3U5RE

Crystal structure of a hypothetical protein smc02350 from sinorhizobium meliloti 1021
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
183
structure length
183
Chain Sequence
KTQSNSITLGTRAADFVLPDAGGNLFTLAEFKDSPALLVAFISNRCPFVVLIREALAKFAGDYAGQGLAVVAINSNDAQAFPEETLERVGAEVKAYGYGFPYLKDASQSVAKAYGAACTPDFFLYDRERRLVYHGQFDDARPGNGKDVTGADLRAAVDAVLKGKDVGTTQVPSIGCNIKWTAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a hypothetical protein SMc02350 from Sinorhizobium meliloti 1021
rcsb
molecule keywords uncharacterized protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Sinorhizobium meliloti
total genus 59
structure length 183
sequence length 183
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3u5rE00
4ML6A 4BWQA 4K7IA 5AGYA 1R5AA 3ZRDA 3GL3A 2N5AA 1QUWA 4QL9A 3KP8A 1PRXA 2C80A 2VCXA 1TU7A 2Z9SA 5F0GA 4V2MA 4LLRA 4EDZA 1GLQA 1A8YA 4FO5A 1THOA 2WS2A 3IK9A 4EXJA 3LYKA 1PKZA 2TRCP 6GSWA 1ZGNA 3TRPA 4LL1B 1YKAA 4WF4A 1GUHA 3HZ8A 2YWIA 4TN8A 1FO5A 1YJ6A 3O76A 4YH2A 2C3TA 2MZCA 1M7TA 1XWCA 2HRFA 5D9WA 3QAVA 1WMJA 4KDYA 1ZOFA 4KSOA 3APSA 1AIUA 2PMTA 3M8NA 2YWMA 1PGTA 1YF0A 2VUPA 2R4VA 4BVXA 2ES7A 3CTGA 2L6DA 3C7MA 3TKSC 2QC7A 1DBYA 2PGTA 4J56E 3I43A 2CAQA 2JADA 4YAPA 5CRGA 2LRCA 5CP1A 3C1RA 2RIIA 2NVLA 3WGEA 1ST9A 5DJMA 3BD2A 3V1WA 3H79A 2VL2C 5E59A 2CA8A 3J7Yk 2OJLA 2YWNA 2VD0A 1YEXA 4IN0A 3DKSA 4XS4A 2IJYA 3CMIA 2XBQA 4EUYA 3FZ9A 4XTSA 2YCDA 4HZ2A 2D2ZA 5AISA 2DJ3A 1FAAA 2GVPA 4GWRA 3QOUA 1PN9A 4J57E 4XIHA 4NV2A 4MP4A 3VK9A 2L59A 5GZZB 3F8UA 1CQHA 5J9BA 2L4CA 2PVQA 2HZEA 2IFQA 4JZQA 5JCGA 1SKWB 2VCWA 4AF2A 1ERVA 1Z7RA 3FZAA 4I97A 1MDJA 2DJ0A 5ELAA 4TVEA 1M2DA 3EURA 1PX7A 2FUG2 1E2YA 1JZWA 3LG6A 3HDCA 3BBYA 1LJRA 2WRTA 1TJDA 3ZYWA 4RQRA 3L78A 1IYIA 1BG5A 2F51A 4POBA 2H76A 4KE3A 3VWUA 3VWWA 2A2SA 1OE8A 5G30A 4F82A 2OKAA 4KA0A 1WPIA 6GSXA 4HQSA 2YJ7A 2XHFA 3M9KA 5E4WA 5JCUA 4PXOA 4HJMA 3A2VA 3I69A 2FWGA 5D9XA 1AQXA 1MEKA 4MMMA 4O32A 3PR8A 4TXVA 3GV1A 4KB3A 4NV5A 3D4MA 2DMMA 3U6VA 2QGVA 1YF1A 3H1NA 4GRFA 4K7NA 5IM9A 1GRXA 4G19A 4IQAA 3PINA 1EP8A 2B7KA 5G5EA 4YQMA 3W6GA 3SBCA 1GUMA 5FWGA 12GSA 2FWEA 5HR0A 3UBLA 4FH8A 4CW9A 1V98A 1MD3A 1FW1A 3H8QA 7GSSA 3QAGA 5ECHB 16GSA 2PERA 2B7JA 5DJLA 4BL7A 5A4UA 1AQVA 4POMA 3UVTA 3HCZA 3ZFLA 2E0QA 5ECRB 4YQUA 1RW1A 3QAWA 3TUEA 5IO2A 4L5OA 2B3SA 1O85A 4CDOA 1EP7A 3I9V2 4V1Ag 2C0GA 2HE3A 5D8IA 5D9TA 3CRTA 4IBPA 1BAYA 1ZYEA 5IIZA 2X8HA 1YQ1A 3VLNA 5DDLA 1K0NA 1WP0A 3DGQA 4L0UA 1SYXA 3HVVA 3HZ4A 3DWVA 3FKFA 1F3BA 1NHOA 2LQOA 1J0FA 1C72A 3IOSA 2TIRA 5CRWA 3TJFA 3CBUA 4RQXA 2B1KA 3GX0A 2IMEA 3PH9A 1AXDA 1PSQA 1PQNA 1XVWA 4BVYA 4TR1B 4FYUA 2NBSA 3M1GA 1YY7A 2V6OA 4TKYA 5ECLB 1AC1A 3QFBC 3KEBA 1PL1A 3ERFA 1SL1B 3ZREA 5J9CA 2OA7A 5J4UA 3EMPA 3M9JA 1Y25A 1TK8B 4D73B 2C0DA 5IPHA 1GH2A 2H0IA 3L9VA 3LWAA 4L5LA 2H6YA 5A5KA 4GQFA 2CZ2A 2VCTA 1TRVA 2VLUA 4MK3A 5KN2A 6GSVA 1XWAA 3ISOA 2YPMA 3CRUA 2MBSA 3RHBA 1A2MA 2LRTA 2CQ9A 3HA9A 4EE0A 2M72A 1M2AA 3EU3A 1T4ZA 1EGRA 2H0HA 2FWHA 5EPFA 3TJJA 1MTCA 3ZL5A 1F6MC 3KGKA 2JACA 1R7HA 1XCCA 2DSAA 2PUKC 1QQ2A 4BPYA 4X0XA 3GKKA 2FHEA 5L71A 1X9WB 5KEJA 3D5JA 2DMLA 4TOPA 3LQ7A 3U5RE 2IMKA 1G7EA 3KIJA 2R6KA 3MSZA 1Z7PA 1GNWA 1W89A 2HLSA 4AGSA 1ERUA 3APQA 1S3AA 5HR3A 4HDEA 2VCZA 2B5YA 2AYTA 4F03A 2WCIA 3Q74A 5F07A 4HS1A 4MABA 3TCOA 5JCWA 5GSSA 2C3QA 3QD9A 2GDRA 4Q5RA 2PWJA 4WETA 3ERGA 3M3MA 3IA1A 3VI5A 4LMVA 1WE0A 2DLXA 3GFKA 3HVXA 3IK7A 1ERTA 1GSFA 3I6AA 1O8WA 4MDCA 2MMAA 1Z3EA 3ED3A 4ULXA 1JZDA 2KUCA 1JZRA 3ZVJA 4EC0A 4MLYA 3TOUA 1Q98A 2OBIA 2VCVA 5HFIA 5A4VA 4BA7A 1V9WA 3BCIA 1XZOA 2AAWA 2JZRA 2FNOA 4MPFA 4V2NA 1GTIA 1SK1A 2H73A 5IOXA 3D21A 4F0BA 1THXA 4DSSB 4JR6A 3BJ5A 1AUCA 3LJRA 3EMXA 3UOMA 3QR6A 6GSUA 1SL2B 4EO3A 2I1UA 3ZLPA 1XW5A 2RM5A 5G1KA 1ON4A 1S3CA 1Q4JA 4GF0A 3FK8A 3TKSE 4OO5A 4IQ1A 2WZ9A 3TJBA 2F8AA 1M2BA 2CV4A 4ECIA 2V2GA 3C1SA 4MH3A 2VLVA 4TR1A 1XW9A 4G2EA 4RUVA 5F05A 5CO3A 4IGJA 1BX9A 2DJKA 2GQKA 4O92A 3J7Yb 1UN2A 4KX4A 4HU9A 3ME8A 1URMA 1FOVA 2AB6A 2LTKA 1T7PB 1X5DA 3QMXA 4D73A 2HT9A 4PQIA 1DUGA 1XWBA 4OFMA 2DIYA 2JZTA 1ERWA 2K18A 1VRSD 2H66A 3F9UA 2YP6A 4K7OA 5C04A 1QMVA 1GTUA 1BYEA 1U6TA 5HFGA 2H71A 1K0BA 1X0RA 3EYTA 1GSSA 2LNSA 5KN3A 4N11A 4XS1A 2LUSA 5C00A 1B8XA 5AIVA 4ECBA 4RI7A 4ZB9A 1SU9A 4X43A 1FG4A 2K9FA 5CAXA 1I5GA 5DQSA 4I2TA 1BQ7A 2WGRA 3RPNA 2EIOA 2VM2A 1GUKA 1GLPA 1HNBA 4MJCA 1OC9B 3K8NA 3TJKA 4MF7A 3IRAA 3P90A 4PQ1A 2O8VB 5GSTA 1Z9HA 4ZL9A 1LBKA 2HFDA 5ECOB 3MWHA 2FA8A 3CYNA 3IHQA 1TP9A 4JE1A 2K8VA 1YEPA 5IMAA 2YNXA 1N8JA 4IJ3A 4FYBA 3FR3A 2GZYA 1JZOA 5CRDA 1XXUA 3FEUA 1VF4A 4PGTA 4CHSA 2O87A 4MZWA 20GSA 5ID2B 5DALB 1GP1A 1QK8A 1B48A 3S9FA 14GSA 1BEDA 4WBRD 3KJYA 3C73A 3LXTA 3W8SA 2P0GA 2N5BA 3F4TA 5HQPA 2O89A 3F3RA 3KZQA 1XOAA 2GZPA 4XS6A 1YKCA 1XIYA 5ECKB 3VURA 2CAIA 2V32A 2JU5A 2HI7A 4DSSA 3KP9A 2MMOA 3TKRA 2HYXA 4OD7A 1XWGA 2XPDA 3LYPA 4TRXA 3G7YA 3US3A 4XCSA 2PVOC 4P3YB 3C71A 5H5RA 3QPMA 4ZBDA 4ISDA 2XC2A 3R2QA 1TKDB 1N2AA 1OE7A 1T1VA 3DD3A 1UVZA 2H1AA 1HQOA 4NWYA 1G0TA 2OACA 3SWLA 1SYRA 2MMZA 2RUEA 2FLSA 2GSRA 4PNFA 1V40A 5CNWA 1A0RP 4O7HA 3KMNA 1WWJA 4ZL7A 4YQVA 5ABRA 1V58A 1EV9A 2VOCA 1ZMAA 4NPBA 1GSUA 3TJGA 4K1FA 2DJJA 1GWCA 4BWSA 1PKWA 1TTZA 2LJRA 1A8LA 3FR9A 2VL3A 4KGIA 2H8LA 3MNGA 2YN1A 3FY7A 2H1BA 2DJ2A 2NDOA 2LSTA 4V2LA 4LMWA 3N5OA 3GYKA 2LRNA 4PQHA 2GT5A 1XFLA 4TR4A 3L4NA 2C8UA 1OKTA 1H75A 5G2ZA 3ZMKA 4F2IA 5IMVA 2AHEA 4YAVA 4QQ7A 4XRAA 2H01A 1OAZA 3F4RA 4N0ZA 3KXOA 4ZIJA 5IMDA 1MDKA 1B9XC 2QKEA 6GSYA 1OC9A 1ABAA 2VM1A 3CTFA 2H72A 4GSTA 2H1DA 1JLWA 1EOHA 6GSSA 3D0ZA 1Z6NA 2G2QA 2IL3A 4MF5A 2CX4A 3BOAA 3G9BA 3QDNA 5DAKB 1TRSA 3NIVA 4AJ7A 2V6KA 3Q19A 4WR4A 3DMLA 2CVKA 4MPGA 1TXXA 3UBKA 2XPEA 1KEBA 2OADA 2P31A 4KW6A 5ECMB 5ID2A 5DALA 4I2UA 3KD0A 4OMVA 2K8SA 5DCHA 4NHWA 2I9HA 1ZCPA 5ECPB 4KAEA 2YWOA 5G31A 1EWXA 5F06A 3NZNA 1PD21 3EC3A 1TU8A 2H6ZA 2LQQA 2L4QA 4G9HA 4IHUA 1JHBA 3P7XA 3HXSA 1X9MB 2VCQA 2GSQA 2RM6A 4K0NA 2H75A 3WYWA 3PGTA 1SKRB 3LORA 3FZ4A 2HSHA 3CXGA 3UMAA 3FR6A 4N10A 5F8BA 1PX6A 4GTUA 3HVSA 4ECJA 2J9HA 4JU5A 3LFLA 4N30A 5ECSA 4IW9A 3F6DA 4JR4A 3AY8A 3ZIJA 1U3IA 1GSEA 1IYHA 2GSTA 3HHVA 1EEMA 2G0FA 2F9SA 2JZSA 5AIXA 2WULA 1DE1A 3GURA 2ON5A 1SJ6A 2GQMA 2B6MA 4ML1A 1V57A 2LKUA 1XWKA 2H6XA 1ZYQB 5GAND 2L5OA 2R2JA 4GSSA 4OO4A 5ELGA 1XW6A 4F9ZA 3P2AA 3GKNA 3TB2A 2IMIA 2I4AA 1AAZA 5B6NA 3LGCA 4KDUA 1K3LA 2YOIA 1TK0B 4DSQA 5ENUA 3N9JA 4EDYA 1KNGA 1A23A 2F8FA 1T8EB 4WR5A 2RLIA 3D4TA 1EEJA 3W8JA 5D73A 3DXBA 3Q6OA 1SK2A 5CYYA 2BTOT 1SL0B 3UEMA 2L57A 4MF6A 3M0FA 4RI6A 5JWRB 4EVMA 2GSSA 2JSZA 4PNGA 3GH9A 3WT1A 3TRQA 1HD2A 1BJXA 3FHKA 2H70A 3UAPA 3DIEA 3ZVJD 4HZ4A 5B8BA 1RK4A 4POKA 2XBIA 2GLRA 4MJAA 3OR5A 1MDIA 2B5EA 3F3QA 5CRHA 3TOTA 2H0GA 3GNJA 3HJMA 1UC7A 1Z6MA 5IMZA 1NSWA 2A2RA 3ME7A 2KOKA 3UARA 11GSA 2CX3A 2E2MA 5J5NA 3ZMLA 4ECCA 4V1Ap 4Z7XA 4KCAA 5INYA 1SJZA 3D6IA 5DAKA 2YJHA 3HY2A 4J2FA 5ECNB 4ZB8A 2X99A 2GTUA 3GKXA 1WIKA 1PL2A 2E2GA 3BCKA 4WBJA 2PPTA 4NXIA 2HRNA 2HNLA 2AUVA 4ZXGA 4POLA 2IPAA 3UVHA 3ZZXA 3F6FA 3WGDA 3IC4A 3L9SA 1TI3A 2K6VA 2JSYA 1M9BA 6GSTA 1XOBA 2N5FA 3DYRA 2VLTA 5CREA 4I8BA 1XVQA 4EF0A 10GSA 1SD9A 3ZITA 2IIYA 4H86A 3A2WA 1EV4A 1VF3A 5D96A 4DEJA 3DEXA 3MDKA 4I6XA 2FY6A 1X5CA 3KTLA 1K0OA 4IELA 4PURA 3RPPA 4MA9A 2H30A 5IMCA 2GZZA 1TDIA 2LV3A 1KBNA 4X1UA 1G6YA 5IPGA 2BJXA 2L5LA 5GAPD 2VL9A 3F0IA 4O5RA 1A0FA 4FIWA 4K2DA 3RAZA 5DQYA 1GNEA 1QGVA 1OYJA 5H5QA 4ID0A 2ZNMA 2E7PA 3E9JB 5ECQB 1K3YA 1F37A 4MH2A 1O6JA 4HJ2A 3EVIA 3KH9A 4NMUA 4OCFA 2YZHA 2H74A 1O81A 3IAM2 4EKZA 3TKQA 5EL8A 2REMA 5B7CA 1OC3A 2R3XA 3TGZA 3GUSA 2J23A 5LNKe 1J08A 2O7KA 4K0GA 3ZIVA 2GT6A 2FCHA 2YANA 5FT3A 3CSJA 2LJKA 4GXZA 4KUNA 3UJ1A 4GSNA 1FVJA 1E6BA 2H19A 1USBA 2P5QA 2B5XA 4ZILA 2OE0A 1FB0A 4OCEA 1ILOA 4EL1A 1OC8A 4ILFA 1TK5B 3NOFA 4K6XA 1M99A 3Q18A 4PUFC 4KCEA 4MCUA 5DCGA 3RDWA 5HFKA 2R37A 5DVBA 3TRXA 2V1MA 2CVBA 3MAKA 3KH7A 1K0MA 1F9MA 5B8AA 2JL4A 1T00A 1CQGA 3HJOA 1U87A 3KCMA 1S3DA 1ACVA 1R26A 1WJKA 3RBTA 3VPTA 2MYGA 2FD3A 1V2AA 2PU9C 5ECIB 3ZFBA 2MMNA 5H5SA 3FRCA 2X64A 3GH6A 4MZBA 1F2EA 2H1GA 4HI7A 4KSMA 4XHMA 1A24A 1VGLA 1NHYA 3GA4A 4JRRA 1T4YA 1GL8A 1R5PA 4HU7A 1M0UA 1AQWA 2GGTA 3VWVA 1K0DA 1ML6A 2CVDA 4ACSA 2DBCA 5JWQB 1ZL9A 2VD1A 5IQYA 2C3NA 2WFCA 4TW5A 2CT6A 3EINA 1DE2A 3RHCA 5B6MA 1G7OA 3FYGA 3EE2A 1KTEA 3LSZA 1U88A 2YZUA 2C4JA 3HYPA 4KNDA 2CZ3A 3O6TA 13GSA 2M46A 2LEGA 4OFNA 1A2JA 4DVCA 1O8XA 1TW9A 5KN1A 5IOWA 5JWOB 2GS3A 2YV9A 3HD5A 3CSHA 2NTOA 5AN1A 4PX1A 2LNTA 4TR3A 3L9UA 3KM6A 2KLXA 4K9ZA 3F63A 1T3BA 4MJBA 2KHPA 2VIMA 1GSYA 1VF2A 3LEFA 3VWXA 3A3TA 1Z5YE 3H4KA 8GSSA 3WD6A 1WRYA 1B4PA 4Q5FA 2WJUA 4PUAA 1MD4A 2KP2A 4L8EA 3IDVA 4AJ6A 2I81A 3GTUB 5IO0A 5DBQA 18GSA 3GKMA 2NPBA 1K0CA 3ERWA 2DJ1A 1EZKA 3GN3A 2HZFA 1GULA 5IMFA 2PBJA 4KDXA 2IN3A 3DVWA 4TXOB 4ZBAA 1TI1A 3FZ5A 3QFAC 4GQCA 9GSSA 5COHA 1GTAA 3LXZA 3L0HA 5A4WA 2KP1A 4WEYA 1TRUA 1XPVA 2EIRA 2M80A 3P8WA 1QXHA 2DIZA 4JBBA 4F0CA 3EU4A 3VI7A 1TOFA 2C1YA 1HNAA 4OFTA 2QSIA 2IMFA 1VF1A 2PN8A 5EY6A 5LCZA 1B9YC 5J3RA 5D93A 3WGXA 5J41A 1A2LA 1U3AA 1QFNA 4TR0A 1SD8A 1HYUA 4OWYA 3E3EA 3KTBA 1OKDA 2OE3A 4IP1A 3DVXA 3TKPA 2C0FA 3TDGA 3A5WA 2OE1A 3IBHA 3GRXA 4ZBBA 3HJPA 1EGOA 19GSA 3GMFA 2TRXA 3CSIA 2B1LA 2ZCTA 2ZUPA 1UA5A 1I9DA 2A4VA 3KMOA 3HKRA 4N0VA 1XBSA 4E8EA 1O7UA 4IKHA 1GSDA 1JLVA 1WOUA 4JEDA 5D9VA 5LD0A 3VPQA 1DSBA 3IPZA 2VAFA 1SENA 4E8HA 1K3OA 2RUFA 2MBTA 2AJQB 1OVNA 4WKWA 3IE3A 2WB9A 5G5FA 1Y6EA 2I3YA 4IS0A 1TRWA 3E0UA 5G1LA 3GHAA 4L0WA 3GL5A 1SJIA 1R4WA 3WT2A 2V41A 3EWLA 1J9BA 1F3AA 2ON7A 4Q5NA 1M9AA 4HEA2 3H93A 4LA1A 1AW9A 1G6WA 3APOA 2FWFA 4NHZA 2GQLA 2LS5A 4HUAA 4DSRA 1O73A 2EIQA 2HSYA 2X8GA 1NM3A 3IR4A 5KN0A 1FHEA 5HR1A 4LL4B 3UL3A 1FB6A 1GTBA 2C0EA 4ZB6A 4HQZA 3JCML 2R5GA 3GIXA 4IVFA 3O3TA 4NAXA 4QL7A 22GSA 3GX8A 3F4SA 2ALBA 2FA4A 1YZXA 4XS4B 4G10A 2VO4A 1RQMA 2LJAA 2IMDA 3DRNA 4Q5QA 4AJ8A 1SK0A 3FW2A 3G7IA 4WF5A 5HR2A 3QCPA 3GSSA 1ZZYA 1X9SB 4HOJA 1W4VA 4IJIA 2P5RA 4GLTA 1X5EA 2HZEB 2IFQB 4MJEA 3TKSA 1GSQA 3D22A 1SKSB 1LU4A 2YV7A 3GTUA 1YDKA 17GSA 1EOGA 4K8MA 2DC5A 4WXTA 4I5QA 4IP6A 4ZL8A 5FHIA 1PMTA 2FGXA 2WDUA 4TXOA 1FVKA 2HXKA 3IV4A 2VL2A 2O85A 1B4QA 2BMXA 2OBKA 2IWTA 4KH7A 1NW2A 3G7JA 3A2XA 3ZTLA 2X8CA 4FYCA 3IAS2 1JFUA 2EC4A 4GCIA 3IXRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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