3UB5A

Profilin:actin with a wide open nucleotide cleft
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
publication title Structural basis for profilin-mediated actin nucleotide exchange.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 115
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ub5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ub5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ub5A03
3IUCA 3GL1A 5AQVA 5BPNA 5F0XA 3BP8A 1HKGA 4IJNA 5AQIA 1BDGA 2IVOA 5AQUA 3DXMB 2E2NA 2Q97A 3EZWA 3AAQA 5EVZA 4PKHA 4BG9A 5KQDA 3IMXA 3D2FB 3GDQA 4KBOA 4CZFA 3FGUA 1T44A 2YCHA 3ATUA 4H5WA 4ISEA 2FLOA 4I6MA 1K8KB 2CGLA 1ATSA 1NGEA 1HKCA 1Z05A 3W3DA 2E1YA 3MN5A 4H0VB 4CZLA 2QWPA 3WXIA 2VYPA 3UKRB 4BRCA 2QWRA 4H5NA 4BREA 2ZWHA 4L3QA 4B1ZA 4EAHD 4EHUA 5AZJA 5E84A 5BRDA 2A6AA 4B1YB 5F1XA 3KZBA 4BRHA 3CJ1A 3HZ6A 4JNEA 2QWOA 4GNIA 5AQXA 5JMVA 4EFHA 2VWBA 2AA4A 1BOTO 5FPEA 3LDPA 3IDHA 2EWSA 4B1UB 3MK6A 2GWKA 4PL7A 1HUXA 4H5TA 4H5VA 3ZX0A 1ZBSA 2GELA 2QWMA 4BR5A 4JD2A 5JICA 2Q2RA 5AQJA 1BA0A 2BUPA 1LOTB 2YI1A 1KAXA 4CJ7A 1YXQA 3RSEB 4K43A 4M7YA 3ZEUB 3U9DA 5AQLA 4FWQA 4CZGA 2F9WA 3CETA 1NGIA 4H0PA 2QXLA 4BVOA 4FO0A 1XC3A 2E8AA 4MLHA 4BQLA 3L6QA 1WUAA 2F9TA 1QQMA 2P9NB 3D2EB 3JXUA 3H46O 1DEJA 1LCUA 3MDQA 1YVNA 3WQUA 4H03B 2E2PA 4Y0WA 1GLCG 1EQYA 4K25A 1NM1A 4LC9B 5F2RA 2CH5A 2VCPA 1GLEG 2FXUA 4BRIA 3CQYA 1RGIA 4BRGA 4JN4A 4M7XA 2KHOA 3LM9A 3MCPA 4BRLA 3ZX3A 3HM8A 4BR7A 3I33A 4A2AA 1SAZA 4BRMA 4AM6A 3KVGA 2Q0RA 2FSKA 3EN9A 3BF1A 4EIAA 2P9PA 4WQ4C 1X3NA 5AZIA 3VF4A 5KPZA 1BG3A 2QWLA 4FWSA 4CBUA 4I6MB 2YHXA 3GBTA 1D4XA 1HPMA 4BRAA 4FPBA 3QICA 3A5NC 3EKUA 3WT0A 2HF4A 3A0IX 1HLUA 4PL8A 3ULEB 3U9ZA 4BC4A 2P9LA 4BC5A 4NB4A 1IJJA 3D7EO 2D1KA 4RTFD 1BO5O 3CERA 3AY9A 5AZJB 4BC3A 4CBWA 2A40A 3LDNA 4H0TB 3BEXA 3A5MC 3CJBA 4BG8A 1J6ZA 4WQ5A 3FZKA 4RWTA 3LDQA 1R59O 3MN6A 3BUZB 5ADXH 4PKIA 2W40A 3W0LA 4E1JA 4BVPA 3SJHA 1T6CA 3ZETA 4BGAA 2E2OA 5AQRA 4J8FA 3O80A 4JD2B 3QMLA 5BN8A 3O8MA 3LL3A 1NGHA 3GOIA 2P9IA 3GE1A 1WOQA 2Q1NA 3FLCO 4CZKA 1NGJA 2GWJA 4GY2B 5BREA 1U2VA 2HOEA 2V52B 5AQSA 4FWOA 3HBTA 1GLFO 3DXKB 1S3XA 3O4WA 3CHWA 1NGFA 2PAVA 3WXKA 2NZTA 4QS9A 1BUPA 4B9QA 3HSCA 3VF2A 4IJAA 1HKBA 4BC2A 4IWVA 3MN7A 1T6DA 1OKJA 3G25A 4FPAA 3VGKA 3VESA 4ISGA 2IVPA 1QHAA 3H1VX 5EY4A 2FF3B 2A42A 1HX1A 5AQHA 3UKUA 3VEOA 5EXWA 4BROA 4BR9A 3B8AX 1U6ZA 3SMPA 2DPNA 4CZEA 3HI0A 3L4IA 3TPQA 2P9SA 1C0GA 4JHDB 2ITMA 2P9PB 3VEXA 5AZIB 3P4IA 4K41A 1E4GT 1KXPA 4BRPA 4FWKA 3FR0A 1BA1A 2YHYA 3VGMA 1QQNA 5AQNA 3ZX2A 3FZMA 5BRHA 3ATVA 5BN9A 2P9LB 2Q31A 2W41A 3CIPA 3VOVA 3DXMA 3CJ9A 5AQWA 3H3OB 3KHYA 5AFUA 4DHYA 2YJEA 3MN9A 3SLCA 3QFPA 3O08A 1QZ6A 3WEEA 1MWKA 2E2QA 2FSNA 5KQ8A 2BTFA 4CI6A 3VEWA 5KPRA 1K8KA 5LY3A 2WUSA 5ELZA 3VEYA 5AQKA 3IFRA 3O1BA 1Q18A 1Z6RA 2CGJA 3UE5A 2YJFA 1YUWA 1U2VB 1BU6O 1MA9B 1NMDA 1ZC6A 3ENHA 4YDUA 3H3NO 4H0OA 5AQPA 5AQOA 1MWMA 3JS6A 3VPZA 1RFQA 1XUPO 3CJCA 4FOEA 4WYBA 2I7PA 1RDWX 4BRQA 1X3MA 2A5XA 4XH4A 2NRHA 4H5RA 2ASOA 3A5LC 1X9JA 4PKGA 3M3ZA 4C23A 3C0BA 4HWIA 2IVNA 3H6EA 3VETA 4F9OA 2Q36A 4CZHA 3DJCA 1MDUB 3LDOA 3L0QA 2V7ZA 2QWQA 3WXLA 1GLAG 2UYTA 4Z94A 4FWMA 3QBXA 5EX5A 5ADXA 3R6MA 2HMPA 2ZF5O 3LDLA 5FPMA 3C7NA 3VEVA 3OHRA 4O8KA 1NGDA 5B8HA 4CD1A 3WUHA 1QZ5A 2V51B 3ID8A 2IIRA 2J4RA 1GLJO 1SQKA 1XQSC 5LJVA 2P9NA 5TKYA 3TU5A 1YAGA 3D2EA 5BPLA 1NGGA 3CI5A 5CE3A 2CH6A 3FFKB 1BWFO 3EKSA 5AQZA 4BR0A 2P9UA 5BRFA 4B1XB 3M1FA 4XH5A 4QS7A 3QFUA 3VENA 4FWPA 5AQFA 2P9KA 4MO4A 3EL2A 4B1WB 1NGCA 3H1QA 2I7NA 1IG8A 4EHTA 4FL9A 2H3GX 1V4TA 2D0OA 2GTDA 3SK3A 1TYQA 3WQTA 4BRDA 4WQ5C 3J8AA 3CQXA 4JAXA 3WEEB 1P8ZA 3QDKA 3ENOA 3HTVA 4CZJA 1JCEA 4RCHA 3MMVA 3ULEA 2QWNA 4NO7A 3M6GA 4MLEA 3VERA 5BPMA 2QW9A 4FSVA 5LJWA 3LM2A 3SMSA 5I9EB 5EOYA 3U8XA 1SZ2A 5AR0A 4IXCA 1NGAA 4CBXA 2ASMA 2E1ZA 3VEZA 1S22A 4QS8A 5FPNA 2YHWA 3I8BA 3R8EA 3AAPA 3CJ7A 3O6WA 4BRFA 4O5FA 3U4LA 4ISFA 1NLVA 5JLFA 3A5OC 4AM7A 2OANA 1ATNA 2FF6A 3DAWA 1HJOA 2GEMA 3GG4A 5FPDA 1G99A 3D2FA 4WQ4A 1QQOA 1TUUA 5AQQA 3C7NB 4K42A 1C0FA 3AARA 3DXKA 1GLBG 2D4WA 3O1WA 4DCHA 5KPTA 3ZETB 3DWLA 5AQYA 3S41A 3VF6A 2E88A 1GLDG 3CJAA 1Y64A 1NGBA 3UKRA 4H0XB 3EO3A 2P9IB 3BF3A 4BR2A 3QBWA 4BRKA 4CZMA 2P9UB 2HF3A 3FZHA 4FWRA 1NWKA 1JCFA 2ASPA 3H45C 5AFUH 1TUYA 1ZXOA 3R9PA 2A41A 4HTLA 1ATRA 4H0YB 3VGLA 2P9KB 4IZ9A 1KAYA 1DGKN 1ESVA 4FWLA 2AP1A 2QM1A 4A2BA 4BGBA 4CD3A 1H1VA 2ZGYA 4B1VA 3QB0A 1V4SA 1TYQB 1E4FT 4JHDA 2ZGZA 2GUPA 2E20A 4A62A 2D0PA 3RSEA 1JCGA 3A8YA 3ZEUA 4BQZA 2A3ZA 4IO8A 4FWNA 3UKUB 1DKGD 4M63C 3WXJA 3UB5A 1KAZA 1NBWA 4FOIA 4A61A 4XEIA 4DB3A 5E26A 2V7YA 5AQTA 4CZIA 2Q0UA 3FZFA 2P9SB 2PBDA 2FSJA 3F9MA 3O5BA 3FZLA 4MO5A 4DQ8A 1GLLO 4YDUC 4XH1A 1CZAN 5AQMA 3FE1A 4BRNA 4BR4A 5AQGA 2NLXA 5JLHA 2CGKA 5BR9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QETA 4CEOA 4YORA 2ZJPL 2FBTA 1RTHA 3SPZA 5F0XA 3BP8A 4IOXA 1VQNN 1HQUA 2IVOA 5AQUA 4Y1DA 2E2NA 2Q97A 2G8KA 5HRRA 1JKHA 3VQCA 4CFBA 3IMXA 3LAKA 3CMAN 3OS0A 2XY5A 2JWKA 4CEBA 1O1WA 2CGLA 3W3DA 4O8UA 4E72A 3KD1E 3L2QA 3ENBA 4CZLA 2OZMA 2VYPA 2FBVA 2QWRA 2HHHK 2D0AA 3MWTA 4DR3K 3RMBA 4OLAA 5AZJA 4I9LA 2G8IA 1NNEA 3V1QA 3CJ1A 3PLAA 3O9QA 4GNIA 2HBJA 1SS6A 3IDHA 4B1UB 1NJZA 4GVEA 3LAMA 4DLEA 3OBYA 4ELUA 1R0AA 2O8EA 1TKZA 3HL8A 1RDUA 4OKEA 3P1GA 4GV6A 2BUPA 4CF2A 1YXQA 3ZSWA 3N4PA 3U9DA 4KHNA 2F9WA 3CETA 3HP9A 4KTZA 2QXLA 4CJEA 3UIQA 1XC3A 2E8AA 4MLHA 2O8FA 2F9TA 4KV8A 1SL0A 3MDQA 3WQUA 3PUFA 1GLCG 1NM1A 2HNDA 1VQ7N 1ZBLA 3L2RA 4W5QA 2ZM6K 1S1VA 4GV3A 1A5VA 4BRGA 3KIOA 4JN4A 4KI6A 1FKOA 2XRIA 4M7XA 1IKYA 1U47A 2XY7A 1QS4A 4BR7A 2KZZA 2G8HA 4JI2K 2UUBK 3AVAA 4JKFA 4EIAA 1HMVA 4CJKA 3VF4A 5KPZA 3QESA 3HP6A 2YHXA 3QERA 3VTIA 5J2NA 4BRAA 1XNQK 4FPBA 3QICA 3A5NC 4CHQA 4MFBA 3U9ZA 3C6AA 3DLBA 2P9LA 4RTFD 1BO5O 3CERA 5AZJB 2A40A 3BEXA 1YJ9N 3V9SA 3LP2A 3QNNA 4BG8A 1J6ZA 3PO4A 3ULDA 3T19A 1R59O 2HHUA 3KTQA 4GMJB 4BVPA 3K5OA 3SJHA 3QEWA 3OJSA 3AGKA 4BGAA 2O8EB 3QEVA 4LH4A 4FLXA 3TANA 3QIPA 3O80A 3CM5A 4JV5K 4DF8A 3NF8A 4YOYA 4NYFA 4FWOA 4CF0A 3O4WA 4DG1A 1I94K 1VQ6N 3ASMA 2O8FB 4DMNA 4OJRA 4QS9A 5C12A 4XIUA 4CGIA 4B9QA 3HSCA 4DSKA 2YNFA 3VF2A 4FK2A 1IKWA 1HKBA 4BC2A 4IWVA 2QKKA 3AGRA 3HOTA 4E7LA 1A5XA 1YTUA 2PYJA 2IVPA 4PA1A 4B8CA 3K0SA 3NMUA 3L3VA 3ZT2A 1RT2A 3UKUA 4BROA 5EXWA 4DV1K 4KH6A 5CYMA 4B9VA 4BE2A 3SMPA 5CY4A 2P9SA 2HBMA 3SCXA 2F96A 4K41A 1E4GT 2OPRA 1WSHA 2D5RA 5IWAK 3TTDA 4B3SK 4FWKA 3FR0A 4CHPA 1QQNA 1HQEA 2P9LB 5AJ3K 2W41A 4IFVA 3K5LA 3VOVA 1VSHA 4W5RA 4PHTX 3CJ9A 2RF2A 5JENA 4DHYA 2YJEA 3SLCA 1TKDA 1JL1A 3QFPA 4L8RB 2E2QA 3K9KA 5LL6Z 1XNRK 3VEYA 3VQEA 3IFRA 4KB0A 1ZBHA 3MXJA 3UE5A 1EXQA 3OYDA 3ENHA 4DR7K 1NMDA 3AVIA 1IO2A 4H0OA 4JI7K 1MWMA 3JS6A 2HNZA 2A5XA 3O3HA 4H5RA 4CGHA 1NJYA 1WAJA 4C23A 1S1TA 2IVNA 3H6EA 4HWIA 1U45A 4JEPA 1YITN 5FRNA 4O55A 2V7ZA 4ID5A 4PY5A 4FYDA 2UYTA 2O8CA 2BE2A 4FK0A 5EX5A 3R6MA 2HMPA 2Q3SA 1T7PA 3ID6A 4DU3A 3VEVA 3NAEA 4LF9K 3OY9A 2OA8A 5FROA 1W7AA 4FM0A 3ID8A 1IG9A 1RILA 2IIRA 4CEDA 2J4RA 1SQKA 5LJVA 2VWJA 2P9NA 1VQKN 3HK2A 4LY7A 4E7JA 1BWFO 3KK7A 4BR0A 2VGNA 3M1FA 4IDKA 2WC9A 1U49A 4OLBA 4QS7A 3PX4A 3VENA 4FWPA 2O4GA 3MCAB 1CZ9A 2B5JA 3EL2A 4CK2A 4K0KK 3ZSYA 3SUOA 1SL1A 2I7NA 3RRHA 2NNWA 1TK8A 4EHTA 5E41A 3WQTA 1DT9A 1SUQA 3J8AA 3VQ6A 2UXBK 3QDKA 2KFNA 2E4LA 1KLMA 3ENOA 4NYNA 1WSIA 1JCEA 1WSGA 1DLOA 3CCEN 2VQFK 5T7BA 1XHXA 3ULEA 1RT3A 4MLEA 2X78A 4ID1A 3EZ5A 4BE0A 3CCVN 3VQQA 3VERA 5BPMA 3DOLA 4KHQA 5LJWA 4DV6K 1JLEA 2OPSA 3KWIA 1VSFA 1SKRA 4JKHA 4ZTFA 2E1ZA 3VEZA 2KZMA 1S22A 4QS8A 3OYGA 2YHWA 3I8BA 2VG7A 4CW7B 3MXIA 3R8EA 4FLUA 3U3GA 4JI1K 3F9KA 3S3MA 1NLVA 3OYFA 4QCLA 4WE1A 1N5YA 3A5OC 1NOYA 2A1RA 2OANA 5KRTA 4DU1A 1T8EA 2Z1HA 1HJOA 1G99A 3D2FA 2E5LK 3NGIA 3DLLL 2HVHA 1KCFA 2D4WA 4DCHA 4DF4A 3ZETB 3DWLA 4CJTA 5AQYA 4KHWA 1T3VA 3S41A 4DTXA 1KFDA 3PX6A 4O44A 2ZJQL 3UKRA 5JVGL 4DTJA 4KTWA 5C24A 3BF3A 1N34K 1HYVA 4JI3K 2B4JA 4CEAA 3G10A 1TUYA 1ZXOA 4CGJA 3C6UA 4BE7B 2HHXA 1EX4A 1XMQK 4IZ9A 1KAYA 3AO5A 1DGKN 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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