3U9DA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-24) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 13-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
b'TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
total genus 107
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9dA03
3IDHA 4PKGA 2GEMA 4BGAA 2GUPA 4WQ5C 5JMVA 5AZIA 2QWRA 1Z05A 3FZMA 4EHUA 2DPNA 2E2OA 3WQUA 2OANA 4IJNA 3CJCA 2ASOA 1QQNA 4GNIA 4BRQA 5CE3A 2QWMA 2Q1NA 4J8FA 3H3OB 3FLCO 5AQMA 2V51B 2HOEA 3U8XA 4YDUA 3ZEUA 5EOYA 4CZHA 1OKJA 4NO7A 3ZX2A 1R59O 2IVNA 2E8AA 4BQZA 4CZKA 4H0YB 1ZBSA 3CJ7A 3VF2A 3LDPA 2A41A 1Q18A 4B1WB 1NGJA 2E1ZA 4C23A 4JNEA 3DAWA 3M1FA 4M7YA 4DQ8A 3QDKA 1IJJA 1TUYA 3WXJA 1ZC6A 4O5FA 3FZLA 2W40A 4MO4A 3VEVA 3WEEB 3WXIA 3VF4A 3A5MC 1P8ZA 4BR5A 2D0PA 2E1YA 3DWLA 5EXWA 4FPBA 3GDQA 5KPZA 4IJAA 3VEZA 1LCUA 2QWNA 4RWTA 2QWQA 1HUXA 3FZFA 1V4SA 5FPNA 4AM7A 2A42A 1ATRA 4H0OA 3AAQA 2E88A 4QS8A 4M7XA 4ISEA 1NGAA 2P9NB 3KVGA 5AQXA 1ATSA 3ULEA 2V7YA 4CJ7A 4B1YB 3MDQA 1BA1A 4WQ5A 5BR9A 1GLBG 3U9DA 3CQXA 2GELA 2CH6A 3O8MA 3A5LC 3VEXA 5KPTA 4BG8A 3FFKB 4PL7A 4BRMA 4WYBA 5E26A 3UKUA 3SK3A 2FF6A 4O8KA 2VWBA 4FWSA 4A61A 5BRDA 3BP8A 3F9MA 4DCHA 4ISFA 3O1WA 4BRDA 3AAPA 3D2EB 1DKGD 4ISGA 1TYQB 4XEIA 3R9PA 2QWPA 4BRLA 1JCEA 1EQYA 5ADXA 1U2VA 4JN4A 3LDOA 3DXKB 3UE5A 4IWVA 2AA4A 5AZJA 5BPMA 2FSNA 1JCGA 4BC5A 4BC2A 1V4TA 3CHWA 3H1VX 2I7NA 4K25A 1HKGA 4BRNA 1NGDA 1GLLO 3CJ9A 2VCPA 4H03B 1HKBA 3HM8A 5AQQA 5F1XA 1X3NA 1CZAN 4BRPA 1MWMA 5LJVA 2Q0UA 4CZLA 1NGEA 2FSKA 1ESVA 2P9UA 5JLFA 4HTLA 2WUSA 1HLUA 2QW9A 1S3XA 4WQ4C 1C0GA 3LDQA 1GLCG 1JCFA 1X3MA 3FE1A 3EN9A 4H5VA 3UKRB 2E2NA 3C7NB 4I6MB 4BC3A 4BRIA 3AY9A 3H3NO 3HTVA 5F2RA 3S41A 4GY2B 1NGCA 3H1QA 1BDGA 3H45C 3VF6A 4FWPA 4PKIA 1RFQA 4MLEA 3VGMA 2YHWA 3L4IA 3R8EA 5F0XA 1LOTB 2QWOA 1NGFA 4K43A 1NLVA 2QWLA 3I33A 2HF4A 4F9OA 1GLFO 3ATUA 1NMDA 5AZIB 3UB5A 2P9IB 1SQKA 3QBXA 3LM9A 5AQLA 3CI5A 2NRHA 2PBDA 1QQOA 4JD2B 3L6QA 2D4WA 2ZGZA 4XH5A 3RSEB 1Z6RA 2Q97A 2A5XA 3A0IX 3KZBA 4BR2A 1MWKA 3U4LA 5EVZA 1H1VA 2YJFA 4BRCA 4H0VB 3LDNA 1BUPA 4BC4A 2HMPA 5AQKA 3ZX0A 3J8AA 2IVPA 3AARA 2FF3B 4FWKA 4FWRA 3EL2A 1E4FT 2BTFA 4IZ9A 2VYPA 3ID8A 2IVOA 5AQGA 3CJAA 2YHXA 2YJEA 5LY3A 3P4IA 4BR4A 5EX5A 1NWKA 5AQUA 4FSVA 2D1KA 3IMXA 1BO5O 4WQ4A 4MLHA 2GTDA 4XH1A 4PL8A 2ZF5O 2E2PA 1BA0A 1YXQA 3FGUA 4Z94A 3A5OC 5JICA 2E20A 4LC9B 4CZJA 1GLAG 3MK6A 4B1VA 4JHDB 4MO5A 5ADXH 5AQYA 4A62A 1YUWA 5AQTA 3WEEA 4CZGA 4BRKA 4BRHA 2P9KA 1YVNA 3ULEB 4QS9A 1BG3A 4BROA 2E2QA 4EFHA 3DJCA 3QICA 3EZWA 1DEJA 4BVPA 3TPQA 5BRHA 1S22A 3HBTA 5FPDA 3HZ6A 4BG9A 5KPRA 1NGHA 2P9NA 4H0TB 2YHYA 3O1BA 4FWLA 5BRFA 4FWQA 2P9SA 5AQOA 4XH4A 2AP1A 1HPMA 4CZFA 4L3QA 3EO3A 2CGLA 3D7EO 4BRFA 1QQMA 3BEXA 4BVOA 3IFRA 2P9PB 3QMLA 1SAZA 3H46O 2BUPA 3CIPA 5AQVA 4CZEA 3ENHA 1SZ2A 3ZETA 4CI6A 1U2VB 3KHYA 3WXLA 3CJ1A 1GLDG 4BRAA 1XQSC 4AM6A 2GWKA 5JLHA 5TKYA 4A2BA 3D2EA 3WT0A 3GOIA 2QXLA 3MN6A 3DXKA 4K41A 1QZ5A 2ZWHA 3D2FA 4B1XB 4EAHD 4BR0A 3VEOA 3BF3A 4IO8A 5I9EB 1RGIA 3ATVA 2F9WA 2A40A 3VETA 2GWJA 5AQNA 1K8KA 3W3DA 4B1UB 5AQSA 1WOQA 1C0FA 2FLOA 1WUAA 4FO0A 4FWMA 3QFPA 1J6ZA 4FWOA 5AQPA 3VERA 1NGBA 3DXMA 5E84A 1HKCA 3GL1A 4Y0WA 2P9LB 3SMPA 1BOTO 3C0BA 5AQHA 1XUPO 3M6GA 4BR7A 3UKRA 2Q2RA 1MDUB 4DB3A 2UYTA 4CD3A 3VGLA 3CERA 4H0XB 5AQRA 4JAXA 3VEWA 1IG8A 4FPAA 2IIRA 3JXUA 4H5NA 4E1JA 1NM1A 4PKHA 4KBOA 3EKSA 3G25A 4RTFD 3ZEUB 3FZKA 3QBWA 4H0PA 4M63C 1T44A 2ASPA 2FSJA 3A5NC 3L0QA 3LL3A 2P9IA 4BQLA 2I7PA 2KHOA 4NB4A 2D0OA 3MN5A 4CBWA 4JD2A 1Y64A 3VENA 3WQTA 3RSEA 1GLEG 1ZXOA 1YAGA 3LM2A 3ZX3A 3A8YA 3LDLA 1E4GT 1NBWA 1HX1A 2W41A 2YCHA 5EY4A 5BPNA 3U9ZA 2EWSA 1HJOA 4EHTA 3VESA 3GG4A 5AFUA 5KQDA 3HI0A 2NZTA 2HF3A 1BU6O 3EKUA 1QHAA 4B1ZA 3R6MA 3I8BA 4DHYA 1XC3A 1KAYA 4K42A 2ITMA 2ZGYA 3MCPA 1BWFO 5BN9A 4EIAA 3O6WA 3GBTA 3FZHA 1ATNA 1G99A 2P9KB 5AR0A 4A2AA 3MMVA 1T6CA 1NGIA 2CH5A 1MA9B 4JHDA 5FPEA 4CBXA 2V7ZA 2A6AA 3O08A 1DGKN 5AQFA 3VOVA 4CBUA 4IXCA 3UKUB 5AQZA 2NLXA 2V52B 2P9SB 3HSCA 3MN7A 2PAVA 3OHRA 1QZ6A 3B8AX 3BF1A 1GLJO 3VGKA 2ASMA 3GE1A 3BUZB 4BREA 3O4WA 5AQWA 1X9JA 3ZETB 5AZJB 3SMSA 5BPLA 3VPZA 5LJWA 4CD1A 2P9PA 3QFUA 3JS6A 1D4XA 1TYQA 2QM1A 3CETA 1KXPA 5BN8A 5KQ8A 1U6ZA 4QS7A 4H5TA 4CZMA 4FL9A 4YDUC 2FXUA 4BR9A 3D2FB 2P9UB 3MN9A 3W0LA 2A3ZA 5BREA 4BGBA 5AQJA 4H5WA 1T6DA 4FWNA 4FOIA 3O5BA 2F9TA 2Q31A 3CJBA 1K8KB 4FOEA 2YI1A 4H5RA 2Q0RA 5B8HA 5AQIA 4BRGA 3WXKA 4RCHA 2H3GX 5ELZA 2Q36A 1KAZA 3SJHA 4B9QA 3DXMB 1NGGA 3H6EA 3C7NA 2CGJA 4I6MA 3VEYA 1RDWX 5FPMA 1TUUA 5AFUH 4HWIA 3SLCA 2CGKA 2J4RA 4CZIA 3TU5A 1KAXA 2P9LA 3WUHA 3ENOA 3FR0A 3QB0A 3O80A 3CQYA 3IUCA 3M3ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K5LA 3DI6A 4PKGA 4FYDA 3FZMA 1OH6A 2WTUA 4EHUA 4LF9K 2B5JA 2YV0X 5CE3A 1VSKA 3V9XA 2V51B 1S1WA 2KLAA 4FLZA 4JRPA 3ZEUA 4NO7A 3ZX2A 1R59O 3L2VA 3ZSRA 2E8AA 4BQZA 3THXA 3BGRA 4IKFA 1NJIO 4ELTA 1BGXT 1I3AA 3TARA 4PHTX 3P1GA 1Z26A 4DTPA 3WXJA 3FZLA 3D0PA 2HVIA 1WAFA 3VEVA 5T7BA 3WXIA 4I9LA 4OJRA 3IG1A 4FPBA 3SJJA 2FC0A 3O9TA 3OVNA 4RWTA 3HXMA 3EE9A 3QNOA 5FPNA 3NGYA 4CEBA 1TL3A 3K9KA 4RW7A 1WSFA 1HQUA 4DU1A 5FROA 1JXEA 3ULEA 4CJ7A 4OGEA 5C2DA 4HUGA 3KWIA 3O4NA 2XRIA 3U9DA 2W42A 3G4SN 4JKCA 3O8MA 3A5LC 4L8RB 4KO0A 3EZ5A 3NBPA 1VQ6N 4PL7A 4KHQA 3AGRA 4GV3A 1XWLA 1BIZA 2VWBA 4FWSA 5BRDA 2C1IA 4CF2A 5JS1A 3OTOK 4CEFA 4DCHA 4KI6A 1DKGD 2QWPA 1EQYA 4CEOA 3L2RA 1U2VA 3KK2A 3RR7A 1WSHA 1NKEA 2E6MA 5AZJA 1E3MA 1LWFA 4JLHA 4AH9A 2HHHK 3V4IA 1N32K 1K73O 1HKGA 1NGDA 1GLLO 3CJ9A 4AHVA 5F1XA 4DSLA 4E1NA 1CZAN 3K5NA 5LJVA 1P90A 5EU7A 3P38A 4DSJA 3TANA 1BIUA 1I39A 2Q0UA 4RG8A 4CZLA 4M3YA 4DR4K 5M1OA 4LF4K 4HTLA 3HPOA 1HLUA 2QW9A 4JI0K 3I8DA 4H5VA 1GLCG 3EN9A 3FE1A 3E9OA 3C7NB 3O4QA 4M3RA 4CK2A 4LH5A 1OVQA 5M1QA 1DT9A 4BC3A 3SQ1A 4BRIA 4DQSA 3S41A 3EY1A 4GY2B 4KHSA 3H45C 3V1RA 3VF6A 4FWPA 1R0AA 3V9SA 1XC9A 1RFQA 3V81A 3VGMA 5F0XA 4K43A 4CCHA 4K8ZA 2QWLA 3OS1A 1K8AO 3I33A 4ELVA 3QEXA 4BY9C 1GLFO 3ATUA 3A2FA 3BDPA 3QBXA 5AQLA 3ITHA 1VAZA 1QQOA 4C8OA 3SUPA 3HP9A 5JENA 2XY5A 2Q97A 3A0IX 3KZBA 5CZ2A 2HMPA 2IVPA 4FWKA 2R7YA 4DV0K 3RRGA 3EL2A 1E4FT 2VQFK 2QKBA 3DLBA 1JLBA 3E66A 4CIEA 2YJEA 5LY3A 2HHTA 4BR4A 3T1HK 5EX5A 3P31A 4C8NA 4JKHA 3DLRA 2OTLN 3CCSN 1YXQA 2VG6A 4CGIA 1JJ2M 4LC9B 1GLAG 4B1VA 4FJIA 5AQYA 3SPZA 2NRTA 4B9NA 2WFBA 1HQEA 4CGGA 1YVNA 3DRRA 1TL1A 4MDBA 1YJ9N 4EFHA 3DJCA 4CERA 4JI3K 1IG9A 4LH4A 3KK7A 5FPDA 2AJQA 5JVHL 3V9WA 2BE2A 3O3FA 1YITN 5BRFA 1IBKK 2P9SA 4A5BA 4M3XA 3HYFA 4XH4A 4JI5K 4KAZA 2CGLA 4BRFA 3BEXA 3QMLA 4W5QA 4FLTA 3H46O 2JWLA 5C24A 2XY6A 3ZETA 1G15A 4CI6A 4C1NI 4NXMK 1IKYA 3CJ1A 1GLDG 4BRAA 4AM6A 3DLLL 5GAGP 5TKYA 5J2PA 3T1YK 3P83D 2D5RA 4CK3A 1U48A 2QXLA 3K59A 4LF6K 1HRHA 3D2FA 2DTUA 3F9KA 3VMFB 4BR0A 4WFBL 3VEOA 5I9EB 4LSLA 1RGIA 3VETA 4DR7K 3PX4A 3CPWM 3W3DA 1TKZA 3J7ZO 4BE7B 4GVEA 1VQ9N 3TSPA 1NGBA 1HMVA 3CFRA 2KFZA 3SMPA 4Y0WA 1BOTO 4J2DA 4B3SK 3TTDA 5AQHA 1XUPO 4EP5A 4KTQA 4DS5A 4DTNA 2Q2RA 4BWJA 4JI8K 1B92A 1X9SA 4DB3A 4CD3A 5D3GA 4FJXA 2KFNA 4JI4K 3VGLA 2O8BB 5AQRA 1UWBA 2Z1JA 4JAXA 4NCAA 3OYEA 4JI2K 3LDSA 5H1SQ 1X9MA 3LPTA 3EKSA 3KLEA 3UIQA 4CF1A 5E41A 2FSJA 3A5NC 2KHOA 4AQYK 1UAXA 4CBWA 2KTQA 3SV4A 4TSXA 1TAQA 4HCCA 3NF8A 5KGWA 2VWJA 1NBWA 3KKRA 1RDBA 2YCHA 3O9UA 3SYZA 2Y1IA 3PLAA 2WONA 3F5TA 1J54A 3KLIA 4FJJA 1QHAA 1VQLN 4DHYA 1NK6A 1W2BM 3NMUA 3NH2A 3DM2A 3MX5A 3JAMO 1NK0A 4LF7K 4M3TA 4LFBK 1X1PA 1D9FA 4IOCL 3CC4N 1Q81O 4DV6K 3OYJA 5AR0A 1Y97A 3OYLA 3VTIA 1NGIA 4OKEA 4AHSA 4W5TA 5FRNA 4DSEA 1GOCA 3VOVA 4CBUA 3CMAN 5CHIA 2PZSA 2HW3A 2NLXA 3ZSVA 4G1QA 1SKSA 4CJ3A 4C8MA 3OHRA 1QZ6A 4FVMA 3ZCMA 3NGIA 2D0AA 3CFPA 3AO4A 1TGOA 4DQPA 4LD0A 1XHXA 1NU0A 1C6VA 3TWHA 3LP3A 3SMSA 5BPLA 2P5GA 1FKPA 1HNIA 3DRSA 5LJWA 1SKWA 4CJWA 2C1GA 1TKDA 4FW2A 4JYAK 3AVFA 2QM1A 1ZBIA 3R3LA 1RBSA 3N4PA 4CJUA 1S1TA 3LP2A 3ZSOA 5J1EA 1TK8A 4H5TA 3CCEN 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2UXD K;  1Q8I A;  3AVB A;  4FWO A;  1HYZ A;  3KK1 A;  2GBZ A;  3DXM A;  5E84 A;  2IAJ A;  4FK0 A;  1HKC A;  2P9L B;  4N76 A;  3C0B A;  5CYQ A;  1NK8 A;  1TV6 A;  4OPK A;  3ZSX A;  4MFB A;  3C6U A;  3AO5 A;  2NRR A;  4B9S A;  4CJR A;  4RW9 A;  3PY8 A;  3VEW A;  4DV1 K;  4LF5 K;  1IG8 A;  4FPA A;  5HRR A;  3VQ5 A;  2O8E B;  4CJS A;  2IIR A;  3JXU A;  4H5N A;  4E1J A;  3PSF A;  3AVC A;  4DTU A;  3ZEU B;  3G25 A;  3M5R A;  4O44 A;  4RTF D;  4YOT A;  3THY B;  4H0P A;  5HL7 L;  1T44 A;  3LL3 A;  2I7P A;  3THX B;  4NB4 A;  2D0O A;  3MN5 A;  3ZT1 A;  4JD2 A;  3J80 O;  5HRO A;  3MEE A;  3ZX3 A;  3K58 A;  3LDL A;  3S5T A;  1HX1 A;  3VQ7 A;  1IH7 A;  5EY4 A;  5BPN A;  2HBJ A;  5C15 A;  2OYQ A;  3NDK A;  3HVT A;  4EHT A;  3GG4 A;  5HRN A;  5KQD A;  2HF3 A;  3TAG A;  4B1Z A;  2IS3 A;  2DFE A;  1C1B A;  2GV9 A;  1XC3 A;  1KAY A;  2ITM A;  4PQU A;  4DR2 K;  3SV3 A;  4EIA A;  1IV0 A;  1RTI A;  4CIG A;  4B9M A;  3DRP A;  3FZH A;  1ATN A;  1G99 A;  2P9K B;  2QI2 A;  3DLK A;  4CBX A;  3KJV A;  2V7Z A;  3O08 A;  1EKE A;  1DGK N;  4FJM A;  3VQC A;  4EZ6 A;  4FJN A;  4B9L A;  4CJK A;  2RN2 A;  3THW A;  2KQ2 A;  5GAE P;  2XY8 A;  3SAF A;  2V52 B;  4EP4 A;  3PO5 A;  4BDP A;  5IT9 O;  3E1Y A;  5M1N A;  1T03 A;  3MN7 A;  1NMN A;  2EHG A;  1QS4 A;  3AVN A;  1JLC A;  1GLJ O;  1TKX A;  3BUZ B;  4KHU A;  2HB5 A;  2PY5 A;  3RMA A;  1NJY A;  3IKM A;  1JLA A;  4CHQ A;  5AZJ B;  4HHT A;  1CXU A;  4CD1 A;  5J2M A;  2P9P A;  3QFU A;  1RDU A;  4NCG A;  1LAW A;  3SI6 A;  2RKI A;  3CET A;  1KXP A;  2O4I A;  4JKD A;  1QVG M;  4QS7 A;  3I55 N;  1RBR A;  5HRS A;  2W6K A;  2FBX A;  1BCM A;  3LZI A;  4JKE A;  2A3Z A;  2F96 A;  2O8C A;  5AQJ A;  1T6D A;  4FWN A;  3O5B A;  1JLE A;  2F9T A;  3CJB A;  3M8P A;  5KTQ A;  3OYK A;  5B8H A;  3RVC A;  4JI6 K;  5ELZ A;  1T05 A;  1O13 A;  1MU2 A;  2BAN A;  1N33 K;  4HUE A;  3MXJ A;  3J7Y P;  3CYM A;  3L3V A;  4B3T K;  1RT6 A;  1TUU A;  3C6T A;  5AFU H;  1KFS A;  4DV7 K;  1Z25 A;  2CGK A;  2J4R A;  3QIP A;  2P9L A;  3O80 A;  4GKJ K;  3EE8 A;  2JGU A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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