3U9ZA

Crystal structure between actin and a protein construct containing the first beta-thymosin domain of drosophila ciboulot (residues 2-58) with the three mutations n26d/q27k/d28s
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
total genus 119
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9zA03
1IG8A 4CD3A 3UKUB 5AZJB 2IVPA 1LCUA 2A5XA 5JLFA 2Q36A 3UB5A 2D0OA 2W41A 4BQZA 2F9WA 3R6MA 3RSEB 3LM2A 1GLJO 2BUPA 1KXPA 2GWJA 4BG8A 4BRQA 3IUCA 3BP8A 3I8BA 1GLDG 3A5OC 3DWLA 1JCFA 1U2VB 5AZJA 1JCGA 3AY9A 4CZMA 4FWSA 1TUYA 3KZBA 1QQMA 2CH5A 2E88A 3FLCO 3RSEA 2DPNA 3L4IA 3FZKA 4CZHA 3VESA 2E2OA 3H1VX 1HKBA 2E1YA 4DQ8A 1QQOA 1TYQB 1U2VA 4ISEA 1BG3A 3QDKA 4FWMA 3SMSA 4B1VA 2QWQA 3SLCA 1S3XA 1E4GT 3G25A 4FOIA 4CZFA 3ZETA 4BGAA 2F9TA 1NGFA 3KVGA 3A0IX 2V7ZA 4RTFD 4XH1A 1NGDA 1TYQA 2V52B 1HKCA 3LDNA 3VEYA 4F9OA 1KAZA 3VGMA 3CIPA 4CBWA 2D0PA 5AQNA 1LOTB 1BU6O 4BR5A 3ZX3A 4A2BA 1YAGA 5BN9A 3U9DA 3O1WA 1MA9B 2QWNA 3A5LC 4GNIA 2VWBA 4FWNA 4DHYA 2ASPA 4YDUC 5KPZA 1QHAA 4XEIA 3CERA 2HF4A 4H0OA 2H3GX 2GUPA 2PAVA 2NRHA 1BA1A 2UYTA 3MCPA 3M1FA 2V51B 3L0QA 3D2EA 4M7YA 4O8KA 2GELA 4BC5A 2VYPA 3CJAA 1MWKA 5KPRA 3P4IA 5LJWA 2W40A 4Y0WA 3H3OB 5AQGA 1BA0A 3O4WA 5FPDA 4BGBA 4A2AA 3A5NC 5TKYA 3C7NB 1Y64A 1Q18A 4AM7A 1NLVA 3I33A 4FSVA 1YUWA 1BOTO 5AQWA 4BC4A 3WXJA 3JXUA 3AAPA 1RGIA 4H5TA 2FSNA 4RWTA 1NGEA 1G99A 2IVOA 3HM8A 3LM9A 3QFUA 1QZ6A 4JAXA 1DKGD 3UKRB 4FPBA 4IJNA 4CJ7A 3R8EA 1WUAA 4BR9A 1GLBG 3CHWA 4CD1A 3LDQA 3VF4A 1NGCA 1NGAA 3LDOA 2A6AA 4Z94A 3UKRA 5FPEA 3UE5A 1R59O 1SAZA 2FF6A 2P9KA 1TUUA 4IXCA 3ULEA 3EN9A 4PKGA 3IFRA 3VPZA 5KPTA 1DGKN 1D4XA 3A8YA 1RDWX 2CGJA 1BO5O 4FWLA 4O5FA 4FWRA 1NGGA 1NWKA 3GOIA 4CZGA 4AM6A 4GY2B 1KAYA 4B1WB 2ASOA 1NBWA 4EHUA 3WEEB 5KQDA 2ZWHA 3FFKB 1ZBSA 4FL9A 4BRKA 4FPAA 3GBTA 3KHYA 2HOEA 4CI6A 3ZETB 5BPLA 3D7EO 1SZ2A 1P8ZA 1X9JA 3B8AX 2FSKA 3WEEA 4BRLA 3ZX0A 2P9NB 5EVZA 5ADXH 2IIRA 2E1ZA 2CGLA 2FXUA 2HF3A 4H0XB 4NB4A 4A61A 4EIAA 5BPNA 3VGLA 4NO7A 2QWRA 2CH6A 3FZHA 1HUXA 4MLEA 4WQ4C 4CBUA 3QB0A 1HLUA 4BQLA 4DCHA 3DXMB 2P9NA 2Q0RA 5F1XA 2FSJA 4BC3A 1NM1A 3MN6A 1XUPO 3EZWA 2FF3B 3GG4A 5AZIA 5BRDA 3U8XA 3GE1A 4K41A 3EL2A 1ATNA 4JD2B 1ESVA 3FZFA 3LDPA 5BN8A 3DXMA 4BRDA 1T6CA 1EQYA 4BG9A 1GLAG 3GL1A 3M6GA 3D2EB 5AQYA 1GLFO 3W0LA 1U6ZA 4BRCA 4EAHD 4IO8A 5AQSA 1JCEA 5EY4A 2QWMA 4H03B 3SJHA 1ATRA 2YHYA 2YCHA 4JD2A 3WXIA 3AARA 4JN4A 4WQ4A 3H46O 2GEMA 5BRFA 3HSCA 3ATVA 2Q2RA 4CZLA 3H1QA 3FZMA 1NGJA 2E20A 2A41A 5E26A 5JLHA 3F9MA 2QWLA 3CJ7A 5CE3A 1E4FT 1QZ5A 4IJAA 5KQ8A 2P9PA 2WUSA 3CQXA 5BR9A 4BR4A 1MWMA 3MN7A 4QS7A 4PKIA 5AQZA 4BRNA 1V4TA 3VEWA 2FLOA 1ZC6A 3VOVA 5BRHA 1BDGA 3ENHA 3VERA 4CZIA 1XQSC 2ASMA 4YDUA 1OKJA 1S22A 3WT0A 1RFQA 3VEZA 4JHDA 4BR2A 4H5WA 2P9UA 3ID8A 3ZEUA 3O08A 1NGHA 2VCPA 4BR7A 4B1ZA 4XH4A 5AFUH 1T44A 1V4SA 3VGKA 3U4LA 3FR0A 3HBTA 2IVNA 4I6MA 3DJCA 4PL8A 4FWPA 1CZAN 1GLEG 4BRGA 3FZLA 4B1UB 4WYBA 5JMVA 3H45C 2P9KB 3GDQA 4K25A 2P9IB 3CJ9A 4MLHA 2YHWA 4RCHA 3R9PA 4DB3A 2Q31A 4JNEA 5F0XA 3ULEB 1T6DA 3CQYA 3QICA 3S41A 4H0TB 5AQJA 2D1KA 4FWOA 2ZGYA 5AQLA 5AQHA 1K8KA 1X3MA 5AR0A 3VF2A 4EHTA 2P9SA 2P9IA 4IWVA 3SMPA 5AQXA 2QWOA 2I7PA 1H1VA 1NGIA 1QQNA 3HZ6A 3VF6A 3O6WA 4BROA 1MDUB 4B9QA 4BVPA 5E84A 4CZEA 5LY3A 1GLLO 5ADXA 3H3NO 4EFHA 3WQTA 3FGUA 5BPMA 5AQOA 2EWSA 3VEOA 1SQKA 2A42A 3O5BA 4L3QA 3DXKA 4BRPA 4FWKA 2E8AA 2NLXA 2ZGZA 3IDHA 4XH5A 3MMVA 2I7NA 4ISFA 4LC9B 5AZIB 3D2FB 3JS6A 3VETA 4B1YB 3QFPA 5F2RA 3UKUA 2Q0UA 3C0BA 3EKSA 2AA4A 4BC2A 3WQUA 5AQUA 4MO4A 3TU5A 1ZXOA 1Z05A 2P9LB 3WXLA 3D2FA 3TPQA 2E2PA 3MN5A 5B8HA 4HWIA 2V7YA 2A3ZA 1HJOA 5AQMA 1NMDA 4ISGA 2D4WA 4KBOA 4H0YB 4CZKA 4BRAA 2P9LA 3QMLA 2QM1A 4PKHA 2P9PB 1ATSA 4H0PA 4K42A 4M63C 3VEXA 4WQ5C 2GTDA 2YJEA 3CJBA 3O8MA 2YHXA 1HX1A 3ENOA 2BTFA 4FO0A 3IMXA 5I9EB 3EO3A 4BRMA 2CGKA 4JHDB 4BR0A 5EOYA 5AQRA 4B1XB 1HKGA 2P9UB 2ITMA 3ZEUB 1YXQA 5ELZA 2E2NA 1HPMA 3M3ZA 3MK6A 1IJJA 1XC3A 4FOEA 1X3NA 5AFUA 4CZJA 4I6MB 1NGBA 4H0VB 3HTVA 4BREA 3ZX2A 4BRHA 3OHRA 4BVOA 3J8AA 5AQQA 5AQVA 5BREA 2HMPA 5AQIA 3CETA 3DAWA 3FE1A 5AQTA 4WQ5A 5EX5A 4FWQA 4H5NA 4BRFA 3H6EA 3O1BA 3MDQA 4H5RA 3VEVA 3WUHA 3O80A 3BEXA 2Q97A 1K8KB 3BUZB 3VENA 2P9SB 4M7XA 2KHOA 1GLCG 4E1JA 3HI0A 2YI1A 3LDLA 2Q1NA 3MN9A 5JICA 1BWFO 3U9ZA 4H5VA 4PL7A 2AP1A 1J6ZA 5EXWA 3W3DA 4J8FA 2PBDA 3C7NA 4BRIA 5AQFA 2QXLA 4K43A 5LJVA 4QS8A 1KAXA 1YVNA 3BF3A 3LL3A 2NZTA 1C0FA 3CI5A 1BUPA 3L6QA 3WXKA 2GWKA 1WOQA 2E2QA 1C0GA 5AQKA 5FPMA 1DEJA 3A5MC 4CBXA 5FPNA 4C23A 3QBXA 3ATUA 4A62A 2ZF5O 3CJCA 3SK3A 1Z6RA 2J4RA 4MO5A 3CJ1A 3QBWA 3DXKB 4QS9A 4IZ9A 3BF1A 4HTLA 2QWPA 2YJFA 2QW9A 5AQPA 3AAQA 2OANA 3EKUA 2A40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WAFA 1NJXA 3AVBA 2IVPA 2HHUA 2A5XA 4DF8A 2KZMA 2VQFK 2Q36A 4FLXA 1EKEA 3RR8A 1IBLK 3LM2A 1GLJO 4DR6K 4KB0A 3IUCA 3BGRA 3A5OC 3DWLA 3CCRN 4AILC 1GOCA 2HHWA 3D6RA 2NRZA 4FWSA 4F8RA 4FLWA 2CH5A 5JVHL 1FW6A 2HW3A 3ISNC 1SKRA 2DPNA 3FZKA 4CF9A 3V9UA 3H1VX 1HKBA 4DQ8A 4ISEA 4OPAA 4CGGA 4FWMA 5TKWA 3O4QA 4B1VA 4CGIA 4AHSA 3SLCA 1S3XA 3G25A 4CVNE 4CZFA 1TKZA 3ZETA 5HRNA 3QEPA 2OZMA 1C1BA 2F9TA 2UUBK 3OYDA 3A0IX 2V7ZA 3HVRA 2RF2A 4CFAA 2V52B 1RBSA 3LDNA 4F9OA 1KAZA 4CJ5A 3CIPA 4OKKA 4E19A 4FM2A 1T03A 1LOTB 1T8EA 1HQUA 2I5JA 4A2BA 1YAGA 1NKBA 4QCLA 1BIZA 4AQYK 4Z4IA 2VWBA 2WONA 2P5GA 5DK5A 4DHYA 4YDUC 3SZ2A 3CERA 2HF4A 1OH5A 4H0OA 2ZE2A 2H3GX 4Q5VA 2FBTA 4FJ5A 3AA3A 3OYCA 3L0QA 1VQLN 4O5BA 1VSHA 4X65K 3MX2A 3L3UA 2VYPA 4FW1A 2HMIA 1MWKA 1J9AA 3THYB 2FBYA 4AHTA 1BA0A 4KPYA 4YOYA 3O4WA 3IAYA 5CZ2A 3LANA 4KV8A 1KFDA 4CJ4A 3TTDA 1Y64A 1I39A 3QINA 3WXMB 5AQWA 3TAMA 1O13A 3TTFA 3ZT1A 4I2PA 4BC4A 3WXJA 4FK2A 2PY5A 4ZHRA 1U48A 4H5TA 3S3MA 3SUPA 5C2FA 1NG9A 3H08A 3HM8A 1HMVA 3OYAA 3KLFA 3THWB 4IJNA 3PSFA 1EWRA 3MAQA 3SNNA 4BR9A 4KB1A 3V4IA 4PWDA 3NFAA 4J2BA 3K57A 4W5NA 2BANA 3J7ZO 1VQON 1VQKN 4IOAL 4Z94A 1ZBHA 5GIOA 1M1KO 1SAZA 3AA4A 4FLTA 3MXIA 4IXCA 3ULEA 4JKBA 1N36K 3A8YA 2F8SA 1EX4A 4O5FA 3UIQA 1NGGA 3GOIA 4DLEA 2NUBA 5C10A 1NBWA 3FFKB 4NLCA 3NGZA 1ZBSA 3S3NA 3DLEA 4CHZA 4YOVA 1NJWA 3ULDA 3KHYA 2HOEA 3SV4A 3OBWA 1W2BM 3ZETB 5BPLA 1P8ZA 1QSYA 2XY7A 1X1PA 4HCCA 1KC8O 4U67L 2E1ZA 3CFOA 3MECA 3OYEA 2WOMA 4CJUA 3FFIA 4WQ4C 3EE8A 4CEBA 1JLEA 1RT3A 3O9RA 1HLUA 4M3YA 3O4NA 2AJQA 4WFBL 5I42A 4HTUA 4BC3A 4IEEA 3ASMA 2B4JA 1LW2A 1NU0A 1EP4A 3GG4A 1HNWK 3DRPA 5HBMA 3M8SA 3GE1A 4GVMA 2W6LA 4JD2B 5C0YA 1ESVA 5BN8A 1KLNA 4BRDA 4C8NA 1EQYA 3SQ2A 4BG9A 5AQYA 3M6GA 3P5JA 1GLFO 4ELVA 1U6ZA 2NRRA 1VQ6N 4JRQA 1JJ2M 3AGKA 3NVKA 4Z4EA 1JKHA 4N47A 3TAGA 4OKJA 5EY4A 1TAQA 3TR8A 2QWMA 4H03B 5FDLA 1S6QA 3CCUN 3Q7CA 1TL3A 4JN4A 1Q7YO 3L2RA 4FJIA 4DR7K 4DTNA 3HSCA 3ZSVA 3ATVA 3H1QA 1OH6A 3FZMA 3NDKA 1WBBA 2A41A 3F9MA 4X62K 1K8AO 2WUSA 1K73O 3CQXA 3OBYA 4LSNA 4KTWA 4BR4A 5AJ3K 4QS7A 5C12A 1FXXA 1YHQN 4E72A 1I94K 1GOBA 2G8UA 5BRHA 3VERA 2ASMA 4RW8A 4YDUA 1S22A 4JHDA 4A5BA 4DUZK 2RE2A 3I56N 3QEXA 3G4SN 3O08A 1A5WA 1NGHA 4XH4A 1VQPN 1REVA 3DJCA 4PL8A 1CZAN 2UUAK 4DV3K 4GW6A 4RCHA 3T7ZA 4CK2A 1WSEA 4DV2K 3R9PA 2RN2A 2Q31A 4JNEA 3ULEB 4CGJA 3CQYA 4H0TB 3NAEA 4FJ9A 4KHNA 5AQHA 1FKPA 2WC9A 4DTXA 4EHTA 1L3UA 2P9IA 4FJ7A 4IWVA 2BH1A 1JLGA 4DR3K 4CF0A 5AQXA 3HP6A 1H1VA 4OLAA 3HZ6A 4BROA 5J1EA 1J5EK 4GKKK 4B9QA 2DY4A 2ZJQL 1DTQA 4BVPA 3QEVA 1N34K 3ENBA 4CZEA 2IDOA 2O8CB 3T19A 2ZM6K 1GLLO 1VSKA 2UXDK 4KHWA 3WQTA 3FGUA 2YNFA 2A42A 3CYMA 3OYLA 3OYGA 4KFBA 1VQMN 4M3RA 2E5LK 2ZGZA 3ZSXA 1J53A 2EX3A 2BDPA 3CMAN 4DV0K 4ISFA 3O9QA 1WSFA 2Z1IA 1D5AA 3RWUA 1FJGK 4O55A 4ID1A 5J2MA 4MO4A 3TU5A 3K2PA 3VQQA 1S1VA 4WFAL 2QKKA 1EETA 3LDSA 3MN5A 3V1QA 1U4BA 2GV9A 2A3ZA 4W5QA 5AQMA 1NMDA 1ZBLA 2HHIA 4CZKA 4JKEA 5C42A 2HHHK 1YTAA 4LF5K 1ATSA 4M63C 4KHUA 4AHUA 3CJBA 1QSLA 4FO0A 3IMXA 2KLAA 4JK8A 1ZBFA 4PA1A 2OPQA 3EO3A 3SQ0A 1W97L 4JHDB 4F2RA 2XY8A 5AQRA 1L3SA 4CJVA 3HOSA 3NCIA 1YXQA 1IJJA 1X3NA 4CZJA 1G15A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4LY7 A;  3NGI A;  2HHS A;  4B9U A;  3OJS A;  3C6T A;  1IG9 A;  1XC3 A;  4FOE A;  4I6M B;  2DTU A;  1NGB A;  4H0V B;  3HTV A;  4BRE A;  4DSK A;  4BRH A;  3M8P A;  3QLH A;  1S9E A;  3SYZ A;  4BVO A;  4KKO A;  2HMP A;  2P51 A;  4DS4 A;  3SUO A;  3U6F A;  5EX5 A;  3MEE A;  4B8C A;  5HP1 A;  4FWQ A;  4JI6 K;  4IO9 L;  1A5V A;  3C6H A;  1U49 A;  1K8K B;  2KTQ A;  1S1X A;  3THX B;  3KTQ A;  3CC7 N;  2HNY A;  4M7X A;  1D8Y A;  2YI1 A;  2D0C A;  2Q1N A;  4DR2 K;  3THY A;  4K8X A;  1BWF O;  1QHT A;  4DTO A;  2AP1 A;  3W3D A;  5EXW A;  3QEI A;  3DLH A;  4CHN A;  3WNF A;  4BRI A;  2QXL A;  1BCO A;  1IO2 A;  4ICL A;  4OPJ A;  2X6S A;  2G8F A;  2NZT A;  1C0F A;  3CI5 A;  1UA1 A;  2YV0 X;  4J2A A;  3LP2 A;  2QXF A;  1RTI A;  2GWK A;  2E2Q A;  2JWL A;  5AQK A;  3U3Y A;  1L3V A;  4F2S A;  3LZJ A;  4HUG A;  2NRW A;  2UXB K;  4DV4 K;  2KFN A;  3QBW A;  5HRR A;  3DXK B;  1T7P A;  4HTL A;  3NBP A;  4B3R K;  5FRM A;  2NRX A;  2QW9 A;  4CIE A;  2W00 A;  3H46 O;  1KVB A;  3HK2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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