3U94A

Crystal structure of the gluk3 ligand binding domain complex with glutamate and zinc: p21212 form
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Zinc Potentiates GluK3 Glutamate Receptor Function by Stabilizing the Ligand Binding Domain Dimer Interface.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
total genus 74
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u94A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u94A02
1JVXA 2D21A 3LSFB 3O6GA 3K2DA 4OQOA 4Q0CA 1B05A 4LP2B 4R2FA 1EZOA 1TFAA 3HPIA 4RK2A 3T93B 1FTJA 2HZLA 3Q29A 3SETA 2XXIA 1FTLA 3UA8A 2E1SA 2REJA 4H1XA 3QK6A 4JDFA 4LUBA 3U72A 4M1VA 3U93A 3K00A 2HCAA 3IOWA 3FVGA 5I59A 1FCKA 3TPAA 1N3WA 1OVTA 3K1MA 3H3GA 1B4ZA 4ZE8A 3V83A 1VFEA 4ND9A 2Q2CA 1PB7A 2VD2A 3LBSA 3LSLA 3E3KA 3O6IA 3KJTA 2VD3A 1SVXB 2DSFA 3HHGA 4GVOA 3PUXE 4IO7A 4NEDA 4RYAA 3T66A 2DWIA 3TCHA 3FJGA 5CBRA 3FIRA 3G3FA 4RXLA 4F3BA 1B9JA 3ECRA 3HHFA 3MZBA 4NF4A 4QF9A 4AB6A 1JEVA 4OERA 5JEIA 4LQ5A 2XXYA 1B5IA 1LLSA 1GTKA 1ZTYA 3CVGA 3DP6A 3KN7A 3PPPA 2DVCA 3ONMA 2P2AA 1DOTA 3EQ1A 3IK6B 1O7TA 2Y7WA 2DXRA 3PD9A 1SW2A 3F11A 4F3GA 4U21A 1B3HA 3PUVE 4WEPA 1F9BA 4DIGA 4P0GA 4XXUA 3U8QA 2DWJA 3M3FA 1AOVA 2O1MA 1P1NA 3FJMA 1NNTA 2A5TB 3KN3A 4Q5TA 4QFPA 3TCFA 1NNFA 3O66A 4EF2A 2XXUA 1BTJA 2ZYOA 1UTBB 4OXVA 4U2RA 3CFXA 1POTA 4KHZE 1H45A 2G93A 3E4RA 4YKPA 1SW5A 1PB8A 1ZBMA 4RY1A 4FEDA 1WDNA 1USYE 1O64A 1Y20A 1MDP1 1SI1A 4KFQA 3A3UA 4NF6B 5TPAB 2GHAA 3FXRA 3MVYA 3OELA 4WXJA 2HZKA 2H9BA 1LBBA 3VV5A 3BFTA 1MM6A 5ELVA 4LQ2A 4XIGQ 2DVZA 1EH3A 2VHAA 2XXTA 3IORA 4ECFA 1B3FA 1FTKA 2IEEA 2I4BA 2W7YA 3C32A 3OMBA 4GOTA 4RNSA 5KDTB 2QS2A 3Q28A 4NF5B 2O6AA 4FEBA 1NL5A 1FQCA 2ZNTA 4PQJA 1YCJA 3N6TA 1MY1A 3CI8A 1MS7A 2PT1A 3KN8A 1BLFA 3PPRA 3KZGA 4THIA 5H8HA 3TFLA 1NH8A 1S50A 5AA1A 1IITA 2DXYA 1JW1A 1B5HA 1SI0A 3SERA 3KSXA 5IKBA 2KLFA 3K0VA 4KR5A 3ZKLA 4DXCA 4KCDA 1P1WA 2RC9A 1GV8A 4U23A 3K01A 1MQGA 3HCQA 3RY3A 4ZEKA 3OD7A 4OETA 3QIMA 3RNNA 2RINA 1GVCA 2GH9A 5I58B 1SW1A 3LUYA 1Q1KA 4BDOA 2V3TA 3CSBA 1SD3A 3B7DA 3IO6A 1M5EA 3OEMA 4XKQA 2ONKE 4POXA 3O6HA 5DT6A 5I58A 5BUUA 4GFRA 3GBBA 3HV1A 2DE4A 1R9LA 2Z23A 3K6XA 3RQTA 1TT1A 4YB5A 3IB2A 3KGCA 1D9VA 1JEUA 1QKAA 1Y3QA 1FW0A 2DE2A 2Y84A 3L6HA 3O9PA 1B3GA 1MXVA 3MUQA 3MWBA 4NTLA 4O3CA 4R72A 2ONRA 4AQ4A 4BDRA 2O68A 2PVUA 3JYRA 1A8EA 1ZJLA 5KCJA 4ZS9A 1VSOA 5H8SA 3U1OA 3G3KA 1LFHA 3G7WA 2XXXA 3G3IA 4TQUQ 3MZ1A 2OLBA 1H44A 4QSCA 5CI5A 4DCXA 2PMSA 3K02A 4IO6A 3K1PA 1LAHE 5FHNA 4F19A 2DS9A 1XVXA 3H6TA 2ANJA 1IQ7A 2P1SA 3D4GA 1MY4A 2PT2A 4GLIA 4O3BA 3T9XB 1IUDA 1P1QA 2ABHA 5AA2B 4JWOA 2A5SA 4F31B 3VLUA 4MH5A 1MXZA 5FTHA 5JTYB 4H65A 1FQBA 1MPCA 4TOZA 4X1BA 4IY6A 4YAHX 1ATGA 2B3FA 4F1YA 1B3LA 1J1NA 1RKMA 5HBCA 3QAXA 2XX9A 5A5XB 2DE3A 3PU5A 3H7MA 2F35A 2I0CA 2XXVA 3H4ZA 4OZ9A 3T9HB 4DXBA 4GF8A 5H8FB 4FATA 2ZNSA 1Y4TA 4F1UA 2P0SA 1II5A 2CZLA 3C31A 4JSOA 4XTCQ 5CMBA 3W9VA 3HO7A 4BDNA 1Z7NE 1IXGA 4HS7A 2DWHA 3U94A 3FVNA 3UP9A 1URGA 3IX1A 3TZAA 2E0SA 4OHNA 4PETA 2I58A 5ITPA 2CMOA 5B7DA 2OWSA 1MH4A 3TTLA 3MP1A 4G8NA 1FTMA 4Z7EA 1JVYA 1UTHB 5K2YA 2QSXA 3HN0A 3C35A 3HSTA 4ZEIA 1D3KA 4YICA 1MH3A 1SYIA 2H25A 2XXQA 4R2BA 1ZMGA 2VGQA 3MC2A 4LA9A 4X48A 4YZZA 3DP4A 4H0WA 1LB8A 3KEIA 1PC3A 2F6PA 1SYHA 2V3QA 4NF5A 2I48A 3IJXB 1MXWA 1Y1MA 3C4MA 1JW5A 4NE4A 3TKDA 4HW8A 1DTGA 2UVIA 3A09A 5A5XA 3S9LC 1VR5A 4OFOA 3UGWA 4YMBA 3MAMA 1A54A 1B32A 1Y4CA 1PBPA 5L9OA 4NMYA 1BP5A 2V25A 3KBRA 1PDAA 2X7QA 3S9EA 2I3VA 4DE8A 4OYVA 4OWDA 4IY5A 1S7YA 4IO2A 5CMCA 4EQ9A 3TODA 2QMXA 4MF3A 4ELRA 1B1XA 1QJMA 4LVQA 3FVOA 2D5WA 1GR2A 3H6WA 3FXUA 1A7LA 1QULA 4KQPA 1TWYA 2BJJX 5DEXB 1CB6A 1MQDA 4GD5A 4NWDA 4KYEA 3TTKA 1XT8A 4Q8RA 4H67A 3K4UA 4FE8A 1ZU0A 1B1HA 2A5TA 3D4CA 4KD5A 2F36A 3IB0A 3PV0E 4DZ1A 1ELJA 1XHYA 4YKJA 1I6AA 1N76A 2UVHA 2I49A 3IO4A 4JWYA 3THIA 3WAFA 1URSA 3TCGA 1PB9A 1FQEA 2Q9TA 2V84A 3FV1A 1I6QA 3PD8A 4GL0A 4PP0A 5CM6A 2ZMBA 4GRKA 4R6KA 3T9VA 5TP9A 4L17A 4JB7A 5L8DA 2QL3A 4LZ8A 3KG2A 4N13A 4C0RA 1FTOA 3C9HA 4OTEA 2PYYA 4KYDA 5TU0A 1YPNA 3CFLA 2OJTA 2ZYMA 4P0IA 3VVDA 1AIVA 1ZKBA 5HPQA 1JW4A 1BKAA 1B5JA 2XXHA 1POY1 5EHMA 1B7HA 5H8HB 3S9NC 5DTBA 1M5FA 4DXUA 3V5AA 4UA8A 4OENA 3DM0A 3M3LA 3P7IA 4F39A 1FQDA 3SKPA 1MQHA 4PFTA 4QFNA 4F18A 2VOZA 2HAUA 4N6PA 4NWCA 4PFYA 1GGGA 4RA1A 2NVUB 1R9QA 5ICQA 1MXXA 4LZ5A 5I57B 4U4XA 3FXQA 3I5OA 3MBPA 4F2OA 1MQIA 2XHDA 1MM7A 2Y7PA 1YAEA 4G8HA 4E0WA 4ZEDA 2ONSA 3UK4A 3VLWA 2NOOA 2F97A 4NF6A 2QS4A 5FHOA 4H8JA 5TPAA 1OLAA 1L5TA 3VXBA 5KDTA 5F7VA 1MY3A 3H6UA 3IOVA 3C36A 3UIFA 2LAOA 1LB9A 3PMVA 1Y9UA 2F6GA 4WKMA 2QS1A 1OVBA 1MQJA 2ALUA 3OOAA 1LAFE 1N3XA 2GHBA 4FORA 3U92A 3LC8A 2HQ0A 3K1NA 3BFUA 3TAJA 5I2NB 1O63A 4YB6A 5K2XA 5I57A 3Q26A 3IR1A 1MXYA 1OIBA 3KSJA 3PPOA 1B7ZA 1NNKA 3PMXA 4FECA 4F2QA 1LBCA 1IEJA 2VP1A 3PUZE 1QUIA 1IIWA 3S2VA 3SEYA 3C33A 2V93A 4HTGA 4X1DA 3A3CA 4HCYA 4NF4B 2FA7A 2H98A 3OSQA 4H5FA 4OESA 2HEUA 2XXWA 3N26A 3G3HA 3QUFA 4C1UA 5KZTA 2QPQA 4UACA 3WAEA 4R6YA 4R74A 3V8XB 2O7IA 4OVJA 4ELPA 4U4SA 1IZ1A 1M5DA 2Y7IA 3CRBA 3EPEA 1NNPA 5H8NA 1A40A 1D9YA 4O3AA 1T0KA 4NF8A 1OQHA 4R9GA 2O69A 2UVGA 4U1ZA 2G29A 2Q88A 2M8CA 1OLCA 4XKRA 3MP6A 4F22A 2F7AA 3N94A 4I1DA 2O7UA 3OO6A 2I0BA 2F78A 2DWAA 3IAZA 3IOTA 4QSEA 1HSJA 1NKXA 2H99A 2Q8JA 3VVEA 3SEXA 2Q89A 3FATA 1Z7ME 4EXLA 1N04A 2FYIA 2Q2AA 4GL8A 5I84A 2Z22A 3MJNA 1HSEA 3FGSA 5I2KA 1LGBC 5FHMA 5CMKA 2OK2A 3MPLA 4H8IA 4Q30B 4OEVA 3MZ9A 3VLVA 3UN6A 3RGYA 3K6VA 4XKPA 2RC7A 1WODA 2F34A 3OO9A 4YKIA 5EYFA 1SQYA 2DP8A 3TTMA 5AA4A 3KJ7A 3KOTA 4FJPA 4QHQA 5H8QB 1AH5A 4PFWA 3QUJA 2YLNA 2AYSA 4ISUA 2ESNA 3ZKKA 2DOJA 4G4PA 5AE4A 1B3EA 1B58A 1LSTA 2Z8EA 1KWHA 3CR9A 4KYSA 4P11A 2NUVA 3DLNA 1B46A 4M4GA 2XD3A 2Y7KA 3FJ7A 3MP8A 4LZ7A 5I2KB 1Y1ZA 3PUYE 4KPTA 1OMPA 2THIA 1YTVA 1SW4A 1M5BA 2F5XA 2HFBA 4G68B 2XD2A 2O1LA 3RTFB 5B70A 1AL3A 4POWA 1Q35A 2F8DA 2OCUA 3VFJA 3W9WA 2QJEA 2RCBA 3USDA 3FASA 2ZNUA 4ZECA 3PPQA 3UORA 1XC1A 3S9MC 4OFLA 1M5CA 3ODBA 5TP9B 3OENA 2AL4A 2NWJA 5J1DA 5I56B 1P1OA 2HXWA 4OEUA 3TTRA 3R26A 5F1QA 4DDDA 4QFOA 3RT8A 5AA2D 3GXAA 1N0TA 3VE1B 1R6ZA 3CSGA 1N7XA 3TYHA 2GFEA 1LAXA 1B51A 1JETA 1B4HA 2O84X 1I69A 3H03A 1H43A 2AIXA 3M8UA 1B40A 4PE5B 4R9FA 4YKKA 3SEVA 4BLAA 1D4NA 1Y3NA 2OWTA 3B6TA 4U22A 3Q27A 1QVSA 1XOCA 2RF1A 3PMWA 3RT6B 3TDJA 3B6WA 3EHSA 1MXUA 4IGTA 4EDPA 5JTYA 1NMUA 3KFMA 3E9XA 4EQBA 2HAVA 3DP8A 4F3SA 2QS3A 5AA2A 4GIZA 1UIVA 2AL5A 4IB2A 4AB5A 2V3UA 1ZLQA 1JQFA 1LFIA 4QFLA 3ZS6A 4Z0IA 4R6HA 2R6GE 5LOMA 1VE4A 4GWOA 3O2AA 4LONB 1DMBA 4RK9A 2X7PA 3MVXA 5DVFA 5DVIA 5DYHA 5H8QA 1A55A 4QRZA 2WKYA 4U1OA 3TQLA 4ESXA 1WVJA 1XVYA 2X26A 2UVJA 3OXNA 2XX7A 5CMMA 1Y3PA 1LCFA 1ANFA 3M3KA 4G2ZA 4LATA 3VVFA 3EN3A 1H3DA 1MRPA 1QKBA 4ZZEA 4ELOA 3CG3A 3MW0A 3TEPA 3MQ9A 4ESWA 1QUKA 3TUSA 3VDFA 1SBPA 4JXIA 5JK4A 2R71A 5H8NB 3DELB 2ZYNA 3W15C 1S9TA 1DSNA 3Q25A 5ISUA 2REGA 3ILTB 2D3IA 1AMFA 3FD3A 2Z8FA 3N6UA 1QW0A 2YJPA 4ZE9A 3H06B 1MY2A 3LSWA 1USYH 4IGRA 3ZSFA 3KOSA 1B0LA 1LCTA 3IB1A 3O97A 4WEDA 1UIUA 1UTHA 3QXMA 3S4UA 4BDMA 2XXPA 4JWXA 3EHUA 5EHSA 3RUMA 3R6UA 3BKIB 3EF7A 4F3PA 1EU8A 2NXOA 3LR1A 3R7XA 4JSDA 5CBSA 2H4IA 2UYFA 3BBRA 5I59B 1BIYA 1EZPA 4YU0A 3FUZA 1B2HA 3K6UA 3O29A 4H6DA 4F29A 4TLLB 2DYXA 2I4CA 3SEWA 4BDQA 4EF1A 5BWJA 3RTWB 5H8FA 1P99A 4YB7A 3RPWA 2Y7RA 1IXHA 1IXCA 4FAJA 1DPEA 5DEXA 1NH7A 4TLMB 1EZ9A 3B6QA 3OO7A 1OQGA 1DTZA 3I3VA 1P1UA 4G77A 2XXRA 3O28A 4MLQA 4OMBA 1ZIUA 4QFKA 2RCAA 1B52A 2RKMA 4R75A 3SEUA 2ZYKA 3GBAA 4RPNA 3V89B 4EUOA 4R73A 3T9UA 4QSDA 1UTBA 5M2VA 4XKNA 3G3GA 1LAGE 2DQVA 3E13X 3PGFA 5CC2A 3QYTA 1PEBA 3RN8A 4ZDMA 4EXKA 4N07A 2OZZA 4GQOA 2B65A 4I8CA 1RYOA 4RPOA 2B3BA 1HSLA 1MPDA 3H6VA 1SDXA 3FZVA 3IOUA 4PFUA 1NFTA 2O51A 4OFJA 3LSXA 1US5A 1VFDA 2QRYA 1FQAA 4KCCA 4I9DA 5CRYA 1A8FA 5IAIA 3AXFA 1URDA 2F7BA 3PPNA 1N84A 1QUJA 1MDQA 1XS5A 4JBZA 5FTIA 3SDFA 2I3WA 5HM4B 1R1NA 5KCJB 4FIMA 2UXAA 4K3FA 5L9SA 2OBGA 5DVJA 2GRVA 5L9MA 1UQWA 3EHTA 4IO3A 3CFZA 4HCWA 4NF8B 5I56A 4G8MA 1A99A 5ICTA 1MPBA 2I6EA 1PBQA 2XX8A 3OSRA 1TFDA 2Z8DA 4MLVA 3SESA 4ZEBA 2PX1A 3FVKA 1DPPA 3JV9A 1IXIA 3K6WA 4MBPA 3RLFE 3CIJA 3IL1B 2PBWA 1B7UA 4GXAA 2QMWA 4I62A 4G68C 3C34A 3N5LA 4RJZA 5ITOA 4ONYA 4DCYA 4E0XA 1TXFA 2RC8A 4C1TA 3MPKA 3OEKA 4IO4A 1JNFA 3OO8A 4EQ7A 2FNCA 3CG1A 4ZZAA 5AA3A 3I6VA 3MVZA 3GLBA 4IO5A 4X9TA 4F1VA 1MG1A 1B6HA 3VXCA 3T96B 3TQWA 1B0HA 1N7WA 4DLDA 3MVWA 3TELA 1RYXA 2F7CA 2ZXTA 2H5YA 1LFGA 4G68A 1I6BA 3L6GA 1CE2A 1MY0A 5I2NA 2IA4A 3ILUB 4MFIA 3G3JA 3JZJA 2UYEA 4GXSB 3PUWE 3TTNA 3GZGA 4YMAA 2R9JA 3T22A 5AA4B 1FQFA 1H76A 4BDLA 4ELQA 3TMGA 2YPNA 1US4A 3IJOB 4ZEFA 3QSLA 4H5GA 3FV2A 4KI0E
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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