3U9DA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-24) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 13-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein, protein binding
source organism Drosophila melanogaster
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 107
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9dA03
1BO5O 4MO5A 3DXMB 3FZKA 3VESA 3H46O 3CQYA 1XQSC 5AZJB 3EKUA 5KPRA 3MN9A 1BWFO 4DB3A 1WUAA 3FGUA 4BRAA 1RDWX 2QWQA 5AQOA 1WOQA 1U2VA 1IG8A 3QBWA 2NZTA 1NGDA 2GUPA 3BF1A 1ESVA 1YUWA 5EY4A 3H45C 2QWRA 4ISEA 2V52B 2IVPA 3H1QA 1T44A 2HMPA 4FPBA 1JCGA 3A5LC 4BRKA 2YHWA 4BRHA 1GLDG 4XH1A 4EAHD 2D0OA 2W41A 2FSNA 5AQYA 3ATVA 4BQLA 3LDNA 3A8YA 1QZ6A 3ID8A 1NM1A 4A2BA 4DCHA 1YXQA 1K8KB 5I9EB 2Q0RA 3LDOA 5LY3A 3AY9A 3UKRA 2P9PB 2GTDA 4FWOA 3VEYA 4H0VB 1JCEA 4IZ9A 5E84A 4I6MB 1R59O 5FPNA 2QXLA 5AZIA 4BC2A 1BA0A 1Q18A 3ENHA 1EQYA 4FOEA 4FWNA 2ZGYA 3MN5A 3AAQA 5ELZA 3SMSA 3VEWA 3ZEUA 2P9KA 3BP8A 2VYPA 5AQZA 5KPZA 1RGIA 2VCPA 3EO3A 3OHRA 5E26A 3EN9A 3S41A 4GY2B 2QWPA 3CJ7A 3ULEB 1QHAA 1S3XA 3U9DA 1KAZA 3LDLA 4B1YB 3CJ9A 3VEOA 2D0PA 4H0PA 1SAZA 5BPMA 3CJBA 4E1JA 3EKSA 4H0TB 3WEEB 2YCHA 4BG9A 3I33A 4BREA 2KHOA 3KHYA 4BC3A 3IFRA 1ZBSA 4FL9A 2BUPA 1BA1A 2FLOA 3VGLA 2A40A 1OKJA 5BN9A 3DWLA 1NGJA 3HI0A 2VWBA 4BRLA 1GLEG 1GLFO 1MA9B 1T6DA 4CD1A 2E2NA 1LOTB 5EVZA 1C0FA 5AQIA 2F9WA 3SMPA 3M3ZA 3WUHA 1BUPA 4MLEA 4IXCA 3SLCA 3ZX3A 1LCUA 4Y0WA 3SK3A 1XUPO 4BG8A 3ATUA 5AQHA 4H5NA 3GL1A 1V4TA 5F1XA 4DQ8A 4PKGA 5FPMA 4FWLA 1TYQA 2NLXA 2P9UA 3DJCA 1NGEA 2EWSA 4JD2B 2P9SA 3U4LA 3UKUB 3QBXA 4QS9A 1QQMA 3U9ZA 4BR5A 3VEXA 1XC3A 4H5VA 1NLVA 3BEXA 1S22A 2D4WA 4AM7A 3RSEA 5BREA 1NGGA 2ITMA 4CBWA 2YJEA 3CERA 3HSCA 3UB5A 2P9IB 2OANA 2YJFA 3KZBA 2ASOA 2V51B 2F9TA 4IJAA 4B1VA 3FLCO 2UYTA 4BVOA 5LJVA 3H3OB 4PL8A 4CZMA 2IVOA 1DGKN 3HZ6A 4JHDB 5BPLA 4EIAA 4B9QA 1JCFA 3W3DA 3O5BA 4CZGA 3WXLA 3MN6A 2ZGZA 3JS6A 1GLAG 3C7NA 3L4IA 5ADXA 3FFKB 4MLHA 2P9LA 1NWKA 4CBUA 3LM2A 2Q97A 2Q1NA 4BROA 2HF3A 2A41A 5AQTA 4KBOA 3VEVA 1SZ2A 4FWRA 3H1VX 4H5WA 3L0QA 3VETA 3R8EA 1V4SA 3ZETA 4H0YB 3M1FA 4FWSA 5AQQA 3WXKA 4F9OA 3GOIA 3HBTA 5KPTA 2IIRA 4CZIA 4BRQA 1DKGD 2W40A 3G25A 3D2EA 4EFHA 2GWJA 4BRDA 2QW9A 3M6GA 3LM9A 4BC4A 4XH5A 1GLLO 1YAGA 3H6EA 5BRHA 1U2VB 2V7ZA 1ATNA 5AR0A 3CQXA 3CJ1A 4RTFD 1HJOA 4FWMA 4IWVA 3QB0A 4ISFA 2A3ZA 4BR7A 2FF3B 4BR0A 1QQNA 3FZHA 3QMLA 3SJHA 3VGMA 5AQMA 3DAWA 4CI6A 3FR0A 1ZXOA 5AQLA 3R6MA 4HWIA 4RCHA 4H0OA 1BU6O 1MWMA 4FWKA 1TUYA 4DHYA 5BN8A 3DXKA 4BRFA 2D1KA 3CI5A 1BG3A 2E8AA 2YHXA 2AP1A 4CZLA 3GE1A 3UKRB 5F0XA 5AQRA 2Q31A 4A61A 1HKCA 2A6AA 5AZIB 5FPDA 4BRMA 4WQ4C 4B1WB 4BC5A 4BRPA 3ZEUB 4M63C 2P9KB 3D2FA 5AQWA 3FZFA 1C0GA 4BGAA 4K42A 2YI1A 3WQTA 4A2AA 5AQFA 2FXUA 3EZWA 1HX1A 2QWLA 3MN7A 3GBTA 4JAXA 3BUZB 4CZFA 4H03B 2Q36A 4BVPA 4CZKA 2CH5A 4FOIA 5AFUA 3ENOA 1TUUA 3O1WA 3J8AA 3GG4A 2P9NA 2QWNA 5BRFA 3VERA 2A5XA 5JICA 2E88A 2GEMA 4WYBA 1H1VA 3O4WA 4B1ZA 3DXMA 5AQJA 4WQ5C 4WQ5A 5AZJA 1HLUA 3BF3A 4MO4A 4AM6A 3A5NC 4PL7A 3MCPA 2GELA 3FZMA 5ADXH 4JNEA 4QS8A 4LC9B 4FWQA 2E2OA 4B1UB 4H0XB 1P8ZA 3C0BA 4QS7A 5AQKA 2E1ZA 5AQSA 3UE5A 4BGBA 3WT0A 1X9JA 5AQGA 3H3NO 4K43A 2ASMA 2V7YA 3A0IX 4IO8A 2ZWHA 1NGHA 1GLBG 2PBDA 3ZX0A 1TYQB 3MK6A 1DEJA 2P9UB 4BR2A 3IDHA 1U6ZA 3VF6A 2P9SB 3I8BA 1K8KA 2H3GX 1HPMA 2P9PA 3R9PA 1J6ZA 5EXWA 3P4IA 4K25A 3RSEB 2QWOA 4BQZA 4I6MA 3A5MC 1BOTO 3O1BA 5BRDA 5B8HA 3O6WA 4PKHA 4B1XB 4C23A 3VGKA 1QQOA 4BR9A 3L6QA 4NO7A 2ZF5O 2A42A 5AQVA 1NGBA 2QWMA 1IJJA 2E1YA 3CJCA 3VENA 4CZEA 5EOYA 3ULEA 5KQDA 1QZ5A 2ASPA 4O8KA 3MDQA 4H5RA 5JLHA 2FSKA 3IMXA 1HUXA 4BRCA 4GNIA 2FF6A 4J8FA 4O5FA 5AQUA 4CBXA 3FZLA 4M7XA 3B8AX 1Z6RA 3U8XA 2GWKA 3C7NB 5TKYA 3WQUA 3VF4A 3VOVA 1E4GT 2P9LB 3WEEA 1MWKA 4L3QA 4PKIA 3TU5A 1KAYA 4M7YA 1GLJO 3O8MA 3TPQA 2IVNA 3ZETB 4K41A 3CHWA 1BDGA 2HOEA 3LL3A 5EX5A 3QFPA 5BR9A 4HTLA 4BRGA 1ATSA 1HKBA 2I7PA 1G99A 3D2EB 3O80A 3WXJA 5BPNA 5JMVA 3IUCA 1D4XA 1Z05A 1KXPA 2CGKA 1NMDA 3VF2A 2Q2RA 2Q0UA 2FSJA 4WQ4A 3A5OC 3QFUA 3W0LA 4ISGA 5AFUH 5F2RA 3AAPA 4A62A 2E2PA 1ZC6A 2CGJA 1MDUB 2E20A 3KVGA 3MMVA 1GLCG 3LDPA 2YHYA 4JD2A 5AQPA 2AA4A 4FSVA 3UKUA 3WXIA 1E4FT 4BRNA 2J4RA 3DXKB 4FO0A 3CIPA 1X3MA 1Y64A 1HKGA 1CZAN 4JN4A 4CZJA 5AQXA 1NGCA 1NGFA 4XH4A 1NBWA 1SQKA 5KQ8A 2DPNA 3HTVA 2E2QA 5AQNA 3CETA 3VEZA 3AARA 3FE1A 3D7EO 3HM8A 5JLFA 2P9IA 3O08A 4FPAA 3VPZA 4CD3A 4BR4A 3JXUA 3EL2A 3LDQA 4NB4A 5CE3A 2I7NA 3D2FB 3F9MA 4JHDA 2QM1A 4IJNA 1KAXA 1T6CA 4FWPA 2BTFA 1X3NA 4CJ7A 5LJWA 4XEIA 1NGAA 4Z94A 3GDQA 1ATRA 1RFQA 2CH6A 1YVNA 3ZX2A 2HF4A 4CZHA 4EHUA 4YDUC 4BRIA 4RWTA 3CJAA 4YDUA 2CGLA 3QICA 2P9NB 2PAVA 2WUSA 4H5TA 3QDKA 2NRHA 1NGIA 5FPEA 4EHTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VQFK 3H46O 4LF6K 2JWLA 3VQQA 1XQSC 3EKUA 3MN9A 3WNGA 4JKGB 4BRAA 1U2VA 4LSNA 5M1KA 4RW8A 2GUPA 3N4PA 3H45C 4C8LA 2IVPA 3H1QA 2IDOA 3KWGA 1J9AA 1JCGA 3A5LC 4BRKA 3O9QA 4JS5A 1RNHA 2FBVA 2OPQA 4B9NA 5J1EA 3I0RA 3E66A 5AQYA 4CJVA 4DTJA 1YVUA 3ATVA 1O13A 4QOZB 3U3GA 3DLBA 4GW6A 1NM1A 3EY1A 1K8KB 2IC3A 2Q0RA 2RKIA 3O9TA 4WFAL 3E1YA 4CW7B 2P9PB 2BGGA 4BACA 4FJHA 2OPSA 4H0VB 1WNSA 3V6DA 3AA5X 3ENHA 4DMNA 4CF1A 4E1NA 3LZIA 1CLQA 3KKRA 3LPTA 3NVMA 5KPZA 3EO3A 2HNDA 4JV5K 1P90A 5E26A 2QWPA 1NK7A 5KRTA 4FJLA 1QHAA 2D0CA 4OKKA 3V4IA 3J81O 2XY5A 1RDCA 1VSFA 1RT1A 2D0PA 2YNIA 2XY6A 1VRUA 2ZE2A 3MWPA 2GV9A 2GUIA 3EKSA 3O3HA 1HNIA 4CJ4A 4KTQA 1TKZA 4BC3A 2VQEK 1VSIA 4DV6K 3IFRA 3CCVN 3KLIA 1X9SA 2BUPA 5CR4A 3S5TA 2FLOA 2JWKA 3HVRA 1OKJA 3DWLA 2ZM6K 4DTNA 4BRLA 4RW7A 3OS1A 2UUCK 1C0FA 3M3ZA 5DM6L 2WOMA 3PIOL 4OGEA 3SK3A 1RCHA 1XUPO 4BG8A 5EU7A 3OA9A 4H5NA 3PSIA 3VQ4A 3BDPA 3GL1A 3L2RA 3SUPA 4DQ8A 4PKGA 2IGIA 1XHXA 2ATQA 5FPMA 3EYZA 3P1GA 5D3GA 1NOZA 2P9UA 1NGEA 2EWSA 3SQ2A 1NKBA 1S1WA 4KB0A 4B3TK 4IO9L 4ID5A 3NFAA 3BEXA 1VSKA 3SBTA 5LMUK 4DU3A 1S22A 4AM7A 3KTQA 3RSEA 5BREA 1NGGA 1JXBA 3LALA 3HSCA 1UAXA 4AHTA 4A59A 3OYKA 3V1OA 3UB5A 2P9IB 3NGIA 1LAVA 3FLCO 4JKHA 4ELVA 4ILGB 4FJ7A 4CZMA 3OYJA 1BGXT 2WFBA 4CCHA 5CYQA 4NCGA 3MN6A 2ZGZA 2HHQA 2KZMA 3FFKB 1IH7A 4RG8A 1O1WA 1K6YA 3ALYA 4EZ6A 2Q97A 2O8BB 2HF3A 1KFSA 1IV0A 1WBDA 1QVFM 3SZ2A 3L0QA 4KHWA 3ZETA 3M1FA 3K0SA 4F9OA 2O8EA 3C6AA 4M3XA 1Z26A 4YNQA 2W40A 3G25A 3ZSQA 2GWJA 2GBZA 4BRDA 1C1AA 4CJQA 3ZSVA 1GLLO 3WXMB 5BRHA 4F3TA 2WONA 3HK2A 3AGRA 4RTFD 1HJOA 4IWVA 4ISFA 2FF3B 1W2BM 1Q86O 3LP2A 3E01A 1VHXA 1L3UA 3OBWA 3FR0A 5C2FA 5AQLA 1S72N 4RCHA 4IFVA 4H0OA 2HMIA 4FWKA 4CEEA 3DXKA 4BRFA 3NH0A 2D1KA 1BG3A 4JRQA 4Z4GA 1RT5A 2PYLA 3MXJA 5AQRA 2Q31A 1HKCA 1UOCA 4HUGA 3LP1A 4WFNL 1T03A 5AZIB 2QKBA 4CJRA 4N56A 4BRPA 3ZEUB 4M63C 5FROA 2P9KB 5AQWA 4E7LA 2YNHA 4IEEA 3RVCA 3K57A 3WQTA 4DKWA 5AQFA 4CJ5A 3NGZA 3S3NA 2VG5A 4E89A 4MDAA 4JI1K 4H03B 5LL6Z 4ILHA 3RRGA 4F2SA 4BVPA 4CZKA 2VG6A 3AGKA 1N6QA 3KK2A 3ENOA 3NF9A 1SV5A 1A5XA 2QK9A 4CJPA 5JICA 4JKEA 3C6TA 2HHXA 4WYBA 2NRWA 4OLAA 2UUAK 3DXMA 4FM2A 3CF5L 1S5JA 4CJKA 4WQ5A 4KFBA 4KTWA 3BF3A 4KREA 1HNVA 4LC9B 2UXCK 1SL1A 1NJIO 4BGBA 1ZBUA 1EO1A 5FRMA 3THVA 1K73O 1Q82O 3H3NO 2ASMA 3C95A 1U48A 4K8XA 4IO8A 2ZWHA 2O8DB 3SQ0A 1NGHA 4KHQA 1HJRA 3MK6A 4OPHA 3VF6A 1NKEA 3CCMN 3TR8A 1QQCA 4MQ3A 2H3GX 5FRNA 3CQ8A 4CJLA 1J6ZA 3HM9A 4K25A 5HROA 3OYAA 4HUEA 1NJYA 1KRPA 4B1XB 3TAFA 1RBUA 3AO1A 4B3SK 1FKOA 4NO7A 4MDBA 3THXA 2A42A 2E1YA 3HPOA 2C1IA 3HVTA 4CZEA 3OS2A 2PFUA 3ULEA 4O55A 4C8KA 1YIJN 1BCMA 1Y97A 3CFPA 3T3FA 1IKWA 4FZXC 4M7XA 1EETA 1VRTA 5TKYA 4B9UA 3VOVA 2P9LB 1VSJA 3ZSOA 4DV3K 3K59A 4PKIA 1GLJO 1HNXK 3CCSN 4X62K 4BE1A 2BANA 4V19S 2F8TA 3LL3A 1I39A 1N5YA 4M3YA 3SAFA 1VQMN 1G99A 4GKKK 4FLVA 1OH5A 3OVNA 4F2RA 3VQAA 1Z05A 1IG9A 3R1XA 3VF2A 2Q2RA 2Q0UA 2HHTA 2X6NA 3LANA 4JKDA 4IOXA 4CJSA 2HHVA 2YKMA 2NRZA 2R7YA 2E2PA 2W00A 1ASWA 3FFIA 3KVGA 3SBGA 2KQ2A 1GLCG 5MLCQ 3AVFA 1Q9YA 4LSLA 5AQPA 1SUQA 2AA4A 3UKUA 5DK5A 3WXIA 4BRNA 3PO5A 4CERA 4N5SA 3QLHA 3CIPA 4E3SA 4GVMA 1FKPA 1Y64A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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