3UARA

Crystal structure of glutathione transferase (target efi-501774) from methylococcus capsulatus str. bath with gsh bound
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
203
structure length
203
Chain Sequence
VMKLYYFPGACSLAPHIVLREAGLDFELENVDLGTKKTGSGADFLQVNPKGYVPALQLDDGQVLTEDQVILQYLADLKPESGLMPPSGTFERYRLLEWLAFISTEIHKTFGPFWNPESPEASKQIALGLLSRRLDYVEDRLEAGGPWLMGDRYSVADAYLSTVLGWCEYLKIDLSKWPRILAYLERNQARPAVQAAMKAEGLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Methylococcus capsulatus
publication title Crystal Structure of Glutathione S-Transferase from Methylococcus Capsulatus
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase
total genus 73
structure length 203
sequence length 203
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2011-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3uarA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3uarA01
1C72A 2HZEA 4TW5A 4XCSA 4E8EA 4FIWA 3AY8A 4PXOA 5GZZB 2XPDA 2VD1A 3FRCA 4BVYA 6GSTA 4MJCA 2IMEA 2MMNA 1UVZA 3QPMA 5DJLA 2K8SA 2GGTA 2VCVA 4FO5A 3ZIVA 1B9YC 4EDZA 1FW1A 2IFQA 2ZCTA 1BAYA 4MCUA 1RK4A 3ZTLA 1LU4A 1SD8A 2OKAA 2GT6A 3EYTA 4ISDA 2CT6A 1JFUA 2VLUA 5G2ZA 3PPUA 4PQHA 3VI5A 3ZRDA 4P3YB 1FG4A 1VF3A 1BQ7A 4NWYA 4HUAA 5CNWA 2H75A 1V40A 3TKSA 4G19A 5IO2A 2PVOC 4BA7A 4F0BA 3HJMA 1B4QA 4JRRA 4KH7A 5CO3A 1PA3A 3C73A 3HDCA 3MWHA 3KH7A 1AC1A 1DBYA 1AAZA 3J7Yk 1ZL9A 2IWTA 4EE0A 3VWXA 1ZZYA 3ME8A 4CDOA 3CYNA 1S3CA 3A2XA 4ZB6A 2HRFA 4LMVA 5DAKA 5IMDA 1Y25A 1JZOA 5CRWA 4CW9A 2WS2A 4EKZA 4GQCA 2JZSA 1XIYA 2GZPA 4BWSA 1HNCA 4HZ4A 1PRXA 2TRCP 2KUCA 4K7OA 1UC7A 4EVMA 1DUGA 1FAAA 1V2AA 2V2GA 1VRSD 3QR6A 2CX3A 3M0FA 3LXZA 2QC7A 5AIXA 3A2WA 4EUYA 1ZOFA 3HVVA 1TXXA 4ACSA 3QMXA 3H93A 4K8MA 5C04A 5ECQB 2HSYA 1URMA 1J9BA 2IPAA 4ZBBA 6GSUA 1WRYA 5ABRA 3IC8A 3UL3A 5F05A 1Z5YE 4IQ1A 2FLSA 1AUCA 3D22A 1K0NA 5ELAA 1MDKA 2OJLA 2L59A 3KMOA 4XIHA 5KN1A 5IPHA 2RIIA 3IK9A 4J56E 3ERWA 4GXZA 3GKKA 1F6MC 4PNFA 4MH2A 1T1VA 2P31A 4NV5A 1M99A 3MSZA 5GAPD 2VCXA 2IMKA 2C8UA 2L57A 4ULXA 2DMLA 1OVNA 1WIKA 1EEJA 3KH9A 3GNJA 3TOUA 3C1SA 4PUFC 3KEBA 4WBRD 4LA1A 4J57E 4XHMA 2EC4A 2JADA 1IYIA 2QGVA 4N0ZA 1JZWA 4K6XA 1GSDA 1OYJA 4L8EA 3GSSA 4MZBA 2VCQA 5ECPB 2X64A 2H0IA 5C00A 4AF2A 16GSA 2ON5A 1TK0B 3F63A 3G7YA 2V6OA 3GKNA 2H70A 2UZ8A 3IOSA 3DXBA 5AISA 3EVIA 2PVQA 2V32A 2YWMA 3LG6A 4X1UA 4DSSB 2V41A 1EEMA 1O85A 5DQSA 3KGKA 5E4WA 2JSYA 3IR4A 2LKUA 4GRFA 2H6XA 5KN3A 1SK0A 4ML6A 2E2MA 2MBTA 1G0TA 1SU9A 4PQIA 2L6CA 1TK5B 4H86A 3VPTA 3ZFLA 1YDKA 2I81A 1JLVA 3F3RA 2KLXA 3IAM2 2LS5A 4V2LA 3BBYA 5F0GA 4N10A 1V98A 2FWEA 4TRXA 4XS6A 3TRQA 1T3BA 1T7PB 4RI7A 3NOFA 4L5OA 3F6FA 2TRXA 4V2NA 5AN1A 3APQA 2HNLA 5J9BA 3TJJA 1M2BA 2GQMA 4KAEA 2H74A 1F3BA 4TOPA 3BCIA 1ZYEA 2VO4A 2DIYA 1SL2B 4PX1A 2MMZA 4IGJA 1OAZA 3TKPA 2GVPA 4MP4A 3R2QA 5ECNB 5LNKe 3PH9A 4L0UA 1FOVA 4YQVA 3SWLA 2V6KA 5JWQB 7GSSA 1OKTA 4N0VA 3IRAA 2YJHA 4YQMA 2ES7A 2HRKA 3GV1A 4MDCA 1R5PA 3D5JA 3A5WA 5IIZA 4V2MA 3KJYA 4GWRA 2GTUA 2IN3A 1A23A 1GUKA 4ZB9A 5B8AA 1EP7A 4Q5QA 3UBKA 1OC9A 2EIQA 4WXTA 3M8NA 3BD2A 3KTLA 4USSA 1AIUA 3RPPA 3Q19A 3ZMLA 1SD9A 4WETA 1E2YA 1XPVA 5DCGA 4HU9A 5L71A 1M0UA 1Z6MA 4TN8A 4JR6A 4HI7A 2DLXA 4KCEA 3IC4A 4LMWA 1K0OA 2CZ2A 3Q74A 2L4QA 3FYGA 2F9SA 3FR6A 5IMCA 2HFDA 3L9SA 1AQVA 3ED3A 1TU8A 1XWCA 2CV4A 4WF5A 3GH6A 3UVTA 5CRHA 2R6KA 4ZB8A 1R26A 1NHOA 5EY6A 1A2JA 2LJAA 2B7KA 4OCFA 4PQ1A 5CREA 3GTUA 1FVJA 3KZQA 5LCZA 4LLRA 1N2AA 2VL2A 2YV7A 3TCOA 4AJ7A 1T4YA 1K3OA 1H4OA 3GKXA 14GSA 2M46A 2YWOA 4DSRA 1M9BA 1ERWA 3E0UA 4I5QA 5CRGA 2YJ7A 1R4WA 3VK9A 1EZKA 2B7JA 4V1Ag 5CAXA 1Q4JA 3ZZXA 3TKRA 2VUPA 1XVQA 3MDKA 5DBQA 4XS1A 2R37A 1X9SB 2VOCA 2FCHA 3NIVA 4POMA 3OR5A 4WR4A 1PSQA 4MABA 3JCML 1GH2A 3E9JB 4MJEA 2YZHA 2PGTA 2LNTA 5JWOB 1K3YA 2X8GA 1QQ2A 5J3RA 4PNGA 1MDJA 3FW2A 4TR1B 2D2ZA 1E6BA 2GSRA 4RUVA 4I6XA 5KN0A 3TKSC 1XWAA 3KD0A 2O7KA 2BJXA 4KSMA 4G0KA 2HSNB 3FR9A 2HSMA 4MLYA 2P5QA 3PINA 2PERA 3DKSA 2AJQB 2XBIA 3ZVJD 3D4MA 1I5GA 2H0GA 5CYYA 3VLNA 5IPGA 3GIXA 2JU5A 2GDRA 1TP9A 4IP6A 1XCCA 1AQWA 4EF0A 1T8EB 1SKRB 2AYTA 3WGXA 4TKYA 5D73A 1ST9A 1SJZA 1EWXA 4L5LA 3GX0A 1WP0A 5HR2A 3F4TA 3IE3A 4AGSA 1EP8A 3ZIJA 1K0AA 4GSNA 3HKRA 4HS1A 4KW6A 4KCAA 2VCZA 4K7NA 2H1DA 3UAPA 3FZ9A 2RUFA 2OE3A 2CAQA 3MNGA 4XS4B 3G7IA 2E7PA 4IS0A 1EV9A 3IXRA 2MBSA 3L9UA 3ZLPA 2QKEA 1YEXA 5GAND 4MA9A 1JHBA 9GSSA 1PGTA 3F0IA 2RM6A 3N9JA 4TXOB 4ZXGA 4EDYA 12GSA 2VIMA 2C3TA 1X5DA 2OA7A 1IYHA 4KDYA 3CSIA 3EU3A 2K8VA 3G7JA 3W6GA 4O32A 1TJDA 3FZ5A 2C1YA 1O8XA 4F9ZA 5ID2B 5DQYA 4KA0A 3P90A 3UMAA 3GYKA 3K8NA 5D9XA 4NHWA 4O92A 1H75A 5ECHB 4BWQA 2HZEB 3WD6A 2I1UA 4BL7A 3D4TA 1K0DA 4BVYB 2GSSA 1ZMAA 4XRAA 1ZGNA 1HNAA 5E59A 1QK8A 1G6WA 4FYCA 2E0QA 1HYUA 3KXOA 2IFQB 1HQOA 1ML6A 5KEJA 3G9BA 1KBNA 4IELA 3FHKA 2LSTA 2KP2A 3M9JA 3KM6A 3PGTA 2AAWA 3QDNA 5AGYA 5FHIA 3CTFA 4MZWA 2TIRA 5JWRB 1XZOA 2HQTA 2L6DA 1ZYQB 5ECRB 4NHZA 2VL3A 5GSTA 4K9ZA 3H1NA 2VLTA 2NVLA 3DVXA 2IL3A 4K7IA 3GFKA 3CRTA 4G9HA 4G2EA 1OC3A 1AW9A 3CSJA 4TXVA 1YY7A 2B6MA 3CSHA 3EE2A 3C8EA 3C71A 2ZNMA 2A4VA 5JCUA 1BJXA 4KE3A 2FGXA 3BOAA 1TI1A 1M7TA 1B8XA 5HQPA 3TJKA 3GKMA 5G5FA 4NXIA 2F8AA 5DAKB 1GP1A 2B1KA 1SKSB 4KUNA 4BPYA 3CMIA 3Q18A 4KX4A 1F9MA 4ML1A 3A2VA 4MZCA 1A8YA 1GRXA 4DEJA 1F37A 3HY2A 3L9VA 1X0RA 4JBBA 4NMUA 2BTOT 1XOAA 2YOIA 5KN2A 1SENA 2B1LA 1HD2A 4IKHA 11GSA 4AJ8A 5D93A 5EL8A 2HRAA 1XW5A 3EU4A 1RQMA 1UN2A 3Q6OA 4HZ2A 3TRXA 2DJ1A 1SKWB 4Q5NA 3BCKA 1GSQA 4F0CA 2C3NA 3UOMA 2Z9SA 4IN0A 2LUSA 3F4RA 3CXGA 2F3MA 2H72A 1PQNA 2HI7A 2IJYA 3GHAA 3TJGA 1NHYA 4ECCA 2XC2A 2YN1A 1ERUA 4WEYA 1ZCPA 4HOJA 2V1MA 1LBKA 4BVXA 1RW1A 1U88A 3WT1A 4PUAA 3TOTA 2C0DA 2VCWA 1CQHA 5DDLA 4IVFA 1JLWA 2YNXA 3L78A 5J4UA 3DD3A 3HZ8A 2GSTA 2MMOA 3D21A 1XWGA 2B5YA 1YKCA 1LJRA 3LFLA 5J9CA 4MK3A 4K2DA 1GSEA 2CVBA 4LL1B 3US3A 3O3TA 2JSZA 4G0IA 1I9DA 1M2DA 5B6MA 3GUSA 1OKDA 2H1GA 2K9FA 3FEUA 3LYPA 1A0RP 3HD5A 3P2AA 5DALA 5IOWA 4L0WA 4I97A 4HEA2 4OCEA 4EXJA 4F2IA 4EL1A 5ECLB 3VWUA 2FUG2 2I9HA 1Z6NA 5IOXA 3QAWA 4FYBA 1EOHA 4HJMA 4GSSA 3ZMKA 4DVCA 4O5RA 3FK8A 3F8UA 1ACVA 1JZRA 2OADA 13GSA 2BMXA 3KIJA 5IMFA 2J9HA 3QAVA 2YP6A 2VL2C 2XBQA 5FWGA 2OBKA 1F2EA 4D73A 1KTEA 17GSA 1MD3A 1R7HA 2AV4A 1NSWA 3GN3A 3TRPA 3HJOA 4IJ3A 1MD4A 4DSQA 1SL0B 3M3MA 1M2AA 4JE1A 2H01A 5B8BA 1BYEA 2H8LA 5A4WA 2B5EA 4MMMA 2LTKA 1EGRA 2P5RA 4QL9A 4FH8A 2NTOA 3ERFA 19GSA 2B5XA 2GQLA 4IHUA 3GA4A 2CVDA 1FO5A 5COHA 5IMVA 3QAGA 1B9XC 3I6AA 1OC8A 1ERTA 3U5RE 2JZTA 1MDIA 1T00A 1TI3A 4NAXA 1TW9A 2DJ2A 2JL4A 5ENUA 4GTUA 2M80A 4WR5A 1GSYA 2GLRA 3HA9A 2J23A 1Z9HA 3F6DA 1PD21 1EOGA 18GSA 3DYRA 2LQOA 5EPFA 2F51A 2OE1A 1SJ6A 2WGRA 4KGIA 1GL8A 1TU7A 2HRKB 1YF1A 1U6TA 3O6TA 3LQ7A 1BEDA 2HLSA 2LRTA 3KP9A 5BMUA 3H8QA 2R4VA 4ILFA 2AB6A 2WJUA 2PUKC 1OC9B 4WF4A 1GLPA 4IJIA 2O89A 3GL3A 4MH3A 4POKA 5ECSA 2NPBA 3RHBA 1BG5A 3HCZA 1PL1A 1K0BA 3TJFA 3I9V2 2WDUA 3WT2A 3WGDA 4ZBDA 1GSFA 1GSSA 2OBIA 3S9FA 5J5NA 3L0HA 4WBJA 3DEXA 2H6YA 3HHVA 1TDIA 4MPGA 5CRDA 3ZFBA 2YPMA 3EURA 2PWJA 5B7CA 3UEMA 3CTGA 1FB6A 1GULA 5ECKB 5HFKA 3HVSA 4POBA 5G31A 2L4CA 3IBHA 4J2FA 2VL9A 1GUHA 3GURA 3J7Yb 1XWKA 5F8BA 5J41A 1J08A 2LRNA 2AUVA 4ZL9A 1J0FA 5H5RA 1XXUA 2MMAA 2VM1A 3GTUB 2XHFA 5H5QA 3VFIA 3VI7A 5A5KA 3GRXA 3PR8A 1W89A 2E2GA 1QGVA 4JZQA 2FWFA 3RAZA 4MF6A 2IMDA 4HQSA 1Z7RA 2H1AA 3IDVA 4IW9A 1YEPA 3DRNA 2H6ZA 5ELGA 4OFTA 5A4VA 3U6VA 4Z7XA 1EGOA 2K18A 3ISOA 4IP1A 1QMVA 1VF1A 2LJRA 2MZCA 3RHCA 2YWNA 1B4PA 2LEGA 1MEKA 1SYRA 2HRNA 2DC5A 1Y6EA 2WZ9A 4QQ7A 2VD0A 3QOUA 4TR3A 5AIVA 2YWIA 4OMVA 1TRSA 5DJMA 3RDWA 1TRUA 2PU9C 3ZREA 1GNEA 5G30A 3ZL5A 2M72A 1PL2A 2EIRA 5D8IA 1VF4A 3GSTA 3IAS2 1YF0A 3C1RA 8GSSA 3GH9A 2HSMB 2GSQA 3APSA 3P7XA 1PKWA 1M9AA 3W8SA 5HFIA 4AJ6A 1DE1A 2FNOA 1X5EA 5D96A 3LGCA 3RBTA 4JEDA 1WWJA 3FR3A 2LRCA 2OE0A 2N5AA 1ILOA 3TKSE 2I4AA 1G6YA 1K0CA 1V58A 1THXA 2G2QA 2MYGA 3NZNA 3DIEA 4ZBAA 1A0FA 2G0FA 2HYXA 2O8VB 4N11A 4OO5A 4GF0A 2DJKA 2H66A 4I2UA 2C0FA 1CQGA 2C3QA 3UJ1A 2CA8A 2FWGA 2PBJA 4PTSA 2CVKA 3I43A 4KF9A 3F9UA 1PN9A 1NW2A 1AQXA 5HR0A 4ECJA 1SYXA 3ZITA 1O73A 5H5SA 2YCDA 4X0XA 6GSYA 2EIOA 1GLQA 3F4SA 5LD0A 2GT5A 3EMPA 5HFGA 2YV9A 4KDXA 6GSWA 5B6NA 3O76A 4K0GA 3UBLA 5IM9A 3H79A 2HE3A 1T4ZA 3SBCA 2WRTA 1BX9A 2GS3A 3VURA 3D6IA 4YH2A 2A2SA 2FA8A 1GTBA 4F82A 2LV3A 4DSSA 5F06A 1O8WA 1ON4A 1VGLA 3HXSA 3M1GA 4BL7B 3DWVA 2DJ0A 3ME7A 4JU5A 4MJAA 4G10A 3IHQA 2WB9A 3IK7A 5D9TA 2H76A 1YKAA 4I8BA 1XWBA 3HVXA 1NM3A 2DIZA 2X8HA 4IBPA 2KHPA 4NV2A 1A24A 4YAVA 5INYA 3DGQA 2CZ3A 2ZUPA 2B3SA 1HNBA 5DVBA 2IMFA 3P8WA 4WKWA 3LWAA 4GQFA 3IPZA 1FB0A 2RUEA 2R3XA 1O81A 4ECBA 2JZRA 1GUMA 5ECIB 3TDGA 3VWVA 5GSSA 1F3AA 1O7UA 4F03A 4EO3A 2H71A 5JCWA 4FQUA 1DE2A 2IIYA 2PMTA 2VAFA 3QFAC 3VWWA 4RI6A 1GSUA 2C4JA 2RLIA 1X9MB 3ERGA 4KNDA 4YAPA 5A4UA 3C7MA 3DMLA 4Q5FA 4OWYA 2FY6A 2DSAA 5JCGA 2DJJA 1PX7A 5IQYA 1GTUA 2HXKA 1N8JA 3IV4A 1X9WB 1K3LA 3WGEA 2NDOA 4ZL7A 5EVOA 3W8JA 2C0GA 2H73A 1G7OA 3VPQA 1Z3EA 2I3YA 4QL7A 2FHEA 1YJ6A 4GCIA 2VM2A 3UIWA 3R3EA 4OO4A 3F3QA 1GTAA 3CBUA 3TUEA 4PGTA 4O7HA 1B48A 2O87A 2WULA 4MF7A 3KMNA 1WMJA 4TVEA 1X5CA 3N5OA 3LSZA 4XTSA 2GZYA 1XBSA 3WYWA 3KTBA 4HU7A 1A8LA 2LQQA 3LEFA 1U87A 1MTCA 4FYUA 2R5GA 1V9WA 2GZZA 2H19A 1WPIA 3EC3A 5G1LA 4RQRA 2VLVA 2AHEA 6GSVA 1EV4A 4MPFA 3GMFA 1TTZA 2CX4A 1TRVA 1O6JA 3I69A 4POLA 5DCHA 2HZFA 4ZIJA 2FA4A 3KP8A 2CQ9A 20GSA 3LXTA 3FKFA 1ABAA 1TRWA 4BVXB 2C0EA 3UVHA 1PMTA 1U3IA 3ZYWA 4GLTA 2FD3A 1ERVA 1AXDA 2REMA 1A2LA 2DBCA 4OD7A 1GTIA 4IQAA 1SL1B 1JZDA 3L4NA 4RQXA 2HSHA 4OFNA 1Z7PA 2JACA 2N5BA 4GSTA 2IMIA 5IO0A 3KCMA 6GSXA 3TKQA 3E3EA 3HJPA 4Q5RA 3V1WA 4ECIA 4PURA 2DJ3A 2K6VA 2L5LA 5DALB 4HDEA 3A3TA 4EC0A 1THOA 3LJRA 1R5AA 2YANA 1YZXA 2PPTA 22GSA 1S3DA 5IMAA 2DMMA 1SK1A 3M9KA 4TR1A 4TR4A 5D9WA 4MF5A 1GWCA 5FT3A 2GQKA 3QCPA 5ECMB 4D73B 1GNWA 1KEBA 3EINA 2O85A 1FVKA 2H0HA 2X8CA 3EWLA 3D0ZA 2OACA 3GL5A 1UA5A 4N30A 4KSOA 4YQUA 4KDUA 1PX6A 2LJKA 4NPBA 1XW9A 5G5EA 1A2MA 1VF2A 3ZVJA 3RPNA 2HT9A 1TKDB 3QFBC 4XRDA 2KOKA 3DVWA 5CP1A 4K0NA 3TJBA 6GSSA 5F07A 3EMXA 4ZL8A 1Q98A 1YQ1A 1KNGA 3HYPA 3IA1A 2FWHA 1FHEA 4HQZA 3LYKA 1OE8A 1G7EA 2LNSA 5HR1A 4ID0A 2XPEA 3APOA 3GX8A 4X43A 2ALBA 5IMZA 1DSBA 4KB3A 1TOFA 4OFMA 4G0LA 1WOUA 2KP1A 5HR3A 3LORA 1W4VA 2CAIA 2F8FA 4JR4A 1WE0A 2X99A 1XFLA 2NBSA 4XS4A 1WJKA 2C80A 1V57A 1XW6A 2ON7A 2PN8A 4MJBA 1USBA 2R2JA 1OE7A 3H4KA 1K0MA 4LL4B 2VCTA 2N5FA 1U3AA 2A2RA 4TR0A 1PKZA 4TXOA 2H30A 1TK8B 1XOBA 3TGZA 2WFCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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