3UB5A

Profilin:actin with a wide open nucleotide cleft
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
publication title Structural basis for profilin-mediated actin nucleotide exchange.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 115
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ub5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ub5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ub5A03
3AARA 1MA9B 3FZHA 4PL7A 2A3ZA 4CBUA 3G25A 5AQXA 1Z6RA 3I33A 4JAXA 3VGMA 3CJCA 3W3DA 1JCGA 3GE1A 2I7NA 5E84A 1H1VA 2YCHA 5ADXH 1YUWA 5AQPA 5ADXA 3JXUA 3U9ZA 2J4RA 1LCUA 4FL9A 3EKUA 4GY2B 3SK3A 3UE5A 4LC9B 1T6DA 1NGGA 5EVZA 2YHXA 5KPRA 3D2EB 1SQKA 1DGKN 4XH5A 2P9NA 2P9NB 4CZMA 4F9OA 4L3QA 4H5RA 4ISGA 1Q18A 3UKUA 2E20A 2QWLA 4E1JA 2PBDA 4BGBA 5EY4A 3KVGA 2ZWHA 1NGHA 3IDHA 4BC4A 1HKCA 2NLXA 2QM1A 3KHYA 3FR0A 5AQSA 4JD2A 3A5NC 1S22A 4QS9A 1R59O 3SMSA 3VEVA 1X9JA 4JN4A 3SMPA 3O5BA 1TUUA 3JS6A 3LM9A 3O08A 4H0TB 5AQFA 4BRCA 4O5FA 4CZLA 4CZHA 2A6AA 2CGJA 2P9IA 5BRDA 5BRFA 3GOIA 4ISFA 4GNIA 4YDUA 3WXKA 2GEMA 1C0GA 2P9KA 1GLDG 1NGDA 2P9KB 3I8BA 5KPTA 1NGJA 2QWMA 3P4IA 2WUSA 4CD3A 4BRFA 1OKJA 4H0VB 2IIRA 2VCPA 2GWJA 3H45C 4H5NA 1NGFA 3FZKA 5ELZA 3VENA 5BPNA 5JLFA 3O4WA 4I6MA 1KAZA 5BN8A 4I6MB 3WQUA 4EHUA 4CI6A 3BP8A 3ATVA 1V4SA 3VEYA 2IVOA 3C7NA 1G99A 2AP1A 4H5VA 3MN5A 2VYPA 1NWKA 4FPAA 3DJCA 5JICA 4B1YB 4H5TA 2QWOA 4M63C 4QS7A 4FWNA 4CD1A 3C0BA 3FZFA 4BRKA 2HF3A 4H0OA 1ATSA 2GTDA 4A2AA 5BRHA 4HTLA 2KHOA 3LDNA 2IVNA 4B1WB 2F9WA 4BC2A 2CGKA 3QFUA 4FOIA 3HTVA 2E2OA 1MDUB 5AQIA 3DXMB 4H0XB 3VERA 5AQRA 4ISEA 2YHWA 3B8AX 1BG3A 5AZIA 3ZETB 2ZGYA 2YJFA 5TKYA 3M3ZA 1BUPA 5AFUH 5AFUA 2HMPA 2P9PA 3VOVA 2P9PB 2A42A 3QBXA 4BR5A 3CQYA 4IO8A 3WXIA 2ASPA 1QHAA 2A5XA 3HM8A 1HX1A 3MK6A 1NMDA 2FSJA 4BC3A 3L6QA 2PAVA 3A5MC 3S41A 3GBTA 3FE1A 4EFHA 3EO3A 1XC3A 3EKSA 4H03B 5B8HA 4A2BA 4B1ZA 4PKHA 1NM1A 4BRNA 5KQDA 2AA4A 3WEEB 3LL3A 1E4FT 4BC5A 3GL1A 1D4XA 3D2EA 3U9DA 4DCHA 1HKBA 3MN7A 4CBWA 1DKGD 1ATNA 4PKGA 3D7EO 4K41A 2ASMA 2GUPA 1HKGA 4FWOA 3FGUA 4JNEA 2ITMA 3VF6A 4FO0A 1T44A 1ZC6A 5LY3A 3L4IA 5CE3A 1WUAA 4CZKA 4FOEA 5EOYA 3CHWA 4WQ5A 2V7YA 2D0OA 4CZFA 4XH4A 1NGIA 2V7ZA 3J8AA 3VF4A 3LDLA 3MDQA 2Q2RA 3BF1A 1P8ZA 3LM2A 1ZXOA 3H6EA 3RSEA 4BG9A 4FWSA 3RSEB 2EWSA 2A40A 4BR2A 4MO4A 1NLVA 3O1WA 1BU6O 1HPMA 4XEIA 4YDUC 4EAHD 1GLAG 4B1XB 3WXLA 4BREA 1JCFA 3IFRA 4MO5A 1XQSC 3FZLA 4HWIA 4MLEA 3DXKB 2A41A 1E4GT 4FWMA 3L0QA 4CJ7A 3MN6A 2DPNA 2GWKA 4BG8A 5FPNA 4Z94A 3EN9A 2ASOA 1TYQB 3ENOA 1KAYA 2QWPA 2YI1A 2V51B 1KAXA 2IVPA 4J8FA 2D4WA 2Q0RA 4BRGA 1QZ6A 3A8YA 1QQMA 3O6WA 3BF3A 5E26A 5BPLA 5FPDA 2VWBA 4FWRA 5BR9A 2CGLA 5EX5A 3ENHA 1K8KA 1J6ZA 1K8KB 2CH5A 1Z05A 4CBXA 5AQNA 3H3OB 5LJVA 3EL2A 4FWLA 3ZEUA 1ESVA 5AQKA 2I7PA 4K43A 3WQTA 3ZEUB 2GELA 2E1YA 4M7XA 3GDQA 5AZJA 5AZJB 2Q0UA 4FSVA 4B1UB 1BO5O 2NRHA 4BRPA 1RDWX 1QQNA 1NGBA 3WXJA 1CZAN 2ZF5O 3ZX3A 3VF2A 4BVPA 2QXLA 3U8XA 4FWQA 2BTFA 1RFQA 1NBWA 4BR4A 1MWMA 3HZ6A 2P9UB 3VGLA 4A62A 4BROA 3VPZA 3H1VX 3QDKA 3CI5A 2BUPA 3MN9A 3DXMA 3UKRB 3AAPA 1U6ZA 5AQMA 1S3XA 3ZETA 4JHDA 1GLEG 1RGIA 5EXWA 1TUYA 4FWKA 3LDQA 3D2FB 4JHDB 4KBOA 1GLFO 2FLOA 1YXQA 3TPQA 3QMLA 4WQ4A 3FFKB 3QBWA 5JLHA 3F9MA 3MCPA 5AQZA 3QFPA 4IJNA 1C0FA 2Q1NA 2QWQA 3KZBA 1U2VA 2P9LA 3MMVA 5AQUA 4BGAA 3VGKA 1SZ2A 1U2VB 2P9LB 3O1BA 1LOTB 3H46O 4IZ9A 3ULEB 5AQTA 2QWRA 1YVNA 3DWLA 4B9QA 3SLCA 4CZJA 2E88A 4QS8A 5F1XA 3IUCA 4BRMA 1NGAA 5FPEA 5F0XA 4M7YA 3WEEA 3VETA 3H3NO 4BR0A 5I9EB 4K25A 3VEXA 4AM7A 4DQ8A 2QWNA 2Q36A 1HUXA 3VESA 3R6MA 1DEJA 5AQVA 4BVOA 4RCHA 1IG8A 3ATUA 2E8AA 5KQ8A 1BWFO 3AY9A 3A5OC 3GG4A 3EZWA 4WQ5C 2Q31A 3TU5A 4IXCA 4DB3A 2E1ZA 1BDGA 2CH6A 5LJWA 3CJAA 3WUHA 1QZ5A 3SJHA 3VEZA 1HJOA 3O80A 4BRLA 3HI0A 3ID8A 3UKUB 4EHTA 3WT0A 2E2PA 3QB0A 4H0YB 4XH1A 2YJEA 3W0LA 1X3MA 3DXKA 3CERA 2E2NA 3HBTA 5BREA 3ZX0A 1Y64A 4IJAA 1XUPO 2V52B 4PL8A 4JD2B 3BEXA 3CJ9A 1ATRA 3VEWA 1GLLO 1TYQA 3ZX2A 4PKIA 5KPZA 4NO7A 3O8MA 4A61A 4O8KA 2YHYA 4K42A 5AQLA 4CZEA 3CETA 2FF6A 3BUZB 3CJ1A 1JCEA 5AQOA 1EQYA 1WOQA 1X3NA 3U4LA 3UB5A 1HLUA 3OHRA 2W40A 2P9IB 3M6GA 4MLHA 3A0IX 4WYBA 4C23A 1QQOA 2HOEA 2NZTA 3CJ7A 4DHYA 2F9TA 4CZIA 1BA0A 3IMXA 1T6CA 5AQQA 5FPMA 1GLJO 5F2RA 4BR7A 3VEOA 5BPMA 5JMVA 4BRQA 1NGCA 2QW9A 3QICA 4BQLA 4IWVA 1V4TA 1BOTO 4BR9A 2HF4A 3CQXA 3FLCO 3FZMA 3HSCA 2P9SA 2P9SB 1GLCG 4NB4A 5BN9A 4Y0WA 1ZBSA 4FWPA 2E2QA 4BQZA 4BRIA 1SAZA 1MWKA 4FPBA 2P9UA 3C7NB 4B1VA 1KXPA 4RWTA 3UKRA 4BRHA 2D1KA 3R8EA 2OANA 3A5LC 1GLBG 3D2FA 4H0PA 4WQ4C 2W41A 3LDOA 1BA1A 3LDPA 2ZGZA 3AAQA 2FSKA 3H1QA 4EIAA 5AQHA 3CIPA 3CJBA 5AQJA 2D0PA 5AR0A 5AQYA 4BRAA 4AM6A 1YAGA 5AQGA 3ULEA 4CZGA 2FXUA 4RTFD 4BRDA 5AQWA 4H5WA 2FF3B 2FSNA 2UYTA 3DAWA 3M1FA 1IJJA 1NGEA 2Q97A 5AZIB 3R9PA 2H3GX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FZHA 3BDPA 2A3ZA 3MWPA 4O55A 1LW0A 4GW6A 3TWHA 4JAXA 3L4QA 3SCXA 4W5NA 1C6VA 2O8EA 4FZZA 2I7NA 1HYVA 3HP6A 4IKFA 1TAQA 3CCEN 1Y97A 4FL9A 4HUGA 4LC9B 4XJXA 4CEQA 1NGGA 2G8VA 4KH6A 2HNYA 1WSJA 5GAGP 2G8FA 4Z4CA 3D2EB 4JKGB 1DGKN 2QI2A 4CZMA 3ZT4A 4F9OA 2OZMA 3UKUA 3J81O 3ZT1A 3DMJA 4CJ3A 5EY4A 4OPHA 4KHQA 3VA0A 3M8SA 1ZBFA 4M3UA 2KFZA 4JD2A 4ZHRA 4BDPA 5TKWA 2KKZA 1YTUA 1TVRA 2B6AA 3NH0A 3UIQA 3PX4A 4JN4A 4GV3A 4K0KK 4MDAA 3OYIA 3O5BA 1TUUA 3QEIA 4GKJK 4CZHA 4O5FA 1HMVA 5IT9O 3HP9A 4JKEA 3U3YA 1S9GA 1WNSA 4I9QA 3I8BA 3P4IA 4CD3A 1RTDA 2I5JA 1I39A 3MEEA 3HT3A 3L2VA 2XHBA 3RR8A 2VCPA 4DQRA 4CJKA 1IKWA 4DR3K 1KAZA 4CIFA 1XHXA 4C8MA 2O8DA 1YJWN 4JI8K 3ATVA 1V4SA 3VEYA 3OS1A 4CCHA 3O9UA 2E5LK 4N56A 3V1OA 3IRXA 5KGXA 1WN7A 4B1YB 3OW2M 4DLEA 4H5TA 3NF9A 4CEAA 4QOZB 5CYMA 2QWOA 4M63C 4FWNA 4CD1A 4E7IA 3THYA 3TARA 5C2FA 3LDNA 3SUPA 1JJ2M 1QSLA 2F9WA 2CGKA 2RPIA 5LMUK 3G6EN 3TTCA 2E2OA 3O3GA 1NJIO 3CD6N 3QIOA 2YHWA 2ZGYA 1O1WA 2YJFA 5M1OA 5TKYA 3M3ZA 1YVUA 3BZCA 3OJUA 4AHSA 4DTOA 4JRPA 3CYGA 2A42A 1EKEA 4BR5A 2YHBA 3D45A 3V9XA 2C1GA 5HRSA 4FLUA 2RKIA 4DR4K 3I56N 1IO2A 4JI6K 3MX5A 3KJVA 1WAJA 2Z1JA 3PY8A 4FJKA 3EKSA 3L2QA 3SZ2A 3RMBA 4A2BA 4B1ZA 3TSQA 1NM1A 3M8QA 2RHKA 3WEEB 3CXCM 1D4XA 1WSEA 3D2EA 4JKGA 1HKBA 3HVRA 4FYDA 3SQ1A 3K9KA 4A57A 2GUPA 2OPSA 4KH4A 4JS4A 3FGUA 2ITMA 1B9FA 1RT7A 1ZYQA 2BH1A 1ZC6A 4IDHA 2DFFA 1VQLN 5LY3A 3L4IA 3VQAA 3CQ8A 1ZBIA 3CCRN 4WQ5A 3WNEA 4CFCA 3CCJN 3J8AA 4FVMA 3AA5X 2D5RA 3VF4A 4DFJA 3EY1A 3LM2A 4BG9A 3HPHA 4C8NA 1J54A 1NLVA 2FC0A 2D0AA 1D9DA 1BU6O 3O4QA 4EAHD 1GLAG 3ENBA 3WXLA 4BREA 1JCFA 3KK1A 3V81A 4JKCA 3TAPA 4CEOA 1S5JA 1VSLA 3C6AA 4CEFA 1VSHA 4W5QA 3EN9A 4E3SA 4FM2A 1KAYA 2NNWA 1W97L 4CW7B 4FM1A 1VQ9N 1KAXA 3MAQA 1K73O 4B3MK 3VQ6A 3OVNA 1HNWK 1XI1A 4TSXA 5JENA 1J6ZA 4FLXA 3QERA 2YKMA 3KLGA 4LFAK 1GOCA 2VG5A 4FLYA 3HL8A 4ID5A 1ESVA 3WQTA 3NCIA 1L3UA 1KQSM 1XMOK 3THWA 4M7XA 5AZJA 3GDQA 2HHTA 5MLCQ 1BI4B 4BE7B 1KLMA 2Q0UA 2LSNA 1KC8O 4B1UB 2UUBK 3VN5A 4M3TA 3CC7N 2HBMA 1Z25A 4FWQA 4JK8A 1RFQA 3VQ8A 2YNHA 4BR4A 4A62A 4W5OA 3L8BA 1FJGK 3CI5A 4MFBA 2OTLN 3UKRB 2OA8A 4HCCA 3AAPA 4IDKA 1S3XA 1TUYA 4FWKA 3CG7A 4NLBA 1GLFO 3P1GA 2YNFA 1NK9A 4CK1A 3FFKB 3QBWA 5JLHA 3MCPA 3CCSN 4CGFA 1KCFA 1U2VA 3QEVA 4BGAA 3O1BA 3H46O 4B9LA 5AQTA 2QWRA 4FVUA 3DM2A 3SLCA 2HHXA 1EO1A 4QS8A 3AGRA 4BRMA 5F0XA 3V1RA 3WEEA 2EHGA 3VEXA 1IKXA 3J7AP 2GUIA 2QWNA 3AVNA 3SYZA 3R6MA 5AQVA 3RRHA 3HSTB 4RG8A 4KHSA 2WOMA 1DT9A 3M5RA 5J2PA 1RBVA 3ZSZA 2Q3SA 4DFMA 2Q31A 3NVMA 4IFYA 5LJWA 1C0MA 1VSIA 4M3XA 1YT3A 4OX9K 3MEDA 2HVIA 3SQ4A 4YOUA 3HI0A 3ZT0A 2FBYA 3SNNA 4DF8A 1WAFA 5CR4A 3PO4A 3E9PA 4EHTA 1CXQA 4C8OA 4FK0A 3DLKA 3NE6A 1KD1O 4DQIA 4JI5K 3S3OA 3BZKA 1NJXA 3CERA 1Q9XA 4KV8A 2OTJN 1Y64A 4PL8A 2V52B 4CHPA 1ATRA 2HHVA 4QAGA 2YHAA 4V19S 4K42A 1KTQA 1OH7A 1M90O 2FF6A 3BUZB 2XY6A 5AQOA 1WOQA 4Z4FA 3CFPA 1X3NA 4CEBA 4DUYK 3ALYA 3OHRA 4DSIA 4HCBA 4DHYA 1S6PA 1T6CA 4OKJA 4FJLA 5GIOA 1GLJO 3VEOA 3TANA 4W5RA 4AHVA 4BR9A 4BDYA 3KTQA 2P9SA 5BN9A 4E89A 3K59A 4Y0WA 1JLFA 1QVGM 1O13A 2OPPA 4BRIA 4R5PA 3O9SA 4B1VA 2KW4A 3AVKA 3UKRA 1JLAA 1SL2A 3HVTA 1VQ6N 2DFEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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