3U9ZA

Crystal structure between actin and a protein construct containing the first beta-thymosin domain of drosophila ciboulot (residues 2-58) with the three mutations n26d/q27k/d28s
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
b'TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
total genus 119
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9zA03
4CD3A 1T44A 4WQ4A 3WEEB 4H0PA 2Q36A 4H5RA 4CZJA 1JCEA 3H3OB 5BREA 4K25A 3UKUA 3BF3A 4B9QA 3LDOA 1P8ZA 1NGCA 4FWKA 1BG3A 4B1WB 2GUPA 3ULEB 1RGIA 4BQZA 2CGJA 5AQMA 3AAPA 4FL9A 1HKCA 3FZMA 3O80A 5AQUA 1RDWX 3MK6A 5AQRA 1X3MA 2QWPA 3LL3A 4BRGA 5ELZA 1NGJA 1IG8A 1NBWA 2P9LB 1MDUB 4JD2A 3CJ7A 2E2PA 3QBWA 2FLOA 4XH1A 4O5FA 1YAGA 5TKYA 4KBOA 2E1YA 3QFUA 3TPQA 4AM7A 1QQMA 4FPBA 3UE5A 3FFKB 2E20A 3DXKA 3EN9A 5ADXH 1QZ6A 4CD1A 5AZIB 5AQIA 2P9UA 3ID8A 3RSEB 1ESVA 1KAXA 3VESA 4JHDB 5FPDA 3KZBA 1KAZA 4CZLA 2V51B 1EQYA 1SAZA 2GWJA 3DXKB 5AFUA 4RWTA 2P9KB 3GBTA 3FGUA 3EL2A 5JLFA 4Y0WA 3DWLA 5EOYA 4H5VA 1BDGA 4J8FA 3W0LA 2VCPA 3WXKA 4QS9A 1JCFA 2HMPA 1DKGD 1NGIA 4YDUC 3BP8A 3CQXA 3CERA 3WXJA 4BC5A 4IO8A 2P9SA 2P9NA 2D1KA 3O1BA 1RFQA 2A6AA 3M6GA 5BN9A 4ISFA 5AZJA 2F9WA 2QWOA 2A41A 2P9PA 1DEJA 4FWSA 4MLHA 1NGGA 3VENA 4H5NA 2FF6A 2NZTA 1U2VA 2Q2RA 4AM6A 3R9PA 3A5OC 4K42A 3UKRA 1C0FA 3KVGA 2IIRA 1U6ZA 2ASOA 5AQXA 4A62A 2Q0UA 3BUZB 4BRMA 3TU5A 2D0PA 2QWQA 2ASPA 3FLCO 2W41A 1T6DA 3HTVA 4I6MB 2E2NA 5AZJB 1LOTB 4CBXA 4L3QA 3JXUA 3QFPA 2CH6A 2HF4A 3ZETB 4JN4A 1HPMA 3MN5A 3VEVA 1ATRA 1K8KB 2E1ZA 2H3GX 4HWIA 3L4IA 2ZWHA 1J6ZA 3ULEA 2ITMA 4M7YA 1YXQA 2CH5A 5BPLA 3H6EA 3MN7A 2D0OA 4WQ5C 3VGMA 5LJVA 3C0BA 4PKIA 4O8KA 3UB5A 2PAVA 1Y64A 5KQDA 2BTFA 4FWLA 3OHRA 2BUPA 2P9LA 3EZWA 3VEOA 5JMVA 5JICA 4PL7A 4BVOA 1C0GA 3SK3A 5LJWA 3DXMB 3B8AX 4A61A 2YI1A 4DHYA 5BR9A 4B1YB 3ENHA 1NM1A 2VWBA 2KHOA 3WT0A 3VETA 3H3NO 5AQQA 1IJJA 1NGFA 5AZIA 3IUCA 5FPEA 3GL1A 3FZLA 1GLBG 4MO5A 3SMPA 4JNEA 4CZMA 4CZIA 3O8MA 1E4GT 3O4WA 4BGBA 3RSEA 2OANA 4YDUA 1MA9B 4BR7A 4MO4A 3ZX2A 3QB0A 4JHDA 5AQZA 4RCHA 4FOIA 1SZ2A 3LDLA 4IXCA 4BRFA 4BRAA 2E2QA 3CI5A 3A5MC 3I8BA 3O1WA 1KXPA 5LY3A 2P9KA 1WOQA 2ZF5O 4IJAA 4QS7A 1Z6RA 3U8XA 4BR9A 1BO5O 3G25A 3SLCA 2WUSA 3QBXA 4B1ZA 1QHAA 5AQNA 1GLDG 3ATVA 3FZKA 2AP1A 1XUPO 3EKUA 3VF2A 1NLVA 2AA4A 5ADXA 2P9IB 4FWNA 4BROA 4IZ9A 3H1QA 4FSVA 1Q18A 3DAWA 3S41A 3O6WA 5AQTA 4BC2A 2EWSA 2YHWA 5BRHA 1HLUA 1S22A 1XQSC 3WQTA 4H5TA 4CBUA 4H0VB 2YJFA 3H46O 4DB3A 3A5NC 1NGEA 4BRKA 4MLEA 2HOEA 3HSCA 4BRQA 2FXUA 1DGKN 1TYQB 4WQ5A 3LM2A 5AQOA 3H1VX 4I6MA 3VEXA 4BG8A 2FSJA 2GELA 1GLJO 3VGLA 1GLFO 3D2EB 5B8HA 3AAQA 3GE1A 2V7YA 3ZETA 4FWQA 3ZEUB 5EVZA 5AQFA 4FOEA 5AR0A 3VGKA 1K8KA 2E2OA 2A3ZA 3VF6A 4NO7A 2GWKA 1BU6O 1BUPA 2F9TA 2A40A 4BR4A 3MN9A 2VYPA 3DJCA 4IJNA 4DQ8A 4JAXA 3GG4A 2ASMA 3ENOA 1V4SA 5AQYA 1QQOA 2I7NA 3HZ6A 4CZKA 3LDPA 2NRHA 1NGBA 2V7ZA 4BRLA 2UYTA 4FO0A 2YHXA 1HX1A 4CZEA 2IVOA 1BOTO 1XC3A 4BQLA 1GLCG 3DXMA 4K41A 4PKHA 3VF4A 4B1UB 4PL8A 4BRIA 5KPZA 4BRPA 3LM9A 4CI6A 3GOIA 3I33A 4BRCA 4BVPA 3HBTA 5EXWA 4EIAA 4H0OA 3IMXA 5AQJA 4BRNA 3L0QA 5AQKA 4EFHA 4XH4A 4CBWA 4H0TB 3FZFA 2QM1A 1HKGA 2QWRA 2YCHA 5AQLA 2IVPA 3A0IX 1D4XA 1ZBSA 3CQYA 1OKJA 2QW9A 2QWMA 1LCUA 2NLXA 4BRDA 2Q1NA 3D2FA 3H45C 5EY4A 1NGDA 1E4FT 4QS8A 2GEMA 3SJHA 4IWVA 2FSKA 3WXIA 1YVNA 5AQSA 3VPZA 2Q97A 1GLAG 3M3ZA 3EKSA 1X3NA 3O5BA 4XEIA 5BRFA 1ZXOA 1X9JA 5FPMA 3JS6A 1MWKA 3D2FB 1R59O 2HF3A 5JLHA 3M1FA 3LDQA 5KPRA 4H03B 4GY2B 2A5XA 4A2AA 1NGHA 3L6QA 2CGKA 2FSNA 2P9IA 2FF3B 3GDQA 4K43A 3A8YA 4BRHA 3CJCA 2J4RA 4FWOA 3U9DA 1ATSA 3UKUB 5BPMA 4CZHA 1QZ5A 1V4TA 1TUUA 5F0XA 3U4LA 4BGAA 4EHTA 4H0YB 5AQVA 1G99A 3R8EA 5E84A 3LDNA 1WUAA 3MCPA 2GTDA 5F1XA 3QMLA 3ZX3A 4BR0A 5CE3A 2E8AA 3VEWA 2QXLA 4NB4A 3O08A 1TYQA 5AFUH 3A5LC 4JD2B 3CJBA 1JCGA 4WQ4C 5I9EB 5FPNA 2A42A 4B1XB 3IFRA 5AQHA 5F2RA 4BG9A 1BWFO 3MN6A 4Z94A 3D2EA 4BC3A 1T6CA 3QICA 4DCHA 3FZHA 3W3DA 4B1VA 4BREA 5KPTA 1KAYA 3C7NA 1TUYA 3D7EO 4ISEA 5EX5A 1BA0A 3ZEUA 4FPAA 4A2BA 1H1VA 2Q31A 3HM8A 3EO3A 5E26A 4M7XA 3CJ9A 4CZFA 4LC9B 1YUWA 4XH5A 3BF1A 5BRDA 3QDKA 2P9UB 2YJEA 4EAHD 4WYBA 3AY9A 4CJ7A 3AARA 3J8AA 3R6MA 3VEYA 3C7NB 4BR5A 1CZAN 3U9ZA 2ZGYA 4E1JA 4GNIA 2DPNA 4BC4A 3F9MA 5KQ8A 4H5WA 3WQUA 3FE1A 2QWLA 4HTLA 1GLLO 2IVNA 2QWNA 1HUXA 4EHUA 1Z05A 5AQPA 3MDQA 1GLEG 3VEZA 4ISGA 1S3XA 1HKBA 2Q0RA 1ZC6A 5AQWA 4C23A 4RTFD 3CJ1A 2P9SB 2P9NB 2PBDA 2YHYA 4FWMA 1ATNA 4PKGA 3WXLA 1BA1A 3VERA 4M63C 3FR0A 4FWPA 2E88A 3WUHA 2V52B 3P4IA 4FWRA 4H0XB 3VOVA 5BN8A 3KHYA 3MMVA 2W40A 3WEEA 1QQNA 2P9PB 3CJAA 3HI0A 1MWMA 1U2VB 5AQGA 3ATUA 3UKRB 2CGLA 3CETA 3IDHA 1NGAA 3ZX0A 3CIPA 1NMDA 2ZGZA 1HJOA 4CZGA 3BEXA 1NWKA 3SMSA 3CHWA 4BR2A 4F9OA 1SQKA 2D4WA 2I7PA 5BPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OYDA 4DSIA 1KTQA 1WN7A 4WQ4A 1U49A 4DG1A 4H5RA 4CZJA 4XIUA 3HYFA 4YOYA 4OGEA 4K25A 3UKUA 1REVA 4CHPA 4DTXA 3LDOA 1J54A 5AJ3K 2HBLA 1NGCA 2HHXA 4B8CA 5KGWA 4BQZA 3G6EN 3AVKA 4YOXA 4FL9A 4YOWA 3FZMA 1B9DA 3TARA 5AQRA 1X3MA 3MWTA 1SKSA 4K0KK 3DMJA 2X74A 4J2EA 3QBWA 2E2PA 2FLOA 2O8CB 1YAGA 3SCXA 3QFUA 4AM7A 1QQMA 3G4SN 3UE5A 3H08A 1ZBFA 1Q8IA 3VTHA 2E20A 3HT3A 3LDSA 5ADXH 4DR5K 4I9LA 1WSGA 4RG8A 1BGXT 4A5BA 4CK2A 1SL0A 2UU9K 4DQPA 4N5SA 3M8RA 1JJ2M 4FZYA 1TKXA 3KZBA 1VSLA 1SAZA 3AVNA 3NMUA 1FW6A 1TKTA 3KK3A 3CFRA 3O4QA 2DFHA 5JLFA 1RTIA 4H5VA 4NCAA 3K5OA 4JKHA 1VSJA 1O13A 1A5XA 3CD6N 4YDUC 3JSMA 3BP8A 1GOCA 5CR4A 3PUFA 3WXJA 1HYVA 1SL1A 2YV0X 3V6DA 2D1KA 2OZMA 4EZ9A 1RFQA 1RT2A 1YVUA 1NJIO 4ISFA 3P83D 3OJSA 2F9WA 3LPTA 2P9PA 4FWSA 4H5NA 4CJ3A 4DSKA 3R9PA 3K9JA 3KK1A 3K58A 3KVGA 4W5TA 2IIRA 2Q0UA 5IT9O 5CY4A 4O44A 4KHNA 4WE1A 5M1NA 2KKZA 3HXMA 4I6MB 2E2NA 5AZJB 4CBXA 1W2BM 3ITHA 2CH6A 1RT7A 3MN5A 1VSMA 1K8KB 3DLRA 3L4IA 1N33K 4RW6A 2ITMA 3CQ8A 2EX3A 4KHUA 3H6EA 3K5LA 1OH5A 2BTFA 3E66A 2P9LA 2W00A 1C6VA 2BDPA 3VEOA 5JMVA 2Z1HA 4YORA 3HP6A 3TAGA 2BANA 4N41A 3DI6A 1W97L 4BVOA 1C0GA 1ZBHA 4GV3A 4DHYA 1U4BA 3SAHA 4Z0UA 1NM1A 4NYFA 3M8SA 2D0AA 2KHOA 3LANA 1NGFA 3CC7N 4KI4A 5FPEA 1CXUA 4E7KA 2HSTA 3I55N 3SMPA 4JNEA 1RDCA 4BGBA 1BISA 3O4WA 1KC8O 2OANA 4BR7A 2NUBA 3VA0A 4IO9L 2W6KA 3PO4A 4I7FA 4W5RA 1IBMK 3AVGA 1KXPA 1QTMA 4CGIA 1KQSM 1WOQA 4JI1K 4M3UA 2O8EA 1Z6RA 1BO5O 3G25A 1QHAA 4I2QA 2QK9A 2JGUA 3PX6A 5AQNA 3PSIA 2W6LA 4CGFA 1YJWN 4F2SA 4CJUA 3ATVA 2RF2A 2ITGA 3FZKA 2AP1A 4DFKA 2WBNA 4GKKK 4IBNA 3KLIA 5ADXA 2O8BB 4LFAK 4BROA 3H1QA 4FSVA 3TAEA 3DAWA 3S3NA 1WB9A 4JKGB 4Z4HA 3ZT2A 2QA4N 3RR8A 3O9RA 1S22A 1XMOK 2RN2A 3CMAN 3LP2A 4DB3A 4DKWA 3CC2N 5FLXO 3F73A 4ILHA 4G1QA 3D45A 4BRQA 1DGKN 4WQ5A 3LM2A 2OYQA 3H1VX 1WAJA 3VEXA 4BG8A 1ZBIA 1YTAA 4LH4A 4BE1A 1LW0A 3WNEA 1XNRK 4CFAA 2QI2A 1W9HA 3AAQA 3GE1A 3ZETA 3O3FA 5EVZA 1BCMA 5HRSA 5AQFA 3BY5A 4JKEA 5AR0A 3SUNA 2A3ZA 4DFPA 1HNVA 1BU6O 3AVBA 2A40A 2VYPA 3O9SA 3DJCA 4OLBA 3RMCA 3CM5A 3CCRN 5AQYA 2VG6A 1KFSA 3HVRA 5CZ1A 1WNSA 1XC9A 3QINA 3PY8A 1DTQA 1VQMN 3UIQA 1RBRA 1GLCG 4DTMA 4C1NI 4PKHA 4CF8A 4B1UB 3THWA 4CI6A 3GOIA 4BVPA 3HBTA 3ZSVA 4ZTJA 3V9UA 4OGCA 4EIAA 4XH4A 4K8XA 4CBWA 2HNZA 1ASVA 3AO3A 3RRGA 2QWMA 2OPRA 3C6HA 4F4KA 1LCUA 4BRDA 3H45C 4QCLA 1NGDA 1TL1A 4B9SA 2VG7A 1NMNA 3AGRA 2FSKA 3WXIA 4O5BA 1JLCA 1NOZA 4FM1A 3ZSRA 2O8DB 3VPZA 3THVA 2G8VA 3QNOA 1X3NA 1NK0A 5D3GA 3SBGA 1DLOA 1X9JA 3NE6A 5FPMA 3JS6A 4JKAA 4OJRA 2HF3A 2PY5A 5JLHA 4HVJA 5HOOA 2UXDK 5KPRA 3MCAB 1XHZA 2DTUA 3QLHA 4O4GA 2UUCK 4K43A 5LL6Z 1JXEA 4FWOA 3UKUB 1WAFA 1NKBA 4CJQA 1V4TA 4ILJA 3NAEA 4B9NA 1RDDA 4AHSA 1YT3A 1G99A 1VAZA 3SQ1A 2GTDA 4CF1A 5F1XA 4NLBA 5CE3A 2KQ2A 2E8AA 3SQ4A 4JI4K 1TYQA 2ZQBA 3AVMA 3DLHA 4W5QA 3CG7A 3CJBA 5DM6L 5GAGP 1Q7YO 3AGKA 2X6SA 1JLAA 3A2FA 4CESA 3MN6A 4CK3A 5C10A 2ZE2A 1T6CA 4IFEA 3AO1A 4DCHA 4B1VA 3W3DA 5EX5A 4YOTA 3ZEUA 4FPAA 1H1VA 4CFBA 3DRPA 4M7XA 1N8RO 4XH5A 5BRDA 4KH6A 3QDKA 1KFDA 1TK8A 3NH2A 4EAHD 3KKSA 4AHTA 2NNWA 3V9ZA 3AARA 3DM2A 4M3ZA 4ID1A 4LF7K 4E1JA 2JWKA 3AA4A 3OYIA 2HBMA 1HPZA 3VQQA 4LF8K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2UUA K;  4FJM A;  1HYS A;  4FO0 A;  1D9F A;  2IVO A;  1BOT O;  4BQL A;  4KFB A;  2GUI A;  4JI8 K;  4CHZ A;  3PIP L;  4PL8 A;  2WFB A;  3C94 A;  3RTV A;  4DTS A;  1ILY A;  3LM9 A;  3I33 A;  3TSU A;  4HUG A;  3KWI A;  2ZJP L;  3AVA A;  4HUE A;  3SBT A;  2O8F B;  5EXW A;  4BRN A;  3L0Q A;  5AQK A;  4EFH A;  4K8Z A;  4H0T B;  4OVL A;  1K9M O;  3LPU A;  3THX B;  2QW9 A;  3T1Y K;  4AF1 A;  4LH5 A;  4EZ6 A;  1E4F T;  2GEM A;  4DMN A;  4FLT A;  1HJR A;  2FC0 A;  1HNX K;  3PLA A;  3T1H K;  1VSI A;  1VQO N;  4FCY A;  5AQS A;  1GLA G;  4WF9 L;  4IEI A;  1RIL A;  4CJT A;  3O5B A;  3VQB A;  1NK6 A;  1ZYQ A;  4XEI A;  5BRF A;  1T05 A;  4JI2 K;  3E9O A;  3PO5 A;  3D2F B;  3DOL A;  4KB1 A;  1R59 O;  3M1F A;  3LDQ A;  4H03 B;  4CK1 A;  1BL3 A;  1YI2 N;  2CGK A;  1YJN N;  2XY8 A;  2J4R A;  4E19 A;  2OA8 A;  5BPM A;  3SPY A;  4ICL A;  3KK7 A;  4FJ8 A;  3OBW A;  5J2M A;  3U4L A;  4BGA A;  4GW6 A;  4HUF A;  3R8E A;  5E84 A;  1HNI A;  3LDN A;  1WUA A;  3QML A;  4FLY A;  1RBS A;  3LZI A;  4CJS A;  5EU7 A;  4NB4 A;  1L3S A;  3A5L C;  4JD2 B;  1WBD A;  5FPN A;  2A42 A;  4B1X B;  3IFR A;  2OPQ A;  3ZT4 A;  4BC3 A;  2YHB A;  3NCI A;  4E7J A;  2IAJ A;  3Q7C A;  3FZH A;  2AJQ A;  1KAY A;  1BIU A;  3OYN A;  1L3U A;  5E26 A;  4ZTF A;  1C0M A;  3U6F A;  2P9U B;  2YNF A;  3AY9 A;  4B3M K;  4M3R A;  1ASW A;  3R6M A;  3QO9 A;  3VEY A;  3C7N B;  4BR5 A;  1CZA N;  2ZGY A;  4AHV A;  4GNI A;  3PX4 A;  5KQ8 A;  3CCV N;  4FLU A;  1IKX A;  5C2F A;  2IVN A;  2QWN A;  1X1P A;  1FJG K;  4L8R B;  4BEC A;  1RT4 A;  1IKV A;  3VEZ A;  4N76 A;  1HKB A;  3LP1 A;  3PX0 A;  5AQW A;  5SWM A;  1P90 A;  3CYM A;  4RTF D;  4I2P A;  3KIO A;  1FXX A;  4JI6 K;  1NKC A;  3WXL A;  3VER A;  1VSK A;  3F2K A;  4M63 C;  4DQQ A;  4FJ7 A;  4CJ5 A;  4FM0 A;  4DWI A;  2V52 B;  2HBK A;  4FJH A;  3DRS A;  3KHY A;  4C8O A;  2W40 A;  1QQN A;  4FK4 A;  3HI0 A;  3KJV A;  3ATU A;  3TSQ A;  4V19 S;  1EET A;  4JK7 A;  4Q5V A;  3IDH A;  3AO2 A;  1L5U A;  1NMD A;  2ZGZ A;  3BEX A;  4M45 A;  4FXD A;  1SQK A;  5GAH P;  2D4W A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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