3TQLA

Structure of the amino acid abc transporter, periplasmic amino acid-binding protein from coxiella burnetii.
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
227
structure length
225
Chain Sequence
b'TDTIKFATEATYPPYVYMGGQVEGFGADIVKAVCKQMQAVCTISNQPWDSLIPSLKLGKFDALFGGMNITTARQKEVDFTDPYYTNSVSFIADKNTPLTLSKQGLKGKIIGVQGGTTFDSYLQDSFGNSITIQRYPSEEDALMDLTSGRVDAVVGDTPLIKQWLKQNGRREYVLIGKPVNDPNYFGKGVGIAVKKGNQALLLKLNKALAAIKANGVYAAIVQKYF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural genomics for drug design against the pathogen Coxiella burnetii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Arginine-binding protein
source organism Coxiella burnetii
molecule tags Transport protein
total genus 71
structure length 225
sequence length 227
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tqlA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tqlA02
4LATA 3PMVA 3OENA 4WEPA 4H6DA 2DQVA 4IO4A 4G2ZA 2ZNTA 3JZJA 1YPNA 5CRYA 3H6VA 5L9OA 2DE4A 2X26A 3CI8A 2HCAA 3TUSA 3ZSFA 5TP9B 3KG2A 4G68B 4MLVA 2VGQA 3TAJA 4OFOA 2OLBA 2ZYMA 3N5LA 3LSLA 1QUJA 1MXYA 3VV5A 1PC3A 1B0LA 3G3KA 1BP5A 4PETA 4OETA 4X48A 3FJMA 1MQIA 3RY3A 5ISUA 4PFYA 4U4XA 2OZZA 3LSFB 3QSLA 4KHZE 1S9TA 3CFZA 2GHBA 1Y1ZA 1DPPA 4IY6A 3TMGA 3B6TA 3QXMA 4OWDA 2OWTA 1IZ1A 3K4UA 1ZKBA 5J1DA 4GQOA 3DP6A 2GFEA 4Q30B 1NFTA 3RUMA 2B65A 3PUXE 3IORA 3Q29A 2A5TA 3Q26A 4FEDA 2P1SA 4MFIA 3SEVA 4BDMA 4H5GA 1LSTA 1OMPA 1B3LA 2Y7WA 5IAIA 3PMWA 2VOZA 3MP6A 1H3DA 3K02A 3KZGA 4YMBA 3OO8A 3TCGA 4ZEFA 4C1TA 3TEPA 5HBCA 3KFMA 5AA2B 3G3JA 3H6UA 3W9WA 4NF6A 1OVBA 3TTMA 4AB5A 4NMYA 4KCCA 3HN0A 1NKXA 3MPLA 3S2VA 1H45A 4Z7EA 1NNFA 2P2AA 1UTBA 1SYIA 4ZDMA 2AL4A 3TCHA 3DLNA 4C0RA 1B3GA 3FJGA 4Q0CA 1FW0A 1UTHA 3ILTB 3TYHA 5I2KA 4OVJA 4YKPA 3T9HB 1QKAA 2V93A 5H8QB 1NNKA 5CI5A 2W7YA 5DTBA 3IR1A 2Q9TA 5AA1A 2V3TA 1DTGA 4ELRA 2F6PA 2UYFA 4GF8A 3O29A 3G3GA 4BLAA 3B6WA 2F36A 5A5XB 3OO7A 4G8MA 4DXCA 3O6IA 4Q8RA 4QFLA 1QULA 1B1XA 3RN8A 3TTRA 1O64A 2OK2A 2NOOA 1URGA 5ICQA 4QFPA 1Y9UA 5H8FA 2IA4A 1B3HA 2QMXA 4U2RA 3LSXA 1NNPA 3O28A 2ZMBA 5H8HA 3HV1A 2ZNSA 1UIVA 4G4PA 1MY3A 1MPDA 3HHFA 4EXLA 1BLFA 4DDDA 4ESXA 1SI1A 3T9XB 3MZ9A 4NF4A 4N13A 3U94A 3FATA 1R9QA 5F1QA 1B7HA 1MPCA 4DXBA 3GZGA 4KPTA 5AA4B 3MJNA 4DCYA 4KYSA 1XS5A 1ZU0A 3K2DA 5ELVA 4H8JA 4F29A 5HM4B 5DEXA 3W15C 1IIWA 1QVSA 3FV1A 1ELJA 4HCYA 5EHSA 3K1MA 1GTKA 4AB6A 2F5XA 4OYVA 3A09A 3TTKA 1XT8A 4NWDA 4EDPA 1ZMGA 1B0HA 2M8CA 4JWXA 3BFTA 3I6VA 3S4UA 1NNTA 1CE2A 2DVZA 4FATA 5L9MA 4LZ5A 4DIGA 2QL3A 4XKNA 1J1NA 3SEXA 4GXAA 3N26A 2GH9A 3IOUA 2Q88A 4DLDA 3EQ1A 5KDTA 2NXOA 1D9VA 3T9UA 1LAFE 3UP9A 2UVHA 3KOSA 1SDXA 3IX1A 5L9SA 4MLQA 2XXQA 4O3BA 2XX9A 2KLFA 4OXVA 4LP2B 1I6QA 2G93A 5I57A 2F7CA 4KCDA 3MUQA 4FECA 2DYXA 5CMBA 2ZYKA 3T22A 5DT6A 4R74A 1EZPA 1Y1MA 4ZEDA 2O51A 3VLVA 4MH5A 1B40A 2G29A 4GIZA 3KOTA 3WAFA 2O7UA 3OEKA 1IXCA 5CBSA 2THIA 2ONSA 5H8NA 4EF1A 2E1SA 5I56A 1SVXB 1I6BA 1GR2A 4HCWA 4BDQA 4F3PA 1FTLA 1L5TA 1PDAA 4RXLA 1F9BA 4UA8A 1LB9A 4RJZA 2I0CA 3C31A 3C35A 3N6UA 4NEDA 2CZLA 1AOVA 3ECRA 1B6HA 1LAXA 3G3FA 2Y7RA 4RYAA 1O7TA 1SW1A 4JSOA 1ATGA 3TZAA 1H76A 1LLSA 4U1OA 4JXIA 4ISUA 1JNFA 3CSBA 1JEVA 3EHTA 1O63A 2PT1A 3UA8A 2E0SA 3MZBA 4UACA 1SW2A 4F31B 4KD5A 5DVFA 3MP8A 3PUZE 2F34A 2PBWA 2LAOA 5AA3A 2RCBA 3KN3A 3E13X 4R9GA 3VVDA 4GOTA 3LC8A 4H1XA 3RT8A 1NH8A 1N84A 2Z8FA 1UTHB 2Z8EA 4H65A 3SKPA 3O9PA 5I2KB 1N3XA 4F39A 2XXWA 4I9DA 3CFLA 1IEJA 4GFRA 5ITOA 1DMBA 1B3EA 1MXUA 4GD5A 3IB1A 3MZ1A 4LONB 4JSDA 2DE3A 2XXYA 5I84A 1MXXA 1PBPA 3S9EA 2F97A 3MWBA 2WKYA 3VLWA 3BBRA 3ONMA 2V25A 1I69A 1PB9A 3C36A 5I59A 1B2HA 4RA1A 5JK4A 1BKAA 5FHMA 1YTVA 4H5FA 1JW1A 4PFWA 1ZBMA 4IY5A 2RC9A 4ZE8A 3RT6B 2F7BA 2REGA 1Q35A 3DM0A 1LCTA 4NTLA 4GVOA 4E0XA 1Y3NA 4OZ9A 5L8DA 2V3UA 3QYTA 2I3VA 2UXAA 1JQFA 3E9XA 1JVXA 3FIRA 1P1OA 4OMBA 3GXAA 3PPOA 3OELA 5H8FB 1DOTA 1MQJA 2ONKE 1OVTA 5H8HB 5B70A 4JB7A 1JETA 2NVUB 3VFJA 2O68A 4YB7A 4LQ2A 1MY1A 3M3LA 4P0GA 4QRZA 2FYIA 4LZ7A 4TLMB 3KJTA 1EU8A 4NF4B 4IGTA 4H67A 3U72A 4NE4A 3B7DA 4N07A 1P1QA 4EF2A 1WODA 5CC2A 3Q28A 1IXGA 5DEXB 3T96B 4OHNA 3PGFA 1P1WA 1A7LA 4YAHX 2I4BA 4QFOA 2I3WA 4YKJA 4BDRA 5KCJA 3TQLA 4ESWA 1QUIA 4IO7A 5I58A 4LVQA 2DXYA 3R6UA 1OQHA 2O6AA 1B7ZA 4L17A 3OD7A 1YAEA 4R2BA 1PB7A 3P7IA 3DP8A 4YB5A 3M3FA 5KDTB 2XXUA 4LUBA 2D5WA 4RNSA 4OFLA 4F3SA 4OFJA 3TKDA 1GVCA 2NWJA 3PPPA 5JTYA 2H25A 2RINA 3TQWA 1A99A 1XHYA 5I57B 2GRVA 1B4HA 4O3AA 1GGGA 3C9HA 1B32A 3IJXB 4R2FA 2DVCA 2V3QA 3LBSA 2QJEA 2XD2A 1IITA 1B51A 4R6KA 1ZLQA 1I6AA 3HO7A 1AMFA 4RK9A 2YLNA 3IB0A 3GBAA 4OERA 4XKQA 1KWHA 3LUYA 1XOCA 1RYXA 4LZ8A 1P99A 5IKBA 1RYOA 2F35A 1VSOA 4NWCA 1URSA 4DZ1A 5H8NB 5I56B 4RPOA 1TWYA 3OO6A 3O6GA 1MQHA 2I6EA 4KFQA 4N6PA 4OENA 3IK6B 3MPKA 2OCUA 1MM7A 4Z0IA 4BDLA 4ONYA 3N6TA 1FQCA 4PP0A 5FHNA 3RTFB 4I1DA 4EUOA 3UIFA 3C33A 2VD3A 1JVYA 3LSWA 1PBQA 3K1NA 4R72A 4BDOA 2CMOA 2XXTA 5CM6A 2IEEA 2UVGA 3EPEA 4NF8A 5K2XA 2DS9A 1M5FA 3FZVA 1MQDA 4R73A 2ONRA 1VR5A 1EZ9A 3OXNA 5BWJA 4BDNA 1SW5A 1US5A 3S9LC 1LCFA 4ZE9A 3O6HA 2O7IA 5BUUA 1B05A 1Z7ME 2PT2A 1OIBA 4YB6A 1ANFA 5CMCA 3H03A 4YKKA 1SI0A 3OMBA 4F1YA 3G3IA 4M1VA 3O97A 1R6ZA 4XIGQ 3KGCA 3RTWB 3UK4A 4R9FA 4YZZA 5B7DA 2PYYA 2O1MA 5I2NA 4OTEA 2Z23A 2HFBA 5TPAA 3FXRA 1FQEA 3R7XA 5AE4A 1B5HA 3VVFA 5FTIA 4IO5A 4ELOA 3G3HA 2X7QA 4KYEA 1N7XA 1YCJA 2DP8A 2XX8A 3USDA 3KN7A 1IXIA 2XXPA 5DVJA 3SETA 3MP1A 5EYFA 5I59B 4OQOA 3WAEA 3DP4A 1LFIA 2O69A 2XXVA 3FGSA 3TFLA 4MF3A 1T0KA 1SBPA 1VE4A 3MVZA 3FVNA 1SW4A 3G7WA 2GHAA 1VFDA 1URDA 1FTMA 2DSFA 4X9TA 2AIXA 3CG3A 2DOJA 3IJOB 3PUYE 3EF7A 2DXRA 3W9VA 2ZYNA 2QPQA 4WKMA 3IOTA 4U22A 1NH7A 3FV2A 2RF1A 4FJPA 3SERA 3A3UA 1JW4A 2Y7IA 3FXQA 4DE8A 1FQDA 1LFGA 1WVJA 3KBRA 4HW8A 4GL0A 4QHQA 4F18A 3H7MA 4R75A 1Y3PA 1MXWA 2HZLA 3V83A 1VFEA 2Q2CA 3VE1B 2Q89A 1ZTYA 3IL1B 3CG1A 3ODBA 2QMWA 1SYHA 1TXFA 1TT1A 2X7PA 5ITPA 4HS7A 1BTJA 1Y4CA 2A5TB 1R9LA 2PMSA 4F1UA 2HQ0A 2DE2A 3BKIB 5M2VA 1TFAA 3IO6A 4F22A 2D3IA 2AYSA 3EHSA 4KR5A 1SQYA 1LAHE 5H8SA 2DWJA 4OEVA 1B58A 5KCJB 3EHUA 2F6GA 4LQ5A 5I58B 2UVIA 3B6QA 4NF6B 1A55A 2UYEA 3CVGA 1R1NA 1LB8A 4YICA 1MH3A 1FTKA 2HZKA 4DCXA 1EZOA 1B5JA 1LAGE 3IOVA 5CMKA 1UTBB 2AL5A 4ZEKA 1D9YA 4GL8A 4TQUQ 5JTYB 3PV0E 4RY1A 3ZS6A 2QS1A 1B5IA 2XXXA 3K6VA 3CR9A 2O84X 3VXCA 4U4SA 2D21A 1N3WA 1AH5A 2P0SA 3SDFA 3PUVE 4OESA 1A40A 3C4MA 2A5SA 3I3VA 3PU5A 1D3KA 4POXA 3DELB 2R71A 2Y84A 2Z22A 2B3BA 4JWYA 2RCAA 3K6UA 4QF9A 4ELQA 4RK2A 1Z7NE 5FHOA 1M5BA 3V8XB 1MY0A 1DSNA 3PMXA 1MXZA 1MDQA 3MAMA 2ABHA 4THIA 4Q5TA 1HSEA 1FTJA 1ZJLA 3TELA 5AA2D 1S50A 3EN3A 4PQJA 1CB6A 5DVIA 3CRBA 3GBBA 4IO2A 4JWOA 2XXRA 4ZEIA 5CBRA 2HEUA 4MBPA 3RLFE 3R26A 3IO4A 4F2OA 1H43A 1H44A 2QRYA 4NF8B 1N04A 5HPQA 1B52A 5K2YA 4F19A 4P0IA 4GLIA 5ICTA 2XXIA 3FUZA 1JW5A 4JDFA 3FJ7A 3FASA 3K6WA 1HSJA 4R6YA 3H06B 3MVXA 1OLAA 1MPBA 2HAUA 3KEIA 3M3KA 3HCQA 3QAXA 1MG1A 1B9JA 4G77A 4PE5B 4ZECA 4F2QA 2H98A 3U92A 4GXSB 3HHGA 3IAZA 2OWSA 3V5AA 4NF5A 4QSEA 5I2NB 3TDJA 4FAJA 4EQ9A 2I49A 2XX7A 5TPAB 1FQAA 3SEYA 2Z8DA 2DWHA 1LBBA 2YPNA 4LA9A 2VD2A 4QSCA 4JBZA 4ZEBA 3V89B 1LGBC 1WDNA 1IQ7A 3CSGA 3K01A 2H4IA 1Q1KA 2O1LA 4QSDA 4RPNA 3H6WA 4O3CA 1MS7A 3T93B 3OSRA 2DWIA 1B1HA 1FQFA 2V84A 4YKIA 1OQGA 4G8NA 3VDFA 3MQ9A 3MBPA 3K6XA 3MW0A 1QUKA 2XXHA 1M5CA 3UGWA 1XC1A 1M5DA 2F7AA 2VHAA 5EHMA 1FTOA 3N94A 3KSJA 2UVJA 3C32A 4YU0A 1LFHA 1MY2A 3HPIA 3MVYA 3KN8A 5JEIA 1P1NA 4FEBA 4FE8A 2OBGA 2PVUA 5TP9A 1PB8A 1MDP1 4U21A 3ILUB 4R6HA 4I8CA 4G68A 2VP1A 2QS2A 3U93A 3O2AA 5F7VA 3OSQA 1RKMA 3K1PA 4IB2A 3VVEA 3SEUA 2ZYOA 3U8QA 1P1UA 3IB2A 4ELPA 3JYRA 1LBCA 1POY1 1USYH 3C34A 3T66A 4KQPA 1AIVA 2R6GE 1MXVA 4OEUA 3VLUA 3TCFA 3QIMA 3OO9A 2Q2AA 1B3FA 4HTGA 2RC7A 4G8HA 4XXUA 3S9NC 3ZKLA 3TPAA 1US4A 3JV9A 1Y3QA 2Y7KA 2REJA 3D4GA 3FVOA 3QK6A 4M4GA 1XVYA 1S7YA 1FQBA 2QS3A 5TU0A 4F1VA 4QFNA 2Q8JA 4E0WA 3PD8A 3T9VA 4TLLB 3PPRA 3SESA 4GRKA 4X1BA 2PX1A 4ND9A 4PFTA 1DTZA 3F11A 2RC8A 3K00A 3PPNA 4ECFA 4I62A 3TODA 3UN6A 3FD3A 1GV8A 3GLBA 3SEWA 4FORA 5KZTA 2FA7A 1XVXA 2R9JA 5AA2A 2I58A 1B4ZA 1MY4A 4YMAA 3TTNA 2OJTA 4U23A 4DXUA 4ZZAA 3ZKKA 2HXWA 2H9BA 3E4RA 2HAVA 4GWOA 3H4ZA 2YJPA 1N76A 2ALUA 3FVGA 3CFXA 2Y7PA 2H5YA 1POTA 4XKPA 4KYDA 1Y4TA 2QSXA 2ANJA 3H6TA 3FVKA 4XTCQ 4QFKA 4EQ7A 5CMMA 1HSLA 1AL3A 5H8QA 1NMUA 5FTHA 3PPQA 4FIMA 3L6GA 1II5A 3VXBA 1M5EA 1JEUA 3RQTA 4ZS9A 1UQWA 2QS4A 4F3GA 3M8UA 3MVWA 3D4CA 1SD3A 5LOMA 4ZZEA 5A5XA 1B7UA 2FNCA 3PD9A 3RGYA 4PFUA 3MC2A 4AQ4A 4KI0E 1IUDA 3QUFA 3E3KA 4K3FA 3O66A 2RKMA 3H3GA 2B3FA 1BIYA 2F78A 3U1OA 4X1DA 1FCKA 4U1ZA 2H99A 4G68C 4EQBA 1MQGA 1D4NA 4EXKA 3KSXA 3KJ7A 1N0TA 1IXHA 4IO3A 4P11A 3CIJA 2BJJX 1PEBA 4NF5B 1A54A 4XKRA 1Y20A 1OLCA 3THIA 1MM6A 4WEDA 2F8DA 1N7WA 4C1UA 3IOWA 5AA4A 1EH3A 2ESNA 4POWA 3QUJA 3FXUA 2NUVA 1A8EA 4F3BA 2ZXTA 3RNNA 1QKBA 3AXFA 4WXJA 3LR1A 4IGRA 3OEMA 3K0VA 3L6HA 2XD3A 3TTLA 3A3CA 3Q25A 4H8IA 1QW0A 2I4CA 4H0WA 3HSTA 1ZIUA 3OOAA 3RPWA 1USYE 1B46A 1TFDA 4IO6A 1NL5A 3UORA 3S9MC 1MRPA 3I5OA 1UIUA 5DYHA 3PUWE 3BFUA 2ZNUA 2DWAA 2XHDA 1DPEA 4TOZA 2I48A 2I0BA 3Q27A 1QJMA 1A8FA 1MH4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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