3TPAA

Structure of hbpa2 from haemophilus parasuis
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
507
structure length
507
Chain Sequence
NTLVNCIATAPMKLSPAITNDANDFNASSQQVYNRLVEFKAGKIEVEPGLAERWEISEDGLVYTFYLRQNVKFHSNKTFSPTRPLNADDVVFSFQRQADKNHPYHNVSAGTYFYFNWMNLPSILKSVEKVDDYTVKITLNKPNTPFITTVAMDFLSIYSKEYADQLLAQGKPETLDQQPIGTGPFIFQTNQTDHAVRYTANVDYWKGKADIERLIFSITPDAGTRYAKLKAGECDVIDFPNISDIAQMKKDPQINLLEREGLNLAYIGLNTTKPELNNVKVRQALHHATDKKAIVDAVYQGGGTVATNPFPDAVLGYNPHLPQYEFNLEKAKALLAEAGYPNGFETEIWVQPVVRPSNPNPRRTAEIIQADWAKIGVKAKLVTHEWADFNKRTREGEFAAGTYGWTSRNGDPDNFLFPLFSQANIPGTNYSRWTDEKFEALLASAAQIQDTQTRAKLYQQAVEIFQQNSPIIPFAHSINYVPLNKRVQGFVQNPFGYTAFYGVSLKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Delineation of the Pasteurellaceae-specific GbpA-family of glutathione-binding proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Haemophilus parasuis 29755
molecule tags Heme binding protein
molecule keywords Heme-binding protein A
total genus 162
structure length 507
sequence length 507
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 3tpaA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tpaA01
3.90.76.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Dipeptide-binding Protein; domain 1 Dipeptide-binding Protein; Domain 1 3tpaA02
2O1MA 4DZ1A 2D3IA 4JWOA 4NF6B 4R9FA 1B1XA 3PGFA 1CE2A 2HZKA 3IOWA 4UACA 2GFEA 4JXIA 2QL3A 4M4GA 1AOVA 4Q30B 3SEUA 5FHOA 3LSLA 4FORA 4NF8A 4F2OA 2ZNTA 1IITA 2ABHA 1H45A 5CM6A 3DELB 3PPRA 1JW1A 1MDP1 4IO5A 2WKYA 3SEWA 3K2DA 1D4NA 3KN7A 4ELRA 3KSXA 4GD5A 3U8QA 1MQGA 1XS5A 2OK2A 4LVQA 3C34A 4RXLA 1DSNA 2V93A 4MLVA 4KHZE 3K6VA 4OHNA 4AQ4A 3T93B 3TODA 1FTMA 5AA1A 3DP8A 3QK6A 1MY1A 4C1UA 4EXLA 5CRYA 5F1QA 2GRVA 1ATGA 1P1OA 3VLUA 1TXFA 1Y4CA 1ANFA 3UP9A 3PMVA 4FECA 4YAHX 3S4UA 1SBPA 4HCYA 4HCWA 1PEBA 3TKDA 1LCTA 2GHAA 3PPPA 3F11A 1MXXA 2ZNSA 5EYFA 3TFLA 4F29A 4EF1A 3OO6A 5B70A 4I1DA 1A40A 3CG3A 2VOZA 3KGCA 1P1WA 4BDRA 3M8UA 1RKMA 3ILTB 1A8EA 1GR2A 1MXWA 4RYAA 4TQUQ 4F31B 1YPNA 1SW1A 3S9EA 1FQCA 2Y7WA 2Y7PA 2I4CA 3K4UA 4RPOA 4QSDA 4ZDMA 3WAFA 3S9LC 3R7XA 3G3KA 3V83A 3B6TA 3CRBA 4FEBA 3OSQA 3RNNA 2DSFA 5KCJA 1D9YA 2UVIA 3DP4A 1MM6A 3HV1A 1MM7A 1B40A 1BP5A 4JSDA 1IZ1A 1O7TA 1JEVA 1USYE 2NUVA 2X7QA 1HSLA 3IR1A 4GWOA 4KR5A 1FQBA 1LB9A 3WAEA 5CBRA 1HSJA 5L9SA 2ESNA 4NF8B 2F8DA 3MPKA 5L9MA 2DP8A 4ISUA 1SDXA 3H03A 3TTLA 4ZE8A 1B3GA 4RK2A 4XIGQ 3KSJA 3PMWA 4GRKA 3TCHA 4F19A 5I56A 4OERA 3GZGA 5CI5A 2RINA 2F7AA 5H8NA 2FA7A 3RQTA 3G3JA 1LGBC 3Q27A 3EHSA 4ZZAA 1GVCA 1N76A 1JNFA 1AL3A 1LFIA 1QW0A 3CSBA 4XKNA 1USYH 1M5FA 4NWCA 1FQAA 4ELPA 4PETA 2ONRA 2UYFA 1B51A 2WOPA 3O6IA 4M1VA 3E4RA 4H1XA 3RLFE 3JZJA 4F3PA 1EZPA 1Q1KA 1UTBB 5DVJA 2FNCA 3MBPA 4H0WA 3FVKA 5A5XA 2XHDA 2P2AA 3EHTA 3TTRA 5I57B 4H5GA 4O3AA 4C0RA 4OETA 5ICQA 3EQ1A 3LVUA 3PD8A 3C36A 4KQPA 1DTGA 3FZVA 3PUYE 3SEYA 3GBBA 1Y3QA 1BLFA 3B7DA 3MZ9A 2ANJA 4YKIA 3ZS6A 1MQHA 4YKKA 2QMWA 4LUBA 1D3KA 3QIMA 1B0LA 1IEJA 1OLCA 4R6HA 4R2FA 4PP0A 4HW8A 2DE2A 1UTHB 4OZ9A 2RC8A 2XXHA 1ZMGA 3HPIA 4H8IA 4KYSA 1B3LA 4LP2B 1LAXA 2G93A 3RN8A 1RYXA 1UTBA 2D21A 2F78A 1I6BA 1P99A 5BWJA 3KN3A 1WVJA 3N6UA 3H6VA 3PV0E 4YICA 1PBQA 1FTJA 3MVYA 3DRFA 1URDA 1MXVA 4FE8A 4GXAA 1XVYA 3H3GA 1GTKA 3FVNA 1MQIA 2ZYNA 3SDFA 3M3FA 4G8NA 1SI0A 3TAJA 4DDDA 4E0WA 1MPCA 1B3EA 3K6WA 3ZSFA 4IGRA 4DIGA 2NWJA 1IXGA 2YPNA 4NMYA 1PB9A 3C32A 4YMAA 2OZZA 3FVOA 4YKPA 3G3GA 5TPAB 3O28A 5LOMA 1FQFA 5H8NB 1AH5A 5I59A 5DEXB 1A7LA 3KN8A 3QUFA 1DPEA 1US5A 3B6QA 4IY6A 3SETA 3FJGA 5I2KB 4IY5A 1SI1A 2ONKE 2ZYMA 1WDNA 5AA2B 2AYSA 2F97A 2Q8JA 3DRHA 1XT8A 4QFPA 1H44A 2UXAA 2UVHA 3FVGA 4U4SA 4WEPA 5FTHA 1ZLQA 5K2YA 4F1VA 4G77A 5I57A 3S9MC 1LFHA 2B3BA 3TYHA 2I58A 4LONB 4RJZA 5KDTB 3O66A 1QJMA 1OIBA 3TELA 2RCBA 1B58A 4GF8A 2GH9A 3BFUA 2Z22A 3BFTA 5B7DA 5I59B 3PPQA 3TCFA 2P1SA 2X26A 1LSTA 2D5WA 4LQ5A 2NXOA 4PQJA 4BDOA 1JW4A 3U92A 3V89B 3KJTA 3OD7A 2Q2CA 4FIMA 3ZKLA 1N04A 3C4MA 4IB2A 5AA3A 4ZECA 3GLBA 3SESA 4GL8A 4C1TA 5H8FA 3IOTA 2G29A 3PUXE 1PB7A 3FXRA 1Y1ZA 3KZGA 1R9QA 1FW0A 5BUUA 1VFEA 5L9OA 2ZYKA 3RPWA 2Q9TA 3IB0A 1DPPA 2HAVA 3A3CA 1B6HA 3G3HA 1KWHA 2Z8DA 2OBGA 2DWIA 2VD2A 3TTNA 4ND9A 4XKPA 1B7ZA 3HO7A 3VVFA 1II5A 3D4CA 4ELQA 4ESWA 1B32A 1R9LA 3QYTA 4OESA 2I4BA 1B7HA 2GHBA 3MAMA 3LUYA 3MUQA 4GVOA 3FUZA 4GIZA 5KDTA 4PFYA 3IL1B 4ZE9A 3K0VA 3V5AA 3IB2A 5DEXA 1MRPA 5DYHA 5H8FB 5HBCA 2ZYOA 2F7BA 3ODBA 3PPNA 3E3KA 3H7MA 1VFDA 5EHSA 2O51A 1R1NA 1LBCA 3VV5A 2B4MA 3OXNA 4XKRA 4U21A 3MPLA 3K00A 5AA2A 3RTFB 1BKAA 1CB6A 1SVXB 2LAOA 3H6TA 3U1OA 1URSA 1TFDA 4P11A 1ELJA 1LAHE 4LQ2A 2O6AA 3IB1A 4EQBA 3TPAA 5TP9B 2F6PA 5HPQA 4ZEDA 3FJMA 5CC2A 2F5XA 5DVIA 3FXUA 1O64A 5EHMA 1OQGA 3KG2A 4F18A 1FTLA 3H4ZA 1MY4A 1WODA 5DT6A 3DRIA 3FIRA 2DE4A 1N3XA 3EHUA 3QUJA 3H6UA 2FYIA 3Q28A 4GXSB 4LZ5A 1IUDA 3O6PA 2XX7A 4EUOA 1QKBA 2DWHA 1LCFA 4POWA 4U1ZA 2NVUB 1T0KA 2I49A 4BDNA 4GL0A 1MY2A 4H8JA 3IO4A 1LBBA 4RNSA 4ESXA 3S2VA 3TZAA 3HN0A 3CSGA 3I3VA 3IJOB 1PDAA 3PMXA 4R74A 1GV8A 3U72A 2HCAA 3UIFA 5TP9A 5IKBA 3VLVA 3K1PA 4FAJA 4GOTA 4F3SA 5KCJB 2DVZA 2QS4A 2ZNUA 3FD3A 3SEXA 4KI0E 5I58A 5ITPA 3O9PA 4R72A 1ZBMA 3AXFA 4R9GA 1XHYA 1ZJLA 3KJ7A 3K02A 4IO7A 2I3WA 4OXVA 4YB7A 2RC9A 3W9WA 3CG1A 4JB7A 4YZZA 3TUSA 4OYVA 4K3FA 1FTKA 4X48A 1N7XA 1H76A 4NF4B 2XD2A 2XXTA 2V3UA 1Y4TA 1JEUA 3KOSA 2DS9A 1QUIA 4I62A 3OO7A 4LZ7A 4MLQA 1BTJA 4NF5A 1NH8A 3FV2A 4NE4A 4R75A 4FATA 2XD3A 1S50A 2Q89A 4QFOA 1NNKA 2ZXTA 3L6GA 5M2VA 5I56B 4BDQA 1M5DA 1NMUA 1RYOA 1MDQA 1PBPA 3FASA 4BDMA 4F1UA 5L8DA 1EZOA 3K1NA 3O29A 4G68C 3DRJA 4JWXA 4ECFA 2OJTA 1TWYA 4UA8A 2ZMBA 5K2XA 4IO2A 3T9HB 4DLDA 2REGA 3MZ1A 4RK9A 3VE1B 3USDA 4JBZA 2Y7RA 2WOLA 3HSTA 1URGA 1ZKBA 1B4ZA 3W9VA 3K6XA 1XOCA 2QMXA 2X7PA 4DXUA 2DOJA 3ECRA 1MY3A 1POTA 3H6WA 3LC8A 3N5LA 4AB5A 4EQ9A 3MP1A 3EPEA 4BLAA 4EXKA 4ZS9A 4RA1A 3BKIB 5H8SA 1Y9UA 5HM4B 4P0GA 3UN6A 3IOVA 2ALUA 4X9TA 3Q29A 4OMBA 3TQWA 1MY0A 1B1HA 4OFLA 3VDFA 1I6QA 3G7WA 4O3BA 3GXAA 4QFNA 3RT8A 3FV1A 1O63A 1FTOA 2HQ0A 2UVJA 4G68A 3U93A 1IQ7A 4BDLA 1SW2A 4YB5A 1N3WA 4OENA 4F39A 1IXHA 2F36A 1N0TA 3JV9A 3P7IA 3PUZE 1NL5A 1B5IA 1DTZA 1HSEA 4H67A 3I5OA 1IXCA 1BIYA 1FQEA 5CMCA 5JTYB 3IO6A 3VLWA 2B65A 3THIA 4NF4A 5CMKA 3QXMA 4DE8A 3RTWB 2PYYA 3IOUA 4NF5B 2R9JA 3PAMA 2BJJX 2OWTA 1B3FA 2CZLA 1QVSA 4H65A 5DTBA 3FGSA 4ZEIA 1MS7A 3C35A 4XTCQ 4G68B 2XXYA 1S7YA 2DWJA 2A5TB 2QS3A 2RCAA 2IEEA 3D4GA 3TTKA 2M8CA 1B7UA 1LFGA 5AA4B 4KPTA 4HS7A 1MXUA 3CR9A 4IO4A 2QPQA 1DOTA 2I0BA 3C33A 3H06B 4OWDA 5JTYA 3N94A 1MH3A 3R26A 2XX9A 1QULA 3IX1A 3DM0A 3K6UA 3RYAA 4OVJA 5ITOA 2R6GE 3HHGA 4OEVA 2XXWA 2UYEA 3LBSA 2XXUA 1M5CA 2YLNA 1L5TA 3L6HA 2OWSA 4ZEKA 1B2HA 2OLBA 2YJPA 1QKAA 5AA4A 5IAIA 3EF7A 4NEDA 1EZ9A 2A5TA 4AB6A 3TTMA 4FJPA 3O6HA 1H43A 1NNFA 3TMGA 4GLIA 4NF6A 3MZBA 3GBAA 3W15C 3OO8A 2F7CA 3DLNA 4XXUA 1QUKA 3T66A 1A8FA 3MVWA 2OCUA 2W7YA 3CVGA 4THIA 5H8HA 3A3UA 5AA2D 4PE5B 3HHFA 3ZKKA 5ICTA 1NKXA 2QSXA 2I48A 4WXJA 5A5XB 3OMBA 2XXRA 4DCXA 4ONYA 1M5BA 3CIJA 1H3DA 4WEDA 4U23A 3SEVA 3T96B 1B5JA 4QF9A 3UORA 4IO6A 4F2QA 1B52A 1XC1A 4KCDA 1B05A 4MH5A 2DYXA 2CMOA 2I3VA 2PVUA 4G8MA 4QFLA 3QAXA 2DQVA 5FTIA 1EU8A 3FJ7A 1VSOA 4KD5A 2F34A 3Q26A 3TEPA 5FHNA 4YKJA 4DCYA 3E13X 3IK6B 3DRGA 2H99A 2PT2A 1Y20A 2O7UA 4N07A 1MG1A 4I8CA 3CFXA 4O3CA 2AL5A 3TQLA 3HCQA 4GFRA 3VFJA 4DXBA 1JW5A 1LAFE 1P1NA 2I6EA 4OEUA 1NFTA 3FATA 4EF2A 2Y7KA 3VXBA 3IORA 2V3QA 4U22A 4KYDA 4U2RA 1MPDA 2KLFA 1ZIUA 1LLSA 3MW0A 1P1UA 4U1OA 2Y7IA 4Q8RA 3MWBA 2PBWA 2V3TA 4PFUA 1UQWA 1PB8A 2HAUA 1MQJA 3CI8A 4X1DA 5JK4A 4I9DA 5ISUA 1B3HA 5TPAA 3FXQA 2PX1A 1NH7A 3OEMA 1IIWA 3PUVE 4H6DA 4OFOA 4LATA 4POXA 4Q5TA 1OLAA 3T22A 3S9NC 1FCKA 1Y3NA 3ILUB 4JWYA 4LA9A 1JQFA 4U4XA 1MPBA 1SD3A 4MF3A 3I6VA 3Q25A 5I2KA 4G4PA 2F6GA 2V84A 1JVYA 3CFLA 4ZEBA 1I6AA 2Z23A 3RGYA 3UGWA 1Y1MA 5H8HB 1SW4A 2H5YA 3OOAA 2VD3A 2O69A 4YMBA 3KOTA 3TCGA 3B6WA 3MC2A 3T9VA 3G3IA 5J1DA 5H8QA 3QSLA 2ONSA 3U94A 3SKPA 1Z7NE 4EDPA 1ZU0A 4R73A 5I58B 1AIVA 4ZZEA 3LSWA 4MFIA 3PUWE 3VVEA 1TT1A 2P0SA 3PU5A 4QRZA 3K01A 4LZ8A 1NNTA 2O68A 1MH4A 2B3FA 1UIUA 1YAEA 4MBPA 1SW5A 2H25A 4Z0IA 4PFWA 2RKMA 1B5HA 2UVGA 4IO3A 3E9XA 4PFTA 4G2ZA 2E1SA 2VGQA 2V25A 4DXCA 3KBRA 4RPNA 5I84A 4QSCA 3RUMA 1LAGE 3DP6A 4R6YA 3OSRA 3LR1A 4QHQA 2DE3A 4KYEA 3SERA 4IGTA 2AL4A 4N6PA 4X1BA 2XXVA 1Y3PA 5TU0A 2O84X 4F3BA 4Z7EA 5CBSA 4ELOA 4QFKA 1PC3A 2H98A 2HXWA 2AIXA 3LSXA 1N84A 2H9BA 3IJXB 1I69A 1TFAA 2Y84A 4H5FA 4YU0A 2RF1A 3M3LA 2DXYA 1GGGA 3UA8A 4F22A 4TOZA 4Q0CA 1POY1 1UTHA 3O6GA 4OFJA 4P0IA 2XXPA 1A54A 1SQYA 2HEUA 2HZLA 4JDFA 4E0XA 3K1MA 3TDJA 1R6ZA 3ONMA 1B46A 2F35A 2O1LA 4XKQA 3C31A 5FHMA 3PPOA 2THIA 3JYRA 3DRKA 3MVXA 2VHAA 1A55A 2PT1A 4OQOA 4WKMA 5CMMA 1D9VA 3OENA 5F7VA 3RY3A 1VE4A 4QSEA 1P1QA 2NOOA 1Z7ME 2HFBA 4R2BA 3R6UA 2QJEA 2QS2A 3A09A 5I2NB 5JEIA 1B4HA 4KFQA 4OTEA 3G3FA 1B0HA 3LSFB 4GQOA 4HTGA 5H8QB 4NWDA 2DWAA 3O97A 2REJA 3T9XB 5CMBA 4F1YA 2E0SA 4FEDA 2RC7A 1UIVA 2WOKA 1VR5A 4NTLA 3IAZA 1YTVA 2I0CA 3MVZA 4R6KA 1QUJA 2PMSA 2IA4A 1YCJA 2QRYA 1IXIA 3VVDA 5DVFA 1OVBA 3KEIA 3MJNA 2O7IA 1AMFA 2Q88A 3O2AA 2XXIA 1ZTYA 1F9BA 1N7WA 1M5EA 1LB8A 1NNPA 2H4IA 1B9JA 3MQ9A 4G8HA 4TLMB 2Q2AA 3OELA 5ELVA 5I2NA 5KZTA 3CFZA 4EQ7A 4F3GA 1A99A 3MP6A 3T9UA 1FQDA 3OO9A 3RYBA 3OEKA 1DMBA 4YB6A 1OQHA 1Q35A 5AE4A 1XVXA 2VP1A 4N13A 3RT6B 3BBRA 3V8XB 1S9TA 2XX8A 1JVXA 2A5SA 2R71A 1OVTA 1J1NA 4ZEFA 1MQDA 2DVCA 1OMPA 3EN3A 2B4LA 3PD9A 4RY1A 1MXZA 1JETA 4JSOA 3CHGA 3KFMA 3MP8A 3N26A 1EH3A 2Z8EA 4KCCA 1SYIA 1US4A 4L17A 3VXCA 3N6TA 2XXXA 2Z8FA 3FTOA 2QS1A 1MXYA 2XXQA 3C9HA 3M3KA 4TLLB 3UK4A 2DXRA 1SYHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JWOA 4Q30B 5FHOA 4MJOA 2ZNTA 1IITA 4F2OA 5CM6A 1EYIA 4IO5A 2WKYA 3KN7A 3KSXA 1MQGA 4PFRA 2OK2A 3T9XB 3C34A 4AS4A 4F1VA 2DDKA 4KHZE 4OHNA 4OA4A 1MY1A 4C1UA 3VLUA 1TXFA 4YAHX 3S4UA 1FPFA 3PPPA 3OO6A 3CG3A 3KC0A 1LBYA 3K4UA 3WAFA 3V83A 3R7XA 3CRBA 4FEBA 2DSFA 3DP4A 1MM6A 1B40A 2X7QA 4GWOA 1HSJA 2ESNA 3H03A 4ZE8A 4RK2A 4HE0A 4F19A 5CI5A 5H8NA 1GVCA 3SKPA 1QW0A 4XKNA 5A5LA 2ONRA 2Y5KA 1B51A 2WOPA 4M1VA 4H1XA 4F3PA 3ISPA 2FNCA 3MBPA 3FVKA 4C0RA 3EQ1A 4PE3A 3RYDA 3PUYE 3B7DA 1D3KA 3QIMA 1B0LA 1JP4A 2DE2A 1NV4A 3HPIA 3RN8A 5ET8A 2D21A 1WVJA 4GXAA 1GTKA 1MPCA 4IGRA 1IXGA 4NMYA 3G3GA 3O28A 5LOMA 1RDZA 1AH5A 5I59A 1A7LA 3KN8A 3QUFA 4IY6A 1FBPA 2AYSA 1FPLA 3FVGA 4QFPA 2UXAA 3RPLA 5FTHA 4G77A 2B3BA 1QJMA 3B50A 3BFTA 5I59B 3PPQA 2P1SA 4PAFA 4LQ5A 2NXOA 1JW4A 3U92A 4GX3A 3IOTA 3PUXE 2FHYA 1Y1ZA 1FW0A 1VFEA 5L9OA 3TTNA 1KA1A 1B7ZA 5ESYA 2I4BA 5T3JA 3IL1B 5DEXA 2ZYOA 3ODBA 3PPNA 2XWOA 1R1NA 1LBCA 5AA2A 3MPLA 1SVXB 4MNCA 4P56A 4EQBA 2F6PA 4ZEDA 3FXUA 3KG2A 4XFEA 2CZKA 3DRIA 1LEVA 3Q28A 3O6PA 1QKBA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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