3TKDA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and cyclothiazide at 1.45 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Thermodynamics and structural analysis of positive allosteric modulation of the ionotropic glutamate receptor GluA2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tkdA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tkdA02
2F35A 1B5JA 2DWJA 3FZVA 2IA4A 4LQ5A 1PB8A 3G3GA 2A5SA 3FIRA 5K2XA 1UTBB 3LSFB 4MH5A 4QFOA 4E0WA 3P7IA 3HHFA 2NUVA 3FVNA 3IR1A 2HAVA 4O3CA 1PDAA 3IO4A 2QL3A 3OXNA 3UA8A 1SVXB 4DZ1A 2I3VA 5AA2A 1MQJA 4KPTA 3S9EA 2Q89A 5H8SA 1B7HA 4EXLA 1OLAA 4G4PA 3CI8A 4NTLA 4KYDA 1PEBA 1JW5A 4U23A 4IO4A 2F6GA 4WEDA 1UTHB 2R71A 3GXAA 1B6HA 1O7TA 3TCGA 1LBBA 1ZBMA 2CMOA 2XXTA 3ONMA 3HHGA 4HS7A 1B9JA 2XXYA 1UTBA 3KSXA 4EF2A 1YTVA 3ILUB 1QUJA 1MM6A 2G93A 1VE4A 2O68A 5CMKA 1ATGA 3PV0E 2WKYA 5CC2A 1US5A 3BKIB 5DTBA 4OYVA 4OEUA 3V89B 4DDDA 4ZE9A 3CIJA 4LA9A 3K6UA 3KBRA 1M5EA 2QJEA 1FCKA 1IZ1A 4G8MA 1NNTA 3PD9A 3O29A 1JEUA 3OEMA 3RQTA 3OSRA 1MY2A 1NFTA 1UTHA 2UYFA 3K4UA 1GR2A 1WODA 2REJA 1SYHA 3K1NA 4ELPA 5L9SA 1FTKA 4OEVA 3BFTA 3ZKKA 4EF1A 5FTIA 1XT8A 2AL5A 3SDFA 1VFDA 3R7XA 4TLMB 3C9HA 1FTJA 1BLFA 2H4IA 1B4ZA 4ESWA 5DT6A 5K2YA 4C1TA 3CFZA 2ZXTA 1B3LA 3MZBA 4EXKA 4C1UA 4OZ9A 4OWDA 4OFJA 1ANFA 4QFNA 1S50A 2RF1A 2F7CA 3BBRA 3GBBA 1MPDA 3HPIA 3H03A 4KHZE 4OERA 2XD3A 3U8QA 5AA2D 1P1UA 3W9VA 4U21A 4M4GA 1AH5A 1MQHA 3SEWA 1USYE 2Q2CA 1XC1A 3EQ1A 1ZJLA 1LAGE 3K02A 2UVGA 4PQJA 4DE8A 3HSTA 3U94A 4DIGA 3TTMA 4LZ7A 5EHSA 3PPPA 3PUXE 2ZYOA 3SEXA 2Q8JA 2REGA 3RN8A 2PBWA 3VE1B 3E13X 3MVYA 3A09A 4GQOA 2X7QA 4YAHX 4YMBA 1L5TA 1KWHA 3U92A 3USDA 1GV8A 4R9GA 4JWXA 1Y9UA 4DXBA 3KGCA 4MBPA 1MXZA 2THIA 4QSDA 4FEBA 1R1NA 4XTCQ 3V8XB 3WAEA 2XXWA 3LSLA 1US4A 5CBRA 1DOTA 2XXXA 3IK6B 3QYTA 1AIVA 2O1MA 1LB8A 1DPPA 4XIGQ 3G3IA 3MVZA 1PBQA 1LLSA 1VSOA 3VFJA 3F11A 4LUBA 1FQEA 1R6ZA 3TCHA 2XXPA 1VR5A 1NKXA 3DP8A 2QS1A 3OD7A 5FHOA 4IO2A 4OFLA 4PFTA 4QF9A 4QFLA 3V83A 2Z8DA 2QMWA 4Q5TA 1NNFA 1XVXA 2G29A 1URGA 3MAMA 4RK9A 4AQ4A 1YAEA 5L9OA 5IKBA 3RNNA 1F9BA 4RPNA 3K6XA 3DP6A 3K6WA 4E0XA 1SYIA 4XKNA 4YKJA 5I84A 2ANJA 2GHAA 1J1NA 2F97A 3C36A 1SW4A 1XHYA 3O6IA 2BJJX 4O3BA 2PT1A 3HCQA 2ZNUA 3BFUA 4FECA 2Z22A 1ZMGA 4NF8B 2O84X 2Q9TA 5H8NB 1S9TA 4R2FA 4OENA 4TOZA 3PMWA 3O66A 4EQBA 2KLFA 1OVTA 1A54A 2I49A 3VVEA 3PUZE 4TLLB 2M8CA 1EZPA 2F7AA 2ZYKA 2VD2A 5HM4B 3FJGA 4QFPA 1TWYA 4R6HA 4UACA 3TODA 3M3KA 4UA8A 3S9MC 5CI5A 2IEEA 1LFIA 1BP5A 1P1QA 1Z7ME 1JEVA 4H6DA 3KG2A 3B6QA 2P0SA 3PUYE 4QFKA 4I8CA 4WXJA 3H4ZA 1QJMA 1MPBA 3OEKA 3C4MA 4N6PA 2ALUA 5BUUA 4NF8A 1FQAA 5H8NA 2DE2A 1B5HA 1SD3A 1FQFA 5DEXB 3MUQA 3FD3A 3JZJA 5ELVA 3K6VA 4Z7EA 4PE5B 1JETA 1P1NA 4BDLA 2Z23A 3IOTA 1VFEA 1LAFE 2HFBA 2HCAA 2UVJA 4THIA 3TCFA 3T66A 3A3UA 1XS5A 2X7PA 3TTKA 1YPNA 4GXAA 1GGGA 3EF7A 1O63A 4PFWA 2A5TB 3VLUA 4JWYA 4F3SA 2NVUB 4BDOA 4GL0A 4EQ9A 3VXBA 4H65A 5AA3A 4NEDA 2I3WA 3MQ9A 4KR5A 4KD5A 1SW1A 4H8JA 3H6UA 3R26A 5DEXA 4NF5A 1DTGA 1H44A 3JV9A 4GF8A 3RLFE 3MPLA 3IB1A 3E9XA 4FE8A 1MS7A 2XXUA 4G8NA 4YKPA 4FJPA 4ND9A 4GXSB 1Q1KA 5AA1A 2AL4A 2ESNA 2VP1A 4POWA 2A5TA 1ZIUA 2FA7A 1OIBA 4OHNA 4ZE8A 4YZZA 1BIYA 3CVGA 5ITOA 3U93A 1ZKBA 1N3WA 4R72A 4O3AA 5KCJA 1OLCA 1Y1MA 3EPEA 1B3EA 1ZU0A 4U1ZA 1AMFA 3CSGA 3SKPA 2ZYMA 3K1PA 3OO7A 2F7BA 1M5DA 2XX7A 4OETA 1N76A 1SDXA 2HZKA 1HSJA 2DSFA 4HW8A 3CFLA 1JW4A 1NH7A 3O28A 5F1QA 4XKQA 3D4CA 2XX8A 1RYXA 4RK2A 1MG1A 5H8FB 1B32A 1WDNA 1I6BA 4NE4A 3CG1A 4PFUA 3W9WA 1JNFA 1TFAA 4ZZEA 4NWDA 5IAIA 3GBAA 2D3IA 4ESXA 4LP2B 1TXFA 4X48A 3N6TA 4DLDA 4ELRA 3QXMA 1B46A 2CZLA 2X26A 4ZDMA 2YLNA 2QS3A 1IXIA 2P2AA 1SW5A 2ZYNA 1MY1A 1MQIA 1ZLQA 4ZEIA 2QMXA 1EZ9A 2Z8EA 4NF6B 3I5OA 3FXRA 1IIWA 2V3TA 1B1XA 2Y84A 4OESA 4BDQA 4GFRA 2XXRA 4MLVA 1M5CA 1HSEA 1Q35A 4H8IA 4M1VA 4F29A 5H8FA 4F3PA 3DM0A 4HCWA 1A7LA 2QSXA 3RPWA 5FHMA 3E3KA 4DCYA 1QVSA 1TT1A 2QS4A 2Y7KA 2V84A 5AA4B 2W7YA 2ONRA 2XXIA 2ABHA 2PYYA 3IOUA 1FTMA 1I6QA 2I0CA 4ZECA 3VLWA 1MDP1 4BDMA 2UVIA 4LZ8A 1MDQA 1H3DA 4GOTA 3H7MA 5A5XB 3PPOA 3SEUA 4IGRA 1OMPA 3KN3A 3CSBA 3O9PA 5H8HA 3MP8A 3ZS6A 5CMCA 2E1SA 2I48A 3MWBA 5JEIA 1N3XA 3UK4A 4NF6A 2H98A 3IJXB 3S9LC 1P1OA 3U72A 3L6GA 3T9HB 4YU0A 1MY4A 2VHAA 2DXYA 5ISUA 3B6TA 2O7IA 4GIZA 3ECRA 4JWOA 3IB0A 4GL8A 1NH8A 2YPNA 1FQBA 5AA4A 1P99A 1AL3A 2H9BA 2I0BA 3MBPA 1DPEA 3PU5A 4ELOA 4N13A 1A8FA 3TQLA 2V3QA 1USYH 5DVFA 1LGBC 5HPQA 3TZAA 4IO7A 5A5XA 4F3GA 2R9JA 3TTRA 2E0SA 1SBPA 1B58A 2ZNTA 2OWSA 4EDPA 3KOTA 4RNSA 3LUYA 3Q27A 3LSWA 1WVJA 4F22A 4I62A 1URSA 3VVFA 1MH3A 4R73A 2DWIA 3OELA 4BLAA 3VVDA 5ICQA 1H45A 1I69A 1JW1A 1B1HA 2VD3A 3RUMA 3KOSA 2F34A 1OVBA 3CRBA 3OENA 4JDFA 2RC7A 4H0WA 2F5XA 5CBSA 3TELA 4R75A 4DCXA 2I4BA 1M5BA 2QS2A 3IB2A 3T22A 1SQYA 4PP0A 2H25A 3THIA 1B40A 3H06B 3M3LA 4LQ2A 4NMYA 4U2RA 3AXFA 4YB6A 1N84A 3SETA 4IO5A 3FV1A 4AB6A 3IOWA 3PGFA 4QHQA 1B4HA 4JBZA 4IY6A 1Y4CA 4I9DA 4KYEA 2DVCA 3OSQA 1B51A 3PUWE 2AYSA 1IUDA 2V25A 5I59B 3LBSA 3TTNA 3S2VA 1B05A 4H5FA 1N0TA 4ZEKA 1YCJA 4G77A 5DYHA 1II5A 1LFGA 2DOJA 3RY3A 3EHSA 2DWHA 4OVJA 3DLNA 3FASA 2F36A 1FTLA 4OMBA 3N6UA 2O51A 4ZEFA 1FQCA 2B3FA 3V5AA 3I3VA 5B70A 2OJTA 3RTFB 3OO8A 4U4XA 1N7XA 2PT2A 1Y1ZA 5FHNA 3LSXA 5ICTA 1DTZA 2HQ0A 1DSNA 2OK2A 3ZSFA 3T9VA 4F39A 4I1DA 2I6EA 4NF5B 2O1LA 2OLBA 3KFMA 5I59A 2Z8FA 3L6HA 4FATA 2RINA 1B0HA 4YKKA 4NF4B 3IX1A 4LATA 1LB9A 4TQUQ 1POTA 3IO6A 5B7DA 3TEPA 4G68B 2XXVA 5I56B 3RTWB 4G2ZA 4ZS9A 3H6TA 3ODBA 4R6YA 2ZMBA 3A3CA 3JYRA 1LAHE 4U1OA 4F19A 4Z0IA 2B65A 4DXCA 2DWAA 1ELJA 1A8EA 1BTJA 5KDTB 4F1UA 2RCAA 4U22A 3CG3A 4GRKA 4F1VA 1Y3PA 3MZ1A 3FXQA 2Q2AA 4QSCA 3G3JA 1B5IA 4G68C 2DP8A 3EHTA 3Q29A 4OQOA 5KCJB 3QIMA 2OWTA 2XX9A 4HCYA 1IQ7A 3S9NC 3OO6A 3QSLA 1P1WA 3I6VA 1D9YA 3PPNA 4DXUA 4OFOA 4WKMA 2QPQA 3FXUA 1MXXA 3FGSA 5I2NB 2D5WA 5EHMA 3QUFA 3CR9A 4NF4A 1SI0A 4RY1A 3PUVE 3TFLA 1IITA 4GLIA 3TUSA 3IOVA 1SI1A 4G68A 1A55A 5I56A 1MQGA 1QULA 3PMXA 4G8HA 3LC8A 4RJZA 3KJTA 3IL1B 5TU0A 1D3KA 1MQDA 3T9UA 3R6UA 1B3FA 5CM6A 1T0KA 2Y7PA 4KI0E 5KDTA 3U1OA 3RT6B 4POXA 1MXWA 1B7UA 4OTEA 4RPOA 5I58B 1A99A 2VGQA 3TKDA 3K2DA 1QKAA 3MW0A 2HXWA 4F2QA 2RKMA 3OO9A 2NXOA 2OBGA 3K1MA 4KFQA 2VOZA 2HAUA 1IXHA 5TP9B 4H1XA 3ILTB 3KJ7A 1N04A 1QW0A 2DS9A 3C33A 4FIMA 4FORA 5I2NA 4GWOA 2NWJA 3H3GA 1XVYA 4P0IA 1LAXA 2DXRA 3M3FA 4HTGA 2F8DA 4ONYA 4ZZAA 4RA1A 5I57B 2Y7IA 4IO6A 1B3HA 4X1DA 2D21A 5L9MA 5J1DA 3MJNA 4JXIA 1MH4A 2XXHA 1B0LA 4LZ5A 1MPCA 2H99A 3K01A 3Q26A 3E4RA 2NOOA 3FVGA 1PC3A 5I58A 1Y4TA 1HSLA 5JK4A 4Q0CA 5H8HB 5TPAB 3FJMA 1A40A 4ISUA 2FYIA 5TP9A 4PFYA 1NNKA 3FVKA 4H67A 2GFEA 1IEJA 2XXQA 2ZNSA 2RC8A 3VXCA 2P1SA 3N5LA 3B6WA 3C34A 4YMAA 4ZEDA 5I57A 1LSTA 4H5GA 3T96B 5EYFA 1Y3QA 5CMBA 4AB5A 4QSEA 1UIVA 4R6KA 1QKBA 2HEUA 4EUOA 4F2OA 4XXUA 2F6PA 2LAOA 1FQDA 3G3KA 2XHDA 5ITPA 5JTYB 3QUJA 4MLQA 2R6GE 3N94A 1H43A 1LCTA 2DE4A 3C35A 1URDA 1IXCA 4GD5A 1B3GA 3SEYA 3LR1A 4PETA 4XKPA 3IJOB 3O97A 2B3BA 1Y3NA 3W15C 2OCUA 4F1YA 3EN3A 4P11A 1PBPA 5TPAA 5LOMA 1QUKA 1R9LA 4RYAA 3C31A 3PPQA 1MRPA 4KCCA 3GLBA 4EQ7A 5BWJA 1EU8A 3KN8A 1GTKA 3DP4A 4Q8RA 3TAJA 2O7UA 5H8QB 2GHBA 4X1BA 4LONB 3ZKLA 1XOCA 1JVXA 3PD8A 4OXVA 2YJPA 3UP9A 2PVUA 1O64A 3M8UA 5JTYA 2DQVA 1UIUA 1D4NA 2V93A 4MFIA 4K3FA 1AOVA 4IO3A 4U4SA 2I58A 3G3HA 3FUZA 4JSOA 4JB7A 1JVYA 1Z7NE 5CMMA 2DYXA 2RCBA 3UN6A 1N7WA 1MY0A 4KCDA 3O6HA 3K00A 2AIXA 4R9FA 1MM7A 3S4UA 5DVJA 3OMBA 3FATA 3FJ7A 4IGTA 3OOAA 5F7VA 3TMGA 4FAJA 2F78A 3MP6A 4BDRA 4YB5A 1RYOA 1EZOA 3FVOA 1PB7A 4GVOA 3Q28A 5KZTA 5H8QA 4LVQA 1MXUA 4IB2A 2UVHA 3K0VA 4YICA 4ZEBA 1OQHA 4KQPA 4N07A 5I2KB 1LFHA 4F18A 3T9XB 1JQFA 4KYSA 3WAFA 2RC9A 4WEPA 5HBCA 1TFDA 4L17A 3QK6A 4ECFA 3MP1A 4Q30B 3CFXA 3RGYA 3H6VA 3O2AA 3B7DA 2UYEA 1D9VA 3MVXA 2O69A 4X9TA 3QAXA 3VDFA 3TDJA 1PB9A 1NL5A 3HV1A 2DVZA 3KSJA 1LCFA 1ZTYA 1H76A 2PMSA 1MY3A 4IY5A 1M5FA 3G3FA 5L8DA 2I4CA 3G7WA 3KZGA 3TPAA 1FTOA 3DELB 1B52A 3VV5A 2OZZA 2ONKE 3TQWA 2DE3A 5FTHA 3TTLA 2V3UA 5I2KA 2O6AA 2GH9A 1R9QA 3EHUA 3KN7A 5M2VA 3MVWA 3PMVA 5CRYA 1S7YA 1Y20A 1BKAA 4F31B 1NMUA 1UQWA 4YB7A 3GZGA 5DVIA 3TYHA 4QRZA 1CB6A 3O6GA 3Q25A 3H6WA 1OQGA 3MPKA 3SERA 2FNCA 3PPRA 4R2BA 1IXGA 3KEIA 4ELQA 1RKMA 1SW2A 2Y7WA 4C0RA 1CE2A 1B2HA 4XKRA 3MC2A 2QRYA 3IAZA 2GRVA 1QUIA 1B7ZA 1I6AA 3VLVA 1MXVA 3UGWA 1EH3A 1GVCA 2H5YA 2HZLA 1POY1 3MZ9A 4BDNA 2UXAA 4MF3A 2XD2A 3UORA 2PX1A 3RT8A 3HO7A 4RXLA 1FW0A 4FEDA 3FV2A 3IORA 3T93B 1NNPA 5AA2B 2Q88A 3N26A 5AE4A 3HN0A 1DMBA 3D4GA 4YKIA 3UIFA 2Y7RA 3SESA 4R74A 4P0GA 1LBCA 1MXYA 3SEVA 4JSDA 4F3BA 3C32A 4NWCA 2ONSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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