3TQLA

Structure of the amino acid abc transporter, periplasmic amino acid-binding protein from coxiella burnetii.
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
227
structure length
225
Chain Sequence
TDTIKFATEATYPPYVYMGGQVEGFGADIVKAVCKQMQAVCTISNQPWDSLIPSLKLGKFDALFGGMNITTARQKEVDFTDPYYTNSVSFIADKNTPLTLSKQGLKGKIIGVQGGTTFDSYLQDSFGNSITIQRYPSEEDALMDLTSGRVDAVVGDTPLIKQWLKQNGRREYVLIGKPVNDPNYFGKGVGIAVKKGNQALLLKLNKALAAIKANGVYAAIVQKYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural genomics for drug design against the pathogen Coxiella burnetii.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Coxiella burnetii
molecule keywords Arginine-binding protein
total genus 71
structure length 225
sequence length 227
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tqlA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tqlA02
3ILUB 1XT8A 2RC8A 1EU8A 3U94A 3S4UA 2DVZA 3ZSFA 1B0HA 5I84A 4OETA 4F39A 4G68B 3OO6A 4KFQA 1MQJA 1B5IA 3THIA 1SDXA 4HCWA 2DXRA 4KYEA 4H0WA 4KCDA 1WDNA 5AA4B 1ZKBA 1A54A 2XXXA 2D5WA 3IL1B 4ELRA 3LSXA 3PV0E 3C33A 1H76A 5I2NB 1Y3NA 4RPOA 1FCKA 4ECFA 4YAHX 3EHSA 4GWOA 1UQWA 1ZIUA 3IJOB 3MJNA 3W15C 1Y1MA 1LFIA 3U8QA 4FECA 4ZEBA 3CRBA 3AXFA 5CBSA 2ANJA 1N04A 4R75A 4I62A 1SQYA 2GHBA 3K01A 3EHUA 2VGQA 4BLAA 1Y1ZA 3RGYA 4IO2A 4XKRA 3PPOA 2QMWA 1T0KA 2Y7KA 5TP9A 1SBPA 3OEKA 3TKDA 2DVCA 5M2VA 5I58A 3G7WA 3OO8A 3G3KA 2O69A 1POY1 1XHYA 3CI8A 4Q8RA 2OZZA 3K1NA 3I3VA 3MAMA 4QRZA 2QJEA 2Y84A 3G3IA 5CM6A 3H6TA 4O3CA 2F7BA 4U22A 1LLSA 4BDOA 3USDA 2HEUA 1ZBMA 4XTCQ 2GHAA 4GL0A 3FV2A 2XXTA 1DSNA 4F22A 1OMPA 1TFDA 2DWAA 3SEUA 4NF5B 1S9TA 3HV1A 3O9PA 1MDP1 2QS2A 3M3LA 4PP0A 3IO6A 3IB1A 1N76A 3FXRA 3KN3A 3MVYA 1URSA 2X7PA 3H3GA 2P1SA 1SVXB 4JWXA 4FEBA 5AA2B 3IAZA 2AL4A 4OVJA 1LBCA 1Y3PA 4IO6A 2HCAA 1JW4A 1B3GA 3O2AA 4P0IA 3EN3A 2A5TA 3VV5A 3UN6A 3Q26A 5L9SA 5JTYA 4OERA 4YKKA 3VLUA 3FJGA 4YKIA 2Q89A 1FTOA 3WAFA 2F5XA 2UVHA 4YB6A 5I56B 1I6AA 3MP6A 5H8HA 5K2XA 2F35A 1MY1A 1Y20A 4MBPA 4OFOA 3WAEA 5L8DA 4R72A 4R6YA 1Y4TA 1II5A 1ZU0A 1XVYA 4NE4A 3IK6B 3KEIA 3B6TA 2ABHA 1P1OA 3FVGA 1NNPA 1L5TA 4R2FA 3GBBA 2Z8EA 4QSDA 5TP9B 4FE8A 1B46A 3CFLA 4OEVA 3TCFA 3OSQA 5F7VA 3UP9A 2RC9A 3S9NC 5AE4A 1MY3A 2F6GA 3JZJA 3CG3A 4OEUA 3RTFB 2I58A 1IEJA 3ECRA 3IJXB 2HZLA 4BDMA 1BLFA 3TTLA 3PUYE 1M5CA 4F1UA 4ZZAA 4BDQA 4H67A 3PPNA 1TWYA 4EQBA 2Q2CA 2XXWA 3RPWA 5B7DA 4R9FA 2F78A 2XXQA 3H4ZA 3HO7A 3V89B 4DXBA 3OELA 2A5SA 2ONKE 4IY5A 2X26A 1M5EA 4BDRA 3IX1A 3O28A 2OJTA 4YKPA 5K2YA 1DOTA 2H9BA 2Z22A 1NL5A 2ONSA 3DELB 1XVXA 3H06B 1JEVA 1VE4A 5LOMA 1SI0A 4LZ8A 3TDJA 3OSRA 3MVXA 1SW4A 3TTKA 2XX8A 1LAFE 3TMGA 4Z7EA 4MLQA 1B51A 4X1DA 1AOVA 4IO4A 1B2HA 1A8EA 2OBGA 5H8FA 3CFZA 3QSLA 1BTJA 2BJJX 4YU0A 4OXVA 3ODBA 2Y7PA 3O6GA 3FATA 1B0LA 1HSLA 4DCYA 4NTLA 3RT6B 3DP8A 3E13X 2XXRA 4DLDA 3FASA 1QW0A 3VE1B 1MQGA 3IR1A 2ZYKA 3MP8A 4OQOA 4WEPA 1I69A 1GVCA 2V84A 1IXGA 1EZPA 1LBBA 1RKMA 1MDQA 3G3FA 2ONRA 4DE8A 4H5GA 4EF2A 4N13A 3U72A 3FJMA 2HQ0A 1B58A 4X1BA 4I8CA 3E3KA 4N6PA 4IO7A 4TLMB 1Q35A 2NUVA 3FD3A 4NF8B 4I9DA 4QHQA 4YICA 4TOZA 3ZS6A 2HZKA 2H5YA 2F34A 3KJ7A 4ZDMA 1ZJLA 5JEIA 3UK4A 1MXZA 4NF6B 2F97A 2ALUA 1UTHA 3RQTA 3KJTA 1GTKA 2O51A 1UIUA 4KQPA 4H1XA 1MXUA 3FVOA 1AH5A 4N07A 4UA8A 1WODA 4QFKA 1LAGE 3DP6A 4OESA 1FQEA 4HW8A 3MW0A 2DWJA 3OO9A 1URDA 3TTRA 2NXOA 1JEUA 1MXXA 2XD3A 4ESXA 2Y7WA 5CRYA 4RYAA 1JQFA 1PB8A 2F36A 2AYSA 1JETA 3W9VA 4LZ7A 1FTKA 3JV9A 3QIMA 4LP2B 3MVWA 3MUQA 3RY3A 4Q0CA 1QULA 4ZE9A 4PETA 5JK4A 3RTWB 1KWHA 3V83A 5H8NA 2PYYA 1SW5A 5FHOA 5AA2D 3T9UA 1ATGA 3IB2A 4GF8A 2HAUA 1US4A 4F3SA 4K3FA 4ZECA 3SEYA 1Q1KA 5CBRA 4ELPA 1DTZA 3BFTA 1JNFA 3RT8A 1TT1A 4KCCA 3H03A 3ILTB 1OLCA 3K02A 3IOUA 1B5JA 1M5DA 3I5OA 1QVSA 1MH3A 2H99A 1PEBA 5F1QA 2RF1A 4KD5A 4GFRA 2FA7A 3KOSA 4JBZA 5KCJA 1H45A 4TQUQ 2LAOA 4MFIA 3QK6A 3KSJA 5EHMA 3TODA 3HHGA 3FIRA 1NKXA 1ZTYA 1CE2A 1MH4A 4ZS9A 3CIJA 2Q88A 2M8CA 4POWA 4U4SA 1IXCA 2QMXA 3TCGA 1HSEA 3QAXA 4EXLA 3SEWA 4IO3A 1FQBA 1TFAA 1F9BA 3HSTA 1A55A 1O7TA 3VVFA 3TCHA 2QPQA 3TELA 2DS9A 4XKPA 5IKBA 1LFHA 1B7ZA 5FTHA 5DEXA 1LB8A 3G3HA 3N5LA 4RY1A 2DE2A 3RLFE 3K6UA 4LA9A 2WKYA 1OVBA 3M3FA 4X48A 4C1TA 1N3WA 1URGA 2ZYNA 3TEPA 4QSCA 5H8QB 4OMBA 2I49A 2G93A 5I59A 5KZTA 4GXSB 4OFLA 4XIGQ 4G8HA 3MVZA 3T9HB 2F8DA 5KDTA 2FYIA 1P1NA 1R9QA 4H5FA 5HBCA 1WVJA 2XX7A 2ZXTA 3FUZA 5DVJA 3GXAA 5A5XA 3L6HA 1IITA 1S50A 2UYEA 2DE3A 5CC2A 4R2BA 3CR9A 5DTBA 5CMMA 4BDNA 1A40A 1UIVA 3FVKA 2OWTA 4KYSA 1MPCA 1JVXA 3T9XB 2Q9TA 1MXVA 2PT1A 1ZLQA 4U21A 1QKBA 5CI5A 4IB2A 2VP1A 3T22A 4ZEKA 1O64A 3OO7A 4IGTA 3GZGA 1FW0A 5I57A 3DM0A 1H44A 3MPKA 3BBRA 3EHTA 3T93B 1P1WA 3Q27A 1MQHA 1FTMA 5FHMA 4YMAA 2QS1A 3IOTA 3MZ1A 1B4ZA 1QKAA 4FEDA 2XX9A 3MC2A 3KZGA 1B05A 1B7HA 4DIGA 4POXA 1IZ1A 3KN8A 3R26A 1IXIA 1VSOA 3O66A 3C9HA 3QUFA 3SEVA 3UORA 2ZNTA 4QFNA 4ONYA 5I58B 3C36A 4U1ZA 4HS7A 2H98A 3HN0A 4JWYA 4OWDA 3U1OA 2E0SA 4YZZA 3V5AA 4JSOA 3TTNA 4MH5A 2IA4A 3D4GA 1VFEA 3U93A 1ELJA 4F1YA 1S7YA 3UIFA 3HCQA 3OD7A 4OYVA 1XS5A 1B32A 4ZZEA 4I1DA 3N26A 5BWJA 4WKMA 4U1OA 2PBWA 5ICQA 2HFBA 4MF3A 2D21A 4NMYA 2THIA 3PD9A 3S9MC 4G2ZA 4QSEA 2I3VA 1OQHA 3PPPA 1FQCA 1MRPA 3SDFA 1MPBA 1YTVA 4FAJA 2I4BA 2B65A 2XXHA 4KR5A 3BKIB 5EHSA 3LSFB 1N0TA 1FQFA 3VXBA 2YLNA 4G4PA 5I2KA 3QXMA 4BDLA 1JVYA 3QUJA 4YB7A 2ZNUA 4O3BA 4OENA 4NF4A 3C32A 4EUOA 1MXWA 4LQ2A 1MG1A 2ZMBA 1UTBA 5TPAA 1Z7NE 3TUSA 4C1UA 4GRKA 2V3QA 2A5TB 3A3CA 2AIXA 3PMXA 1B7UA 4P0GA 1PB7A 4ISUA 4G8NA 5JTYB 3EPEA 3MZBA 1A99A 3LSLA 3N6UA 4ESWA 2RKMA 2R71A 4PE5B 2I3WA 4ELOA 1NNFA 2V93A 3SETA 1B3LA 4AQ4A 4G68A 4YKJA 4OZ9A 2DQVA 3CSBA 5H8HB 1SW2A 3K00A 3R7XA 3Q29A 3FXQA 5FHNA 1EZOA 4GL8A 5CMBA 1OQGA 5AA4A 1Y3QA 1B3HA 2KLFA 4QF9A 3VXCA 1POTA 4RA1A 1IUDA 1LSTA 4THIA 5I2NA 2W7YA 2CZLA 3C4MA 4EDPA 1NNKA 3SKPA 2VD2A 2DOJA 1XC1A 3LSWA 3LC8A 2Z8DA 3C35A 4MLVA 5ISUA 3DLNA 2RCBA 1DMBA 3OEMA 1DTGA 3PUZE 4GVOA 3LUYA 4RNSA 1TXFA 3SEXA 4YB5A 2DYXA 4LONB 2H4IA 1B1HA 4M4GA 1SI1A 3T66A 2PMSA 4G8MA 1RYOA 3K2DA 3MWBA 3PUXE 1CB6A 1ZMGA 1Y4CA 4F19A 2UVIA 3H6VA 3JYRA 2XXPA 3FXUA 2DXYA 2V25A 5EYFA 3UA8A 1P99A 3KG2A 3S9EA 4JB7A 4C0RA 4NWDA 4GLIA 4GOTA 5DT6A 3VLVA 3Q28A 2AL5A 2OCUA 4OFJA 3RNNA 1AIVA 2O1MA 1USYE 1B40A 4F2OA 3IORA 3O6IA 3K6XA 3FJ7A 3OENA 1H43A 3OOAA 1D9YA 3CVGA 4JWOA 3K6WA 4H8IA 1LCTA 4HTGA 4GXAA 2B3BA 2UVJA 3KN7A 1SYIA 4KPTA 4NF5A 1HSJA 1LFGA 3MZ9A 1DPEA 3CG1A 1MQDA 5J1DA 3S9LC 1B5HA 2QRYA 4OHNA 4NWCA 1QJMA 5H8FB 1LGBC 1N84A 1PBQA 2XXVA 4E0WA 5AA2A 3VFJA 2ESNA 4RK2A 4EF1A 4PFTA 4O3AA 4H65A 3GBAA 2O7UA 3A09A 4DXUA 1FTLA 3PU5A 1M5BA 1VR5A 2REGA 4H6DA 4RJZA 1R9LA 3PMVA 5HM4B 1NH7A 3FZVA 1PB9A 4Q30B 2YJPA 1PBPA 2R6GE 2V3UA 5IAIA 3TQWA 4ZE8A 4XKNA 1LAHE 1NNTA 4ZEFA 1US5A 5I56A 3OXNA 1B4HA 2GFEA 1PDAA 3IB0A 5L9MA 4DDDA 1EZ9A 4RXLA 2I0CA 3O6HA 2P2AA 1N3XA 4R73A 3VLWA 4LATA 5BUUA 1D4NA 1R6ZA 3K0VA 1AMFA 4F29A 3QYTA 1B3EA 1LCFA 4WEDA 1UTHB 4EXKA 1JW1A 4JXIA 1XOCA 4JSDA 3SERA 2QSXA 5DVFA 3UGWA 4R9GA 1NH8A 3FV1A 1MM6A 1O63A 1B9JA 3B7DA 1LB9A 5CMCA 4RPNA 1MS7A 2XHDA 2D3IA 2RC7A 4GIZA 2XXIA 4E0XA 4LZ5A 4Z0IA 2QS4A 2GRVA 4KHZE 3PPQA 1B1XA 1B3FA 2NVUB 3S2VA 3R6UA 2ZYOA 3IOVA 2Q2AA 2DSFA 2QS3A 1NFTA 4UACA 1FQDA 3PGFA 3CFXA 4FORA 4XXUA 4DXCA 2VHAA 3G3JA 4QFLA 1A8FA 1AL3A 5DYHA 5CMKA 4U4XA 3H6UA 4R74A 4QFOA 2QL3A 1I6BA 2PVUA 5AA1A 1FTJA 2ZYMA 3K1MA 1FQAA 3N94A 5H8NB 1N7WA 2H25A 3FVNA 4IY6A 3B6QA 1P1QA 2UXAA 1MQIA 4FIMA 5ELVA 2B3FA 3KOTA 2NWJA 2OK2A 2I48A 3E9XA 4LQ5A 1QUIA 3BFUA 4R6HA 3K4UA 3N6TA 4IO5A 4GQOA 4AB6A 1SW1A 5KCJB 1YCJA 1J1NA 3VVDA 2REJA 1MM7A 3GLBA 1H3DA 4GD5A 2F6PA 2DWHA 1Y9UA 4F3GA 3MBPA 3SESA 4ZEIA 4G77A 2Z8FA 2O84X 2P0SA 4DZ1A 3H7MA 4Q5TA 3ONMA 4PFYA 5ITPA 1OIBA 1IQ7A 1OVTA 3IOWA 1YAEA 1OLAA 3RN8A 2YPNA 5ITOA 3IO4A 3TTMA 5DEXB 2RINA 3MPLA 3E4RA 3PD8A 3C31A 1MY4A 2XXYA 2X7QA 2I6EA 4NF8A 1D3KA 3LR1A 4G68C 4R6KA 4XKQA 4F3PA 5I59B 4NF6A 4LVQA 2VOZA 5KDTB 3OMBA 1DPPA 2DP8A 5A5XB 5HPQA 1SD3A 3TQLA 4F1VA 2G29A 4PFUA 2HAVA 4TLLB 1GV8A 1BP5A 4U23A 1QUKA 3PMWA 5L9OA 2UVGA 3HHFA 3TYHA 3C34A 2O1LA 5B70A 2Y7RA 3PUWE 1B52A 1IIWA 1Z7ME 2V3TA 3K1PA 4RK9A 1IXHA 4YMBA 1PC3A 3PPRA 1MY2A 5H8SA 1M5FA 1LAXA 2O68A 4H8JA 4M1VA 3L6GA 2F7CA 1A7LA 3ZKLA 4OTEA 2HXWA 5I57B 2ZNSA 5DVIA 2IEEA 1B6HA 4KYDA 2XXUA 4LUBA 3U92A 5ICTA 2UYFA 2VD3A 3TAJA 3V8XB 3P7IA 2Q8JA 4WXJA 3M8UA 4ELQA 4ZEDA 3O97A 2FNCA 4QFPA 1GGGA 4IGRA 3K6VA 4FATA 1N7XA 3CSGA 3Q25A 3ZKKA 3FGSA 3A3UA 3TPAA 1R1NA 2RCAA 1RYXA 3TFLA 4FJPA 1D9VA 2Y7IA 2DE4A 4ND9A 3PUVE 2OWSA 4HCYA 3KGCA 4DCXA 2O6AA 3MQ9A 2CMOA 3EF7A 3DP4A 3KSXA 1ANFA 3H6WA 1VFDA 2I4CA 4KI0E 4AB5A 2PX1A 1MY0A 3I6VA 4NEDA 2R9JA 4JDFA 1NMUA 1YPNA 3TZAA 3LBSA 1MXYA 3RUMA 1SYHA 2E1SA 4F18A 3MP1A 1EH3A 4PFWA 3KBRA 3W9WA 2NOOA 4F31B 1GR2A 5AA3A 1JW5A 3G3GA 1BKAA 2XD2A 4EQ9A 5FTIA 2O7IA 3VVEA 4X9TA 3EQ1A 3F11A 3T96B 3VDFA 2F7AA 5I2KB 1BIYA 2Z23A 2PT2A 1P1UA 3O29A 3HPIA 4U2RA 5TU0A 4NF4B 2GH9A 3M3KA 1MPDA 3KFMA 2OLBA 3B6WA 1UTBB 3T9VA 4L17A 3D4CA 5TPAB 5H8QA 1I6QA 4PQJA 1USYH 4EQ7A 2I0BA 1QUJA 2DWIA 4F3BA 4F2QA 4P11A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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