The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
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structure length |
56
|
Chain Sequence |
RQCKVLFEYIPQNEDELELKVGDIIDINEEVEEGWWSGTLNNKLGLFPSNFVKELE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Differential Recognition Preferences of the Three Src Homology 3 (SH3) Domains from the Adaptor CD2-associated Protein (CD2AP) and Direct Association with Ras and Rab Interactor 3 (RIN3).
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CD2-associated protein
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-09-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2M51 A; 2O88 A; 5GJV B; 2DJQ A; 3H0H A; 4OMN A; 1BU1 A; 5FWB A; 4J9D A; 1GBR A; 2DL3 A; 2BZY A; 1BBZ A; 1T0H A; 2ED0 A; 1AVZ C; 1GFC A; 1WLP B; 4ESR A; 1VYV A; 1OEB A; 2DRK A; 3THK A; 2EGE A; 1QWE A; 1WXB A; 4A63 B; 4OML A; 1AEY A; 4J9H A; 3I5S A; 2PZ1 A; 2HSP A; 3QWY A; 2X3W D; 3EG1 A; 1UTI A; 2GQI A; 2VWF A; 2LCS A; 1I0C A; 2YUO A; 3CQT A; 2L3S A; 1TUD A; 1NEB A; 2J6K A; 4EIK A; 3VS3 A; 2OI3 A; 2H8H A; 2LNH B; 4WCI A; 2JS0 A; 1FYN A; 2LJ3 A; 4RTT A; 1Z9Q A; 2LMJ A; 1KFZ A; 2HDA A; 1X43 A; 1OPK A; 3PVQ A; 2DM1 A; 1E6G A; 5IHK A; 2FG0 A; 3H0I A; 2A36 A; 1ZLM A; 3EG2 A; 3I35 A; 2V1R A; 1K4U S; 1NYF A; 1E7O A; 3I9Q A; 1NYG A; 4OMO A; 2GTO A; 1B3Q A; 2FRW A; 1ZUU A; 2ENM A; 1RLQ C; 2JMC A; 4J9F A; 1AD5 A; 1GRI A; 1UJY A; 4M4Z A; 1KJW A; 2DA9 A; 4KRT A; 3UAT A; 5L23 A; 1U06 A; 2EGA A; 1U5S A; 1H92 A; 2OAW A; 1AOJ A; 3R6N A; 1BB9 A; 1IO6 A; 2DNU A; 1UEC A; 1WYX A; 2RQT A; 3JV3 A; 2EPD A; 1EFN A; 2FPD A; 2AZV A; 2EYZ A; 1YCS B; 4RTV A; 4E6R A; 2OJ2 A; 1G2B A; 4JJB A; 1AWW A; 1NEG A; 1PRM C; 2SEM A; 5IXF A; 5IXB A; 2YDL A; 1WFW A; 1JU5 C; 3C0C A; 1V1C A; 4RTU A; 3M0S A; 5IH2 A; 1E6H A; 4RTY A; 4J9I A; 4AFQ C; 1NM7 A; 4GLM A; 1AWO A; 4HXJ A; 2YT6 A; 3EGU A; 4LUE A; 5I22 A; 3O5Z A; 2GBQ A; 1JXO A; 1WA7 A; 1UGV A; 3ZL7 C; 1LCK A; 3LH5 A; 1WDX A; 1GCQ A; 1SHF A; 4HVW A; 2L3Q A; 1VYU A; 3TSZ A; 2CUB A; 4HVU A; 3RBB B; 2J7I A; 2DMO A; 2ROL A; 2LQW A; 2DLP A; 2EVR A; 1WX6 A; 1PRL C; 2KXD A; 1UHC A; 3PE0 A; 4D8K A; 4DEX A; 2KEA A; 3M0R A; 1PKS A; 2L3P A; 2HCK A; 2JT4 A; 3M0P A; 2EQI A; 4LN2 A; 1YN8 A; 3NGP A; 2MCN A; 2XMF A; 1SSH A; 1OV3 A; 1WIE A; 4JZ3 A; 4QT7 A; 5HCK A; 2J06 A; 2FRY A; 2O9V A; 4J9B A; 3EHR A; 2CDT A; 1WI7 A; 1X2Q A; 2DL4 A; 2NWM A; 4RTZ A; 2CSI A; 5I11 A; 1M3B A; 1QWF A; 4CC7 A; 2DX1 A; 1HJD A; 2DRM A; 4X1V A; 2O9S A; 4RTX A; 4J9E A; 2JS2 A; 3REB B; 4AFZ C; 1U3O A; 1G83 A; 2K6D A; 2FPE A; 4F16 A; 5FW9 A; 1OOT A; 2A37 A; 1UFF A; 4D8D A; 2LZ6 B; 4K11 A; 3UF4 A; 2RQU A; 1UDL A; 1W1F A; 2KXC A; 1SHG A; 2D8H A; 1X27 A; 4RTW A; 1SRM A; 1HD3 A; 2FEI A; 2EBP A; 1H8K A; 2DF6 A; 2O2O A; 4AFS C; 1MV3 A; 1TUC A; 1YWP A; 2K9G A; 4IIM A; 2QDL A; 2C0T A; 1SPK A; 2C0I A; 3SHW A; 2CRE A; 3NPF A; 2I0N A; 1PHT A; 1UG1 A; 2K79 A; 2RNA A; 2KRM A; 4CC4 B; 1GCP A; 1T3L A; 2KRO A; 2D0N A; 1ABO A; 3VRY A; 2AKK A; 3VS4 A; 2L0A A; 3KFV A; 5ECA A; 4JJD A; 1BK2 A; 1KSW A; 2J05 A; 4LNP A; 2EYY A; 2YSQ A; 1UHF A; 4ORZ A; 1VA7 A; 4J9C A; 2KBT A; 3SEM A; 2PNI A; 1RLP C; 1A0N B; 1UUE A; 2DL8 A; 3RNJ A; 2EGC A; 2DL7 A; 1NLP C; 2LX7 A; 2LP5 A; 2IIM A; 1CSK A; 2M0Y A; 1K9A A; 2RN8 A; 4RUG A; 2SRC A; 2DVJ A; 2ECZ A; 2K2M A; 3VS7 A; 1FMK A; 2D8J A; 2J6O A; 2KNB B; 4Z88 A; 2O31 A; 4LE9 A; 1AZG B; 1YP5 A; 3H0F A; 1JEG A; 1KIK A; 4J9G A; 2K7A A; 2YUN A; 2CUD A; 2AZS A; 1SEM A; 2AKL A; 2FO0 A; 4F14 A; 3UA6 A; 1WXT A; 4OMP A; 4AG1 C; 1YWO A; 3VS5 A; 1AZE A; 4CC2 A; 3I5R A; 4GBQ A; 1ARK A; 1GBQ A; 3IQL A; 1OPL A; 2CSQ A; 2L2P A; 1CKA A; 1UE9 A; 1NLO C; 5IHI A; 1M27 C; 1MV0 B; 1ABQ A; 3QWX X; 3VS6 A; 1ZBJ A; 2LJ0 A; 3EHQ A; 2F2W A; 1T3S A; 2K3B A; 2CT4 A; 1MUZ A; 2GNC A; 1AWX A; 2CH4 W; 1I07 A; 2DYB A; 2B86 A; 3UA7 A; 1GCQ C; 2JXB A; 2ABL A; 2CT3 A; 1W6X A; 2EKH A; 1Z9Z A; 1ZX6 A; 2BTT A; 1GFD A; 1RI9 A; 2W10 A; 2DE0 X; 1AWJ A; 1QCF A; 2JMA A; 4DEY A; 1PWT A; 2ED1 A; 2F2X A; 4OMM A; 1PNJ A; 1RUW A; 1X6G A; 2NUZ A; 4JPB W; 1K0X A; 1HSQ A; 1TG0 A; 2KT1 A; 2W0Z A; 1N5Z A; 1ZUY A; 1NG2 A; 2KRS A; 2ESW A; 2BZX A; 1SRL A; 1X2K A; 3GBQ A; 2E5K A; 2AK5 A; 1M8M A; 1CKB A; 2JM9 A; 4JZ4 A; 2LQN A; 4Y92 A; 1Y0M A; 2KGT A; 1ZUK A; 1JQQ A; 3VS1 A; 3ULR B; 2CH4 A; 1QKW A; 2G6F X; 3TVT A; 1ZSG A; 1J3T A; 2F2V A; 1H3H A; 3REA B; 2HEQ A; 1I1J A; 2FPF A; 1WXU A; 4Z8A A; 1QKX A; 2D1X A; 2X3X D; 4Z89 A; 4HCK A; 1B07 A; 2DIL A; 3NHN A; 3VS2 A; 2BZ8 A; 5GJW B; 1GL5 A; 2A28 A; 1K76 A; 2JM8 A; 2VKN A; 5FWC A; 4IIO A; 2LJ1 A; 3M0U A; 3TSW A; 2A08 A; 2YUQ A; 5EC7 A; 3NMZ C; 4CC3 A; 1JO8 A; 2KRN A; 1K1Z A; 4LUD A; 2DL5 A; 1Y57 A; 4JJC A; 2JTE A; 4R0K A; 4OMQ A; 3FJ5 A; 3PVL A; 1T0J A; 2GTJ A; 3U23 A; 1K0S A; 2RQW A; 2KR3 A; 2V1Q A; 1VYT A; 1YNZ A; 2DBM A; 3EG3 A; 3EG0 A; 4ZNX A; 1S1N A; 2KE9 A; 2PTK A; 2KYB A; 2P4R A; 4FSS A; 2JW4 A; 2EYX A; 1JXM A; 1W70 A; 2HBW A; 3M0T A; 3A98 A; 2C0O A; 2YUP A; 2GGR A; 1QLY A; 2RQR A; 2J6F A; 2RQV A; 1M3C A; 3M0Q A; 1UJ0 A; 3H41 A; 2RMO A; 3VS0 A; 2KT8 A; 2EW3 A; 2KYM A; 2MOX A; 2ROT A; 1M30 A; 3VRZ A; 4AFU C; 5IHN A; 1XOV A; 1X69 A; 2MIO A; 1PKT A; 4AG2 C; 2DBK A; 2RPN A; 4HVV A; 4F17 A; 2RF0 A; 1M3A A; 2VVK A; 2EYW A; 1X6B A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Y07 A; 4F04 B; 3H8Z A; 2XDP A; 1C1A A; 2K3Y A; 3JB9 D; 4M75 B; 5LJ5 h; 4PJO C; 1MGQ A; 3M4Y A; 4CI0 C; 5CKE A; 1AVZ C; 3CCJ Q; 1WLP B; 4AT1 B; 4ESR A; 3MCA B; 3DB3 A; 3THK A; 3OYE A; 4A63 B; 4J9H A; 4LDV A; 1K8A U; 1ZHI A; 3SFM A; 3CC7 Q; 1UTI A; 2GQI A; 2LCS A; 1QP3 A; 5LJ5 f; 4JS5 A; 5D6X A; 4PJO E; 1WGS A; 5GAN j; 1TS9 A; 2VB6 A; 2HBP A; 2MMP A; 3EGD A; 1M1K U; 1VQ4 A; 2QEX A; 1NEB A; 3JB9 H; 4EIK A; 3VS3 A; 3C12 A; 3SWN C; 4RTT A; 4O5V A; 1UGP B; 1WJQ A; 1X43 A; 5IHK A; 2A36 A; 3WVD B; 1IGU A; 1VQ8 Q; 3I35 A; 2V1R A; 1NYF A; 1NYG A; 3P8B B; 3PNW C; 4GY5 A; 3M59 A; 4R56 A; 1FMW A; 4M4Z A; 2DA9 A; 1K9M C; 4P5N A; 5L23 A; 1MMA A; 1H92 A; 2OAW A; 1AOJ A; 3MP8 A; 3EFO B; 4ZTJ A; 5DM7 R; 1W2B A; 3CCE Q; 5CO7 A; 1MMG A; 2KAF A; 4KUL A; 5I2M A; 2K5I A; 5CAI A; 3JV3 A; 3V8L A; 1LVK A; 3M9Q A; 3CMA T; 2AZV A; 3LX7 A; 2M9U A; 1U8R A; 2OJ2 A; 1G2B A; 3CCR A; 5DY9 A; 3OMC A; 4C8Q F; 2VYT A; 2SEM A; 1VQM A; 2YDL A; 5KYW A; 3C0C A; 5GAN f; 1V1C A; 4II1 A; 3M57 A; 1D3B A; 1E6H A; 4J9I A; 3D7S B; 1JJ2 A; 4GLM A; 3F70 A; 4HXJ A; 3EGU A; 3G1J A; 3G4S T; 2QQ9 A; 2HSE B; 4YTL A; 3EG9 B; 3OYK A; 1G8X A; 1TOV A; 3VYG A; 1VQN A; 3ZL7 C; 1HXD A; 1Q81 U; 1IRE B; 3CCL A; 3TSZ A; 2CUB A; 4BDZ A; 5J39 A; 4HVU A; 2J7I A; 3E2U A; 2DLP A; 1PRL C; 1NBE B; 2HQX A; 1G3W A; 4JJN K; 3GF5 A; 2OX7 A; 2ZPB B; 1MNE A; 4PJO B; 3NGP A; 4QVD A; 1SSH A; 2RK2 A; 3AT1 B; 3ZEH A; 9ATC B; 3G7Z A; 3PMI A; 4J9B A; 4XTZ A; 5LJ3 j; 3EHR A; 2CZ1 B; 1VQP T; 4QKU A; 1XNI A; 5J3B A; 3A8M B; 1IHW A; 1WI7 A; 2DL4 A; 2BIV A; 3I56 Q; 2FVU A; 3OS5 A; 2CSI A; 1BI2 A; 1OYX A; 2H3J A; 4M7A D; 3QJ6 A; 2XI9 A; 2HZY A; 7AT1 B; 4N0A A; 1YIT Q; 4KH1 B; 5FLX E; 1U3O A; 1G83 A; 3CPW P; 2LCL A; 4RG2 A; 3SWN B; 1KC8 U; 3CC4 Q; 3EFO A; 4D8D A; 2LZ6 B; 3UF4 A; 3FRN A; 1SHG A; 4PFP A; 5CCA A; 1PCX A; 2RJF A; 1WQW A; 5LJ3 h; 2EBP A; 1PC0 A; 2O2O A; 3L2Q A; 1MV3 A; 2K9G A; 1IZ6 A; 2QDL A; 2C0T A; 4KGZ B; 3JCM e; 3H9N A; 4LXC A; 5GAM g; 1YJW T; 2I0N A; 4XQ3 A; 2K79 A; 2OTL A; 4FYV B; 4CC4 B; 3G4S Q; 3VKI A; 2KRO A; 2LDM A; 1ABO A; 2AKK A; 5A2Q E; 4BY6 C; 3VS4 A; 2L0A A; 5LJ3 f; 1VQK T; 3CPF A; 5ECA A; 4M7D C; 4LNP A; 4FL6 A; 4ORZ A; 3EG9 A; 1RAF B; 3SEM A; 1C0M A; 3QZ5 B; 3TRE A; 2I2L A; 2DL8 A; 2KDS A; 3PT9 A; 6AT1 B; 2DL7 A; 1NLP C; 4FT4 A; 4C92 G; 4MZM A; 4ZGD B; 3G71 Q; 1ZBX A; 2MI6 A; 2EQJ A; 1K9A A; 2CZ6 B; 2SRC A; 2DVJ A; 1Q7Y C; 2OTJ Q; 4DA4 A; 3X25 B; 4M7D E; 1FMK A; 2KNB B; 2O31 A; 5GMK e; 1TTH B; 1JEG A; 4DBR A; 1BYM A; 3MP6 A; 4PKC C; 2F5K A; 2CUD A; 2AZS A; 1SEM A; 2CZ0 B; 4PJO A; 4F14 A; 3UA6 A; 1WXT A; 1VQP Q; 1TU0 B; 4JRQ A; 4CC2 A; 2E3H A; 2JTF A; 1OPL A; 2L2P A; 5IHI A; 1F1B B; 2JUF A; 1MV0 B; 2LQK A; 2Y90 A; 1ABQ A; 3VS6 A; 1YJ9 T; 4ATO A; 3QUI A; 2X4Y A; 3RIR A; 4L59 A; 2YLC A; 3LW5 E; 2Y4X A; 3E9G A; 4JDS A; 1T3S A; 2K3B A; 1VQ5 T; 3BY7 A; 2GFA A; 2Y4Y A; 3HHT B; 3OQ5 A; 1W6X A; 3S6W A; 3SWN A; 5KCH A; 3EH1 A; 2BTT A; 1GFD A; 4A4F A; 4BAC A; 1VQ7 A; 1EZZ B; 1QCF A; 3QYG B; 5GAO r; 2MWP A; 2F2X A; 3KXT A; 1PNJ A; 3CCJ A; 4JPB W; 1HSQ A; 1VIE A; 2QAZ A; 2KT1 A; 4XTU A; 1OU9 A; 2JZ2 A; 2RJC A; 2ESW A; 1XJW B; 2E5K A; 4Y91 A; 1ZSZ C; 3CC7 A; 4A4K A; 2LQN A; 3VS1 A; 1FXX A; 3AHU A; 3TVT A; 3WVE B; 3V7C A; 3GNG A; 2HEQ A; 1M8V A; 1Q82 C; 4HCC A; 1QKX A; 2D1X A; 2X3X D; 4Z89 A; 3NHN A; 5LJ5 g; 4X9D A; 3M53 A; 3CCM T; 5FU7 C; 3JAM E; 1K76 A; 2VKN A; 4BY6 B; 1VQ8 A; 4PK4 A; 5FWC A; 4IIO A; 2LJ1 A; 4BE2 A; 3TSW A; 2HD0 A; 4M7D B; 1QCN A; 2DIG A; 2KRN A; 1K1Z A; 4QVC A; 2E3I A; 2WSE E; 2DL5 A; 2C06 A; 4HKE A; 4R0K A; 1VQL T; 4IUT A; 1LOJ A; 3CCE A; 4E7L A; 3P8D A; 3J81 E; 1T0J A; 2GTJ A; 3U23 A; 1G3S A; 2XDB A; 3MO8 A; 5KYN A; 2DER A; 2KR3 A; 3JCM X; 5CKH A; 2DBM A; 1VQ5 Q; 3EG0 A; 2ZPH B; 2KYB A; 4FSS A; 2JW4 A; 2RI2 A; 3L2V A; 1JXM A; 5HK3 A; 2X4X A; 4Y28 E; 2CYZ B; 1W2B P; 5FRN A; 1WHK A; 1K8A C; 2O4X B; 2B8A A; 3LWI A; 2YXY A; 4AMC A; 3H41 A; 2RMO A; 3VS0 A; 2V8J A; 3QXE B; 2MOX A; 4N4H A; 1M30 A; 1SSF A; 4C0G A; 3CPW A; 2QYZ A; 3M54 A; 2RA2 A; 1XOV A; 1PG5 B; 1X69 A; 3A8H B; 4AG2 C; 1VQ9 Q; 2YLB A; 3ME9 A; 4HA8 A; 5GAN g; 2RO0 A; 1Q7Y U; 2DJQ A; 3H6Z A; 3NTK A; 2V8I A; 3JB9 J; 4IUV A; 3QG1 A; 1YIJ Q; 2K4Y A; 1AEY A; 4FYW B; 3QWY A; 2ZZD A; 2MYS A; 4FCY A; 2X3W D; 3JCM Q; 2FZK B; 1I0C A; 3DLL A; 2YRV A; 2YUO A; 3I55 Q; 3M55 A; 1YHQ T; 4IUQ A; 3FB9 A; 1M9S A; 3I56 A; 1ZQ1 A; 3VUZ A; 2QTV A; 1S72 Q; 1ZSZ B; 2OI3 A; 3JCM h; 2JS0 A; 1AT1 B; 2QA4 Q; 4E7H A; 1Z9Q A; 2LMJ A; 1YJN T; 2EQU A; 1BCO A; 4MDW A; 2E70 A; 5HK0 A; 1PSF A; 1YIT A; 4M7D A; 1FWZ A; 3PVQ A; 2DM1 A; 1E6G A; 1VQL Q; 3JB9 G; 1XQH A; 3EG2 A; 4BI3 A; 1E7O A; 3KUF A; 2GTO A; 2FRW A; 2JMC A; 3CC4 A; 4J9F A; 1AD5 A; 3JCM f; 3EFS A; 2KK4 A; 1QP2 A; 3E9F A; 4PJO F; 3VYH B; 3UAT A; 2EGA A; 1U5S A; 3CD6 Q; 4QVZ A; 3OYG A; 2QQB A; 3A8O B; 1WYX A; 2RQT A; 1I81 A; 4V2S A; 4PFZ A; 2EPD A; 2K5F A; 2EQM A; 1EFN A; 2ZPG B; 3NFC A; 1SG5 A; 1YCS B; 3CCQ T; 5GMK h; 3HTR A; 1BCM A; 2LTO A; 4E47 A; 3GPL A; 5IXB A; 1WFW A; 2VGM A; 1JU5 C; 1M90 C; 4JLG A; 4JUV A; 2RH2 A; 1OQK A; 1Q82 U; 5IH2 A; 3OYH A; 1IXD A; 5GAO l; 1M2V B; 3QYH B; 4DQ2 A; 4C92 C; 3M58 A; 3HL8 A; 5KYY B; 3G71 A; 4C8Q D; 4PJM A; 5DLO A; 1MMN A; 3HRS A; 2GBQ A; 4QQ6 A; 2DFU A; 2QG9 B; 1JXO A; 2BE9 B; 5LJ3 g; 2KQW A; 2OTJ A; 2DKG A; 3V8J A; 2XIC A; 3RBB B; 3TU4 K; 3G6E Q; 4C92 E; 5I2S A; 2DMO A; 3SD4 A; 3FLG A; 2KXD A; 2DD5 A; 3PE0 A; 2RI5 A; 2R57 A; 3M4G A; 4D8K A; 4DEX A; 3M0R A; 2DZC A; 2L3P A; 2HCK A; 3M0P A; 5GAN 3; 1TH7 A; 4HCZ A; 4PJL A; 2LCC A; 2F69 A; 3CXC S; 1YJN Q; 4B6M A; 2WSF E; 4JZ3 A; 4QT7 A; 3L1A A; 2FRY A; 2O9V A; 1ZSZ A; 3LYI A; 1N8R R; 2CDT A; 2COZ A; 2F5T X; 3S3M A; 1MMD A; 4WTO B; 5I11 A; 2ZPF B; 2XHC A; 1QWF A; 4X9C A; 3SDZ A; 3VUB A; 4FIB A; 1HJD A; 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