3U9ZA

Crystal structure between actin and a protein construct containing the first beta-thymosin domain of drosophila ciboulot (residues 2-58) with the three mutations n26d/q27k/d28s
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
total genus 119
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9zA03
2P9PB 1HUXA 2E8AA 3B8AX 1DGKN 2NLXA 3MDQA 2YJFA 1CZAN 3GG4A 1Z6RA 3KHYA 3JS6A 4Y0WA 1U6ZA 1GLJO 4AM7A 4FWKA 2HF4A 2ASMA 2F9WA 4A61A 3U9ZA 1ATSA 4PL8A 3ID8A 5BPLA 3AAPA 1JCGA 3O4WA 2IVNA 2UYTA 4M63C 4HTLA 1ZXOA 5EOYA 4B1XB 1MA9B 3M6GA 4KBOA 2Q0UA 3JXUA 1NBWA 5AQTA 1MWKA 3DWLA 5AQUA 2P9UB 4EIAA 2P9LA 4CI6A 2E2OA 1JCFA 2HOEA 3D2FB 1LCUA 1BDGA 1ESVA 4CZMA 3S41A 3OHRA 2HF3A 2P9PA 2CGJA 2V7YA 5AQRA 5KQDA 4BR2A 2FSNA 3QFPA 2ZGYA 3KZBA 2P9NB 3H1QA 1MDUB 3CJ1A 4BRPA 2GUPA 4ISEA 3ZX3A 5AQFA 4E1JA 2GWJA 2BUPA 4JNEA 5BN9A 4BRAA 2QWPA 5FPEA 4EHUA 5AQWA 3EZWA 5E26A 1QZ6A 2E1ZA 3KVGA 4CBXA 3WXJA 3ENHA 4CZHA 4HWIA 4FL9A 3FZKA 4CZEA 5AQSA 1QHAA 2PAVA 4L3QA 3BP8A 3FE1A 1NGJA 3U8XA 4BROA 4BREA 4H0VB 2E88A 1QQOA 1WUAA 2V51B 2V52B 3VGKA 2H3GX 4BRDA 2A40A 3DXKA 1NLVA 3UB5A 1TUYA 4NB4A 4FOIA 4BGAA 1GLFO 1LOTB 3VEVA 1C0GA 3VPZA 2FSKA 4BQZA 4MLHA 1X9JA 2D0OA 4RCHA 4H0YB 5AQGA 4BRGA 4WQ5C 4B1ZA 4BVPA 1SQKA 4LC9B 4PKIA 1R59O 4BC5A 4FWQA 4FWOA 4MO4A 4BR4A 3FZLA 3ZX2A 4IXCA 1V4SA 2IVOA 4BR5A 4FO0A 4K41A 2Q31A 2VYPA 4IO8A 1TYQA 3R8EA 1K8KB 4MO5A 3VF2A 5AQNA 3O80A 3CERA 1HJOA 3CQYA 2W41A 2E20A 1NGGA 2FF3B 4H03B 1GLBG 4JHDA 3R6MA 3F9MA 4DHYA 4CZJA 1BA1A 3VEWA 3H6EA 2A41A 3I8BA 4WYBA 3L4IA 4MLEA 4B1VA 1QQMA 1RFQA 2I7PA 4B1YB 4CZLA 1NGDA 2QWOA 3C0BA 4NO7A 5BRHA 3O08A 1YVNA 1HPMA 2NZTA 2E2NA 4BGBA 2CGLA 4BRFA 3CIPA 3MCPA 3QBXA 3H1VX 5AZJB 5BR9A 2OANA 2D0PA 4H5VA 2QWNA 2KHOA 1KAYA 2ZGZA 1K8KA 2DPNA 3ZX0A 1KAXA 1OKJA 4GNIA 1P8ZA 2V7ZA 1J6ZA 2A6AA 5AQIA 4FWNA 5BN8A 4M7XA 3ULEB 1E4GT 1X3NA 3DAWA 5AQMA 1U2VB 5AFUH 3VETA 3W3DA 4IJNA 2ITMA 2AP1A 3EN9A 4BRHA 3LDQA 3ZEUA 1D4XA 5E84A 3O1BA 5AZIB 4H0PA 3FLCO 3DXKB 3O6WA 4H5WA 3LDPA 5AQJA 4WQ4C 3LDNA 1NGHA 3HZ6A 5AQHA 1TUUA 4BRQA 3VF6A 4IZ9A 3H3NO 1T6DA 4BR7A 4BRIA 3HM8A 1NM1A 5AZJA 4IWVA 2P9SB 1RDWX 3A8YA 1DEJA 5LJVA 3H46O 1BWFO 3IFRA 4YDUA 1MWMA 3TU5A 4BR0A 1ZC6A 3CJAA 3M1FA 5ADXA 2YHYA 4BRCA 3ULEA 2YI1A 2IIRA 4BRKA 1XC3A 1TYQB 2VCPA 3EKSA 3LM2A 1U2VA 2QXLA 5BRFA 1SAZA 3QFUA 4H5RA 4K25A 4J8FA 2WUSA 4M7YA 4PKGA 3WXIA 4GY2B 3ATUA 5TKYA 3TPQA 3M3ZA 3SK3A 3CJ7A 3UKUB 3BF3A 5AZIA 1WOQA 4BQLA 3A5OC 2EWSA 2A3ZA 1GLCG 3MN7A 4JHDB 2QW9A 3HBTA 1NMDA 3MN6A 3L6QA 2I7NA 2E1YA 2QWMA 3VESA 1NWKA 2BTFA 1JCEA 1BOTO 5F1XA 3CJ9A 3SMSA 2P9SA 1SZ2A 1S22A 1DKGD 2ASPA 4A2BA 3EO3A 3EL2A 2D1KA 3HTVA 2A42A 5AQVA 4FWPA 3ATVA 3WEEB 3O1WA 3FR0A 3WXLA 4CZGA 1BU6O 2QM1A 3CQXA 1IG8A 1Y64A 4EAHD 3FZMA 3WQTA 4H0OA 1ATRA 4XH5A 1T6CA 4CZKA 3GL1A 2YJEA 3MN9A 2QWRA 5AQZA 3BUZB 5FPNA 4CBUA 3UKUA 4CZFA 1NGEA 3MK6A 5EX5A 1X3MA 5I9EB 1YUWA 4K42A 4O5FA 4BR9A 2ZF5O 3H3OB 1XUPO 5LJWA 2NRHA 1BO5O 1HKCA 1H1VA 1C0FA 2GEMA 3A5LC 2GELA 3IDHA 3ZEUB 4B9QA 4A62A 1HLUA 3A5NC 3LDLA 4BG9A 4FSVA 3D2EB 4B1WB 1S3XA 2Q1NA 3VGLA 4ISFA 5EVZA 4CD1A 5F0XA 1RGIA 3H45C 3WEEA 4CZIA 5AQKA 5BRDA 1BA0A 2J4RA 2PBDA 2FSJA 4A2AA 4CJ7A 3LDOA 5EY4A 3VEYA 1E4FT 5KQ8A 3AY9A 2F9TA 4XH1A 4AM6A 5B8HA 1HX1A 3VEOA 3VEZA 3VGMA 3CJCA 5KPZA 4FPBA 3SLCA 3QBWA 4BC4A 2QWLA 4H0XB 4O8KA 5BREA 4DCHA 4F9OA 5AR0A 1GLEG 3GE1A 3CJBA 3L0QA 3G25A 4QS9A 1BG3A 3BF1A 3CHWA 3D2EA 4CD3A 4FWRA 4WQ4A 3SJHA 4QS8A 1ZBSA 3QB0A 3HI0A 4JD2B 1GLAG 1HKBA 5AQPA 3O5BA 3QMLA 2FLOA 4FPAA 5AQOA 3SMPA 4XEIA 3P4IA 3IUCA 3HSCA 1G99A 3C7NB 4JAXA 3I33A 5CE3A 2CH5A 1IJJA 2Q2RA 2Q36A 5F2RA 3BEXA 3A0IX 3ZETA 2D4WA 3W0LA 2YCHA 3VOVA 5ELZA 1EQYA 4BC2A 1HKGA 2W40A 4XH4A 3U9DA 1NGCA 3EKUA 5JMVA 3CI5A 1YXQA 4CBWA 3AARA 3MN5A 4K43A 3FZFA 3D7EO 2GTDA 3GOIA 2VWBA 4B1UB 1YAGA 4FOEA 4H5NA 3FFKB 4YDUC 3VERA 1BUPA 4BRNA 3FZHA 3ENOA 1ATNA 1Z05A 4JD2A 3DXMB 3UKRB 3VENA 1T44A 2P9UA 3VF4A 2E2PA 2GWKA 4H0TB 4FWSA 4I6MB 3WQUA 3C7NA 3O8MA 2CGKA 5AQLA 3QICA 5BPNA 4WQ5A 3IMXA 4BVOA 3U4LA 1NGIA 3CETA 1KAZA 2P9KB 2YHWA 5AQXA 5EXWA 1QZ5A 1NGAA 3D2FA 3GBTA 5AFUA 3WUHA 4RWTA 3DJCA 4RTFD 4Z94A 3A5MC 4PKHA 4BRLA 3RSEB 2P9NA 1GLDG 2AA4A 1NGFA 1V4TA 5BPMA 3WXKA 2P9IB 4EFHA 4FWLA 4PL7A 2IVPA 5LY3A 4JN4A 4BG8A 5AQQA 2Q0RA 2FF6A 2QWQA 3WT0A 1QQNA 3AAQA 4H5TA 3GDQA 1XQSC 1KXPA 3QDKA 5JICA 4QS7A 3DXMA 2YHXA 3UKRA 2ZWHA 3FGUA 4FWMA 3R9PA 2CH6A 3J8AA 3UE5A 4EHTA 4I6MA 3LL3A 3MMVA 5JLFA 2A5XA 2FXUA 3LM9A 5FPDA 2E2QA 5FPMA 4IJAA 5KPRA 4BRMA 2P9KA 3VEXA 4ISGA 5ADXH 1GLLO 5AQYA 1NGBA 4DB3A 3RSEA 4DQ8A 2HMPA 1Q18A 5JLHA 2P9LB 2ASOA 4C23A 2Q97A 4BC3A 2P9IA 3ZETB 5KPTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1J54A 3ASMA 1CXQA 3MDQA 2YJFA 1CZAN 1ASUA 1C1CA 2X78A 1W0HA 5FRNA 3EE8A 3T7ZA 4AM7A 4FWKA 2HF4A 2OPQA 4Z0UA 3F73A 4FJMA 5KGXA 1RTJA 3OS1A 4DFJA 5A2QO 4O0JA 1XMQK 3C6TA 3O4WA 3NE6A 2IVNA 3MAQA 5J2QA 2JWLA 4HVJA 4DKWA 4B1XB 4DSFA 4DTMA 3TWHA 4EIAA 4HUFA 3OS2A 1SKSA 4CJ5A 2AJQA 4DSKA 1UAXA 2HOEA 1DT9A 3D2FB 4CZMA 1E3MA 3S41A 3OHRA 3ZSXA 5AQRA 4BDZA 3QERA 2X6SA 4OLBA 5GINA 4CK3A 3L2QA 3L2WA 3CJ1A 3QEWA 4DUYK 3CMEN 4GV6A 1NJZA 1Q9XA 2GUPA 2E5LK 1QSLA 4OPJA 4Z4EA 4JNEA 1DTTA 5FPEA 5AQWA 1LAVA 1WSGA 2E1ZA 3SAHA 3WXJA 3ENHA 2OPPA 3FZKA 1FKOA 1TAUA 2B4JA 4KHWA 4FJ7A 4CFAA 4B8AB 3U8XA 4FJ9A 4H0VB 5JVHL 5FDLA 2IDOA 2V52B 1NLVA 4AHCA 3CMAN 3DLKA 1GOAA 3DRSA 3KWIA 2OZMA 1FK9A 1M1KO 4ID5A 1VQ9N 3KLIA 1GLFO 1LOTB 3VEVA 4KHUA 3LAMA 4MLHA 4H0YB 4JKDA 3VTIA 3E66A 1EWRA 4I7FA 1SQKA 4PKIA 4B1ZA 3NCIA 4NCBA 4MO4A 3C95A 1C1AA 3DOKA 1V4SA 4EZ6A 3D6RA 3E1YA 4BR5A 4FVUA 2YKMA 1YHQN 3MXJA 2Q31A 1JL1A 2VYPA 3DOLA 1HQUA 3VQAA 5CHIA 3VF2A 5AQNA 4CFCA 4GV3A 1S1TA 2KQ2A 4M41A 5SZTA 4FLZA 3AVAA 2O8EB 2FF3B 4KHPK 1RTIA 1YVUA 4AHTA 3CC2N 3KK7A 4O55A 3NF9A 3TR8A 3KD5E 4WYBA 1NNEA 4B1YB 2QWOA 4KTWA 2NZTA 5JS2A 2E2NA 3AVCA 4BGBA 2CGLA 4BRFA 1O1WA 2ZD1A 3SBTA 4DFPA 3NH0A 4CEOA 2QWNA 1YJ9N 3M8PA 2DPNA 4C1NI 4YORA 2V7ZA 2W6LA 1J6ZA 2A6AA 5AQIA 4YOYA 1X3NA 1S5JA 3DAWA 4DMNA 4W5QA 1NK0A 3VETA 3THWB 4IJNA 1F21A 4HCBA 3LWLA 4X62K 1D4XA 1J5EK 5E84A 1UA1A 1OH8A 5AQJA 3J80O 5MLCQ 4DV6K 4G9ZA 2ZM6K 3LDNA 1NGHA 3HZ6A 5AQHA 3ZSWA 2R7YA 2RHKA 1WB9A 3H3NO 5M1QA 4BRIA 1U49A 3OA9A 5DK5A 1IKWA 4LSLA 3HOTA 1NU0A 1BWFO 5CYMA 1YT3A 4B3TK 2W42A 4OPKA 4E0DA 3L8BA 4BRKA 3V9ZA 4OO1J 3LM2A 1U2VA 2QXLA 5BRFA 1SAZA 3QFUA 4H5RA 1IO2A 4M7YA 1FXXA 1RCHA 1EX4A 5TKYA 3PSFA 3BF3A 4B3SK 4DTUA 3TAQA 3PX6A 2HBLA 4BQLA 2A3ZA 4JHDB 2QW9A 1NMDA 5AJ3K 1YJNN 3LP0A 3VESA 1BL3A 5F1XA 4AILC 1S22A 3NAEA 1DKGD 2ASPA 5FLXO 3HTVA 3J81O 1KC8O 4GW6A 2NNWA 1YF5L 3U3YA 4M3TA 3AVBA 4CZGA 4N5SA 4CVNE 3VQCA 3T69A 2BDPA 4XH5A 4DV0K 3GL1A 3VQ6A 3MN9A 4FJGA 4CIFA 4CZFA 4HCCA 2HHSA 1NGEA 4DS4A 3MK6A 4R79A 4JV5K 3OY9A 5I42A 4FLYA 2ZF5O 4CJVA 1XUPO 3DRRA 5LJWA 4DFKA 2G8UA 3WNGA 2GEMA 2GELA 2VQFK 4A62A 1HLUA 1KVAA 3A5NC 2F4VK 3LDLA 4CK1A 3OYAA 5TKWA 4DUZK 3DMJA 4B1WB 1S3XA 2Q1NA 1ZBHA 3NHGA 4FJHA 1RGIA 2JWKA 4CF0A 3CFPA 4DV5K 4CZIA 4KI6A 1Q9YA 1WSJA 3SUQA 3CFRA 3O4QA 2FSJA 1VSJA 3CYGA 1I39A 5KQ8A 1KLMA 4FVMA 4XH1A 2QK9A 3CCQN 1C0UA 5KPZA 2B6AA 4CESA 4BC4A 4Z4HA 1FKPA 4H0XB 5BREA 1HYVA 5AR0A 1GLEG 3GE1A 4JLHA 4OLAA 3L0QA 2PFUA 4DSLA 4CGHA 1LWEA 3G25A 3BDPA 4ZHRA 4QS9A 3CHWA 3ZT2A 1IKXA 1TV6A 4QS8A 2UXCK 1ZBSA 2IGIA 1JL2A 1SL1A 3P4IA 3IUCA 4X65K 3NGZA 1XNQK 4JAXA 1XHXA 4FJKA 1WAJA 3DLEA 2CH5A 3TSUA 2Q2RA 1ZBIA 3ULDA 4LF8K 3V81A 2D4WA 4ELVA 4DTXA 3TSPA 3VQ8A 3VOVA 3V9UA 4JI4K 1EQYA 1YJWN 1ZBFA 2W40A 1HJRA 2I5JA 4RW7A 4XH4A 4CK2A 1NGCA 5JMVA 3KKSA 2IS3A 5SWMA 3AARA 3MN5A 1HNVA 3RVCA 3AA5X 3DM2A 4M42A 2GTDA 3GOIA 2VWBA 1Q7YO 2YHBA 4YDUC 4FXDA 2UXDK 3NH2A 4BRNA 3SCXA 4GV9A 3IAYA 3K57A 3PO4A 3S5TA 3DXMB 1EXQA 3SI6A 2O8BB 2C1GA 4DWIA 1TKZA 2E2PA 2GWKA 4H0TB 3C7NA 3O8MA 2XY5A 3RMCA 5M1OA 1EO1A 4AHRA 3AVNA 4WQ5A 4ELUA 2RN2A 4RW6A 5AFUA 3ZT4A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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