3U9DA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-24) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 13-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 107
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9dA03
2ZWHA 3U9DA 4BRGA 3VESA 3QFPA 4ISFA 5AQZA 3UKRB 1C0GA 3H45C 3I33A 5AZJA 2ASPA 1Y64A 3ENHA 2A5XA 4RCHA 4IXCA 1K8KB 4BRHA 5JMVA 1E4GT 3QDKA 1NGCA 1WOQA 4WQ5A 3L0QA 5BN9A 1YUWA 1LOTB 2ASMA 2D1KA 1BUPA 3FZHA 5KPTA 3HM8A 4FOEA 2CGKA 1E4FT 1GLAG 1K8KA 2HOEA 4BR0A 4CZHA 3AAQA 2HF4A 3VGLA 3GDQA 2V7YA 4WQ4A 4BRDA 4Y0WA 5B8HA 5FPDA 1NGDA 3M3ZA 3DXKB 4BC4A 3VEVA 4H5VA 3SK3A 3O8MA 1NGBA 5EXWA 3O08A 1YVNA 1RFQA 3CERA 3IDHA 5AQWA 4MLHA 2IVOA 4F9OA 4JD2B 2VWBA 3FE1A 1NGHA 3EKUA 1NGGA 3BP8A 5KPZA 1GLDG 2AP1A 3VF6A 1YXQA 3ID8A 2IVNA 2FSJA 2Q31A 4B1VA 2VYPA 4CZMA 3H1VX 4BC3A 5AFUA 5AQKA 3UKUB 2YJFA 5AQGA 2FF3B 2P9LA 2NZTA 3MMVA 3VEXA 3R9PA 3C0BA 3TPQA 3QFUA 4B9QA 5FPMA 1LCUA 4C23A 2OANA 3SMPA 5AQVA 2YHWA 1JCFA 1GLEG 4QS7A 5AZIB 1D4XA 4FWNA 2P9IA 1SQKA 5AQQA 4AM6A 4JN4A 5BRHA 3CETA 2W40A 4CZJA 3SJHA 3QICA 3CQXA 1HX1A 3VEYA 1JCGA 2NRHA 3LDNA 4CBXA 3C7NA 4O8KA 4BR2A 3VGKA 4B1ZA 4QS9A 3FR0A 5AZJB 1X9JA 3IFRA 1T6CA 4BC5A 2CGLA 2P9KB 4KBOA 5BPNA 3FZMA 2J4RA 1TUYA 3VEOA 2FSKA 3P4IA 4FSVA 2FF6A 1BO5O 1NGEA 3BUZB 2FLOA 1BA1A 1J6ZA 3M6GA 4BC2A 2YJEA 2P9NA 4BRQA 2F9TA 3H1QA 4B1XB 3ENOA 4JAXA 2P9NB 1DGKN 4HWIA 3KVGA 1C0FA 2QWLA 1QZ5A 4FPBA 4EFHA 2Q2RA 1IG8A 3GG4A 3ULEA 3BEXA 3UE5A 3UKRA 3SMSA 2ZGZA 2Q0RA 2E1YA 4A2AA 4A61A 3FLCO 2QWQA 2Q1NA 1JCEA 4DQ8A 5AQTA 1V4TA 2YI1A 5EY4A 4PKHA 2FSNA 3DXMA 1QQMA 4DHYA 2DPNA 3CJCA 1HPMA 3A5NC 4J8FA 3D2FB 3ZETA 4BQLA 4H0PA 5BPLA 3LM9A 1HKCA 5F2RA 3O80A 5AZIA 3VEWA 3D2EA 2VCPA 3CJ1A 1QQNA 3GBTA 3EL2A 3FFKB 4BR7A 5BRDA 2QWOA 5KQDA 4JD2A 1U2VB 4FO0A 1QQOA 4BRMA 3O1BA 3SLCA 4BR9A 5FPEA 3WUHA 1NM1A 2IVPA 2YHYA 3O6WA 1S3XA 2D0PA 1QHAA 1SAZA 3DXKA 4CBWA 1MWKA 1XQSC 3WXJA 5AQFA 2BTFA 1Q18A 1GLLO 2P9UB 4EAHD 1Z6RA 3HI0A 1KXPA 1X3MA 4EHUA 4IZ9A 5AQNA 4Z94A 4EHTA 1ESVA 1NGAA 2Q97A 2A42A 2D4WA 4RTFD 5LJWA 1MWMA 4LC9B 1BWFO 1V4SA 1NGIA 1KAYA 3B8AX 3AARA 3L4IA 2GELA 2ZF5O 5AQSA 5F1XA 3QMLA 1BDGA 1ATRA 5AQIA 3HZ6A 1CZAN 4NB4A 4FWMA 2QWPA 3WQTA 1ZXOA 5ELZA 3AAPA 2W41A 3MK6A 3VETA 5AQUA 4A2BA 2P9PB 4GNIA 3WXLA 4K41A 5KQ8A 3RSEB 3LDPA 1GLCG 4CD1A 4JHDA 3HSCA 5EVZA 3FZLA 3QB0A 3MN5A 2V7ZA 4MLEA 4PL8A 1H1VA 2E88A 2P9PA 3EZWA 4M7YA 5AR0A 1ATSA 2GTDA 3CJAA 4XH5A 4H5NA 4FWOA 2GEMA 1MDUB 5BRFA 3HTVA 4H0OA 3EO3A 5FPNA 3WEEA 2QWNA 1GLJO 3GE1A 5EOYA 4E1JA 3U8XA 3OHRA 5AQOA 2P9IB 3G25A 3MN9A 4XEIA 4BRPA 3ZX0A 3O4WA 3VGMA 3O5BA 3RSEA 4I6MA 2V51B 3DJCA 1S22A 4YDUC 4CBUA 3LDOA 1HJOA 4JHDB 5AQXA 2QW9A 2A3ZA 3DWLA 2NLXA 1P8ZA 1T44A 2QWMA 3CJBA 1OKJA 3LDQA 1DKGD 2UYTA 4A62A 2IIRA 3MN7A 4FOIA 3VPZA 4IJNA 2AA4A 1NWKA 3M1FA 3CJ9A 3W0LA 4FWKA 4MO4A 4H5RA 5ADXH 1ZC6A 2A6AA 2P9SA 2QM1A 5AQPA 4BRCA 1ATNA 3U4LA 5BN8A 4FWPA 4QS8A 2E2OA 2D0OA 1IJJA 1HKBA 1TUUA 4L3QA 2ZGYA 3ATUA 4FWSA 3I8BA 1NMDA 4BG8A 4BR4A 1GLFO 4BRKA 3GOIA 3ZEUB 4BVOA 5AQLA 3R8EA 2YHXA 5I9EB 3W3DA 3CJ7A 3D2FA 2EWSA 3BF3A 3VERA 3A5LC 2P9UA 4DCHA 1R59O 4WQ4C 3A5MC 4BRNA 2ITMA 2Q0UA 4HTLA 2F9WA 3A8YA 2GUPA 2QXLA 4BVPA 2BUPA 2CH5A 3VF2A 5E84A 3FZFA 4I6MB 1U2VA 5JLHA 4BRAA 1HKGA 4EIAA 2CGJA 4WQ5C 3BF1A 1Z05A 3WQUA 2HMPA 1EQYA 4M7XA 2E20A 5EX5A 3ZETB 4H0VB 2A41A 5JLFA 5AQJA 3WEEB 3H3NO 1XUPO 3R6MA 1KAXA 1X3NA 2E2NA 1NGJA 3VENA 3IUCA 2I7NA 2P9KA 3GL1A 3U9ZA 3D7EO 3WXIA 1KAZA 1RGIA 2CH6A 3WXKA 4PL7A 2GWKA 4BGAA 4BRLA 3ZX3A 4CZEA 3DAWA 4B1YB 4CI6A 1DEJA 1HUXA 3J8AA 3VF4A 1BG3A 1NGFA 3CI5A 3QBXA 4WYBA 5KPRA 1RDWX 3H3OB 3C7NB 1ZBSA 4O5FA 4BROA 4XH1A 3JS6A 1G99A 3ATVA 2KHOA 4BGBA 3LL3A 4CZLA 4JNEA 4AM7A 4MO5A 4K42A 3ULEB 4RWTA 3WT0A 4CZGA 1NLVA 2A40A 4FPAA 4BRIA 3QBWA 5ADXA 4FL9A 2P9LB 2PBDA 5TKYA 2QWRA 2HF3A 2FXUA 3A0IX 3UKUA 1SZ2A 4PKIA 3AY9A 5JICA 3LM2A 3KHYA 4H0YB 4ISGA 1WUAA 1YAGA 1QZ6A 4H03B 4PKGA 5AFUH 3VEZA 2YCHA 3EN9A 2WUSA 4FWLA 3HBTA 4BREA 3LDLA 5CE3A 3O1WA 1TYQB 1U6ZA 2E8AA 5BREA 3ZEUA 3FZKA 5BPMA 5AQRA 1T6DA 1TYQA 3CQYA 4H5WA 3FGUA 3A5OC 3TU5A 3DXMB 3S41A 3MDQA 2P9SB 4CJ7A 4CZFA 4CZIA 3H6EA 4BRFA 4FWQA 4BR5A 4H0TB 5LY3A 2E2QA 2E1ZA 5LJVA 3F9MA 3L6QA 3EKSA 4CD3A 4B1WB 4IWVA 4NO7A 1NBWA 2I7PA 2V52B 2E2PA 4H0XB 5F0XA 5AQYA 4XH4A 5BR9A 4B1UB 2ASOA 4CZKA 1MA9B 5AQHA 3MN6A 3JXUA 2Q36A 3ZX2A 1HLUA 4BG9A 4ISEA 4BQZA 3CHWA 3KZBA 3IMXA 3CIPA 1BU6O 2PAVA 4K43A 4YDUA 3VOVA 4FWRA 3D2EB 5E26A 1XC3A 2GWJA 5AQMA 3MCPA 4IO8A 1BOTO 2H3GX 4GY2B 4H5TA 1GLBG 4M63C 4DB3A 4IJAA 1BA0A 3UB5A 4K25A 3H46O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZWHA 4JKGB 4EZ6A 4JKAA 3UKRB 1C0GA 4KO0A 2YKMA 1Y64A 3ENHA 5K14A 4CFCA 4RCHA 2E5LK 4A57A 1HQUA 5JMVA 4DTXA 2HNYA 4WQ5A 4DV1K 1S1WA 4B9NA 4J2BA 1LOTB 2ASMA 3MEEA 4N41A 2FBYA 2DFHA 1E4FT 2OA8A 2HOEA 4DWIA 3VQ4A 3NF7A 4YOXA 3NDKA 4AQYK 2JWLA 3ZCMA 1L3UA 1HMVA 1KVAA 5FPDA 3M3ZA 3DXKB 4BC4A 3VEVA 3SK3A 1VRTA 5GIPA 4DSLA 4B3RK 2G8UA 4DTMA 2D5RA 3O08A 2G8IA 3U3YA 1YVNA 1RFQA 3IDHA 1ZYQA 3THWB 1N8RO 3CYMA 4F9OA 3NF9A 3J7ZO 1NGHA 4NXMK 3KD1E 1C0UA 3QLHA 1GLDG 5KI6A 3BZCA 1K8AO 4KV8A 3ID8A 5A2QO 3CD6N 2IVNA 3T7ZA 1U49A 3KKSA 2FSJA 3CXCM 4X66K 1HYZA 1NJWA 4CZMA 3KLIA 1N36K 3HPHA 2O4IA 3TTCA 3MMVA 3V9XA 3R9PA 3TWHA 3QFUA 4FJLA 2G8VA 5AQVA 4DR2K 1HYVA 4OPHA 1S72N 2OTLN 1JCFA 4QS7A 5H1SQ 5AZIB 4FWNA 1LW0A 1SQKA 5AQQA 4CJWA 4A5BA 1RDUA 3AA2A 4CZJA 4B3TK 3LDNA 2A1SA 4CBXA 1ASUA 4BR2A 4AILC 4B1ZA 4QS9A 3IS9A 3VA3A 2CGLA 5DM7L 3KLEA 4CJPA 1K73O 3RRHA 1WSHA 3FZMA 2J4RA 5BPNA 4JKFA 3VEOA 3VQ9A 3CF5L 4DQSA 3CCSN 4DFPA 3TAPA 1J6ZA 3M6GA 3AVFA 3NF8A 3CFPA 4BRQA 3TAEA 1IBKK 4HWIA 1DGKN 1JXEA 3K58A 3KVGA 4Z0UA 4CEZA 1WSGA 4BACA 1C0FA 1N5YA 4DTOA 4JKDA 1RILA 3BEXA 4FJ5A 3UKRA 3TAQA 3QETA 2Q0RA 2E1YA 2KQ2A 4FLVA 4A2AA 3SQ4A 4F4KA 3N4PA 3DYAA 2VWKA 2BDPA 1IV0A 3DLRA 5AQTA 1B9FA 1V4TA 5DMRA 2O8BA 2YI1A 4EP4A 4JS5A 4CJUA 3E9PA 1A5XA 1RBVA 3JYTA 3CJCA 3ZETA 1HPMA 3LP3A 4BQLA 3P83D 1S1TA 1RBRA 4ILJA 5GAGP 5F2RA 3AVCA 3E01A 4MQ3A 4YOUA 3OYJA 3C6TA 3SQ0A 3VEWA 3D2EA 1QQNA 4O5BA 3FFKB 2QWOA 5KQDA 4MDBA 1U2VB 4QOZB 3KLFA 4TSXA 2VQEK 3LPTA 3OS1A 3G6EN 2XHBA 1XQSC 1I3AA 3PV8A 4CFBA 2W6KA 4B9TA 1OVYA 3MEDA 1T05A 3K57A 3QEWA 4EHUA 5JS2A 3Q7CA 5AQNA 1J54A 1NGAA 4OJRA 4PUOA 1WNSA 2PFUA 4LC9B 4OGEA 4BE7B 3OYDA 1KAYA 3B8AX 4FK2A 4CIEA 1X9SA 2GELA 2YNIA 1BDGA 1NKCA 5GADP 3CC2N 2HVIA 1ZXOA 3KTQA 1TGOA 3NMUA 3MK6A 5AQUA 4H8KA 1NJIO 3LAMA 1NOYA 3QINA 4GNIA 1VQ6N 2GUIA 3LDPA 4CD1A 4W5QA 2YNHA 3HSCA 1OH8A 1XMOK 2UUAK 1X9WA 3ZSQA 4JI0K 2UXBK 4LH4A 4AHCA 3EZWA 4ID1A 3E1YA 1ATSA 1QQCA 3ZSRA 2GTDA 4W5RA 4H5NA 5HOOA 1VQ8N 1SKRA 2Y1IA 1L3TA 4JV5K 1RT1A 5FPNA 3L2RA 4J2DA 5SWMA 2QWNA 2HW3A 1GLJO 5CZ1A 1ZBFA 2KLAA 5M1KA 2ZJRL 1KVCA 1TKXA 4BRPA 3T1AA 1WBDA 5HL7L 3LDOA 2UUBK 4JHDB 5AQXA 3SUPA 3V1RA 4AHRA 4FJGA 4FK0A 4DR5K 4E7KA 2GX9A 3DWLA 3VQDA 3ZSYA 3HP9A 2IC3A 2NRVA 2UYTA 1REVA 2IIRA 3BDPA 3VPZA 2B4JA 3L2QA 1WSJA 3CJ9A 1CXQA 5LMUK 1N6QA 4F3OA 1VSKA 1VQ5N 1YT3A 4H5RA 3V9ZA 4B8AB 1ZC6A 2A6AA 1NOZA 4C8OA 4JLHA 3CFRA 3K5MA 2NRWA 1HKBA 1TVRA 4L3QA 1GLFO 3G0ZA 1RTHA 3OJUA 2EWSA 3WNEA 3OY9A 4F2RA 2RPIA 2Q0UA 4F3TA 4M42A 2HHVA 4BVPA 3K9KA 2WBNA 3VF2A 1Y97A 4FJJA 2VG5A 4FJNA 1HKGA 1TK8A 1VSHA 4B9VA 1GOAA 1Q7YO 2IOCA 4KHYA 3NGIA 3NFAA 4OPAA 4DFMA 4LSLA 4FLZA 3NVMA 2E20A 2ZD1A 4CEOA 3R6MA 1BI4A 3ZT2A 1NG9A 4JKEA 1X3NA 5C15A 1TAUA 1NGJA 3IUCA 3U9ZA 1YJ9N 2G8FA 1RGIA 2CH6A 2VQFK 4DV6K 3EZ5A 4BGAA 4CZEA 3ZX3A 3B6OA 1QE1A 4JI2K 4BEBA 1EWQA 1OH7A 4KH4A 1JLGA 4DTPA 4LFBK 4Z4CA 3K2PA 3E9LA 1NNEA 4JNEA 4KTQA 2E6MA 3M8PA 2O8FB 2VGNA 1LWEA 3SJJA 5TKYA 1BCOA 3AY9A 4I9QA 3P38A 4DS5A 3QIPA 3DRRA 4GW6A 5C2DA 1YAGA 1RDAA 2HBKA 4M41A 3HBTA 4DTJA 1YI2N 4PA1A 2F96A 4IEIA 2NRRA 3ZEUA 4J2EA 1BGXT 2P5OA 3S3MA 3EE9A 3MWTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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