3U94A

Crystal structure of the gluk3 ligand binding domain complex with glutamate and zinc: p21212 form
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Zinc Potentiates GluK3 Glutamate Receptor Function by Stabilizing the Ligand Binding Domain Dimer Interface.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 74
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u94A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u94A02
4RNSA 1B40A 3SKPA 2OK2A 4NF5B 1FTMA 2I49A 2HEUA 5FTIA 4RJZA 1B0LA 3QIMA 3KJ7A 2HXWA 3OENA 1UTBB 2XXXA 3T9UA 1Y1ZA 3TPAA 1HSEA 2B3BA 3Q29A 3UORA 1I6AA 4NF6A 3TTNA 3PPPA 1PB8A 3HV1A 3PUWE 1VE4A 4ELRA 3OO7A 2ANJA 1PB9A 1IIWA 1MXZA 3VDFA 3K1PA 3UN6A 4YU0A 2DP8A 1US5A 1POTA 2ONKE 1Y3PA 1M5FA 3FXQA 4G68A 2PBWA 3GBAA 3IX1A 1MDQA 3CFZA 2UVHA 3KEIA 3T22A 3PD8A 2XX9A 4P0IA 4YKPA 3IL1B 4AB6A 1II5A 2Y7PA 2I4CA 4OENA 3HPIA 5H8QA 3I5OA 3H4ZA 1N84A 4R6YA 4YKIA 4QF9A 5H8FB 1B3EA 3H03A 2O84X 5ICTA 3VVFA 2Q88A 3E13X 1B7UA 4U22A 4DZ1A 3CFLA 5H8HB 3V5AA 3LSWA 4ZEDA 3RY3A 5KZTA 3C34A 3KOTA 4IO3A 3T9VA 1FQDA 3ILTB 3O66A 3MW0A 5CBSA 4I8CA 3CR9A 4LQ2A 4XKNA 3M3FA 2DE4A 1A40A 5AA2D 2KLFA 4F18A 1KWHA 3CFXA 2I48A 4GLIA 2UVJA 4R6HA 2Q2AA 4ZZAA 4R74A 1LAHE 4ZS9A 3CSGA 4X9TA 1NMUA 4ZECA 4F2QA 5HM4B 2H98A 4ZEBA 4X48A 1S7YA 1JW4A 4WEDA 5LOMA 2QS3A 2O1MA 3TEPA 1Y4TA 3RN8A 4JWYA 3I3VA 2NXOA 3ZKKA 2Z8DA 2VGQA 3TTRA 1MXUA 3VLUA 3QSLA 1PDAA 1QVSA 1OVTA 1B1XA 5FTHA 3EQ1A 1Y3QA 3K01A 1NFTA 2Z8EA 2Q9TA 3FVOA 4G8NA 3IJOB 1N7WA 4R9GA 3V8XB 4R2BA 3DM0A 4YKKA 1B6HA 2QPQA 1IXHA 4N6PA 4IO6A 1UTHA 5CBRA 2QJEA 3FV1A 3MVZA 4QHQA 1QKAA 1RYOA 4DXBA 3WAEA 5DT6A 5CMCA 1FQCA 3FD3A 1OLCA 1JW5A 1XVYA 3SEUA 4HW8A 1CE2A 4U4SA 2DWAA 4F1YA 1SW1A 3D4GA 1USYH 3CG3A 3RLFE 3MPLA 2XHDA 3MZ1A 3OD7A 2ZYOA 4OFJA 4H5FA 5TU0A 1FTKA 3PUZE 1H76A 2NOOA 4DXUA 1I69A 1IUDA 5ICQA 5TP9B 1ZBMA 3M3LA 2OJTA 1DMBA 1MH4A 1P1WA 3DP8A 1R6ZA 1P1OA 4I9DA 3RT6B 3UIFA 3PPRA 1MM6A 3P7IA 1MH3A 3A3UA 3VLWA 2H9BA 5KDTA 3SEWA 4QSDA 3AXFA 4GL0A 3MP1A 4DCXA 3FJGA 4NE4A 3TUSA 3QAXA 2Y7RA 1NNFA 2CMOA 4PQJA 3VVEA 4EXLA 4BDMA 4ZEFA 3RT8A 4ZEIA 3T93B 1GR2A 1EU8A 2ABHA 1Y1MA 1B7HA 2RC7A 3PD9A 4DE8A 3IK6B 3C9HA 1FQEA 5ISUA 1CB6A 4KR5A 1UTBA 1A8FA 3O28A 3KN8A 2YLNA 2RCAA 4KD5A 4EXKA 1POY1 3GBBA 2P0SA 1D9VA 4C0RA 5EYFA 2ALUA 5AA4B 5EHSA 1VFDA 4F3BA 1I6BA 1HSLA 2XXPA 3CVGA 4BDNA 3LSFB 2R9JA 3ECRA 2I3WA 3U93A 5AA1A 5H8SA 3QYTA 3TTMA 2F6PA 2F35A 1MXVA 1SI1A 3E3KA 4OESA 1B4HA 4GL8A 3EN3A 3Q27A 1B52A 3SESA 2PT1A 1H3DA 2QSXA 3ZSFA 4XTCQ 1MS7A 4ECFA 4KCDA 3O29A 2XD2A 2PX1A 2PVUA 5I57B 5I2KB 3SETA 1JEUA 3PUVE 1MY0A 1JNFA 2FA7A 3WAFA 1N3XA 3OO6A 1MXYA 3T9HB 5M2VA 3TDJA 4MLVA 4QFOA 4ESXA 1EH3A 5FHMA 2ONRA 2Y7WA 1DOTA 1Q35A 1R1NA 2Y7KA 2UXAA 1RKMA 3SDFA 4DLDA 4E0WA 3U94A 1MQGA 4IO5A 1YAEA 1DTGA 1MXXA 4FECA 1I6QA 4R6KA 3IR1A 3IOVA 2XXWA 4X1BA 4EQBA 2UYEA 4KYDA 4Q30B 4K3FA 4KCCA 3LSLA 1O7TA 1ATGA 4JWXA 3TYHA 3FJMA 2X26A 5F1QA 3OSRA 4NEDA 3HO7A 2I6EA 3VV5A 2IEEA 3PMWA 1XVXA 2H4IA 1A7LA 2ZXTA 3LSXA 2DWHA 5J1DA 5IAIA 4IGRA 1GGGA 3LBSA 2G93A 5B70A 1D4NA 1SI0A 4OMBA 4ESWA 4ONYA 4TOZA 4F22A 4C1UA 5I56A 3ZS6A 3FGSA 1JETA 4H1XA 1B51A 1PB7A 3G3JA 1M5CA 5ITOA 3U72A 5CMMA 3BBRA 1BKAA 4EF1A 5I59A 3DP6A 1ZKBA 3K6XA 1JQFA 4GD5A 4MF3A 2F78A 1N0TA 5CI5A 5ELVA 5TPAA 2V84A 4GIZA 4FEDA 3FUZA 4TLLB 3K02A 3TQWA 4MH5A 5CC2A 2H25A 2QS1A 5A5XB 4QRZA 5I58A 2HFBA 2HQ0A 1QULA 1MRPA 5TP9A 2IA4A 4IY5A 3EHSA 1B3FA 1MPCA 3IOUA 3M8UA 3B6QA 4NF8A 3KOSA 4MFIA 4ELOA 3EPEA 3TODA 3R6UA 2O69A 3H3GA 2DSFA 2DVZA 1FQBA 5H8NA 2O1LA 4FIMA 1AOVA 2F7CA 4IGTA 3GLBA 1MM7A 4FJPA 3EHUA 3K00A 1TFDA 4QFPA 3G3HA 3TAJA 2QMWA 3PGFA 4TLMB 3IO4A 2OLBA 1SW4A 4HCWA 1LAXA 3HSTA 1MY4A 3IB0A 1MG1A 4JSOA 1A99A 4PFWA 3O9PA 4I1DA 3O6GA 1QJMA 4F31B 4PFYA 2Q89A 1AIVA 1IITA 4JDFA 2Z22A 4M4GA 1MQJA 3FV2A 3VXBA 4RY1A 2O51A 5AA2B 3E4RA 4EDPA 2DWIA 1JEVA 3VE1B 3KGCA 4OERA 5I2NB 4N13A 2UVIA 4OVJA 1N7XA 4PE5B 4Q5TA 4NTLA 4G8MA 4GQOA 4P11A 1B58A 2GHAA 3EHTA 3CSBA 3T96B 3PU5A 4RA1A 4AQ4A 3N6TA 4O3CA 4F2OA 3USDA 3OMBA 2HZKA 3E9XA 2I3VA 2H5YA 2VHAA 3M3KA 1MQHA 2A5TA 1URDA 2WKYA 3PUYE 3K6VA 2ZYNA 4GOTA 3U8QA 4QSCA 3UA8A 2F7AA 3FIRA 3BFUA 2DWJA 5I2KA 3H6UA 4H8IA 2F5XA 1TXFA 1ANFA 2Q2CA 4HS7A 3K4UA 5DEXB 4YAHX 2HCAA 3K6UA 1LFHA 3KFMA 1URGA 1XHYA 2HZLA 1QUIA 3TCGA 3C31A 1OIBA 1ELJA 1FTJA 1MPBA 4LONB 4ZDMA 1EZOA 2F34A 3HN0A 1DPPA 3DLNA 5K2YA 1B05A 2FNCA 1B5JA 1BP5A 3H6WA 3C33A 4NF6B 1IXIA 3IAZA 2XD3A 4OEUA 4JWOA 2F97A 4ISUA 2AYSA 4G77A 2YJPA 4DCYA 4RPNA 3K0VA 2GRVA 3FZVA 3Q28A 3FJ7A 3KJTA 2RKMA 2VP1A 2XXIA 3G3FA 2V3UA 1TWYA 4FATA 4POXA 3UK4A 1LBCA 4F3GA 1URSA 3FXUA 5H8QB 4NF4B 1VR5A 2R71A 1T0KA 3SEYA 4WEPA 4KYEA 1IXCA 3IO6A 5L9SA 4ZE9A 2ZNTA 3IOTA 1LGBC 3MP8A 5CRYA 4F1UA 1OQHA 4NF5A 4XIGQ 5JTYB 2UVGA 1LLSA 3KG2A 4Z0IA 2OBGA 2OWSA 4IY6A 1AL3A 1SW5A 1YPNA 4ELQA 4U2RA 2OWTA 2QL3A 3RTFB 4U1OA 1USYE 4EF2A 3F11A 2RC9A 4YMAA 3OOAA 4GF8A 3RUMA 2V25A 1M5EA 4U1ZA 1L5TA 1LCTA 3D4CA 3ILUB 2DXYA 1ZJLA 1SQYA 4OTEA 3N5LA 2XXVA 1SW2A 1GVCA 3O6HA 4KYSA 1R9LA 5H8FA 1B46A 2P2AA 3IORA 3PMXA 1D3KA 1FW0A 4H8JA 3QK6A 5DTBA 2VD3A 4RK9A 1Y9UA 1JVXA 5H8HA 4JB7A 1B5HA 4XKRA 4NWCA 1SD3A 1QUKA 2Q8JA 1IZ1A 4G8HA 2RC8A 1B1HA 2ZNSA 2NUVA 2R6GE 1PEBA 3ZKLA 1UTHB 1GV8A 2AIXA 4LVQA 4F3SA 4F1VA 1NL5A 1SDXA 4ELPA 4YKJA 5CMKA 3IJXB 2V3TA 4TQUQ 3K2DA 4QFKA 4DDDA 2Z23A 4QFLA 3PPQA 3O97A 4LQ5A 1QW0A 3G3GA 3MVWA 1M5DA 1GTKA 3W15C 4XKQA 5KCJB 5JK4A 4DXCA 1B32A 4IO2A 1LCFA 3TFLA 3HCQA 1LSTA 4Z7EA 3CG1A 1EZ9A 2CZLA 5DVJA 4LA9A 3LC8A 4H5GA 3S9EA 2D5WA 3A3CA 1IEJA 1Z7NE 4BDRA 1FQFA 4H6DA 1R9QA 2P1SA 2Y84A 5KDTB 5B7DA 4GXAA 1UIVA 5L9OA 1DSNA 2Y7IA 5EHMA 3TTLA 2DQVA 5DEXA 5FHOA 5IKBA 3RTWB 2E0SA 1N76A 1P1UA 4EQ7A 1AMFA 1B9JA 3TELA 1H45A 1B3GA 1NNPA 4QFNA 3B6TA 4WXJA 1PBPA 1A55A 4OYVA 1N3WA 1XC1A 4H65A 1Y3NA 1MXWA 1ZU0A 2DE2A 2F6GA 3HHGA 1NNTA 3N94A 1OVBA 2XX8A 4YB5A 3Q26A 3SERA 4THIA 1JW1A 4OHNA 1UQWA 2PMSA 2AL4A 4U23A 4IO4A 1MY2A 4Q8RA 4LZ8A 4N07A 3ONMA 3S9MC 4PETA 4ND9A 3V83A 2RF1A 3PV0E 4FE8A 2I0BA 3QUFA 3O2AA 1FCKA 3OXNA 4KPTA 5BUUA 4NWDA 1P99A 1XS5A 1SBPA 3PUXE 1SYIA 3C32A 1WODA 4OZ9A 2VOZA 3RGYA 3MBPA 3QUJA 2W7YA 4NF4A 4Q0CA 3BKIB 1Y20A 1ZMGA 3OEMA 1US4A 1MY3A 1HSJA 4OWDA 3UP9A 2X7PA 3MJNA 1ZLQA 4OQOA 4HCYA 4UACA 4FAJA 1NH8A 5JTYA 1B3LA 4AB5A 1VFEA 3MZ9A 2UYFA 3KZGA 2HAUA 4YB7A 4U21A 1PBQA 1QUJA 3TTKA 3N6UA 4HTGA 3S2VA 2REJA 3K6WA 1OMPA 3H06B 4JBZA 3OSQA 4F19A 2I58A 5AA4A 3G3IA 4RYAA 5I84A 1P1NA 3GXAA 3SEVA 3L6GA 3G3KA 1S9TA 2LAOA 2XXHA 2QRYA 1FQAA 4ZEKA 1YTVA 1TFAA 1PC3A 3VVDA 3MZBA 2ZNUA 1WDNA 5F7VA 2F8DA 4BDOA 3MAMA 3OELA 4R9FA 4YICA 3U92A 4QSEA 1NKXA 3MP6A 3UGWA 4RK2A 5ITPA 4F39A 3MUQA 3K1NA 4GVOA 1LAGE 5I57A 2O68A 1NNKA 4GWOA 4XXUA 4P0GA 2THIA 4LZ5A 2NWJA 4BDQA 4RXLA 2GFEA 3RQTA 5L9MA 1F9BA 4O3BA 3H7MA 4KHZE 4KQPA 3DELB 4ZZEA 3PMVA 3IB2A 2QS2A 4MBPA 1MQDA 3MC2A 4MLQA 2D21A 4G4PA 3Q25A 4UA8A 5I56B 1AH5A 4R72A 1BTJA 1B5IA 1LAFE 3KSXA 1DTZA 1H43A 2F36A 3FVKA 4YZZA 3L6HA 3MVXA 3SEXA 3KN7A 5I59B 3TKDA 1IXGA 3LR1A 4OXVA 5DYHA 1S50A 3R7XA 4IO7A 5TPAB 2E1SA 3JYRA 4DIGA 2XXUA 1FTLA 5K2XA 1MQIA 1VSOA 3DP4A 3JV9A 2OZZA 1WVJA 3S9NC 2PT2A 2GH9A 4EQ9A 3U1OA 4G68B 2O6AA 2DYXA 5KCJA 2G29A 1MY1A 3MPKA 5I58B 2DE3A 2RCBA 4BLAA 5AA3A 2QS4A 1OLAA 3BFTA 4FORA 5HBCA 3HHFA 3KSJA 4NF8B 4XKPA 3KBRA 1Q1KA 3B6WA 3OO8A 1UIUA 1SVXB 3THIA 3I6VA 3FATA 3T66A 3FVGA 4JSDA 1N04A 1FTOA 4C1TA 5H8NB 1M5BA 3N26A 4OFLA 3R26A 1H44A 4IB2A 3S9LC 1RYXA 1BLFA 2ZYMA 2DS9A 4LP2B 4POWA 2PYYA 5AE4A 2I0CA 4JXIA 4EUOA 4G68C 3MVYA 4GFRA 3QXMA 4L17A 4RPOA 2X7QA 3K1MA 5JEIA 2B3FA 1XT8A 4R75A 2ZYKA 2QMXA 3C36A 1P1QA 3OO9A 1B4ZA 3TQLA 2ESNA 4H67A 4LUBA 4E0XA 2HAVA 1LFIA 1LFGA 2FYIA 3VLVA 3ODBA 3O6IA 4F29A 5A5XA 4F3PA 1YCJA 2DOJA 2BJJX 4NMYA 2XXTA 2ZMBA 2REGA 4LATA 5BWJA 1MDP1 3H6TA 3MQ9A 1MPDA 3PPOA 4YB6A 3VXCA 2NVUB 4LZ7A 3B7DA 2DVCA 1B2HA 3CIJA 3RPWA 5DVFA 3RNNA 1D9YA 2OCUA 3JZJA 3PPNA 3W9WA 4PP0A 3W9VA 2D3IA 4GRKA 4PFUA 4BDLA 4X1DA 1OQGA 1J1NA 1XOCA 3EF7A 4OFOA 1LBBA 3G7WA 4OETA 2A5TB 3GZGA 2GHBA 4U4XA 1Z7ME 3OEKA 4I62A 2XXYA 3KN3A 3S4UA 5CM6A 5L8DA 3V89B 3FASA 2ONSA 1IQ7A 4R2FA 1B7ZA 1B3HA 3LUYA 4R73A 4FEBA 2I4BA 4GXSB 2AL5A 5FHNA 1O63A 2A5SA 2YPNA 1O64A 1EZPA 3TCFA 2B65A 4KI0E 2DXRA 4YMBA 3C4MA 5AA2A 5CMBA 1JVYA 1BIYA 2M8CA 5HPQA 1ZIUA 4O3AA 1TT1A 3FXRA 4G2ZA 5I2NA 4M1VA 2O7UA 1LB9A 3IOWA 1LB8A 2H99A 3C35A 2F7BA 2V3QA 3MWBA 1NH7A 2V93A 4OEVA 1A54A 1B0HA 2XXRA 4H0WA 3T9XB 3H6VA 3FVNA 1Y4CA 2VD2A 2RINA 4WKMA 3TCHA 2XXQA 2O7IA 2Z8FA 5DVIA 1ZTYA 3TMGA 3CRBA 4ZE8A 4PFTA 1QKBA 1SYHA 2XX7A 3CI8A 3IB1A 4KFQA 1DPEA 1A8EA 3VFJA 3TZAA 3A09A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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