3U9DA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-24) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 13-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
total genus 107
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9dA03
4ISGA 3UKUA 1ESVA 2HMPA 3TPQA 3D2FB 1XC3A 3L0QA 3ZEUB 4BRCA 4BRIA 1NGCA 2YHWA 3MK6A 4EHTA 4BRKA 4QS7A 4IZ9A 2Q2RA 2IVOA 4I6MB 1QHAA 4PKIA 1GLEG 3DWLA 3VEZA 3SK3A 3AY9A 3BUZB 2Q97A 3ZETA 4M7XA 4FOEA 2QW9A 5AQTA 2DPNA 2I7NA 3EKUA 1BA1A 3OHRA 1T6DA 2FSKA 2Q1NA 3MN6A 5AQVA 4BQZA 5AZJA 1TUUA 5BRDA 4JHDB 4F9OA 4FWQA 5AQJA 2A5XA 4ISFA 4CZJA 2ZWHA 1SZ2A 5F2RA 3VETA 3QDKA 4FPBA 1KAYA 3H1VX 1S22A 4BGBA 5LJVA 4EFHA 4XEIA 5AQHA 2QWLA 3JS6A 2HF3A 3O1BA 5AZIB 4BGAA 3EO3A 1NGJA 4MO4A 2IVPA 4BC5A 1MWMA 4AM7A 3MCPA 1BO5O 2VWBA 3FZLA 4A61A 4B1VA 4BR7A 5TKYA 3SJHA 4BR4A 3HZ6A 3IFRA 2P9LB 3DXKB 3D2FA 3R9PA 4NO7A 4M7YA 2UYTA 4A2BA 2Q0UA 3EKSA 3FGUA 2AP1A 1QZ5A 1D4XA 1GLAG 1TUYA 1RDWX 5E26A 2A41A 2V7ZA 1C0FA 1WUAA 3LDNA 4B1YB 3A5MC 2E20A 3UKUB 2J4RA 1IJJA 3VEOA 1NGEA 5AQSA 4PL7A 5AQOA 4Y0WA 3U4LA 4GY2B 4O8KA 5AQZA 3FZHA 3ATUA 1ATRA 3U9DA 3VGLA 3QBXA 1HLUA 3R8EA 2Q36A 3GDQA 1V4SA 1BA0A 4IO8A 4MLEA 4BREA 1WOQA 1U6ZA 2D4WA 2F9TA 3O5BA 4H5TA 3FFKB 3ZETB 5JLHA 5AR0A 1X9JA 4BVPA 5AZJB 4HWIA 5AZIA 3G25A 5AQKA 4B1UB 4JD2A 3CJ1A 1NLVA 4QS8A 2E2OA 1GLFO 1XQSC 2WUSA 2P9PA 2HOEA 3AARA 5FPNA 2GEMA 1MDUB 3QFUA 3MN5A 5AQFA 4CZHA 4H03B 4FSVA 3L6QA 4H5WA 2YCHA 1LCUA 2QWQA 2V51B 2P9SA 1J6ZA 4H0TB 4BR0A 3A0IX 3SMSA 1EQYA 4EHUA 4CJ7A 3A5NC 1RFQA 3UE5A 3KHYA 3QMLA 1GLBG 3FZKA 4HTLA 3M1FA 1BUPA 4EAHD 5CE3A 4H5NA 5AQRA 3MDQA 3CQXA 5JMVA 4CBXA 2E2QA 1TYQA 4XH5A 2KHOA 4CZMA 4FWRA 3O80A 4A2AA 2FXUA 2F9WA 3O08A 4B1XB 3WUHA 3O8MA 4A62A 3DJCA 4WQ5A 4WQ5C 4K25A 1HKCA 1MA9B 5AQLA 4QS9A 2D0PA 3BEXA 3KVGA 4BC2A 1YXQA 3VEXA 1S3XA 2CH6A 5KPRA 1NGGA 3QICA 3VEVA 5KPZA 4B1WB 2CH5A 2CGJA 1DGKN 3O6WA 3S41A 1NMDA 4H0PA 3ULEA 1NBWA 3TU5A 2YI1A 2P9UA 4CZKA 3LM9A 4H0OA 3CJBA 3VESA 4IJAA 3J8AA 2QM1A 3C7NA 3I8BA 4FWNA 2GELA 3WXLA 3A5OC 3FE1A 3BF1A 4CD3A 2AA4A 4BC4A 1T6CA 3JXUA 2QWNA 2CGLA 2E1ZA 5AQNA 2Q31A 4JD2B 3UKRB 2YHYA 1QQNA 5EY4A 4CZEA 4EIAA 4DQ8A 2P9PB 4DB3A 2D1KA 3HM8A 2NZTA 5BPNA 2P9SB 1JCFA 5JLFA 4XH4A 4B9QA 5FPEA 1NGIA 2FF3B 3ID8A 4JAXA 5FPDA 2P9NA 4E1JA 1Z6RA 3LDLA 3H1QA 3VF6A 5AFUH 3BP8A 2NRHA 3WXIA 1GLJO 5ELZA 3H46O 1BG3A 2ZF5O 3CIPA 3L4IA 1TYQB 2P9IB 3MMVA 1QQMA 3QBWA 4MO5A 4WYBA 4BRMA 4BVOA 2QXLA 4BR2A 1ATSA 4H0XB 5AQWA 4BRQA 3VERA 5KQDA 3UB5A 4WQ4A 1HKBA 2QWRA 1RGIA 3ENOA 1HPMA 1GLDG 4AM6A 3CETA 3IDHA 4B1ZA 1T44A 2V52B 1JCGA 2W40A 5AFUA 5ADXA 4RWTA 3HI0A 1JCEA 5AQXA 1NGAA 2GWKA 3WEEA 2FLOA 4BRFA 2P9KA 1MWKA 3AAQA 4PKHA 5EXWA 4BR9A 1GLCG 1NWKA 4NB4A 1X3NA 1NGHA 2GUPA 3P4IA 3SMPA 3UKRA 3ULEB 4K43A 4CZLA 5LJWA 2P9UB 3LL3A 3M3ZA 4RCHA 3DAWA 3MN9A 1G99A 3F9MA 3LDPA 3C7NB 4CD1A 3VF2A 4IXCA 5JICA 3CQYA 3ZX2A 4CZGA 3QFPA 2E8AA 3FLCO 3VOVA 1YVNA 2ASOA 1X3MA 2FSNA 1HUXA 3IMXA 1NGFA 2A42A 3DXMB 3AAPA 3WT0A 4JNEA 3W3DA 3GOIA 2P9IA 3B8AX 1C0GA 5AQQA 2BUPA 4Z94A 1DKGD 2FSJA 2P9NB 2ASPA 2A3ZA 4FWOA 1ATNA 3LDQA 3VF4A 3WQUA 3I33A 1U2VA 4ISEA 5F1XA 1ZC6A 3H3NO 4BG9A 2CGKA 3EN9A 3FZMA 2BTFA 1BU6O 2E1YA 4CBUA 1KAXA 1YAGA 1HKGA 4L3QA 4PL8A 5AQPA 3H3OB 5AQIA 5BPMA 1KAZA 4FOIA 4DCHA 3ZX3A 1BDGA 3GL1A 3O1WA 4M63C 3M6GA 4FO0A 5BRFA 3VENA 4O5FA 5F0XA 3HTVA 2A6AA 2H3GX 3D2EA 3CI5A 1Q18A 4BRPA 3U8XA 1NGBA 5KPTA 3ATVA 4BROA 2YJEA 3IUCA 4PKGA 3VEYA 2QWMA 2VYPA 3WEEB 2QWPA 2P9KB 2GTDA 1R59O 3GE1A 3O4WA 3GBTA 4BRNA 5BN8A 4H5RA 3VEWA 1Z05A 2PAVA 4FWKA 4JN4A 3DXMA 4FWSA 3HBTA 2HF4A 2I7PA 1Y64A 5BR9A 2W41A 3LM2A 1BWFO 5BN9A 4H0VB 4CZIA 5B8HA 4GNIA 2D0OA 5ADXH 3A8YA 1HX1A 3KZBA 2A40A 2Q0RA 4H5VA 4BR5A 2E2PA 4KBOA 2FF6A 5BPLA 3FZFA 5KQ8A 2E2NA 2PBDA 2GWJA 4BRAA 1ZXOA 5AQMA 1SAZA 4RTFD 2ASMA 3RSEB 4CBWA 5AQUA 5EX5A 4YDUA 5BREA 4YDUC 4FWMA 3EZWA 1SQKA 3QB0A 3VGMA 1K8KB 3ZEUA 1BOTO 1E4FT 3A5LC 3MN7A 4LC9B 1U2VB 4WQ4C 3LDOA 4BQLA 1DEJA 5AQYA 4C23A 5BRHA 4BRLA 1HJOA 3CHWA 3W0LA 4FWPA 1QQOA 4I6MA 5LY3A 1QZ6A 1YUWA 4J8FA 1GLLO 4XH1A 3WQTA 1ZBSA 3WXJA 2V7YA 1CZAN 3R6MA 2IIRA 3C0BA 3EL2A 4IWVA 4MLHA 4BG8A 3D2EB 3H45C 4IJNA 4JHDA 2VCPA 1H1VA 3VGKA 2E88A 3WXKA 4CZFA 1LOTB 2YJFA 1V4TA 1NGDA 3CJCA 4FPAA 3FR0A 4K42A 1E4GT 4K41A 4H0YB 3H6EA 1NM1A 2IVNA 2YHXA 4BRDA 5EVZA 2ZGYA 3VPZA 3CERA 3U9ZA 4BRHA 2QWOA 1KXPA 1XUPO 3HSCA 4FWLA 4BRGA 4DHYA 3CJAA 3ENHA 4BC3A 5AQGA 3BF3A 3CJ9A 1P8ZA 5I9EB 1IG8A 5EOYA 5FPMA 4FL9A 1OKJA 5E84A 3RSEA 2EWSA 2OANA 2P9LA 3DXKA 4CI6A 2ITMA 1K8KA 3GG4A 3ZX0A 3SLCA 3CJ7A 3D7EO 2NLXA 2ZGZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4E1MA 2DFEA 1N8RO 1EP4A 3T1YK 4EP5A 4F8RA 4KB0A 4QCLA 4N5SA 3HL8A 3ZT0A 4JKHA 4M3ZA 2XY8A 3MK6A 1QVGM 1JLEA 4EHTA 4CGGA 3CYGA 4CHOA 4RW4A 3DRPA 4I7FA 4DTOA 2IVOA 1GLEG 3DWLA 1UAXA 2VQFK 3BUZB 2Q97A 3NF7A 4F3TA 2QW9A 3ZCMA 2DPNA 3OHRA 1SL1A 1VSEA 3E1YA 2Q1NA 1WSJA 2Y1IA 1XNQK 4CZJA 4ISFA 2D0AA 1WBBA 3QDKA 3H1VX 1RT2A 1S22A 5LMNK 3PY8A 4KREA 4BGBA 3A2FA 3HOSA 5LJVA 3SJJA 2QWLA 4M3TA 1OH5A 4CHZA 1G15A 2HF3A 4R5PA 3VTIA 3NH0A 3ZSWA 1RBVA 3EO3A 2HBMA 3OW2M 1J54A 4AM7A 5C10A 3ID6A 4A61A 4B1VA 2NUBA 5TKYA 4BR4A 2ZM6K 1YI2N 3R9PA 4NO7A 4M7YA 1KLMA 1IBMK 1C0FA 3LDNA 4DQQA 3A5MC 2E20A 2HHUA 1HYSA 2YNIA 4DSJA 4PL7A 2UU9K 1UA1A 4PHTX 3THXB 1NJIO 3VQQA 3ATUA 2YHBA 3FFIA 4Z4GA 3L2QA 1WSGA 2FBVA 1HLUA 3QBXA 4DFPA 2Q36A 3SUNA 3OJSA 4DSIA 4CIFA 4CJ3A 3K59A 3HXMA 5CY4A 2D4WA 2F9TA 4H5TA 4C8MA 3ZT2A 3ZETB 3HM9A 4LF7K 4DS4A 3SQ4A 2G8WA 1HNXK 4BVPA 5AZJB 2YHAA 3LZIA 4HWIA 3G25A 3U6FA 1NLVA 3PUFA 1XQSC 3C95A 4RW9A 5FPNA 2F8TA 3O4NA 4KH5A 5AQFA 4H03B 4H5WA 2P5GA 2YCHA 3VQ9A 4OO1J 1YJ9N 4CJPA 3DLGA 4CJ7A 4CHPA 3QMLA 1GLBG 5J2NA 4JEPA 1BUPA 2WC9A 4WF9L 1YJWN 4JI8K 4H8KA 4CF1A 2ITGA 3OS2A 4HUEA 3EZ5A 1TYQA 4XH5A 2KHOA 2DFFA 4FJXA 3THXA 3LAKA 1O1WA 2GUIA 3SAHA 3QESA 4CGFA 1VQLN 1RTIA 2O8FB 4EP4A 3DJCA 1KC8O 1NK9A 2UUBK 3CPWM 4CJEA 1A5XA 2OPPA 3TAFA 4B9VA 3NF8A 3QICA 4GMJB 3VEVA 3SNNA 4EZ6A 1LV5A 4DTMA 4E7HA 3BDPA 4FJIA 5JS2A 4KV8A 4IDKA 4W5TA 3DOKA 2YI1A 2ZJQL 3NCIA 4KPYA 3LPTA 3LM9A 4H0OA 1EWRA 3T69A 2FBTA 4ZTJA 3FE1A 3BF1A 5HP1A 4KTZA 1T6CA 2OPQA 2PYLA 1NK7A 4CK2A 2Z1JA 4ID1A 4JD2B 2YHYA 3CC4N 3RR7A 3CM5A 2P9PB 4DB3A 2D1KA 4IFEA 3CCSN 2NZTA 4LSNA 4DF8A 3KLGA 1NKEA 5FPEA 3LAMA 5FPDA 2OA8A 3VF6A 2F4VK 1Q8IA 1KVCA 3C6TA 2G8HA 1E3MA 3LP0A 4C8NA 1R0AA 3AV9A 3MMVA 1IKYA 4MO5A 4BVOA 1UWBA 1ATSA 4DU4A 5AQWA 1WNSA 4KO0A 3TABA 1U4BA 3UB5A 3E01A 4YOVA 3M8RA 1JLBA 3PX4A 4DTXA 4B1ZA 4OLBA 1T44A 2W40A 2AJQA 2G8UA 1JCEA 2WBNA 1TV6A 1NGAA 3CCVN 3LP3A 1NWKA 3TANA 1X3NA 2GUPA 3C6HA 4O4GA 5IT9O 4K43A 4B8CA 3M3ZA 4RCHA 2BDPA 1YF5L 3DAWA 1J5OA 3MCAB 3LDPA 3C7NB 3CPEA 1WSHA 4IOCL 4JV5K 4IXCA 5JICA 3KJVA 2D5RA 3MXIA 3CQYA 2PFUA 5C0YA 3ZX2A 4CESA 1TK0A 2E8AA 3KK3A 1P90A 1NG9A 3AA4A 2G8KA 1X3MA 1HUXA 2ZD1A 3AAPA 3DLLL 3W3DA 3O9UA 1X9MA 1DTQA 3ASMA 3B8AX 4E1NA 1FKPA 1DKGD 3CFOA 3CG7A 4FWOA 1ATNA 3NVMA 3WQUA 1U2VA 1BIZA 2Z1GA 3FZMA 2BTFA 2E1YA 1U45A 2IS3A 4L3QA 3H3OB 3P39A 2BE2A 3ZX3A 2YKMA 2PZSA 1RNHA 3GL1A 1BI4A 5BRFA 2GV9A 3D2EA 4CJFA 3CI5A 1NGBA 4MFBA 1DLOA 3ZSQA 3O4QA 3DRRA 4CF2A 1GOCA 1FXXA 1R59O 1IBKK 4OGEA 3GBTA 3VEWA 5J2QA 3K0SA 4DV3K 2PAVA 1CLQA 4E0DA 3ZYYX 5CZ1A 1X1PA 5BR9A 2W41A 4DLEA 1RDBA 5BN9A 5B8HA 4CJ5A 1HQUA 1ZBIA 1Z25A 3TARA 4BR5A 5BPLA 1S1UA 2E2NA 1KSPA 1NNEA 3KKRA 3L2RA 1JLCA 1B9FA 1YHQN 4RW7A 3EZWA 1SQKA 3T19A 1KVBA 1UA0A 1BOTO 4MQ3A 2Z1HA 3A5LC 4WQ4C 4DV1K 1HNZK 4BQLA 1DEJA 1NK8A 4BRLA 4CECA 4FWPA 1N36K 4I6MA 5CYMA 1QZ6A 4O55A 2RE2A 4OKEA 1CZAN 1YTAA 3K5NA 1N6QA 4CJRA 3NF6A 1ZBFA 3QEXA 4IWVA 3UIQA 3RMCA 3H45C 3B6PA 2VCPA 4DV5K 4CJSA 1M1KO 2OPSA 3N4PA 3OTOK 3JYTA 3DMJA 3OYHA 1E4GT 4K41A 4X65K 4JI1K 1NM1A 1YITN 4J2AA 2ZGYA 1XNRK 3KWIA 1VQ8N 3VPZA 4E72A 3OYLA 1B9DA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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