The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
53
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sequence length |
195
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structure length |
190
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Chain Sequence |
b'PLGSVASAYAALPSWIAYEKARADLEEAKKNDVSPQLLKQLTKACNIAKSEFEREASVQKKLDKMAEQAAASMYKERKSKIVSAMHSLLFGMLKKLDMSSVNTIIEQARNGVLPLSIIPAASATRLIVVTPNLEVLSKVRQENNVHYAGAIWSIVEVKDANGAQVHLKEVTAANELNITWPLSITCERTT'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Nonstructural proteins 7 and 8 of feline coronavirus form a 2:1 heterotrimer that exhibits primer-independent RNA polymerase activity.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Non-structural protein 6, nsp6,
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| source organism |
Feline infectious peritonitis virus
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| molecule tags |
Replication
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| total genus |
53
|
| structure length |
190
|
| sequence length |
195
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
2.7.7.48: RNA-directed RNA polymerase. |
| pdb deposition date | 2011-10-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Thrombin, subunit H |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3UB0 A; 2AHM E; #chains in the Genus database with same CATH topology 4CRA A; 1J8A A; 2BVR H; 3T29 A; 2XC5 A; 2ZTY A; 2BHG A; 2B8O H; 2BDY A; 2VIV A; 3SUF A; 1JRT A; 1NRR H; 1RXP A; 2AIQ A; 3SQH E; 3KN2 A; 1BDA A; 2PV9 B; 1NM6 A; 2BY9 X; 1CA0 B; 1V2L T; 3HKJ B; 3LIW A; 4NWK A; 1A3B H; 3RUO A; 1DY9 A; 3P8G A; 5EXM A; 3F2G A; 4ASU D; 2D8W A; 2FOF A; 2ULL A; 4Y0Y E; 2ZHE H; 2UWO A; 3MFJ A; 3DCL A; 4R0I A; 1GI7 B; 3GY5 A; 5DP4 A; 1UHB A; 4BTT B; 4A1T A; 2Y6T A; 2R0K A; 1MTU A; 1T32 A; 1XXF A; 5DSF A; 3AVZ A; 4OS7 A; 1K1L A; 3A7W A; 2F4L A; 1DY8 A; 1GBE A; 5E0J A; 1DT2 A; 2BDA A; 5EQR A; 2XBX A; 4U32 A; 4F49 A; 1UVP A; 3DT0 H; 4TY7 A; 4GSO A; 3BIV H; 2PFE A; 4JYV H; 1O33 A; 1OXG A; 2AFQ B; 4X6M A; 1XUF A; 1MKW K; 3FP8 E; 1T8L A; 1O2I A; 3R3G B; 3VB6 A; 1S5S A; 1O2Q A; 1SQR A; 1NZQ H; 2G5V A; 5GDS H; 1C1R A; 1C9P A; 3PMH B; 2P8O B; 1GL0 E; 1GHA F; 1TMB H; 3UR6 A; 3RXP A; 1NU7 B; 2VNT A; 1EOJ A; 1XVM A; 3SN8 A; 4OGX A; 1V2Q T; 2F9P A; 4Q2K A; 2Q1J A; 4OS4 A; 3E1X B; 2A7H A; 3B9F H; 1TBZ H; 3LT3 A; 3KQD A; 1TBQ H; 3TJV A; 4YO9 A; 2PLX A; 3M7T A; 3ZZ3 A; 4FUC A; 2Z9K A; 2TBS A; 1SL3 A; 8KME 2; 3F0O A; 2EST E; 1ETS H; 5E8E H; 1TYN A; 1RTF B; 2ANW A; 1EB1 H; 3RP2 A; 3H7O A; 3F2H A; 3ZZ7 A; 1NRP H; 1P2M A; 3B23 B; 1K21 H; 4X1R U; 5EU8 A; 2AS9 A; 1V2J T; 1A0J A; 1GJC B; 4IMZ A; 1QBN A; 3LGT A; 4DG4 A; 4FUG A; 5EIY A; 4I8J A; 4Z1M D; 3BTD E; 3LON A; 5HKK D; 2ZF0 H; 4Y8Z A; 1C1Q A; 1W0J D; 1ZML A; 3F9H A; 2ZFF H; 5AFY H; 1ZR0 A; 1BHX F; 2ZZU H; 1C5O H; 4P02 A; 2BDC A; 4FUF A; 4GVU A; 3RXM A; 4AG2 A; 4AYY B; 2FO9 A; 3P8O A; 1KTT B; 3S69 A; 2KFW A; 4HGC A; 3SV2 H; 3SU3 A; 2ZEB A; 3GY4 A; 2KZ4 A; 3SW2 B; 1CGI E; 3SGA E; 1PYT D; 2ZFP H; 3UNS A; 1MAB B; 3SND A; 1C2I A; 1GVK B; 4Q7Z A; 1IQE A; 3M7U A; 4MPW A; 1LHF H; 3PO1 B; 1YGC H; 1BMM H; 1A5H A; 1MQ5 A; 5FBE A; 4NA8 A; 4ZKN U; 4ZRO A; 4KTU A; 4WME A; 3SU2 A; 2TIO A; 2PUX B; 3ZZ4 A; 2A5I A; 3SGB E; 3T2N A; 1TGN A; 5IDK A; 1QBO A; 2JIZ D; 1E1Q D; 2FS9 A; 1JBU H; 2BZ6 H; 3S9C A; 3QLP H; 2TGP Z; 3SV6 A; 1FY5 A; 2W3K A; 1C5U A; 1GDN A; 1XKA C; 2JET B; 1MH0 A; 2XXL A; 1DWC H; 2WHX A; 2XWA A; 3QGN B; 1TNK A; 4FUE A; 5T6G A; 4ZMA H; 2VH6 A; 1C1O A; 2EA3 A; 1VJ9 U; 3NPS A; 1HAY B; 2PTN A; 4HTC H; 3MU1 A; 1TA2 A; 3U98 H; 1YCP M; 4BXW A; 1GBM A; 1P9U A; 1EAI A; 3M35 A; 1GBJ A; 1MTS A; 2ZI2 H; 2SGQ E; 1C2H A; 3U9A H; 1VKY A; 1E35 B; 1VGC C; 2ODY B; 3ODF A; 1YPJ H; 2D26 C; 4YXW D; 4A1X A; 5CMX H; 5SGA E; 3UUZ A; 1SVP A; 1HJ8 A; 2A2X H; 2VB0 A; 1UVT H; 5EPN A; 5C0U A; 3HAT H; 1HAP H; 1IAU A; 2AGI X; 3LPR A; 3Q00 A; 1PPH E; 3BTH E; 3DFJ A; 5EJZ A; 4Y79 A; 2WV9 A; 3ZVA A; 5TCA A; 5CE1 A; 1NY2 2; 1P57 B; 2I6S A; 5DGJ A; 1CBW B; 2ZA5 A; 5K7R A; 2Z3D A; 1GI9 B; 2ALP A; 2VIO A; 2HRV A; 4UDW H; 1E38 B; 5HM9 A; 4BXS A; 1BTH H; 2BLQ A; 1WOF A; 4JZF H; 4M9F A; 1C2G A; 5J4Q A; 4XOJ A; 2VU8 E; 3N99 A; 1QRX A; 3RM2 H; 1EJA A; 1TPO A; 2KCA A; 1IQN A; 1YPE H; 4YLU A; 1FIW A; 2ZU5 A; 3VB4 A; 3O8B A; 3H7T A; 1C4U 2; 2FOM B; 1NS3 A; 1V2P T; 2OXS A; 1KLI H; 5C1X A; 1L4D A; 1ANE A; 1SGC A; 1OP2 A; 1V6D A; 1C5Y B; 1MCV A; 8EST E; 1OWH A; 4ISO A; 1TX8 A; 4EST E; 2WV5 A; 1AO5 A; 2QGR A; 1CSO E; 1P2I A; 4NZL A; 4DIH H; 2FOB A; 3G01 A; 2W7S A; 1O3F A; 2JH6 D; 1RIW C; 1N6X A; 2G55 A; 4MPV A; 4TSF D; 3SQE E; 5A8Y A; 2P3F H; 1C2F A; 4NIX A; 3U8T H; 4CH8 B; 2PP6 A; 1ANC A; 3GCH C; 1W13 U; 2G4T A; 3K6Y A; 5FBI A; 1ZPZ A; 2FLR H; 5AVD A; 3RLW H; 1EFR D; 1KMH B; 3BTG E; 6LPR A; 2EI7 A; 3M36 A; 1LHE H; 1LPZ B; 4AFZ A; 4CR9 A; 2Y80 A; 1C5V A; 2XND D; 3URE A; 3UWJ H; 1YP9 A; 1UVO A; 3UFA A; 4DGJ A; 3SNC A; 1S0Q A; 3RU4 T; 4RKO B; 4AYV B; 3L3T A; 3EST A; 1SB1 H; 1UO6 A; 3BTE E; 1J9C H; 1GWA A; 3WY8 A; 1SGQ E; 1O3C A; 4B74 A; 1RRK A; 1EB2 A; 1QBV H; 2H1U A; 3OFN D; 1SG8 B; 1TRY A; 2O8T A; 1O5D H; 3PRO A; 5FL7 D; 4BOH A; 1BQY A; 4IMQ A; 1C1P A; 3BN9 A; 1DIT H; 4NSY A; 3ZV9 A; 4NG9 H; 2FS8 A; 2ZPR A; 1PPF E; 2Z9L A; 1WQS A; 2F91 A; 1QL9 A; 3BV9 B; 1TWX B; 2ASU B; 2DE8 A; 4K1E A; 4DT4 A; 1RS0 A; 1VGC B; 1WU1 A; 3OTP A; 1FUJ A; 1FN8 A; 4DUR A; 3NUM A; 1C1M A; 2FLB H; 2RDL A; 2ZC9 H; 3T28 A; 2TGD A; 2Y5F A; 1TLD A; 3HGP A; 4MNW A; 1EPT C; 1F5K U; 1O3H A; 1AU8 A; 3ITI A; 2VH0 A; 2J9N A; 4YT6 H; 1DLE A; 2CGA A; 2DUC A; 2GGV B; 4AG1 A; 2AYW A; 1Z71 A; 1C9T A; 5GJ4 B; 3KL6 A; 2W7U A; 4AB8 A; 2FZZ A; 1K1N A; 5HIY A; 2BY6 X; 2A7C A; 1SMF E; 5JB8 S; 2SNV A; 1W12 U; 3T25 A; 4IBL H; 2O8W A; 3VGC C; 3A7Y A; 2FP7 B; 1TA6 A; 1CQQ A; 1SGI B; 4WH6 A; 3MQK C; 4AZ2 B; 1FAX A; 4XBD A; 1MD7 A; 1F2S E; 1AQ7 A; 2GKV E; 2J92 A; 1OP8 A; 2YOL A; 2ZFQ H; 5E2P A; 4R8T B; 2GCH F; 1TMT H; 1L1G A; 1PPG E; 1YY3 A; 1VCP A; 2BD4 A; 1HFD A; 1S84 A; 2ANY A; 4TT3 D; 5LGO A; 3EAJ A; 3RXE A; 3F9G A; 1MAY A; 4XSK U; 1TRM A; 2J95 A; 2G4U A; 3UOP A; 3SV7 A; 1CT4 E; 1IOE A; 1P06 A; 1RIW B; 1SGD E; 2JKH A; 3W94 A; 1QTF A; 5HIZ A; 3HPT B; 3KF2 A; 1GHA G; 1Z8J B; 2JH5 D; 4JMY A; 5DP7 A; 2BLW A; 3K9X B; 1GBA A; 2YMS D; 3GCH B; 3M37 A; 1AD8 H; 3T26 A; 2QC2 A; 1OWI A; 5DN6 D; 1TQ7 B; 4DY7 B; 2FTL E; 4FUJ A; 4YT7 H; 2ALV A; 2R9P A; 2OBQ A; 1IQI A; 2GV7 A; 2OQ5 A; 3E0P B; 1J15 A; 1BML A; 2WPH S; 1EAX A; 2AGE X; 1FAK H; 5A0A E; 4ACA A; 1BUI A; 5E0H A; 2SGA A; 3SUD A; 1JXP A; 3P70 B; 4H42 U; 2HPP H; 1AWF H; 1Y3Y A; 3RXI A; 1Y3W A; 4WH8 A; 1YM0 A; 1PYT C; 1E37 B; 2WUB A; 3CS0 A; 1HAH H; 1G9I E; 1P03 A; 4K2Y A; 1W7X H; 1BT7 A; 2C8Z B; 2B5T B; 2QV1 A; 4YZU A; 1ELD E; 1V3X A; 3UWI A; 3V13 A; 5DP6 A; 3TGK E; 3OEH D; 1AZ8 A; 5LPR A; 3PMJ A; 3TGI E; 1YPH E; 1O38 A; 4YTA A; 3ZVD A; 4D7F A; 3MTY A; 2KR7 A; 2K8I A; 2AGG X; 2AIP A; 3I77 A; 3KQB A; 2STB E; 2FOD A; 2V6N A; 1GI8 B; 2RCE A; 4J1Y A; 1AB9 C; 1UVS H; 2JJ2 D; 2SGF E; 1YYY 1; 4FUH A; 1IQG A; 1C1U H; 1FXY A; 1GI3 A; 3PV4 A; 1OYQ A; 1ZSJ A; 4DCD A; 2R3U A; 3SJ8 A; 2C8Y B; 1ELC A; 1CHG A; 1OWD A; 3OX7 U; 4JZD H; 1WXR A; 4B76 A; 1PQ5 A; 2UWP A; 2ZGX H; 1GHY H; 1GPZ A; 4KTS A; 1OYT H; 2G5N A; 1Y5A T; 3I78 A; 4DOQ A; 3P17 H; 1AND A; 1EPT B; 2ZQ2 A; 1SKY E; 2OC1 A; 4K69 A; 1AVG H; 4AOQ A; 5FX5 A; 1TON A; 2BD8 A; 1BB0 B; 2A7J A; 3LGU A; 1CT2 E; 2PKS C; 3NXP A; 1QL7 A; 3RM0 H; 3V3M A; 2BOH B; 1FY3 A; 2OC8 A; 1FDP A; 3FZD A; 1CT0 E; 4XRN A; 2QF3 A; 3VB5 A; 1SOZ A; 3ZVE A; 2AMP A; 4INK A; 2FDA A; 5HYO A; 4IN2 A; 1OKX A; 5B6L A; 4A7I B; 5FCK A; 3SJO A; 2HGT H; 4Y10 E; 2ZDV H; 4GLY A; 4AB9 A; 4X8T H; 1SLX B; 4TWW A; 2UUK B; 3ZVG A; 3A8D A; 1KXF A; 4WJG 2; 1BMF D; 3A7Z A; 1GI4 A; 1O2X A; 4KGA A; 4O97 A; 3SJI A; 7LPR A; 4F48 B; 4KKD A; 3QUM P; 1EZS C; 1HIA B; 1A5G H; 2QF5 A; 3EA8 A; 1QJ7 B; 1TE0 A; 2GCT C; 4FXG H; 2NWN A; 3A89 A; 3MMG A; 2I6Q A; 4B2B A; 1D3T B; 4AFQ A; 1NU9 A; 2Y5H A; 2VID A; 1KY9 A; 1QY6 A; 1O2P A; 4BNR A; 4UE7 H; 1BRA A; 2AH4 X; 2PSY A; 1FPC H; 1P2N A; 1UTN A; 1LTO A; 5FX6 A; 1JIM A; 3RC5 A; 3MH6 A; 1HBT H; 5C5O A; 1GVZ A; 1GHX H; 2FIR H; 2FX4 A; 4K8Y A; 2QN5 T; 4HI3 A; 3RMO H; 2CJI A; 2BTC E; 4RT0 A; 1H9H E; 4ZCN A; 1EPT A; 1AVX A; 1Z6J H; 2AEI H; 1TOM H; 2B0F A; 4MG3 A; 3A87 A; 4WXV A; 2XWB I; 3VG8 A; 1IQK A; 1MKW H; 3STJ A; 2KX4 A; 1OX1 A; 1YPL H; 2Z9J A; 2C90 B; 3PYH A; 4XFQ A; 1O3B A; 4E7R G; 3D23 A; 3OSY A; 2BD3 A; 4F55 A; 1XUG A; 4BAK B; 2L6O A; 5JYI A; 1NC6 A; 1E36 B; 4IGD A; 1O3N A; 2A4O A; 2C4F H; 1O3E A; 5EGM A; 2G51 A; 4TYD A; 1AY6 H; 4RI0 A; 1KXB A; 2H6M A; 3OU0 A; 1QQU A; 1GJ9 B; 4OS6 A; 1IQF A; 4WWY A; 2FWW A; 3SO3 A; 4X1N U; 3SNA A; 2BLO A; 2Y7X A; 3PM3 A; 4AOR A; 1AMH A; 2A31 A; 2KM0 A; 3A85 A; 1ELB A; 1DST A; 2IJO B; 3KNX A; 3TH3 H; 3P92 A; 2J34 A; 2PTC E; 3NCL A; 3RXG A; 3PB1 E; 5FCR A; 4O03 A; 5E0G A; 1D4P B; 1OWJ A; 1KXE A; 3LGV A; 2FI4 E; 2EY4 C; 2ZCH P; 4BAO B; 3ATM A; 4ZXY H; 3BSQ A; 1HIA A; 2UWL A; 1DE7 H; 2THF B; 3IIT A; 1YCP K; 3MOC A; 4RN6 A; 1PPZ A; 4BAH B; 3ZZ5 A; 1WTG H; 1W0K D; 2NU4 E; 2ZFS A; 2BDB A; 1ELG A; 1AZZ A; 3Q76 A; 3PMB B; 3SU0 A; 1TNI A; 4X1P U; 3N7D A; 1H8D H; 4HG6 A; 1K1M A; 1EAU A; 1WBG B; 4CHA C; 1HJA C; 4UEH H; 1EAS A; 2PKS B; 1ZJD A; 3KQC A; 5IYT A; 2PW8 H; 3ENS B; 5A0C A; 1INC A; 5F8T A; 1TAL A; 5T1V A; 4D7G A; 1V2N T; 2F9U A; 3ELA H; 1MKX H; 3ZIA D; 2LPR A; 1AKS B; 1GBL A; 4BTU B; 4IC5 A; 2FOC A; 2OTV A; 3E8L A; 1TOC B; 1SGF G; 1P3E A; 1LHC H; 3UNQ A; 4KTC A; 1MTN B; 1A61 H; 2JJ1 D; 2ZO3 H; 4D76 A; 3JZ2 B; 5TJX A; 3UIR A; 1D3P B; 1HCG A; 1O5G H; 3OAA D; 1BTX A; 2GCT B; 1O2O A; 4MDS A; 3RML H; 1SGT A; 3PWC A; 3TU7 H; 4JYU H; 1TAB E; 1ELA A; 3S0N A; 4LK4 A; 3LGI A; 1VIT H; 4YOI A; 2A1D B; 2ZPS A; 1O31 A; 2A2Q H; 3I29 A; 1T31 A; 4LZ4 B; 3TLO A; 2GDD A; 2QF4 A; 1H8H D; 1BCU H; 1B0F A; 1BTU A; 2CHA C; 4I86 A; 1DS2 E; 2H2Z A; 1HYL A; 1O2G H; 3GY3 A; 4KP0 A; 1DWD H; 3O8R A; 3SJK A; 4NZQ A; 4B73 A; 1GL1 A; 2GCH G; 2H9H A; 1F0T A; 2GJG A; 2SGP E; 1V2T T; 1K28 D; 2OK5 A; 2ZGC A; 4JZE H; 2BVS H; 3ZVC A; 4ABJ A; 1MQ6 A; 2B9L A; 1TGC A; 4JK6 A; 3URD A; 2CN0 H; 3NRL A; 5JBA S; 3CP7 A; 3ZZ8 A; 1IQJ A; 4FU9 A; 2BMG B; 2VIQ A; 3FAO A; 1WDI A; 4XDE A; 3DSP A; 2J2U A; 2BZA A; 2ZCK P; 3L6P A; 1FX0 B; 2GZ8 A; 1DDJ A; 3TJN A; 4I33 A; 3A83 A; 2FOA A; 3QWC H; 7EST E; 2ZU1 A; 5DKM A; 8GCH F; 1GBK A; 2PSX A; 1ELT A; 3F0P A; 1O2R A; 1AKS A; 3LH3 A; 3KHV A; 4OM9 A; 4K1S A; 1VCQ A; 3TH2 H; 1JIR A; 1P12 E; 2TGA A; 4CRG A; 1Y5B T; 1WCZ A; 3M7Q A; 1CE5 A; 1A0H B; 3PLP A; 4YOJ A; 3PWB A; 3FOA A; 5JBB S; 1ORF A; 3TJO A; 1H8E D; 1CVW H; 1P02 A; 1W0Y H; 1G32 B; 2AMD A; 2FPZ A; 1MU8 B; 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