3TXFA

Hewl co-crystallization with cisplatin in dmso media with glycerol as the cryoprotectant
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title Experience with exchange and archiving of raw data: comparison of data from two diffractometers and four software packages on a series of lysozyme crystals.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3txfA00
1DXJA 4XJFA 1LZSA 1UICA 5F16A 5KXZA 2Q0MX 1GE0A 3AW7A 4DYGA 1OUEA 3WMKA 4CJ2A 1GF6A 3W6CA 1KIPC 4RLMA 3GXKA 3WUMA 4GCEA 1GF3A 2EKSC 2Y8PA 2BQGA 4YOPA 2C8OA 4P2EA 3OJPA 8LYZA 5KY1A 1LSAA 1BHZA 2BQMA 1IC7Y 3A91A 4H9IA 2CJLA 1LYSA 4TTDA 4GN4A 1IR7A 2D91A 4LT3A 3TXHA 2MEEA 2VB1A 1UIGA 5LA5A 1XGQC 1TEWA 2ZYPA 4OWBA 4LYZA 4NHPA 3A67Y 4NGVA 1GXV2 2CWIA 154LA 1LSFA 1UIDA 1JIYA 4TX7A 1VDQA 4G4HA 2HUBA 1GAZA 3A3RX 3N9AA 2XJWA 4NGWA 1AT6A 1QQYA 5B07A 2DQIY 4N5RA 4NFVA 1EL1A 1LSDA 4DDCA 1JJ3A 1VFBC 4B1AA 2HECA 3BKVA 1HEOA 4AGAA 1RJCB 2Z19A 4N1EI 4NSGA 5F9UA 5KXKA 1UACY 4TSCA 1LMCA 4WO6A 4DDBA 5KJ9A 4DD1A 2FYCA 3A8ZA 4YENA 1GF5A 2X0AA 4HTNA 5A3ZA 5LINA 4O34A 1QDTA 1REYA 4H8XA 2DQFC 5LXWA 4NGIA 4DD9A 1Z55A 133LA 3W6EA 1IC5Y 1IC4Y 1KXWA 4C3WA 2CDSA 1GFVA 194LA 1YIKA 1NQIA 2FBDA 1F10A 3F6ZA 4GN3A 1LYZA 4WLDA 4UWNA 135LA 1OUGA 4J1BA 4B49A 4ET9A 2A7DA 4PJ2C 1CNSA 4G4CA 3B6LA 1TDYA 3LZ2A 1GF7A 2Z18A 2ZILA 1BB5A 1LZBA 4H9FA 3AZ7A 3WL2A 1GEZA 4DD2A 5FCPA 4FJRA 3EXDA 2BQDA 4IATA 3CT0A 1NBZC 1HSXA 4NY5A 1GFEA 1G7HC 4CFPA 1LHKA 4H92A 1YANA 1LMTA 3A96A 4C5FA 1FKQA 3D3DA 4WG1A 4I8SA 1QUTA 1XEKA 2BQFA 4NSJA 2H5ZA 3A34A 1IP2A 2HTXA 3IJVA 4EMNA 1EQEA 4J1AA 5KXNA 1REMA 1GF4A 1BB7A 2G4PA 1GE3A 3WU9A 1LSBA 2DQGY 1G7LC 2HEDA 1AZFA 1JUGA 1XGTC 3P4ZA 3TXFA 1B7MA 1JHLA 3A6CY 1QSAA 3TXJA 3WH1A 3WW5A 1UCOA 4AXTA 4OWCA 2MEIA 3CB7A 2DQAA 4Z3MA 2IHLA 1GF0A 1GFJA 1UUZC 4GLAA 4BADA 1HF4A 1IO5A 5B1FA 1UIBA 4B0DA 1IY3A 2H9KA 4M6DA 1UBZA 2HEAA 4GCCA 5IELA 1GBSA 3M3UA 2HEEA 1B7QA 5KXRA 3FE0A 5IHGA 4GCDA 5C6IA 1IP5A 3WPJA 1LSYA 1IWYA 1WQPA 1DI3A 4HV2A 2Z39A 1OQMA 3A93A 4H9EA 1LPIA 1ZVHL 2G4NA 2ZQ3A 4RW2A 1LZRA 1LZCA 1J1PY 3WXUA 2ZIKA 4H93A 4LT2A 4NGOA 1YKXX 1WTMA 4KPMA 1FLWA 4DT3A 1GE2A 2XBRA 1H87A 1AM7A 1WVVA 1YAPA 2BQCA 3CSQA 4J7VA 3AGIA 1JTOL 4HJYA 5LYTA 2B5ZA 3ZEKA 4TSBA 1GF8A 5LVHA 1QSWA 5KXMA 2ZNXY 1A2YC 1DKJA 1LZGA 1CKFA 2YBLA 5LAGA 3ZVQA 1GE1A 1HENA 1LJEA 5LVGA 4WM3A 4XENA 3RNXA 5KXOA 2FYDA 1JEFA 1GBWA 1QDRA 4WMGA 2CGIA 1JPOA 2AUBA 3EO5A 4NWEA 4H91A 1OUIA 1RFPA 5I5QA 2YBHA 5D5FA 4II8A 4Z41A 4HTQA 4IASA 3WULA 4WG7A 1GHLA 4WM4A 1H6MA 1FN5A 4H9HA 2D4IA 1XFPL 1YL0X 1IEEA 1LKRA 3A6BY 1IOCA 4KXIA 3W6FA 1HNLA 2HU1A 1LZAA 5APEA 1YKYX 1QTKA 5ILFA 1ZV5L 3MGWA 4I0CA 3LHMA 3W3EA 4PPOA 5I54A 4MCKA 2FBBA 5DM9A 5L3IA 1CKCA 1JSFA 1W6ZA 4XJHA 2BQHA 1HFXA 4HJZA 1XGUC 3T36A 1INUA 1UA6Y 1GXXA 3EBAB 3TMVA 4ET8A 2MECA 5B05A 1B7LA 1LMOA 1UIHA 1HSWA 1C08C 3A3QA 1EQ5A 1YAOA 3A92A 1NDMC 1LHMA 1GFTA 1LSGA 4DDAA 1NMMA 4ANRA 1JITA 1GFRA 4CFOA 4ETCA 3ATOA 1HMLA 4GCFA 4GLVA 3RT5X 3G3AB 5FDJA 1LKSA 4DC4A 5I4YA 1GB5A 3HBEX 5DN5A 4XYYA 3A94A 4DWXA 1GEVA 5HNCA 1IWUA 1LZ5A 1XSFA 4A7DA 1LZNA 4DD7A 1JJ1A 2W1MA 1J1OY 1IWXA 4HP0A 4NHQA 2DQEY 1WQQA 6LYZA 1B9OA 1HFZA 1JSEA 2LZ2A 1UIFA 4NHSA 4NSIA 2W1YA 4GN5C 3WUNA 3WU7A 3KAMA 3WVXA 5C6LA 2Z12A 5B06A 2MEGA 2F30A 5FELA 4B4EA 1NBYC 4OOTA 4QY9A 3CT1A 5HLLA 1AT5A 5KXXA 1BVXA 1LAAA 1YILA 1B7NA 2DKVA 2ZWBA 4N0JA 4UWUA 1SLYA 2DBTA 5APCA 5LIOA 3TMUA 4WLTA 2IFFY 1GBOA 5I53A 4IJ4A 5DN4A 1LOZA 4BAFA 4LZTA 4QEQA 4PHIA 1O23A 4BS7A 3M18B 4WOAA 3AYQA 1ALCA 1B7SA 1GB3A 2I25L 3WU8A 1GBXA 1OUJA 2MEFA 4LYBA 1YKZX 2DQJY 3TMXA 4XJDA 1IR8A 2F4AA 1VAUA 1LSPA 4H9BA 4PGJB 1VDPA 5ILCA 4LYMA 2BQAA 4WM5A 1WQNA 3P68A 4LYOA 3TXEA 1LMPA 1A4VA 2BAAA 3RZ4A 4HPIA 4L41A 3N9EA 4R0FA 4YM8A 1GB6A 4XJGA 6LYTA 3TXDA 3CSRA 3ZVQB 1I20A 1BWIA 1DPXA 2DQCY 4NGYA 2BQOA 2WARA 2YBIA 3N9CA 3QNGA 1REZA 4NGKA 5HNLA 2D4JA 1HEWA 2BLXA 2LZTA 5L9JA 3LN2A 1BB4A 1LSMA 2MEDA 4RLNA 1WTNA 3HBHA 4NHIA 2BQLA 1DQJC 1GE4A 3QY4A 1B7OA 2PC2A 1GD6A 1LZ1A 3WW6A 1IP1A 1B7PA 4CHXA 5B59A 1NHEA 1ZMYL 5F81A 1TAYA 3IJUA 1CJ9A 1C45A 1LJFA 2W1LA 1VATA 1YQVY 2A7FA 4H90A 1HHLA 2BQIA 3ULRA 1BQLY 2MEHA 1LZTA 4NG8A 4G4BA 1YL1X 2BQEA 5LVJA 1B5UA 3WYHA 1F6RA 4KL7A 1LJGA 1GFGA 4YF2A 3QE8A 1IWWA 1FBIX 4PRUA 4NIJA 4UWVA 1B0DA 4XJBA 1G7IC 5HMJA 1I1ZA 4B4IA 1YAMA 5F14A 2Z38A 3W6BA 1OUBA 4RW1A 4DD0A 4J0LA 4NEBA 1G7JC 1IP6A 1QUSA 3RU5A 4TWSA 3K3TA 3TXIA 1LYOA 207LA 2YBJA 1NDGC 3J4GA 4WM6A 3CSZA 1CJ7A 4NGZA 3HBDA 1LMQA 3AB6A 2YBNA 3G3BB 1LJIA 1I56A 2I26L 5FHWA 1KIRC 2YBMA 4NGLA 4OOOA 5FSTA 1G7MC 1C7PA 1FLUA 2ZNWY 1E8LA 5AMYA 4GCBA 2NWDX 4XADA 5J7CA 4ZFPA 1C43A 5KKIA 4OW1A 1J1XY 4H9AA 3AJNA 1B5YA 3LYZA 5LYZA 2GV0A 1IOSA 1EQ4A 1JWRA 1QTEA 1V7SA 3E3DA 4CGEA 1V7TA 4ZIXA 1LJHA 2D6BA 2YSSC 4OWAA 1CKDA 1T6VL 1KIQC 1JTPL 3EMSA 2EPEA 1PS5A 3T6UA 1YAQA 4H9CA 5LAFA 5APFA 1LTMA 1IR9A 1JKCA 4H1PA 1GB2A 1WVUA 2D4KA 2N5ZA 1RE2A 3LYTA 4WM2A 4HPEA 1OUDA 1LHIA 1XGPC 2EQLA 1HEMA 3AGHA 3LYOA 4N8ZA 1LZ9A 5HQ1A 1PZYA 4N1CC 1LZ8A 4H94A 1KXXA 4H8ZA 1IVMA 1OUFA 5B1GA 1B5XA 3P64A 5JENB 2MEAA 1SQ2L 1HMKA 3B0IA 1IORA 1VDTA 3TXGA 2XTHA 193LA 3VWOA 1D0KA 2F2NA 4ETBA 1GFAA 3OK0A 1GB7A 3TXBA 4W94A 1LZ4A 1JTTL 1P2CC 1T3PA 1IWZA 3TXKA 4EOFA 4ML7A 4U3XB 3WXTA 4ETAA 4R6CA 1JKDA 4HSFA 7LYZA 5F9XA 1B5WA 1LJ3A 1WQRA 1NWGA 1TBYA 3A90A 2ZIJA 4WO9A 4DD3A 2H9JA 1BWJA 1JJ0A 9LYZA 1WQOA 2BQBA 4LT1A 4TUNA 1JISA 2YDGA 1WQMA 1CJ6A 1B5VA 1ZVYB 1REXA 3W6AA 3AZ6A 4E3UA 4LYTA 4LGKA 1LCNA 5LVIA 5I4XA 1GB9A 3B0OA 1DZBX 1HFYA 5K7OA 1CKHA 2BQJA 3BKHA 5DLAA 208LA 5E9RA 1LJKA 4G9SA 3P66A 2DQDY 2YVBA 1GDWA 4ETEA 5LYMA 2RSCA 1B5ZA 1OUCA 1OUHA 5E4PA 1F0WA 2HEBA 4WLYA 1C46A 1IX0A 1D0MA 1QIOA 2HU3A 3B72A 1GBYA 4G49A 3W6DA 1IIZA 132LA 1HERA 1MLCE 3CT5A 4LFXA 4HV1A 4WM1A 5KXYA 5LVKA 1CKGA 1IWVA 1CJ8A 1FDLY 1VDSA 1LHLA 1LZDA 2MEBA 5KXSA 3HFMY 1YROA 2F4GA 3J6KA 1OP9B 1DKKA 3IWRA 4RDSA 3B0KA 1LZ6A 2EIZC 1GFHA 4WL6A 4ETDA 5HMVA 1XGRC 3AW6A 5I4WA 1RI8B 1LSEA 3WUAA 4H8YA 1LJJA 5DL9A 2DQHY 1DI4A 3CQLA 2LYMA 1NKHA 4MSTA 1N4FA 3D9AC 1BB3A 1DPWA 4FDYA 2C8PA 4M4OA 1LJNA 1GB8A 5C6JA 4ZEEA 1FLYA 1IP3A 1D6PA 5D5CA 1FLQA 5L3HA 1LSZA 3LYMA 4Z46A 5KXLA 1HELA 1GFUA 1W08A 4XN6A 2LYOA 1KXYA 1RCMA 1F6SA 4WL7A 3P65A 1LZEA 4N9RA 4LT0A 4OWHA 1LSCA 1BWHA 1XEIA 2Z2EA 4XJIA 2I6ZA 1D9UA 5FEKA 1IOQA 2XBSA 1GDXA 5KXPA 4LFPA 4QDNA 1OUAA 1HEPA 2LYZA 4X3BA 3A95A 5KKJA 2Z2FA 5LA8A 3WPKA 5IDDA 4HTKA 3RW8A 3SP3A 1IOTA 1GF9A 1LJ4A 1LYYA 1LMNA 2Z37A 1HEQA 4LYCA 5M1YA 1FKVA 1GWDA 1MELL 4QGZA 2BQKA 2G4QA 2W1XA 2BQNA 4MR1A 5II3A 5KXTA 3FI7A 1IP7A 4NWHA 1UIAA 3WPLA 5APDA 2BPUA 2HEFA 4NGJA 5KXWA 1D0LA 2BLYA 4W96A 1AKIA 1IY4A 4PRQA 1GFKA 4Z98A 5EBHA 3GXRA 1NF5A 3AZ4A 4KT3A 2ZQ4A 1GPQC 2ZYCA 4YEOA 1XEJA 4NSHA 5T3FA 3WVYA 1LMAA 1GB0A 4D9ZA 4WLXA 4BAPA 1B7RA 5A3EA 153LA 1UC0A 4OWEA 4YEMA 1IP4A 1HC0A 1BB6A 2LHMA 3ATNA 1GBZA 1LHHA 4NG1A 1TCYA 3LZTA 1C10A 1GAYA 4HJVA 134LA 3TMWA 1LZYA 3AGGG 1D6QA 1JKBA 4B4JA 1LHJA 1B2KA 4NHTA 1BGIA 1VEDA 1DI5A 1UIEA 1JKAA 1BVKC 1IWTA 1LSNA 3AZ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D2WA 1DXJA 230LA 1G0KA 1LZSA 1L24A 4DYGA 3WMKA 2OTYX 3C7YA 253LA 1D2YA 3GXKA 4RLMA 2EKSC 3HDEA 2F47A 1PQMA 8LYZA 1QS9A 1L68A 1BHZA 2BQMA 1IC7Y 1QSBA 1L87A 5LA5A 1L45A 4NGVA 2B6ZA 247LA 3C8QA 4TX7A 4NGWA 2XJWA 1QQYA 2DQIY 102LA 1CV1A 1LSDA 4N5RA 4DDCA 1VFBC 1LYEA 4DKLA 4AGAA 5F9UA 1L0JA 5KXKA 4DD1A 2FYCA 2LC9A 1QT5A 5LINA 3LZMA 3JR6A 1L70A 1L86A 2DQFC 5ILFA 3W6EA 1IC4Y 2CDSA 1GFVA 1YIKA 3DKEX 1F10A 1LYZA 1OUGA 4J1BA 3HDFA 2Z18A 1BB5A 3AZ7A 1L13A 2BQDA 1GFEA 118LA 1LHKA 103LA 1LMTA 3A96A 4C5FA 1FKQA 4I8SA 2BQFA 3DN8A 2QB0B 1L67A 1IP2A 3IJVA 2LZMA 4EMNA 1AZFA 1L76A 3P4ZA 3WW5A 1B7MA 1JHLA 3TXJA 3QAKA 1UCOA 4AXTA 4OWCA 1C60A 2IHLA 3GUPA 1HF4A 1G06A 1UBZA 2HEAA 191LA 1GBSA 2HEEA 1WQPA 1IWYA 4HV2A 1G0MA 2Z39A 3A93A 1LPIA 1XEPA 3GUKA 1LZCA 1L56A 1YKXX 4IAPA 4KPMA 201LA 1YAPA 3HH3A 4HJYA 2YBLA 2OU8A 1GE1A 1HENA 3C80A 4XENA 3RNXA 5KXOA 2FYDA 2AUBA 5I5QA 4H91A 1RFPA 2F2QA 2YBHA 4IASA 1H6MA 1OVHA 1YL0X 3A6BY 3W6FA 1C64A 5APEA 4PPOA 4XJHA 1W6ZA 3TMVA 4ET8A 1L77A 3A92A 1GFTA 1LSGA 1D9WA 4GCFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1DXJ A;  4XJF A;  1LZS A;  1UIC A;  5F16 A;  5KXZ A;  2Q0M X;  1GE0 A;  3AW7 A;  4DYG A;  1OUE A;  3WMK A;  4CJ2 A;  1GF6 A;  3W6C A;  1KIP C;  4RLM A;  3GXK A;  3WUM A;  4GCE A;  1GF3 A;  2EKS C;  2Y8P A;  2BQG A;  4YOP A;  2C8O A;  4P2E A;  3OJP A;  8LYZ A;  5KY1 A;  1LSA A;  1BHZ A;  2BQM A;  1IC7 Y;  3A91 A;  4H9I A;  2CJL A;  1LYS A;  4TTD A;  4GN4 A;  1IR7 A;  2D91 A;  4LT3 A;  3TXH A;  2MEE A;  2VB1 A;  1UIG A;  5LA5 A;  1XGQ C;  1TEW A;  2ZYP A;  4OWB A;  4LYZ A;  4NHP A;  3A67 Y;  4NGV A;  1GXV 2;  2CWI A;  154L A;  1LSF A;  1UID A;  1JIY A;  4TX7 A;  1VDQ A;  4G4H A;  2HUB A;  1GAZ A;  3A3R X;  3N9A A;  2XJW A;  4NGW A;  1AT6 A;  1QQY A;  5B07 A;  2DQI Y;  4N5R A;  4NFV A;  1EL1 A;  1LSD A;  4DDC A;  1JJ3 A;  1VFB C;  4B1A A;  2HEC A;  3BKV A;  1HEO A;  4AGA A;  1RJC B;  2Z19 A;  4N1E I;  4NSG A;  5F9U A;  5KXK A;  1UAC Y;  4TSC A;  1LMC A;  4WO6 A;  4DDB A;  5KJ9 A;  4DD1 A;  2FYC A;  3A8Z A;  4YEN A;  1GF5 A;  2X0A A;  4HTN A;  5A3Z A;  5LIN A;  4O34 A;  1QDT A;  1REY A;  4H8X A; 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 1GB8 A;  5C6J A;  4ZEE A;  1FLY A;  1IP3 A;  1D6P A;  5D5C A;  1FLQ A;  5L3H A;  1LSZ A;  3LYM A;  4Z46 A;  5KXL A;  1HEL A;  1GFU A;  1W08 A;  4XN6 A;  2LYO A;  1KXY A;  1RCM A;  1F6S A;  4WL7 A;  3P65 A;  1LZE A;  4N9R A;  4LT0 A;  4OWH A;  1LSC A;  1BWH A;  1XEI A;  2Z2E A;  4XJI A;  2I6Z A;  1D9U A;  5FEK A;  1IOQ A;  2XBS A;  1GDX A;  5KXP A;  4LFP A;  4QDN A;  1OUA A;  1HEP A;  2LYZ A;  4X3B A;  3A95 A;  5KKJ A;  2Z2F A;  5LA8 A;  3WPK A;  5IDD A;  4HTK A;  3RW8 A;  3SP3 A;  1IOT A;  1GF9 A;  1LJ4 A;  1LYY A;  1LMN A;  2Z37 A;  1HEQ A;  4LYC A;  5M1Y A;  1FKV A;  1GWD A;  1MEL L;  4QGZ A;  2BQK A;  2G4Q A;  2W1X A;  2BQN A;  4MR1 A;  5II3 A;  5KXT A;  3FI7 A;  1IP7 A;  4NWH A;  1UIA A;  3WPL A;  5APD A;  2BPU A;  2HEF A;  4NGJ A;  5KXW A;  1D0L A;  2BLY A;  4W96 A;  1AKI A;  1IY4 A;  4PRQ A;  1GFK A;  4Z98 A;  5EBH A;  3GXR A;  1NF5 A;  3AZ4 A;  4KT3 A;  2ZQ4 A;  1GPQ C;  2ZYC A;  4YEO A;  1XEJ A;  4NSH A;  5T3F A;  3WVY A;  1LMA A;  1GB0 A;  4D9Z A;  4WLX A;  4BAP A;  1B7R A;  5A3E A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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