3U9DA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-24) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 13-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
b'TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
total genus 107
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9dA03
3ATUA 1NGIA 3H3NO 4JAXA 5AQUA 5AQOA 2D1KA 3DXMB 1BA0A 2QXLA 4PL7A 1QZ6A 4WQ5A 4DHYA 3MMVA 1IJJA 4FOEA 2P9PA 2E2QA 1V4TA 2QWMA 4ISFA 2CGLA 5KPRA 1BU6O 1C0GA 2ZWHA 4H0OA 3M3ZA 5FPNA 1NGAA 4CZHA 2P9SB 3EO3A 2ASOA 2GEMA 5F2RA 5AQYA 4EHUA 1NWKA 4MLEA 4BC4A 4BR9A 2Q31A 1RGIA 2BTFA 2W41A 4RTFD 4B1ZA 5BR9A 4CZMA 3B8AX 1BG3A 1NMDA 2HMPA 3LDOA 3TU5A 3ATVA 4FL9A 3FGUA 3EKUA 5B8HA 3A8YA 3R8EA 1K8KB 4M7XA 3SMPA 3EN9A 3WEEA 3AAPA 4ISEA 1R59O 2BUPA 5AZIB 3WQTA 3QB0A 5ADXH 3DJCA 3L0QA 4FPBA 4BR7A 4RWTA 5KQDA 4M7YA 3U4LA 5AR0A 3CQXA 5JLHA 1GLLO 1Q18A 4H5TA 3UKUA 4BRAA 4XH1A 2VWBA 4FWRA 3FFKB 4QS9A 3KVGA 1E4FT 4H5WA 4JHDB 4M63C 3ULEA 2P9NA 2P9IB 2E1YA 3C0BA 2NLXA 3VPZA 2UYTA 3FZLA 3IUCA 1HPMA 4CBXA 4GY2B 2IVPA 4BC3A 2A41A 4EHTA 1EQYA 1YXQA 4F9OA 1GLEG 2FXUA 3CJ7A 4YDUA 5AQQA 2P9LA 4IJNA 5CE3A 3WUHA 4CJ7A 3SJHA 1E4GT 3GOIA 1KAZA 4IXCA 4BC2A 2HF4A 2P9UB 2GTDA 4I6MB 2V51B 2ZGZA 4B1YB 1NGJA 3ZETA 4MO4A 3ZEUA 2QM1A 3H46O 3GBTA 3KZBA 1XQSC 2A40A 2H3GX 4CD3A 5BN8A 5AQNA 3BF3A 5LY3A 4B1WB 2F9TA 5BPLA 2ASMA 2E1ZA 3I33A 4L3QA 3VOVA 3O1BA 2D0OA 4B1VA 5BPMA 1ZXOA 4IWVA 1BWFO 5AQPA 4FWMA 5AZJB 3WQUA 4AM7A 2V7ZA 3CJCA 3SLCA 4BG8A 4CZGA 2P9KA 1DGKN 3D2EA 4CZEA 3S41A 3ID8A 1BUPA 3ZX2A 1BO5O 2AA4A 3MN7A 5EX5A 2OANA 4RCHA 4BRPA 3U8XA 3BP8A 1BDGA 1Z6RA 3H1VX 4BVPA 1NGGA 3VF2A 1DKGD 3CETA 5ADXA 3VEZA 3QFPA 4H0VB 3D2FB 1ESVA 3L4IA 5BRHA 4BR5A 4CZIA 2YHYA 3QBWA 3AY9A 2CGKA 2FLOA 3R9PA 1MDUB 4BG9A 1HJOA 1JCFA 3DAWA 3O80A 5AQHA 3VGMA 4EIAA 4B9QA 3U9DA 2GWKA 4DCHA 1TUYA 2IIRA 2YI1A 3IMXA 4WQ4C 4BRGA 2WUSA 3H3OB 3LDNA 3VEYA 3UB5A 3J8AA 1QHAA 1GLBG 1X3MA 2J4RA 1BA1A 4O8KA 3RSEA 2A5XA 4BVOA 4BRKA 3CJ1A 2QWLA 3VF6A 2Q2RA 3A5OC 4FWSA 3MN5A 4KBOA 2Q0UA 4BRHA 3UE5A 1MA9B 2E2OA 4B1UB 4K42A 5AQZA 3VEWA 3MN9A 3WT0A 4FO0A 1ZC6A 3CIPA 5I9EB 2ASPA 5LJWA 4FWNA 2QWPA 2YJEA 1QQNA 4NB4A 4QS7A 4MLHA 1GLCG 3AAQA 3LM2A 4XH4A 2EWSA 1SQKA 1T6CA 3MDQA 5AQGA 3QFUA 3UKRA 1SZ2A 2Q1NA 3GDQA 1U2VA 1HUXA 3LM9A 3ZX0A 4XEIA 4H0PA 1V4SA 1IG8A 3C7NA 1GLJO 4H03B 1TYQA 4EAHD 4Z94A 4BRMA 3A5LC 1BOTO 2FF6A 3DXKA 1MWKA 4FSVA 4BC5A 5FPMA 2GELA 4O5FA 1YVNA 1ATNA 3DWLA 3CJ9A 3CJBA 2E88A 3HBTA 3DXMA 3ENOA 3P4IA 4BR0A 5FPDA 1YUWA 1NGHA 5AFUH 4H0YB 5AQIA 5EOYA 2ITMA 4H5NA 1NM1A 2QWNA 4K43A 3O6WA 4JNEA 3VETA 2HF3A 3KHYA 3HTVA 4FPAA 2Q0RA 5BPNA 3O8MA 2P9SA 2E20A 2IVNA 4AM6A 3QDKA 1X3NA 3M1FA 2P9PB 3WXIA 4CI6A 1YAGA 3W3DA 4CZJA 4PKHA 5AQKA 3BEXA 5LJVA 4IZ9A 3A5MC 5KQ8A 2FSJA 1LOTB 2A6AA 4J8FA 4BRLA 1Y64A 2PBDA 5EVZA 4CZKA 1DEJA 3CJAA 3CI5A 4Y0WA 3G25A 5JLFA 2QWOA 4PKGA 1NBWA 2ZF5O 4WYBA 5EY4A 3IDHA 3SK3A 3TPQA 1T6DA 5AQJA 4E1JA 1K8KA 3H45C 3L6QA 3HI0A 2Q36A 5KPZA 1NGFA 3H1QA 5AQVA 4BRNA 4A62A 4BRCA 4IO8A 2E8AA 4QS8A 3BUZB 2I7PA 3D7EO 5AZIA 3U9ZA 4BROA 3QBXA 3ZX3A 5TKYA 3AARA 5AQXA 4IJAA 5BRFA 3A0IX 1S3XA 1WOQA 3HZ6A 3MK6A 2YHWA 1GLAG 1HLUA 3CHWA 4BR2A 4BRIA 3WEEB 3GE1A 3VF4A 3JXUA 3SMSA 4BR4A 4H5RA 4EFHA 3H6EA 1T44A 4JHDA 3ENHA 2P9IA 4BRDA 3CQYA 4K41A 2GUPA 2CH5A 4FWKA 1G99A 1MWMA 3VEVA 5EXWA 1D4XA 1S22A 3UKUB 3WXKA 3F9MA 5AQTA 1J6ZA 4C23A 2YJFA 3ULEB 2P9NB 2V7YA 3LL3A 1ATRA 5AFUA 1H1VA 1QZ5A 4WQ4A 2FF3B 5F1XA 4PL8A 4A61A 1NGBA 4WQ5C 5AQFA 1LCUA 4B1XB 2HOEA 1X9JA 2KHOA 3LDLA 3HM8A 3LDPA 3W0LA 1XC3A 2P9UA 4LC9B 4I6MA 2A42A 2YHXA 2A3ZA 5JICA 3QMLA 3EL2A 5E84A 2P9LB 2IVOA 4K25A 5KPTA 5F0XA 4CZLA 1NLVA 1C0FA 4CBWA 4HWIA 3ZETB 4GNIA 3VERA 3ZEUB 4BRFA 3CERA 1U6ZA 4CZFA 1QQOA 1JCEA 3VGKA 5AZJA 4PKIA 4H5VA 3WXLA 2FSKA 1TUUA 1NGEA 2YCHA 3EKSA 1NGCA 3MCPA 3O4WA 1QQMA 1HX1A 1HKGA 2P9KB 3OHRA 3D2EB 3D2FA 2D0PA 2FSNA 3A5NC 3M6GA 4H0TB 4JD2B 4FOIA 2CGJA 3WXJA 2ZGYA 5AQRA 2W40A 1KAYA 3I8BA 2DPNA 4BQZA 2QWRA 2I7NA 1KXPA 5AQMA 3VENA 2E2NA 4BGAA 5FPEA 1RFQA 1WUAA 4HTLA 5JMVA 1GLDG 1SAZA 4JN4A 3FR0A 4NO7A 5AQWA 2NRHA 1ZBSA 4XH5A 4ISGA 2GWJA 1GLFO 4YDUC 4DQ8A 5AQSA 3EZWA 2PAVA 3O5BA 3RSEB 4CBUA 3FLCO 2Q97A 5BREA 1HKBA 3GL1A 4FWLA 3FZHA 4CD1A 4BQLA 5E26A 3FZMA 3O1WA 5AQLA 4DB3A 5BRDA 4FWOA 4BREA 3IFRA 3GG4A 3FE1A 4FWPA 3R6MA 1KAXA 4A2AA 1ATSA 4BRQA 3UKRB 3BF1A 1U2VB 2VYPA 5ELZA 3VESA 1JCGA 2CH6A 4A2BA 1CZAN 2VCPA 2QW9A 2NZTA 5BN9A 1OKJA 3C7NB 1Z05A 3HSCA 1P8ZA 1XUPO 3JS6A 3FZFA 3VGLA 4H0XB 4FWQA 1TYQB 3MN6A 2AP1A 3QICA 4JD2A 3VEXA 4MO5A 4BGBA 1NGDA 2E2PA 2D4WA 1RDWX 2V52B 3DXKB 3VEOA 2QWQA 3O08A 3FZKA 3LDQA 2F9WA 1HKCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K9KA 4DR5K 3ATUA 3SBTA 3SNNA 5AQUA 4FXDA 2B4JA 2NNWA 5AQOA 3DXMB 5GIOA 2QXLA 4PL7A 3MMVA 3OYEA 3K5LA 1J53A 4CEEA 5FPNA 4EZ6A 2ASOA 2GEMA 4PHTX 1NWKA 4WFNL 3MX2A 3TAMA 4BC4A 3NGZA 4JEPA 2BTFA 5CHIA 4HVJA 4H4OA 1VHXA 1GOBA 2PYJA 1JLEA 4CZMA 1BG3A 1SUQA 1X9MA 1NMDA 3LDOA 4IKFA 3TSUA 3TU5A 3ATVA 4H4MA 4HHTA 3THWA 4JRPA 4CE9A 3SMPA 3WEEA 1K6YA 2BDPA 4ISEA 3EYZA 4KV8A 3WQTA 1VSLA 4W5TA 4M7YA 3BY5A 1HR0K 4DQRA 1GLLO 1Q18A 4H5TA 3SCXA 3KWIA 2UXDK 3O4QA 2ZD1A 2HHIA 1E4FT 4M63C 3ULEA 2G8VA 4JI2K 4FVUA 2D0BA 3FZLA 4J2EA 4JS5A 4KRFA 3V6DA 2A41A 4JKDA 3IRXA 1REVA 3K5NA 4KO0A 3MEEA 4F9OA 1IH7A 4PQUA 1W7AA 4DKWA 4OJRA 1RTDA 2P9LA 2A1SA 5CE3A 3WUHA 3DLGA 3OYCA 4DTOA 4IXCA 4B9NA 3NVMA 1LWEA 4I6MB 2ZGZA 4KH4A 4WF9L 3T3FA 3SBGA 3GBTA 4CD3A 5BN8A 3P5JA 5JENA 3RR7A 4DTUA 4N76A 2F9TA 3I33A 1ZBUA 2F8SA 3KLFA 4FJXA 2KLAA 3WQUA 5AZJB 1N33K 5BRFA 4CZGA 4AM7A 3CJCA 4CZEA 2HMIA 1BUPA 4ILHA 3ZX2A 1WSIA 5KGXA 4RCHA 5KRTA 4BRPA 3U8XA 3S3NA 3CPWM 3VF2A 4B3MK 4IEIA 1U45A 1QSSA 1RT7A 5HRPA 4CEZA 2D0CA 3D2FB 3P39A 3L4IA 3PIOL 1ZYQA 3AY9A 2X78A 3MAQA 3P83D 2FLOA 3R9PA 4AHTA 4ZTFA 3DAWA 1C0MA 1KSPA 3VGMA 4B9QA 2GV9A 3F5TA 1TUYA 2IIRA 4WQ4C 1L3SA 4FJNA 3H3OB 2O8DB 4OGEA 4NCGA 1GLBG 1X3MA 4O8KA 4CIEA 2A5XA 1KVBA 4BVOA 4CECA 3HP9A 1M90O 4FWSA 4KBOA 3KLEA 1XNRK 4BRHA 5J2NA 3UE5A 2E2OA 4B1UB 3VEWA 3WT0A 3B6PA 2YV0X 5CY4A 4AF1A 4KAZA 4CJSA 1VSMA 5LJWA 2QWPA 2YJEA 4NB4A 4QS7A 4MLHA 2A1RA 4XH4A 1SQKA 1T6CA 4JKAA 5AQGA 3QFUA 3GDQA 1U2VA 3LM9A 3R3LA 3ZX0A 5M1FA 4FW1A 2VG5A 3KTQA 1VSKA 3G71N 2DFEA 3TR8A 3NFAA 3S9HA 1NJWA 3LAMA 4C8NA 3A5LC 1I94K 4JLHA 1BOTO 4YFUA 3VTIA 2FF6A 3DXKA 2VQFK 4FSVA 5DM6L 2GELA 1YVNA 5C2DA 4O0JA 4LF5K 1RNHA 3CJ9A 4CIGA 3DXMA 2XY6A 3ENOA 1M1KO 3PO4A 1WSJA 3P4IA 1S1VA 3I0SA 4BE1A 4A59A 5AFUH 3NF6A 4H0YB 5AQIA 4NCAA 1NM1A 2QWNA 4KH5A 3VETA 5JVGL 3AA2A 3OYIA 4ID1A 4FPAA 1QVFM 3VA0A 1B92A 3H08A 2YNIA 2VQEK 4N41A 1TKTA 2P9PB 4M41A 3HT3A 4CI6A 3W3DA 5AQKA 3BEXA 4Y1DA 4DMNA 5LJVA 2HHVA 3L2QA 3A5MC 5KQ8A 2FSJA 2IGIA 4ICLA 3OYBA 2G8KA 4V19S 3ENBA 1Z26A 2B5JA 4CZKA 2W42A 4Y1CA 4O5BA 5AJ3K 3G25A 1BIUA 5FLXO 5AQJA 4E1JA 3L6QA 2Q36A 3CCEN 2P1JA 3CMEN 1GOCA 1RT4A 3TSPA 3K5OA 1HRHA 4IO8A 4QS8A 1VQON 3SV4A 1I3AA 5AQXA 1EP4A 2YNHA 4DTPA 3MK6A 4JKHA 4KTZA 2DFHA 4DR2K 1CXUA 1JLGA 4C1NI 4Z4EA 4ELTA 1VSFA 4FCYA 4BRDA 3U3YA 3CQYA 1U47A 3AVJA 4FWKA 2YKMA 4W5RA 3MEDA 4ZTJA 1D4XA 3UKUB 4DLGA 2WONA 2Z1JA 3F9MA 5GAEP 3AA3A 4B9UA 1J54A 4BEBA 1ATRA 1U04A 4LF9K 2FF3B 4HCBA 4O4GA 3HOSA 5AQFA 2C1IA 4FLTA 3U6FA 3OS2A 1VQMN 3QEXA 4CW7B 5CZ1A 1KLNA 4LC9B 4I6MA 2A42A 4F8RA 1TK8A 2VWJA 2PY5A 1L5UA 2O8FB 5CZ2A 4CERA 5HOOA 5A2QO 4K25A 4O8UA 5F0XA 4CZLA 3SUNA 4CJLA 3WXMB 1KTQA 3KK3A 3VQ9A 3PX4A 4M3XA 4DV1K 4A57A 3AVKA 4GNIA 3VERA 3ZEUB 1OH8A 3OVNA 5AZJA 4CZFA 2HVIA 4PKIA 2VGMA 4DV3K 3TTFA 3OS0A 1B9DA 1LWFA 4PA1A 1WN7A 3V1RA 1HNWK 3E01A 4ILGB 5KTQA 1VQLN 2YCHA 5KI6A 3CXCM 5GIPA 4JI4K 4BY9C 3AO2A 1YVUA 1QQMA 3NF8A 4RW7A 1VQ8N 4JI5K 4LFCK 1HKGA 3D2EB 3D2FA 4X62K 4K8XA 2OZMA 4L8RB 4FOIA 2G8HA 3RR8A 1Y97A 1BCMA 3C95A 4JKGB 4B8AB 3AA4A 3NVKA 1RFQA 2O8DA 1FKPA 4E7JA 1SAZA 3FR0A 3G6EN 4J2DA 4B9TA 5AQWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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