1NA 4WKMA 3ZKLA 1A8EA 4OZ9A 4LZ5A 4C1TA 3PPQA 1OVTA 2F78A 5JK4A 2F35A 3VFJA 5AA4A 1P1UA 3VVFA 2HCAA 1YTVA 1JEUA 1DTGA 5EYFA 2XX9A 4PE5B 4EUOA 1PB8A 4XTCQ 2BJJX 2RC7A 4EQ9A 1B5JA 3B7DA 1J1NA 4XKNA 4YKIA 1MY1A 3PMVA 2REGA 3EHSA 4NF6B 4O3CA 3QUJA 1CB6A 4F2QA 4GWOA 3FATA 4QFKA 1A99A 1XVXA 4P0GA 4JSDA 1LAGE 5F7VA 2HZLA 1B7ZA 3FVGA 3PD8A 1SQYA 4NEDA 1R9LA 5AE4A 1TT1A 3MZ1A 2Y7IA 3CVGA 1WODA 3TCHA 5CI5A 2B3BA 4NF5A 3Q27A 1S50A 5IAIA 3PD9A 1MRPA 1ZTYA 3CG3A 3Q29A 4ZE9A 2FYIA 2QPQA 3PUXE 4PETA 3K02A 1JW5A 1A55A 1OIBA 4FEBA 3SESA 3W15C 1ATGA 3S2VA 1A7LA 4LZ8A 4ELPA 4NMYA 2V3TA 4WEPA 3KJTA 2Q9TA 2AYSA 1Z7NE 1GV8A 4EQ7A 4BLAA 2F5XA 4QRZA 3PGFA 1H76A 2OLBA 3K4UA 3O6IA 1MQGA 1R1NA 3M3LA 2KLFA 4JSOA 1KWHA 1IXGA 3MVZA 4YMAA 4H6DA 2ZYNA 5CC2A 3MBPA 1B4ZA 4KR5A 1URDA 4YICA 1LFIA 3KN7A 4OENA 3B6QA 4NF4B 2PMSA 2DXRA 3MZBA 3V83A 5B7DA 2X26A 1URGA 1HSJA 2D21A 4R73A 4YZZA 3P7IA 2P2AA 1EZPA 4GVOA 4Q5TA 1JW1A 1PB9A 3TZAA 4H8IA 3MQ9A 4IY6A 1AMFA 2YJPA 3C31A 1DTZA 2VGQA 4U21A 2WKYA 3T96B 2M8CA 2G29A 1NNTA 4RPOA 1FTOA 4RJZA 4F39A 4ECFA 5B70A 4DE8A 4IGTA 3KN8A 3QYTA 4ND9A 1QKAA 1LAHE 3PMXA 5DEXB 4QSCA 3RT6B 3M3FA 1MXWA 1ANFA 3OD7A 1R6ZA 1DPEA 3MVXA 1MXUA 2H98A 1SBPA 5H8FB 4TLLB 3LBSA 2UXAA 4FIMA 1JETA 3LR1A 2RC8A 3EHTA 4GFRA 3TTKA 1FCKA 1IIWA 1B3EA 4DCXA 4EDPA 3FD3A 2Z22A 1F9BA 3RLFE 1Y3QA 1ZLQA 5KDTA 2I48A 2I58A 3LSFB 3KFMA 1MXZA 4FORA 1SI1A 3MPLA 2ABHA 4U1OA 4GOTA 3N5LA 3CSGA 1D3KA 2RCAA 4QSDA 3I3VA 2DWIA 5TP9A 5L9MA 1MQDA 4F31B 4G8MA 1HSLA 3FIRA 2F6GA 2Q89A 3N6UA 5AA3A 1VR5A 3OO6A 2UVIA 3FXUA 2A5TB 3I6VA 1MDQA 1MQHA 2R9JA 3U8QA 1NNFA 2R6GE 2UYFA 1YCJA 5DVFA 2Y7PA 4ESXA 2UVGA 3O66A 1M5CA 3VVDA 2F8DA 4G68A 5CMBA 2NOOA 2FNCA 4ZEFA 1LFGA 1DMBA 1B1HA 5H8QA 5KCJA 1JQFA 1IQ7A 1LBBA 3HCQA 4PFWA 3DLNA 4XKRA 1LCTA 3A09A 2V93A 4MLQA 3HSTA 5L8DA 1Y1ZA 3R26A 5H8HA 2Y7KA 2H4IA 2IA4A 1GVCA 4KPTA 1I6QA 1IXHA 3C35A 3JZJA 1AH5A 3K6UA 3IORA 1HSEA 1Y1MA 3ZSFA 3DELB 2Z8DA 1CE2A 4Z7EA 4GRKA 4QSEA 3H6UA 3H3GA 4BDMA 3CFZA 4RPNA 3KBRA 3KN3A 5DYHA 2OBGA 4QHQA 4XKQA 1QUJA 3PUWE 2DE3A 2R71A 3V5AA 3DM0A 4HW8A 2ZYKA 4Q8RA 4IO3A 3ECRA 5JTYA 3B6TA 4JBZA 3IL1B 1JNFA 4JDFA 4EXLA 5H8SA 5I2KB 3TKDA 1VFDA 3G3HA 3C36A 1URSA 1II5A 4QF9A 3TCGA 3V89B 4IO5A 5TPAB 3QIMA 3MW0A 4R6YA 1B9JA 4ZS9A 4IO6A 2H5YA 2GHBA 3L6GA 4I1DA 5TP9B 3K2DA 4FJPA 3UGWA 1LCFA 4H8JA 4OEUA 3MZ9A 1TFDA 4H5FA 4XIGQ 1PBPA 1SW1A 4QFNA 2DSFA 4ZEIA 2XXYA 3KOSA 1MY2A 1MY3A 4NF8A 2B65A 3USDA 4F18A 3M3KA 2DQVA 4ZEDA 2DOJA 2DE2A 4UA8A 1R9QA 3FVNA 1POY1 3VLVA 1QW0A 4NWDA 1NL5A 5CRYA 2V84A 3EHUA 4KYSA 1GGGA 3QUFA 1M5EA 3OSRA 2DWHA 4THIA 2ZYOA 4O3AA 4X9TA 3M8UA 1B2HA 3UN6A 4QFPA 3TEPA 3RN8A 4O3BA 2F97A 4X1BA 3UORA 1LLSA 3U92A 1B3FA 1N76A 3OENA 4N07A 4WXJA 4X1DA 4TLMB 1WVJA 1H44A 3VXCA 3QK6A 3FJGA 4IGRA 2PVUA 3KEIA 5H8NB 4MBPA 5ICQA 4R9GA 4U2RA 2UVHA 2V3QA 5I57B 3KSXA 1QVSA 2I6EA 3ONMA 3O28A 3IOTA 5BWJA 3FJ7A 2GHAA 3B6WA 5CMMA 4LQ2A 4GXAA 3H06B 1UQWA 2F6PA 3CFXA 4Z0IA 5I56A 4G77A 2G93A 3S4UA 1TWYA 5ELVA 4RYAA 1Y3NA 4F29A 2XD2A 5J1DA 4JXIA 4F1VA 1NMUA 1N3XA 1SYHA 4LATA 3BFUA 1YPNA 3IAZA 4HTGA 2ONSA 3R6UA 1B7HA 3CFLA 4YU0A 1LAXA 3OMBA 1OVBA 1B3LA 4KCCA 3DP8A 1B0HA 3N26A 3O6HA 2B3FA 1AIVA 1N84A 4GD5A 1L5TA 3TELA 1DOTA 4NF8B 2QSXA 1B7UA 3VVEA 1B05A 3T66A 3GXAA 1T0KA 3G3GA 4IO2A 3TQLA 4HCWA 1UTBA 1O64A 1SI0A 3TTLA 3F11A 2ONRA 3RTFB 1MY0A 3BBRA 4F1YA 1XHYA 4NWCA 2QL3A 5A5XB 4K3FA 3PPNA 1GTKA 5L9SA 3C33A 2W7YA 1SW2A 4YB7A 4OFJA 4YKPA 1MM7A 1B4HA 3U94A 3RUMA 3H03A 3Q25A 4R2FA 4FEDA 2DVCA 5I59B 3PU5A 4R6HA 1PB7A 5AA1A 1B32A 4IO7A 4R6KA 4U1ZA 4OXVA 3MVWA 2I3WA 2D5WA 3S9MC 1IXIA 2ZMBA 4JWXA 1MS7A 4L17A 5AA2A 3OO9A 5FTIA 2QS3A 1ELJA 3FXQA 5AA4B 1O63A 2RINA 1MXVA 1A40A 4BDLA 5DTBA 1OMPA 3CG1A 4BDOA 3IOUA 3TODA 1PDAA 1POTA 1EU8A 2ZXTA 2VHAA 4AB5A 1ZIUA 3RPWA 2OWSA 4HCYA 1FQEA 4ZECA 1WDNA 2AL4A 2F7CA 3H6WA 2QS1A 2I3VA 1FQAA 3FZVA 2VOZA 4DZ1A 1B46A 1Q35A 5I2NA 2UVJA 4RK2A 3FGSA 4FAJA 1B6HA 3K01A 1DSNA 3S9NC 3T9HB 2NXOA 4ZEKA 2LAOA 4R72A 1MQIA 1AOVA 2Y7RA 1EH3A 3E9XA 3UP9A 3RTWB 1JEVA 2XXUA 1B5HA 2I0CA 2HXWA 3FV2A 4NF5B 4DLDA 3V8XB 4DXUA 4MH5A 3N6TA 3T22A 3I5OA 2RC9A 3KGCA 1RYOA 4PFTA 4U23A 3A3UA 2ONKE 4GXSB 1A8FA 1PBQA 4IB2A 1P99A 3IOWA 3AXFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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