3TXGA

Hewl co-crystallization with cisplatin in dmso media with paratone as the cryoprotectant
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title Experience with exchange and archiving of raw data: comparison of data from two diffractometers and four software packages on a series of lysozyme crystals.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 44
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3txgA00
1LZDA 1G7HC 5KXKA 1VFBC 3WMKA 5LYTA 2DKVA 1UBZA 1FBIX 1F6RA 1GBSA 5KKJA 3OK0A 4NHPA 1UIFA 2N5ZA 1O23A 4N9RA 4H9EA 1VAUA 2YBNA 3WPKA 1LSBA 3M3UA 4ETAA 1JTPL 5KXSA 4N0JA 4NSGA 2Z2FA 4NHSA 1LJKA 1SLYA 4H9IA 1OUEA 3A34A 3LN2A 5E9RA 1GB6A 1GF3A 1JUGA 4NGLA 1GDWA 1IP2A 4WM4A 2BQDA 133LA 2YDGA 1GAZA 1DI4A 1HSXA 2G4NA 1BB4A 5HQ1A 1CKGA 1LSPA 2ZNWY 2XBRA 1GF7A 5HMJA 1IP6A 1D0LA 1GHLA 1LTMA 1XGRC 1BB5A 1GFKA 1HEQA 1YKYX 1DQJC 2C8OA 3ZVQB 1QTKA 1HMKA 3M18B 2B5ZA 4U3XB 4NFVA 1IC7Y 1LZRA 3WULA 4LYZA 3A92A 5FEKA 1DI5A 1W6ZA 1GFTA 1V7SA 3AW7A 5KKIA 1B5VA 1BWJA 1LMQA 1YROA 1FN5A 4WO9A 3ULRA 1GB9A 3MGWA 1LZYA 1FLUA 5APDA 1LSNA 4Z3MA 3AJNA 4LYBA 1B5ZA 1LJ4A 2LZ2A 4LGKA 2EIZC 1XGUC 4H8ZA 4HTKA 3ZVQA 1ZV5L 1LJHA 4WMGA 5LAFA 1XFPL 1BWIA 1LHMA 4OWAA 3AGGG 4DDBA 4NGZA 1GB2A 5FDJA 1KXXA 5LVKA 4LT0A 1BWHA 4WLDA 5DL9A 1SQ2L 1QSWA 3W6EA 4ETEA 1IWWA 4HP0A 1LZ5A 1T6VL 4PGJB 1OUFA 4DD0A 3D3DA 4LT2A 3TXDA 4LT3A 1FLWA 2BQIA 3AZ4A 5KXYA 4ET8A 3WH1A 5M1YA 5KXMA 1GBXA 1GF0A 2A7DA 154LA 3RZ4A 1JKBA 2HEAA 1KXYA 1IWTA 4J0LA 4WG1A 1IWZA 134LA 1D6QA 4NSIA 4FDYA 2AUBA 5I54A 2WARA 4NGWA 1GAYA 4B0DA 1LKRA 4NY5A 1EL1A 2HU1A 4NSJA 5DN4A 5LXWA 2HEEA 1KIRC 1NDGC 5II3A 4XENA 1LMAA 1OUBA 1I20A 1DKKA 3CT0A 4G4CA 5ILCA 1LHLA 4HV2A 3TMXA 4M4OA 1GF5A 2BQAA 5F14A 1QDTA 1C45A 1HEMA 4YM8A 1KIQC 4GCCA 3A67Y 5LAGA 2ZILA 1AT5A 3AZ5A 1TEWA 5I4WA 1YANA 4TWSA 1CKDA 3WU7A 5JENB 4HSFA 1J1OY 5HNCA 1WQNA 2MEAA 5F16A 1F10A 1J1XY 1LMNA 3N9EA 4NG8A 3FI7A 2F4AA 4PPOA 2W1YA 1KIPC 1NHEA 1IP5A 4LZTA 1B7SA 1ZMYL 1HENA 2FBDA 2YBJA 1B7RA 1JEFA 2BAAA 2XTHA 3OJPA 5FELA 5LIOA 1JISA 2Z12A 3TMVA 1LSAA 4BAPA 1LZCA 3AGIA 4RLMA 5B1GA 2GV0A 1NMMA 4N5RA 1UACY 2DQDY 2IFFY 1CJ9A 2ZQ3A 4XJDA 9LYZA 2Z19A 4QGZA 4Z46A 1ALCA 3A3QA 4B1AA 2MEBA 4CHXA 1NQIA 1UICA 5K7OA 1LZ9A 135LA 2D4IA 1LJFA 3A93A 1IP3A 4WM1A 3A3RX 4HPEA 5KXLA 3T36A 4XJIA 1LZAA 1UC0A 5B05A 1GE4A 2DQCY 3E3DA 4WM3A 5F9XA 1QUTA 4NWHA 1C46A 1LZGA 3P65A 1ZVHL 1LSZA 1LSEA 1GXXA 5DN5A 3RW8A 4YF2A 1C10A 1W08A 3WW6A 1LJGA 4H9HA 3LHMA 2YBLA 1FDLY 4GN4A 1INUA 1UUZC 1OUGA 1XGPC 4L41A 2YSSC 2BQFA 1DKJA 1LHJA 4B49A 1HC0A 1D6PA 2MECA 1WQOA 4ZIXA 1IVMA 4NEBA 3AYQA 3WXTA 1REZA 3A6CY 1XSFA 2Z39A 5APFA 3T6UA 3W6DA 4CFOA 4Z41A 5LVHA 1JIYA 1GFGA 2BQLA 4B4JA 1JKAA 3LYMA 5C6IA 1OUDA 3BKVA 5T3FA 5B07A 1XEIA 1HHLA 2HEFA 1NBYC 4PRQA 4M6DA 2MEFA 4OWBA 4QEQA 1JJ1A 4UWVA 2FYCA 1IP4A 4NHIA 3WU9A 5DLAA 3QE8A 1GE0A 1WQMA 1GDXA 2HEDA 1LZBA 3TXEA 1NF5A 3B0KA 5IELA 1CKCA 2PC2A 2IHLA 3TXFA 2Q0MX 4XJGA 1IP1A 2BQHA 2DQHY 3WUNA 4QY9A 4TSCA 5E4PA 1AM7A 5KXZA 1N4FA 4BS7A 1IOQA 4XYYA 1PZYA 2BPUA 193LA 1JJ0A 1BQLY 4HTQA 1NDMC 3EXDA 3B6LA 1AZFA 3WVXA 4N1CC 1DPXA 194LA 1LKSA 1GB8A 4MR1A 4NGJA 4HJZA 3IWRA 2HU3A 4DD7A 1GFRA 5KXRA 4II8A 4RW2A 1PS5A 1LYZA 3LZTA 3TXJA 4C3WA 4H92A 1B5UA 3TMUA 1JSEA 1LJJA 4HJYA 3CT5A 4YEMA 1B7MA 6LYTA 3J4GA 3EBAB 3ATOA 1CKHA 3AZ7A 5F9UA 5KXOA 4NGKA 4YENA 1YQVY 1IY3A 5C6JA 4YEOA 4J1BA 2MEHA 1BHZA 1B5XA 2HEBA 1RJCB 2BLYA 2D91A 2G4QA 2H9JA 1IC4Y 2BQKA 3FE0A 3WU8A 3WUAA 3BKHA 1GFEA 8LYZA 4ZEEA 1C08C 3IJUA 4DYGA 4EMNA 2XJWA 4R0FA 4WM5A 3TXIA 1GFHA 1IY4A 1G7MC 1WVVA 4C5FA 1LYSA 3G3AB 2BQGA 1YL1X 4WO6A 4LYMA 4NHQA 4XJBA 5LYMA 1GF9A 1IX0A 4BAFA 1BVKC 2BQBA 5LVIA 1IORA 1RFPA 1UIEA 4LFXA 4B4IA 1CJ7A 5LA5A 4XJFA 1HSWA 1HFXA 1P2CC 1LZ6A 4WLYA 1XGQC 208LA 5KJ9A 1HERA 1IC5Y 4H9BA 1GBZA 3A6BY 4KXIA 4LT1A 1EQ4A 1LMTA 4EOFA 1QQYA 3CSRA 1B7PA 1LSFA 2MEEA 1D9UA 3K3TA 4DDAA 1TAYA 3WPLA 5D5CA 5KY1A 1TBYA 3EO5A 4GLAA 4NGVA 1IOCA 1G7LC 1NWGA 2A7FA 4BADA 2YVBA 4W96A 2LHMA 4D9ZA 1JTOL 4E3UA 4I8SA 2CJLA 1F6SA 1G7IC 2W1XA 3CSQA 5J7CA 3B72A 3W6FA 5I4XA 1WTMA 1AKIA 3TXBA 1YAQA 4ETCA 1AT6A 1GF8A 1TDYA 5I53A 2DQJY 2BQNA 3P68A 2HECA 1IOTA 1XGTC 1GFAA 2FBBA 1JTTL 4H9FA 4IASA 1CNSA 1GFVA 2W1MA 1B7OA 1H87A 3P4ZA 3RNXA 3TMWA 3WXUA 3LZ2A 7LYZA 1LHKA 1HFZA 1YILA 1A4VA 1GBOA 2BQOA 3J6KA 4PHIA 4CJ2A 3HBDA 153LA 3N9CA 2HTXA 5APEA 4J7VA 2YBHA 3LYZA 1HEOA 5F81A 3RT5X 1VDSA 1ZVYB 1GB0A 3A95A 5IDDA 4DD1A 1GB3A 2G4PA 4NHTA 4ML7A 5APCA 5B1FA 1A2YC 5L9JA 1DXJA 1RE2A 2ZYPA 1HNLA 1LZ8A 2XBSA 3AZ6A 4H9AA 1WQRA 1REYA 4N1EI 4DC4A 5HLLA 1IR8A 2RSCA 5B59A 2ZIKA 4WG7A 3N9AA 3KAMA 3A96A 1LZ1A 2VB1A 2CGIA 3LYTA 1GFJA 1B7QA 1YAPA 3TXGA 1IIZA 3A8ZA 1OUAA 2YBMA 4DD9A 5LVJA 4IJ4A 5KXWA 1GPQC 5LINA 4KPMA 5D5FA 2DQGY 3VWOA 2FYDA 1EQ5A 1JSFA 1QUSA 2ZWBA 4G9SA 4GCBA 2MEGA 4OOOA 1DPWA 1UIBA 4HV1A 4NWEA 5L3IA 1YKZX 5DM9A 4RDSA 1GXV2 4GCDA 1DZBX 1GEVA 1OUHA 2D4JA 4OWEA 1GWDA 1LZEA 1LOZA 4J1AA 3WYHA 1VDQA 4GN3A 3CQLA 1DI3A 4KT3A 1GEZA 4NGOA 1IOSA 3HBHA 1B5YA 4IATA 1IP7A 1JKDA 4FJRA 5AMYA 1IWXA 4AGAA 1GB5A 1BGIA 1LJIA 1LMPA 5LA8A 4XN6A 5FCPA 1YAOA 5LYZA 1OUJA 1GE3A 2Z38A 3WUMA 3IJVA 2NWDX 1QSAA 2BQJA 2LYOA 4ETDA 1HEWA 1LZTA 4R6CA 1LSYA 1LSDA 4LYCA 1D0KA 1UCOA 1XEKA 5IHGA 132LA 2D6BA 1GF4A 1LPIA 4X3BA 1BB6A 3AB6A 4DD2A 4ZFPA 4UWNA 2I6ZA 1B7NA 4LYOA 4XADA 4ETBA 1B5WA 5HNLA 4XJHA 1LJ3A 6LYZA 2D4KA 5FSTA 4H93A 1HMLA 2CWIA 4A7DA 2W1LA 1C43A 4TTDA 4OWHA 1JJ3A 1LAAA 4G4HA 4H91A 4MCKA 4I0CA 4P2EA 2Z18A 3SP3A 5KXXA 1KXWA 1XEJA 4NGIA 4OWCA 4TX7A 4ET9A 5C6LA 1YIKA 4CGEA 1E8LA 1YKXX 4KL7A 4OOTA 5ILFA 1LSGA 1IEEA 1IR9A 1F0WA 1FLYA 1GD6A 1HELA 1LHIA 2EPEA 1FKQA 4O34A 1H6MA 1VDPA 1UIAA 2EKSC 2YBIA 4MSTA 4NG1A 4NGYA 1V7TA 1VDTA 1BB3A 3ZEKA 2DQAA 3B0IA 2Z2EA 4H90A 4WOAA 1LJEA 4H1PA 3TXKA 1Z55A 1JPOA 1UIHA 2BQCA 1JHLA 1LMOA 1REXA 3B0OA 3GXKA 2I26L 1QTEA 3P66A 1WTNA 3WL2A 1UIDA 1GBWA 3ATNA 1CJ8A 2DQFC 1BVXA 1LZNA 5I4YA 1B7LA 1VATA 4LYTA 4UWUA 4WL7A 4B4EA 1GBYA 1TCYA 3HBEX 1NBZC 1B0DA 3P64A 4GCEA 1OQMA 1QIOA 4H9CA 4PJ2C 3CT1A 3W6BA 1CJ6A 4YOPA 3W3EA 2DBTA 2ZQ4A 4AXTA 3W6AA 1RI8B 1WVUA 1IR7A 2EQLA 3CB7A 2F30A 2MEDA 4CFPA 4WLTA 1OUCA 3F6ZA 1B2KA 2ZNXY 1JKCA 4N8ZA 4RLNA 3QNGA 4TUNA 1YAMA 3W6CA 4WLXA 1YL0X 4H8YA 1I1ZA 4LFPA 3WPJA 3GXRA 2C8PA 4QDNA 2X0AA 2Z37A 5KXTA 1LYYA 1MLCE 1JITA 1REMA 4GCFA 5FHWA 1MELL 3G3BB 3RU5A 4Z98A 207LA 5A3ZA 3WW5A 4HPIA 4WM6A 4NSHA 5HMVA 3A94A 1VEDA 3D9AC 1GFUA 4GLVA 1HFYA 1LCNA 1OUIA 2ZIJA 3HFMY 1HF4A 1EQEA 1B9OA 4WL6A 4HTNA 1IWUA 1LMCA 1GB7A 3TXHA 4ANRA 1UA6Y 2BQEA 1OP9B 1WQQA 4DD3A 1LYOA 2LZTA 1RCMA 5I5QA 4GN5C 5B06A 5KXPA 4WM2A 5A3EA 2BLXA 1BB7A 2F2NA 3LYOA 4NIJA 5L3HA 1LSMA 1CKFA 2DQIY 4PRUA 5LVGA 4G4BA 2Y8PA 4G49A 1QDRA 4H94A 5KXNA 4TSBA 3CSZA 3AW6A 1G7JC 1LZSA 1C7PA 2BQMA 4OW1A 4DDCA 2CDSA 1WQPA 3EMSA 2H5ZA 5EBHA 1IWYA 1LSCA 1D0MA 2DQEY 1FLQA 1FKVA 2LYMA 4RW1A 3AGHA 1HEPA 2F4GA 1GE2A 1LHHA 2I25L 4W94A 4DWXA 1NKHA 2ZYCA 3A90A 1IWVA 4H8XA 1UIGA 1LJNA 1GF6A 1GE1A 2H9KA 2LYZA 3QY4A 4DT3A 1IO5A 2HUBA 1J1PY 4HJVA 1T3PA 1I56A 1LZ4A 3A91A 3WVYA 1JWRA 2MEIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ARLA 1QUHA 1UBZA 4N9RA 1VAUA 2YBNA 184LA 1CV5A 1JTPL 1SLYA 1D3JA 1OUEA 1L27A 1GB6A 163LA 155LA 133LA 1L90A 1DYAA 3DKEX 1L09A 5HMJA 1GHLA 1XGRC 1GFKA 3C7ZA 1QT7A 228LA 1DQJC 2C8OA 4U3XB 3C7YA 1IC7Y 3WULA 5FEKA 1DI5A 1LYJA 5KKIA 1BWJA 1CU6A 1LZYA 1FLUA 4LYBA 1DYBA 3ZVQA 1ZV5L 1LJHA 3K2RA 4DDBA 4ARMB 4OWAA 3AGGG 1P36A 3W6EA 5DL9A 1L95A 1SQ2L 4HP0A 1LZ5A 4PGJB 1OUFA 223LA 3D3DA 4LT3A 2BQIA 3AZ4A 1GF0A 1L30A 154LA 1KXYA 4WG1A 1D6QA 2AUBA 1C6MA 2WARA 1GAYA 2HU1A 1G0QA 4XENA 1LMAA 3SB8A 1DKKA 1LLHA 4G4CA 1LHLA 4HV2A 3TMXA 3C80A 1C6AA 5F14A 1QDTA 1C45A 1HEMA 4YXAC 4YM8A 1KIQC 4GCCA 3A67Y 5LAGA 2LC9A 2OU9A 1LGUA 1L80A 5HNCA 1L28A 2MEAA 5F16A 1J1XY 3N9EA 3CDQA 4PPOA 1IP5A 3C81A 1CV1A 2GV0A 1CVKA 1PQOA 4N5RA 9LYZA 2ZQ3A 4Z46A 1ALCA 2MEBA 1LZ9A 3A93A 4HPEA 1QT8A 166LA 5B05A 1QUTA 1QUOA 1QT6A 1LSZA 3GUKA 3RW8A 4YF2A 1C10A 2B6TA 3WW6A 1L94A 1OUGA 1HC0A 1D6PA 1OWZA 1KS3A 1IVMA 4NEBA 1REZA 3T6UA 1L72A 5LVHA 3GUNA 5T3FA 1L52A 109LA 2MEFA 4QEQA 220LA 1IP4A 165LA 2CUUA 2HEDA 1LZBA 3TXEA 1NF5A 3DN0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1LZD A;  1G7H C;  5KXK A;  1VFB C;  3WMK A;  5LYT A;  2DKV A;  1UBZ A;  1FBI X;  1F6R A;  1GBS A;  5KKJ A;  3OK0 A;  4NHP A;  1UIF A;  2N5Z A;  1O23 A;  4N9R A;  4H9E A;  1VAU A;  2YBN A;  3WPK A;  1LSB A;  3M3U A;  4ETA A;  1JTP L;  5KXS A;  4N0J A;  4NSG A;  2Z2F A;  4NHS A;  1LJK A;  1SLY A;  4H9I A;  1OUE A;  3A34 A;  3LN2 A;  5E9R A;  1GB6 A;  1GF3 A;  1JUG A;  4NGL A;  1GDW A;  1IP2 A;  4WM4 A;  2BQD A;  133L A;  2YDG A;  1GAZ A;  1DI4 A;  1HSX A;  2G4N A;  1BB4 A;  5HQ1 A;  1CKG A;  1LSP A;  2ZNW Y;  2XBR A;  1GF7 A;  5HMJ A;  1IP6 A;  1D0L A;  1GHL A;  1LTM A;  1XGR C;  1BB5 A;  1GFK A;  1HEQ A;  1YKY X;  1DQJ C;  2C8O A;  3ZVQ B;  1QTK A;  1HMK A;  3M18 B;  2B5Z A;  4U3X B;  4NFV A;  1IC7 Y;  1LZR A;  3WUL A;  4LYZ A;  3A92 A;  5FEK A;  1DI5 A;  1W6Z A;  1GFT A;  1V7S A;  3AW7 A;  5KKI A;  1B5V A;  1BWJ A;  1LMQ A;  1YRO A;  1FN5 A;  4WO9 A;  3ULR A;  1GB9 A;  3MGW A;  1LZY A;  1FLU A;  5APD A;  1LSN A;  4Z3M A;  3AJN A;  4LYB A;  1B5Z A;  1LJ4 A;  2LZ2 A;  4LGK A;  2EIZ C;  1XGU C; 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 2MED A;  4CFP A;  4WLT A;  1OUC A;  3F6Z A;  1B2K A;  2ZNX Y;  1JKC A;  4N8Z A;  4RLN A;  3QNG A;  4TUN A;  1YAM A;  3W6C A;  4WLX A;  1YL0 X;  4H8Y A;  1I1Z A;  4LFP A;  3WPJ A;  3GXR A;  2C8P A;  4QDN A;  2X0A A;  2Z37 A;  5KXT A;  1LYY A;  1MLC E;  1JIT A;  1REM A;  4GCF A;  5FHW A;  1MEL L;  3G3B B;  3RU5 A;  4Z98 A;  207L A;  5A3Z A;  3WW5 A;  4HPI A;  4WM6 A;  4NSH A;  5HMV A;  3A94 A;  1VED A;  3D9A C;  1GFU A;  4GLV A;  1HFY A;  1LCN A;  1OUI A;  2ZIJ A;  3HFM Y;  1HF4 A;  1EQE A;  1B9O A;  4WL6 A;  4HTN A;  1IWU A;  1LMC A;  1GB7 A;  3TXH A;  4ANR A;  1UA6 Y;  2BQE A;  1OP9 B;  1WQQ A;  4DD3 A;  1LYO A;  2LZT A;  1RCM A;  5I5Q A;  4GN5 C;  5B06 A;  5KXP A;  4WM2 A;  5A3E A;  2BLX A;  1BB7 A;  2F2N A;  3LYO A;  4NIJ A;  5L3H A;  1LSM A;  1CKF A;  2DQI Y;  4PRU A;  5LVG A;  4G4B A;  2Y8P A;  4G49 A;  1QDR A;  4H94 A;  5KXN A;  4TSB A;  3CSZ A;  3AW6 A;  1G7J C;  1LZS A;  1C7P A;  2BQM A;  4OW1 A;  4DDC A;  2CDS A;  1WQP A;  3EMS A;  2H5Z A;  5EBH A;  1IWY A;  1LSC A;  1D0M A;  2DQE Y; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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