3TX9 | Genus

Total Genus 156

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	156
sequence length	399
structure length	399
Chain Sequence	SFVKDFKPQALGDTNLFKPIKIGNNELLHRAVIPPLTRMRALHPGNIPNRDWAVEYYTQRAQRPGTMIITEGAFISPQAGGYDNAPGVWSEEQMVEWTKIFNAIHEKKSFVWVQLWVLGWAAFPDNLARDGLRYDSASDNVFMDAEQEAKAKKANNPQHSLTKDEIKQYIKEYVQAAKNSIAAGADGVEIHSANGYLLNQFLDPHSNTRTDEYGGSIENRARFTLEVVDALVEAIGHEKVGLRLSPYGVFNSMSGGAETGIVAQYAYVAGELEKRAKAGKRLAFVHLVEPRVTNPFLTEGEGEYEGGSNDFVYSIWKGPVIRAGNFALHPEVVREEVKDKRTLIGYGRFFISNPDLVDRLEKGLPLNKYDRDTFYQMSAHGYIDYPTYEEALKLGWDKK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Studies of Enantioselectivity in OYE1 rcsb
molecule keywords	NADPH dehydrogenase 1
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Saccharomyces pastorianus
total genus	156
structure length	399
sequence length	399
ec nomenclature	ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date	2011-09-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3tx9A00

2DZPA 2NLIA 3NQ6A 3ZWSA 2CWNA 2OT1A 4N2YA 3L65A 3W1RA 3QC3A 2YW4A 1G4SA 4UFIA 3SGZA 1V7YA 2BX7A 4AWSA 3W85A 3W7JA 3H55A 3UWYA 4QISA 2A1YA 4AAJA 5HUOA 3HPXA 4NNBA 2WSYA 4N9EA 3M5VA 3EWZA 4O12A 3R5EA 5G1TA 5C54A 3NA8A 4JNMA 4JTLA 3O6DA 2Y7FA 1Q6LA 3TAOA 1VQTA 4JGDA 1VLWA 4TIMA 3PY2A 3W2LA 3S1VA 5G1YA 4A3UA 4EOUA 5HJLA 3G0SA 4FXRA 3G1YA 1Q45A 2QCLA 5A5WA 1YPFA 1PCWA 3IVTA 3W88A 1BTMA 1PS9A 3RMJA 2RHGA 3CEPA 1VGAA 4QNEA 4JXCA 2ZZ6A 1UASA 3S8HA 3SECA 1KA9F 2IQTA 1L9WA 2VXNA 1WA3A 4QSHA 1JUEA 1TPVA 3W7KA 3LOTA 4YL2A 4GUFA 2ZQ0A 4FNPA 2JKEA 2RKXA 4LU0A 2Y85A 1VLIA 4N02A 3THAA 1FCQA 1M7OA 3OVQA 1SW0A 3CC1A 4MY1A 1TRDA 3UWVA 2AGKA 2P0OA 4UTTC 3ZR4A 2DU2A 3A9IA 1SO5A 4O18A 1ME7A 4IOTA 4NNAA 4JYEA 4NXSA 3W83A 4FNUA 4OV4A 3P81A 5KZEA 4AHQA 1SW7A 4AXKA 1W31A 4MY8A 4M6QA 3C2VA 2Y61A 3W7OA 3UWZA 2FPYA 3LDVA 4UTTA 2YW3A 3UYCA 5AC6A 2QEZA 5LHEA 3LI1A 5L9FA 2J6XA 1OFEA 4G1KA 3BW3A 3NPVA 1TPWA 3T78A 1FWNA 2A85A 3W2UA 1KFCA 2NX3A 1H7XA 5AC7A 1FDZA 1FWSA 3MMTA 3A21A 3BW2A 5LZLA 3DFOA 1P0KA 1J5TA 3GVGA 3S5OA 1OFDA 1UJPA 1J4EA 1H7RA 3NQAA 2P1FA 3B0PA 3DZ1A 4GUHA 3M16A 2QJIA 4K8EA 4OGZA 3P7YA 4D2JA 1LRNA 3S9YA 4KWWA 4Y96A 5TIMA 4GRSA 1TQJA 4YCOA 4DBEA 2I1OA 3BG9A 3QPZA 3I6RA 4FXSA 1GYLA 3T44A 4ONVA 4O0ZA 4JTTA 4R7JA 3MBFA 1CX9A 1I8JA 3IVUA 1F76A 4Z1DA 1SO4A 2VFHA 3NQDA 2ZTJA 4MPQA 4GNJA 3G1VA 1WDWA 1DJNA 3RF9A 3VE7A 4UFLA 3HGOA 1QWGA 2D73A 3CTLA 1GVFA 1GTHA 3FS2A 3CLMA 4LS2A 1R30A 2QCCA 1YTEA 3RK8A 1QAPA 3QFEA 1PIIA 1WYIA 3I68A 4IGHA 5CPNA 3LXCA 3O6CA 1IXPA 1KFEA 3DFSA 4M6PA 1SSGA 4N9BA 5HWMA 1TTIA 1XM3A 3TXVA 1FBAA 3NAVA 3TAKA 1EIXA 1GTEA 4NQ1A 1TRIA 3BPWA 3DENA 4CNPA 4XTIA 2XN2A 3UWUA 1THFD 1SW3A 2WNZA 2CLHA 3MHUA 2R14A 4NNCA 3T7VA 2E6YA 4CNOA 4XQ6A 4XBSA 4O17A 1FY6A 2GVLA 4HHPA 4RKAA 5FF7A 1GG0A 1EP2A 3NL3A 5F1VA 2NZLA 1K03A 2XN0A 1FDJA 1SR9A 1XUZA 1T96A 3GYEA 3EXRA 4NJIA 2YPIA 5EBUA 4YXGA 4O1AA 3PVFA 4R33A 4ZQCA 5KSWA 1ML1A 1ZENA 2A7NA 3DI1A 3TKFA 4LRTA 3TXZA 3MI2A 3G1HA 3GKAA 3NL6A 4PFMA 1QOPA 1XXXA 5LNVA 5LSMA 5FF3A 1H5YA 1EEPA 3RNDA 3W1XA 2J24A 3LTSA 4JS3A 1LM1A 3I65A 2Z2UA 2QCEA 3NNTA 3GXTA 4JTIA 1GPWA 3W1LA 2VENA 2B7QA 4UC5A 3HG3A 1FCVA 5I3IA 4UMBA 5KINA 2V2CA 1UUOA 3HJZA 5K3VA 4MJZA 1LLWA 2YDAA 3W2JA 3B4UA 4O54A 5D2XA 5C5YA 1WQ5A 4R34A 2NXIA 4UUIA 5LGXA 3KRSA 4I9AA 1JUBA 1K8YA 4UTUA 3G8RA 5A8GA 1R2RA 2PC4A 1M7PA 1I2PA 1JCMP 2QUVA 4HNTA 1DQXA 1L6WA 2QCDA 3CM4A 4JYDA 1F5ZA 1YXCA 5BW6A 1XUUA 3GAKA 5D37A 4ZQOA 2J88A 1R46A 4MUZA 1LCOA 3L5LA 3E9AA 2ABAA 3UPWA 5DXYA 3STCA 2H8XA 3W2KA 2C14A 4Y6GA 1DORA 2CZFA 2H3BA 4LY8A 2AQWA 4NX0A 5U7SA 1G7VA 4IXHA 3LLFA 3C61A 4DF2A 1W5OA 3W74A 3G24A 1H50A 3M44A 2QCFA 3KHJA 1S5VA 2QF7A 3STFA 3HOJA 4Z08A 4O4VA 2ZBTA 2R91A 1OX6A 2PCQA 3O6YX 4Z0SA 3CU2A 4O53A 4AB4A 4HKPA 4B5NA 3A22A 3DHDA 4NUWA 1MEHA 1D9EA 3P5YA 5AC8A 3WFAA 2ZRZA 2VEPA 1IIGA 1FDYA 2FB2A 3DAQA 3M5YA 4ICNA 2CLIA 3N2XA 3UY8A 4JTGA 5I3GA 2O7QA 1GVRA 3QQ1A 1ALDA 1L2UA 4TMCA 1RD5A 2QKFA 3D0CA 1XBYA 2NUXA 3E02A 3GX9A 1KM4A 1VYRA 3LV6A 1T0OA 1Z42A 1GG1A 2ZA3A 2E6FA 1HO4A 1OYBA 1GT8A 4Q33A 1ONRA 3MBDA 3EWYA 1F05A 4FX8A 5LNWA 3MI6A 1VYPX 1H7PA 2YR1A 4IMCA 2I9EA 1PL9A 3G0XA 3QW4B 3W23A 4PCFA 1JVNA 5AHFA 4RZ6A 1Q6RA 1TPC1 4E2BA 4E2DA 1ME9A 1GVOA 5AFDA 2H8ZA 4WUIA 3B03A 5D02A 4MVAA 1K02A 1SFLA 4LOCA 2GJNA 4QJ1A 3DGRA 1KTBA 3GR8A 1TJPA 3TJLA 1OF6A 1SU5A 4IMDA 3LX9A 4NU7A 3W7RA 1JQXA 3W6YA 1JCLA 3VE9A 1QMLA 2C6QA 2F84A 1GVQA 2FTPA 3PBVA 3O8AA 4PH6A 1IXQA 5F4WA 1M6JA 1AK5A 2OZ0A 3TW6A 3W2NA 4LV4A 1BKSA 5LGZA 2Y7DA 5I3FA 1DV7A 2QCGA 5KZDA 4CCDA 4TX9A 1I2NA 1XBXA 4A22A 5ABTA 4AHPA 2V8ZA 4ZVJA 5HQEA 4IMEA 3DI0A 4FNQA 4YLWA 2ZDRA 1JRCA 3W7NA 1TIMA 3TFCA 1I45A 1TB3A 3LERA 5F4SA 4AF0A 3FYPA 2QR6A 5EA9A 2VEKA 1W5PA 1G6CA 1OYCA 5K4XA 5C55A 5LNSA 1YDNA 3TSDA 2CZEA 3NQGA 4AH7A 1K7EA 2TYSA 2YX0A 2ZZ1A 3Q58A 3PUDA 4LC8A 3BO9A 1YTDA 3DBPA 1IGSA 1RPXA 4FIQA 5C2XA 4YCPA 1YDVA 2V9DA 3NPUA 1FWTA 2CLKA 3B06A 3UZ5A 2DZTA 2ZZ2A 3MJYA 3OEXA 2E6DA 4PA8A 4CNNA 4UTIA 2B4GA 2Z6IA 5KZMA 1PVNA 3LBCA 1EWEA 5KMYA 4Q4KA 5D04C 1RQBA 3FYOA 1NSJA 2Q8ZA 2WJZA 3H54A 3QQ0A 1H7NA 4IQLA 3B05A 3DFTA 2WSQA 3CPRA 1GOXA 3IVSA 3W1MA 4AEOA 3C52A 4GWEA 2V81A 4MOZA 3FKRA 1QO2A 3UNDA 2HS6A 4LV9A 5EY5A 2OMAA 1YADA 4LS1A 3G1FA 3IIZA 3NZRA 4ZQRA 3TMQA 1Z44A 5DLCA 3TX9A 2PRLA 4Z1AA 3P84A 5DBUA 4GUJA 1G7UA 3G22A 1S5WA 2DZSA 1J2WA 4Z0JA 2GQ9A 4HPXA 4UTLA 1NF0A 1OF8A 3ABRA 8TIMA 1QPQA 5EKYA 1SZGA 3BG5A 1SZEA 3MWAA 3QSTA 1KBJA 3NQEA 1SUXA 3W07A 3TSMA 4DO4A 1OABA 3EXTA 1Q3NA 3NVTA 2QAFA 3M47A 3MP5A 4GE8A 2ABBA 2FPTA 2ZRVA 3QF0A 3S1XA 5K2ZA 1QFEA 4DO5A 2BSLA 3HBLA 3G0UA 3N73A 4K7VA 4FIRA 3EX1A 4TU1A 2E1DA 4RLIA 1SO6A 3N9SA 3NPWA 4W9TA 1ZFJA 2ATMA 3BLIA 4OQVA 2NWSA 3PBWA 4DF0A 1K8ZA 5G4EA 1H1YA 4IJBA 1SPQA 2ZFAA 1W5NA 3LHUA 3N19B 2VEIA 2X30A 4E0CA 3F03K 3W7MA 3E0IA 4FNRA 4WY0B 1WOBA 1X1OA 4A2RA 4OBTA 5AHEA 2Y63A 1KM0A 1YLVA 4EWND 1UBSA 3LHTA 3LRKA 2CFFA 4UCGA 5AYYA 3O16A 2EKCA 1XL9A 1TPEA 1FCUA 3PSVA 3NQVA 4PEKA 2VEMA 1T99A 1HG3A 3IIPA 1KFBA 2QDHA 2OX1A 4LW7A 5F2GA 2ISWA 4KFOA 3HB9A 5FF2A 3O1NA 5CPLA 2C18A 4OWGA 4GBUA 4LS0A 3C2FA 3GAYA 5G4WA 4CCCA 1MXSA 3HGJA 4MZ8A 3C2OA 4OU1A 2A6LA 3W1NA 3B04A 1KV5A 3SR7A 4L4LA 4AHOA 3NQMA 3LLDA 3JR2A 3LHYA 3IGXA 2BZNA 5FI8A 2VFIA 2ZZ3A 1EX5A 3HGSA 1WX0A 5D2VA 4FX7A 1C8VA 2ZA1A 4XKYA 3TW7A 3DFPA 3UWQA 1OX4B 3SFKA 2C16A 4O52A 3GZ3A 3NQFA 4NXKA 4OHQA 3I7SA 1VCGA 4RX0A 1WOAA 4Y9AA 3LV5A 1EP1A 1MEIA 1GZGA 3BLFA 1TPH1 2JBMA 4O14A 4LRSA 3ZS4A 2A0NA 4XTDA 1YTKA 3LI0A 1H7OA 3W1UA 1YYAA 1SSDA 1TYGA 2VFDA 1I4NA 3LHVA 1FWWA 4AWUA 1ICQA 2W0UA 1OYAA 5AN7A 3C4UA 3NQ8A 2A2IA 2G96A 3QM3A 5CPOA 5H91A 2BLEA 5EYWA 3VCRA 5AHMA 3W73A 2CLMA 2DZWA 2FFCA 3Q37A 1TO3A 4N9DA 3W7EA 1ICSA 1SO3A 3WJYA 1PHWA 4EVZA 3PSWA 3P82A 3NL2A 3KVJA 2RDUA 1LYXA 1EUNA 1HL2A 3GDKA 5I3JA 3NG3A 1F6PA 1ZCOA 1DKWA 1WXJA 3EX3A 3NR0A 4FB7A 3TNOA 4KFPA 4O1DA 1FWRA 4MYXA 3TC7A 4MIMA 1DOSA 4YMZA 3E49A 3STEA 4BF9A 2CLLA 4RK8A 1WBHA 1B9BA 3IGSA 3EEGA 2Q8LA 3TJXA 5C6MA 5F2LA 4M7TA 1KFLA 4H3DA 1F74A 1TTQA 4FF7A 1JJKA 3M43A 2F7FA 1EP3A 1FCBA 1JCXA 1KM3A 4O10A 2P10A 2RH9A 2NUWA 2ISSA 4JTKA 3S42A 1C29A 3TV8A 3DXIA 4LNYA 4IX2A 3LTYA 3OBKA 1TPUA 3OG3A 5FF0A 1QPNA 4S1FA 3SGUA 5K4ZA 3FLUA 3PB2A 2B7NA 2NWRA 3GK0A 3GXNA 3IIXA 4JIQA 4JTEA 3LBMA 1DL3A 4H6KA 5HWJA 3R8RA 1NFBA 3CHVA 5DCEA 3W2MA 3RLVA 2E5CA 3EXSA 5EPDA 3WK3A 3CWNA 2NXGA 3PWAA 4K37A 4UR8A 4TR9A 4DF1A 3CIWA 1TV8A 4XWUA 3LHZA 4ZMGA 4LUJA 3FOKA 4A2SA 4Z1BA 2Z1BA 2ZCGA 4I7WA 1P0NA 3VFLA 3LB0A 3A24A 1HFBA 4CCEA 3N14A 4K38A 3MHGA 4N6FA 3H53A 4O19A 3W7IA 1MEWA 2WO5A 1K8XA 4MJMA 3LTPA 3ATZA 2CU0A 3BGGA 4RXFA 1KM5A 1QPRA 3L68A 1ZALA 3KRZA 2W6RA 2V0TA 2OJPA 6ALDA 3KOFA 2R94A 3QYQA 4PL1A 3EWBX 2Y7GA 1JULA 4O50A 1RVGA 3G18A 4BK9A 3LRMA 3MYPA 4BI5A 4HPJA 3AJXA 1W3NA 4A21A 4RZ5A 3U2OA 3GDLA 5D03A 3FFSA 1JCYA 2C0AA 4LWWA 1SZNA 5TQLA 3ATYA 4LVBA 1H60A 1IIHA 4IXXA 4LC6A 3TQ0A 3OVRA 4X3ZA 3MI3A 4O28A 4ZQNA 4WOQA 4Q32A 4HNNA 3W7QA 4MY9A 4ZQPA 1AG1O 3KVKA 4UIOA 4I7UA 3S6DA 3MW7A 1K7FA 4K6AA 3HF3A 1XI3A 2YGYA 3IV3A 1LDCA 1RV8A 2WQPA 4Y90A 5CKSA 1N7KA 2PURA 4RJEA 4M5PA 3TSBA 4ADUA 2E77A 1Y0EA 2RDTA 4JTUA 3LGEA 1XC4A 3KRUA 4AWTA 3WK0A 4BFAA 1OFRA 1XBZA 3PAJA 3C2RA 4IX0A 1O5KA 1FXQA 3P8JA 5FEZA 4MFEA 3HMJG 1XCFA 3EKZA 2E5BA 5AHNA 1TQXA 2TPSA 1ZAIA 1X8FA 1GEQA 3SI9A 3HPZA 1QO5A 3T40A 3G1XA 2YZRA 2TRSA 4DQWA 4JYFA 1G67A 1O60A 1AL7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1PEZ A;  4KQN A;  4LY4 A;  1QPQ A;  1V6U A;  1F8I A;  1FWE C;  1Z89 A;  3E38 A;  3ABR A;  3VNI A;  4C6O A;  1UZ4 A;  3VKD A;  2P0I A;  1KBJ A;  1SUX A;  4FZI A;  3TSM A;  3HMC A;  4XZN X;  2L5H A;  3M47 A;  2ZRV A;  3S1X A;  1QFE A;  1JGM A;  4FIR A;  4Q7N A;  4RPQ A;  1ZP4 A;  3AHY A;  3UG4 A;  1IWB A;  4QGC A;  3H22 A;  3PBW A;  1UPP A;  4JKM A;  2ZFA A;  1W5N A;  3LHU A;  2X30 A;  5F7U A;  4R27 A;  3W7M A;  4WY0 B;  1WOB A;  1X1O A;  4HU4 A;  1LL4 A;  3AWN A;  3MSG A;  1YLV A;  4P7O A;  3UR2 A;  2CFF A;  3UG3 A;  1IHI A;  1XL9 A;  2ZKM X;  4C65 A;  1NP0 A;  2YL8 A;  1PZ1 A;  3CAW A;  3NQV A;  1XPY A;  1HG3 A;  4W7W A;  1KFB A;  4KFO A;  5B80 A;  1O66 A;  3EDD A;  3HB9 A;  5FF2 A;  3LMZ A;  3E6E A;  4B4H A;  3HGJ A;  4NZC A;  3FJ4 A;  4P7L A;  1US2 A;  3SR7 A;  3W0K A;  3W82 A;  3LLD A;  3FAW A;  1EX5 A;  5D2V A;  3UG8 A;  1C8V A;  4MNK A;  2IS7 A;  4XKY A;  3SFK A;  2C16 A;  2PDN A;  3GZ3 A;  2VZS A;  5JBF A;  4RX0 A;  2H9A A;  3EMC A;  4Y9A A;  4TVU A;  3GHU A;  2X1I A;  1F4H A;  1V3L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3TX9A

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