3U9ZA

Crystal structure between actin and a protein construct containing the first beta-thymosin domain of drosophila ciboulot (residues 2-58) with the three mutations n26d/q27k/d28s
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 119
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9zA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9zA03
2YI1A 3BUZB 4BR9A 2P9SA 3WQUA 2BUPA 3O8MA 1ATSA 3IDHA 3UKUB 3OHRA 1BA1A 4FWNA 2ASMA 1QZ6A 3O1BA 3D2EB 2A42A 3S41A 4JD2B 3ZX0A 2KHOA 1BG3A 1RFQA 4BG9A 4IXCA 3A5LC 3WXKA 4ISFA 1BU6O 1NGIA 1K8KA 1HX1A 3A5NC 4CZJA 1GLBG 3CJ7A 2QWLA 5CE3A 4BRLA 2YHWA 3LDPA 4GY2B 3ZX2A 5LJVA 1WUAA 4FSVA 3U9ZA 3RSEB 1NGGA 4O8KA 2P9PA 4EHTA 4JN4A 4M63C 1GLFO 5AQLA 3ZETB 2FSKA 4WQ5C 5EVZA 2PBDA 1QZ5A 3RSEA 2E1YA 2A5XA 3DJCA 4H0PA 3VETA 4DB3A 2YJFA 3FE1A 4E1JA 1MWMA 1R59O 2CGKA 5I9EB 5EY4A 3ZETA 4QS7A 2FXUA 3ENOA 3LL3A 5KQDA 5F1XA 2F9WA 1U2VB 4A2BA 3KVGA 1ZXOA 2IVNA 5ADXH 4MLHA 4B1ZA 3CERA 2VWBA 4I6MB 2AP1A 3H1VX 2E2PA 3B8AX 4FWLA 5AFUH 1SZ2A 5AQFA 2AA4A 5AQJA 4IWVA 4PL7A 3EKSA 4WQ4A 2A40A 3H45C 4IJNA 3FLCO 3A8YA 3ID8A 4JNEA 4NO7A 5JMVA 3P4IA 2I7PA 1ESVA 1TUUA 1HPMA 1NGHA 1ZBSA 2NRHA 2P9SB 3GG4A 3H3NO 4LC9B 5AQIA 5AQTA 5AQZA 3HM8A 1BUPA 4BGAA 1GLLO 4RWTA 1EQYA 3BP8A 1TUYA 3CQXA 5FPNA 3O4WA 4PKHA 3ULEB 3D2FA 3C7NB 3JS6A 5AZIA 1TYQB 3MDQA 4RCHA 2GUPA 2J4RA 4DQ8A 3FZLA 1HUXA 2QW9A 3HZ6A 3EN9A 4M7YA 3EO3A 2ZGYA 3VPZA 1BWFO 3CIPA 3QDKA 2HMPA 5AQKA 4I6MA 5AFUA 4H5VA 2GWKA 4CZHA 5AQWA 4EAHD 3GDQA 1KAYA 2QWOA 3IMXA 2Q31A 4MO5A 3KZBA 2P9LB 4DCHA 1NGEA 3VEYA 3HBTA 1MA9B 1YAGA 1QQNA 2YJEA 5AQNA 3J8AA 2VCPA 4BRCA 1T6CA 3O1WA 3ATUA 5AZJA 3HTVA 5FPDA 2V51B 5AR0A 5TKYA 4WQ5A 3VEXA 3WQTA 3R6MA 4BRHA 4B1WB 1JCGA 3ZX3A 3MCPA 3O80A 4BR7A 5JLHA 1Q18A 4CZGA 4CZKA 3FGUA 3QFUA 4K43A 1HLUA 2E20A 4IJAA 5EOYA 1NBWA 3MMVA 3L4IA 1OKJA 3CJAA 1U2VA 1T44A 3ZEUA 4CZIA 3SLCA 2ASPA 1KAXA 3M6GA 4FWOA 4BR5A 2W41A 5F0XA 3AAPA 3FZKA 4MO4A 1GLJO 2ZF5O 3FFKB 2OANA 3WXJA 3R8EA 4CJ7A 1JCFA 3A0IX 2PAVA 2A3ZA 4Y0WA 2VYPA 2P9PB 4FWMA 3SK3A 2GTDA 3IFRA 4H5NA 2E2OA 3VEOA 4H5TA 4BRFA 1SQKA 2H3GX 3VF2A 4BQLA 1ZC6A 4EHUA 3CJBA 4HTLA 3VEWA 4BR0A 4FWQA 3H46O 2P9UA 4J8FA 3CJCA 4BRGA 5JLFA 4A62A 3VGLA 2ITMA 3VESA 4Z94A 4BR2A 3VF6A 4L3QA 3TU5A 2P9NA 4FWKA 5BN8A 2CH6A 1NMDA 3WXIA 3CJ1A 4JHDB 2E2QA 3A5MC 4QS8A 4FPBA 3LDNA 4BRPA 5E84A 4GNIA 1NGAA 3BF3A 2FF6A 1S3XA 3GOIA 3LDLA 3UB5A 2QWRA 1XQSC 3GE1A 4BRAA 3C0BA 2EWSA 4CD1A 2V7ZA 1DEJA 2E8AA 5ADXA 1T6DA 1YUWA 2Q1NA 3L0QA 5BPNA 4FPAA 4C23A 1P8ZA 2NZTA 3LM2A 1NGDA 5FPEA 3AY9A 2FSJA 1V4TA 3CQYA 4H5RA 1E4FT 1Z05A 3WEEB 4XH1A 3DXKB 4IO8A 3M3ZA 3VEVA 1HJOA 1IG8A 3CHWA 2YHXA 4O5FA 1U6ZA 3W3DA 3U9DA 3MK6A 1IJJA 1QQMA 5BN9A 4EFHA 4JHDA 5BRHA 1BDGA 3LDQA 4XEIA 3U8XA 2YHYA 1NWKA 5BREA 1RGIA 3KHYA 3SMSA 2Q0RA 2FSNA 4FOIA 3VENA 1XC3A 1V4SA 5AZJB 4A2AA 2P9IB 3HSCA 1GLAG 2DPNA 1NGBA 3VF4A 4BC3A 2FF3B 5AQSA 1Z6RA 3MN9A 4ISEA 3DWLA 1TYQA 1YXQA 4QS9A 3SJHA 5AQQA 4KBOA 2GELA 2P9UB 4YDUC 1WOQA 2QXLA 4FOEA 5AQVA 3O5BA 3WXLA 4BQZA 1GLEG 5BRFA 3F9MA 4M7XA 2Q2RA 2CGJA 2P9KA 2HOEA 3UE5A 4B1UB 4BC2A 3LM9A 1NGJA 1KAZA 1C0GA 2V7YA 3EL2A 3WUHA 4BGBA 1QHAA 1XUPO 1NLVA 3QFPA 1CZAN 2HF4A 4XH5A 2QWPA 5KQ8A 2V52B 5JICA 2CH5A 4H03B 4CBXA 3QBWA 5BRDA 3GL1A 3W0LA 4PKGA 2D0OA 3WEEA 5FPMA 1ATNA 2YCHA 5LY3A 3TPQA 4BG8A 3UKUA 3VGMA 1HKBA 4DHYA 4CI6A 4CD3A 5EX5A 3FR0A 2UYTA 4K42A 4CZFA 3EZWA 1MWKA 3CETA 5BPLA 4JAXA 1KXPA 4RTFD 4IZ9A 4FWSA 2A41A 3WT0A 1NGCA 3D2EA 3ENHA 5B8HA 2P9IA 4AM7A 4H0YB 1NM1A 3FZMA 1K8KB 2Q97A 4FO0A 1S22A 3QMLA 4HWIA 3JXUA 2P9NB 3QICA 2W40A 2NLXA 1J6ZA 2Q0UA 1BOTO 2ZGZA 1D4XA 2QWQA 1H1VA 4CBWA 5AQRA 4WQ4C 3UKRB 1GLDG 5LJWA 3VEZA 2P9LA 4H5WA 2E88A 4CBUA 4BC4A 3BF1A 1Y64A 4F9OA 1RDWX 2ZWHA 1DGKN 1X3MA 5ELZA 2E2NA 5AQGA 3VGKA 2I7NA 1HKCA 4BVOA 2IIRA 3FZHA 1E4GT 3DXKA 5AQMA 4PL8A 4FL9A 4BC5A 3CI5A 1YVNA 3VOVA 4PKIA 3O6WA 1GLCG 5KPZA 3L6QA 4BRIA 3H6EA 3HI0A 3QBXA 3EKUA 4WYBA 1JCEA 3MN5A 2F9TA 1HKGA 5AQXA 4EIAA 2BTFA 2IVOA 2D4WA 4K41A 4CZEA 2IVPA 4CZLA 3AAQA 1SAZA 3GBTA 1QQOA 1G99A 4BREA 3DXMB 4B1VA 3AARA 3CJ9A 4JD2A 4B9QA 1MDUB 1C0FA 2D1KA 3C7NA 2QWMA 4BR4A 1BA0A 3UKRA 4ISGA 5AQUA 2FLOA 3DXMA 1NGFA 3G25A 4MLEA 2D0PA 5AQYA 4BRMA 4FWPA 3O08A 3QB0A 3FZFA 4K25A 2A6AA 4H0VB 4B1XB 3H1QA 3ATVA 3BEXA 5KPTA 4YDUA 5AQOA 2CGLA 4CZMA 1ATRA 3M1FA 3MN7A 5KPRA 2P9KB 4BVPA 1DKGD 1LOTB 2GEMA 3A5OC 3ZEUB 3I33A 2E1ZA 3LDOA 4BRNA 4A61A 2HF3A 5AQHA 3IUCA 3R9PA 3I8BA 3H3OB 5E26A 4BROA 1LCUA 4XH4A 2ASOA 2GWJA 1X3NA 4AM6A 4BRKA 3U4LA 4BRDA 5F2RA 2QWNA 1BO5O 3DAWA 1X9JA 4NB4A 4FWRA 4H0TB 5AQPA 3D7EO 5BPMA 4H0OA 2Q36A 4B1YB 2QM1A 3SMPA 3VERA 3MN6A 4H0XB 5EXWA 2WUSA 3ULEA 3D2FB 5AZIB 4BRQA 5BR9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KFBA 2FBXA 2O8BA 3CCEN 4FK0A 2GUIA 4F4KA 4DTOA 1TAUA 3D2EB 3S41A 3SBGA 2KFZA 3C6TA 2XY8A 3MECA 4ISFA 3WXKA 4DUZK 4HCCA 1GLBG 2QWLA 4B9VA 4Q5VA 4FJ8A 1DLOA 1NJWA 4BY9C 4FSVA 4DFPA 4NXMK 4N56A 3RSEB 1TKDA 4O8KA 3M8SA 1VSHA 4E1MA 3ZETB 3K5NA 2G8IA 1QZ5A 3AA4A 4MDBA 1VQKN 3VETA 1TK5A 1EP4A 3FE1A 4F2SA 4BWMA 4CJWA 2CGKA 2RPIA 5EY4A 3ZETA 2FXUA 4E72A 4X62K 5I3UA 4FLVA 3K5OA 3FFIA 1U2VB 5SZTA 4DSEA 1YT3A 2IVNA 5ADXH 1YTAA 3DRSA 4CF8A 4I7FA 4DLEA 4GV9A 2AP1A 3G71N 4DU4A 2E2PA 1YHQN 4FWLA 3C6HA 3O4QA 5AQFA 5AQJA 4PL7A 4KTWA 2YNHA 3EKSA 1W9HA 4OGCA 4WFNL 2X78A 3DLGA 3OYEA 2OPSA 3ID8A 1KVBA 1TUUA 5M1QA 4CFBA 2GV9A 3CF5L 1ZBSA 2ATQA 3L2WA 2OCEA 3HVRA 3TABA 3HM8A 4Z4EA 4KAZA 1GLLO 4RWTA 4AHTA 3O4WA 3CPEA 4PKHA 3D2FA 3JS6A 2OPPA 3L2UA 3MCAB 3HOTA 1A5XA 4H4MA 1O13A 2QW9A 3E1YA 1VQON 4RG8A 3EN9A 4OKKA 4ELVA 1Y97A 2ZGYA 4CJ5A 1KD1O 2HMPA 3J81O 5AQKA 3R3LA 4GVEA 1LW0A 5AFUA 2FBYA 2O8EB 1K73O 2QWOA 3IMXA 3MWTA 4I9QA 1T3VA 1L3VA 1MA9B 1U04A 1YAGA 1QQNA 3OTOK 4FVUA 1T6CA 3HTVA 1VRTA 2YX6A 2QXFA 3WQTA 4LFAK 4BRHA 5KGWA 3I55N 3SQ1A 3G0ZA 1BIZA 1Q18A 2JWKA 4B9SA 4Z4GA 1HLUA 4IJAA 1NBWA 2VWKA 3CJAA 3ZEUA 5C25A 4YOVA 4C8KA 3M6GA 3HPOA 5HRSA 2RE2A 2QK9A 1NKEA 3AAPA 3FZKA 3RR8A 4UQGA 1GLJO 3DYAA 1SKWA 3AVHA 3WXJA 3SUNA 3A0IX 4CJLA 3OYHA 2HSTA 4Y0WA 3ISNC 2VYPA 2RN2A 3ZSYA 5C12A 3P39A 1RDCA 5FROA 3TSQA 4IG3A 3AVAA 4H5NA 4PHTX 4H5TA 1SQKA 4BE0A 5KTQA 2UXBK 1VQ7N 1W97L 1IKYA 2WONA 2ZQBA 1NK5A 1NK9A 3NF9A 3SUQA 4CGHA 4JK9A 4A62A 3E9PA 3HSTB 3CM5A 4Y1CA 3WNGA 4DF8A 3C6AA 1JLGA 3HP6A 5BN8A 1N34K 2B5JA 1M90O 3CJ1A 4QS8A 4DV6K 4BRPA 1HYZA 4GNIA 5E84A 3LWLA 2WOMA 2ZJPL 3EY1A 3TSUA 3ZSXA 4HCBA 3ALYA 3GE1A 4IDKA 1GOBA 1C0TA 4TSXA 1DEJA 1HJRA 1S1WA 1TKZA 1YUWA 2D0CA 4C1NI 3KD1E 4FJGA 2JWLA 4Q0BA 1V4TA 4B8AB 1X9WA 3AVMA 4H5RA 4LF7K 4JI6K 3LP1A 3CC4N 1MU2A 1U49A 4IO8A 4JI4K 3O3FA 3HO1A 4CFCA 1HJOA 1IG8A 2DFFA 2YNGA 3CHWA 1NNEA 4O5FA 1QSYA 3ID6A 2D0BA 4BWJA 4GMJB 3CC2N 4HUGA 4XEIA 1RGIA 4HUFA 3MEGA 2DFHA 2ZJQL 4G9ZA 1V4SA 3KKSA 4CF2A 3M8PA 2DPNA 2VG5A 1NGBA 3THYA 4DFKA 4BC3A 1RCHA 3CCQN 1VSDA 2FF3B 1KRPA 3MN9A 3OYGA 4CEZA 4QS9A 3SJHA 3KLEA 2P9UB 2HNDA 2Y1JA 4AHRA 3DRPA 5AQVA 3O5BA 4BQZA 1NG9A 3PX6A 2PYLA 2HHWA 3F9MA 3VQEA 2CGJA 3ZT3A 2P9KA 1W0HA 5DM7L 3UE5A 4BDPA 3AO4A 1NGJA 1C0GA 4C8OA 1QHAA 3WXMB 2VG7A 3OYDA 1N32K 1KFDA 1CZAN 4XH5A 3KK2A 3SUOA 5D3GA 3VQQA 2V52B 5C2DA 5JICA 3QBWA 3SBTA 5BRDA 3AA5X 2D0OA 4FLYA 3NGYA 4AHVA 2YCHA 3TPQA 4BG8A 4GV6A 4CIEA 3ZSRA 4CI6A 1KSPA 5EX5A 4CJEA 4AQYK 2UYTA 1XI1A 2IS3A 5HOOA 1RTHA 1VQMN 1KCFA 1KXPA 4JS5A 2HBLA 3VMFB 3KWGA 2OTLN 1UA1A 4IZ9A 2A41A 1A5WA 3D6RA 3WT0A 4DU3A 1NK7A 4JYAK 1OH7A 2P9IA 2YKMA 4AM7A 3QNOA 1GOCA 4ZTFA 4HWIA 2P9NB 4LFCK 2NLXA 1J6ZA 2Q0UA 2QWQA 3U6FA 1VSIA 3VEZA 4JK8A 3KK3A 4C8LA 2Z1JA 4YFUA 4DTMA 1L5UA 3VGKA 1DGKN 1X3MA 5J1EA 2I7NA 2FBVA 3K59A 2IIRA 3SCXA 3K57A 3PY8A 3CPWM 3KD5E 2YNIA 1YVUA 1VQ6N 1T7PA 4OLAA 4KHNA 1GLCG 4BRIA 3V9ZA 1BQMA 2E5LK 3T1HK 3T69A 5AQXA 2D0AA 4RW8A 3AVCA 4BDYA 4K41A 3V9UA 3VQ7A 2DY4A 4CJQA 4B1VA 4KV8A 2OPQA 2UUCK 1JLCA 3C7NA 3ZLJA 2E6MA 4JKGB 1BA0A 3WNFA 2BANA 3DXMA 3NGZA 3G25A 3NF7A 5AQYA 3J7YP 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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