3TPAA

Structure of hbpa2 from haemophilus parasuis
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
507
structure length
507
Chain Sequence
b'NTLVNCIATAPMKLSPAITNDANDFNASSQQVYNRLVEFKAGKIEVEPGLAERWEISEDGLVYTFYLRQNVKFHSNKTFSPTRPLNADDVVFSFQRQADKNHPYHNVSAGTYFYFNWMNLPSILKSVEKVDDYTVKITLNKPNTPFITTVAMDFLSIYSKEYADQLLAQGKPETLDQQPIGTGPFIFQTNQTDHAVRYTANVDYWKGKADIERLIFSITPDAGTRYAKLKAGECDVIDFPNISDIAQMKKDPQINLLEREGLNLAYIGLNTTKPELNNVKVRQALHHATDKKAIVDAVYQGGGTVATNPFPDAVLGYNPHLPQYEFNLEKAKALLAEAGYPNGFETEIWVQPVVRPSNPNPRRTAEIIQADWAKIGVKAKLVTHEWADFNKRTREGEFAAGTYGWTSRNGDPDNFLFPLFSQANIPGTNYSRWTDEKFEALLASAAQIQDTQTRAKLYQQAVEIFQQNSPIIPFAHSINYVPLNKRVQGFVQNPFGYTAFYGVSLKL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Delineation of the Pasteurellaceae-specific GbpA-family of glutathione-binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heme-binding protein A
source organism Haemophilus parasuis 29755
molecule tags Heme binding protein
total genus 162
structure length 507
sequence length 507
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 3tpaA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tpaA01
3.90.76.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Dipeptide-binding Protein; domain 1 Dipeptide-binding Protein; Domain 1 3tpaA02
4WKMA 3RN8A 5I59A 2ONKE 1XOCA 3OXNA 4IO4A 3KBRA 3B6TA 1FQDA 3OD7A 1OLCA 3CVGA 3SEWA 1LAFE 1SW1A 1Q35A 3OELA 2E1SA 1A55A 1VE4A 1FTKA 4F22A 1QKBA 2F97A 2VGQA 4HCWA 3B6QA 4R2BA 1R9LA 3GLBA 4FEDA 1USYH 3V5AA 3G3IA 2D21A 4KYEA 2O1MA 1BP5A 1II5A 3QAXA 4HTGA 3FTOA 3DP8A 1N04A 1MH4A 2Y7IA 3TCGA 1JEUA 1MXWA 3CSGA 4YKJA 2F5XA 2O68A 1UTBB 4UA8A 1I6QA 4JSDA 3OSRA 1TFDA 3L6GA 3T66A 4U4SA 3MUQA 2ZYOA 3RUMA 4PFWA 3N6UA 3EQ1A 4F3GA 4FEBA 4EXLA 2Z8EA 2B4LA 2V3TA 1BTJA 1B7ZA 3DM0A 3PPNA 1Y3QA 1LFGA 1JW4A 2DWHA 3PUZE 4F3PA 4KCCA 3S2VA 1IQ7A 1B4HA 3R6UA 3CFXA 3O29A 5ICQA 4TQUQ 2Q89A 4EF2A 3PPPA 4NF5A 3ZKLA 4IY6A 2QS4A 2ZNUA 1UTHB 5A5XB 1LFHA 3FJMA 1Y9UA 4RA1A 2Q8JA 3DP4A 3IORA 2O69A 2OWSA 1MRPA 5JTYA 3KN8A 3P7IA 4IO5A 4BDNA 2PVUA 4OYVA 3B6WA 3EHTA 1AH5A 2QL3A 3OENA 2DXYA 2GHBA 3IJXB 3PUVE 1S50A 3PD9A 1N76A 4ZEBA 4P0GA 2AL5A 1MQIA 4MFIA 2F6PA 2B3FA 3RGYA 3ZS6A 3UIFA 3DRGA 5IAIA 1A99A 2FNCA 3K2DA 3VDFA 3IX1A 4KPTA 4F2OA 3N26A 2BJJX 3LSWA 2RC9A 5H8HA 3I5OA 1Z7NE 3K4UA 2A5TA 2DWAA 4FJPA 4ELQA 3BKIB 5H8QB 2QS2A 5B7DA 3N5LA 3JZJA 4GLIA 5AA2B 1NMUA 3OO8A 4XTCQ 2UVJA 3E3KA 1VFDA 4JDFA 2ZMBA 4FAJA 2UVIA 1US5A 2HCAA 1D9VA 4RJZA 2DVCA 4C1TA 1LCFA 1SD3A 1MY1A 1SYIA 1UTHA 4GD5A 4R9GA 1AMFA 4EQ7A 4PFTA 1MM7A 3H7MA 1Y3PA 1F9BA 1P1NA 4FATA 3MZ9A 1TT1A 5EHSA 2FYIA 1BLFA 1LB9A 2UXAA 2F7AA 2I58A 1R6ZA 4QRZA 5F1QA 2VD3A 2H9BA 3K6UA 1OVBA 1MY4A 1IXGA 3FJ7A 4KYDA 3R7XA 2D3IA 5TPAB 1YPNA 4R75A 1YCJA 3MPLA 1RKMA 1H43A 3VV5A 1EZPA 2F78A 5BUUA 5EYFA 5LOMA 3HV1A 1B51A 3FJGA 4JWYA 5H8QA 5FTHA 2QJEA 3A3CA 4MH5A 4BDLA 1MY2A 1A8EA 5AA2A 4O3AA 4QFKA 3MW0A 2NVUB 3GXAA 2Y7RA 2GHAA 4OVJA 1MY3A 2AL4A 3CFZA 3EN3A 1EU8A 4F3BA 5ICTA 2P1SA 4ECFA 2HZLA 4HCYA 3FVKA 3C33A 4H8JA 2ONSA 3T9VA 4OTEA 4H0WA 1SQYA 3IL1B 4MLVA 3DP6A 1S9TA 4I8CA 3UK4A 3VFJA 1Y20A 3K6XA 4YZZA 3TTLA 4QFNA 4RPNA 1UQWA 1B1HA 1LFIA 2XXTA 4XKPA 4IO2A 5F7VA 1B52A 2I0BA 5AA4B 4JBZA 3RYBA 4QSDA 2RCBA 4PETA 4ZS9A 4GL8A 2DE4A 3PD8A 5KCJA 4ZECA 2OZZA 1LB8A 4DXBA 5AE4A 3VXCA 2GH9A 3O6HA 3JYRA 3PPRA 3RLFE 3K1NA 5AA2D 3T9XB 3O6PA 3OEKA 3Q27A 3W15C 2ONRA 3K6VA 1QKAA 1B3FA 2VHAA 2OK2A 4IGRA 3HN0A 2XXRA 1UIUA 3LC8A 5I58B 1YTVA 3TFLA 4Q30B 1WVJA 4YU0A 1ZIUA 1GTKA 1JW1A 1BKAA 2O84X 3QK6A 5DT6A 4NE4A 4I1DA 2OWTA 4O3CA 3TUSA 2XX7A 3RT8A 1FQAA 3FGSA 2UYEA 1Y1ZA 4YMBA 3CFLA 1MXXA 3EHUA 4P0IA 4OEVA 3K02A 1JETA 1OQGA 4ESWA 1IXHA 5ELVA 4OETA 2G93A 5TU0A 1H3DA 4PQJA 5AA4A 2I48A 4LQ2A 5DEXB 1P1OA 1PB8A 5K2YA 3E13X 3EF7A 4DZ1A 4KFQA 1RYXA 5JK4A 3OO7A 4G77A 3S9LC 2B3BA 4Z0IA 3PAMA 3D4CA 4BDOA 4YKIA 4YB7A 3G3FA 5AA3A 4AB5A 3KFMA 4GQOA 2FA7A 4ZE8A 2Q2AA 1FTJA 2DSFA 3G3GA 3PPQA 4QHQA 5I58A 3MP1A 3TTMA 4F19A 4R72A 1XC1A 3DRIA 3PMXA 1URDA 2XX9A 2Y84A 1QVSA 2NWJA 1OLAA 4PE5B 2PBWA 3DELB 1ZLQA 1ELJA 1H44A 4ESXA 3W9WA 2IEEA 5ITPA 1B58A 1SVXB 1MDP1 3W9VA 4RNSA 2E0SA 2HXWA 1B0LA 1NH7A 1B6HA 3T93B 1B5JA 2GFEA 5CI5A 3TTNA 2H98A 3I6VA 4ELPA 3CI8A 5H8NB 4M1VA 3FVGA 1B7UA 2UVGA 5DEXA 4LP2B 4H8IA 4L17A 1CE2A 3Q28A 2ZYMA 4U4XA 5FHNA 1B05A 2B4MA 2O7IA 1P99A 2W7YA 1SI0A 1A54A 4G68C 4LQ5A 1FTLA 2V93A 3ONMA 5CMBA 4ZDMA 3CR9A 3UGWA 3TTKA 4FIMA 1MS7A 4OMBA 4ZE9A 1GGGA 1Y1MA 1M5DA 1AL3A 3ODBA 1D4NA 2WOPA 4NEDA 1MG1A 3RPWA 2H5YA 2ABHA 2QS1A 5CMMA 4F31B 4I62A 1IXIA 1VFEA 3C36A 3T9HB 1B3LA 4RXLA 3MC2A 3H6WA 3GBBA 4H67A 2XX8A 3VVDA 5M2VA 3O97A 2XXHA 3FXUA 4XKNA 3N6TA 4R6YA 3G7WA 2QPQA 3SDFA 3BBRA 3H3GA 5L8DA 4DDDA 4GL0A 2XXWA 1B5IA 4E0XA 2X26A 4PFUA 1GV8A 2QRYA 4GVOA 1FTMA 5H8NA 3IOUA 1H76A 5TP9B 3OMBA 2Y7WA 5CMCA 4WEPA 1ZU0A 1IEJA 1N7WA 1IIWA 1FQCA 2DXRA 4QSCA 2V25A 3MQ9A 1UTBA 1PB9A 1JEVA 2A5SA 5H8FB 4N13A 4NF4B 1B7HA 2LAOA 5K2XA 1US4A 4F29A 4LVQA 5KZTA 1MQDA 2Z22A 1AOVA 1HSJA 2DE2A 4G68B 1GVCA 4Q0CA 3HHFA 1EZOA 4KD5A 4EUOA 4O3BA 4BDQA 3D4GA 2O6AA 4YAHX 3TKDA 3MPKA 1O64A 2O1LA 4G8MA 4TOZA 1IZ1A 4GWOA 1P1QA 1PBPA 5A5XA 3PUYE 1M5CA 5IKBA 3R26A 3IB2A 2UVHA 1FTOA 4ELOA 2QMXA 4NTLA 3PMWA 3VLVA 1NNKA 2O51A 2H25A 3KSJA 4X1BA 1MQGA 3GBAA 5TP9A 1URSA 1LSTA 2QS3A 1LGBC 2B65A 4ND9A 3TODA 1O63A 1ZKBA 2OJTA 3QYTA 1POY1 3E4RA 2ALUA 2WOLA 3GZGA 4QFLA 2HAUA 3PV0E 5ITOA 2F8DA 2Y7KA 3KEIA 1EZ9A 3QSLA 3QIMA 4NF4A 1MH3A 2Q2CA 1DOTA 1NKXA 3HPIA 4BDMA 1MM6A 1MDQA 4LONB 2Y7PA 2R9JA 3WAEA 4DCYA 2HZKA 5I57B 3O28A 4G68A 3LVUA 2ANJA 3FV1A 2PX1A 4JWXA 1WDNA 2DVZA 4NWCA 3FVOA 2KLFA 3TQLA 5ISUA 3TDJA 4QSEA 1SBPA 4R73A 3PPOA 1SYHA 2F36A 5I56B 1BIYA 2Z8FA 2HFBA 4RPOA 3A09A 3F11A 3ZKKA 4U22A 4JXIA 2ZYNA 5I84A 1FCKA 1LBCA 1SDXA 4RY1A 2YPNA 3FASA 3CIJA 2XXUA 4JWOA 3KOSA 4AB6A 3VLUA 3LSLA 4DXCA 3SEUA 3E9XA 3VLWA 3IOWA 1PBQA 1WODA 5DTBA 3K6WA 2XXQA 1IXCA 3V83A 4P11A 2F35A 1VSOA 3TYHA 1DSNA 3DRHA 5TPAA 1DTZA 3H06B 4R74A 2PT1A 2ZNSA 3CG3A 4F1YA 4LATA 3TCFA 3KSXA 1RYOA 1I69A 2PYYA 4N6PA 4DLDA 1B32A 1B4ZA 5JEIA 2H99A 3SETA 2WKYA 5I57A 1QULA 4RYAA 3HHGA 1Y4TA 3UORA 3Q29A 1B3GA 3QUJA 3N94A 3LUYA 2HQ0A 4H1XA 3PMVA 1DPPA 4GFRA 5I56A 4G8HA 5I59B 1D3KA 3TPAA 1A8FA 4G2ZA 4DIGA 4G8NA 3T9UA 1DTGA 3UN6A 4HS7A 3QUFA 5CMKA 3RY3A 3MWBA 2DS9A 4RK9A 5HM4B 4IGTA 5FHMA 3U92A 2XD3A 4R9FA 3FZVA 3IB0A 2RC7A 4FE8A 2THIA 1ZBMA 3MVXA 2V3QA 3Q26A 3CSBA 3H6TA 3SEYA 3H6UA 3RNNA 1A40A 3ILUB 3KOTA 3S4UA 4N07A 3LR1A 4GRKA 4NF6B 4ZEIA 4TLMB 5HBCA 1LAGE 1ZMGA 1N3WA 2VP1A 4XXUA 1OIBA 4ZEDA 3O9PA 4TLLB 4YMAA 4IY5A 4F1UA 2G29A 2XXXA 3SEVA 3EHSA 1YAEA 4XIGQ 4FORA 1I6BA 5AA1A 3S9MC 3UP9A 3C9HA 2AYSA 4KCDA 3MVWA 3TQWA 4QFPA 4C0RA 3HCQA 4KR5A 2ZNTA 4YB6A 5KDTB 2DE3A 1P1UA 2XXIA 3OO6A 1MPDA 3TMGA 1USYE 3HO7A 3T22A 1MXVA 3MVYA 4NMYA 1OVTA 3QXMA 3ECRA 5CBSA 3M3FA 1R1NA 4LA9A 1N7XA 4EXKA 3MP8A 2QMWA 1J1NA 5CBRA 3L6HA 1LCTA 4G4PA 4M4GA 1QJMA 4OFLA 3TAJA 1JVYA 1I6AA 4NF5B 3CRBA 1L5TA 2PMSA 5HPQA 3SERA 1NNTA 1XT8A 3PGFA 3KZGA 1Y4CA 2D5WA 2F6GA 1CB6A 3IAZA 3A3UA 3O6IA 5JTYB 1HSEA 4NF6A 4OERA 2DQVA 4KI0E 2HEUA 1B0HA 3MAMA 1FQBA 3C32A 3MZ1A 3C4MA 1ATGA 4R6HA 4EQBA 3M8UA 2XXPA 4POXA 3IK6B 1JVXA 4ZEKA 4MBPA 4GOTA 1LAXA 4H5FA 3Q25A 5CC2A 2O7UA 1SI1A 2Q88A 4OENA 5KDTA 1POTA 4YICA 4EQ9A 3FXRA 3U72A 4GF8A 3IO6A 1NNPA 1UIVA 4U1OA 5DVFA 1MY0A 5H8HB 2A5TB 1PDAA 4BLAA 3B7DA 3KN3A 1N3XA 4PP0A 1B3HA 2GRVA 4JSOA 1XVXA 3PUXE 3DLNA 3OEMA 2R6GE 3LSFB 1PEBA 4ZZAA 4UACA 3FUZA 3RT6B 3OSQA 4U23A 4ELRA 3CHGA 1QUKA 4E0WA 4QF9A 4WEDA 4IO3A 3SEXA 5J1DA 3ILTB 5EHMA 2DP8A 4GXSB 1JW5A 1MXYA 4OWDA 1JNFA 3VE1B 4OXVA 1B1XA 1SW5A 3G3HA 3MJNA 4EF1A 3FVNA 2HAVA 3TTRA 1GR2A 1T0KA 1MQJA 2R71A 4JB7A 2AIXA 1O7TA 1Y3NA 1PC3A 3KGCA 3VXBA 4AQ4A 1SW2A 1FQFA 5I2NB 4K3FA 1NNFA 3MZBA 2RC8A 1Q1KA 4OFOA 2XHDA 1SW4A 5DVJA 4OEUA 3K1PA 4Q5TA 2ESNA 1M5FA 1MPBA 4EDPA 3USDA 1B40A 3KG2A 4XKRA 4X9TA 1A7LA 4GIZA 1TWYA 1B2HA 3U1OA 3MVZA 2NXOA 4DE8A 2NUVA 3KN7A 4Z7EA 4KQPA 2DOJA 2DWJA 4LZ7A 3VVFA 4GXAA 3WAFA 2OBGA 3HSTA 2YLNA 4LZ5A 1PB7A 1JQFA 4YKPA 1LAHE 4YKKA 3I3VA 2NOOA 3FXQA 1NH8A 2VOZA 2V3UA 5B70A 2ZXTA 3U93A 2XXVA 2UYFA 1P1WA 4ISUA 4H65A 3C35A 4F3SA 1DMBA 4MF3A 1VR5A 3TELA 3G3JA 5H8FA 5I2NA 3SKPA 3K00A 3BFTA 3UA8A 1N84A 3RTWB 3MP6A 3ZSFA 4YB5A 2WOKA 1ANFA 3K01A 2DWIA 2Z8DA 5KCJB 4I9DA 2PT2A 4NF8B 2I4BA 1IITA 4PFYA 3SESA 1HSLA 3DRKA 2DYXA 5DYHA 2I3WA 4U2RA 3S9EA 1KWHA 4WXJA 1B9JA 4F39A 3IJOB 3DRJA 3T96B 2P0SA 2XD2A 5I2KB 4R2FA 2V84A 3OOAA 5L9OA 3CG1A 1M5BA 2X7QA 3TCHA 3IB1A 5L9MA 4DXUA 4ONYA 3LSXA 2I6EA 1ZTYA 5FHOA 3O66A 4U1ZA 4U21A 2OLBA 3TZAA 3G3KA 3O2AA 3AXFA 5FTIA 1S7YA 3H6VA 2OCUA 1URGA 2XXYA 3H03A 1NL5A 1XS5A 3TEPA 5DVIA 4F1VA 3FV2A 2I0CA 2Z23A 3JV9A 1NFTA 3V89B 3PU5A 1D9YA 2VD2A 3U8QA 1OMPA 5CRYA 4ZEFA 1QUJA 2QSXA 1FW0A 3VVEA 4KHZE 4LUBA 3FATA 3RYAA 1MPCA 3MBPA 2CZLA 1TFAA 3O6GA 4IO7A 4POWA 3V8XB 1B5HA 4THIA 4NF8A 4HW8A 3OO9A 2F7BA 4XKQA 2I3VA 4H5GA 4IO6A 2F34A 3FD3A 3K0VA 1EH3A 1MXUA 4NWDA 3S9NC 2M8CA 2RF1A 4ZZEA 4BDRA 3IOVA 2I4CA 4F18A 2H4IA 1B46A 5I2KA 4OQOA 2RCAA 2F7CA 4DCXA 1R9QA 3RQTA 3H4ZA 1OQHA 1DPEA 2X7PA 3C34A 4QFOA 3FIRA 4H6DA 4RK2A 2P2AA 4X1DA 4F2QA 3K1MA 2YJPA 1XHYA 4R6KA 1AIVA 5H8SA 1H45A 1QW0A 2Q9TA 4OHNA 2RKMA 3U94A 3IR1A 4OESA 3EPEA 1LBBA 3IOTA 3KJTA 1M5EA 1TXFA 1FQEA 3THIA 2REGA 4X48A 5CM6A 4KYSA 3IO4A 1LLSA 4Q8RA 3C31A 4C1UA 2RINA 3RTFB 3BFUA 4IB2A 3KJ7A 4OFJA 1MQHA 2IA4A 1B3EA 2ZYKA 1MXZA 1N0TA 2REJA 5BWJA 1Z7ME 1ZJLA 3M3LA 1IUDA 3PUWE 1QUIA 5L9SA 4FECA 4MLQA 4LZ8A 2I49A 3LBSA 4OZ9A 2CMOA 3M3KA 3DRFA 1XVYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WKMA 3RN8A 5I59A 2ONKE 4PFIA 1XOCA 2GQ1A 3OXNA 4IO4A 3KBRA 3B6TA 1FQDA 3OD7A 1OLCA 3CVGA 1DK4A 2WYPA 3SEWA 1LAFE 1SW1A 1Q35A 3OELA 1INPA 2E1SA 2ZZVA 1A55A 1VE4A 1FTKA 4JVCA 4F22A 4P1LA 5I3SA 1QKBA 2F97A 2VGQA 4HCWA 3B6QA 4R2BA 1R9LA 3MYUA 3GLBA 4FEDA 5I5PA 1LBVA 1USYH 3V5AA 1NV1A 3G3IA 1NV4A 2D21A 4KYEA 2O1MA 1BP5A 1II5A 2PFYA 3QAXA 4HTGA 4GWXA 3FTOA 3DP8A 1N04A 1MH4A 2Y7IA 3TCGA 1FPBA 1JEUA 1MXWA 3CSGA 4X8RA 1FBPA 4YKJA 2F5XA 2L5VA 2O68A 1UTBB 2FIXA 4UA8A 4MEVA 1I6QA 4JSDA 2OX3A 1LBYA 3OSRA 1TFDA 3L6GA 3T66A 4U4SA 3MUQA 2ZYOA 3RUMA 4GX6A 4PFWA 3N6UA 4PGPA 3EQ1A 4F3GA 4FEBA 4EXLA 2Z8EA 2B4LA 4NG7A 4XFEA 2PFZA 4MNIA 5FBPA 2V3TA 1BTJA 1B7ZA 3DM0A 3PPNA 1Y3QA 5F24A 1KA1A 1LFGA 1JW4A 2DWHA 3PUZE 4F3PA 4KCCA 3S2VA 2WYKA 1IQ7A 1YYZA 1B4HA 3R6UA 3CFXA 3O29A 5ICQA 4TQUQ 2Q89A 2XWOA 4EF2A 3PPPA 4NF5A 3ZKLA 4IY6A 2QS4A 2ZNUA 1UTHB 4OANA 5A5XB 1LFHA 3FJMA 1Y9UA 4RA1A 2Q8JA 3DP4A 3IORA 2O69A 2OWSA 1MRPA 5JTYA 3KN8A 3P7IA 4IO5A 4BDNA 2PVUA 4OYVA 3B6WA 3EHTA 1AH5A 2QL3A 3OENA 2DXYA 2GHBA 3IJXB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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