3U5RE

Crystal structure of a hypothetical protein smc02350 from sinorhizobium meliloti 1021
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
183
structure length
183
Chain Sequence
b'KTQSNSITLGTRAADFVLPDAGGNLFTLAEFKDSPALLVAFISNRCPFVVLIREALAKFAGDYAGQGLAVVAINSNDAQAFPEETLERVGAEVKAYGYGFPYLKDASQSVAKAYGAACTPDFFLYDRERRLVYHGQFDDARPGNGKDVTGADLRAAVDAVLKGKDVGTTQVPSIGCNIKWTAG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords uncharacterized protein
publication title Crystal structure of a hypothetical protein SMc02350 from Sinorhizobium meliloti 1021
rcsb
source organism Sinorhizobium meliloti
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 59
structure length 183
sequence length 183
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3u5rE00
3GKMA 4ZBDA 1TK0B 2DMLA 1WIKA 5LCZA 3DD3A 3F3RA 4MJAA 1XWBA 3IK7A 1AQXA 5CRHA 3O76A 3CRUA 1Z7RA 4V1Ag 4L0UA 1YF1A 1THOA 3ZVJD 4MPGA 4KB3A 2KHPA 3PH9A 4TKYA 1Y25A 4G19A 2CA8A 3FZ4A 2B3SA 2BMXA 2VIMA 3CRTA 4EUYA 2F8FA 5IO2A 2VCXA 5G2ZA 1G7EA 3A5WA 22GSA 1MDIA 2RM6A 3IXRA 3QFAC 4EC0A 5ECLB 1S3AA 4N10A 1QFNA 2H1DA 2YANA 2LSTA 1EOGA 3G7IA 5IMDA 3F4TA 1TK8B 2OE1A 2C0GA 3OR5A 4MCUA 2PGTA 1PKWA 3HJOA 4DSSA 4OD7A 4IELA 2GSTA 3DVWA 1B48A 1K0CA 1PRXA 1OYJA 3LGCA 1Z7PA 1KBNA 2HRNA 3F3QA 2K18A 1ST9A 2HSHA 2OBIA 1KEBA 5G5EA 3IAS2 3IRAA 4EL1A 6GSVA 4X43A 3TJJA 5CREA 1M9BA 3ZMLA 2VLUA 2L4CA 3ZFBA 4KDYA 2L5LA 4F2IA 3EVIA 5ID2B 3FW2A 1QUWA 1NHYA 2DJ2A 6GSTA 1Q98A 3UMAA 2JZTA 1S3CA 2VCQA 1GTBA 1RQMA 1FVKA 1JLVA 1HNAA 2GSQA 1V2AA 1MEKA 5CP1A 1K3YA 3MWHA 3HHVA 1TDIA 2PWJA 3D22A 2RLIA 1RW1A 3GX8A 5KN3A 2TRXA 1LJRA 2GSRA 2I3YA 1XOBA 11GSA 1KNGA 4MMMA 1B9YC 1YQ1A 5IOXA 3H79A 4IJIA 3I6AA 3F63A 1EWXA 2OA7A 1OE8A 1A0FA 2FWEA 3GKXA 2L5OA 4HJ2A 2H75A 3IDVA 4YAPA 2FY6A 1R5PA 5IM9A 4POMA 4G9HA 3DKSA 2HZEB 2E2MA 4BVXA 5AIVA 4ZL7A 5CO3A 4JEDA 1V57A 4DVCA 1SD8A 1LU4A 1DE2A 2ZCTA 2EIOA 4TW5A 3KP9A 3IR4A 3F0IA 4OFMA 3F4RA 3F8UA 4EE0A 1SENA 1K0AA 3VK9A 4PQHA 3UVHA 3C73A 4KSOA 1XVWA 1HQOA 2X8CA 3R2QA 3QD9A 3NIVA 3GRXA 2B5YA 3TOUA 4Q5QA 2JZSA 2IMKA 3CTGA 4KDUA 1VF2A 2H72A 2AYTA 1XXUA 3TGZA 1GL8A 5AIXA 1O85A 4E8HA 3Q18A 4EDYA 3ZIVA 3VPQA 1TOFA 1OC9B 2GDRA 3VFIA 1A8YA 1SK2A 3QDNA 4PX1A 4J2FA 3F4SA 1XOAA 1MDJA 3HY2A 3M9JA 4G10A 3PINA 5ECRB 2XPEA 2VM1A 1ZYEA 4AF2A 4KE3A 2OADA 1LBKA 3CMIA 2VD1A 1ZZYA 3TJKA 4EVMA 2F51A 1YJ6A 1VF1A 1M2AA 1SK0A 5DCGA 2YJHA 1X5DA 1B4QA 3ERGA 3ZVJA 2C0EA 5CRDA 3IK9A 1IYHA 3QAGA 4TVEA 1AQVA 1IYIA 3IV4A 3D0ZA 3KH7A 2CAIA 1URMA 5CRGA 2QGVA 3GUSA 2XBQA 4PXOA 2RM5A 4EO3A 3I43A 3J7Yb 3A2VA 2IMIA 3ZITA 1JFUA 4ECCA 1F9MA 4J57E 2IIYA 3LJRA 4NPBA 4NHWA 2HXKA 4MZBA 1PSQA 1SL1B 1DE1A 4LA1A 4YH2A 3BCKA 2DMMA 4LL1B 5G1KA 1X5CA 3EINA 3GKNA 4OMVA 4QL9A 3NOFA 4XS6A 4HEA2 1O8XA 1USBA 2I4AA 2PN8A 4ZL9A 2AB6A 1K3OA 2KLXA 2HZEA 3LQ7A 1YY7A 1SU9A 4N0VA 2MMNA 1EV9A 3MNGA 1Z9HA 4ZIJA 1XWAA 3FYGA 3Q74A 1RK4A 2X64A 1SJZA 3GIXA 1W4VA 4MF5A 3TRXA 2R5GA 1K0OA 2CX4A 3DXBA 1R5AA 3L9UA 2H19A 2MYGA 2O7KA 2VAFA 2CVBA 2K6VA 3TB2A 5DCHA 1XW9A 1N8JA 3DVXA 3E3EA 2IMDA 5ECHB 4ZXGA 3SBCA 3VPTA 13GSA 1XBSA 4ZB6A 1QXHA 1EOHA 2X8HA 2VCZA 3V1WA 1PD21 4TR1A 5ECNB 3QFBC 4XTSA 2M72A 2WB9A 4D73A 2X99A 3L9SA 3Q6OA 1DBYA 1GRXA 5A4UA 2GZPA 2C3TA 2C3NA 3ZFLA 1GTAA 2JU5A 2KUCA 2BJXA 2TIRA 4WETA 2OBKA 2GS3A 3QPMA 2C3QA 3IOSA 3ISOA 2YWMA 1WJKA 2YCDA 1PX7A 2LS5A 2NDOA 2AJQB 5G30A 5KN2A 2MMZA 1I5GA 4K9ZA 4CHSA 4F82A 1GNEA 3LEFA 1TI1A 2HRFA 3GTUA 1W89A 3WT2A 1A2JA 1U3AA 3GN3A 4K1FA 4IHUA 3US3A 3LXZA 1V9WA 3O6TA 1MD4A 4GRFA 2JADA 2LTKA 3TRPA 2O89A 2DJ0A 2DJKA 4K7IA 4N11A 5D96A 4GSTA 1O7UA 4ML1A 3Q19A 1GSFA 5KEJA 4EF0A 1G6WA 1ML6A 2WRTA 1TRUA 5JWRB 1YEPA 2L6CA 3P7XA 2YNXA 1OKTA 3KEBA 1PL2A 3MAKA 3EYTA 3FKFA 3RAZA 3IC4A 4GCIA 5HR2A 2VL3A 3WGXA 4F0CA 2B6MA 3TKQA 3BBYA 4V2LA 3HVSA 3SWLA 5DQYA 2E7PA 2YN1A 4OFNA 3O3TA 2H6YA 3TKSC 1ABAA 3VWUA 3CSJA 1AQWA 3GFKA 3KH9A 3VURA 3TKSE 3LXTA 1OVNA 3QOUA 2FA8A 4HZ4A 1XZOA 1EEMA 2FD3A 1M9AA 1F6MC 3W8JA 4MH3A 4TR0A 1XW6A 2D2ZA 4TOPA 2E0QA 4JR4A 5J3RA 3KD0A 2JZRA 3TKSA 2L57A 1H4OA 3ME8A 1SKWB 2GQKA 4YQUA 1WP0A 4F03A 3N9JA 2FWFA 4JZQA 4MLYA 2YP6A 2H01A 2VL2C 4AJ7A 2O8VB 1M0UA 1U87A 4FIWA 2L6DA 3GA4A 3TJFA 5D73A 4RI6A 3LYKA 2DJ1A 1J0FA 3D4TA 3FR3A 2VOCA 3C7MA 3KJYA 1GNWA 4KCEA 1XIYA 4HQSA 1QK8A 4HDEA 1SL0B 4YQVA 1CQGA 2VD0A 4PURA 5FT3A 4OO4A 4PUAA 1GWCA 1BEDA 2DJJA 1GULA 4WBJA 3I69A 2V41A 2VL2A 1XPVA 3ZTLA 2G2QA 1EGRA 1HD2A 5ECSA 4KUNA 1V58A 2EIQA 2PVQA 1TTZA 2LJKA 3WGEA 5DALB 3P8WA 2V6KA 2ON5A 3IHQA 1Z6MA 4ID0A 1T00A 3IE3A 3CSIA 1ZL9A 4GXZA 3RBTA 4I2UA 2GGTA 3IBHA 2I81A 3TKPA 3FEUA 1ZMAA 4XHMA 5IMCA 1X9SB 2CT6A 3GMFA 4OCFA 6GSWA 3APOA 3KM6A 2OE0A 3ME7A 2FWHA 1K0BA 3JCML 3TUEA 3QR6A 1K0NA 4KA0A 1F3BA 1VF4A 2MMAA 1A23A 4K8MA 5HFIA 2VCWA 1M2DA 5F0GA 1CQHA 2VLVA 2H1BA 3BOAA 4G2EA 4I6XA 3L9VA 1AUCA 4TXOA 1NSWA 1T4ZA 4H86A 1AXDA 1NW2A 2YWNA 3QAWA 2FA4A 4PGTA 5F8BA 2PERA 4GTUA 3ZYWA 3K8NA 4XS4B 3LORA 1WE0A 2V1MA 2FGXA 3FK8A 1JHBA 2CV4A 2WULA 3ZIJA 4PNFA 3LFLA 5EL8A 1YKAA 4MZWA 1PX6A 2RUFA 3ZRDA 5EVOA 3UVTA 4J56E 2G0FA 2H30A 2YV9A 1A2LA 5INYA 4IW9A 2OE3A 3I9V2 3D4MA 2ZUPA 3WD6A 5ECKB 2K8VA 3KMNA 3J7Yk 2JACA 3U5RE 1SKSB 3EMPA 2GTUA 1XWGA 3TRQA 2ES7A 4K0NA 2IFQB 3BCIA 2GT6A 4P3YB 1TP9A 4MP4A 3FZ5A 4ACSA 2LRCA 4Q5FA 5H5RA 1G0TA 1GH2A 1FB0A 2OKAA 1J08A 1FB6A 3KTLA 3WYWA 3TDGA 4BVYA 3C1SA 4HU9A 2R3XA 1HNCA 4WEYA 1T7PB 2I9HA 5IMFA 4POLA 1R4WA 4DSQA 4HOJA 2XHFA 4PQ1A 3LG6A 4K0GA 2WCIA 1EV4A 3TCOA 2A2SA 2CZ3A 2B1KA 1T1VA 1FOVA 5D9TA 3ZL5A 4BL7A 2R4VA 2DSAA 4DEJA 2LRNA 1TK5B 5ID2A 2R6KA 5B6MA 1T3BA 4F0BA 5FWGA 4XS1A 4NV5A 5GAND 2C4JA 5B8AA 3IA1A 4ZBAA 3VI7A 1EGOA 2CVDA 5J4UA 1YEXA 2IL3A 4RQXA 1YKCA 1K0MA 3FRCA 8GSSA 5ECMB 3RPNA 1AW9A 3KP8A 4AGSA 1ERTA 2L59A 1F37A 1TU7A 4O5RA 2GSSA 4CW9A 3U6VA 3WGDA 1JZWA 4HJMA 1PL1A 1A2MA 4XRAA 1WMJA 2X8GA 1BYEA 2B7JA 4IP6A 3GH9A 1WOUA 1FVJA 1JLWA 5DAKB 2ALBA 3RHCA 4L5OA 2WGRA 5JCUA 1FG4A 2DBCA 3TJBA 3GSSA 4GQCA 5D8IA 4N30A 5G5FA 4K2DA 5LD0A 5KN0A 1Z6NA 3M1GA 2EIRA 4IN0A 2H0IA 3FR6A 1ON4A 4ECBA 5B8BA 5C04A 1XFLA 1A0RP 2N5FA 2WDUA 3HJPA 2A2RA 2H6ZA 2OJLA 1R7HA 2DC5A 4I2TA 3HD5A 2B7KA 3H1NA 1UN2A 2XPDA 4L8EA 2YZHA 4FYUA 2PVOC 1MTCA 4TXVA 1T8EB 1GSUA 1XWKA 1PGTA 3LYPA 3HYPA 4IQAA 3GYKA 4JR6A 1A24A 1F3AA 1GSSA 4XRDA 3EE2A 3ZMKA 2FUG2 2BTOT 3F6DA 5EY6A 2LUSA 2LNSA 1UA5A 5EPFA 3GNJA 3EURA 2P5RA 2CVKA 2E2GA 5ECQB 3UOMA 1TW9A 1GSDA 4WF5A 2V2GA 4PNGA 3GL3A 4N0ZA 1OC9A 1XCCA 4KDXA 4MF7A 2B5XA 5F05A 1XWCA 2GZZA 4ULXA 3KTBA 3KIJA 2YOIA 3RPPA 2WJUA 2H0HA 2B5EA 16GSA 4BWSA 3VWXA 1JZOA 2MBSA 2H66A 2VO4A 3H93A 2XC2A 3N5OA 1DSBA 2H1GA 5HFKA 5JCGA 3GURA 5IO0A 4DSSB 1GUMA 3HZ4A 2CZ2A 2LKUA 1SJIA 3GH6A 5E59A 2GZYA 3RHBA 1F2EA 1E2YA 3F6FA 1FO5A 5CNWA 3W6GA 4ML6A 1GP1A 5HR1A 1V40A 2C1YA 3KCMA 2HE3A 1PN9A 1ZOFA 5IPGA 1HNBA 3GHAA 2H70A 5IMVA 4ZILA 2R37A 1GSYA 2C80A 1U3IA 4MK3A 2GQMA 1E6BA 4FO5A 19GSA 2PBJA 1NM3A 5KN1A 4OWYA 4ECIA 1THXA 5D93A 1ZCPA 4ZL8A 5B6NA 2M46A 5DJMA 1BG5A 1TI3A 2C0DA 4Q5NA 18GSA 3FR9A 4MJEA 5J41A 5IIZA 3AY8A 2CX3A 4PUFC 5DQSA 4TR4A 3A2WA 1WPIA 3CTFA 3H4KA 3HVXA 2H74A 2GT5A 1V98A 3FY7A 3APSA 4ISDA 2LQOA 4WR5A 4XIHA 3UIWA 2ZNMA 1JZDA 2OACA 4CDOA 1H75A 4OO5A 4ZBBA 3GKKA 3CXGA 2H0GA 3M3MA 4POKA 4BWQA 2V32A 5F06A 3ZLPA 3CYNA 2IPAA 5F07A 1QMVA 4LMWA 2AHEA 4IVFA 1J9BA 2C0FA 1B8XA 3HKRA 1QQ2A 3BD2A 4BA7A 2N5BA 1U6TA 2LQQA 4Z7XA 3C8EA 3HXSA 5ENUA 3DWVA 3P2AA 5G31A 5FHIA 1TRSA 2WFCA 3EU3A 2EC4A 2VUPA 1TXXA 4V2NA 5D9VA 2KOKA 2DIZA 2QC7A 1M99A 4K7OA 4I5QA 4JBBA 2L4QA 2K8SA 2P31A 3KZQA 2IJYA 1G7OA 1I9DA 4MDCA 1MD3A 4NHZA 1EZKA 4KW6A 2GVPA 5G1LA 3PR8A 4V1Ap 3A2XA 4NWYA 1O73A 1OAZA 3E9JB 1KTEA 4K6XA 1M2BA 1ERUA 6GSUA 14GSA 5ECOB 3UBKA 1GUKA 3EWLA 6GSXA 3L0HA 4ZB9A 4ILFA 4XCSA 2P0GA 5GSSA 1FHEA 5ELGA 5GSTA 3HCZA 4MABA 2VCTA 2HT9A 1Z5YE 1UC7A 5A5KA 3DGQA 3GV1A 3QAVA 2J9HA 1GUHA 4GSSA 2YJ7A 2HLSA 3TKRA 1NHOA 3CBUA 3CSHA 4NAXA 4NXIA 3ZREA 4JU5A 2HZFA 5IOWA 5DBQA 4LL4B 4MA9A 3HZ8A 3DEXA 1YDKA 2H71A 5D9WA 4L5LA 4K7NA 1BQ7A 4BPYA 1PMTA 5AISA 4KAEA 1XVQA 4MZCA 3HDCA 2HNLA 5DVBA 1PKZA 3VWWA 5AGYA 3UBLA 1ZGNA 1MDKA 1GTUA 4GSNA 1BAYA 2YV7A 4LLRA 5IMAA 1ILOA 5HR3A 4IS0A 4Q5RA 1M7TA 4V2MA 5A4VA 2IN3A 3DRNA 4MPFA 5ABRA 4O7HA 1WRYA 4E8EA 2O85A 3KMOA 1O6JA 1S3DA 4KX4A 1TU8A 4KGIA 4ECJA 1X9MB 7GSSA 3VLNA 3G9BA 4RQRA 5D9XA 5LNKe 2C8UA 2VLTA 3G7YA 2P5QA 3C1RA 3RDWA 4X0XA 4KSMA 5JWQB 1TKDB 4TR1B 1AIUA 2H73A 4EDZA 4D73B 2FLSA 5DALA 6GSSA 2PMTA 3UAPA 5CYYA 2NPBA 4FYCA 2YWIA 2MMOA 2LJAA 2JSYA 20GSA 2RUEA 2KP2A 3APQA 1SJ6A 2NTOA 3E0UA 2IMFA 4OFTA 3C71A 5C00A 1ERVA 1AAZA 2VCVA 1YF0A 1QGVA 1GTIA 4MF6A 2YPMA 3IPZA 4LMVA 4F9ZA 2HFDA 2M80A 4AJ6A 4IGJA 2QKEA 10GSA 1UVZA 4I8BA 3GTUB 5B7CA 4HUAA 2H8LA 3UARA 4IQ1A 2FCHA 1PA3A 2O87A 3EU4A 3D5JA 4RUVA 4I97A 2B1LA 1OE7A 1GSEA 1G6YA 3F9UA 2QSIA 2HI7A 3DYRA 5IQYA 2FHEA 1SK1A 4XS4A 2LJRA 1U88A 2AUVA 1YZXA 2TRCP 1ACVA 5ECPB 1ZYQB 4O92A 5JCWA 5J9CA 1BX9A 4GF0A 2YWOA 2I1UA 4L0WA 1B4PA 2F9SA 2MBTA 3G7JA 3M9KA 3HA9A 5GAPD 2XBIA 3FZ9A 3TOTA 3W8SA 1X0RA 1EP8A 2CQ9A 2RIIA 4TRXA 4PQIA 2HSYA 4MJCA 2IMEA 5GZZB 5DDLA 4IP1A 1Z3EA 1GLPA 3D6IA 2CAQA 2HYXA 3KXOA 4JRRA 2MZCA 1OC8A 1X5EA 3WT1A 1TRWA 4KNDA 2IFQA 2KP1A 3DIEA 3DMLA 5COHA 2A4VA 2ON7A 4NV2A 2H1AA 1K0DA 5DJLA 2PUKC 2AV4A 2F3MA 4WKWA 4WBRD 2WS2A 1VF3A 2DJ3A 5H5QA 2J23A 4HQZA 3VWVA 3QCPA 4X1UA 1R26A 1EEJA 4DSRA 2YZUA 3UL3A 3GX0A 5CRWA 4FH8A 1A8LA 4KH7A 3A3TA 3QMXA 2LNTA 3LSZA 1JZRA 5CAXA 1C72A 2FWGA 4YAVA 2JSZA 4IBPA 4HZ2A 3PGTA 1T4YA 5ECIB 12GSA 1VGLA 2IWTA 4YQMA 3VI5A 4OCEA 1FW1A 3ED3A 5IPHA 2GQLA 2F8AA 4GQFA 4HU7A 2WZ9A 5J5NA 2VM2A 1B9XC 2LV3A 2NVLA 17GSA 1XW5A 2LRTA 5HQPA 5JWOB 3EC3A 3MDKA 1AC1A 3L78A 2K9FA 4MH2A 1EP7A 4GWRA 1Q4JA 1TRVA 5A4WA 3P90A 4TN8A 4IJ3A 2V6OA 3H8QA 4TR3A 5E4WA 3M8NA 3GSTA 4KCAA 4MJBA 4ZB8A 2PU9C 1SYRA 1HYUA 5H5SA 3S9FA 4IKHA 2R2JA 3ERFA 3ERWA 4POBA 2LEGA 1FAAA 2N5AA 5DAKA 2FNOA 1WWJA 1VRSD 3HVVA 3EMXA 4EXJA 4WR4A 2GLRA 3UJ1A 4WXTA 2JL4A 2NBSA 4RI7A 5ELAA 1GLQA 2DLXA 1X9WB 4EKZA 6GSYA 3MSZA 3FHKA 1GSQA 3KGKA 1O8WA 4WF4A 1ERWA 2AAWA 4FYBA 4QQ7A 1SD9A 4O32A 1OKDA 3UEMA 3FZAA 1BJXA 4GLTA 5HR0A 3LWAA 4TXOB 4JE1A 3ZZXA 4NMUA 3HJMA 1TJDA 2H6XA 3L4NA 5AN1A 1SYXA 3BJ5A 1O81A 4QL7A 3IAM2 1N2AA 4AJ8A 3TJGA 1Y6EA 2VL9A 5L71A 1SL2B 9GSSA 1PQNA 2Z9SA 4HS1A 2PPTA 3GL5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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