3TPAA

Structure of hbpa2 from haemophilus parasuis
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
507
structure length
507
Chain Sequence
NTLVNCIATAPMKLSPAITNDANDFNASSQQVYNRLVEFKAGKIEVEPGLAERWEISEDGLVYTFYLRQNVKFHSNKTFSPTRPLNADDVVFSFQRQADKNHPYHNVSAGTYFYFNWMNLPSILKSVEKVDDYTVKITLNKPNTPFITTVAMDFLSIYSKEYADQLLAQGKPETLDQQPIGTGPFIFQTNQTDHAVRYTANVDYWKGKADIERLIFSITPDAGTRYAKLKAGECDVIDFPNISDIAQMKKDPQINLLEREGLNLAYIGLNTTKPELNNVKVRQALHHATDKKAIVDAVYQGGGTVATNPFPDAVLGYNPHLPQYEFNLEKAKALLAEAGYPNGFETEIWVQPVVRPSNPNPRRTAEIIQADWAKIGVKAKLVTHEWADFNKRTREGEFAAGTYGWTSRNGDPDNFLFPLFSQANIPGTNYSRWTDEKFEALLASAAQIQDTQTRAKLYQQAVEIFQQNSPIIPFAHSINYVPLNKRVQGFVQNPFGYTAFYGVSLKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Heme binding protein
source organism Haemophilus parasuis 29755
publication title Delineation of the Pasteurellaceae-specific GbpA-family of glutathione-binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heme-binding protein A
total genus 162
structure length 507
sequence length 507
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 3tpaA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tpaA01
3.90.76.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Dipeptide-binding Protein; domain 1 Dipeptide-binding Protein; Domain 1 3tpaA02
1FCKA 1NNPA 2Q89A 2W7YA 3W9VA 3G3FA 2REGA 3QK6A 3E3KA 3MZ9A 2RC8A 3OXNA 4KYSA 3DRFA 3IB0A 2H25A 1BP5A 2DE2A 3PU5A 4YB6A 3A09A 1LB8A 3DLNA 1KWHA 4IO3A 3B6TA 4GD5A 2Z8DA 3CG1A 3RQTA 1FTKA 4F1UA 4GL0A 4U2RA 3OO7A 3OEKA 3SEYA 1FTMA 5FHMA 1QULA 2F34A 4G8HA 2Z22A 3OO8A 3T9HB 4KQPA 2GHAA 3KN8A 4JSDA 3Q27A 1ZIUA 1Y1ZA 1BTJA 1FQFA 3TTLA 3EF7A 5DVIA 1QVSA 4H6DA 3R7XA 3H6UA 1DMBA 2WKYA 1I6QA 1HSJA 2QPQA 3QIMA 4E0XA 2ZXTA 3HHFA 4X48A 2QS4A 3MVZA 3T66A 3UGWA 1UTBB 4G8NA 5CC2A 1FQAA 2UYFA 4OFOA 3C32A 3U8QA 1MRPA 2GRVA 1USYH 5DVJA 5EHSA 4Z7EA 1ZMGA 1SI0A 1JEUA 3K6VA 5AA2D 4F39A 3L6HA 2Z23A 2RCAA 1H43A 1MY3A 1MY4A 2VGQA 2I49A 2OCUA 4BLAA 5JK4A 1OLAA 4GL8A 1QUKA 1O7TA 1XVYA 4XKQA 2VP1A 4C1UA 2I3VA 1IZ1A 3EHSA 2DSFA 1FQDA 1MQHA 5TU0A 2I4BA 3RGYA 1GVCA 3C33A 3ZSFA 4QHQA 1IXCA 5TPAA 5KDTB 4NF4A 1SW5A 1UTBA 2WOKA 1MQDA 3TYHA 4NF5B 1Y3NA 3UIFA 2V3QA 1LLSA 2V93A 1NNTA 3O6PA 5CMCA 4P0GA 2H4IA 2XX7A 1JW5A 2ZNSA 1URDA 2ONSA 4RA1A 3S9NC 4OTEA 4EQBA 2ZMBA 4OEUA 3L6GA 2B4LA 1I6AA 1JQFA 3DRKA 5L9OA 2OLBA 3FTOA 3THIA 4N6PA 4JWOA 3D4CA 1Q1KA 2ONKE 4IO2A 5KDTA 2FYIA 4NF8B 4PFYA 4FE8A 3MVWA 2XX9A 4I8CA 2YPNA 3KG2A 5L9SA 3TTRA 1T0KA 3IOWA 4LONB 1F9BA 1OIBA 4ELPA 4NF5A 3RN8A 3U92A 4ZEBA 4R72A 3TFLA 4EQ9A 3MAMA 3SEUA 4OERA 3CRBA 4KPTA 3FXRA 4LZ8A 2H5YA 2D21A 1MXZA 5I84A 2RCBA 4R2BA 2E1SA 2IEEA 5H8SA 3TQWA 3PUYE 2ABHA 2F35A 1NH7A 4G2ZA 3SERA 3RUMA 2ALUA 3FZVA 3FV2A 4GFRA 4XKNA 1MY0A 4NF8A 5IKBA 3FVNA 4PFTA 3K6UA 3M3KA 5CRYA 1B3EA 1B1XA 3OEMA 3I3VA 1PB9A 3IOVA 2H99A 1TWYA 1B58A 1HSEA 1USYE 4YB7A 4OZ9A 1B4HA 5H8HB 3FJMA 1M5BA 3UN6A 2Q88A 1ANFA 1IXHA 4TLMB 2Y7PA 1IUDA 1M5FA 3H6TA 3SEWA 4ESXA 3PMWA 2FA7A 5CM6A 3C4MA 1NMUA 4ND9A 4OHNA 3F11A 1N3XA 4ECFA 1YPNA 3ILUB 2QS2A 4IY6A 3DP4A 2ZYOA 4OVJA 5FHNA 3VFJA 4IO4A 1Q35A 4ZEIA 1QKBA 1URSA 2O69A 1MXWA 2RF1A 3PD9A 1LB9A 1N7WA 1QUJA 5H8HA 4BDNA 1AMFA 2ESNA 3C9HA 3RT6B 3O29A 2H98A 4BDRA 5I56A 3OELA 3MZ1A 4ELOA 2Q2CA 1IQ7A 2B4MA 1MXXA 4YZZA 1P99A 2NVUB 3R6UA 3DM0A 2V3TA 2F5XA 1IEJA 5I59B 3JZJA 1PBPA 3MWBA 2VD2A 3MC2A 3PGFA 5BUUA 2XXHA 2UYEA 1ZBMA 4QFPA 1ZU0A 1POY1 3K1NA 3B6QA 1MY1A 3DRGA 4O3AA 4MFIA 3Q26A 4ZE8A 2I48A 1EZPA 5ELVA 3BKIB 3FVKA 2HAVA 4MF3A 4ISUA 3QYTA 3D4GA 3VXCA 3UP9A 1LAHE 4THIA 3K6XA 5M2VA 4Q30B 2QMWA 1ZKBA 4IO5A 2Y7RA 4FEBA 1P1WA 1S7YA 4NWCA 4LATA 5I59A 4KCDA 4I9DA 3B6WA 2ZYNA 1XOCA 3TAJA 4NEDA 3O28A 3IJOB 1XC1A 2UVJA 4R75A 4MLQA 4LZ5A 1J1NA 4HTGA 4POXA 4ZS9A 1JNFA 4OEVA 5H8QB 1VSOA 3I6VA 3S4UA 2XXWA 2NXOA 1JW4A 4R9FA 5HPQA 5AA4A 3H3GA 4F3BA 3VV5A 4JSOA 5I2KB 2DVCA 1TXFA 2RKMA 1WODA 1UIVA 4GF8A 1FTLA 3EN3A 1Y1MA 3V8XB 2I0CA 4FORA 2E0SA 1H3DA 5DEXB 2R9JA 3IOTA 2I0BA 2B3FA 4PE5B 2QS3A 3ZS6A 3VLUA 2QRYA 2VOZA 3PMVA 1R9QA 2UXAA 2ONRA 1N7XA 3DP8A 5H8QA 3MQ9A 4P0IA 1O63A 3T9XB 1B5IA 3SKPA 2DE3A 2DWIA 1DPPA 3N26A 5I57B 3C35A 2QSXA 1UTHA 5DYHA 5CBRA 4X1BA 1ELJA 4OFLA 1OLCA 3FV1A 3HHGA 2XD3A 4LA9A 3OOAA 3OENA 2ANJA 5DEXA 2DXRA 3TODA 4G68C 2QS1A 2UVGA 1LFHA 1RKMA 3HSTA 1US4A 5AA2B 3H7MA 2PT1A 1IIWA 1H44A 2ZNTA 3MP8A 2OK2A 3IX1A 2OWSA 4L17A 3EQ1A 1SW1A 4RJZA 4YKKA 1DOTA 3KBRA 2PVUA 4LZ7A 3TELA 5CMKA 1NKXA 3PPQA 2RC7A 2AIXA 5I57A 3SEXA 4H67A 4ZEKA 3EPEA 2P2AA 3ODBA 3LUYA 3B7DA 1DTGA 3K1MA 5LOMA 4DCXA 3N94A 2D5WA 1A99A 3K02A 4ONYA 3PPRA 1JVYA 4FJPA 4ZDMA 4OETA 1XT8A 5AA2A 1LAFE 1SD3A 3S2VA 4R9GA 3RPWA 3A3UA 1ATGA 3I5OA 3O66A 1P1NA 2DOJA 5FTHA 1BIYA 3PPOA 4F3GA 4U23A 4Q8RA 4AB5A 4F22A 4GLIA 3EHUA 2ZYKA 2F7AA 2A5SA 3KZGA 5CMBA 1A54A 3IAZA 3TMGA 3E4RA 1DSNA 3PPPA 3LVUA 2QJEA 4MLVA 4KHZE 2NUVA 4MBPA 2WOPA 4QFLA 2V3UA 4IGTA 2G93A 1VFDA 1QUIA 4XKPA 3VLVA 4R6HA 5I58B 1B05A 4U4SA 1B46A 4BDQA 3P7IA 3LSLA 2DWHA 1EZ9A 1Y9UA 4ZEFA 3FVGA 3EHTA 2V84A 4G68B 4ZECA 1FQBA 1FTJA 3CVGA 4H5GA 5J1DA 4U1OA 3O97A 3G3IA 4F2OA 2RC9A 1AOVA 1LBBA 1MH4A 3K6WA 3PUVE 1YTVA 1B7UA 4RPOA 5AA3A 4YICA 5EYFA 5HBCA 4IB2A 1MM7A 3FVOA 1M5DA 3FXQA 4YKJA 3RY3A 4LVQA 2BJJX 4I1DA 5EHMA 3TKDA 5ISUA 5I58A 3RT8A 3G3HA 3TPAA 1OVTA 1XVXA 4KYDA 3SDFA 2Y7KA 3WAFA 1MS7A 4Q0CA 1B0LA 3T22A 2OJTA 1O64A 2XXXA 2PT2A 2F8DA 3FJGA 1SW2A 4R6KA 1YCJA 1LAXA 1PBQA 4RK2A 5IAIA 1B40A 5TP9B 4QRZA 2Q8JA 1D9YA 1B51A 3KSXA 3KOSA 4YAHX 2F97A 5B7DA 5JEIA 2H9BA 2FNCA 2B65A 4WEDA 1PB8A 2HAUA 1D3KA 1P1OA 1NNFA 2VHAA 3U94A 1Z7NE 3LSXA 1H45A 2DS9A 4P11A 3CSBA 3VVDA 3KFMA 1PC3A 1LFIA 2KLFA 2O68A 1IXGA 4RYAA 4O3BA 1MDQA 4R6YA 3UA8A 1S50A 5L8DA 4GWOA 4TOZA 2HZKA 4IGRA 4H65A 3DRHA 3MVYA 4F3SA 3Q28A 5TP9A 3FJ7A 4KI0E 3VVEA 3ZKKA 1N76A 3FIRA 1JEVA 1B52A 2HEUA 5JTYB 1EU8A 3V83A 2X7QA 4Z0IA 4H8JA 1EZOA 3UORA 3TQLA 4DXUA 2QL3A 3CHGA 4JB7A 1IITA 1MY2A 4F1VA 4KYEA 1SW4A 1FTOA 4NTLA 4EUOA 3TEPA 1FW0A 2I4CA 4DZ1A 3U93A 5HM4B 1JETA 3G3JA 4QFNA 4M4GA 2Y7IA 3VE1B 3S9EA 3IORA 4K3FA 4Q5TA 3KGCA 2XHDA 4IO7A 3T9UA 3DRIA 3PUWE 3HN0A 1LAGE 4OQOA 5BWJA 4QFOA 3HV1A 3RNNA 4F1YA 5JTYA 2F7CA 3MP6A 3AXFA 4N07A 2A5TB 3FUZA 1MPDA 4JDFA 3FASA 3MPKA 3KN3A 1B3HA 4OYVA 1A40A 3ECRA 3RYAA 1Z7ME 4NWDA 4XTCQ 3CFZA 3M8UA 3ILTB 3LBSA 1FQCA 2Q9TA 1BKAA 1VFEA 2O7IA 3IR1A 3SETA 2O1LA 1SYHA 2DYXA 4MH5A 4OESA 3O6IA 1NL5A 4TQUQ 4DE8A 2P0SA 3O6GA 4IO6A 1B7HA 1RYOA 1GV8A 2A5TA 4KFQA 4C0RA 3FXUA 2DE4A 4DDDA 1RYXA 1B1HA 4XXUA 4X1DA 4XKRA 3GLBA 1VE4A 2R71A 2GHBA 5H8FB 4BDLA 3W9WA 5H8NB 4F18A 4DCYA 1N3WA 2G29A 1LCFA 4AB6A 3TDJA 3RTFB 1LFGA 1I69A 3IB1A 2THIA 2F6GA 4F31B 1Y4CA 2B3BA 2RINA 3LSFB 3HPIA 3QUJA 3WAEA 1ZJLA 4UA8A 2ZNUA 5ITOA 3O9PA 1LBCA 3OSRA 4OMBA 1QJMA 4KD5A 4YMBA 4DLDA 4FIMA 4F29A 1B4ZA 1B3FA 3LSWA 4F19A 5H8FA 1TFDA 4DIGA 5H8NA 3BFTA 3KOTA 2Y7WA 1YAEA 3OD7A 1B3GA 1POTA 2GH9A 4RXLA 2CMOA 3CFLA 3T93B 5I2KA 4YMAA 2XXUA 2DP8A 3H03A 3CIJA 3ONMA 1SI1A 2O1MA 5F7VA 2Z8EA 1MXYA 3OMBA 2I3WA 3Q29A 4FATA 4G4PA 3RYBA 3HO7A 3LR1A 4O3CA 3C36A 3G3GA 4QFKA 4ZZEA 4JWYA 3TCGA 2DWAA 3SEVA 4NF6B 3DRJA 3PAMA 3PPNA 1JW1A 4YB5A 2O6AA 3K2DA 4PFUA 4QSDA 1Y4TA 4WXJA 2PMSA 3MBPA 3GBBA 3PMXA 4U21A 4FAJA 4RK9A 1Y3PA 4U22A 1M5CA 1MPBA 3N5LA 2DQVA 1US5A 3H6VA 4LUBA 1D9VA 3QUFA 3H06B 3DP6A 1FQEA 1R6ZA 3CG3A 2YLNA 4OXVA 4U1ZA 1OVBA 4G77A 1B9JA 4H0WA 4NF6A 5L9MA 5DVFA 2HFBA 4F3PA 5TPAB 4NF4B 4EDPA 3CR9A 4ZE9A 1SDXA 3QAXA 5FTIA 4OWDA 3U1OA 2F36A 4JWXA 3VXBA 1H76A 2LAOA 3VVFA 3BBRA 4GXAA 1MQIA 1P1QA 4NE4A 4PFWA 2DXYA 2F7BA 3E13X 2D3IA 3V5AA 2O84X 1MXVA 2XXVA 3PD8A 2XX8A 5CBSA 2P1SA 2Q2AA 1B0HA 1IXIA 3VDFA 4EXLA 5ICTA 1OQHA 3IJXB 2WOLA 3VLWA 1AL3A 3CFXA 3OO9A 1VR5A 3IL1B 3OO6A 3K01A 3CI8A 3OSQA 4R73A 3W15C 3TCHA 3UK4A 3C34A 2CZLA 1QW0A 4PETA 3M3LA 4U4XA 3RLFE 4ELQA 5I2NB 4DXCA 3IOUA 2X26A 4FECA 4ESWA 4GXSB 1UIUA 3IO6A 2Y84A 2HCAA 4HS7A 1TT1A 3SESA 3PUZE 3MVXA 1A8EA 4JXIA 4ZEDA 2NOOA 1R1NA 2AL5A 1WDNA 2OWTA 3KN7A 4RNSA 3CSGA 3TTNA 5FHOA 1MQGA 1A7LA 1URGA 5K2XA 1NNKA 5ITPA 1B7ZA 3K4UA 1B5HA 2XD2A 4G68A 4QSEA 4UACA 2PBWA 2X7PA 4I62A 4EF1A 2AL4A 1D4NA 5I2NA 1CB6A 3S9MC 4NMYA 1ZLQA 2O7UA 1NH8A 3G3KA 3GZGA 2O51A 3RTWB 1GTKA 1N04A 1WVJA 3K1PA 4JBZA 1R9LA 3MPLA 2VD3A 4QSCA 1N84A 4OENA 4DXBA 4RPNA 2UVIA 1SQYA 1L5TA 4HCWA 4ZZAA 2R6GE 4OFJA 4RY1A 1MH3A 1MQJA 1Y3QA 4BDMA 2AYSA 4WEPA 3E9XA 3GBAA 1OQGA 3QSLA 2XXRA 5CI5A 3TTMA 5KCJB 4N13A 1PB7A 3ZKLA 4HW8A 4IY5A 1AH5A 2XXYA 4GVOA 5K2YA 3MW0A 5I56B 5AE4A 3HCQA 4QF9A 4YU0A 1NFTA 2OZZA 2I6EA 3V89B 5B70A 2XXIA 2PX1A 2XXQA 1P1UA 4LP2B 2DVZA 1HSLA 1GGGA 1A8FA 5DTBA 1PEBA 3PV0E 1JVXA 4GQOA 3JV9A 2UVHA 4AQ4A 1B3LA 4GOTA 1MDP1 5KCJA 4FEDA 3O6HA 3LC8A 3H4ZA 2F78A 3C31A 3KJTA 2REJA 1EH3A 1II5A 3QXMA 4C1TA 1A55A 4PQJA 3O2AA 3IB2A 1CE2A 3KEIA 5CMMA 1GR2A 3FGSA 4KCCA 4EXKA 1MPCA 1XS5A 3MP1A 3T96B 5ICQA 2F6PA 1DTZA 3BFUA 1MG1A 4HCYA 4X9TA 1B5JA 4G8MA 2PYYA 4GRKA 2HQ0A 1BLFA 1DPEA 4XIGQ 3TUSA 1B6HA 3MJNA 4R2FA 1S9TA 1LGBC 2IA4A 3T9VA 5AA4B 1LCTA 4EQ7A 4YKIA 3FATA 4F2QA 4GIZA 5A5XB 3R26A 3A3CA 4KR5A 4LQ5A 2QMXA 3H6WA 1OMPA 1AIVA 4H8IA 1ZTYA 3IO4A 1LSTA 3JYRA 4H5FA 3GXAA 2HZLA 4H1XA 3N6TA 4R74A 3IK6B 4E0WA 1SYIA 3MZBA 3K00A 3G7WA 1N0TA 1B2HA 2Z8FA 2XXPA 1TFAA 2HXWA 2OBGA 2XXTA 2ZYMA 5KZTA 3M3FA 3K0VA 1SVXB 1Y20A 5F1QA 2I58A 1B32A 2GFEA 4ELRA 1QKAA 4TLLB 2YJPA 1MM6A 1UTHB 5A5XA 3TCFA 3N6UA 4BDOA 3U72A 2M8CA 3DELB 2V25A 4WKMA 2DWJA 3S9LC 5DT6A 3TTKA 3Q25A 3KSJA 4YKPA 3MUQA 1XHYA 3FD3A 4EF2A 1MXUA 5AA1A 1SBPA 3TZAA 1M5EA 3USDA 4PP0A 3KJ7A 4LQ2A 4POWA 1PDAA 3PUXE 2NWJA 4M1VA 1UQWA 1I6BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FCKA 1NNPA 2Q89A 2W7YA 2KQZA 3W9VA 4PE3A 4KXPA 3G3FA 2REGA 3QK6A 3E3KA 3MZ9A 2RC8A 3OXNA 4KYSA 3DRFA 3IB0A 2H25A 4PAFA 4H45A 1BP5A 2DE2A 3PU5A 4YB6A 3A09A 4N17A 1LB8A 3ROJA 4XF5A 2P3NA 1NV3A 3DLNA 1KWHA 4IO3A 3B6TA 4GD5A 2Z8DA 2FHYA 3CG1A 3RQTA 1FTKA 4F1UA 4GL0A 4U2RA 3OO7A 3OEKA 3PTYA 3SEYA 1XI6A 1FTMA 5FHMA 1QULA 2F34A 4G8HA 4H46A 2Z22A 3OO8A 3T9HB 4KQPA 2GHAA 3KN8A 4JSDA 4GWXA 3Q27A 1ZIUA 1FPLA 1Y1ZA 1BTJA 1FQFA 3TTLA 3EF7A 5DVIA 1QVSA 4H6DA 3R7XA 3H6UA 1DMBA 2WKYA 1EYKA 1I6QA 1HSJA 2QPQA 2P3VA 1FPKA 3QIMA 4E0XA 4JVIA 2ZXTA 3HHFA 4X48A 4PDDA 2QS4A 3MVZA 3T66A 3UGWA 1IMAA 1UTBB 1NUXA 1NI9A 1FPIA 4G8NA 1FQAA 5CC2A 3HFUA 2UYFA 4OFOA 3C32A 3U8QA 4P3LA 1MRPA 2GRVA 1USYH 5DVJA 5EHSA 4Z7EA 1ZMGA 1SI0A 1JEUA 3K6VA 5AA2D 4F39A 1NUYA 3L6HA 4NGUA 2Z23A 2RCAA 1H43A 2HHMA 4PF6A 1MY3A 1MY4A 2VGQA 2I49A 2OCUA 4BLAA 5JK4A 1OLAA 4GL8A 1QUKA 1O7TA 1XVYA 4XKQA 2VP1A 4C1UA 2I3VA 1IZ1A 4JVCA 3EHSA 2DSFA 1FQDA 4NG7A 1MQHA 5TU0A 2I4BA 3RGYA 1GVCA 3C33A 3ZSFA 4QHQA 1IXCA 5TPAA 5KDTB 4NF4A 1FPBA 1SW5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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