3U9ZA

Crystal structure between actin and a protein construct containing the first beta-thymosin domain of drosophila ciboulot (residues 2-58) with the three mutations n26d/q27k/d28s
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
total genus 119
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9zA03
5BPNA 4JNEA 2IVPA 3VEWA 1OKJA 2VWBA 4IXCA 4H0VB 2QWQA 2QWMA 1HUXA 1TYQA 4H0TB 3UKRB 1GLCG 1EQYA 5I9EB 1ATNA 3D2EB 5AQPA 3DAWA 4BVPA 3WXIA 4MLEA 1XC3A 4BGBA 5BPMA 4QS8A 4FWOA 5AQRA 4H0XB 1GLDG 2P9PB 3HTVA 2BUPA 3WEEB 1YXQA 4BR0A 3CERA 4DQ8A 2HF3A 4K42A 3VGLA 1GLEG 1E4FT 3HZ6A 3WXLA 4A62A 4Y0WA 5AQXA 1ATRA 3ZX2A 3R6MA 4ISFA 1X3NA 2P9LB 3CETA 1C0GA 1MDUB 1U2VB 2ASPA 3FZFA 4B1YB 4EAHD 1LCUA 1R59O 4CZMA 1HX1A 1BA0A 4FWRA 3I8BA 3FLCO 4JHDB 4BQZA 3KHYA 3RSEA 3VEVA 3CJBA 4CBUA 2GTDA 2P9UB 4H0YB 2QWNA 3FZLA 3HM8A 5AQKA 4BREA 3EZWA 3S41A 5AQHA 1NGIA 3FZMA 2GWKA 2H3GX 2A5XA 2FF3B 3VENA 3LDQA 4CJ7A 2YJEA 3IDHA 3HBTA 1BU6O 4A61A 2A41A 2WUSA 2KHOA 3VF2A 2NRHA 5FPEA 2Q2RA 3AARA 3D7EO 3H6EA 4L3QA 5F2RA 4BR5A 3O80A 4JN4A 4GNIA 2D1KA 1RFQA 4I6MB 1BO5O 4IWVA 4HTLA 1NWKA 3DXKB 4BC5A 4HWIA 1V4SA 2IVOA 2A40A 2F9WA 5AQLA 5JLFA 3U8XA 1X3MA 4FWSA 3FR0A 3GL1A 4B1UB 2ASOA 3ULEB 4EIAA 3DWLA 3O8MA 2E20A 3VEYA 4RTFD 5LJVA 5BRFA 2E2OA 3C7NB 3A5MC 4JD2B 5F1XA 3O1BA 2FSNA 3A8YA 4DCHA 2V51B 3AAPA 3AY9A 3EKUA 4FWQA 1QZ6A 3CJCA 3ZX3A 3SJHA 1P8ZA 3KZBA 4M7XA 1KAZA 5BN8A 3BF3A 3A5NC 1DKGD 4K41A 5JICA 4H5WA 5BRDA 2CH6A 5AQMA 3H46O 2HOEA 3UKRA 4BRIA 3UKUB 1NGBA 3O5BA 3D2EA 2J4RA 4LC9B 2PBDA 1HKGA 4H5NA 3VEZA 4PL7A 2W41A 4CZLA 2F9TA 1IJJA 2QWLA 4JAXA 2HMPA 4K25A 3WEEA 3VGMA 5BPLA 4BQLA 2AP1A 3WQUA 2AA4A 2QM1A 3O1WA 3U4LA 1YUWA 2FXUA 4PKHA 3EN9A 1LOTB 2FLOA 2I7PA 3VETA 1BDGA 2P9LA 4BRHA 2E8AA 4F9OA 1U2VA 5AFUH 3QFUA 4MO5A 2QXLA 4J8FA 4FOIA 1KAYA 5JMVA 5EXWA 3GDQA 2YCHA 2NLXA 3CHWA 4H03B 4JHDA 3EO3A 3CIPA 2GUPA 1GLBG 5BREA 3FZKA 5KQDA 2P9UA 3QICA 4DHYA 3L6QA 3LM2A 3W3DA 4BRMA 5FPDA 1KXPA 1TUUA 4CZJA 3D2FB 4PKIA 1S3XA 1WUAA 1K8KB 2ZGYA 3FE1A 1HKCA 3A5OC 3ZX0A 1NMDA 1X9JA 4CZFA 4KBOA 4BRFA 3QFPA 3GOIA 3DJCA 4EHTA 2E2PA 2Q0RA 1QHAA 3VPZA 4CBWA 5F0XA 2ZWHA 3G25A 3H3OB 5AQWA 4I6MA 5AQQA 5AZJB 1MWMA 1NBWA 3DXKA 4EHUA 2VYPA 1NGFA 4CZHA 2ZGZA 2D4WA 3SMSA 4BRPA 1TYQB 1Z6RA 4O5FA 2A3ZA 2P9KA 2YHYA 2V52B 1ESVA 2P9SB 1GLLO 3JS6A 3FZHA 1S22A 1ZXOA 4CBXA 4WQ4C 3VGKA 3B8AX 3J8AA 5EX5A 4K43A 2FF6A 3O08A 4H5RA 4B1WB 5E84A 4NB4A 2E2NA 3WXJA 5AQVA 2CGLA 1BOTO 4JD2A 2D0OA 5CE3A 1ZBSA 1T6DA 3F9MA 1MWKA 4CZKA 1JCGA 2DPNA 3M1FA 4B1VA 4FPAA 3LDNA 3ZEUB 4E1JA 4BRQA 2Q31A 3FGUA 4FOEA 5EVZA 2P9IA 3HI0A 4BRLA 1Z05A 3QB0A 4RCHA 3GE1A 1Y64A 4BC4A 2HF4A 3ENHA 4YDUA 1GLAG 5AQGA 4M7YA 4CZEA 3SLCA 5AZIB 2E1YA 3LDPA 1HPMA 3MK6A 2QWOA 3DXMB 3QBXA 3JXUA 4BC2A 1NGHA 1JCFA 2PAVA 3VF4A 3MN9A 2Q0UA 4CZGA 1D4XA 3UB5A 3ATUA 4FWLA 1T6CA 1YVNA 3CJ9A 4C23A 2W40A 2E2QA 3GG4A 1NLVA 3H1QA 4B9QA 2IIRA 5KPRA 3M3ZA 4QS9A 2VCPA 4IJNA 4WYBA 3ZETB 5B8HA 3M6GA 4MO4A 4BROA 3L4IA 2OANA 2P9PA 4A2AA 4CZIA 4RWTA 1ATSA 1BA1A 4FWKA 3SMPA 4BRNA 5KPZA 3CJAA 3P4IA 3D2FA 2P9NB 4ISEA 5AQNA 3H3NO 4CD3A 4H0PA 4Z94A 5AQTA 3TU5A 4B1ZA 1NGJA 1E4GT 1J6ZA 2FSJA 4FSVA 4BRKA 3O4WA 4BR7A 4CI6A 4NO7A 3R8EA 5E26A 2A42A 1QQNA 3MDQA 4O8KA 4BRCA 1SZ2A 3QDKA 3CJ7A 3CQXA 1YAGA 5AZJA 4FPBA 3U9ZA 5AQJA 1DEJA 1CZAN 3SK3A 2V7YA 3WT0A 1RDWX 2CGKA 2A6AA 3KVGA 3R9PA 2E88A 4XH5A 3WQTA 5TKYA 2BTFA 2P9SA 3AAQA 2ASMA 5BN9A 4WQ5A 3L0QA 3MN5A 3MMVA 1T44A 1DGKN 4FWPA 5AFUA 1U6ZA 4B1XB 5AQFA 5FPNA 3EL2A 4FWMA 3VOVA 5KQ8A 1QQMA 3CQYA 5KPTA 5BRHA 1XUPO 1NGGA 5AQYA 4H0OA 4PKGA 4IZ9A 1BG3A 3LM9A 1G99A 4BRDA 3ZEUA 2EWSA 3ULEA 3LDOA 3OHRA 3EKSA 4YDUC 4A2BA 3VEOA 1ZC6A 3UE5A 1NM1A 4XH1A 3BP8A 1MA9B 3ENOA 2GEMA 4PL8A 4BVOA 3H1VX 4MLHA 4EFHA 2QWRA 4CD1A 2UYTA 5BR9A 2GWJA 1GLFO 2YJFA 3BUZB 4ISGA 4FWNA 3WUHA 1NGEA 5AZIA 3VF6A 3MN7A 1SQKA 3C7NA 3VERA 1SAZA 3DXMA 4M63C 3VESA 3BEXA 3FFKB 3BF1A 1XQSC 1HLUA 5ADXH 3TPQA 2FSKA 5AQIA 5AQOA 4IO8A 3QMLA 4QS7A 1NGCA 1QQOA 4BR2A 4IJAA 4GY2B 5JLHA 1RGIA 2D0PA 3RSEB 2QWPA 2GELA 5LJWA 5AQZA 4BRAA 3W0LA 3CI5A 2IVNA 3UKUA 4BRGA 1C0FA 2Q36A 4BR9A 3C0BA 3ZETA 3LL3A 4H5VA 4AM7A 2CGJA 3MCPA 1GLJO 4XEIA 1H1VA 1V4TA 4XH4A 2P9KB 2I7NA 3MN6A 3O6WA 5AQUA 2Q97A 2V7ZA 1NGDA 4H5TA 3HSCA 2QW9A 2P9NA 5ADXA 5ELZA 1WOQA 1HJOA 1QZ5A 3I33A 4BG8A 4WQ4A 5LY3A 3IMXA 3GBTA 2YHWA 3U9DA 3LDLA 3A0IX 1KAXA 3IUCA 4AM6A 1NGAA 2ITMA 3IFRA 3CJ1A 2YHXA 4BG9A 1BUPA 2Q1NA 2P9IB 2ZF5O 3WXKA 4BGAA 4DB3A 3QBWA 2CH5A 4WQ5C 1K8KA 3H45C 3VEXA 1JCEA 5AQSA 3ID8A 4FL9A 1HKBA 1IG8A 3ATVA 1BWFO 5EOYA 2YI1A 5AR0A 2E1ZA 4FO0A 1TUYA 1Q18A 4BC3A 2NZTA 5EY4A 4BR4A 3A5LC 5FPMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1X9WA 2GX9A 4JNEA 4DS4A 2Z1IA 1RBRA 2PY5A 4IXCA 3HSTB 4JK8A 1RDCA 4H0VB 2QWQA 1TYQA 4H0TB 3OYDA 4IOAL 1VQ6N 1TGOA 3AGKA 4JKGB 4BVPA 5BPMA 1A5WA 1NJZA 3AVMA 4H0XB 1TKDA 4MDAA 4BR0A 4KKOA 4G1QA 3ITHA 3ISNC 2HF3A 4FVUA 3VGLA 1E4FT 1GLEG 4R5PA 4C8OA 4Y0WA 2WONA 1ATRA 3D0PA 1X3NA 2P9LB 3AO3A 1C0GA 1MDUB 1U2VB 1YITN 4EAHD 5DM7L 3N4QA 3HYFA 1LCUA 1R59O 2YNIA 4CZMA 1Q81O 3I8BA 4DQIA 2F8SA 2XY5A 4FW1A 4JHDB 3CJBA 3QIPA 1Q8IA 4AH9A 4BREA 4X66K 3VQ6A 4FJ7A 4LFBK 3PX6A 4LF9K 1NGIA 2GWKA 4FLWA 1D8YA 1I39A 3E01A 3HBTA 4YOUA 1BU6O 4A61A 4NLCA 2WUSA 2KHOA 1XHXA 3J80O 1IKXA 3AVIA 3VF2A 4YOYA 1TAQA 3AARA 3D7EO 4J2DA 3H6EA 3VTHA 4L3QA 4BR5A 1ASWA 4KH5A 1ITGA 3O80A 1HYZA 3CFRA 4GNIA 2X6SA 4CF0A 4I6MB 1WBDA 4HTLA 4BC5A 4M3XA 2IVOA 2A40A 3U8XA 3HVRA 4DR2K 4KI4A 2EHGA 4FWSA 3THVA 4B1UB 3J81O 1VQ8N 3F73A 3SAFA 1S1XA 3LWLA 3NVMA 2E20A 3VEYA 1OVQA 5BRFA 3NF7A 4CF1A 4CJRA 4C1NK 3OY9A 4DV0K 3O1BA 4M3RA 1T03A 1X1PA 3AY9A 1B9DA 4FWQA 1IBMK 4AILC 3TANA 4OLAA 2DY4A 3KZBA 4DTPA 3A5NC 4K41A 4H5WA 4IDKA 5AQMA 1SL1A 4CFDA 2RPIA 4DFKA 3SQ1A 4O5BA 3UKRA 4BRIA 2J4RA 2HBKA 4OKEA 4OGEA 2W41A 4CZLA 4LF5K 1IJJA 4JAXA 3L2RA 3VGMA 2QI2A 5BPLA 3QETA 1A5VA 2AP1A 2FBVA 3LPUA 3PLAA 2FC0A 4PKHA 4J2EA 3ASMA 4GV3A 4CIGA 4DV3K 1JXBA 5KRSA 4F9OA 5AFUH 2QKKA 3LP3A 1N6QA 5JMVA 5EXWA 2VG5A 2YCHA 1U49A 4DV5K 3IAYA 3SBTA 5BREA 5FDLA 4DV6K 3HRGA 2P9UA 1QSYA 4JS4A 4NCGA 5J2PA 3W3DA 3P5JA 2HHWA 4CHOA 1JLBA 1NKEA 3OYJA 4PKIA 4KRFA 1HKCA 3ZX0A 2IGIA 4CZFA 1M90O 4DTMA 2UUAK 4ICLA 2NRXA 1ZBIA 3LWMA 1B92A 4ID1A 1QHAA 2HHQA 1TVRA 4CBWA 5F0XA 2ZWHA 1GOCA 4J2BA 4YHHK 1FK9A 3CCVN 3IG1A 4JYAK 2ZGZA 4O5FA 2YHYA 1ESVA 4DG1A 2IC3A 4WQ4C 3VGKA 1BL3A 4MQ3A 4K8ZA 1SKSA 2NRRA 2ZM6K 3WXJA 1S1TA 2WOMA 3OBWA 5TKWA 4CJEA 4UY8O 4CJSA 1BOTO 3KLHA 4F3TA 3MECA 1T6DA 5I42A 4B1VA 2G8UA 4YOXA 1VQ7N 4JK9A 1LAVA 3OYMA 4DKWA 1N34K 3L4QA 2E6LA 2P9IA 5IWAK 2B5JA 1G15A 3GE1A 3OYGA 1JLFA 3ENHA 1BQNA 1GLAG 1JL1A 1U48A 1ZBUA 3DXMB 4HVJA 1NGHA 1BQMA 4F2RA 1JCFA 2YKMA 1HNZK 2HNDA 2VGNA 4DQRA 4IO9L 3L2WA 4FWLA 5T7BA 4CGGA 2W40A 3O9QA 3RMCA 3K9KA 3RRGA 1FJGK 3ZCMA 3H1QA 1YJNN 4DTUA 5A2QO 4KO0A 2IIRA 5KPRA 4DLEA 4EP5A 3QESA 2VCPA 4BE1A 4WYBA 1EX4A 4BDPA 3ZETB 4MO4A 3SPYA 2OANA 3DLGA 3AV9A 1T3VA 4CZIA 3TWHA 4DF4A 3SMPA 5C25A 3CJAA 2GV9A 2VWKA 4NXNK 3P4IA 4FYDA 5AQNA 1XMOK 1BI4B 4CD3A 4H0PA 5AQTA 5IT9O 1E3MA 2HSTA 1YI2N 4A59A 4B1ZA 2OZSA 1EWRA 2HMIA 4BRKA 1OH7A 1KVBA 3J7AP 2XY6A 2UXCK 1RTJA 3S5TA 4ELVA 4OVLA 3MDQA 3SJJA 4FLYA 3MX5A 3TSPA 3CJ7A 3CQXA 4FJJA 2OTLN 3U9ZA 5AQJA 1Q86O 3CG7A 3SK3A 2V7YA 1OH5A 4LF7K 1CZBA 4FJMA 1D5AA 3VQ7A 3AAQA 4CJUA 1KQSM 2O8EB 2OCEA 1T44A 4YFUA 5CR4A 3KK2A 2WFBA 1HNXK 3JYTA 2O8CA 4CIFA 2HBJA 3PY8A 1KVAA 4FWMA 5KQ8A 4Z4FA 3NCIA 3U3YA 1WSGA 1BIUA 2BGGA 2F7TA 1LWFA 4FJNA 3AO5A 1HMVA 3EKSA 4PY5A 1SKWA 3O9RA 3QINA 1MA9B 3I8DA 1JLGA 4BVOA 3H1VX 4I2PA 2O8BA 4CD1A 1GLFO 3BZKA 2YJFA 3EEQA 4JKFA 5M1OA 5AZIA 3VF6A 3C7NA 4M63C 3FFKB 3UIQA 4KPYA 5ADXH 3O3FA 3PO5A 4GVEA 5AQIA 5AQOA 1I94K 4YNQA 1GOBA 3QMLA 4A5BA 5J1EA 1T05A 1QQOA 1BCOA 4NYFA 2QK9A 3QO9A 4IJAA 5M1KA 4GY2B 4Z4EA 4H4MA 3RSEB 1TKZA 4CJVA 5C15A 4KV8A 5AQZA 3UKUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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