3U9DA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-24) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 13-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
total genus 107
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9dA03
3VETA 3L6QA 3L4IA 2IIRA 3O5BA 1P8ZA 3L0QA 5AQMA 1WOQA 5AZJB 2P9UA 1GLCG 4BG9A 3AARA 3BP8A 4BR0A 3A0IX 4CBWA 2AP1A 4C23A 3MN5A 2Q36A 3LDPA 2YI1A 3GDQA 2FLOA 4JD2A 2BTFA 5BRDA 4BRDA 4FSVA 2BUPA 3QICA 4H0OA 5E84A 5KPTA 2ZGYA 2Q31A 5EXWA 2P9NA 4MO5A 3VEVA 5ADXA 2ASOA 3BEXA 1NGGA 2D0PA 4BRCA 4FPBA 4CD1A 5KPZA 3R6MA 3H1VX 4H5VA 5LY3A 2I7NA 4CBUA 3CQYA 5F2RA 2QWRA 1TYQB 3IMXA 4A2AA 1ATNA 3LM9A 2ITMA 1BO5O 4AM6A 1QQMA 2E8AA 5AQVA 1EQYA 2Q97A 4B1XB 5FPNA 2P9LB 2Q2RA 3ENHA 1KXPA 2ZF5O 5JICA 5F0XA 4H0XB 1NGJA 5ADXH 1XC3A 4FWQA 4A62A 4IXCA 3CJCA 4RTFD 4WQ4C 3WUHA 2Q0UA 2W40A 2OANA 3O1WA 4CZLA 5E26A 3FLCO 1E4FT 4MLHA 4BVPA 5AQSA 1T6CA 3ZEUA 3C0BA 4BRMA 3W3DA 2E88A 3AY9A 2P9IA 3H6EA 1TUYA 3LL3A 3CI5A 1MWMA 3JS6A 5BRFA 2E20A 3QFPA 1IG8A 4HWIA 4PL8A 5AQJA 4EFHA 1MDUB 3VESA 1NGIA 3O08A 3QBWA 4IZ9A 4ISGA 2V7YA 4FO0A 4ISFA 5TKYA 4FWOA 2GTDA 2QWOA 3UKRB 2FF6A 4QS8A 1CZAN 1YVNA 1SZ2A 2YJFA 1IJJA 4CZJA 4BRNA 3ZETA 1WUAA 2HF3A 2E2NA 4PKHA 5EVZA 3VEOA 3CIPA 4O5FA 4BC5A 2NRHA 1C0GA 3UKUB 4NO7A 3WXIA 4WQ5A 5CE3A 3S41A 3H3OB 2A3ZA 5AZJA 1RFQA 4QS9A 2E2QA 5BRHA 5AQWA 3W0LA 1DEJA 1ZC6A 3FZMA 5AQTA 2V51B 4E1JA 2GWKA 3C7NB 5AQZA 3DXKB 1X3NA 2ASPA 2QWLA 4B9QA 1V4SA 3CQXA 1Y64A 3VOVA 1YUWA 2IVNA 5FPEA 4CZKA 3EL2A 4BREA 5AQNA 1QHAA 5AQRA 2FSJA 1BG3A 5EOYA 1NBWA 5I9EB 3HSCA 5BPLA 4CD3A 4EHUA 1NGBA 2V7ZA 2QWMA 5AQIA 1KAZA 3M6GA 1BA1A 3GG4A 1NGFA 3DWLA 5AZIB 4BRKA 1MA9B 3SMPA 5AQGA 4RWTA 3VF4A 2V52B 3CHWA 5FPMA 3U8XA 3B8AX 3FZLA 4WYBA 3M1FA 4H0TB 1E4GT 2P9LA 2D0OA 1DKGD 2QXLA 4BC3A 5AFUA 4Y0WA 5JLHA 3FE1A 1HLUA 1Z6RA 3CETA 3ULEB 4K43A 2J4RA 4FWPA 2QWNA 5KQDA 3IUCA 3U4LA 2W41A 3IDHA 4K42A 3ZX0A 4B1YB 3VEZA 4BC4A 4XH1A 4GNIA 2CH6A 1NGCA 2E2PA 4BRQA 3WQUA 4FWNA 4BQLA 3AAQA 3A5MC 3JXUA 4M63C 2P9SB 4BVOA 2FSKA 4BRPA 1GLDG 3BF1A 1NGDA 1YXQA 3FR0A 2GELA 4IWVA 1XUPO 3MMVA 5AQUA 5AFUH 4PL7A 5BPNA 2FXUA 3SLCA 3O8MA 1GLAG 2D1KA 4I6MB 4M7YA 4IO8A 2E1YA 4CZIA 2I7PA 3QB0A 4CZHA 1NM1A 1SAZA 5FPDA 2YJEA 3UKRA 3MK6A 1U2VB 4EIAA 4H5RA 5BR9A 4FWKA 2F9WA 1BUPA 2IVPA 4Z94A 4H5NA 4M7XA 3R8EA 5EX5A 2PBDA 3FZFA 4WQ4A 1KAXA 3KHYA 1BU6O 4RCHA 3WQTA 5AQXA 5BPMA 3UKUA 1JCFA 1NGHA 3SMSA 3VGKA 3TU5A 3LDNA 2P9NB 4CZEA 2QM1A 4L3QA 2AA4A 4BC2A 2P9PA 1X3MA 3VGMA 3QMLA 3O1BA 1BDGA 4DB3A 1HKGA 1XQSC 3EKSA 5BN8A 3DXKA 3LDLA 3A5OC 1RGIA 2A40A 4BGAA 3GOIA 4JNEA 2A5XA 4A2BA 1NMDA 3VEXA 1QQOA 3VF2A 3KZBA 2YHXA 3CERA 2P9KB 1HX1A 1SQKA 4FWRA 3CJ1A 4DHYA 3CJAA 3U9ZA 1K8KB 5AQYA 2VYPA 1HUXA 3RSEB 2E1ZA 3O4WA 2IVOA 1LOTB 3HBTA 5AQLA 3FGUA 4BQZA 3FFKB 5B8HA 5AZIA 2HF4A 3LDQA 2YCHA 3IFRA 1G99A 4K41A 2FF3B 2UYTA 3ZEUB 3D2EB 1T6DA 3G25A 3ULEA 4BR9A 3R9PA 4FWSA 1TUUA 3WXKA 1HPMA 1GLLO 4BR2A 3GL1A 2HMPA 4BRGA 1NGAA 3A5LC 3FZKA 4O8KA 4JN4A 4FOEA 4BR7A 2CGJA 3CJBA 1MWKA 2VCPA 4B1WB 1QQNA 1NGEA 3H45C 4BG8A 2P9SA 1TYQA 1QZ5A 2D4WA 3H1QA 2ASMA 3VGLA 3H46O 3HI0A 3WXJA 2FSNA 5AQHA 3DXMB 3TPQA 4BROA 4EAHD 4CJ7A 4FPAA 4HTLA 3FZHA 4H0VB 3WEEB 4MLEA 1X9JA 3VF6A 3CJ9A 3D2FB 3CJ7A 4MO4A 3MCPA 4JHDB 5BN9A 1U2VA 2H3GX 4FOIA 3UE5A 5LJWA 3ZX2A 4XEIA 3A8YA 2YHWA 1NLVA 1QZ6A 2A6AA 3I8BA 3EO3A 4H0YB 4ISEA 4CZGA 1NWKA 4A61A 3O80A 2A42A 1ZBSA 3EN9A 4AM7A 4FWMA 4DCHA 4YDUC 1BOTO 3H3NO 1D4XA 2EWSA 3ZX3A 4CBXA 5KPRA 1C0FA 1OKJA 1RDWX 3J8AA 3UB5A 2QW9A 5BREA 4YDUA 2GEMA 3BUZB 3MN7A 3ID8A 1ATRA 1U6ZA 4JAXA 2P9UB 5ELZA 5AR0A 3QDKA 2CH5A 1T44A 3QFUA 3A5NC 3VEYA 4IJAA 3HTVA 4H03B 1BWFO 2P9KA 3ATVA 4KBOA 3GE1A 3QBXA 5F1XA 3EZWA 2PAVA 3MN9A 4JD2B 2WUSA 1K8KA 3DJCA 4CZMA 1JCGA 3M3ZA 3DAWA 4QS7A 3RSEA 4B1UB 4H5TA 4F9OA 4CZFA 5AQPA 2ZWHA 5AQKA 1Q18A 1HJOA 1V4TA 2F9TA 3C7NA 5LJVA 1JCEA 3D2EA 1ZXOA 2GWJA 3P4IA 3VENA 4B1VA 1LCUA 2YHYA 3O6WA 5EY4A 3LM2A 3HM8A 4IJNA 5KQ8A 4BRHA 2CGKA 2NZTA 4XH5A 3VEWA 2NLXA 3ENOA 4FWLA 3SJHA 4PKIA 5JMVA 2CGLA 4K25A 1H1VA 2VWBA 3U9DA 3WXLA 4DQ8A 4BR5A 2ZGZA 3KVGA 3VERA 5JLFA 4BRAA 1GLBG 4H0PA 3EKUA 4EHTA 1DGKN 3BF3A 1S3XA 3GBTA 2QWQA 3AAPA 3DXMA 4BRLA 4BRIA 3LDOA 1ESVA 2DPNA 4WQ5C 1GLFO 3MN6A 2P9IB 2QWPA 3MDQA 1ATSA 5AQFA 3WEEA 2Q0RA 4GY2B 4BR4A 2GUPA 3D2FA 3OHRA 3ATUA 1HKBA 1HKCA 4FL9A 4JHDA 1BA0A 1S22A 3HZ6A 4H5WA 4J8FA 2P9PB 4CI6A 2E2OA 2A41A 4BGBA 2Q1NA 4NB4A 1Z05A 1GLJO 1R59O 4LC9B 3VPZA 4BRFA 3WT0A 1YAGA 1KAYA 3F9MA 5AQOA 3D7EO 1J6ZA 3I33A 3SK3A 3ZETB 4XH4A 4B1ZA 1GLEG 4PKGA 5AQQA 4I6MA 2HOEA 2KHOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F7TA 3O5BA 4DR3K 2XY7A 1P8ZA 2OPPA 3MWPA 1IBKK 5AQMA 4JI7K 3ZYYX 2QI2A 4CBWA 1GOBA 5AJ3K 3LDPA 4JD2A 4DTMA 4DWIA 1K6YA 4LFAK 4LD0A 3V9XA 4F3OA 2D0PA 3CFPA 1BISA 4B9MA 3CQYA 2QWRA 1JLGA 3IMXA 4ELUA 3THWA 3DMJA 4CEQA 3JAMO 1U47A 3TAEA 1YJ9N 2P9LB 3ENHA 4MFBA 5JVGL 1CXUA 1VSDA 2HMIA 5HRSA 2BDPA 2BE2A 4A62A 2VQEK 3E9PA 4FLZA 2W40A 4KKOA 2OANA 4C1NK 1E4FT 4JKAA 3NE6A 5AQSA 3LPTA 3NGYA 2HNZA 3HPOA 3V9UA 4OPHA 3LL3A 4C8MA 2YHBA 1MWMA 3S3OA 3MXMA 4I7FA 2O4GA 4NCAA 5AQJA 1MDUB 4E0DA 3T19A 3C95A 3RRHA 1N34K 1VSMA 5TKYA 4FWOA 4BDYA 2RHKA 1VHXA 4QS8A 3SQ0A 1CZAN 4CEEA 1IJJA 2HBLA 4BRNA 3ZETA 1WUAA 4CJEA 5EVZA 3VEOA 4O5FA 4O0JA 4V19S 1IKWA 2NRZA 3ASMA 4M3UA 4WQ5A 5AZJA 3CCEN 1S1TA 5BRHA 5AQWA 1DTQA 3OYJA 5AQTA 2V51B 3TAMA 1WB9A 3AV9A 5AQZA 3OYIA 1X3NA 2ASPA 1V4SA 3CQXA 3THXB 4A5BA 3ZCMA 1SKSA 5FPEA 4FW1A 2FBVA 3OYNA 1T7PA 4O5BA 1EWQA 1QHAA 2QXFA 4X65K 1FK9A 3L2UA 1VK0A 1W7AA 5BPLA 3L3VA 4CD3A 1LW2A 1RT3A 3OA9A 4J2AA 1QSLA 3D0PA 3GG4A 1X9SA 3SMPA 5AQGA 3AGKA 3VF4A 4FLUA 1LWCA 3CHWA 3FZLA 1SUQA 4H0TB 4O44A 4CFCA 2QK9A 1HLUA 3AA2A 3PX4A 3CYGA 1EXQA 4IFVA 5CYMA 2UXCK 3KLEA 4KPYA 4FWPA 2QWNA 5KQDA 3RR8A 3V1OA 2IC3A 3KK1A 3ZX0A 3E9OA 4B1YB 3CC7N 3K5NA 4IBNA 4OPAA 3VEZA 4GNIA 4DTXA 3QEIA 3TAGA 3JXUA 2P9SB 4YHHK 4JI0K 2FSKA 2KLAA 3BF1A 1TK5A 3FR0A 3O4QA 1XUPO 5AQUA 4J2DA 2FXUA 1UOCA 3D6RA 3SLCA 3SUPA 3O8MA 2JGUA 2D1KA 4Z4EA 3MEDA 2ITGA 4DV5K 5FDLA 1BQMA 1XC9A 2PFUA 1RTIA 2I7PA 3QB0A 4B3SK 2YJEA 2KTQA 4M3XA 4FZYA 1U2VB 5BR9A 2IVPA 4A5AA 4FLYA 3R8EA 2PBDA 2FC0A 5CR4A 4FM2A 3T7ZA 1JLFA 5BPMA 3AVFA 1JLBA 4CGJA 3HO1A 1JCFA 1NGHA 3VGKA 3ITHA 3SPZA 2QM1A 4BC2A 4CJ5A 4KB0A 4KHNA 3O1BA 4DKWA 1HKGA 2HHTA 3EKSA 4NLBA 4N41A 1BI4B 3RRGA 3AVLA 3G71N 4BGAA 4JNEA 2A5XA 3SQ4A 4B9TA 3VEXA 1QQOA 3VF2A 2HW3A 4FLWA 4I2QA 3VQ4A 3T1YK 4B8CA 3KZBA 2YHXA 1HX1A 3OYAA 4FWRA 4DHYA 1IH7A 4CJQA 1TKTA 4DTNA 3U9ZA 4A57A 4DSEA 5AQYA 3SUNA 1HR0K 4FCYA 2E1ZA 5GIPA 3VQPA 4E89A 3K5MA 4ID1A 1LOTB 4BQZA 2IDOA 3FFKB 1REVA 3LDQA 4IFEA 5FLXO 3ZT0A 4LH4A 3J7YP 1VSJA 3G25A 4IOAL 2DTUA 4BR9A 3R9PA 4A59A 1VQ7N 3SV4A 4BRGA 4GKKK 1BL3A 4BEBA 3WNHA 1SKWA 1MWKA 1TAQA 4CHYA 3PSIA 2Y1IA 5I42A 3RR7A 1NK0A 1ZYQA 4IDHA 3CMEN 3RMDA 2O8EB 1HQEA 2NNWA 2ZE2A 4JS4A 4KFBA 3T3FA 1OH6A 2D0CA 5KI6A 4JI5K 3NF9A 5GAHP 4PUOA 3SNNA 1GOCA 2R7YA 4H0VB 1X9JA 1VQ9N 3VF6A 3D2FB 2HBMA 3BY5A 4NCGA 1HJRA 3AO5A 3V6DA 1J5EK 1WBDA 1NU0A 3A8YA 1QZ6A 5CZ2A 4CHPA 3I8BA 3PX0A 4CF1A 2GV9A 3V9ZA 1NK4A 3BZCA 5J2NA 4F3TA 4DSIA 1NNEA 1KRPA 4BE2A 3H3NO 3ZX3A 3TSPA 3ZSRA 1OKJA 3NGZA 1L3TA 2OPSA 4FK2A 1RDWX 3UB5A 1HRHA 1WAFA 4E1NA 2G8FA 4WFAL 4Z4IA 3ID8A 5ELZA 3QDKA 1T44A 3A5NC 1ASVA 5LL6Z 4FJ9A 2QKBA 4BE1A 1KFDA 2P5GA 4DTSA 4KBOA 4FJNA 5F1XA 3NH0A 3MN9A 3RWUA 4JD2B 3DJCA 4CZMA 3DAWA 3RSEA 4M3TA 3TTCA 3DRPA 2Z1IA 1BHLA 2DFFA 3V9SA 5AQKA 4CJSA 2XO7A 5LJVA 3QEWA 1JCEA 2VGMA 5EY4A 3LM2A 3THWB 3HSTB 3VEWA 3PIOL 5J2PA 3SJHA 1NG9A 2CGLA 2VWBA 5KRTA 4DG1A 3HYFA 4DV6K 4Z4GA 2ZGZA 1RDUA 3VQAA 3KVGA 1TK0A 1ITGA 3VERA 1KSPA 3QESA 4H0PA 3NAEA 3CPWM 3CPEA 3OYDA 3QO9A 4OVLA 2Q3SA 4AF1A 1QVGM 2HSTA 3ZSQA 4DS5A 3DXMA 4CJPA 2OTJN 4JK9A 5SZTA 3MN6A 1VQNN 4CF9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3IS9 A;  5CHI A;  4FLV A;  1NGA A;  5HRP A;  4JKH A;  3FZK A;  4DTJ A;  3ZLJ A;  1EP4 A;  3VQB A;  3NVM A;  4HCB A;  2D5R A;  1QQN A;  3S3M A;  2P9S A;  1TYQ A;  3CCV N;  1QZ5 A;  3VQ6 A;  1RT6 A;  2OZM A;  3VGL A;  1XMQ K;  3HI0 A;  2YNF A;  3MEG A;  5AQH A;  4DS4 A;  5HRO A;  1RBU A;  1SKR A;  4CHZ A;  4KRF A;  1NK5 A;  4M42 A;  4MO4 A;  3KD1 E;  4JHD B;  1U2V A;  2H3G X;  4FOI A;  4JKD A;  5HL7 L;  3HOT A;  5HLF A;  4XEI A;  1RDA A;  1NLV A;  1RT1 A;  2A6A A;  3EO3 A;  4ISE A;  3TTF A;  1XHX A;  3M8S A;  4M3R A;  4LF9 K;  4WF9 L;  3EN9 A;  4DQR A;  4AM7 A;  2ZQB A;  1RBT A;  2B4J A;  3SBG A;  4DCH A;  3LWL A;  4PY5 A;  1S6P A;  1C0F A;  4R79 A;  3RMC A;  4K8Z A;  2KZM A;  3I8D A;  1DLO A;  2KKZ A;  3KWG A;  1RDC A;  1B9F A;  4YDU A;  4ILJ A;  3PSF A;  3MN7 A;  5AR0 A;  4LFB K;  3T1H K;  4IJA A;  2QTD A;  3G4S N;  1BWF O;  3ATV A;  3ID6 A;  4F2R A;  3GE1 A;  2PAV A;  2WUS A;  2Z1H A;  1Q7Y O;  3M3Z A;  1JJ2 M;  4QS7 A;  4AHV A;  4I2P A;  2HBJ A;  3UIQ A;  4JYA K;  4BWJ A;  3LZI A;  4CEZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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