3TQLA

Structure of the amino acid abc transporter, periplasmic amino acid-binding protein from coxiella burnetii.
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
227
structure length
225
Chain Sequence
TDTIKFATEATYPPYVYMGGQVEGFGADIVKAVCKQMQAVCTISNQPWDSLIPSLKLGKFDALFGGMNITTARQKEVDFTDPYYTNSVSFIADKNTPLTLSKQGLKGKIIGVQGGTTFDSYLQDSFGNSITIQRYPSEEDALMDLTSGRVDAVVGDTPLIKQWLKQNGRREYVLIGKPVNDPNYFGKGVGIAVKKGNQALLLKLNKALAAIKANGVYAAIVQKYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural genomics for drug design against the pathogen Coxiella burnetii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Arginine-binding protein
molecule tags Transport protein
source organism Coxiella burnetii
total genus 71
structure length 225
sequence length 227
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tqlA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tqlA02
3OEMA 3ODBA 1N76A 5KCJB 4ZECA 3TTMA 1A7LA 5CMBA 5I84A 4TLLB 4RA1A 4OETA 4DXBA 2I4BA 1H76A 5I58B 1MQIA 1VFDA 3M8UA 4OYVA 3IJOB 4EDPA 4YB7A 3V8XB 3E4RA 5CMKA 1POTA 2O6AA 1N3XA 4PFWA 1NKXA 1B5IA 5HM4B 4H65A 1BIYA 1VFEA 4IO6A 3K6WA 1IXGA 5DVFA 5FHNA 4X1DA 4H6DA 2ZNUA 3QUJA 1MRPA 3ZSFA 4O3CA 4LP2B 3FVKA 2P1SA 1I6AA 2M8CA 1QKBA 1RYXA 5FTHA 3MPLA 4KPTA 3SEVA 1LCFA 4RJZA 1J1NA 3JZJA 4F31B 4TOZA 4AQ4A 1PB8A 2I4CA 2Q9TA 1JETA 2ZYNA 3FIRA 1SW4A 2F7BA 3PMWA 5ICTA 3TFLA 2E0SA 5H8QA 3N5LA 5I59A 4MF3A 1WODA 4IY6A 1Y3QA 3QYTA 1B3GA 4MH5A 5HPQA 1SDXA 3I6VA 1CE2A 4C0RA 1B7ZA 4OWDA 1SQYA 3HN0A 2OWSA 4IB2A 4P11A 2H25A 4ELOA 2UVHA 3Q26A 4O3BA 1XVYA 4H8JA 3IB1A 5TU0A 3TCGA 3ECRA 2OCUA 5H8QB 1F9BA 1DOTA 2OLBA 3R7XA 5CBSA 4GVOA 3BKIB 3VVFA 3EN3A 4OEUA 3VXBA 1OMPA 4R72A 4JB7A 3PPRA 3K2DA 1WDNA 4DE8A 3MWBA 5B7DA 3H3GA 2QSXA 1GVCA 4M1VA 2D21A 2HFBA 3IL1B 3QIMA 4F3GA 2Z8FA 2HZLA 3QSLA 4LATA 4P0IA 4PFYA 5AE4A 3O6IA 3EQ1A 3U92A 2I3VA 3PPOA 3GLBA 2H5YA 4BDNA 4Q8RA 3PMVA 4XTCQ 1JEUA 4BDRA 1HSLA 1MH4A 2YJPA 4KCDA 2ONSA 4DXCA 2DWHA 4UACA 3HHGA 1FTJA 1JNFA 5I56A 1PBQA 3PUVE 3TDJA 2OWTA 3OD7A 1S9TA 2A5SA 4XKRA 2Z23A 1R9LA 4ZEBA 3C34A 3ILUB 1OQHA 2DWIA 4KYDA 1SYHA 1L5TA 4ELRA 3O66A 4JWYA 2DWJA 3GXAA 3TPAA 4R75A 2UVGA 4GXSB 4NWDA 2R9JA 2O51A 2XXPA 2Y7WA 1VSOA 3Q28A 2I6EA 3VFJA 3K1NA 2UVJA 4WEDA 3Q25A 3D4CA 3O2AA 2F8DA 2ZYKA 4KQPA 4IO2A 5I56B 4IO4A 2HAVA 3L6HA 3B6QA 2DXRA 1P1UA 3PUZE 4BDMA 1ZBMA 2DXYA 3RLFE 3LBSA 2PT2A 4JSDA 4PE5B 3TMGA 4F3PA 4DIGA 4F1YA 3BFUA 2R71A 3IOVA 1FQCA 3T96B 1MDQA 4JSOA 3M3LA 1IZ1A 4ZZAA 3KOTA 1P1WA 2VGQA 3KOSA 1MXVA 2H4IA 1LFIA 1N84A 5K2XA 5F1QA 2Q2CA 2AL4A 5KDTA 4LA9A 4FATA 3G3FA 3FXQA 2RC8A 1FQBA 5I57A 3DLNA 2V3TA 3FGSA 2AYSA 1YCJA 3K6VA 3ILTB 4X48A 2X7QA 3PPPA 4RPOA 4HCWA 1EZPA 5J1DA 2DS9A 2PT1A 3CRBA 1SI1A 3K1PA 3ZS6A 1URGA 2O7UA 3OEKA 1Z7ME 2A5TA 3N94A 5AA2D 3CI8A 4NEDA 2UYFA 4ZZEA 3BBRA 2YPNA 5JTYA 4R6KA 1USYE 2PX1A 4U1OA 5TP9A 5L9SA 4IO7A 1NMUA 1Y9UA 1ZLQA 3VVDA 4U21A 1LB9A 4ONYA 3LUYA 1M5DA 3KSXA 4RNSA 4X1BA 3K1MA 4IY5A 2I3WA 5EHMA 2XD2A 1EU8A 5I57B 3FV1A 2DWAA 4YZZA 3O29A 3T93B 4IO3A 3C31A 1DMBA 4LZ8A 3I3VA 3RNNA 3M3KA 3KBRA 2A5TB 3H6UA 2QMXA 1SI0A 1B3LA 1MDP1 1USYH 5JTYB 3TODA 4RYAA 4OEVA 5KCJA 3DP4A 4DCYA 5TP9B 1UTHA 1MXUA 2ZXTA 4QFOA 4OENA 3SEWA 3U1OA 5CI5A 4YMAA 3TELA 3N6TA 2O69A 3RT6B 3RY3A 1UQWA 4G2ZA 4G8MA 4DZ1A 3MW0A 5EHSA 1QVSA 4YKKA 1TT1A 1TWYA 1BKAA 1MPCA 3E3KA 1Q35A 3FATA 3KJ7A 4RK9A 3W9WA 4ELPA 3WAEA 3OELA 5LOMA 1DTGA 4I1DA 3H06B 1EZOA 1UTHB 4OESA 1QUIA 3MP8A 3O28A 3UP9A 5JK4A 3UK4A 4POWA 3A3UA 2X26A 2Y7PA 2F6GA 4M4GA 1A8FA 1B1HA 3H4ZA 1FQDA 3PV0E 2HQ0A 2QPQA 5L9OA 1M5EA 5BUUA 1XS5A 3LSWA 3K6XA 1B0HA 4G68C 1MPBA 2REJA 1LAGE 3SDFA 3S2VA 2CMOA 3MZ1A 3PU5A 1A54A 3V83A 4QHQA 4NF8A 3TZAA 4GL8A 2F5XA 1B51A 3A09A 3FD3A 1IEJA 4MFIA 3C9HA 2XXRA 3CFLA 4F2OA 2Q88A 1UIVA 3SEXA 2QS2A 5EYFA 1NH8A 2VP1A 2RCAA 2XXTA 2ZYMA 3QXMA 4GFRA 1MH3A 1OLCA 3CG1A 4PP0A 1B7HA 2PBWA 2FYIA 3MJNA 4ZEKA 3E13X 5ITOA 2NOOA 4YICA 2XD3A 2VHAA 1YAEA 4NF8B 3IAZA 5BWJA 1FQAA 5DYHA 1US4A 3OO7A 2NXOA 3H7MA 3G7WA 4MLQA 3RUMA 1XVXA 3DM0A 5CM6A 4RK2A 2QMWA 4KYEA 3MBPA 1Y3NA 1SVXB 3CFZA 2RF1A 4YKIA 2QS3A 1AL3A 5H8NA 3PPNA 4OVJA 3TUSA 3GBAA 1FW0A 3R26A 4TLMB 4LZ5A 3JV9A 4H67A 1PC3A 3MVYA 3WAFA 4GXAA 4NF4A 5CBRA 2XXVA 3BFTA 4LZ7A 4C1TA 2QL3A 2RCBA 3V89B 3H6TA 2ZYOA 4FAJA 5K2YA 3U72A 1P1QA 1MQJA 1MY1A 1WVJA 3SEYA 4F39A 2W7YA 2NUVA 3G3GA 1B2HA 3DELB 3I5OA 3RTFB 5H8NB 3IX1A 1NH7A 1AIVA 4YMBA 4E0WA 4U2RA 3CFXA 4GL0A 1B40A 4R73A 4KFQA 4BDLA 3TEPA 4KHZE 1IIWA 4IGTA 1II5A 4HCYA 4NF4B 3RTWB 1S50A 3USDA 2PYYA 2Z22A 4HW8A 3GBBA 3S9MC 1LBCA 3MQ9A 1JW5A 1Y1ZA 1YPNA 1T0KA 1B0LA 1D3KA 1NNFA 1GV8A 1QULA 1B52A 3SKPA 4R2BA 3TQLA 3B6TA 3TKDA 4DXUA 4GRKA 2GRVA 1CB6A 3HSTA 4Z7EA 4E0XA 2E1SA 3PD8A 4KI0E 4I8CA 4P0GA 3H6WA 1A55A 1MM7A 1NNTA 1XC1A 1MY4A 1URDA 1O64A 3OSRA 2GHBA 4GLIA 3IB0A 5A5XB 2Z8DA 4NF5B 4EQBA 2DVCA 4ZEDA 1JVYA 5DVIA 1EZ9A 3PUXE 1B3FA 4THIA 4OHNA 1MQDA 5AA3A 2ALUA 1OQGA 2Y7RA 3OO8A 4MLVA 4JXIA 5DTBA 3T66A 2OK2A 1IXIA 2B65A 4U1ZA 4OFJA 1XHYA 2XHDA 3MPKA 3FJ7A 3LSFB 2DYXA 4EXKA 1MM6A 4NTLA 3UN6A 3MVZA 4YB5A 2REGA 4PFUA 2HEUA 1Y20A 2WKYA 3MVXA 1ZMGA 4X9TA 2ZMBA 3FJGA 4BLAA 2Z8EA 4BDOA 3SERA 4ISUA 5CMCA 3UA8A 2O7IA 4QFLA 3TTKA 2H98A 3OO6A 1XOCA 3VDFA 3TTLA 5I2KA 3MC2A 4G68B 1ZTYA 1KWHA 1FTOA 1N7WA 4OXVA 5FHMA 3EHTA 1SW1A 1D9VA 5TPAA 1NNKA 1FTMA 3K02A 1JQFA 4EF2A 3IJXB 4O3AA 3LSXA 5ICQA 1DPEA 1PEBA 4OZ9A 4R74A 3U93A 4ND9A 3IORA 4F18A 2F6PA 1TXFA 1URSA 2O1MA 4G8NA 5B70A 4R9FA 2XX8A 3SESA 1QUJA 5I2KB 1B1XA 3AXFA 3C36A 3TCFA 4QFPA 1LAXA 2I58A 5TPAB 4XXUA 1S7YA 5KZTA 4G77A 3TAJA 5ITPA 2Q8JA 2THIA 2B3FA 2DE4A 1Y3PA 5CC2A 1A8EA 5L8DA 3OMBA 3MP6A 2Q2AA 3S9NC 1FTKA 1TFDA 4XKNA 3E9XA 4WEPA 2ZNSA 4F19A 4FJPA 5H8FB 3S9EA 3THIA 1PB9A 2NWJA 3Q29A 2ONKE 3ONMA 1MXZA 1H3DA 3W9VA 2LAOA 2DE3A 3MZBA 1MQHA 3KJTA 4R6YA 1LFGA 4EQ7A 1ZKBA 2O84X 4Q30B 1QJMA 2G93A 3P7IA 1UTBA 3MVWA 3FJMA 4YB6A 2XX7A 1VE4A 4JBZA 4QFNA 3K00A 4YU0A 2ANJA 4H5GA 1H45A 3MUQA 4EF1A 3ZKKA 3FVNA 5ISUA 4RPNA 1JW4A 5CMMA 3VLUA 1OIBA 3KFMA 3LR1A 1Y1MA 2VOZA 4QFKA 3LC8A 5FTIA 1Z7NE 4FECA 4FE8A 2GH9A 3T9VA 5DT6A 3PPQA 3TTNA 1SBPA 3B6WA 2ONRA 4F1UA 3KN8A 2I48A 2FA7A 1UTBB 3Q27A 5DEXB 4JDFA 1OVBA 4OTEA 4U4XA 3G3KA 4GWOA 1IITA 3FVGA 4YKJA 4KCCA 3RPWA 1D4NA 3IB2A 4YKPA 1NFTA 1R6ZA 3K4UA 3U8QA 4DDDA 2DVZA 2YLNA 3C4MA 2F97A 3VLWA 4JWXA 2O68A 2I0BA 2XXQA 4BDQA 4RY1A 3FUZA 2RKMA 2P0SA 2ABHA 3FXRA 5DVJA 3FVOA 1M5FA 2H9BA 1A99A 1FCKA 2UVIA 1M5BA 3T9HB 4F2QA 5H8HA 3IR1A 4XIGQ 4ZEFA 4EXLA 1LFHA 3IOTA 1P99A 3VVEA 4F22A 4MBPA 1POY1 3CIJA 1OVTA 4HS7A 2Y7KA 4I9DA 3CR9A 4OERA 3V5AA 3TTRA 4OQOA 4PFTA 2I49A 2GFEA 4OFLA 2XXYA 2OJTA 3N6UA 4UA8A 3EF7A 1PB7A 1B4HA 3D4GA 1JW1A 4LQ5A 1AOVA 1RYOA 3PD9A 1PDAA 4H1XA 5AA2A 1P1NA 1Y4TA 3N26A 3OSQA 2QS4A 3KEIA 2IEEA 5H8HB 4F29A 3QUFA 4QF9A 2O1LA 4TQUQ 2QJEA 4GF8A 1A40A 4Q5TA 4C1UA 4LUBA 4WKMA 3O9PA 4GOTA 2HXWA 1I6QA 3RN8A 3IK6B 4EQ9A 1SW5A 4NWCA 1BTJA 1P1OA 1N3WA 2UXAA 3O6GA 5FHOA 1ZJLA 4F3BA 3S4UA 4ECFA 1H44A 1Y4CA 2NVUB 3DP6A 3VLVA 1LB8A 3B7DA 1EH3A 1QW0A 3G3IA 5AA2B 5I59B 2UYEA 4N13A 4FEDA 2VD2A 4LQ2A 1HSJA 3TQWA 1FQFA 4GIZA 3SETA 3TYHA 2F34A 5HBCA 2F35A 1Q1KA 2XXWA 1LCTA 3K01A 5I2NA 4AB6A 2G29A 4ELQA 1MXYA 3CSBA 4U4SA 2D3IA 1HSEA 1JVXA 4U22A 5CRYA 2HCAA 3MZ9A 2XXXA 2DOJA 4R2FA 4H5FA 5A5XA 4NF5A 1LAHE 4ZEIA 2V3QA 3OENA 2HAUA 3HHFA 2AL5A 1SW2A 1QUKA 1B3EA 4RXLA 1B7UA 3IO4A 4Q0CA 3L6GA 3IOWA 1R1NA 1BP5A 1R9QA 4OFOA 3S9LC 1I6BA 4GD5A 3H03A 4DLDA 2RINA 5IKBA 2XXIA 5I2NB 4U23A 4AB5A 1IXHA 3PGFA 3IO6A 2AIXA 1AH5A 3KSJA 4ZS9A 3DP8A 3K6UA 1XT8A 2RC7A 3T9UA 3VXCA 3LSLA 2RC9A 3HCQA 5AA4A 1B05A 4QSEA 2OBGA 1B9JA 2V84A 2B3BA 3EPEA 1M5CA 4G68A 1ATGA 1DPPA 2D5WA 4POXA 2V93A 5ELVA 1H43A 3FASA 3PMXA 4FORA 2XX9A 2DP8A 3G3JA 3KG2A 3F11A 2BJJX 2CZLA 1B32A 3CG3A 3ZKLA 4EUOA 1MXWA 3SEUA 3OOAA 1DTZA 1N7XA 1GR2A 3CVGA 1N04A 3TCHA 1LGBC 4LONB 3FZVA 1MQGA 4K3FA 2GHAA 1GGGA 4G4PA 2P2AA 2I0CA 5AA4B 1MY0A 3EHSA 3OO9A 2F7CA 2VD3A 2PMSA 2FNCA 3M3FA 4JWOA 2Y7IA 3QK6A 4N6PA 4H8IA 3W15C 3FXUA 4QRZA 4QSCA 1I69A 2V3UA 3R6UA 1MY2A 4I62A 1IQ7A 3FV2A 1MXXA 4NF6A 3RGYA 2F7AA 1B5HA 3OXNA 4N07A 2QS1A 3KN3A 3HPIA 1MY3A 4WXJA 5F7VA 3G3HA 2Q89A 1OLAA 4NMYA 3PUYE 2OZZA 5H8FA 1B6HA 2HZKA 4ESXA 3VV5A 3KGCA 4KR5A 1PBPA 3EHUA 5L9MA 3A3CA 4R9GA 5AA1A 4ZE8A 1D9YA 5M2VA 3O6HA 2IA4A 1AMFA 4NE4A 4NF6B 4R6HA 1ANFA 1JEVA 1B58A 4YAHX 2PVUA 3HV1A 1O63A 4ZE9A 2ZNTA 3U94A 1VR5A 3HO7A 4KYSA 3T22A 1B46A 1LLSA 2F78A 3UIFA 2ESNA 1SYIA 5JEIA 4KD5A 4Z0IA 1FTLA 1B5JA 3QAXA 4L17A 3KZGA 3KN7A 4ESWA 5KDTB 2X7PA 2H99A 1B4ZA 4GQOA 4DCXA 5H8SA 1GTKA 3VE1B 2DSFA 1NNPA 2XXHA 1LSTA 3T9XB 1FQEA 3RT8A 4LVQA 1BLFA 2V25A 3K0VA 3C33A 3UORA 4ZDMA 3C32A 3PUWE 4OMBA 3MAMA 1LBBA 4HTGA 4XKQA 1ELJA 1YTVA 3UGWA 1NL5A 4QSDA 3GZGA 4IO5A 1UIUA 4IGRA 3RQTA 2XXUA 5DEXA 4FEBA 4PQJA 4FIMA 4XKPA 1O7TA 1US5A 1B3HA 1MS7A 3IOUA 3O97A 1QKAA 1IXCA 5I58A 4H0WA 3CSGA 1MPDA 4G8HA 2QRYA 1SD3A 3H6VA 1N0TA 2DQVA 4F1VA 2DE2A 3C35A 1TFAA 3MP1A 2Y84A 2F36A 1ZU0A 1RKMA 1DSNA 2R6GE 5IAIA 4PETA 1IUDA 1LAFE 1ZIUA 3JYRA 2KLFA 4F3SA 1MG1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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